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文檔簡介

1、精品原核誘導(dǎo)表達(dá)的標(biāo)準(zhǔn)操作程序(SOP )一目的:使本實(shí)驗(yàn)室工作人員了解誘導(dǎo)表達(dá)的操作過程,并能實(shí)際動(dòng)手進(jìn)行原核誘導(dǎo)表達(dá)一系列實(shí)驗(yàn)。二適用范圍:本 SOP 適用于對(duì)新基因克隆的表達(dá),并針對(duì)新基因產(chǎn)生的可溶性蛋白。三實(shí)驗(yàn)原理:E.coli 的乳糖操縱子含Z、Y及A三個(gè)結(jié)構(gòu)基因,分別編碼半乳糖苷酶、透酶和乙酰基轉(zhuǎn)移酶,此外還有一個(gè)操縱序列O 、一個(gè)啟動(dòng)序列P 及一個(gè)調(diào)節(jié)基因I。I 基因編碼一種阻遏蛋白,后者與O 序列結(jié)合,使操縱子受阻遏而處于關(guān)閉狀態(tài)。在啟動(dòng)序列 P 上游還有一個(gè)代謝物基因激活蛋白(CAP )結(jié)合位點(diǎn)。由P 序列、 O 序列和CAP 結(jié)合位點(diǎn)共同構(gòu)成lac 操縱子的調(diào)控區(qū),三個(gè)酶的

2、編碼基因即由同一調(diào)控區(qū)調(diào)節(jié),實(shí)現(xiàn)基因產(chǎn)物的協(xié)調(diào)表達(dá)。在沒有乳糖存在時(shí),lac 操縱子處于阻遏狀態(tài)。此時(shí),I序列在 PI 啟動(dòng)序列操縱下表達(dá)的Lac阻遏蛋白與O 序列結(jié)合, 阻礙 RNA 聚合酶與P序列結(jié)合,抑制轉(zhuǎn)錄起動(dòng)。當(dāng)有乳糖存在時(shí),lac操縱子即可被誘導(dǎo)。在這個(gè)操縱子體系中,真正的誘導(dǎo)劑并非乳糖本身。乳糖進(jìn)入細(xì)胞,經(jīng)b 半乳糖苷酶催化,轉(zhuǎn)變?yōu)榘肴樘?。后者作為一種誘導(dǎo)劑分子結(jié)合阻遏蛋白,使蛋白構(gòu)象變化,導(dǎo)致阻遏蛋白與 O 序列解離、發(fā)生轉(zhuǎn)錄。異丙基硫代半乳糖苷(IPTG )是一種作用極強(qiáng)的誘導(dǎo)劑,不被細(xì)菌代謝而十分穩(wěn)定,因此被實(shí)驗(yàn)室廣泛應(yīng)用。感謝下載載精品四、試劑準(zhǔn)備:(一)實(shí)驗(yàn)器材的滅菌:

3、槍頭的滅菌:1mL , 200 L, 20 L 的槍頭放入槍頭盒,用報(bào)紙包?。? 層),放入高壓滅菌鍋中滅菌,121 , 20min。 80 烘箱中烘干,常溫放置。螺口管及離心管的滅菌:將螺口管和離心管分別放入鋁制飯盒中(蓋子要擰松,離心管的管蓋打開),放入高壓滅菌鍋中滅菌,121 , 20min。 80 烘箱中烘干,常溫放置。50mL離心管的滅菌:將 50mL離心管用報(bào)紙包?。? 層),放入高壓滅菌鍋中滅菌,121 , 20min。80 烘箱中烘干,常溫放置。(二) LB 培養(yǎng)基的配制液體 LB 培養(yǎng)基(1L ):蛋白胨10g氯化鈉10g酵母提取物5g調(diào) PH 值到 7.5 ,高壓滅菌,4

4、保存。固體 LB 培養(yǎng)基(1L ):蛋白胨10g感謝下載載精品氯化鈉10g酵母提取物5g瓊脂粉15g高壓滅菌,不燙手的情況下加入抗性,抗性:培養(yǎng)基=1 : 1000 (氨芐,卡那通常濃度) ,混勻。馬上在無菌操作臺(tái)中倒平板,并開大風(fēng)吹干。用封口膜封住,倒置放于 4保存。(三) 1M IPTG的配制:經(jīng)過計(jì)算,10gIPTG 可以配42ml的 1MIPTG 。買來的粉末狀的IPTG 一般全部配成1M IPTG。1 、無菌操作臺(tái)紫外線照射,后通風(fēng)。2 、用少量去離子水將IPTG 溶解完全,并定容。3 、在無菌操作臺(tái)中,用0.22 m 的濾器將配好的IPTG 濾入滅菌后的1.5ml離心管中,過濾除菌

