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1、短鏈peptides的定義含有數(shù)個(gè)至數(shù)十個(gè)胺基酸者,稱為peptide 或polypeptide;百個(gè)以上者可稱蛋白質(zhì),至於其間的模糊地帶,稱蛋白質(zhì)或多汰均可。另一方面,很多胺基酸也有生理作用,例如味素的成分是麩胺酸,也是神經(jīng)傳導(dǎo)物質(zhì)的一種;而色胺酸有安眠的作用,牛奶中含有很多色胺酸(9)。有許多peptides已經(jīng)具有生理功能,而且作用強(qiáng)大。這些peptides的合成方式都不盡相同,有些是經(jīng)過蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)譯後切下來的片段,有些是要用酵素把一個(gè)一個(gè)胺基酸接上去的。它們的基本作用機(jī)制都很相似,都是以該peptides所組成的特殊立體構(gòu)形,與目標(biāo)細(xì)胞膜上的接受體結(jié)合,進(jìn)而對(duì)細(xì)胞產(chǎn)生作用。下列為一些具生
2、理功能peptides的實(shí)例(9):1. 腦啡Enkephalin(YGGFM)2. 代糖L-Aspartame(L-ASP-Phe-CH3)3. 短鏈荷爾蒙Oxytocin, Vasopressin4. 抗生素Gramicidin S(含D-amino acid)短鏈peptides最值得重視的生理功能即為它們具有抗菌功能,有人將這些peptides稱為peptides抗生素。peptides抗生素是指相對(duì)分子量通常在1×104以下,具有抗菌活性的peptides。但是由於區(qū)分peptides與蛋白質(zhì)的界限不很嚴(yán)格,不同學(xué)者對(duì)peptides抗生素的分子量上限有不同的觀點(diǎn)(10)。
3、抗菌性peptides的發(fā)現(xiàn)peptides抗生素研究的真正源起是從20世紀(jì)80年代初期始的。1980年,Boman等人從美國(guó)天蠶蛹中分離得到了具有抗菌活性的peptidececropins,並於次年在Nature上公布了其氨基酸序列。同是在1980年人Lefur等人從兔的巨噬細(xì)胞中分離到了另一種peptides抗生素defensins。並於3年後公布了其氨基酸序列。此後數(shù)年間,人們相繼從細(xì)菌、真菌,到兩棲類、昆蟲、高等植物、哺乳動(dòng)物、直至人類體內(nèi),發(fā)現(xiàn)了peptides抗生素。目前,昆蟲來源的peptides抗生素,就已達(dá)170餘種(10)。為什麼生物體要製造抗菌性peptides地球最早演
4、變時(shí)有微生物存在,而後才有動(dòng)植物,也就是動(dòng)植物要有防禦系統(tǒng)來避免和克服病原菌的感染,才得以存活,其中包括抗菌peptides的產(chǎn)生。由於許多這類peptides於試管內(nèi)顯示可以對(duì)抗已對(duì)傳統(tǒng)抗生素有抗性的微生物,他們可能提供了抗感染藥劑的設(shè)計(jì)模版,如此這種peptides將會(huì)對(duì)目前抗性微生物增多導(dǎo)致傳統(tǒng)抗生素效力下降的情形有所助益,同時(shí)也可能發(fā)展抗病轉(zhuǎn)基因動(dòng)植物。動(dòng)植物抗菌peptides通常是陽性分子,由12至45個(gè)胺基酸組成,這種peptides可能原本存在於體內(nèi)或感染受傷後才製造出來,一些呈-螺旋狀結(jié)構(gòu),一些則為分子內(nèi)胱胺酸(Cystine)雙硫鍵穩(wěn)定化的-層元件。屬-螺旋peptides
5、者,Boman首先發(fā)現(xiàn)蠶蛹中的抗菌peptideCecropins,但類似此peptides的物質(zhì)不僅存在於其他昆蟲綱,亦發(fā)現(xiàn)在豬腸和海洋生物中。-層結(jié)構(gòu)的抗菌peptides在許多動(dòng)植物中產(chǎn)生,某些為抗真菌和抗細(xì)菌的物質(zhì);某些能在高鹽環(huán)境中維持其活性,如Protegrins和Tachyplesins在血液和組織液中。脊椎動(dòng)物產(chǎn)生的Defensins含29至40個(gè)胺基酸,因Cysteines的位置和結(jié)合性不同分為-和-Defensins。四種-Defensins貯存在嗜中性白血球中防禦微生物的侵入,-Defensins中HBD-1由上皮細(xì)胞產(chǎn)生流入全身,主要在腎和女性生殖道存在;另一HBD-2
