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核苷酸代謝主題知識(shí)講座核苷酸代謝主題知識(shí)講座第1頁(yè)核苷酸代謝
本章重點(diǎn)討論核酸酶類別和特點(diǎn),以及核苷酸生物合成和分解代謝。第一節(jié)核酸酶促降解第三節(jié)核苷酸合成代謝第二節(jié)核苷酸分解代謝核苷酸代謝主題知識(shí)講座第2頁(yè)核酸酶促降解
一、核酸酶二、限制性內(nèi)切酶
核酸酶核苷酸酶核苷酸磷酸化酶
核酸核苷酸核苷堿基+戊糖磷酸核苷酸代謝主題知識(shí)講座第3頁(yè)核酸酶
1、核酸酶分類(1)依據(jù)對(duì)底物專一性分為(2)依據(jù)切割位點(diǎn)分為核糖核酸酶(RNase)脫氧核糖核酸酶(DNase)非特異性核酸酶核酸內(nèi)切酶核酸外切酶2、核酸酶作用特點(diǎn)核苷酸代謝主題知識(shí)講座第4頁(yè)外切核酸酶對(duì)核酸水解位點(diǎn)5′
p
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pOHB
p
p
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p3′BBBBBBB牛脾磷酸二酯酶(5′端外切5得3)蛇毒磷酸二酯酶(3′端外切3得5)核苷酸代謝主題知識(shí)講座第5頁(yè)內(nèi)切核酸酶對(duì)RNA水解位點(diǎn)示意圖5′
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pOHPyPuPyPy1′
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pGACU
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pGA3′RNAaseIRNAaseIRNAaseT1RNAaseT1Pu:嘌呤Py:嘧啶
核苷酸代謝主題知識(shí)講座第6頁(yè)限制性內(nèi)切酶
類型
命名
意義
原核生物中存在著一類能識(shí)別外源DNA雙螺旋中4-8個(gè)堿基對(duì)所組成特異含有二重旋轉(zhuǎn)對(duì)稱性回文序列,并在此序列某位點(diǎn)水解DNA雙螺旋鏈,產(chǎn)生粘性末端或平末端,這類酶稱為限制性內(nèi)切酶(ristrictionendonuclease)。核苷酸代謝主題知識(shí)講座第7頁(yè)限制性內(nèi)切酶類型
I型:分子量大于105,多亞基,需S-腺苷蛋氨酸、ATP和Mg2+,識(shí)別位點(diǎn)與切割位點(diǎn)相差甚遠(yuǎn),產(chǎn)物為異質(zhì),是限制與修飾相排斥多功效酶.
Ⅱ型:分子量小于105,需Mg2+,切割位點(diǎn)位于識(shí)別位點(diǎn)上,產(chǎn)物為專一性片段,不具修飾酶功效?,F(xiàn)在分子生物學(xué)研究所用限制性內(nèi)切酶均為這類。
Ⅲ型:識(shí)別位點(diǎn)為5-7bp非對(duì)稱序列
,切割位點(diǎn)在次序之外離識(shí)別序列5-10bp,切割雙鏈,個(gè)別也切割單鏈。是限制與修飾多功效酶.核苷酸代謝主題知識(shí)講座第8頁(yè)常見(jiàn)DNA限制性內(nèi)切酶專一性酶識(shí)別序列和切口說(shuō)明‥‥AGCT‥‥‥‥TCGA‥‥‥‥GGATCC‥‥‥‥CCTAGG‥‥‥‥AGATCT‥‥‥‥TCTAGA‥‥‥‥GAATTC‥‥‥‥CTTAAG‥‥‥‥AAGCTT‥‥‥‥TTCGAA‥‥‥‥GTCGAC‥‥‥‥CAGCTG‥‥‥‥CCCGGG‥‥‥‥GGGCCC‥‥BamHIAluIBglIEcoRIHindⅢSalISmaI四核苷酸,平端切口六核苷酸,平端切口六核苷酸,粘端切口六核苷酸,粘端切口六核苷酸,粘端切口六核苷酸,粘端切口六核苷酸,粘端切口核苷酸代謝主題知識(shí)講座第9頁(yè)限制性內(nèi)切酶命名和意義EcoRI序號(hào)屬名種名株名例:EcoRI,這是從大腸桿菌(Ecoli)R菌珠中分離出一個(gè)限制性內(nèi)切酶
限制性內(nèi)切酶是分析染色體結(jié)構(gòu)、制作DNA限制圖譜、進(jìn)行DNA序列測(cè)定和基因分離、基因體外重組等研究中不可缺乏工具,是一把天賜神刀,用來(lái)解剖纖細(xì)DNA分子。核苷酸代謝主題知識(shí)講座第10頁(yè)核苷酸降解2、嘧啶降解1、嘌呤降解
