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1、分子生物學(xué)復(fù)習(xí)(僅供參考)基因芯片的測(cè)序原理是雜交測(cè)序方法,即通過與一組已知序列的核酸探針雜交進(jìn)行核酸序列測(cè)定的方法,在一塊基片表面固定了序列已知的八核苷酸的探針。當(dāng)溶液中帶有熒光標(biāo)記的核酸序列TATGCAATCTAG,與基因芯片上對(duì)應(yīng)位置的核酸探針產(chǎn)生互補(bǔ)匹配時(shí),通過確定熒光強(qiáng)度最強(qiáng)的探針位置,獲得一組序列完全互補(bǔ)的探針序列。據(jù)此可重組出靶核酸的序列。假基因(pseudogene)具有與功能基因相似的序列,但由于有許多突變以致失去了原有的功能,所以假基因是沒有功能的基因,常用表示。端粒是線狀染色體末端的一種特殊結(jié)構(gòu),在正常人體細(xì)胞中,可隨著細(xì)胞分裂而逐漸縮短。細(xì)胞分裂一次,由于DNA復(fù)制時(shí)的

2、方向必須從5'方向到3'方向,DNA每次復(fù)制端粒就縮短一點(diǎn),所以端粒其長(zhǎng)度反映細(xì)胞復(fù)制史及復(fù)制潛能,被稱作細(xì)胞壽命的“有絲分裂鐘” 。DNA變性是指核酸雙螺旋堿基對(duì)的氫鍵斷裂,雙鏈變成單鏈,從而使核酸的天然構(gòu)象和性質(zhì)發(fā)生改變。變性時(shí)維持雙螺旋穩(wěn)定性的氫鍵斷裂,堿基間的堆積力遭到破壞,但不涉及到其一級(jí)結(jié)構(gòu)的改變。凡能破壞雙螺旋穩(wěn)定性的因素,如加熱、極端的pH、有機(jī)試劑甲醇、乙醇、尿素及甲酰胺等,均可引起核酸分子變性。DNA的復(fù)性指變性DNA 在適當(dāng)條件下,二條互補(bǔ)鏈全部或部分恢復(fù)到天然雙螺旋結(jié)構(gòu)的現(xiàn)象,它是變性的一種逆轉(zhuǎn)過程。熱變性DNA一般經(jīng)緩慢冷卻后即可復(fù)性,此過程稱之為&q

3、uot; 退火"(annealing)。簡(jiǎn)并密碼子編碼同一個(gè)氨基酸殘基的兩個(gè)或兩個(gè)以上的密碼子。核酶(ribozyme)是具有催化功能的RNA分子,是生物催化劑,可降解特異的mRNA序列。核酶又稱核酸類酶、酶RNA、核酶類酶RNA。大多數(shù)核酶通過催化轉(zhuǎn)磷酸酯和磷酸二酯鍵水解反應(yīng)參與RNA自身剪切、加工過程。核酸探針是指帶有標(biāo)記物的已知序列的核酸片段,它能和與其互補(bǔ)的核酸序列雜交,形成雙鏈,所以可用于待測(cè)核酸樣品中特定基因序列的檢測(cè)。持家基因(house-keeping genes):又稱管家基因,是指所有細(xì)胞中均要表達(dá)的一類基因,其產(chǎn)物是對(duì)維持細(xì)胞基本生命活動(dòng)所必需的。如微管蛋白基因

4、、糖酵解酶系基因與核糖體蛋白基因等。真核生物結(jié)構(gòu)基因,由若干個(gè)編碼區(qū)和非編碼區(qū)互相間隔開但又連續(xù)鑲嵌而成,去除非編碼區(qū)再連接后,可翻譯出由連續(xù)氨基酸組成的完整蛋白質(zhì),這些基因稱為斷裂基因(splite gene)信號(hào)肽是引導(dǎo)新合成的蛋白質(zhì)向分泌通路轉(zhuǎn)移的短(長(zhǎng)度5-30個(gè)氨基酸)肽鏈。常指新合成多肽鏈中用于指導(dǎo)蛋白質(zhì)的跨膜轉(zhuǎn)移(定位)的N-末端的氨基酸序列(有時(shí)不一定在N端)。轉(zhuǎn)化所謂重疊基因(overlapping gene)是指兩個(gè)或兩個(gè)以上的基因共有一段DNA序列,或是指一段DNA序列成為兩個(gè)或兩個(gè)以上基因的組成部分?;蛑委煟╣ene therapy)是指將外源正?;?qū)氚屑?xì)胞,以糾

