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文檔簡介

1、1.1、生物大分子種類:蛋白質(zhì)、糖類、脂類、核酸1.2、生物大分子的相互作用力:(主要是非共價作用力,即次級鍵,包括氫鍵、范德華引力、疏水作用力、鹽鍵等)2.1 、miRNA:又稱微小RNA,是指植物和動物細(xì)胞中自然產(chǎn)生的一類長度為1825bp的小分子RNA。3.1、順反子(遺傳學(xué)上的最小單位)是一段核苷酸序列,能編碼一條完整的多肽鏈,這種多肽鏈既可以是一種生物活性的蛋白質(zhì),也可與其他多肽聚合而形成復(fù)雜的蛋白質(zhì)。順反子中最小交換單位(交換子)和最小突變單位(突變子)都是DNA分子中的一個核苷酸對。3.2、在不連續(xù)基因中有編碼功能的區(qū)段稱為外顯子(exon),無編碼功能的區(qū)段稱為內(nèi)含子(intr

2、on)。3.3 、ORF:可讀框,是指從起始密碼子起到終止密碼子為止的一段連續(xù)的密碼子區(qū)域,或在DNA序列測定中由計算機(jī)系統(tǒng)辨別認(rèn)出的可能的編碼區(qū)域 4.1、8.參與DNA復(fù)制有關(guān)的酶和蛋白質(zhì)?(1)、DnaA識別起始序列,在起始特異性位置解開雙鏈、 (2)、DnaB 解開DNA雙鏈、 (3)、DnaC幫助DnaB結(jié)合于起點、 (4)、HU類組蛋白,DNA結(jié)合蛋白,促進(jìn)起始(5)、DnaG(引物合成酶)合成RNA引物(6)、SSB(單鏈DNA結(jié)合蛋白)結(jié)合單鏈DNA、 (7)、RNA聚合酶促進(jìn)DnaA活性、 (8)、DNA解旋酶(拓?fù)洚悩?gòu)酶II)釋放DNA解鏈過程中產(chǎn)生的扭曲張力、 (9)、D

3、am甲基化酶使起點GATC序列的腺嘌呤甲基化。4.2、前導(dǎo)鏈(leading strand):與復(fù)制叉移動的方向一致,通過連續(xù)的5-3聚合合成的新的DNA鏈。后隨鏈或滯后鏈(lagging strand):與復(fù)制叉移動的方向相反,通過不連續(xù)的5-3聚合合成的新的DNA鏈。又稱滯后鏈5.1、點突變(堿基對置換):DNA錯配堿基在復(fù)制后被固定下來。由原來的一個堿基對被另一個堿基對取代。堿基對置換有兩種類型:轉(zhuǎn)換(transition),指兩種嘧啶或兩種嘌呤之間互換;顛換(transversion),發(fā)生在嘧啶和嘌呤之間的互換。6.1、DNA重組類型:同源重組、位點特異性重組、轉(zhuǎn)座重組和異常重組。6

4、.2、同源重組(homologous recombination)是指一般性重組,由兩條通遠(yuǎn)去的DNA分子,通過配對、鏈斷裂和再連接而產(chǎn)生的片段之間的交換過程。6.3、Holliday模型:它是通過要發(fā)生重組的2個DNA分子的2條單鏈在同一部位斷裂,斷裂的游離末端彼此交換形成異源雙鏈,然后2條雜合單鏈彼此連接形成Holliday連接體。是用來解釋同源重組現(xiàn)象。6.4、轉(zhuǎn)座子(transposon):是在基因組中可以移動的一段DNA序列。類型:插入序列(insertion sequence,IS,簡稱IS因子),最簡單的轉(zhuǎn)座子;復(fù)合轉(zhuǎn)座子,這類轉(zhuǎn)座子中除了有轉(zhuǎn)座酶基因外,還帶有藥物抗性基因(或其