6、由發(fā)炎皮膚製造。植物特有的抗菌peptides Thionins約為5KDa,Drosomycin為在果蠅中發(fā)現(xiàn)的抗真菌peptides(8)??咕詐eptides的作用機(jī)制不同抗菌及抗微生物peptides對(duì)於不同的目標(biāo)生物作用機(jī)制不盡相同,簡(jiǎn)單介紹如下:抗菌及抗微生物peptides殺菌的機(jī)制peptides吸附於脂膜表面,產(chǎn)生延展表面的張力,使脂膜變薄,當(dāng)peptides濃度超過臨界值,peptides 會(huì)裂開脂膜,形成孔洞,使微生物及細(xì)菌的新陳代謝失調(diào)而死亡(11)。真菌的作用許多peptides除了具有抗細(xì)菌的活性外,還具有抗真菌的作用。如兔defensinNp-1對(duì)玉米的致病真菌
7、也有作用。一些來源於植物的peptides,如植物defensi11s、thionins等對(duì)多種植物致病真菌具有殺傷作用。最近,Cavallarin等發(fā)現(xiàn)cecropin衍生物N末端螺旋區(qū)域的11個(gè)氨基酸順序與抗真菌活力有關(guān)(10)。 抗菌及抗微生物peptides對(duì)原蟲的作用一些peptides可以有效地殺死寄生於人類或動(dòng)物的寄生蟲。如5hiva-1(一種ce-cropin的類似物)可以殺死瘧原蟲;一種cecropinmelittin的雜合肽可以殺傷萊什曼鞭毛蟲(10)。 抗菌及抗微生物peptides對(duì)病毒的作用目前發(fā)現(xiàn)抗微生物peptides以3種不同的機(jī)制抗病毒。第1種是通過抗微生物p
8、eptides直接與病毒粒子相結(jié)合而發(fā)揮作用。如-defensins、mode1in-1等對(duì)皰疹病毒的作用,polyphemusins對(duì)HIV病毒的作用。第2種是抑制病毒的繁殖,如mellitin和cecropin A對(duì)HIV病毒的作用。第3種機(jī)制是通過模仿病毒的侵染過程而起作用。如me1ititn及其類似物K71的結(jié)構(gòu)與煙草花病毒核外殼與mRNA相互作用的區(qū)域具有相似性,通過干擾病毒的組裝而對(duì)病毒產(chǎn)生作用(10)。 抗菌及抗微生物peptides對(duì)癌細(xì)胞的作用許多研究顯示與正常細(xì)胞相比,腫瘤細(xì)胞對(duì)peptides更敏感,目前對(duì)引起這種差別的原因還不完全清楚,初步認(rèn)為與以下幾個(gè)因素有關(guān):由於腫
9、瘤細(xì)胞的高代謝引起細(xì)胞膜電位的改變;腫瘤細(xì)胞膜外表面含有更高的酸性磷脂;腫瘤細(xì)胞的細(xì)胞骨架或胞外基質(zhì)的變化。目前已經(jīng)發(fā)現(xiàn)cecropin及其類似物,magainin2及其類似物,cecropinA一magainin2,cecropinA-melittin雜合肽及其類似物都對(duì)腫瘤細(xì)胞具有選擇性殺傷作用(10)??刮⑸锏膒eptides在動(dòng)物防禦系統(tǒng)的角色動(dòng)物每天可能藉由接觸、吞嚥及吸入而曝露於百萬個(gè)潛伏的病源菌中,他們藉由先天性的免疫機(jī)制避免受到感染,細(xì)胞性免疫系統(tǒng)並不會(huì)在動(dòng)物一開始遭遇病源菌即被觸發(fā),以擔(dān)任抵禦感染之責(zé),所以近十年來發(fā)現(xiàn)cationic antimicrobial pepti
10、des在防禦微生物的重要性與抗體、免疫細(xì)胞、吞噬細(xì)胞相同。以果蠅為例,cationic antimicrobial peptides是主要對(duì)抗細(xì)菌或lipopolysacchride的型式,且調(diào)控機(jī)制與哺乳類免疫系統(tǒng)相似,均由Toll receptors及NFB參與(1)。cationic antimicrobial peptides是由12至50個(gè)氨基酸所組成,其中約百分之五十為疏水性氨基酸,由於lysine與arginine的緣故,所以帶有兩個(gè)以上之正電。cationic antimicrobial peptides普遍出現(xiàn)於所有生物體中,包括:植物、昆蟲、軟體動(dòng)物、甲殼類、兩棲類、魚類、