5、,-20 保存。注意事項(xiàng): 在用濾器將IPTG 濾入離心管時(shí),先用針頭吸IPTG ,然后將槍頭拔掉,排出氣體,濾頭加入IPTG 液,在使針管與濾器相連,保證整個(gè)裝置無氣體進(jìn)入。濾的過程中,手不能碰濾頭。(四) 3 ×SDS-PAGE loading buffer的配制:3 ×SDS-PAGE loading10ml感謝下載載精品buffer1M Tris-Hcl (PH 6.8)1.5mlSDS0.6gBPB( 溴酚藍(lán) )30mg甘油(丙三醇)3ml去離子水5.5ml1將除 BPB 以外的藥品完全溶解。SDS 常溫下很難溶解,可以在37 水浴溶解。完全溶解后,再加入BPB

6、,進(jìn)行溶解。2把溶好的 buffer 分裝到 1.5ml的離心管中,1ml/ 管,常溫放置。3使用前,每管加入30 L 巰基乙醇。注意事項(xiàng):巰基乙醇為危險(xiǎn)品,加入的過程在通風(fēng)櫥中完成,并且?guī)Ш檬痔?。(五?10 ×PBS 的配制:0.1M PBS ( 10 ×PBS)1LNaH 2 PO 4 .2H 2 O2.83gNacl85gNa 2 HPO 4 .12H 2 O28.98g用去離子水將以上藥品進(jìn)行溶解。(溶解的非常慢,可能需要過夜)調(diào) PH 值到 7.2 ,用 0.4 m 的濾膜過濾。常溫保存。工作時(shí)用的是 1 ×PBS。感謝下載載精品(六) 1.5M Tr

7、is-Hcl (PH 8.8)的配制:1.5M Tris-Hcl250mlTris45.425g1 用 200ml去離子水將Tris 溶解。2 用濃鹽酸調(diào)PH 值到 8.8 。3調(diào)好 PH 的 Tris-Hcl定容到 250ml 。4 0.4 m 的濾膜過濾,常溫保存。注意事項(xiàng):Tris 的緩沖能力很強(qiáng),調(diào)PH 值時(shí),費(fèi)些時(shí)間,但不要調(diào)過。(七) 1M Tris-Hcl (PH 6.8)的配制:1M Tris-Hcl250mlTris30.275g1 用 200ml去離子水將Tris 溶解。2 用濃鹽酸調(diào)PH 值到 6.83 調(diào)好PH 的 Tris-Hcl定容到250ml。4 0.4 m 的濾

8、膜過濾,常溫保存。(八) 30% 丙烯酰胺的配制:30% 丙烯酰胺250ml丙烯酰胺72.5 ml感謝下載載精品BIS 甲叉丙烯酰胺2.5 ml1 把藥品用去離子水溶解后定容到250ml 。2 用濾紙過濾,放在棕色瓶子中,4 保存。注意事項(xiàng):兩種藥品有毒性,配制過程要帶手套和口罩。(九) 10%SDS的配制:1 1gSDS 加入 10ml去離子水進(jìn)行溶解。2 分裝到1.5ml離心管中,-20 保存。(十) 10% 過硫酸銨的配制:1 1g過硫酸銨加入10ml去離子水進(jìn)行溶解。2 分裝到1.5ml離心管中,-20 保存。(十一)5 ×SDS-PAGE電泳緩沖液的配制:5 ×S

9、DS-PAGE 電泳緩沖液1LTris15.1gGlycine (甘氨酸)94gSDS5g將以上藥品用去離子水溶解后定容到1L ,常溫保存。 工作時(shí)用的是 1 ×SDS-PAGE電泳緩沖液。感謝下載載精品(十二)考馬斯亮藍(lán)R-250 染色液的配制:考馬斯亮藍(lán)R-250 染色液1L1 往 1g 考馬斯亮藍(lán)R-250中加入 250ml異丙醇,在磁力攪拌器上攪拌六小時(shí)以上。2 加入 650ml去離子水,磁力攪拌器攪拌過夜。3 再加入 100ml冰醋酸進(jìn)行溶解,磁力攪拌器攪拌。4 在通風(fēng)櫥內(nèi)用濾紙進(jìn)行過濾。常溫保存。染色液只能反復(fù)用兩次。注意事項(xiàng):在磁力攪拌器上攪拌時(shí),要把容器封口。(十三)

