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Chapter8ProteinSortingI8.1蛋白質(zhì)分選簡介8.2信號假說8.3蛋白質(zhì)跨內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜運輸8.3.1蛋白質(zhì)跨膜運輸
8.3.2跨膜蛋白質(zhì)的形成8.3.3蛋白質(zhì)如何正確折疊8.4分選基本路徑和具體形式8.4.1蛋白質(zhì)分選類型8.4.2膜泡運輸8.5膜泡運輸機理細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)眾多,需要定向運輸如何保證有條不紊8.1IntroductionofproteinsortingSecretoryPathway8.2SignalhypothesisTranslocationofSecretoryProteinsacrosstheERMembrane.
8.2.1Signalhypothesis分泌型蛋白N端帶有特定的信號序列,指導(dǎo)蛋白質(zhì)到粗面內(nèi)質(zhì)網(wǎng)上合成,在成熟時候信號序列被切除。8.3ProteintransportacrossERmembrane
GTPGTPGDPsignal-recognitionparticle,SRPSRPreceptor(DP)Detailprocess8.3.1ProteintransportacrossERmembrane
SRPreceptor=DPSRP受體就是停泊蛋白
,一端與新生蛋白質(zhì)相連,另外一端結(jié)合核糖體翻譯停止
(SRP+ribosome)+DP,與內(nèi)質(zhì)網(wǎng)上的異位子結(jié)合,SRP和DP分離,翻譯繼續(xù)。EnergyisrequiredforinsertionofthesignalsequenceintothetransloconPolypeptidesMovethroughtheTransloconintotheEREnergyisrequiredforinsertionGTPModifiedfromFigure14-15,Page461from:EssentialCellBiologybyAlbertsetal.1998,GarlandPublishingInc.NewYork,NYERImportofTransmembraneProteinsMultipasstransmembraneproteinsStop-transferpeptideStart-transferpeptideEukaryotesArchaeaBacteria--TriggerFactorNACNAC-Hsp80system[Hsp80system]Hsp80systemprefoldinprefoldin-chaperonins(groupII)chaperonins(groupII)chaperonins(GroupI)smallHspssmallHsps[smallHsps]Hsp90-[Hsp90]AAAATPasesAAAATPasesAAAATPases--SecB--[PapD/FimC]Hip,Hop,Bag,clusterin,cofactorsA-E,calnexin,calreticulin,etc.etc.--Overviewofchaperonefamilies
8.4.1Proteinsortingposttranslocationco-translocationTransmembranetransportVesiculartransportGatedtransportProteintransportincytosolSequenceTransportway8.4BasicpathwayandtypeofproteinsortingSortingpathwayPosttranslocation
蛋白質(zhì)完全合成后開始轉(zhuǎn)運。8.4.2VesiculartransportAClathrincoatvesicleTrans-golgisurfaceBCOPIIRoughERCis-golgiCCOPICis-GolgiERDepolymerizationofClathrinCoats
COPIImediatestransferofvesiclesfromtheroughERtothecis-Golgi/cis-Golginetwork;InsomecasesCOPII-coatedvesiclesfusewitheachothertoformlarger"ER-to-Golgiintermediatecompartments"thataretransportedalongamicrotubuleandeventuallyfusetoformthecis-Golgi.BCOPIIcoatedvesicles介導(dǎo)從內(nèi)質(zhì)網(wǎng)到高爾基體的物質(zhì)運輸。衣被小泡形成的部位,稱為內(nèi)質(zhì)網(wǎng)出口(exitsites),該處沒有核糖體。大多數(shù)跨膜蛋白是直接結(jié)合在COPII衣被上,少數(shù)跨膜蛋白和多數(shù)可溶性蛋白通過受體與COPII衣被結(jié)合。分選信號位于跨膜蛋白胞質(zhì)面的結(jié)構(gòu)域,形式多樣,有些包含雙酸性基序[DE]X[DE],如Asp-X-Glu序列。COPIIcanselectandcondensematerialSelectiveCOPIIrecognizesignalincytosoloftransmembrneERprotein
CytosolfaceoftransmembrneERproteinactasreceptortobindwithsolubleproteininERlumenCOPII跨內(nèi)質(zhì)網(wǎng)蛋白