11、鳥類、哺乳類及人類,已經(jīng)有超過五百種此類peptide被發(fā)現(xiàn)。它們的結(jié)構(gòu)上至少分為四大類。這些peptides的作用對(duì)象廣泛,能殺死或中和革蘭氏陽性及陰性細(xì)菌、真菌、寄生蟲、腫瘤細(xì)胞及病毒,它們會(huì)選擇性地作用於微生物而非真核細(xì)胞,但也不是所有的peptides都具有上述全部之功能,例如:indolicidin這種具13個(gè)氨基酸的peptide即具有殺死細(xì)菌、真菌及HIV之能力(1)??刮⑸飌eptides常見於會(huì)直接與病原菌接觸的部位,如:眼、耳、皮膚、及上皮表面(包括舌頭、氣管、肺、腸道、骨髓及睪丸),而且它們也是嗜中性球中最普遍的蛋白質(zhì)型式,可與嗜苯銨鹽顆粒球共同作用以組成非氧化性的抗菌
12、毒殺系統(tǒng)(1)。動(dòng)物的黏膜表層覆蓋著上皮組織以對(duì)抗微生物、物理及機(jī)械性的傷害,這樣的第一道防線主要組成份子為黏液素、其他的醣蛋白、蛋白質(zhì)酵素抑制物以及cationic peptides,健康的上皮細(xì)胞-defensin基因會(huì)少量表現(xiàn),有些defensin基因能在施以proinflammatory cytokines、LPS或細(xì)菌時(shí)被誘導(dǎo),例如:人體在keratinocytes製造的-defensin(HBD)-2會(huì)在keratinocytes與革蘭氏陰性菌或是proinflammatory cytokines(如腫瘤壞死因子及IL-1)接觸時(shí)被強(qiáng)烈地誘導(dǎo),HBD-2 mRNA表現(xiàn)於皮膚、包皮、
13、肺、氣管但不會(huì)在腎臟、唾腺、小腸和肝臟表現(xiàn)。但HBD-1就主要在泌尿道及腎臟持續(xù)性地表現(xiàn)。其他產(chǎn)生於上皮細(xì)胞可誘導(dǎo)性的-defensin還包含了有:分離自牛呼吸道黏膜的氣管抗微生物peptide(TAP)、舌狀的抗微生物peptide以及腸道的-defensin;TAP在呼吸道的圓柱狀上皮細(xì)胞所表現(xiàn),其mRNA在與LPS反應(yīng)時(shí)大幅表現(xiàn)。因?yàn)橛衪ranscription factor NFB和Toll receptors的參與證實(shí)了人類上皮細(xì)胞產(chǎn)生之HBD-2與植物及昆蟲的始祖防禦機(jī)制相似;當(dāng)上皮細(xì)胞遇上了曾經(jīng)接觸過的微生物,這樣的防禦機(jī)制便會(huì)產(chǎn)生立即性的對(duì)抗微生物反應(yīng),此機(jī)制與免疫系統(tǒng)最大的區(qū)
14、別在於免疫系統(tǒng)的專一性較高,但需要花費(fèi)較多時(shí)間辨識(shí)自我與非我之差別,而誘導(dǎo)性的peptide反應(yīng)卻可在短時(shí)間對(duì)廣泛的微生物作出反應(yīng)(1)。 在動(dòng)物實(shí)驗(yàn)的模式中證明了不同的peptide的確具有抗菌、抗真菌、佐劑及抗內(nèi)毒素之功效。實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示了乳酸鏈球菌菌素(一種由乳酸菌產(chǎn)生,有抑菌作用之小分子peptide)在鼠體內(nèi)具有系統(tǒng)性保護(hù)其不受Streptococcus pneumoniae感染之效。研究這些peptide的可應(yīng)用以在gene-therapy上,利用腺病毒將帶有DNA或人類peptide LL-37送入鼠體,結(jié)果有效地降低了細(xì)菌對(duì)鼠產(chǎn)生之反應(yīng),並減少發(fā)炎現(xiàn)象,並且戲劇性地生高了牠在面臨
15、Escherichia coli所產(chǎn)生內(nèi)毒素的存活率(1)。已知cationic antimicrobial peptides是某些吞噬細(xì)胞的主要成份,尤其是嗜中性球及泡狀的巨噬細(xì)胞,它們?cè)谶@些細(xì)胞中似乎參與了非氧化性的毒殺作用,雖然,吞噬細(xì)胞對(duì)細(xì)菌的氧化性毒殺作用較受到重視,但非氧化性的毒殺作用也十分具有效力,因?yàn)樵诼匀庋苛霾』俭w內(nèi)的嗜中性球缺乏氧化效力,但仍舊能殺死大部份的細(xì)菌,實(shí)際上,這類的患者只是較容易受到一種對(duì)於cationic antimicrobial peptide有抗性的細(xì)菌Burkholderia cepacia的感染。cationic antimicrobial pep