10、脫色液的配制:脫色液1L醋酸(冰乙酸)100ml乙醇(無水乙醇)50ml去離子水850ml常溫保存。四實(shí)驗(yàn)步驟:(一):質(zhì)粒的轉(zhuǎn)化1 使用無菌操作臺(tái)之前先用75% 的酒精擦拭,然后將滅菌的培養(yǎng)基以及所有要用到的器具放到超凈臺(tái)上,在開紫外照射30min左右。操作之前,關(guān)掉紫外,打開通風(fēng)櫥,將手用酒精擦拭后開始操作。感謝下載載精品2 從 -80 的冰箱中取出表達(dá)菌( BL21 )的感受態(tài)細(xì)胞(每管100 L ),在 -80 冰水中融化。3 載體( PET32a等)與基因片段的連接后質(zhì)粒1 L,緩慢的加入到100 L BL21感受態(tài)中,冰置15min。(無菌操作)3 42 下熱激90s ,隨后在冰水

11、中冰置5min。4 涂板:先將涂布棒用酒精棉球擦,然后用酒精燈火焰燒,放置等它涼卻。把處理后的感受態(tài)點(diǎn)在含有抗性的固體培養(yǎng)基(氨芐或卡那等)上。用冷卻的涂布棒進(jìn)行涂布,左手把該蓋拿起,小指輕輕轉(zhuǎn)動(dòng)培養(yǎng)基,右手來涂,涂到培養(yǎng)基表面快干。(無菌操作)5 放在 37 培養(yǎng)箱中,倒置培養(yǎng)過夜。注意事項(xiàng):1 質(zhì)粒的轉(zhuǎn)化時(shí),質(zhì)粒是凍在-20 的冰箱中,等它完全化了在進(jìn)行吸取,往感受態(tài)中加入質(zhì)粒時(shí),一定要緩慢,因?yàn)楦惺軕B(tài)非常脆弱,防止感受態(tài)受傷。2 質(zhì)粒的轉(zhuǎn)化時(shí),熱激的時(shí)間90s ,一定要控制好時(shí)間。3 質(zhì)粒的轉(zhuǎn)化時(shí),涂布棒在涂布前,一定要晾涼涂布棒。防止感受態(tài)被燙死,或固體培養(yǎng)基的損壞。(二):挑菌與接菌

12、:1 無菌操作臺(tái)紫外線照射,后通風(fēng)。將轉(zhuǎn)化后的平板取出。2 在無菌操作臺(tái)中, 把消毒后的螺口管 (一般一個(gè)基因取四個(gè)螺口管, 進(jìn)行平行實(shí)驗(yàn))感謝下載載精品取出,在酒精燈的外焰上灼燒螺口管管口。3 滅菌后的LB 培養(yǎng)基從冰箱中取出,在酒精燈的外焰上燒一下培養(yǎng)基瓶口。吸取 LB培養(yǎng)基 (一般 5.5mL )加入螺口管中, 后加入抗性 (氨芐霉素、 卡那等)。氨芐霉素 (卡那):LB 培養(yǎng)基 =1:1000 ( 5.5 L ),抗性由載體決定。4 鑷子用酒精棉球擦拭,并在酒精燈的外焰上灼燒,將鑷子晾涼。用晾涼的鑷子,夾取 20 L 小槍頭,在轉(zhuǎn)化后的平板上挑取單菌落,扔到培養(yǎng)基中。5 接好菌的螺口管

13、,進(jìn)行搖菌。37 , 180rpm 。搖到菌的對(duì)數(shù)期(OD 600 值0.4-0.6 ),時(shí)間大概 2-3h 。可以模糊看到手即可。(注意不要搖過)6 用完的平板用封口膜封住,倒置放于4 保存。7 若直接用菌液進(jìn)行接菌,接菌比例為,菌液:LB 培養(yǎng)基 =1 :100 。注意事項(xiàng):1 接 菌吸培養(yǎng)基時(shí),把放置培養(yǎng)基的三角瓶傾斜才吸取培養(yǎng)基,移液槍盡量不要插進(jìn)三角瓶中。2 接菌時(shí)一定要加入抗性,挑菌落時(shí),要挑單個(gè)的菌落,且不要把培養(yǎng)基也扣起來。3 搖菌不要過了它的對(duì)數(shù)期,2 小時(shí)后隨時(shí)注意其生長狀態(tài)。(三)小量保菌:1 無菌操作臺(tái)紫外線照射,后通風(fēng)。2 將搖到標(biāo)準(zhǔn) OD 值的菌液進(jìn)行小量保菌,先在

