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基因工程原理PrincipleofGeneEngineering第三章基因工程原理當(dāng)前1頁(yè),總共84頁(yè)。DNA重組(限制性內(nèi)切酶)運(yùn)輸工具——基因克隆載體目的基因的制備目的基因?qū)胧荏w細(xì)胞外源基因的表達(dá)基因工程的應(yīng)用當(dāng)前2頁(yè),總共84頁(yè)。第三章基因克隆載體克隆載體:一種具有特定功能的DNA分子,他們將攜帶外源DNA片段或基因進(jìn)入受體細(xì)胞,并使其在特定受體細(xì)胞中得以維持或表達(dá)。原核生物克隆載體真核生物克隆載體穿梭載體:是指含有兩個(gè)親緣關(guān)系不同的復(fù)制子,能在兩種不同的生物中復(fù)制的。例如既能在原核生物中復(fù)制,又能在真核生物中復(fù)制的載體。當(dāng)前3頁(yè),總共84頁(yè)。針對(duì)受體細(xì)胞的可轉(zhuǎn)移性自主復(fù)制功能:ori顯著的篩選標(biāo)記:抗藥性或顯色特定的多克隆位點(diǎn):RE位點(diǎn)安全性:不含對(duì)受體有害基因、不任意轉(zhuǎn)入其它細(xì)胞尤其是人體細(xì)胞第一節(jié)克隆載體的一般特征當(dāng)前4頁(yè),總共84頁(yè)。一、細(xì)菌質(zhì)粒載體第二節(jié)原核生物基因克隆載體——細(xì)菌質(zhì)粒載體是以細(xì)菌質(zhì)粒DNA分子為基礎(chǔ)構(gòu)建的克隆載體,主要用于外源基因片段的轉(zhuǎn)移、貯存、表達(dá)以及基因文庫(kù)的構(gòu)建等。當(dāng)前5頁(yè),總共84頁(yè)?!拗骷?xì)胞染色體外裸露的雙鏈DNA分子。(一)質(zhì)粒(Plasmid)組成與構(gòu)型1.質(zhì)粒構(gòu)型:共價(jià)閉合環(huán)型DNA(ccc-DNA)呈超螺旋SC構(gòu)型開(kāi)環(huán)DNA(oc-DNA)線性DNA(L-DNA)當(dāng)前6頁(yè),總共84頁(yè)。ccc-DNAl-DNAoc-DNA當(dāng)前7頁(yè),總共84頁(yè)。2.質(zhì)粒DNA分子大小當(dāng)前8頁(yè),總共84頁(yè)。3.質(zhì)粒的復(fù)制——嚴(yán)緊型質(zhì)粒:1個(gè)寄主內(nèi)僅含1-3拷貝——松弛型質(zhì)粒:1個(gè)寄主內(nèi)含10-60拷貝當(dāng)前9頁(yè),總共84頁(yè)。質(zhì)粒DNA復(fù)制:?jiǎn)蜗驈?fù)制,受宿主細(xì)胞和質(zhì)粒遺傳系統(tǒng)雙重控制,不會(huì)無(wú)限制復(fù)制。質(zhì)粒DNA復(fù)制控制機(jī)理的分子模型:自體阻遏蛋白質(zhì)模型(autorepressormodel)抑制蛋白質(zhì)稀釋模型(inhibitordilutionmodel)質(zhì)??刂疲篛ri序列拷貝數(shù):細(xì)胞內(nèi)某種質(zhì)粒的數(shù)量與染色體的數(shù)量之比。當(dāng)前10頁(yè),總共84頁(yè)。自體阻遏蛋白質(zhì)模型:質(zhì)粒DNA復(fù)制控制機(jī)理有兩種解釋解釋一:質(zhì)粒DNA的復(fù)制是由一種叫做起始蛋白質(zhì)Rep引發(fā)的。Rep蛋白質(zhì)編碼基因rep和自體阻遏蛋白質(zhì)編碼基因atr是屬于同一個(gè)操縱子,它們共轉(zhuǎn)錄成同一個(gè)mRNA分子。自體阻遏蛋白質(zhì)通過(guò)同啟動(dòng)子-操縱基因區(qū)(P/O)的結(jié)合作用,調(diào)節(jié)質(zhì)粒DNA的轉(zhuǎn)錄作用,以維持細(xì)胞中Atr和Rep蛋白質(zhì)處于恒定的水平。