16、tides被認(rèn)為是在膜上才具活性的作用者,但或許對(duì)某些peptides是如此,許多peptides甚至於是絕大部分並不將膜視為必須的目標(biāo)位置。cationic antimicrobial peptides對(duì)於革蘭氏陰性菌概要的作用機(jī)制為:peptides會(huì)與細(xì)胞膜產(chǎn)生交互作用並毒殺此細(xì)胞。一開始peptide經(jīng)由self-promoted uptake穿過外膜,因?yàn)檫@些peptides能與LPS產(chǎn)生交互作用而取代其雙鍵使之破壞,然後peptides就能從這些被破壞處進(jìn)入細(xì)胞外膜,接著,peptides與帶負(fù)價(jià)電的磷脂類膜結(jié)合並以與膜相互平行之方向插入膜中,再經(jīng)由膜上原本的孔洞進(jìn)入細(xì)胞之中,帶正
17、電的peptides與帶負(fù)電的DNA作用而使之受到阻斷。而Burkholderia cepacia就是因?yàn)槿狈α藄elf-promoted uptake的能力,使得peptide的作用無法執(zhí)行(1)。每年在北美洲至少有五千個(gè)病患會(huì)面臨敗血癥,敗血癥的發(fā)生常伴隨著血液中含有病原微生物或它們產(chǎn)生的毒素,如下圖所示:敗血癥可能由革蘭氏陽性菌及革蘭氏陰性菌所引發(fā),革蘭氏陰性敗血癥通常起因於細(xì)菌釋放出外膜構(gòu)造LPS,LPS的毒性在於它的lipid A部份;革蘭氏陽性敗血癥據(jù)推測(cè)也是由於釋出了某些細(xì)胞壁的成份,如:lipoteichoic acid(LTA)、peptidoglycan(PG),而目前對(duì)於
18、細(xì)菌性感染的抗生素治療方式,多會(huì)引發(fā)這些導(dǎo)致致死性敗血癥的物質(zhì)釋出;相較之下,peptides在組織培養(yǎng)與人體血液中能防止細(xì)菌釋出物誘導(dǎo)細(xì)胞激素的產(chǎn)生,且它能阻斷鼠敗血癥的發(fā)生。另有研究指出,一種稱為CEMA的peptide能阻斷許多由LPS所誘導(dǎo)的基因表現(xiàn),因其具有部分阻止LPS與血清蛋白LBP的能力,除此之外,CEMA更能直接影響巨噬細(xì)胞基因的表現(xiàn)(1)。因此,作者想藉由cationic antimicrobial peptides加上lysozyme-assisted killing達(dá)成直接殺死微生物並回饋控制細(xì)胞激素反應(yīng)的效果,進(jìn)而能利用不同的peptides對(duì)抗具有抗抗生素能力的感染
19、原(1)。艾爾文加州大學(xué)的科學(xué)家在老鼠實(shí)驗(yàn)中,發(fā)現(xiàn)一種稱為Paneth細(xì)胞,它能捍衛(wèi)腸子對(duì)抗入侵的細(xì)菌;當(dāng)腸內(nèi)的外敵入侵時(shí),它能在數(shù)分鐘內(nèi)釋放出一種抗生素蛋白,叫做防禦質(zhì)(defensins)(5)。血管生成素4 (angiogenin 4, Ang4) 原本被認(rèn)定屬於促進(jìn)新血管生成可以提供腫瘤細(xì)胞養(yǎng)份的蛋白族群之一員,而現(xiàn)在科學(xué)家發(fā)現(xiàn)小腸中的Ang4來源是由小腸內(nèi)襯當(dāng)中稱為Paneth細(xì)胞所分泌。原本這些Paneth細(xì)胞位於小腸消化腺的底部可以分泌溶解酵素 (lysozyme),在腸道的抗菌過程中即扮演一定的作用。更令科學(xué)家們吃驚的是,在腸道中Ang4蛋白的表現(xiàn)卻是由腸道中的益菌Bacter
20、oides thetaiotaomicron所調(diào)控的。到目前為止,由細(xì)菌調(diào)控而產(chǎn)生具有抗菌能力的蛋白,Ang4可以說是第一個(gè)而且是唯一的例子(6)。植物抗菌性peptides不同的生物以各式各樣的機(jī)制來抵禦侵略者,最有效率的莫過於產(chǎn)生免疫球以直接對(duì)抗不同微生物,可是只有在高等脊椎動(dòng)物才有產(chǎn)生免疫球的機(jī)制,而其他更廣大的生物群則藉由產(chǎn)生小的peptides來達(dá)成防衛(wèi)的目的(2)。以植物為例,病原和寄主接觸後,寄主對(duì)病原的一種早期專一性的快速反應(yīng),決定是否病原繼續(xù)生長(zhǎng)及病害繼續(xù)發(fā)展。當(dāng)病原接觸植物表面後,特別是真菌及細(xì)菌性病原會(huì)釋出如糖蛋白、多醣類、脂肪酸和勝鏈等物質(zhì),在各種寄主-病原組合,這些物
