遺傳標(biāo)記檢測方法及連鎖分析

遺傳標(biāo)記檢測方復(fù)旦大學(xué)生物醫(yī)復(fù)旦大學(xué)現(xiàn)代人類學(xué)教育SCI收 總計(jì)48篇;HumanMolecularJCEM等SCI收錄第一或通訊作 18中國遺傳學(xué)會(huì)遺傳咨詢分會(huì)委員（ 研究方向:1. 疾病遺傳學(xué)研2承擔(dān)課題973課題，國家自然科學(xué)基金面上項(xiàng)目，國家自然科金青年基金 市教委科研創(chuàng)新重點(diǎn)項(xiàng)目： 遺傳病及致 的克vs無雀vs卷發(fā)7

英 及

掌跖角??疾?。ㄈ珑牋罴t細(xì)胞貧血）主要發(fā)生在新和幼兒多疾病（如精癥）主要發(fā)生遺傳病是多種疾病 的重要原 由于 病發(fā)生基本上受一對等顯性遺OnlineMendelianinheritancein 疾病 遺傳?。┻z傳方式 顯性遺 遺

隱性遺x連鎖顯 遺

X連鎖隱 顯性遺傳致 在雜合狀態(tài)下即可致無病 的后代不會(huì)患此在系譜中，疾病連續(xù)相傳，無間斷現(xiàn) 遺傳致 只有在純合狀態(tài)下才致X.連鎖顯性遺 在系譜中，疾病連續(xù)傳遞，無間斷現(xiàn)X.連鎖隱性遺往往只見 患女性患者的父親亦為患者，母親為攜OnewaytothinkaboutEachpuzzlepiecewouldrepresentasetofgenesinaspecificway,similartoaFindingaGeneontheChromosomeMother’s Father’sTheinformationcarriedingenesdiffersslightlyfrom Thisiswhatmakeseachofusunique.Asaresult,thecolorsofthepuzzlepieceswouldbedifferentbetweenfamilymembers.ThechildreceivesexactlyhalfofitsgeneticinformationfromthemotherexactlyhalffromtheGeneticdisorderrunsin FindthepuzzlepiecethatisresponsibleforGenecauseCollinsFS.(1992)Naturegenetics1:3- 尿癥使得苯丙氨酸及苯酸積蓄并從尿中大等。1/16500 先定位、后克隆、不依賴于現(xiàn)有研究基定位家系連鎖分 因組圖譜所取代。但對許多尚未被克隆的致 而言， 本的定位全外顯 隨著 致病基因扮演著越來越家系連鎖分析法基本independentcomplete親本型重組型

重組型親本型在每 內(nèi)是直線排列的 可以自由組合，而排在 上 是不能自由組合的。這種特點(diǎn)稱 的“連鎖兩 間的重組率與它們的距離有關(guān)，相距越近重組率越小，組率為1%時(shí)的遺傳距離為1cM，約相當(dāng)于100萬bp兩 間的重組率也是相對恒定的，重組率的大小反 座上相對距重組值可以通過新組合在整個(gè)后代中的比例來推算重組率介于0-50%之間，在遺傳圖上以看超50c的現(xiàn)，這是因?yàn)閮蓚€(gè) 間發(fā)生了次交換。Ⅰ-Ⅱ-Ⅲ-Ⅳ-

Ⅱ-Ⅲ-Ⅳ- 遺傳標(biāo)Chrom.Chrom.Chrom.第一代遺傳標(biāo)限制性片段長度多態(tài)性(RestrictionFragmentLengthPolymorphism,RFLP)。第二代遺傳標(biāo)記:微 標(biāo)記420M9-3663（上）和478B14-848（下） 分型Lod值（對數(shù)優(yōu)勢比 LOD=log10(likelihoodofdataIflocilinkedat/likelihoodofdataiflociunlinkedat=0.5） LODscore=Z=

(1-θ)+1θ(1-]-5

L值是以1值＋1：LOD值為－2則表示100：1的連鎖機(jī)會(huì)，被認(rèn)為是排除連的。連鎖分Linkage————————————————————————————————LODSCOREAT ——————————————————————————————————————--------————————————————————————————————舉“Thepresentcasedemonstratesthatthelawoperatesinmanas ntsloweranimals.TheabnormalityisshownheretobeadominantFamilyFamilyandBDA1photosinFarabee’s 無大家系怎么辦 全外顯子舉連鎖分析：需大家系；定位后隱藏有 傳異質(zhì)性（Locusheterogeneity）+遺傳疾病的致 突克 遺傳病致 的意 為相關(guān)藥物開發(fā)提供藥 遺傳病及致 的尋高血風(fēng)濕性精