內(nèi)質(zhì)網(wǎng)腔內(nèi)可溶性蛋白識別識別Sarprotein(asmallcombinedGTPprotein),canactasmolecularswitch,regulatevesicularcoatSar+GDP=inactive,Sar+GTP=active,SarproteincombinewithmembraneofER,formCOPⅡcoatedvesiclesCCOPⅠcoatedvesicles功能1:負(fù)責(zé)回收、轉(zhuǎn)運內(nèi)質(zhì)網(wǎng)逃逸蛋白(escapedproteins)返回內(nèi)質(zhì)網(wǎng),由7種蛋白組成。在C端有一個不同的回收信號:Lys-Asp-Glu-Leu(KDEL)。順面高爾基網(wǎng)上有KDEL的受體,識別C端駐留信號,以COPI有被小泡的形式捕獲逃跑蛋白。逆向轉(zhuǎn)運,內(nèi)質(zhì)網(wǎng)是開放的監(jiān)獄COPI功能2:順向轉(zhuǎn)運在非選擇性的批量運輸中行使功能,負(fù)責(zé)粗面內(nèi)質(zhì)網(wǎng)-高爾基體-分泌泡-細(xì)胞表面的運輸過程。從高爾基順面到反面的運輸也可能涉及COPI。
RetriveescapedproteinbacktoERCOPⅠvesiclecoatregulationARF+GDP=inactive,ARF+GTP=activeARF+GDPGNRPARF+GTPGAPARFchangedependonGNRP(鳥嘌呤核苷酸釋放蛋白)andGAP(GTP酶激活蛋白)GNRPletARFreleaseGDPandcombinewithGTP,ARFbecomeactive,regulatedformationofCOPⅠvesiclecoatGAPtriggerARFhydrolyzeGTPintoGDP,ARFbecomedinactive,COPⅠvesiclecoatdisaggregation,vesiclefusedwithtargetmembrane
FormationofCOPIVesicles
SpecificfusionofintracellularvesiclesInvolvesaconservedsetoffusionproteins,V-SNAREandT-SNARE
V-SNARE,whichisincorporatedintoatransportvesicleasitbudsfromthedonororganelle;ThespecificV-SNAREoneachtypeoftransportvesicletargetsthevesicletoitscorrectmembranefusionpartner.T-SNAREs,whichactcooperativelytospecificallybindaparticulartypeofV-SNARE.Yeastcells,likealleukaryotes,expressseveralrelatedV-SNAREandT-SNAREproteins,therebypermittingeachtypeoftransportvesicletobetargetedcorrectly.8.5VesiculartransportmechanismNSF:N-乙基順丁烯二亞胺敏感融合蛋白SNAREs:solubleNSFattachmentproteinreceptorSNAP(可溶性NSF附著蛋白,solubleNSFattachmentprotein,SNAP)V-SNARE,locatedonthetransportvesicularmembrane(eg:VAMP:Vesicle-associatedmembraneprotein)T-SNARE,locatedontargetmembrane(eg:syntaxin)DockingusesSNARESVesicleFusion定向運輸機制1:膜泡的定向融合機理定向運輸機制二:膜泡沿極性微管的極性運輸分泌蛋白分選特例:溶酶體的分選溶酶體的形成是一個相當(dāng)復(fù)雜的過程,涉及的細(xì)胞器有內(nèi)質(zhì)網(wǎng)、高爾基體和內(nèi)體等。比較清楚的是甘露糖-6-磷酸途徑(mannose6-phosphatesortingpathway):溶酶體的酶類在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)上合成,跨膜進(jìn)入內(nèi)質(zhì)網(wǎng)的腔.在順面高爾基體帶上甘露糖6-磷酸標(biāo)記后在高爾基體反面網(wǎng)絡(luò)形成溶酶體分泌小泡.分泌小泡.與次級內(nèi)體結(jié)合,最后通過脫磷酸才成為成熟的溶酶體.內(nèi)體(endosome)內(nèi)體有初級內(nèi)體(earlyendosome)和次級內(nèi)體(lateendosome)之分,內(nèi)體的主要特征是酸性的、不含溶酶體酶的小囊泡。初級內(nèi)體是由于細(xì)胞的內(nèi)吞作用而形成的含有內(nèi)吞物質(zhì)的膜結(jié)合的細(xì)胞器。次級內(nèi)體中的pH呈酸性,且具有分揀作用。內(nèi)體膜上具有ATPase-H+質(zhì)子泵,利用H+質(zhì)子的濃度,保證了內(nèi)部pH的酸性。溶酶體酶蛋白的M6P標(biāo)記溶酶體酶蛋白在膜旁核糖體上合成,進(jìn)入內(nèi)質(zhì)網(wǎng)后進(jìn)行N-連接糖基化,經(jīng)加工后形成帶有8個甘露糖殘基和2個N-乙酰葡萄糖胺殘基的糖蛋白轉(zhuǎn)運到高爾基體。溶酶體的酶上都有一個特殊的標(biāo)記∶6-磷酸甘露糖(mannose6-phosphate,M6P)。這一標(biāo)記是溶酶體酶合成后在粗面內(nèi)質(zhì)網(wǎng)和高爾基體通過糖基化和磷酸化添加上去的。信號斑(signalpatch)信號斑是溶酶體酶蛋白多肽形成的一個特殊的三維結(jié)構(gòu),它是由三段信號序列構(gòu)成的,可被磷酸轉(zhuǎn)移酶特異性識別。溶酶體酶蛋白信號斑與磷酸化酶相互作用M6P受體蛋白M6P受體蛋白是反面高爾基網(wǎng)絡(luò)上的膜整合蛋白,能夠識別溶酶體水解酶上的M6P信號并與之結(jié)合,從而將溶酶體的酶蛋白分選出來。M6P受體蛋白主要存在于高爾基體的反面網(wǎng)絡(luò),但在一些動物細(xì)胞的質(zhì)膜中發(fā)現(xiàn)有很多M6P受體蛋白的存在,這是細(xì)胞的一種保護(hù)機制,可防止溶酶體的酶不正確地
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