14、酒精燈的外焰上灼燒螺口管管口。3 保菌:從滅菌的飯盒中取出4 個(gè) 1.5ml的滅菌的離心管,加入50 L 的滅菌后的感謝下載載精品80% 的甘油, 并分別加入相應(yīng)的350 L 菌液。一個(gè)基因的四個(gè)平行實(shí)驗(yàn)菌都要進(jìn)行保菌。(若不保菌,實(shí)驗(yàn)不能進(jìn)行重復(fù),只能從頭做)4 標(biāo)清保菌的類別,名稱,時(shí)間,如“BL21 PET32aVAV 1號(hào) 2010.7.14”,其中的 1號(hào)是平行對(duì)照中它排幾號(hào)。5 混勻, -20 保存。注意事項(xiàng):1 在小量保菌中,一個(gè)基因的四個(gè)平行對(duì)照都要保菌,否則得重新摸條件。2 在小量保菌中,菌液與甘油一定要混勻在保存,否則菌會(huì)被凍死。(四)蛋白誘導(dǎo)表達(dá)條件摸索1 無菌操作臺(tái)紫外

15、線照射,后通風(fēng)。2 小量保菌后的四個(gè)平行實(shí)驗(yàn)組,分別加入不同終濃度的IPTG,在不同的溫度條件下進(jìn)行誘導(dǎo)(如下圖) :對(duì)照編號(hào)IPTG 終濃度誘導(dǎo)溫度誘導(dǎo)溫度1 號(hào)1 mmol/L3h37 2 號(hào)0.1 mmol/L3h37 3 號(hào)1 mmol/L3h30 4 號(hào)0.1 mmol/L3h30 (五)小量收菌感謝下載載精品1 將誘導(dǎo)完成的四個(gè)平行實(shí)驗(yàn)組菌液,分別取出1mL ,對(duì)應(yīng)裝于4 個(gè)不同的1.5ml離心管中并做好標(biāo)記。剩余的平行實(shí)驗(yàn)組菌液放入4 保存。2離心 7000rpm , 2min,使菌沉淀。3把上層培養(yǎng)基倒掉,用1ml 1 ×PBS 把表達(dá)菌重懸,再次離心7000rpm

16、, 2min ,使菌沉淀。4把上層 1×PBS 倒掉,再次離心同步驟3 。5用 80 L 1 ×PBS 把表達(dá)菌體重懸。6在四個(gè)平行的重懸液中,分別加入80 L3 ×SDS-PAGEloadingbuffer 。(把3 ×SDS-PAGE loading buffer當(dāng)成 2 ×SDS-PAGE loading buffer用)7 煮樣 8min 。(打開鍋蓋煮)8 離心13000rpm,10min。吸上清。9 進(jìn)行SDS-PAGE電泳。注意事項(xiàng):在煮樣時(shí)要打開鍋蓋煮,防止小樣進(jìn)水,若樣進(jìn)水,則不能再用。(六) SDS-PAGE膠的配制1 分離

17、膠的配制( 1 )找出配套的膠板,用擦鏡紙擦干凈,并固定在配膠器上。隨后用去離子水試漏。( 2 )若膠板不漏水,就進(jìn)行分離膠的配制。依次將水、30% 丙烯酰胺、1.5MTris-Hcl( PH 8.8 )、 10%SDS 、 10% 過硫酸銨加到干凈的小燒杯中(如下圖),混勻。( 1mm的膠板,一般配一塊膠用5ml 。所配的膠濃度一般為12% ,但濃度也要視情感謝下載載精品況而定。蛋白越小,膠的濃度越大。)( 3 )將膠板中的水倒掉,并用濾紙吸干水分(不要將濾紙塞到膠板底部)。( 4 )小燒杯中再加入TEMED ,混勻。 ( TEMED 可使膠凝固,所以最后加)( 5 )灌膠:混勻的分離膠沿著

18、膠板邊緣輕輕灌下,防止產(chǎn)生氣泡。( 6 )用水將分離膠壓平。 (用水灌滿,同時(shí)加水時(shí)要緩慢加入,防止把膠吹起)2 濃縮膠的配制(1 )待分離膠與水中間形成明顯的橫線,即分離膠凝固。隨后進(jìn)行濃縮膠的配制,依次將水、 30% 丙烯酰胺、 1.0M Tris-Hcl( PH 6.8)、 10%SDS、 10% 過硫酸銨加到干凈的小燒杯中(如下圖)感謝下載載精品(2)將分離膠上層的水倒掉,并用濾紙吸干水分。(盡量不要把濾紙插入)( 3 )小燒杯中再加入TEMED ,混勻。( 4 )灌膠。然后插入梳子。( 5 )把制膠器倒過來,膠仍然不會(huì)往外流,或可以明顯看出梳子中兩個(gè)齒之間的膠面明顯凹下去,說明濃縮膠