核苷酸酶核苷酸磷酸化酶核苷酸核苷堿基+(脫氧)戊糖磷酸核苷酸代謝主題知識(shí)講座第11頁(yè)嘌呤分解核苷酸代謝主題知識(shí)講座第12頁(yè)嘧啶分解核苷酸代謝主題知識(shí)講座第13頁(yè)核苷酸合成代謝一、核糖核苷酸生物合成二、脫氧核糖核苷酸生物合成三、單核苷酸轉(zhuǎn)變成核苷二磷酸和核苷三磷酸(自學(xué))四、各種核苷酸相互轉(zhuǎn)變核苷酸代謝主題知識(shí)講座第14頁(yè)核糖核苷酸生物合成1、嘌呤核苷酸生物合成(1)從頭合成路徑(2)補(bǔ)救路徑(自學(xué))2、嘧啶核苷酸生物合成(1)從頭合成路徑補(bǔ)救合成路徑(自學(xué))核苷酸代謝主題知識(shí)講座第15頁(yè)嘌呤核苷酸從頭合成路徑3、IMP轉(zhuǎn)變?yōu)锳MP和GMP
1、嘌呤環(huán)上原子起源2、IMP從頭合成核苷酸代謝主題知識(shí)講座第16頁(yè)嘌呤環(huán)上各原子起源N3N9N7N1C2C6C4C5C8來(lái)自谷氨酰胺酰胺氮來(lái)自甲酸來(lái)自甲酸來(lái)自天冬氨酸來(lái)自甘氨酸來(lái)自CO2核苷酸代謝主題知識(shí)講座第17頁(yè)IMP生物合成一碳基團(tuán)代謝核苷酸代謝主題知識(shí)講座第18頁(yè)IMP轉(zhuǎn)變?yōu)镚MP和AMP核苷酸代謝主題知識(shí)講座第19頁(yè)嘌呤核苷酸合成補(bǔ)救路徑(自學(xué))
磷酸核糖轉(zhuǎn)移酶嘌呤+PRPPA(G)MP+PPi嘌呤+1-P-核糖嘌呤核苷
A(G)MPATP
ADP核苷酸代謝主題知識(shí)講座第20頁(yè)嘧啶核苷酸從頭合成路徑
c、UMP轉(zhuǎn)變?yōu)镃TPCTPCTP合成酶
ATPGlnH2OUMPUDPUTP
a、嘧啶環(huán)上原子起源b、UMP從頭合成核苷酸代謝主題知識(shí)講座第21頁(yè)嘧啶環(huán)上各原子起源
來(lái)自天冬氨酸來(lái)自CO2來(lái)自NH3NNCCCC654321核苷酸代謝主題知識(shí)講座第22頁(yè)尿嘧啶核苷酸合成路徑核苷酸代謝主題知識(shí)講座第23頁(yè)嘧啶核苷酸補(bǔ)救合成路徑(自學(xué))尿嘧啶+PRPP尿嘧啶+1-P-核糖尿嘧啶核苷+ATPUMP+PPi尿嘧啶核苷+PiUMP+ADP核苷酸代謝主題知識(shí)講座第24頁(yè)脫氧核苷酸合成
2、脫氧胸腺嘧啶核苷酸合成1、脫氧核苷酸合成核苷酸代謝主題知識(shí)講座第25頁(yè)核糖核苷酸還原反應(yīng)硫氧還蛋白核糖核酸還原酶系硫氧還蛋白還原酶核糖核苷酸還原酶NADP+NADPH+H+硫氧還蛋白還原酶FAD核糖核苷酸還原酶(B1和B2)ATP、Mg2+硫氧還蛋白(還原型)SHSH硫氧還蛋白(氧化型)SSOP-P-CH2NOHOH核糖核苷二磷酸OP-P-CH2NOHH+H2O脫氧核糖核苷二磷酸核苷酸代謝主題知識(shí)講座第26頁(yè)脫氧胸腺嘧啶核苷酸合成
胸腺嘧啶核苷酸合成酶NADPH+H++SerNADP++Gly
N5、N10亞甲基FH4FH2二氫葉酸還原酶Ser羥甲基轉(zhuǎn)移酶ONHNOdR-PCH3ONHNOdR-PdUMPdTMP核苷酸代謝主題知識(shí)講座第27頁(yè)核苷酸合成及相互關(guān)系核苷酸代謝主題知識(shí)講座第28頁(yè)氨基酸與一碳基團(tuán)代謝
1、一碳基團(tuán)(一碳單位)概念2、一碳基團(tuán)和氨基酸代謝Gly、Ser、Thr、His都能夠作為一碳基團(tuán)供體。3、一碳基團(tuán)利用:參加合成反應(yīng),如磷脂、核苷酸等合成。核苷酸代謝主題知識(shí)講座第29頁(yè)一碳基團(tuán)
在代謝過(guò)程中,一些化合物(如氨基酸)能夠分解產(chǎn)生含有一個(gè)碳原子基團(tuán)(不包含CO2),稱為一碳基團(tuán)。一碳基團(tuán)轉(zhuǎn)移除了和許多氨基酸代謝直接相關(guān)外,還參加嘌呤和胸腺嘧啶生物合成一碳基團(tuán)轉(zhuǎn)移酶輔酶:FH4一碳基團(tuán)四氫葉酸化合物結(jié)構(gòu)和命名-CH=NH亞氨甲基H-CO-甲?;?CH2OH甲醇基-CH=次甲基-CH2-亞甲基-CH3甲基核苷酸代謝主題知識(shí)講座第30頁(yè)核苷酸代謝主題知識(shí)講座第31頁(yè)核苷酸代謝主題知識(shí)講座第32頁(yè)葉酸和四氫葉酸(FH4)葉酸四氫葉酸HH105N5,N10-CH2-FH4N5-CHO-FH4CH2CHO核苷酸代謝主題知識(shí)講座第33頁(yè)一碳基團(tuán)起源與轉(zhuǎn)變S-腺苷蛋氨酸N5-CH2-FH4N5N10-
CH2-FH4N5,N10=CH-FH4
N10-CH
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