而后,由Atr蛋白質(zhì)調(diào)節(jié)產(chǎn)生的Rep蛋白質(zhì),則是通過(guò)同復(fù)制起點(diǎn)(ori)的結(jié)合,來(lái)引發(fā)質(zhì)粒DNA的復(fù)制[圖(a)]。當(dāng)前11頁(yè),總共84頁(yè)。自體阻遏蛋白質(zhì)模型:解釋二:Rep蛋白質(zhì)是一種具有雙重功能的蛋白質(zhì)。它既具有自體阻遏蛋白質(zhì)的功能,可同P/O區(qū)結(jié)合而抑制轉(zhuǎn)錄作用;同時(shí)又具有起始蛋白質(zhì)的功能,能對(duì)復(fù)制起點(diǎn)(ori)發(fā)生作用,引發(fā)質(zhì)粒DNA進(jìn)行復(fù)制[圖(b)]當(dāng)前12頁(yè),總共84頁(yè)。抑制蛋白質(zhì)稀釋模型:質(zhì)粒DNA的復(fù)制,是受一種由質(zhì)粒DNA編碼的抑制蛋白質(zhì)Cop調(diào)控的。細(xì)胞中Cop蛋白質(zhì)的濃度是同質(zhì)粒分子的拷貝數(shù)成正比。Cop抑制質(zhì)粒DNA復(fù)制活性的作用方式有兩種途徑:通過(guò)同質(zhì)粒DNA的復(fù)制起點(diǎn)(ori)結(jié)合,直接地抑制質(zhì)粒DNA的復(fù)制。通過(guò)阻斷起始蛋白質(zhì)Rep的合成,間接地抑制質(zhì)粒DNA的合成。當(dāng)前13頁(yè),總共84頁(yè)。——在沒(méi)有選擇壓力的情況下,兩種親緣關(guān)系密切的不同質(zhì)粒,不能在同一宿主細(xì)胞中穩(wěn)定地共存,這一現(xiàn)象叫質(zhì)粒不親和性。隨著細(xì)胞分裂質(zhì)粒分配到子細(xì)胞質(zhì)??截悢?shù)加倍兩種不相容質(zhì)粒的拷貝數(shù)變化4.質(zhì)粒的不親和性當(dāng)前14頁(yè),總共84頁(yè)。野生型與其衍生物通常屬于不親和質(zhì)粒,因此,受體細(xì)胞最好不含內(nèi)源質(zhì)粒當(dāng)前15頁(yè),總共84頁(yè)。接合型質(zhì)粒:含有tra基因的質(zhì)粒。F質(zhì)粒非接合型質(zhì)粒:不含tra基因的質(zhì)粒。ColE15.質(zhì)粒遷移——轉(zhuǎn)移性質(zhì)??稍诩?xì)胞間轉(zhuǎn)移,并能帶動(dòng)染色體發(fā)生轉(zhuǎn)移的現(xiàn)象。構(gòu)建克隆載體的一般是非接合型質(zhì)粒當(dāng)前16頁(yè),總共84頁(yè)。顯性質(zhì)粒:能使宿主細(xì)胞表現(xiàn)出質(zhì)粒所攜帶的性狀。如:隱蔽質(zhì)粒:不會(huì)賦予宿主細(xì)胞新性狀的質(zhì)粒為隱性質(zhì)粒。6.顯性質(zhì)粒和隱蔽質(zhì)??剐再|(zhì)粒(R質(zhì)粒),抗Amp(Ap)、抗Cmp(Cm)、抗Kan(Km)、抗Tet(Tc)等育性質(zhì)粒(F質(zhì)粒)降解質(zhì)粒:降解農(nóng)藥Ti質(zhì)粒:形成冠癭瘤當(dāng)前17頁(yè),總共84頁(yè)。(二)構(gòu)建質(zhì)粒克隆載體的策略含有有效的質(zhì)粒復(fù)制起始位點(diǎn)(ori)含有外源DNA片段克隆位點(diǎn)含有標(biāo)記基因載體DNA分子盡可能小特殊需要的元件:強(qiáng)啟動(dòng)子、終止子…當(dāng)前18頁(yè),總共84頁(yè)。(三)質(zhì)粒載體的構(gòu)建選擇合適的出發(fā)質(zhì)粒:ori,選擇標(biāo)記、克隆位點(diǎn)、啟動(dòng)子、終止子……正確獲得構(gòu)建質(zhì)粒載體的元件組裝合適的選擇標(biāo)記基因選用合適的啟動(dòng)子構(gòu)建過(guò)程簡(jiǎn)單1.質(zhì)粒載體的構(gòu)建原則當(dāng)前19頁(yè),總共84頁(yè)。pBR322質(zhì)粒的結(jié)構(gòu)特征:大?。?363bp具有ColE1拷貝復(fù)制子選擇標(biāo)記:Amp,Tet24種限制性核酸內(nèi)切酶單一位點(diǎn)
