楊榮武生物化學蛋白質的結構課件

第二章蛋白質的結構ProTens提綱、肽的結構1.肽的定義、分類和命名2.寡肽的理化性質蛋白質的結構1.蛋白質的一級結構2.蛋白質的二級結構3.蛋白質的三級結構4.蛋白質的四級結構三、蛋白質的折疊歷程與結構預測蛋白質折疊的基本規(guī)律2.蛋白質折疊的歷程3.與蛋白質錯誤折疊相關的疾病4.蛋白質結構的預測四、蛋白質組及蛋白質組學肽的定義★肽就是氨基酸之間通過α-氨基和α-羧基縮合以酰胺鍵或肽鍵相連的聚合物,它包括寡肽、多肽和蛋白質。★構成肽的每一個氨基酸單位被稱為氨基酸殘基。各氨基酸殘基以肽鍵相連形成的鏈狀結構被稱為肽鏈。肽的分類和命名★肽的命名和分類的主要依據是氨基酸殘基的數目和組成。★肽的分類可根據氨基酸殘基的數目而直呼其為幾肽。例如,2個氨基酸形成的肽稱為二肽,3個氨基酸構成的肽稱為三肽,以此類推。一般將2~10個氨基酸殘基組成的肽稱為寡肽,由11~50個氨基酸殘基組成的肽稱為多肽,由50個以上的氨基酸殘基組成的肽通常被稱為蛋白質。肽的化學結構與命名二肽肽鍵H2N一CH-CNH-CH-C-OHCHCOOH★除了少數環(huán)狀肽鏈以外,其它肽鏈都Ala-Asp含有不對稱的兩端:丙氨酰天冬氨酸其中含有自由α-氨三肽基的一端被稱為氨肽鍵肽鍵基端或N端,含有自由α-羧基的一端H2N一CH—C-NH—CH—C—NH—CHoH稱為羧基端或C端。CHOHCHSHCH,CNH2Ser-Cys-Asn絲氨酰半胱氨酰天冬酰胺非核糖體合成肽與核糖體合成肽類型和種類來源類別功能備注非核糖體合成肽胱甘肽動植物細胞肽抗氧化第一個肽鍵為γ-肽鍵短桿菌肽S細菌環(huán)狀十肽抗菌含有D-氨基酸肽聚糖分子中的寡肽細菌細胞壁小肽形成細菌細胞壁的含有D-氨基酸網絡結構肌肽肌肉細胞肽不明含有β丙酸核糖體合成多肽促甲狀腺素釋放因子下丘腦三肽促進甲狀腺素釋放N-端發(fā)生焦谷氬酰化,C-端發(fā)生酰胺化催產素腦垂體后葉八肽刺激子宮收編排乳、促進遺忘加壓素腦垂體后葉八肽升血壓、抗利尿、促進記憶Wa鵝膏蕈堿鬼筆鵝蕈環(huán)狀八肽真核RNA聚合類真菌酶Ⅱ的強抑制劑寒肽的理化性質1.兩性解離肽也有等電點,其中小肽的pl的計算方法與氨基酸相似,但復雜的寡肽只能與多肽和蛋白質一樣不能計算,只能測定(如使用等電聚焦的手段)。2.手性與旋光性爻3.雙縮脲反應凡含有兩個肽鍵的肽含有與雙縮脲結構相似的肽鍵(至少含有兩個肽鍵,故二肽不行),都能發(fā)生此反應。4.水解5.具有特定的生物學功能蛋白質的一般概念⊙1830年,Mulder研究生物體在去除糖、脂和鹽等物質以后剩余的成分燜⊙1838年,Berzelius使用蛋白質這個詞。希臘語中的表示最重要的意思⊙蛋白質是氨基酸的線性多聚物(>51aa)x⊙1958年,Watson.提出“中心法則”:DNA→RNA→蛋白質(信息流)DNA的功能在于其一級結構;蛋白質的功能在其三維結構。蛋白質的多樣性★組成的多樣性★大小的多樣性★結構的多樣性★功能的多樣性蛋白質組成的多樣性★蛋白質可能含有一條或多條肽鏈1.一條多肽鏈-單體蛋白2.不止一條多肽鏈-寡聚蛋白:同源寡聚體-同種肽鏈異源寡聚體-兩種或多種不同的肽鏈;血紅蛋白是一種異源四聚體:2條α鏈,2條β鏈★蛋白質可能含有非蛋白質成分1.多肽