21、質(zhì)可作為寄主識(shí)別作用的病原激發(fā)因子(pathogen elicitor)。寄主植物上對(duì)激發(fā)因子之感受器(receptor)的存在位置仍不清楚,可能在細(xì)胞膜外、細(xì)胞膜上或細(xì)胞間(4)。一旦寄主植物上的分子識(shí)別且和衍自病原的激發(fā)因子反應(yīng),植物產(chǎn)生警告訊息(alarm signal)分子,和酵素蛋白或核基因結(jié)合,將啟動(dòng)植物細(xì)胞一連串生物化學(xué)反應(yīng)及構(gòu)造改變,其產(chǎn)物向病原侵入點(diǎn)移動(dòng),以抵擋病原,包括其所分泌之酵素及毒質(zhì)等。此訊息分子的傳遞,可經(jīng)由細(xì)胞間或系統(tǒng)性輸送??梢苿?dòng)的訊息分子之化學(xué)特性並不確定,細(xì)胞內(nèi)的訊息分子轉(zhuǎn)換者(transducer)包括有各種激酵素(protein kinase)、鈣離子(
22、calcium ion)、磷酸化酵素(phosphorylases)、磷脂酵素(phospholipase)、ATPase、過氧化氫(hydrogen peroxide)、乙烯(ethylent)和其他物質(zhì)。系統(tǒng)性的訊息分子轉(zhuǎn)換作用(systemic signal transduction)和系統(tǒng)誘導(dǎo)抗病性(systemic acquired resistance)有關(guān),經(jīng)由水楊酸(salicylic acid)、植物細(xì)胞壁釋出之寡半乳糖醛酸(oligogalacturonides)、jasmonic acid、systemin、脂肪酸、乙烯和其他物質(zhì)所完成。所以某些人工合成化合物如水楊酸、d
23、ichloroisonicotinic acid能夠啟動(dòng)訊息分子途徑(signaling pathway),導(dǎo)致對(duì)植物病原性病毒、細(xì)菌及真菌等產(chǎn)生系統(tǒng)誘導(dǎo)抗病性(4)。對(duì)病原的激發(fā)因子之瞭解仍少,病原的激發(fā)因子可能在病原侵入前或侵入時(shí)所產(chǎn)生,其可能是病原表面物質(zhì)在植物酵素(如-glucanase和/或chitinase)作用之後釋出的-葡聚糖(-glucan)、幾丁質(zhì)(chitin)、殼聚糖(chitosan),或是病原侵入植物後受到寄主訊息分子刺激而產(chǎn)生(4)。 抗菌性peptides是由單一基因藉由很迅速且很有彈性的方式所產(chǎn)生,因其分子很小,故生產(chǎn)這樣的peptides只會(huì)消耗h
24、ost少量能量及biomass。最常見的兩種抗菌性的peptides為cecropins及magainins。cecropinst為第一個(gè)被發(fā)現(xiàn)的動(dòng)物抗菌性peptide,常累積於非脊椎動(dòng)物的淋巴結(jié),對(duì)於革蘭氏陽性及陰性菌均具有強(qiáng)大之殺傷力,而對(duì)於真菌和真核細(xì)胞沒有毒性;magainins則由兩棲類的皮膚腺體所分泌,對(duì)於革蘭氏陽性及陰性菌、真菌、原生動(dòng)物都有殺傷作用,但對(duì)於革蘭氏陽性菌的活性比cecropins要低十倍左右。這兩者均為小的基本peptides(20-40 residues),具兩性的-helical結(jié)構(gòu),能穿過微生物的膜形成離子孔洞。另一類的抗菌peptide是Cys-rich
25、 peptides,與cecropins及magainins不同的是它具有複雜的cystine-stabilized三級(jí)構(gòu)造,並且多為反平行的-sheets??咕|(zhì)(defensins)是屬於Cys-rich antimicrobial peptides的一類,它們具有不同的長(zhǎng)度、cystine數(shù)量、鍵結(jié)及組裝架構(gòu)。昆蟲的抗菌質(zhì)與cecropins同樣是藉由病源菌誘導(dǎo)而在淋巴結(jié)產(chǎn)生,而哺乳動(dòng)物的抗菌質(zhì)則由體內(nèi)許多不同的特殊細(xì)胞所產(chǎn)生,它們也會(huì)由上皮細(xì)胞所分泌,如腸道及呼吸道,以維持正常菌相的平衡,除此之外,也有助於在上皮細(xì)胞曝露於細(xì)菌LPS時(shí)的調(diào)控作用。抗菌質(zhì)在先天性免疫系統(tǒng)上的重要性我們可由