BamHI等導(dǎo)致Tet插入失活
PstI等導(dǎo)致Amp插入失活可以克隆10kb以下外源DNA片段2.大腸桿菌質(zhì)??寺≥d體pBR322當(dāng)前20頁(yè),總共84頁(yè)。啟動(dòng)子區(qū)當(dāng)前21頁(yè),總共84頁(yè)。啟動(dòng)子:Promotor,DNA分子上能與RNA聚合酶結(jié)合并形成轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合體的區(qū)域,在許多情況下,還包括促進(jìn)這一過(guò)程的調(diào)節(jié)蛋白的結(jié)合位點(diǎn)。當(dāng)前22頁(yè),總共84頁(yè)。Pribnowbox5’-AGGAGG-3’SD序列當(dāng)前23頁(yè),總共84頁(yè)。pBR322質(zhì)??寺≥d體構(gòu)建:當(dāng)前24頁(yè),總共84頁(yè)。pBR322質(zhì)粒載體的結(jié)構(gòu)來(lái)源優(yōu)點(diǎn):分子量小2個(gè)選擇標(biāo)記及若干個(gè)插入失活位點(diǎn)高拷貝數(shù)Apr缺點(diǎn):負(fù)篩選當(dāng)前25頁(yè),總共84頁(yè)。①pUC質(zhì)粒載體的結(jié)構(gòu)特點(diǎn)pBR322的復(fù)制起點(diǎn)Amp標(biāo)記大腸桿菌β-半乳糖苷酶基因LacZ的啟動(dòng)子、調(diào)節(jié)因子及編碼α-肽鏈的DNA序列——LacZ’在LacZ’的5‘端有1段多克隆位點(diǎn)(MCS)區(qū)段。3.質(zhì)??寺≥d體pUC18/19當(dāng)前26頁(yè),總共84頁(yè)。當(dāng)前27頁(yè),總共84頁(yè)。當(dāng)前28頁(yè),總共84頁(yè)。pUC質(zhì)粒載體的優(yōu)點(diǎn)——具有更小的分子量和更高的拷貝數(shù)pUC18/19的分子量2.69kb——具有多克隆位點(diǎn):多種粘性末端的切點(diǎn)——篩選方便:藍(lán)/白菌落當(dāng)前29頁(yè),總共84頁(yè)。當(dāng)前30頁(yè),總共84頁(yè)。pBR322質(zhì)粒是人工構(gòu)建的一種較為理想的大腸桿菌質(zhì)粒載體,分子大小為(4.3kb),具有松弛型復(fù)制子,選擇標(biāo)記為(Amp)和(Tet)。就克隆一個(gè)基因(DNA片段)來(lái)說(shuō),最簡(jiǎn)單的質(zhì)粒載體也必需包括三個(gè)部分:(復(fù)制區(qū):含有復(fù)制起點(diǎn));(選擇標(biāo)記:主要是抗性基因);(克隆位點(diǎn):便于外源DNA的插入)。另外,一個(gè)理想的質(zhì)粒載體必須具有低分子量。載體的功能是(d)(a)外源基因進(jìn)入受體的搭載工具(b)不能為外源基因提供整合能力(c)不能提供復(fù)制能力(d)不能為外源基因提供表達(dá)能力基因工程中所用的質(zhì)粒載體大多是改造過(guò)的,真正的天然質(zhì)粒載體很少,在下列載體中只有(a)被視為用作基因工程載體的天然質(zhì)粒載體(a)pSCl01(b)pBR322(c)pUBll0(d)pUCl8當(dāng)前31頁(yè),總共84頁(yè)。第七次課結(jié)束!當(dāng)前32頁(yè),總共84頁(yè)。