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實(shí)戰(zhàn):Google再次“登月”Baseline工程把基因大數(shù)據(jù)化

縱觀幾年,谷歌蘋(píng)果三星微軟幾家巨頭在健康領(lǐng)域投入越來(lái)越大,勢(shì)頭愈加生猛。據(jù)華爾街日?qǐng)?bào)報(bào)道,緊接無(wú)人駕駛汽車,隱形眼鏡式血糖儀,高原氣球網(wǎng)絡(luò)服務(wù),Google儼然開(kāi)始了一項(xiàng)自公司成立以來(lái)最具野心,最為困難的科學(xué)項(xiàng)目,一個(gè)“登月”工程。GoogleX實(shí)驗(yàn)室開(kāi)始了Baseline“基線”項(xiàng)目,大量收集人類基因組標(biāo)本并利用大數(shù)據(jù)合成一份完美的健康人類基因圖譜,為多種疾病的提早發(fā)現(xiàn)及治療提供前提。基線工程的第一步是采集175個(gè)參與者的匿名基因和分子信息,取樣包括基因排序,血液,唾液,眼淚,尿液,以及參與者的食物及藥物代謝信息,心率,家族病史等,第一波測(cè)量過(guò)后,參與者將佩戴可穿戴測(cè)量設(shè)備,持續(xù)提供體征信息。Google將通過(guò)第三方的隱私過(guò)濾得到匿名的基因組信息。下一步將把實(shí)驗(yàn)群體擴(kuò)大到數(shù)千人,獲得更多更廣的基因數(shù)據(jù)。項(xiàng)目領(lǐng)導(dǎo)者分子生物學(xué)家安德魯·康拉德(AndrewConrad)2013年3月加盟Google,現(xiàn)在已經(jīng)建立起了一支70-100人的隊(duì)伍,包括生理,生物化學(xué),成像和細(xì)胞生物學(xué)的專家。康拉德認(rèn)為基線工程處在剛剛起步階段,基因圖譜的制作和分析是一項(xiàng)極其艱難的工作,我們對(duì)于DNA,蛋白,酶類間的相互關(guān)系和外界的影響知之甚少,但隨著掌握的數(shù)據(jù)量增多,依賴Google強(qiáng)大的大數(shù)據(jù)計(jì)算能力,研究者們可以從海量的基因組數(shù)據(jù)中獲得生物標(biāo)記(biomarker)的規(guī)律,而這些生物標(biāo)記將對(duì)預(yù)防,治療,制藥領(lǐng)域產(chǎn)生強(qiáng)大的引領(lǐng)和促進(jìn)作用。舉例來(lái)說(shuō),每個(gè)人對(duì)于食物脂肪的代謝功能都是不一樣的,部分人的基因組中缺乏幫助人體代謝多余食物脂肪的生物標(biāo)記,從而導(dǎo)致早年的心血管疾病,通過(guò)數(shù)據(jù)收集,研究者們可以準(zhǔn)確的定位生物標(biāo)記在基因中的位置,確定新病人是否缺乏這段標(biāo)記,及時(shí)做出準(zhǔn)確的治療和飲食推薦。大量減少心血管疾病的發(fā)生。既然基因組的作用如此強(qiáng)大,在Google之前為什么沒(méi)有人開(kāi)始同樣的收集工作呢?原因很簡(jiǎn)單,沒(méi)錢沒(méi)時(shí)間。人類的基因組及其龐大,一個(gè)基因組由十萬(wàn)以上的基因分段組成,每個(gè)基因段又由成百上千個(gè)核苷酸配對(duì)組成,放在幾十年前,受集一份整套的基因組的工作量是不可想象的。2001年,第一份基因組才被排序成功,而在十年前,單單一份基因排序需要一億美金,隨著排序技術(shù)的發(fā)展,如今只需要1000美金就可以完成。但一般的公司和個(gè)人還是支付不起系統(tǒng)性收集基因組的。