5、相關(guān)基因),因結(jié)構(gòu)較大而復(fù)雜。6.5、復(fù)合型轉(zhuǎn)座子與IS元件異同復(fù)合型轉(zhuǎn)座子特點:(1)末端有反向重復(fù)序列,為轉(zhuǎn)座酶所必須(2)中間有ORF作為標(biāo)記基因(3)轉(zhuǎn)座后,把位點大都成為正向重復(fù)序列。異同點:IS元件較小,含一個轉(zhuǎn)座酶基因,編碼與轉(zhuǎn)座有關(guān)的蛋白質(zhì);兩側(cè)為短的末端反向重復(fù)序列。復(fù)合型轉(zhuǎn)座子:較大而復(fù)雜;含一個轉(zhuǎn)座酶基因,基因末端為反向重復(fù)序列;中間含有標(biāo)記基因、轉(zhuǎn)為后,靶位點成正向重復(fù)序列。7.1、原核RNA轉(zhuǎn)錄的一般過程。7.2、簡述真核與原核生物基因轉(zhuǎn)錄的差異(1)原核只有一種RNA聚合酶,真核有三種(2)啟動子結(jié)構(gòu)不同,真核有三種不同的啟動子和相關(guān)元件(3)真核RNApol高度分

6、工,核內(nèi)三種RNA聚合酶分別轉(zhuǎn)錄不同類型的核基因(4)真核RNApol借助各種轉(zhuǎn)錄因子選擇結(jié)合啟動子,轉(zhuǎn)錄過程有很多蛋白因子參與(5)轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物差別很大,原核的初始轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物大多數(shù)都是編碼序列,與蛋白質(zhì)氨基酸序列成線性關(guān)系;真核,初始產(chǎn)物很長,有內(nèi)含子,成熟的mRNA只占初始轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的一小部分。(6)真核轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物經(jīng)歷剪接,修飾的轉(zhuǎn)錄后加工成熟過程,原核初始轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物基本無成熟過程,直接作為成熟mRNA行使翻譯模板工功能;原核生物的其他各類RNA仍以前體方式合成,然后加工為成熟的rRNA,tRNA等(7)原核:轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物mRNA為多順反子;大多數(shù)真核,mRNA是單順反子結(jié)構(gòu)。(8)原核:轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物直接作為

7、翻譯模板,轉(zhuǎn)錄合成mRNA的同時,蛋白質(zhì)翻譯也在進(jìn)行。即原核轉(zhuǎn)錄mRNA與蛋白翻譯進(jìn)行偶聯(lián)。(9)真核轉(zhuǎn)錄以正調(diào)控為主,原核調(diào)控正、負(fù)都有。(10)真核DNA的順式元件比原核復(fù)雜得。7.3、轉(zhuǎn)錄的不對稱性是指在RNA的合成中,DNA的二條鏈中僅有一條鏈可作為轉(zhuǎn)錄的模板,稱為轉(zhuǎn)錄的不對稱性。與mRNA序列相同的那條DNA鏈稱為編碼連(encoding strand)/(非模板鏈(non- template strand)/:非模鏈板與合成的RNA產(chǎn)物鏈從一個方向閱讀時序列完全相同。/有義鏈(sense strand)/正鏈(Positive-strand);將另一條根據(jù)堿基互補原則指導(dǎo)mRNA合

8、成的DNA鏈稱為模板鏈(template strand):用于轉(zhuǎn)錄的鏈。/反義鏈(anti-sense strand):復(fù)制出的互補鏈。/負(fù)鏈(Negative strand)。7.4、TF(transcription factor,轉(zhuǎn)錄因子):真核生物RNA聚合酶在轉(zhuǎn)錄過程中所需要的各種蛋白質(zhì)因子。分為兩類:通用轉(zhuǎn)錄因子(general transcription ,GTF)和基因特性轉(zhuǎn)錄因子(gene specific transcription factor,)7.5、TBP(TATA結(jié)合蛋白)作用,TBP是PIC的一部分,并在組建復(fù)合物過程中發(fā)揮組織作用;TBP的特異性由與其相伴的TA

9、F決定;TBP是一種普通的對所有啟動子都起作用的轉(zhuǎn)錄因子,而不要求啟動子是否都具有TATA框。7.6、真核三種RNA聚合酶分別轉(zhuǎn)錄什么RNA:RNA聚合酶I轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物為rRNA,RNA聚合酶II的產(chǎn)物負(fù)責(zé)hmRNA或mRNA前體轉(zhuǎn)錄,RNA聚合酶III負(fù)責(zé)tRNA。8.1、核mRNA前體內(nèi)含子的剪接有哪幾種:(1)自我剪接內(nèi)含子(2)蛋白質(zhì)參與剪接的內(nèi)含子(3)依賴snRNP剪接的內(nèi)含子。9.1、遺傳密碼的簡并性:同一種氨基酸具有兩個或更多個密碼子的現(xiàn)象,主要變現(xiàn)在mRNA密碼子的第三位堿基上。簡并性的出現(xiàn)是由于tRNA反密碼子的第一位堿基可以和mRNA構(gòu)成擺動堿基對。極性通常是由密碼子的第二位