4.TA載體TTAA當(dāng)前33頁(yè),總共84頁(yè)。當(dāng)前34頁(yè),總共84頁(yè)。5.質(zhì)粒表達(dá)載體——表達(dá)載體是在克隆載體的基礎(chǔ)上增加了表達(dá)元件構(gòu)建而成的,在受體細(xì)胞內(nèi)能穩(wěn)定維持并表達(dá)外源目的基因。當(dāng)前35頁(yè),總共84頁(yè)。lac啟動(dòng)子表達(dá)系統(tǒng)當(dāng)前36頁(yè),總共84頁(yè)。質(zhì)粒表達(dá)載體融合型表達(dá)載體非融合型表達(dá)載體分泌型表達(dá)載體當(dāng)前37頁(yè),總共84頁(yè)。融合蛋白質(zhì)克隆載體克隆外源基因示意圖融合蛋白表達(dá)載體:融合蛋白:由克隆在一起的兩個(gè)或數(shù)個(gè)不同基因的編碼序列組成的融合基因轉(zhuǎn)移產(chǎn)生的單一的多肽序列。當(dāng)前38頁(yè),總共84頁(yè)。表達(dá)融合體蛋白質(zhì)策略的優(yōu)點(diǎn):(1)克隆的外源基因能有效轉(zhuǎn)譯。(2)表達(dá)的蛋白質(zhì)穩(wěn)定。(3)可以加入信號(hào)肽,定位輸送蛋白質(zhì)。(4)利于分離純化。當(dāng)前39頁(yè),總共84頁(yè)。非融合蛋白表達(dá)載體:當(dāng)前40頁(yè),總共84頁(yè)。二、噬菌體克隆載體λDNA:——在噬菌體中是線狀DNA分子,進(jìn)入寄主細(xì)胞后呈環(huán)狀DNA分子?!L(zhǎng)48kb?!笥覂啥烁饔?2bp組成的彼此完全互補(bǔ)的粘性末端。形成cos位點(diǎn)?!?1個(gè)基因,其中1/2參與了噬菌體生命周期,是必要基因,另1/2屬于不必要基因,用于基因工程操作。當(dāng)前41頁(yè),總共84頁(yè)。相關(guān)概念:溶菌生命周期:噬菌體吸附到寄主細(xì)胞表面后,注入DNA進(jìn)行復(fù)制及蛋白質(zhì)合成,并組裝成子代噬菌體顆粒后,使寄主細(xì)胞破裂,釋放出來(lái)的過(guò)程。溶原生命周期:在感染過(guò)程中沒(méi)有產(chǎn)生出子代噬菌體顆粒,噬菌體DNA整合到寄主細(xì)胞染色體上,隨著染色體的復(fù)制而復(fù)制的過(guò)程。溫和噬菌體:能進(jìn)入溶原周期和溶菌周期的噬菌體。烈性噬菌體:具有溶菌生命周期的噬菌體。溶原性細(xì)菌:帶有溫和噬菌體的細(xì)菌。當(dāng)前42頁(yè),總共84頁(yè)。溶原性噬菌體的生命周期a:噬菌體吸附到寄主細(xì)胞表面;b:噬菌體DNA注入寄主細(xì)胞;c:噬菌體大量增殖d:子代噬菌體顆粒組裝;e:寄主細(xì)胞溶菌;f:噬菌體DNA從寄主染色體DNA上刪除下來(lái);g:溶原性細(xì)胞按照正常速率分裂。當(dāng)前43頁(yè),總共84頁(yè)。1.與構(gòu)建載體相關(guān)的λ噬菌體性質(zhì)基因按功能相近性聚集成簇:左側(cè)區(qū):A-J,合成頭尾蛋白的全部基因中間區(qū):J-N,非必要區(qū),與重組有關(guān)右側(cè)區(qū):N-R,DNA合成及調(diào)控。當(dāng)前44頁(yè),總共84頁(yè)。G+C=10A+T=2cos位點(diǎn):cohesive-endsite粘性末端位點(diǎn)線性雙鏈DNA分子兩端各有1條由12個(gè)核苷酸組成的完全互補(bǔ)的5'單鏈突出序列,即粘性末端。注入到寄主細(xì)胞內(nèi)的線性DNA分子會(huì)迅速的通過(guò)粘性末端之間的互補(bǔ)作用,形成環(huán)狀雙鏈DNA分子。然后在DNA連接酶的作用下,將相鄰的5'—P和3'—OH基團(tuán)封閉起來(lái),進(jìn)一步超盤(pán)旋化,這種由粘性末端結(jié)合形成的雙鏈DNA區(qū)域稱為cos位點(diǎn)。