5、正或補(bǔ)償因基因缺陷和異常引起的疾病,達(dá)到治療目的。順式作用元件(cis-acting element)位于基因的旁側(cè),可以調(diào)控影響基因表達(dá)的核酸序列。包括啟動(dòng)子(promoter) 、增強(qiáng)子(enhancer)、應(yīng)答元件(responsive elements)等。其活性只影響與其自身同處于一個(gè)DNA分子上的基因。其本身并不編碼蛋白質(zhì),可以與反式作用因子相互作用參與基因表達(dá)調(diào)控。反式作用因子(trans-acting factor)是指能直接或間接地識(shí)別或結(jié)合在各類順式作用元件核心序列上參與調(diào)控靶基因轉(zhuǎn)錄效率的蛋白質(zhì)。內(nèi)含子是阻斷基因線性表達(dá)的序列。DNA上的內(nèi)含子會(huì)被轉(zhuǎn)錄到前體RNA中,但R

6、NA上的內(nèi)含子會(huì)在RNA離開細(xì)胞核進(jìn)行轉(zhuǎn)譯前被剪除。在成熟mRNA被保留下來(lái)的基因部分被稱為外顯子。內(nèi)含子有時(shí)也叫內(nèi)顯子,與外顯子相對(duì)。轉(zhuǎn)移DNA(transferred DNA,T-DNA):T-DNA也叫三螺旋DNA,是指一種由三股ssDNA旋轉(zhuǎn)螺旋行成的一種特殊結(jié)構(gòu)。DNA文庫(kù):某一特定來(lái)源DNA通過細(xì)胞DNA克隆技術(shù)構(gòu)建呈含有所用DNA片段的重組DNA分子,并轉(zhuǎn)化至細(xì)菌內(nèi),構(gòu)成DNA文庫(kù)。依據(jù)DNA的來(lái)源不同,可分為,基因組DNA文庫(kù)和cDNA文庫(kù)。無(wú)義突變(nonsense mutation )是指由于某個(gè)堿基的改變使代表某種氨基酸的密碼子突變?yōu)榻K止密碼子,從而使肽鏈合成提前終止。

7、編碼氨基酸的密碼子突變?yōu)榻K止密碼子,使肽鏈合成中斷。沉默子也稱為沉默子元件,是真核基因中的一種特殊的序列,與增強(qiáng)子有許多類似之處。沉默子能夠同反式因子結(jié)合從而阻斷增強(qiáng)子及反式激活因子的作用,并最終抑制該基因的轉(zhuǎn)錄活性。在真核生物基因組中,絕緣子既是一種邊界元件,又是一種控制基因表達(dá)的調(diào)控元件。是一段具有特化染色質(zhì)結(jié)構(gòu)的區(qū)域,它能阻斷增強(qiáng)子或沉默子對(duì)靶基因/啟動(dòng)子的增強(qiáng)或失活作用效應(yīng),而且能保護(hù)兩個(gè)絕緣子間的基因免受任何外界因子的作用與影響。RNA加工mRNA的轉(zhuǎn)錄后加工: 加帽。即在mRNA的5'-端加上m7GTP的結(jié)構(gòu)。此過程發(fā)生在細(xì)胞核內(nèi),即對(duì)HnRNA進(jìn)行加帽。加工過程首先是在磷

8、酸酶的作用下,將5'-端的磷酸基水解,然后再加上鳥苷三磷酸,形成GpppN的結(jié)構(gòu),再對(duì)G進(jìn)行甲基化。 加尾。這一過程也是細(xì)胞核內(nèi)完成,首先由核酸外切酶切去3'-端一些過剩的核苷酸,然后再加入polyA。 剪接。真核生物中的結(jié)構(gòu)基因基本上都是斷裂基因。結(jié)構(gòu)基因中能夠指導(dǎo)多肽鏈合成的編碼順序被稱為外顯子,而不能指導(dǎo)多肽鏈合成的非編碼順序就被稱為內(nèi)含子。真核生物HnRNA的剪接一般需snRNA參與構(gòu)成的核蛋白體參加,通過形成套索狀結(jié)構(gòu)而將內(nèi)含子切除掉。RNA加工修飾3內(nèi)部甲基化。由甲基化酶催化,對(duì)某些堿基進(jìn)行甲基化處理。 tRNA的轉(zhuǎn)錄后加工: 主要加工方式是切斷和堿基修飾。RNA加

