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(hù)服。6)每次實(shí)驗(yàn)后,所有表面都要用0.6%的次氯酸鈉進(jìn)行清理。次氯酸鈉應(yīng)該當(dāng)天配制,將商業(yè)漂白劑與水進(jìn)行1:10的稀癖,將pH調(diào)到7。這個(gè)溶液可以抑制致病原,破壞核酸。殘留的漂白劑要用0.1%的硫代硫酸鈉和70%乙醇或等價(jià)物去除,否則可能會(huì)在不銹鋼或罩子上留下斑跡。商業(yè)產(chǎn)品是為去除核酸特別設(shè)計(jì)的,核酸酶也可以用于表面的清理。只要懷疑受到污染,熱循環(huán)機(jī)和離心機(jī)用稀釋的漂白劑清理(同3)。離心管的清洗根據(jù)制造商的說(shuō)明。貨架和托盤(pán)每次使用后在0.6%的次氯酸鈉溶液中浸泡后用水充分沖洗。凝膠梳和玻璃器皿使用后用中性洗滌劑或用水沖洗。4一些具體污染防控措施1)應(yīng)盡可能優(yōu)化和整合樣品DNA提取、反應(yīng)液配制的操作步驟,以減少污染機(jī)會(huì)。所有試劑應(yīng)以大體積、高濃度配制,然后稀釋和分裝成僅夠一次使用的量進(jìn)行貯存,以避免污染。2)盡量使用一次性的、帶濾芯的加樣器吸頭,以減少氣溶膠的污染機(jī)率。3)UNG控制污染:使用尿嗟呢DNA-糖昔酶(UNG),并用脫氧尿昔三磷酸(dUTP)代替脫氧胸甘三磷酸(dTTP)。其做法是將所有的擴(kuò)增反應(yīng)與UNG酶進(jìn)行預(yù)反應(yīng),可以去除殘留在DNA中的dU(但不影響DNA、gUTP或RNA),產(chǎn)生數(shù)十或數(shù)百的無(wú)堿基位點(diǎn),DNA聚合酶會(huì)在這些位點(diǎn)處停滯。而且這些位點(diǎn)是不穩(wěn)定的,在熱循環(huán)中會(huì)發(fā)生斷裂,每一種損傷都會(huì)防止重?cái)U(kuò)增的發(fā)生。PCR產(chǎn)物越長(zhǎng),UNG去污染的效率就越高,但對(duì)短于100bp的PCR產(chǎn)物不能用UNG完全消除污染。4)紫外線控制污染。用紫外線使干燥的DNA失活以減少器材表面模板DNA污染的手段,機(jī)理是通過(guò)在相鄰的嗟嚏堿基之間形成環(huán)丁烷而造成DNA損傷,環(huán)「烷形成鏈內(nèi)的嗟呢二聚體,從而抑制了聚合酶介導(dǎo)的鏈延伸反應(yīng)。其缺陷是不能消除所有污染,而只能將污染降低幾個(gè)數(shù)量級(jí),并且當(dāng)DNA片段小于300bp時(shí)效果較差。另外像加樣器、離心機(jī)等器材只有一小部分是向著光源的,這樣就不能被紫外線有效地去除污染。因而,紫外線照射僅可以為PCR實(shí)驗(yàn)室的無(wú)污染提供部分安全保障。5)應(yīng)該在日常樣品檢測(cè)中分析陽(yáng)性和陰性質(zhì)量控制對(duì)照結(jié)果,以說(shuō)明基于PCR方法的實(shí)驗(yàn)結(jié)果的可靠性。從污染控制角度,應(yīng)合理設(shè)立陰性對(duì)照和空白對(duì)照1。1)陰性對(duì)照陰性對(duì)照是指應(yīng)對(duì)使用的每一套引物和探針進(jìn)行分析從而確定在樣品處理過(guò)程中,反應(yīng)預(yù)混液和樣品中不存在核酸污染。在反應(yīng)過(guò)程中,陰性對(duì)照沒(méi)有擴(kuò)增信號(hào)則說(shuō)明檢測(cè)體系是成立的。兩種主要形式的陰性對(duì)照介紹如表1所列。(l)PCR陰性對(duì)照PCR陰性對(duì)照用于確保反應(yīng)預(yù)混液中沒(méi)有核酸污染。該對(duì)照是在配制主反應(yīng)混合液中加入模版的步驟時(shí)加入的,只是加入的不是待擴(kuò)增的模版而是加入分子生物學(xué)級(jí)別的水或緩沖液替代模版。陰性對(duì)照呈現(xiàn)陰性結(jié)果表明反應(yīng)預(yù)混液和試劑都沒(méi)有被污染。在每個(gè)PCR反應(yīng)批次的每套引物的現(xiàn)場(chǎng)測(cè)試樣品中按照1~5%的數(shù)量設(shè)置。一個(gè)PCR反應(yīng)批次是指一組樣品使用相同的PCR預(yù)混液和PCR儀,在相同的PCR反應(yīng)條件下進(jìn)行擴(kuò)增。(2)方法的空白對(duì)照設(shè)置方法的空白對(duì)照是為了檢查在樣品處理過(guò)程和PCR分析過(guò)程中是否有污染。這個(gè)控制步驟是通過(guò)使用滅菌水完成的,這份滅菌水與測(cè)試樣品一起經(jīng)過(guò)前處理,核酸提取,樣品轉(zhuǎn)移以及PCR反應(yīng)等步驟。每一樣品批次至少設(shè)置一個(gè)方法的空白對(duì)照。一個(gè)樣品批次是指測(cè)試樣品的整過(guò)實(shí)驗(yàn)步驟包括從樣品處理直到PCR反應(yīng)。不同種類的轉(zhuǎn)基因樣品,如果前處理和核酸提取步驟不同,就視為不同的樣品批次的樣品。2)環(huán)境質(zhì)控對(duì)照這種對(duì)照可每月進(jìn)行一次。具體方法是:在試劑準(zhǔn)備區(qū),向主反應(yīng)混合液中加入滅菌水以替代模板。然后將這些PCR管放置在試劑準(zhǔn)備區(qū)、樣品準(zhǔn)備區(qū)、核酸提取區(qū)中,將蓋子打開(kāi),暴露15分鐘后蓋好。將這些PCR管同陰性對(duì)照一樣進(jìn)行PCR擴(kuò)增。如果任何一管出現(xiàn)陽(yáng)性
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