10、堿基決定。9.2、反密碼子:是位于tRNA反密碼環(huán)中部、可與mRNA中的三聯(lián)體密碼子形成堿基配對的三個相鄰堿基。SD序列:細(xì)菌的mRNA通常含有一段位于起始AUG序列上游10nt左右富有嘌呤堿基的區(qū)域。9.3、何謂信號肽?有哪些功能特點?信號肽(signal peptide):是進(jìn)入ER受體蛋白N端的一段疏水性肽段,其基因的5端有一段1632個氨基酸肽段。功能特點:(1)幾乎所有的信號肽都是疏水的(2)信號肽一般位于蛋白質(zhì)的N端,進(jìn)入膜后被信號肽酶水解(3)信號肽中部由10-15個殘基構(gòu)成疏水性核,這種核容易形成 螺旋,進(jìn)而被折疊,這些機(jī)構(gòu)對信號肽功能很重要。 (4)信號肽C端有一個能被信號肽

11、酶識別的位點(5)將信號肽認(rèn)為只是位于N端的一段疏水短肽是片面的(6)信號肽沒有嚴(yán)格的專一性(7)信號肽還是一種環(huán)狀結(jié)構(gòu)。(起功能是在信號識別蛋白(SRP)和SRP受體等因子的協(xié)助下引導(dǎo)多肽鏈穿過ER膜進(jìn)入腔內(nèi))。10.11、乳糖操縱子調(diào)控模型主要內(nèi)容:   Z、Y、A基因的產(chǎn)物由同一條多順反子的mRNA分子所編碼  這個mRNA分子的啟動子緊接著操縱區(qū)(O區(qū)),而位于阻遏基因I與操縱基因O之間的啟動子區(qū)(P),不能單獨起動合成-半乳糖苷酶和透過酶的生理過程。  操縱基因是DNA上的一小段序列(僅為26bp),是阻遏物的結(jié)合位點。&#

12、160;當(dāng)阻遏物與操縱基因結(jié)合時,lac mRNA的轉(zhuǎn)錄起始受到抑制。 誘導(dǎo)物通過與阻遏物結(jié)合,改變它的三維構(gòu)象,使之不能與操縱基因結(jié)合,從而激發(fā)lac mRNA的合成。當(dāng)有誘導(dǎo)物存在時,操縱基因區(qū)沒有被阻遏物占據(jù),所以啟動子能夠順利起始mRNA的合成。10.12、色氨酸操縱子機(jī)制(1)阻遏蛋白的負(fù)調(diào)控:受其上游調(diào)控蛋白R基因的調(diào)控。R并沒有與O結(jié)合的活性,只有當(dāng)環(huán)境能提供足夠濃度的色氨酸時,R與色氨酸結(jié)合后而活化,能夠與O結(jié)合,阻遏結(jié)構(gòu)基因的轉(zhuǎn)錄。 (2)弱化子及其作用:當(dāng)色氨酸達(dá)到一定濃度,但還沒有高到能夠活化R使其起阻遏作用的程度時,產(chǎn)生色氨酸合成酶類的量已經(jīng)明顯降低,而且產(chǎn)生的酶量與色氨酸濃度呈負(fù)相關(guān)。這種調(diào)控現(xiàn)象與色氨酸操縱子特殊的結(jié)構(gòu)有關(guān)。 10.2、CAP(環(huán)腺苷酸受體蛋白) 是大腸桿菌分解代謝物基因活化蛋白,這種蛋白可將葡萄糖饑餓信號傳遞個許多操縱子,使細(xì)菌在缺乏葡萄糖時可以利用其他碳源,屬于正調(diào)控。10.3、操縱子一般包括調(diào)節(jié)基因、啟動子、操縱基因核仁結(jié)構(gòu)基因等功能序列組成。10.4、 反式作用因子10.5、模體(motif)和結(jié)構(gòu)域(domai

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