19、凝固。將凝固的膠板裝入電泳槽內(nèi),并在電泳槽內(nèi)加入SDS-PAGE電泳緩沖液,把膠浸泡一段時(shí)間,時(shí)間越長越好。(防止梳子與膠相連,或膠因濕度不夠而萎縮)(6 )點(diǎn)樣時(shí),再把梳子拔出來,拔時(shí)動(dòng)作要輕,防止膠齒被拔斷。(七)未誘導(dǎo)和空載的制備在誘導(dǎo)表達(dá)中,有兩個(gè)重要的對(duì)照組,即空載誘導(dǎo)和未誘導(dǎo)。1 未誘導(dǎo)的制備( 1 )未誘導(dǎo)是我們所做一個(gè)基因除了四個(gè)平行實(shí)驗(yàn)外, 再做的一個(gè)對(duì)照組菌, 唯一不同的是它不進(jìn)行誘導(dǎo)(接菌步驟如上) ,在 37 下,進(jìn)行搖菌,不加 IPTG ,搖起來即可。(和表達(dá)完的菌濃度差不多即可)( 2 )未誘導(dǎo)的菌進(jìn)行小量處理,見上面的小量收菌。2 空載誘導(dǎo)的制備(1 )空載的轉(zhuǎn)化

20、:感謝下載載精品將不連基因片段的空載體質(zhì)粒,轉(zhuǎn)入表達(dá)菌(和前面的試驗(yàn)用一個(gè)表達(dá)菌),如“BL21-PET32a-VAV質(zhì)粒 ”轉(zhuǎn)入 “BL21表達(dá)菌 ”,其空載應(yīng)當(dāng)是“BL21-PET32a ”轉(zhuǎn)入 “BL21表達(dá)菌 ”。轉(zhuǎn)化步驟同上。( 2 )空載接一個(gè)菌(實(shí)驗(yàn)組) ,并搖菌搖到對(duì)數(shù)期(步驟同上) 。( 3 )空載的誘導(dǎo):空載的誘導(dǎo)條件固定為溫度37 ,時(shí)間 3h. , IPTG 終濃度為 1mmol/L 。(誘導(dǎo)步驟如上)。(4 )空載的菌進(jìn)行小量處理,見上面的小量收菌。(八)蛋白誘導(dǎo)表達(dá)條件摸索的SDS-PAGE電泳1 拔掉SDS 膠上的梳子,并用小針調(diào)整齒的位置(使它們都平行)。2 點(diǎn)

21、樣。用20 L 的小槍頭,吸煮過的樣品10 L ,對(duì)準(zhǔn)膠孔點(diǎn)樣,注意不要把樣品點(diǎn)在外面。我們用的marker是低分子量蛋白marker。一般的點(diǎn)樣順序是:1234567空載未誘導(dǎo)樣品 1 號(hào)樣品 2 號(hào)樣品 3 號(hào)樣品 4 號(hào)marker3 開始電泳,電泳儀正負(fù)極接好,打開電源。濃縮膠:電壓low 100V分離膠:電壓high 150V。4 卸膠染色。等膠內(nèi)的所有的藍(lán)色都跑出去,電泳停止,一般時(shí)間為1 小時(shí) 45 分。把膠板從電泳儀上卸下,用刀片把膠板撬開,膠的濃縮膠部分割除,放入考馬斯亮藍(lán)R-250染色液中進(jìn)行常溫過夜染色。5 脫色。將過夜染色的SDS-PAGE 膠放入脫色液中進(jìn)行脫色,直到

22、背景發(fā)白。感謝下載載精品(九)四個(gè)平行實(shí)驗(yàn)組菌液的選擇1 將脫好的膠拿出進(jìn)行觀察,看四個(gè)平行實(shí)驗(yàn)組菌液是否進(jìn)行了蛋白表達(dá)。一般來說,未誘導(dǎo)沒有過量的蛋白表達(dá),而空載有一處蛋白的過量表達(dá)(大小由表達(dá)載體決定),四個(gè)平行實(shí)驗(yàn)組也有一處蛋白的過量表達(dá),它比空載表達(dá)的蛋白要大,大出的那一部分即我們的目的蛋白。2 若平行實(shí)驗(yàn)組中無過量蛋白表達(dá),尤其是37 ,1mmol/L, 3h 無過量蛋白表達(dá),則說明蛋白無表達(dá)。3 若平行實(shí)驗(yàn)組中有過量蛋白表達(dá),但它的大小與空載的大小相同。這說明蛋白進(jìn)行了漏表達(dá)。4 若蛋白表達(dá)正常,則選擇誘導(dǎo)溫度最低,IPTG 濃度最低的實(shí)驗(yàn)組(30 , 0.1mmol/L, 3h

