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目的基因的連接與轉(zhuǎn)化第1頁(yè)/共15頁(yè)目的基因的連接、轉(zhuǎn)化第2頁(yè)/共15頁(yè)分類及原理分類:
根據(jù)限制性內(nèi)切酶酶切后產(chǎn)生的末端的類型,分為非互補(bǔ)突出末端的連接、相同粘性末端的連接、平末端連接第3頁(yè)/共15頁(yè)DNA連接示意圖第4頁(yè)/共15頁(yè)載體自連及去磷酸化第5頁(yè)/共15頁(yè)常用堿性磷酸酶BAP(大腸桿菌)CIAP(小牛腸)分子量80,000溫度60℃—65℃最適PH8.0熱穩(wěn)定性好,100℃暫時(shí)性失活,室溫放置可恢復(fù)活性,苯酚完全失活分子量100,000溫度37℃最適PH10.0附近(高底物濃度)PH8.0附近(低底物濃度)65℃30分鐘處理99%的活性不可逆失活,隨具體條件改變有變動(dòng),完全失活苯酚處理第6頁(yè)/共15頁(yè)本實(shí)驗(yàn)連接材料及連接體系第7頁(yè)/共15頁(yè)連接示意圖第8頁(yè)/共15頁(yè)連接體系載體DNA17ng目的DNA50ng連接緩沖液(5×)1.2ul用蒸餾水稀釋至6ul附注:目的DNA的總體積是3ul,如果不夠總質(zhì)量以總體積為準(zhǔn)第9頁(yè)/共15頁(yè)1.載體和插入片段的摩爾濃度比載體:插入片段的摩爾數(shù)的變化范圍可為8:1到1:16,但通常的變化范圍是3:1到1:3。插入片段的長(zhǎng)度和序列的變化會(huì)影響和同一載體的連接效果。每一個(gè)連接反應(yīng)都需要作實(shí)驗(yàn),來(lái)選擇最佳的載體和插入片段的摩爾數(shù)比。在最小的反應(yīng)體積中,通常一個(gè)連接反應(yīng)用10-50ng的載體DNA。2.進(jìn)行連接反應(yīng)時(shí)的保溫的時(shí)間和溫度也需優(yōu)化。一般而言,平末端連接在22℃保溫4-16小時(shí),粘性末端在22℃保溫3小時(shí),或16℃保溫16小時(shí)。大多數(shù)連接反應(yīng)用T4DNA連接酶,但大腸桿菌的DNA連接酶可用于粘性末端的連接,平末端連接時(shí)用此酶,活力較低。3.載體和插入片段的純度應(yīng)較高,融解的溶劑最好使用滅菌的雙蒸水而不是TE,畢竟TE中含有離子,可能影響連接反應(yīng)。第10頁(yè)/共15頁(yè)感受態(tài)細(xì)胞的制備Hanahan法是制備高效感受態(tài)細(xì)菌的標(biāo)準(zhǔn)方法。這種化學(xué)方法制備的感受態(tài)細(xì)菌的轉(zhuǎn)化效率可達(dá)到109cfu/μgDNA。注:1.低溫培養(yǎng),18℃培養(yǎng)至OD600約為0.5;
2.超凈臺(tái)無(wú)菌操作,低溫操作;
3.標(biāo)準(zhǔn)質(zhì)粒的種類不同同種感受態(tài)的轉(zhuǎn)化率不同,不同質(zhì)粒形態(tài)轉(zhuǎn)化率也不相同。第11頁(yè)/共15頁(yè)轉(zhuǎn)化原理1.0℃的CaCl2低滲溶液中,使細(xì)胞膨脹,同時(shí)Ca2+使細(xì)胞膜磷脂層形成液晶結(jié)構(gòu),使得位于外膜與內(nèi)膜間隙中的部分核酸酶離開(kāi)所在區(qū)域,這就構(gòu)成了大腸桿菌人工誘導(dǎo)的感受態(tài);2.加入DNA,Ca2+又與DNA結(jié)合形成抗脫氧核糖核酸酶(DNase)的羥基-磷酸鈣復(fù)合物,并粘附在細(xì)菌細(xì)胞膜的外表面上;3.經(jīng)短暫的42℃熱脈沖處理后,細(xì)菌細(xì)胞膜的液晶結(jié)構(gòu)發(fā)生劇烈擾動(dòng),隨之出現(xiàn)許多間隙,致使通透性增加,DNA分子便趁機(jī)進(jìn)入細(xì)胞內(nèi)。Mg2+的存在對(duì)DNA的穩(wěn)定性起很大的作用,MgCl2與CaCl2又對(duì)大腸桿菌某些菌株感受態(tài)細(xì)胞的建立具有獨(dú)特的協(xié)同效應(yīng)。二甲基亞砜(DMSO)和二巰基蘇糖醇(DTT)進(jìn)一步誘導(dǎo)細(xì)胞產(chǎn)生高頻感受態(tài)的程序,大大提高了大腸桿菌的轉(zhuǎn)化效率。第12頁(yè)/共15頁(yè)轉(zhuǎn)化示意圖第13頁(yè)/共15頁(yè)連接效率的計(jì)算連接
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