當(dāng)前45頁(yè),總共84頁(yè)。2.λ噬菌體作為構(gòu)建克隆載體的依據(jù)λ噬菌體是一種溫和噬菌體能承載比較大的外源DNA片段存在多個(gè)限制性位點(diǎn)當(dāng)前46頁(yè),總共84頁(yè)。3.構(gòu)建λ噬菌體克隆載體的基本策略和路線用限制酶切去λDNA上的非必需區(qū)在λDNA的非必需區(qū)內(nèi)組入選擇性標(biāo)構(gòu)建重組λDNA分子體外包裝系統(tǒng)當(dāng)前47頁(yè),總共84頁(yè)。噬菌體的包裝:當(dāng)前48頁(yè),總共84頁(yè)。體外包裝:在離體條件下,用噬菌體或病毒的蛋白質(zhì)包裹噬菌體或病毒的裸核酸,組裝成有感染性的噬菌體或病毒顆粒的過(guò)程。當(dāng)前49頁(yè),總共84頁(yè)。λDNA分子體外包裝系統(tǒng)的建立E基因:λ噬菌體的E基因編碼頭部基因的主要成分(占頭部總蛋白的70%)D基因:λ噬菌體的D基因也編碼頭部蛋白,但主要與λDNA進(jìn)入頭部和頭部的成熟有關(guān)(占20%)當(dāng)前50頁(yè),總共84頁(yè)。當(dāng)前51頁(yè),總共84頁(yè)。當(dāng)前52頁(yè),總共84頁(yè)。4.λ噬菌體DNA的包裝限制問(wèn)題包裝能力:λDNA×75%——λDNA×105%,即從36kb——51kb野生型λDNA的必要區(qū)是28kb,所以能加入的外源DNA長(zhǎng)度最大為51kb-28kb=23kb。實(shí)際為15kb。若λ基因組缺失大于25%時(shí),也不能有效包裝。當(dāng)前53頁(yè),總共84頁(yè)。轉(zhuǎn)染作用(transfection):寄主細(xì)胞捕獲噬菌體DNA的過(guò)程。或重組噬菌體DNA分子感染并進(jìn)入大腸桿菌的過(guò)程。轉(zhuǎn)導(dǎo)作用(transduction):以噬菌體顆粒為媒介轉(zhuǎn)移遺傳物質(zhì)的過(guò)程。轉(zhuǎn)化作用(transformation):將質(zhì)粒等外源DNA引入細(xì)胞的過(guò)程。5.λ噬菌體克隆載體的應(yīng)用——構(gòu)建cDNA文庫(kù)細(xì)菌質(zhì)粒載體:是以細(xì)菌質(zhì)粒DNA分子為基礎(chǔ)構(gòu)建的克隆載體,主要用于外源基因片段的轉(zhuǎn)移、貯存、表達(dá)以及基因文庫(kù)的構(gòu)建等。當(dāng)前54頁(yè),總共84頁(yè)。三、Cosmid載體(cossite-carryingplasmid)(一)Cosmid載體的特征環(huán)形雙鏈DNA分子,大小一般在10kb以下具有質(zhì)粒的性質(zhì)含有一個(gè)cos位點(diǎn):cohesive-endsite粘性末端位點(diǎn)能承載較大的外源DNA片段——一類(lèi)由人工構(gòu)建的含有λDNA的cos序列和質(zhì)粒復(fù)制子的特殊類(lèi)型的質(zhì)粒載體。當(dāng)前55頁(yè),總共84頁(yè)。
克隆能力:31—45kbpBR322(6524bp)λDNA:cos序列和控制包裝序列pBR322質(zhì)粒的復(fù)制子抗藥性基因多克隆位點(diǎn)區(qū)當(dāng)前56頁(yè),總共84頁(yè)。(二)Cosmid載體的應(yīng)用程序應(yīng)用柯斯質(zhì)粒載體,在大腸桿菌細(xì)胞中克隆大片段的真核基因組DNA技術(shù),叫做柯斯克?。╟osmidcloning)??寺∵M(jìn)柯斯載體包裝進(jìn)噬菌體感染大腸桿菌選擇轉(zhuǎn)化子當(dāng)前57頁(yè),總共84頁(yè)。