23、),進(jìn)行下面的小量超聲實(shí)驗(yàn)。(十)表達(dá)菌的小量超聲實(shí)驗(yàn)1把以上做的四個(gè)平行實(shí)驗(yàn)組菌液從4 中拿出。2將最有條件的實(shí)驗(yàn)菌全部收集在1.5ml 的小離心管中。 (其他平行實(shí)驗(yàn)組的菌進(jìn)行滅菌)3離心 7000rpm , 2min ,使菌沉淀。4把上層培養(yǎng)基倒掉,用 1ml 1 ×PBS 把表達(dá)菌重懸,再次離心7000rpm , 2min ,使菌沉淀。5 把上層1×PBS 倒掉,再次離心同步驟3 。6 用 500 L 1 ×PBS 把表達(dá)菌重懸。感謝下載載精品7 將菌液放入小玻璃管中,準(zhǔn)備進(jìn)行超聲。8 將超聲儀打開預(yù)熱 20min ,并準(zhǔn)備冰盒。9 將呈菌液的小玻璃管放入

24、冰盒進(jìn)行超聲,超聲效率為30 50HZ ,超聲 3s,停 5s 。直到菌液超澄清(透明呈現(xiàn)雞蛋清色)。10 將超開的菌液進(jìn)行離心,13000rpm, 10min 。11離心產(chǎn)物上清取出100 L,加入 100 L3 ×SDS-PAGE loading buffer。12 上清倒掉,沉淀用1ml 1 ×PBS 把表達(dá)菌重懸,再次離心 13000rpm,10min 。13重復(fù) 11 步。14 上清倒掉, 用 100 L 將沉淀懸起,加入100 L3 ×SDS-PAGE loading buffer。15 上清和沉淀都進(jìn)行煮樣,開鍋蓋,8min 。16 離心13000r

25、pm,10min。吸上清。17 進(jìn)行 SDS 電泳。注意事項(xiàng):1 小樣超聲時(shí),要超徹底,一般超4 5 分鐘即澄清。若仍然不澄清,則可能是包涵體。超的過程中不要超糊。2 在洗超聲離心物的沉淀時(shí),要洗干凈。(十一)破菌超聲的SDS-PAGE電泳1 配膠、點(diǎn)樣、電泳的步驟如上。破菌超聲的點(diǎn)樣順序一般為:123456marker未誘導(dǎo)空載全菌破菌上清破菌沉淀感謝下載載精品未誘導(dǎo),空載,全菌為摸索表達(dá)條件時(shí)所用的樣品。注:我們破的幾號(hào)菌,就上幾號(hào)的全菌樣。2 若破菌上清表達(dá)的蛋白與全菌的蛋白分子量一致(目的蛋白),且破菌沉淀中沒有,這說明蛋白可溶;若破菌沉淀中有目的蛋白,而破菌上清中沒有,說明蛋白為包涵

26、體。(十二)目的蛋白的大量表達(dá)(1L )1 配制培養(yǎng)基1L ,每大瓶500ml ,高壓滅菌4 保存。2 一級(jí)接菌: 摸索完條件的表達(dá)菌進(jìn)行接菌3 管,每管 5ml ??剐裕?培養(yǎng)基 =1:1000,菌液:培養(yǎng)基 =1:100 。(菌液為針對(duì)可溶條件的小量保菌液)步驟如上。37 ,120rpm,過夜搖菌。3 標(biāo)準(zhǔn)保菌: 100 L 滅菌甘油加入700 L 過夜菌?;靹?,-20 保存。(寫好名稱日期,如上,放入表達(dá)菌的庫中)3 二級(jí)接菌:對(duì)大瓶進(jìn)行接菌,抗性:培養(yǎng)基=1:1000 ,菌液:培養(yǎng)基=1:100 。即每瓶 5ml 。4 搖菌: 37 , 180rpm,搖到對(duì)數(shù)期,搖到菌的對(duì)數(shù)期(OD

27、600 值0.4-0.6),時(shí)間大概2-3h ??梢阅:目吹绞旨纯伞#ㄗ⒁庠趽u過程中隨時(shí)觀察狀態(tài),不要搖過)5 誘導(dǎo):依據(jù)摸索好的條件進(jìn)行誘導(dǎo)。(十三)大量誘導(dǎo)的收菌:1 50ml離心管滅菌烘干,待用。2 找出兩個(gè)50ml離心管,管蓋和管壁上做標(biāo)記,并稱重。3 6 個(gè) 50ml離心管(包括稱重的兩個(gè)) ,倒入菌液( 40 45ml )。配平,離心 7000rpm,感謝下載載精品10min 。4 倒掉上清,用1 ×PBS 把菌重懸,離心7000rpm, 10min。5重復(fù)4 。6 倒掉上清,稱菌體的重量。7 懸菌。1g 菌體加入35ml的純化時(shí)用的上樣緩沖液懸起。-20 保存。(十四