9、工修飾4真核生物tRNA前體一般無(wú)生物學(xué)特性,需要進(jìn)行加工修飾。加工過程包括:(1)剪切和拼接tRNA前體在tRNA剪切酶作用下,切成一定大小的分子。大腸桿菌RnaseP特異切割tRNA前體5旁側(cè)序列,3核酸內(nèi)切酶如RnaseF可將tRNA前體3端一段序列切下來(lái)。RnaseD可水解3端多余核甘酸。剪切后的tRNA分子在拼接酶作用下,將成熟tRNA分子所需片斷拼接起來(lái)。(2)稀有堿基的生成(3)加上CCA-OH3-末端:在核苷酸轉(zhuǎn)移酶的作用下,在3-末端刪去個(gè)別堿基后,換上tRNA統(tǒng)一的CCA-3-末端,完成柄環(huán)結(jié)構(gòu)。 rRNA的轉(zhuǎn)錄后加工:主要加工方式是切斷。rRNA的剪接不需要任何蛋白質(zhì)參與

10、即可發(fā)生,這就說(shuō)明了RNA本身即具有酶的催化作用。因而把具有酶促活性的RNA命名為核酶(ribozyme)。操縱子調(diào)控原核生物大多數(shù)基因表達(dá)調(diào)控是通過操縱子機(jī)制實(shí)現(xiàn)的。操縱子通常由 2個(gè)以上的編碼序列與啟動(dòng)序列、操縱序列以及其他調(diào)節(jié)序列在基因組中成簇串聯(lián)組成。啟動(dòng)序列是RNA聚合酶結(jié)合并啟動(dòng)轉(zhuǎn)錄的特異DNA序列。多種原核基因啟動(dòng)序列特定區(qū)域內(nèi),通常在轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)上游-10及-35區(qū)域存在一些相似序列,稱為共有序列。大腸桿菌及一些細(xì)菌啟動(dòng)序列的共有序列在-10區(qū)域是TATAAT,又稱Pribnow盒(PribnowBox),在-35區(qū)域?yàn)?TTGACA。這些共有序列中的任一堿基突變或變異都會(huì)影響R

11、NA聚合酶與啟動(dòng)序列的結(jié)合及轉(zhuǎn)錄起始。因此,與共有序列的一致度決定啟動(dòng)序列的轉(zhuǎn)錄活性大小。操縱序列是原核阻遏蛋白的結(jié)合位點(diǎn)。當(dāng)操縱序列結(jié)合阻遏蛋白時(shí)會(huì)阻礙RNA聚合酶與啟動(dòng)序列的結(jié)合,或使RNA聚合酶不能沿DNA向前移動(dòng),阻遏轉(zhuǎn)錄,介導(dǎo)負(fù)性調(diào)節(jié)。原核操縱子調(diào)節(jié)序列中還有一種特異DNA序列可結(jié)合激活蛋白,使轉(zhuǎn)錄激活,介導(dǎo)正性調(diào)節(jié)。原核和真核RNA聚合酶DNA復(fù)制DNA復(fù)制是指DNA雙鏈在細(xì)胞分裂以前進(jìn)行的復(fù)制過程,復(fù)制的結(jié)果是一條雙鏈變成兩條一樣的雙鏈(如果復(fù)制過程正常的話),每條雙鏈都與原來(lái)的雙鏈一樣。這個(gè)過程通過半保留復(fù)制機(jī)制得以順利完成。DNA復(fù)制主要包括引發(fā)、延伸、終止三個(gè)階段。 增強(qiáng)子

12、基本結(jié)構(gòu)和作用模式DNA復(fù)制的基本特征反義RNA是指與mRNA互補(bǔ)的RNA分子,也包括與其它RNA互補(bǔ)的RNA分子。由于核糖體不能翻譯雙鏈的RNA,所以反義RNA與mRNA特異性的互補(bǔ)結(jié)合, 即抑制了該mRNA的翻譯。根據(jù)反義RNA的作用機(jī)制可將其分為3類:類反義RNA直接作用于靶mRNA的S D序列和(或)部分編碼區(qū),直接抑制翻譯,或與靶mRNA結(jié)合形成雙鏈RNA,從而易被RNA酶 降解;類反義RNA與mRNA的非編碼區(qū)結(jié)合,引起mRNA構(gòu)象變化,抑制翻譯;類反義RNA則直接抑制靶mRNA的轉(zhuǎn)錄。轉(zhuǎn)錄過程的終止蛋白質(zhì)翻譯的過程及機(jī)制翻譯是蛋白質(zhì)生物合成(基因表達(dá)中的一部分,基因表達(dá)還包括轉(zhuǎn)錄)過程中的第一步,翻譯是根據(jù)遺傳密碼的中心法則,將成熟的信使RNA分子(由DNA通過轉(zhuǎn)錄而生成)中“堿基的排列順序”(核苷酸序列)解碼,并生成對(duì)應(yīng)的特定氨基酸序列的過程。但也有許多轉(zhuǎn)錄生成的RNA,如轉(zhuǎn)運(yùn)RNA、核糖體RNA和小核RNA等并不被翻譯為氨基酸

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