進(jìn)行λDNA體外包裝時(shí),選擇E基因突變的λ噬菌體,能夠使溶菌物中積累了大量的(尾部蛋白),而利用D基因突變的λ噬菌體,產(chǎn)生大量的(頭部蛋白),把這兩種溶菌物和重組DNA混合起來(lái),將重組λDNA包裝起來(lái)。 重組在λ噬菌體載體上的DNA分子轉(zhuǎn)導(dǎo)大腸桿菌的過(guò)程包括:制備包裝物,然后進(jìn)行(體外包裝),侵染(大腸桿菌),并篩選(重組體)噬菌斑??滤官|(zhì)粒(cosmid)是質(zhì)?!删w雜合載體,它的復(fù)制子來(lái)自(質(zhì)粒)、COS位點(diǎn)序列來(lái)自(噬菌體),最大的克隆片段達(dá)到(45)kb。噬菌體載體由于受到包裝的限制,插入外源DNA片段后,總的長(zhǎng)度應(yīng)在噬菌體基因組的(75%~105%)的范圍內(nèi)。下列哪種克隆載體對(duì)外源DNA的容載量最大?(b)(a)質(zhì)粒(b)cosmid(c)λ噬菌體載體(d)cDNA表達(dá)載體(e)pUC質(zhì)粒當(dāng)前58頁(yè),總共84頁(yè)。第八次課結(jié)束!當(dāng)前59頁(yè),總共84頁(yè)。四、藍(lán)藻基因克隆載體(一)藍(lán)藻質(zhì)粒表達(dá)載體pPEK2的構(gòu)建出發(fā)質(zhì)粒:藍(lán)藻pPbS和pBR322當(dāng)前60頁(yè),總共84頁(yè)。(二)藍(lán)藻染色體定位整合載體的構(gòu)建當(dāng)前61頁(yè),總共84頁(yè)。第三節(jié)酵母基因克隆載體1.2μm質(zhì)粒當(dāng)前62頁(yè),總共84頁(yè)。當(dāng)前63頁(yè),總共84頁(yè)。2.YEp24(酵母游離型質(zhì)粒)載體出發(fā)質(zhì)粒:酵母2mm質(zhì)粒和pBR322當(dāng)前64頁(yè),總共84頁(yè)。ura3基因:尿嘧啶合成缺陷型基因酵母V號(hào)染色體上的一個(gè)基因,系統(tǒng)命名號(hào)為YEL021W,編碼乳清苷5-磷酸脫羧酶,是酵母RNA嘧啶核苷酸合成過(guò)程中關(guān)鍵酶。應(yīng)用方式:(2)陰性選擇:乳清苷5-磷酸脫羧酶正常(1)陽(yáng)性選擇:乳清苷5-磷酸脫羧酶缺陷轉(zhuǎn)入ura3基因,培養(yǎng)基中加入尿苷或尿嘧啶,缺陷株生長(zhǎng)。5-氟乳清酸5-氟尿嘧啶,乳清苷5-磷酸脫羧酶細(xì)胞死亡當(dāng)前65頁(yè),總共84頁(yè)。Ti質(zhì)粒(Tumorinducingplasmid)——存在于植物的土壤致癌農(nóng)桿菌中,誘發(fā)植物產(chǎn)生冠癭瘤的質(zhì)粒。分為4種類(lèi)型:一、農(nóng)桿菌Ti質(zhì)粒載體章魚(yú)堿型胭脂堿型琥珀堿型農(nóng)桿堿型第四節(jié)植物基因克隆載體(一)農(nóng)桿菌Ti質(zhì)粒當(dāng)前66頁(yè),總共84頁(yè)。Ti質(zhì)粒是根癌農(nóng)桿菌染色體以外的遺傳物質(zhì)雙鏈閉合環(huán)型DNA200-250kb結(jié)構(gòu)分為4個(gè)功能區(qū):
(Vir區(qū))(Con區(qū))T-DNA區(qū)Vir區(qū)Con區(qū)Ori區(qū)當(dāng)前67頁(yè),總共84頁(yè)。(Vir區(qū))(Con區(qū))長(zhǎng)度25kb,占Ti質(zhì)粒1/10主要功能是轉(zhuǎn)移DNA,隨機(jī)插入植物染色體中。——天然的質(zhì)??寺≥d體。含有2類(lèi)基因:(1)編碼冠癭堿合成酶(ocs、nos)及分解代謝的基因。(2)誘發(fā)腫瘤基因(Onc)Vir區(qū):激活T-DNA轉(zhuǎn)移,使農(nóng)桿菌表現(xiàn)出毒性。