26、血液中缺乏抗菌質(zhì)的生物體會(huì)一再地受到感染而得知。最近我們發(fā)現(xiàn)植物體內(nèi)有一類新的peptides結(jié)構(gòu)與功能和昆蟲及哺乳動(dòng)物的抗菌質(zhì)相似,所以我們將這類物質(zhì)稱為plant defensins。植物抗菌質(zhì)首次是由Mendez及與其共同工作成員所發(fā)現(xiàn)分並離自小麥和裸穀類,因?yàn)樗鼈兊拇笮∨c-、-thionins相似並具相同數(shù)量之雙硫鍵結(jié),故原取名為-thionins,後續(xù)的研究發(fā)現(xiàn)thionins與-thionins在結(jié)構(gòu)上並不相關(guān),而與-thionins相似的蛋白質(zhì)則可自單子葉及雙子葉植物種子中分離。這些植物抗菌質(zhì)有下列之特色:1. 結(jié)構(gòu)與功能和昆蟲及哺乳動(dòng)物的抗菌質(zhì)相似,推測(cè)彼此之間有演化上的關(guān)係2
27、. 有些植物抗菌質(zhì)能有效地抑制微生物的生長(zhǎng)3. 具有保護(hù)植物種子的能力4. 具有保護(hù)植物組織的能力比較不同種類植物的抗菌素氨基酸序列發(fā)現(xiàn)了下列幾個(gè)共同點(diǎn):為45至54個(gè)氨基酸組成、帶淨(jìng)正電荷、序列有相當(dāng)保守性。近年發(fā)現(xiàn)一種由果蠅(Drosophila meelanogaster)所製造的抗真菌peptide稱為drosomycin,與植物抗菌質(zhì)Rs-AFP1具有38的residues相似性,除此之外,植物的抗菌質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能和昆蟲及哺乳動(dòng)物的抗菌質(zhì)相似。許多植物抗菌質(zhì)只要在micromolar的濃度即能抑制廣泛的針菌,但帶兩個(gè)正電荷離子的存在卻會(huì)抑制植物抗菌質(zhì)的作用,尤以鈣離子為最,這樣的現(xiàn)象也
28、可在昆蟲及哺乳類的抗菌質(zhì)中見到。植物的抗菌質(zhì)在結(jié)構(gòu)上及功能上與昆蟲及哺乳動(dòng)物的抗菌質(zhì)相似,有證據(jù)指出植物的抗菌質(zhì)在植物的防禦上相當(dāng)重要,不論是在其週圍的組織上或是在病原菌的壓力下,會(huì)表現(xiàn)抗菌質(zhì)之基因轉(zhuǎn)殖植物都表現(xiàn)出較高的存活率(2)。有越來越多的證據(jù)指出,植物和動(dòng)物有一些相同的份子,可以用來防禦病源菌,原本認(rèn)為,在植物中有nonspecific system包括主動(dòng)和被動(dòng)的防禦,而動(dòng)物中有specific immune system,令人驚訝的是植物也有specific nonself-surveillance system,而動(dòng)物中有nonspecific system(3)。在植物中已知道
29、有8種抗微生物的peptide,大小從2到9kD,包括有thionin、defensins、so-called lipid transfer protein、hevein-and knottin-like peptides、MBP1、IbAMP、snakins,此8種Plant defense 藉著2到6個(gè)雙硫鍵型成緊密的結(jié)構(gòu)(3)??刮⑸锏膒eptide在植物防禦中佔(zhàn)有很重要的角色,有一些判定peptide的方法,(a)在in vitro時(shí)可以抗微生物的活性(b)基因的表現(xiàn),peptide的分布,peptide在植物中被病源菌感染前和感染後的濃度差異(c)和其他基因產(chǎn)物的相互作用(3)。在
30、動(dòng)物中的抗微生物peptide,其結(jié)構(gòu)可能為直線或是球狀(雙硫鍵型成的-sheet結(jié)構(gòu)),然而在植物中,目前只發(fā)現(xiàn)雙硫鍵型成的peptide結(jié)構(gòu);在植物中抗微生物的peptide,thionin是第一個(gè)可以在in vitro,具有抗微生物能力的,之後又發(fā)現(xiàn)許多其cysteine-rich peptides包括defensins、lipid transfer protein、hevein-type peptides、knottin-type peptides(3)。植物抗菌性peptides的結(jié)構(gòu)分析為研究的方便,人們根據(jù)peptides抗生素的結(jié)構(gòu)對(duì)其進(jìn)行了分類。以下茲就各種植物抗菌性pept
31、ides的結(jié)構(gòu)作分析:一、thionin的結(jié)構(gòu)和分布thionin和purothionin為同源的peptide,purothionin是第一個(gè)從小麥種子中分離出來的。最原始的purothionin是從hexaploid wheat中分離出來的,而在Aegilops-Triticum的22diploid、tetraploid、hexploid species中,觀察它的胚乳,發(fā)現(xiàn)每一個(gè)diploid至少都有一個(gè)變化二、defensin的結(jié)構(gòu)和分布植物的defensin是屬於抗微生物peptide的一種,其長(zhǎng)度有4554個(gè)胺基酸,defensin從不同的taxa分離出,且可能在整株植物中都具有d