28、)大量表達(dá)菌的超聲1 把表達(dá)菌從-20 拿出,在流水中融化。2 把完全融化的表達(dá)菌,放入小燒杯中準(zhǔn)備超聲。3 將超聲儀打開預(yù)熱20min,并準(zhǔn)備冰盒。4 將呈菌液的小燒杯放入冰盒進(jìn)行超聲,超聲效率為30 50HZ ,超聲3s ,停5s 。直到菌液超澄清,呈現(xiàn)雞蛋清色。(一般超20-30min,注意不要吵時(shí)間太長,使菌超糊)5 將超開的菌液進(jìn)行離心,13000rpm, 10min。6 將上清收集在滅菌的50ml離心管中,進(jìn)行純化。五促進(jìn)原核表達(dá)的蛋白可溶的方法:一般來說,人們認(rèn)為包涵體的形成是因?yàn)樾律嚯逆湶荒茉谡_位置形成二硫鍵,二硫鍵錯(cuò)配,進(jìn)而錯(cuò)誤折疊的結(jié)果。而IPTG 濃度越低,溫度越低,

29、一般蛋白的可溶性越大,因?yàn)檫@樣的條件下,可以減慢蛋白的形成,減少蛋白的二硫鍵錯(cuò)配,從而促進(jìn)蛋白的可溶。1 使蛋白可溶的條件并不是固定的,一般來說,以上條件就可是蛋白可溶(有感謝下載載精品時(shí)2/4條件可以把IPTG濃度提的高一點(diǎn))。但如果仍不可溶的話,可以試一下0.025mmol/L,常溫,過夜誘導(dǎo)。這種條件是IPTG 使用量的最小濃度,可以使包涵體部分可溶。2 180rpm搖菌搖對(duì)數(shù)時(shí),不要搖過。對(duì)數(shù)期時(shí),是表達(dá)菌產(chǎn)蛋白的最佳時(shí)期。表達(dá)菌濃度太大,對(duì)菌中蛋白的可溶性影響會(huì)很大。所以在搖菌到2h 后,一定密切關(guān)注菌的濃度,隨時(shí)用分光光度計(jì)測(cè)OD 600 值。這就意味著在接菌時(shí),多接一些菌 (由實(shí)

30、際情況而定)。3 蛋白的可溶與表達(dá)菌也有關(guān)系。菌株內(nèi)源的蛋白酶過多,可能會(huì)造成外源表達(dá)產(chǎn)物的不穩(wěn)定,所以一些蛋白酶缺陷型菌株往往成為理想的起始表達(dá)菌株??胺Q經(jīng)典的BL21系列就是 lon和 ompT蛋白酶缺陷型,也是我們非常熟悉的表達(dá)菌株。大名鼎鼎的BL21(DE3)融源菌則是添加 T7 聚合酶基因, 為 T7 表達(dá)系統(tǒng)而設(shè)計(jì)。 BL21(DE3) 即我們做表達(dá)是常用的表達(dá)菌。真核細(xì)胞偏愛的密碼子和原核系統(tǒng)有不同,因此,在用原核系統(tǒng)表達(dá)真核基因的時(shí)候,真核基因中的一些密碼子對(duì)于原核細(xì)胞來說可能是稀有密碼子,從而導(dǎo)致表達(dá)效率和表達(dá)水平很低。改造基因是比較麻煩的做法,Rosetta2系列就是更好的

31、選擇 這 種 攜 帶pRARE2質(zhì) 粒 的BL21衍 生 菌 , 補(bǔ) 充 大 腸 桿 菌 缺 乏 的 七 種( AUA,AGG,AGA,CUA,CCC,GGA及 CGG )稀有密碼子對(duì)應(yīng)的tRNA ,提高外源基因、尤其是真核基因在原核系統(tǒng)中的表達(dá)水平。(已經(jīng)攜帶有氯霉素抗性質(zhì)粒)當(dāng)要表達(dá)的蛋白質(zhì)需要形成二硫鍵以形成正確的折疊時(shí),可以選擇K-12衍生菌Origami 2系列, thioredoxin reductase (trxB)和 glutathione reductase (gor)兩條主要還原途徑雙突變菌株,顯著提高細(xì)胞質(zhì)中二硫鍵形成幾率,促進(jìn)蛋白可溶性及活性表達(dá)。(卡那霉素敏感)感謝下

