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表觀遺傳學(xué)專(zhuān)題知識(shí)表觀遺傳學(xué)專(zhuān)題知識(shí)第1頁(yè)一、DNA甲基化
DNA甲基化(DNAmethylation)是研究得最清楚、也是最主要表觀遺傳修飾形式,主要是基因組DNA上胞嘧啶第5位碳原子和甲基間共價(jià)結(jié)合,在空間上妨礙轉(zhuǎn)錄因子復(fù)合物與DNA結(jié)合。DNA甲基化普通與基因緘默相關(guān)聯(lián);非甲基化普通與基因活化相關(guān)聯(lián);而去甲基化往往與一個(gè)緘默基因重新激活相關(guān)聯(lián)。表觀遺傳學(xué)專(zhuān)題知識(shí)第2頁(yè)二、組蛋白修飾
組蛋白(histones)真核生物體細(xì)胞染色質(zhì)中堿性蛋白質(zhì),依據(jù)氨基酸成份和分子量不一樣,主要分成5類(lèi)H1、H2A、H2B、H3、H4,由4種組蛋白H2A、H2B、H3和H4,每一個(gè)組蛋白各二個(gè)分子,形成一個(gè)組蛋白八聚體,約200bpDNA分子盤(pán)繞在組蛋白八聚體組成關(guān)鍵結(jié)構(gòu)外面,形成了一個(gè)核小體。連接相鄰2個(gè)核小體DNA分子上結(jié)合了另一個(gè)組蛋白H1染色質(zhì)就是由一連串核小體所組成。表觀遺傳學(xué)專(zhuān)題知識(shí)第3頁(yè)二、組蛋白修飾表觀遺傳學(xué)專(zhuān)題知識(shí)第4頁(yè)二、組蛋白修飾組蛋白修飾是表觀遺傳研究主要內(nèi)容。組蛋白N端是不穩(wěn)定、無(wú)一定組織亞單位,其延伸至核小體以外,會(huì)受到不一樣化學(xué)修飾,這種修飾往往與基因表示調(diào)控親密相關(guān)。被組蛋白覆蓋基因假如要表示,首先要改變組蛋白修飾狀態(tài),使其與DNA結(jié)合由緊變松,這么靶基因才能與轉(zhuǎn)錄復(fù)合物相互作用。所以,組蛋白是主要染色體結(jié)構(gòu)維持單元和基因表示負(fù)控制因子。表觀遺傳學(xué)專(zhuān)題知識(shí)第5頁(yè)二、組蛋白修飾活化修飾:乙?;?,賴(lài)氨酸甲基化,絲氨酸磷酸化(Ac-K9,4H3/Me3-K4H3/P-S10H3)抑制修飾:賴(lài)氨酸甲基化(Me3-K9K3)表觀遺傳學(xué)專(zhuān)題知識(shí)第6頁(yè)二、組蛋白修飾組蛋白修飾種類(lèi)乙?;?-普通與活化染色質(zhì)構(gòu)型相關(guān)聯(lián),乙?;揎棿蠖喟l(fā)生在H3、H4Lys殘基上。甲基化--發(fā)生在H3、H4Lys和Asp殘基上,能夠與基因抑制相關(guān),也能夠與基因激活相關(guān),這往往取決于被修飾位置和程度。磷酸化--發(fā)生與Ser殘基,普通與基因活化相關(guān)泛素化--普通是C端Lys修飾,開(kāi)啟基因表示。SUMO(一個(gè)類(lèi)泛素蛋白)化--可穩(wěn)定異染色質(zhì)。其它修飾表觀遺傳學(xué)專(zhuān)題知識(shí)第7頁(yè)三、染色質(zhì)重塑染色質(zhì)修飾與重塑(共價(jià)修飾型與ATP依賴(lài)型)表觀遺傳學(xué)專(zhuān)題知識(shí)第8頁(yè)三、染色質(zhì)重塑(A)結(jié)合(B)松鏈(C)重塑八聚體轉(zhuǎn)移八聚體滑動(dòng)+ATP重塑復(fù)合物ATP依賴(lài)染色質(zhì)重構(gòu)機(jī)制染色質(zhì)重塑復(fù)合物依靠水解ATP提供能量來(lái)完成染色質(zhì)結(jié)構(gòu)改變,依據(jù)水解ATP亞基不一樣,可將復(fù)合物分為SWI/SNF復(fù)合物、ISW復(fù)合物等,這些復(fù)合物及相關(guān)蛋白均與轉(zhuǎn)錄激活和抑制、DNA甲基化、DNA修復(fù)及細(xì)胞周期相關(guān)。表觀遺傳學(xué)專(zhuān)題知識(shí)第9頁(yè)四、RNA調(diào)控RNA干擾(RNAi)作用是生物體內(nèi)一個(gè)經(jīng)過(guò)雙鏈RNA分子在mRNA水平上誘導(dǎo)特異性序列基因緘默過(guò)程。因?yàn)镽NAi發(fā)生在轉(zhuǎn)錄后水平,所以又稱(chēng)為轉(zhuǎn)錄后基因緘默(post-transcriptionalgenesilencing,PTGS)。RNA干擾是一個(gè)主要而普遍表觀遺傳現(xiàn)象。表觀遺傳學(xué)專(zhuān)題知識(shí)第10頁(yè)五、其它表觀遺傳機(jī)制除DNA甲基化、組蛋白修飾、染色質(zhì)重塑、和RNA調(diào)控以外,還有遺傳印跡、X染色體失活、等。遺傳印跡、X染色體失活本質(zhì)仍為DNA甲基化、組蛋白修飾、染色質(zhì)重塑。表觀遺傳學(xué)專(zhuān)題知識(shí)第11頁(yè)一、概述染色質(zhì)免疫沉淀技術(shù)(chromatinimmunoprecipitationassay,CHIP)是當(dāng)前唯一研究體內(nèi)DNA與蛋白質(zhì)相互作用方法。ChIP不但能夠檢測(cè)體內(nèi)反式因子與DNA動(dòng)態(tài)作用,還能夠用來(lái)研究組蛋白各種共價(jià)修飾與基因表示關(guān)系。應(yīng)用:表觀遺傳學(xué)專(zhuān)題知識(shí)第12頁(yè)二、原理檢測(cè)目標(biāo)基因活性在保持組蛋白和DNA聯(lián)合同時(shí),染色質(zhì)被切成很小片斷,經(jīng)過(guò)利用對(duì)應(yīng)于一個(gè)特定組蛋白標(biāo)識(shí)生物抗體,將目標(biāo)
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