SLE基因定位：人類(lèi)疾病之范例？PPT課件

1、SLE基因定位：人類(lèi)疾病之范例？基因定位：人類(lèi)疾病之范例？Stephen S. Rich, Ph.D.Department of Public Health SciencesWake Forest University School of Medicine簡(jiǎn)單與復(fù)雜性狀之比較簡(jiǎn)單與復(fù)雜性狀之比較 簡(jiǎn)單性狀 復(fù)雜性狀 -少見(jiàn) - 常見(jiàn) - 單個(gè)基因（孟德?tīng)柗▌t） - 許多基因（寡基因的） - 重度突變 - 輕微突變 - 明顯的表型效應(yīng) - 小的表型效應(yīng)復(fù)雜疾病之難點(diǎn)復(fù)雜疾病之難點(diǎn)l 復(fù)雜的基礎(chǔ)生物學(xué)機(jī)制導(dǎo)致難于確定復(fù)雜疾病易感性相關(guān)基因 - 表型異質(zhì)性 - 遺傳異質(zhì)性 - 基因-環(huán)境相互作用l

2、針對(duì)輕微效應(yīng)易感基因（QTLs），目前的研究手段有限l 遺傳研究樣本規(guī)?；蚧?環(huán)境相互作用環(huán)境相互作用基因基因-環(huán)境相互作用：環(huán)境相互作用：復(fù)雜遺傳疾病復(fù)雜遺傳疾病遺傳/宿主易感性環(huán)境影響臨床前期（危險(xiǎn)因素或疾病易感性標(biāo)記物）出現(xiàn)臨床癥狀（可逆或不可逆的器官結(jié)構(gòu)和功能改變）如何發(fā)現(xiàn)一個(gè)基因如何發(fā)現(xiàn)一個(gè)基因l 確定一個(gè)人群l 臨床評(píng)價(jià)l 連鎖分析-基因組篩選l 精細(xì)定位和基因定位l 基因鑒定/序列變異體l 功能基因組：基因表達(dá)臨床評(píng)價(jià)問(wèn)題臨床評(píng)價(jià)問(wèn)題l 定義疾病表型 病史，亞臨床后果的證據(jù)，以及通過(guò)臨床檢查進(jìn)行證實(shí) 具有不同資料的門(mén)診記錄對(duì)下述問(wèn)題有肯定答案： - “您是否曾經(jīng)被診斷為 ”

3、- “如果是，這種情況是否發(fā)生過(guò)一次以上？”l 標(biāo)準(zhǔn)化問(wèn)卷l 標(biāo)準(zhǔn)化協(xié)議l 研究協(xié)作和人員培訓(xùn)l 質(zhì)量控制/質(zhì)量保障人群選擇人群選擇l 表現(xiàn) - 孤立的，混合的或者近交的 - 混合的、異質(zhì)性人群l 家族結(jié)構(gòu) - 無(wú)關(guān)個(gè)體 - 家族 父母和子女 擴(kuò)大的家族：家系l 來(lái)源 - 單一人種 - 多種人種連鎖分析示例連鎖分析示例受累的同胞家系受累的同胞家系系統(tǒng)性紅斑狼瘡（系統(tǒng)性紅斑狼瘡（SLE）l SLE是一種慢性自身免疫炎癥性疾病，以自身抗體的產(chǎn)生為特征l SLE是一種臨床異質(zhì)性疾病，可導(dǎo)致多系統(tǒng)損害，如關(guān)節(jié)、皮膚、血液和腎臟l SLE多發(fā)生于育齡期婦女（90%）l 美國(guó)SLE發(fā)生率約為40-45例/

4、100，000（Hochberg 1997）SLE的家族性的家族性l SLE具有較強(qiáng)的遺傳成分 MZ孿生子的同病率增加（Deapen et al.,1992,Reichlin et al.,1992） 同胞間患病風(fēng)險(xiǎn)增加（s=10-20;Vyse and Todd,1996）l SLE不表現(xiàn)為單純孟德?tīng)栠z傳模式，可能包括：受累的親屬配對(duì)集受累的親屬配對(duì)集l Minnesota cohort - 187對(duì) SLE同胞配對(duì)家族 - 6p11-21,16q13,14q21-23,20p12.3 l Oklahoma cohort - 94 個(gè)擴(kuò)大的多重家系 - 1q23,13q32,20q13,1q31l 種族特異性效應(yīng)SLE聯(lián)合基因組掃描的聯(lián)合基因組掃描的NPL回歸分析回歸分析聯(lián)合基因組掃描聯(lián)合基因組掃描SLE標(biāo)本的相似標(biāo)本的相似性和差異性性和差異性聯(lián)合基因組掃描聯(lián)合基因組掃描SLE在不同種族在不同種族中的差異中的差異總結(jié)總結(jié) 狼瘡SCOR聯(lián)合基因組掃描為SLE在數(shù)個(gè)染色體區(qū)域的定位提供了證據(jù)：1q,4p,4q,6,7p,16,20 除第6號(hào)染色體之外，我們樣品的連鎖峰值以以白人家系為主 我們的數(shù)個(gè)連鎖信號(hào)被已有報(bào)道的一些基因組掃描數(shù)據(jù)相佐證