記著之前在學(xué)校學(xué)起DNA排序時(shí),十分激動(dòng)的問(wèn)生物老師我們要是收集幾萬(wàn)人的DNA后通過(guò)大數(shù)據(jù)豈不是可以把人體的秘密通通展現(xiàn)出來(lái),老師淡然一笑:好想法,你有錢嗎?我沒(méi)有,但是Google財(cái)大氣出,魄力十足。有人可能會(huì)好奇當(dāng)今基因排序技術(shù)的準(zhǔn)確度,老實(shí)說(shuō),不是很高,Emory大學(xué)的神經(jīng)學(xué)系主任AllanLevey在講座中勸告聽(tīng)眾不要盲目花錢做基因排序,提到一位老友的故事:50歲后這位仁兄去做了一個(gè)基因排序以防基因病來(lái)得錯(cuò)手不急,結(jié)果發(fā)現(xiàn)他的APP基因突變了,這個(gè)基因突變理論上必然導(dǎo)致老年癡呆癥(Alzheimer’sDisease),結(jié)果老兄喪氣地找到Levey教授尋求解釋,經(jīng)過(guò)一番測(cè)試后發(fā)現(xiàn)他已經(jīng)過(guò)了開(kāi)始發(fā)病年齡卻一點(diǎn)癥狀沒(méi)有,后來(lái)發(fā)現(xiàn)是基因排序出了差錯(cuò)。這類事件時(shí)有發(fā)生,但是終歸是針對(duì)個(gè)人案例的。大數(shù)據(jù)的絕對(duì)優(yōu)點(diǎn)就是海量數(shù)據(jù)彌補(bǔ)個(gè)別差錯(cuò)?;蛟S基線工程的第一波實(shí)驗(yàn)結(jié)果會(huì)出現(xiàn)不準(zhǔn)確的風(fēng)險(xiǎn),但是幾年后,當(dāng)實(shí)驗(yàn)群擴(kuò)張到千人甚至萬(wàn)人的時(shí)候,通過(guò)計(jì)算足以剔除DNA中的大量無(wú)用分段和錯(cuò)誤信息,將研究者的目光直接導(dǎo)向致病的基因段。人類的健康基因圖譜將得到越來(lái)越多的完善,接近完美。那么關(guān)于老生常談的隱私問(wèn)題呢?Google已經(jīng)建立起當(dāng)今世界上最為強(qiáng)大的電腦和信息網(wǎng)絡(luò)來(lái)支撐搜索引擎和YouTube這樣強(qiáng)勁的數(shù)據(jù)捕獲手段,今年年底又要利用安卓涉足穿戴式設(shè)備領(lǐng)域,數(shù)據(jù)的掌控量之恐怖,自然會(huì)讓我們不放心Google獲得大量的基因組數(shù)據(jù)??道略诓稍L中提到Google將與斯坦福和杜克大學(xué)的醫(yī)學(xué)院合作,兩個(gè)大學(xué)將把基線工程參與者的身份信息抹掉,把匿名數(shù)據(jù)交給Google,聽(tīng)起來(lái)讓人稍稍安心一些,但仔細(xì)想想,那些被抹掉的也只是參與者的信息,Google獲得的卻是人類身體中最為珍貴的秘密,如果Google不將這些計(jì)算后的結(jié)果公開(kāi),而單獨(dú)和幾家制藥公司分享,我們作為普通老百姓可能一點(diǎn)辦法沒(méi)有,任由巨頭們把我們的弱點(diǎn)和需求看個(gè)透。Google創(chuàng)始人之一拉里佩奇(LarryPage)多次提到大數(shù)據(jù)在健康和醫(yī)藥領(lǐng)域的巨大潛能,常常不忿隱私法律對(duì)于人體數(shù)據(jù)獲取的制約,現(xiàn)在來(lái)看,Google可能在建立一個(gè)獨(dú)立的龐大數(shù)據(jù)池,僅供自己所用,直接繞過(guò)隱私法獲得數(shù)據(jù),為其數(shù)據(jù)計(jì)算能力找到了新的用武之地。我們只能寄希望

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