老年黃肥多疾?。河啥鄠€(gè)與環(huán)境因子共同作用所引起的遺傳性疾病。它包括由一個(gè)主和其他加上環(huán)境因子共同作用所引起，以及由相當(dāng)多的微效共同參與加上環(huán)境因子所引起。其遺傳方式復(fù)雜，很難在一個(gè)中確定正常和患病。只有通過對大量進(jìn)行研究后，方能確定遺傳因子在 病生中的作用 ⒋微效具有累加效應(yīng)，即一個(gè)對表型作用很小，但若干個(gè)共同作用，可對表型產(chǎn)生明顯 疾?。瓘?fù)雜的機(jī)

境質(zhì)量性 數(shù)量性Qualitativetraits tativeClassicalmedeliantraits2ormorealleleofageneWithlittleorLinkagestudy

Manygenesmodifiedby Complexdisease tative Schizophrenia,autism,arthritis,etComplexMutiplegeneswithsubtleeffectsEnviromentfactorstativeMethodforidentifyinggenesincomplexAssociation

Case-controldesignFamily-baseddesigntativetrait 疾病的遺傳率（度在多高血 MZ同病一致率DZ同病一致率遺傳度在多 病，傳可高-80；為30%～40%或更，表環(huán)境因在決定病更為要，遺因素的用顯。表6- 人類一些性狀的遺傳性遺傳性遺傳身理科天坐數(shù)學(xué)天體文史天性幽門狹高血 冠狀動(dòng)脈 SingleNucleotide 標(biāo)”（geneticsignposts）的勘定。疾病的發(fā)生有關(guān)聯(lián)causative 不同堿基，其中最少一種在群體中的頻率不小于 組中大概每1000個(gè)堿基就有一個(gè)SNP，人類組上的SNP總量大概是3×106個(gè)。ThemostcommonsourcesofgeneticvariationbetweenhumanSNP的類 Coding

IntronicSNP–iSNP–doesnotcauseanaminoacid

RegulatoryregionSNP–effectamountofproteinexpressedorifCodingregion：Alsocoversynonymous（同義的）andnon-SNP是繼人類組計(jì)劃之后又一國際研究競爭新熱點(diǎn)，是闡明組SNP是人類組DNA序列變異的主要形式，是決定人類疾病的重要遺以前是LinkageA1A2alleleatlocus1:PA1;PA2B1B2alleleatlocus2:PB1;PB2Iftwolociareindependent,thenIftwolociaredependent,PA1B1ishigherorlowerthanPA1*PB1.Thus,thetwolociaresaidtobeinLDAhaplotypeisacombinationofallelesatdifferentlocithataretransmittedtogetherTag-SNPisarepresentativeSNPinaregionofthegenomewithhighLDMethodforidentifyinggenesincomplexAssociation

Case-controldesignFamily-baseddesigntativetraitCase-Control StudydesignisveryimportantPopulationsubstructureandselectionSampleselection(phenotypeSampleGeneticAppropriate ReplicationofpositiveresultsinanindependentcohortPaper1(Conventionalcasecontrolstudy)Paper2(Extremeselection)

A/Cor 隊(duì)列對照研究可采用前瞻性方式，以開始觀察的時(shí)間為始 人類復(fù)雜疾病研樣本選選SNP分型方法選樣本選Case-Family-Population-TwinTwinTwinHeritabilityandenvironmentalTheadditionalMZindividualcanelevatethestatisticalpowerforassociationbyupto~40%UCSDTwinproject(beganin2001)5yearsfollowupThe“coldpressortest”(“CPT”:onehand,0oCicewater,60IceusingColinPilothardwareandATLAS/ANS/TDA選胰島素激素合SNPHowtochooseFunctionalSNPs（NCBI分型方法分型方直Taqman探Massarray分子量陣列技GWAS： 組關(guān)聯(lián)分Massarray分子量陣列dAMP=313.2DadCMP=288.2DadGMP=329.2DadTMP=304.2Da分子量陣列技術(shù)平西格諾公司（SEQUENOMInc）生產(chǎn)基于飛行時(shí)間質(zhì)譜（MALDI-TOFMS）技dAMP=313.2DadCMP=288.2DadGMP=329.2DadTMP=304.2Da制造廠商：Sequenom安裝日期 ：度分型、甲基化 表

Maker：SequenomIncSettingdate：2008Room：307,MingdaoBuildingContact：Mainparameter：Highresolution,Highaccuracy,High epigenetics,gene 成每個(gè)反應(yīng)所 分子量陣列技術(shù)平臺主要技術(shù)指離子源Smart飛行距離800真空壓5x10-6檢測器 Genome-WideAssociationStudy基 的SNP檢通過酶反應(yīng)的間接雜直接雜直接雜交法檢測SNP或突 對于每一位置的野生型探針，在其位置的某 物延伸法;C連接酶檢測法.紅線代表熒光標(biāo)記的靶 Aff