32、efensin,根據(jù)defensin的胺基酸長(zhǎng)度,進(jìn)而將不同的defensin作分類,而不同的結(jié)構(gòu),其抗微生物的能力也有所不同(Figure2)。這個(gè)Family的所有defensin members都具有8個(gè)和cysteines結(jié)合的雙硫鍵,有一個(gè)甚至位於C-terminus,在所有的defensin這8個(gè)雙硫鍵都具有高度的保守性(Figure2)。三、lipid transfer protein的結(jié)構(gòu)和分布lipid transfer protein(LTPs)如此命名,是因?yàn)榘l(fā)現(xiàn)他們是屬於一種會(huì)在lipid及organelles之間作移動(dòng)的peptide,而近期的發(fā)現(xiàn),更進(jìn)一步指出此pe
33、ptide和植物的防禦有關(guān)。植物的LTPs有9095amino acid polypeptide,一開始在菠菜的葉子、玉米的胚芽鞘、大麥的種子中有找到LTPs,後來幾乎在所有植物的細(xì)胞壁中都有找到LTPs。比對(duì)所有已被報(bào)導(dǎo)的LTPs序列,發(fā)現(xiàn)整個(gè)序列有1/3其保守性很高,其中含有8個(gè)cysteines所結(jié)合的雙硫鍵(Figure3)。近期有報(bào)導(dǎo)指出,棉花的纖維中具有的LTPs含有6個(gè),而LTPs的四級(jí)結(jié)構(gòu),用X-ray diffraction和proton nmr作研究,除了結(jié)構(gòu)之外進(jìn)一步也要知道LTPs和lipid的interaction是如何發(fā)生。四、其他植物中的peptide famil
34、y(1)Hevein-and Knottin-like peptideHevein在橡膠樹的橡漿中是最多的蛋白質(zhì),其長(zhǎng)度有43個(gè)胺基酸長(zhǎng)度,所含有的cysteine-rich peptide和植物中的chitin-binding domain及一些抗微生物的peptide同源。Hevein -like抗微生物的 peptide,來自甜胡椒,具有8個(gè)雙硫鍵結(jié)合的cysteine,從橡漿中也可找到,然而在amaranth中的Hevein like缺少了2個(gè)cysteines,這是因?yàn)镃-terminal的deletion。除此之外,利用proton nmr的分析,進(jìn)而了解Hevein 有3個(gè)-st
35、rands加上一個(gè)-helix的結(jié)合,造成Hevein的3級(jí)結(jié)構(gòu)。Knottin-like peptide抗微生物的 peptide,其長(zhǎng)度有3637個(gè)胺基酸長(zhǎng)度,從Mirabilis jalapa的種子中分離出來,具有6個(gè)雙硫鍵結(jié)合的cysteine,可以和Hevein -like抗微生物的 peptide明顯區(qū)分。而chitin-binding及Knottin-like peptide,從Pharbitis nil的種子中,和sugar-beet葉子中也有分離出來。胺基酸長(zhǎng)度從cDNA進(jìn)行研究,發(fā)現(xiàn) encoding Hevein的N-terminal signal peptide及C-t
36、erminal propeptide和煙草中的pathogenesis-related protein PR4同源。而從cDNA進(jìn)行研究,發(fā)現(xiàn)在amaranth中 Hevein like protein會(huì)encod出相似的precursor ,但是C-terminal peptide會(huì)變短。Knottin-like precursor不具有C-terminal propeptide。Hevein和Knottin-like peptide,in vitro可以廣泛的抑制真菌和gram-positive bacterium,且他們的活性可以藉著二價(jià)陽離子恢復(fù)活性。雖然大部分的文獻(xiàn)指出Hevein和