32、載載精品Rosetta-gami?2則是綜合上述兩類菌株的優(yōu)點(diǎn),既補(bǔ)充7 種稀有密碼子,又能夠促進(jìn)二硫鍵的形成,幫助表達(dá)需要借助二硫鍵形成正確折疊構(gòu)象的真核蛋白。(卡那霉素敏感)Origami B是衍生自lacZY突變的BL21 菌株,這個(gè)突變能根據(jù)IPTG 的濃度精確調(diào)節(jié)表達(dá)產(chǎn)物,使得表達(dá)產(chǎn)物量呈現(xiàn)IPTG 濃度依賴性。(四環(huán)素敏感)在決定試用這些名字古怪的菌株時(shí),有幾個(gè)小Tips是要注意的,一個(gè)是不同菌株有時(shí)已經(jīng)攜帶某個(gè)質(zhì)?;蛘咭呀?jīng)具有某種抗生素抗性,要注意自己的表達(dá)質(zhì)粒是否能與之兼容。比如Rosetta 2已經(jīng)攜帶有氯霉素抗性質(zhì)粒,不能再用氯霉素篩選等等?,F(xiàn)象可能原因改進(jìn)方案建議菌株無蛋

33、白表達(dá)Rosetta 2補(bǔ)充稀有密碼子的E. coliRosetta-gami 2tRNA ;將稀有密碼子突變?yōu)槌霈F(xiàn)截短蛋白的密碼子偏移性Rosetta-gami B普通大腸桿菌密碼子RosettaBlue降低宿主胞質(zhì)的還Origami 2二硫原性; 利用促進(jìn)二硫鍵形成的Rosetta-gami 2鍵形成困難各種載體標(biāo)簽Rosetta-gami B包涵體表達(dá)控制優(yōu)化表達(dá)水Tuner過快,表達(dá)量過平:降溫,IPTG 濃度優(yōu)化Rosetta-gami B高降低宿主胞質(zhì)的還Origami 2蛋白無活性蛋白錯(cuò)誤折疊原性; 利用促進(jìn)二硫鍵形成的Rosetta-gami 2感謝下載載精品各種載體標(biāo)簽Ros

34、etta-gami B控制優(yōu)化表達(dá)水Tuner平:降溫,IPTG 濃度優(yōu)化Rosetta-gami B細(xì)胞死亡,生長毒性更嚴(yán)格的本底表達(dá)pLysS極困難蛋白控制菌株過高更嚴(yán)格的本底表達(dá)pLysS 、無克隆生長本底表達(dá)控制pLysE菌株4 若實(shí)在不可溶,只能把蛋白截短,這樣可溶性會(huì)明顯增加。六 SDS-PAGE的相關(guān)技巧:1 SDS-PAGE電泳的原理:SDS- 聚丙烯酰胺凝膠電泳,是在聚丙烯酰胺凝膠系統(tǒng)中引進(jìn)SDS(十二烷基硫酸鈉),SDS 會(huì)與變性的多肽,并使蛋白帶負(fù)電荷,由于多肽結(jié)合SDS 的量幾乎總是與多肽的分子量成正比而與其序列無關(guān),因此SDS 多肽復(fù)合物在丙稀酰胺凝膠電泳中的遷移率只

35、與多肽的大小有關(guān),在達(dá)到飽和的狀態(tài)下,每克多肽可與1.4g去污劑結(jié)合。當(dāng)分子量在15KD到 200KD之間時(shí),蛋白質(zhì)的遷移率和分子量的對(duì)數(shù)呈線性關(guān)系,符合下式:logMW=K-bX,式中:MW為分子量,X 為遷移率,k 、 b 均為常數(shù),若將已知分子量的標(biāo)準(zhǔn)蛋白質(zhì)的遷移率對(duì)分子量對(duì)數(shù)作圖,可獲得一條標(biāo)準(zhǔn)曲線,未知蛋白質(zhì)在相同條件下進(jìn)行電泳,根據(jù)它的電泳遷移率即可在標(biāo)準(zhǔn)曲線上求得分子量。感謝下載載精品2 SDS-PAGE電泳遇到的相關(guān)問題及解答。( 1 )配膠緩沖液系統(tǒng)對(duì)電泳的影響?在 SDS PAGE 不連續(xù)電泳中,制膠緩沖液使用的是Tris HCL 緩沖系統(tǒng),濃縮膠是pH6.7 ,分離膠pH8.9 ;而電泳緩沖液使用的Tris 甘氨酸緩沖系統(tǒng)。在濃縮膠中,其pH 環(huán)境呈弱酸性,因此甘氨酸解離很少,其在電場(chǎng)的作用下,泳動(dòng)效率低;而 CL 離子

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