配體受體結合ppt課件

1、配體受體結合1;.2配體受體結合函數(shù)配體受體結合函數(shù)配體配體 - 受體結合模型受體結合模型溶劑對配體受體結合的影響溶劑對配體受體結合的影響物理性質決定的配體物理性質決定的配體 - 受體結合受體結合 目目 錄錄3通則通則回目錄配體配體受體在活體內的交互取決于大量的多樣的因素受體在活體內的交互取決于大量的多樣的因素。一旦配體和受體足夠接近,配體可以分散和到達到對應受體的結合位點。這需要配體和受體之間的識別。這可能是由配體和受體之間的長程靜電相互作用,然后由短程氫鍵和范德華相互作用。這些相互作用廣泛變化。水分子將被綁定取代，雖然有些可能留存在表面和居中綁定影響。4配體L和受體R：結合過程對應的處理確

2、定所述雙分子締合速率常數(shù)，導通率，Kon。在解除綁定過程決定了雙分子解離速率常數(shù)，解離速率，Koff。配體受體結合函數(shù)配體受體結合函數(shù)回目錄5系統(tǒng)的受體配體結合。 （a）在鎖和鑰匙模型中，配體（綠色）恰好裝配到受體結合位點（紫色）。 （b）該配體與受體弱相關聯(lián)和誘導產(chǎn)生的結合構象變化。（c）配體優(yōu)先結合于該受體的某些一致構象。實施方法實施方法回目錄6在配體在配體 - 受體結合的第一種模型，埃米爾受體結合的第一種模型，埃米爾菲舍爾提出，受體和配體組合在一起就像鎖菲舍爾提出，受體和配體組合在一起就像鎖和鑰匙和鑰匙.在這個比喻中，可以方便的觀看鎖和鑰匙之間的區(qū)別。然而，在鎖和鑰匙的畫在這個比喻中，可

3、以方便的觀看鎖和鑰匙之間的區(qū)別。然而，在鎖和鑰匙的畫面，受體和配體是剛性的實體。在現(xiàn)實中，結合是伴隨某種程度的構象變化的。這可面，受體和配體是剛性的實體。在現(xiàn)實中，結合是伴隨某種程度的構象變化的。這可以在以在“拉鏈拉鏈”或者或者“手到手套手到手套”的類比來形容受體的類比來形容受體 - 配體相互作用。構象變化可以被配體相互作用。構象變化可以被認為是一種由于結合不同優(yōu)勢構象的誘導契合。構象選擇合奏分子中的結合和未結合認為是一種由于結合不同優(yōu)勢構象的誘導契合。構象選擇合奏分子中的結合和未結合狀態(tài)或兩者的組合。一些結合模型都是在藥物設計特別感興趣的。狀態(tài)或兩者的組合。一些結合模型都是在藥物設計特別感興

4、趣的。配體 - 受體結合模型回目錄7溶劑周圍的配體和受體對它們的結合有非常重要的影響。與像甲醇或脂質膜的疏水性內部非極性環(huán)境相比在像水的極性溶劑中結合親和力非常不同。這是因為結合總是涉及配體 - 受體相互作用和配體 - 溶劑和受體 - 溶劑相互作用之間的競爭。周圍的離子強度和pH會影響配體和受體之間的靜電相互作用的強度。Viscogens和擁擠代理也可以影響配體 - 受體結合。它們可通過它們的粘度影響結合親和力或通過動力學改變介電性能。溶劑對配體受體結合的影響溶劑對配體受體結合的影響回目錄8配體 - 受體結合包括通過配體置換的配體 - 水分子和受體水分子的相互作用受體和水與水的相互作用。范德華

5、相互作用貢獻毫不遜色于配體 - 受體親和力。物理性質作用的配體物理性質作用的配體 - 受體結合受體結合9受體 - 配體絡合中的水。 （a）主要尿蛋白-I（MUP-I）與結合的配體（PDB代碼1I06）。兩水域（紫色球）的配體結合囊（表面表示）的疏水性環(huán)境使得極性基團的相互作用呈現(xiàn)在親脂性信息素上（棒表示）。 （b）該周質的復雜寡肽結合蛋白與OPPA肽（LysGluLys）（PDB代碼1JEU）。蛋白質的唯一活性中心殘基如圖（棒表示）。水分子（紫色球）調解它的肽配體之間的相互作用（周質寡肽結合蛋白）。 （c）蛋白激酶C的相互作用蛋白（PKCI）二聚物（PDB代碼1KPA）具有干燥表面與大多數(shù)晶體

6、觀察水分子（紫色球）形成的界面周圍的環(huán)。10在晶體結構中學習配體 - 受體表面的包裝方式和水合模式。一些界面是很好填充水分子（例如，見，圖c）。有序界面水分子位點往往在既定位置上，水分子可以調節(jié)受體和配體之間的氫鍵（圖b）。特別有序水分子位點有時被認為是溶質的固有部分。界面水分子位點可以改變一個結合位點的特異性，因為它們有能力接受和捐贈達四個氫鍵。如示于（圖a）的例子中，界面的水分子可允許相當疏水受體位點與配體相互作用并適應其氫鍵的能力。11 靜電相互作用在配體 - 受體結合發(fā)揮一個顯著的作用。它們是長程、隨距離變化的為 ，因此特別重要對于分子識別。在整個分子中的電荷分布，每個分子可被認為具有不僅一個凈電荷。在配體 - 受體模型研究中，局部電荷通常分配到原子中心。相同電荷排斥和不同電荷相吸。因此，許多積極和消極的方面構成一個庫侖靜電能量配體 - 受體復合物，下式給出：1r12其中，0是自由空間的介電常數(shù)，為周圍介質的相對介電常數(shù)，并且QL和QR是局部原子點電荷的配體和受體。庫侖定律適用于均勻電介質。如果該系統(tǒng)的所有的原子都明確建模，包括溶劑中所有