37、Knottin-like peptide只在種子中找到,但是Hevein和-like peptide在植物的其他組織中有找到。在轉(zhuǎn)殖基因的煙草植物中,過度產(chǎn)生Hevein和Knottin-like peptide,並不會(huì)增加抑制真菌Alternaria longipes,雖然在轉(zhuǎn)殖基因的蕃茄植物中,過度產(chǎn)生Hevein like peptide,將會(huì)減少真菌Trichoderma hamatum的感染。(2)Four-cysteine Antimicrobial peptide至少有2個(gè)抗微生物的 peptide families,具有4個(gè)cysteine,包括有MBP-1,從玉米中分離出來,
38、其具有33 peptide,而從Impatiens balsamina的種子中分離出來,其具有20 peptide(Ib-AMPs)。第一個(gè)有活性的peptide可以抑制gram-positive bacterium及gram-negative bacterium,然而Ib-AMPs可以抑制真菌及gram-negative bacterium。利用CD和two-dimensional proton nmr的分析,進(jìn)而了解Ib-AMPs的結(jié)構(gòu)。從multipeptide precursor進(jìn)行processing,才能產(chǎn)生成熟的Ib-AMPs,此過程的產(chǎn)生和apidaecin的過程很像,apid
39、aecin從蜂蜜中分離出來的抗微生物 peptide。(3)Twelve-csteine peptides新形式的抗微生物peptide,具有12個(gè)cysteine,包括有snakin-1(St-SN1),從potato tuber中分離出來,其具有63 peptide,其活性可以抑制小於10l濃度的真菌及gram-positive bacterium及gram-negative bacterium,此peptide有能力可以聚集bacterium,但是對(duì)人工的lipid membrane沒有影響。雖然此family還沒有其他成員被發(fā)現(xiàn),但是它的同源peptide應(yīng)該是存在的。Erwinia
40、chrysanthemi的Snakin-sensitive突變,造成它對(duì)野生的potato tuber有較低的感染力,而在potato tuber中,snakin是主要的抗微生物 peptide。這個(gè)事實(shí)強(qiáng)烈的指出,此protein family的defense功能(3)。短鏈peptides的應(yīng)用目前這些抗菌peptides不僅已應(yīng)用於局部感染之治療劑,正在進(jìn)行臨床前和臨床試驗(yàn),另外亦已將抗菌peptides轉(zhuǎn)殖至動(dòng)植物成為抗菌品種動(dòng)植物(8)。但是隨著研究的深入,人們相繼發(fā)現(xiàn)這類peptide還具有抗寄生蟲、病毒、癌細(xì)胞等功能,尤其是隨著這類peptides在醫(yī)藥學(xué)上的應(yīng)用。下列為這些pe
41、ptides應(yīng)用的實(shí)例:一、 以人工方式合成抗菌peptides合成方式有兩種:化學(xué)合成法、基因工程合成法。化學(xué)合成法的優(yōu)點(diǎn)是可以方便地在合成過程中改變peptides的一級(jí)結(jié)構(gòu),加入特殊的氨基酸,對(duì)peptides末端進(jìn)行修飾,但昂貴的成本是限制其工業(yè)化應(yīng)用的最大障礙。基因工程合成法生產(chǎn)peptides是降低生產(chǎn)成本的一條有效途徑,但peptides對(duì)於原核細(xì)胞的毒性在一定程度上限制了其在原核表達(dá)系統(tǒng)中的應(yīng)用(10)。前述之cecropin,由於其具有對(duì)於革蘭氏陽性及陰性菌均具有強(qiáng)大之殺傷力,而對(duì)於真菌和真核細(xì)胞沒有毒性之特性,故已被人工合成並商品化(10)。另外,一篇被登載在Journal of American Chemical Society由William DeGrado等人所發(fā)表的研究文章,其中指出將蛋白的基本NH2基及COO基鍵結(jié)(peptide bond)由共享一個(gè)碳變成分別鍵結(jié)一個(gè)碳,個(gè)別的兩個(gè)碳再連結(jié)。前者是自然的鍵結(jié)方式而後者是人工合成。利用此技術(shù),該研究群成功合成一
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