占Ti質(zhì)粒1/3。Con區(qū)——調(diào)控Ti質(zhì)粒在農(nóng)桿菌之間的轉(zhuǎn)移,含有與細(xì)菌間接合轉(zhuǎn)移的有關(guān)基因tra。Ori區(qū)——復(fù)制起始區(qū)。當(dāng)前68頁(yè),總共84頁(yè)。(二)農(nóng)桿菌Ti質(zhì)粒克隆載體的構(gòu)建取代型Ti質(zhì)粒載體的構(gòu)建當(dāng)前69頁(yè),總共84頁(yè)。第五節(jié)動(dòng)物基因克隆載體一、SV40克隆載體二、逆轉(zhuǎn)錄病毒基因載體三、腺病毒基因載體四、豆苗病毒基因載體五、桿狀病毒表達(dá)載體當(dāng)前70頁(yè),總共84頁(yè)。SV40克隆載體:猿猴空泡病毒405243bp當(dāng)前71頁(yè),總共84頁(yè)。一、酵母人工染色體(YAC)的構(gòu)建第六節(jié)人工染色體載體利用酵母著絲粒載體所構(gòu)建的大片段DNA克隆??寺≥d體上含有著絲粒、端粒、可選擇標(biāo)志基因、自主復(fù)制等序列,可攜帶插入的大片段DNA(100~1000kb)在酵母細(xì)胞中有效地復(fù)制,如同微小的人工染色體。是基因組研究的有用工具。當(dāng)前72頁(yè),總共84頁(yè)。TEL:酵母染色體DNA端粒ARS:DNA復(fù)制起點(diǎn)CEN:著絲粒應(yīng)用:構(gòu)建人類(lèi)和高等生物的基因組文庫(kù)選擇標(biāo)記his3:組氨酸合成缺陷型基因Trp1:色氨酸合成缺陷型基因ura3:尿嘧啶合成缺陷型基因sup4:赭石突變抑制基因第二受體克隆子篩選標(biāo)記第一受體克隆子篩選標(biāo)記:抗生素當(dāng)前73頁(yè),總共84頁(yè)。某一突變基因的表型效應(yīng)由于第二個(gè)突變基因的出現(xiàn)而恢復(fù)正常時(shí),稱后一突變基因?yàn)榍罢叩囊种苹?。回?fù)突變使突變基因的脫氧核糖核酸(DNA)分子結(jié)構(gòu)恢復(fù)正常;抑制基因則并不改變突變基因的DNA分子結(jié)構(gòu),而只是使突變型的表型恢復(fù)正常。抑制基因一般用符號(hào)Su代表。無(wú)義抑制基因的種類(lèi):琥珀型抑制基因:UAG赭石型抑制基因:UAA乳白型抑制基因:UGA、UAG當(dāng)前74頁(yè),總共84頁(yè)。酵母人工染色體(YAC)的應(yīng)用酵母人工染色體(YAC)的局限性構(gòu)建基因組文庫(kù)存在插入子的穩(wěn)定性問(wèn)題。同一酵母細(xì)胞內(nèi)多個(gè)YAC引起交換轉(zhuǎn)化效率低。難以制備純的YAC-DNA(因結(jié)合組蛋白)。當(dāng)前75頁(yè),總共84頁(yè)。二、細(xì)菌人工染色體載體(BAC)利用大腸桿菌F質(zhì)?;騊1噬菌體為基礎(chǔ)構(gòu)建的用于在大腸桿菌中克隆大片段DNA(100~350kb)的載體。用于基因組結(jié)構(gòu)的分析。當(dāng)前76頁(yè),總共84頁(yè)。特點(diǎn):
帶有外源DNA的BAC載體在細(xì)胞中是單拷貝的;
載體分子量很小(7.4kb);
選擇標(biāo)記:氯霉素抗性基因;
多克隆位點(diǎn)。當(dāng)前77頁(yè),總共84頁(yè)。BAC的優(yōu)點(diǎn):BAC的優(yōu)點(diǎn):1.BAC復(fù)制子來(lái)源于F因子:穩(wěn)定性好2.宿主為大腸桿菌3.體外操作簡(jiǎn)單4.容易構(gòu)建5.篩選方便6.克隆位點(diǎn)兩側(cè)含有T7和Sp6聚合酶啟動(dòng)子,可用于轉(zhuǎn)錄獲得RNA探針獲直接
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