pubmed如何進行醫(yī)學(xué)信息檢索

美國醫(yī)學(xué)文獻數(shù)據(jù)庫

MEDLINE2008.9.222/1/20231復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室一、數(shù)據(jù)庫概況（一）主辦單位：美國國立醫(yī)學(xué)圖書館(NLM)編制。（二）收錄學(xué)科內(nèi)容：主要收錄生物醫(yī)學(xué)和健康科學(xué)以及生命科學(xué)相關(guān)領(lǐng)域的文獻。包括行為科學(xué)、健康專業(yè)所需要的化學(xué)、生物工藝學(xué)，基礎(chǔ)研究和臨床、護理、公共衛(wèi)生、衛(wèi)生政策發(fā)展或相關(guān)教育活動的內(nèi)容。2000年起增加了生物、環(huán)境科學(xué)、海洋生物、植物和動物學(xué)、生物物理學(xué)和生物化學(xué)等生命科學(xué)方面的研究內(nèi)容。2/1/20232復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室

（三）文獻來源：收錄全球70多個國家和地區(qū)的近5000種生物醫(yī)學(xué)期刊，大都經(jīng)美國衛(wèi)生健康研究院的文獻選擇技術(shù)評估委員會LiteratureSelectionTechnicalReviewCommittee(LSTRC)評估挑選,由NLM和各專業(yè)協(xié)會的數(shù)據(jù)協(xié)作采集專家推薦。近年數(shù)據(jù)涉及37種語種，回溯至1950年的數(shù)據(jù)涉及60種語種。數(shù)據(jù)庫47%為美國本土出版文獻，90%為英文文獻，79%的文獻有著者撰寫的英文文摘，（以上數(shù)據(jù)根據(jù)2007年11月數(shù)據(jù)庫提供）。一、數(shù)據(jù)庫概況2/1/20233復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室（四）收錄數(shù)據(jù)類型已處理完畢的數(shù)據(jù)（Indexed）1950-1965回溯數(shù)據(jù)1966topresent近年數(shù)據(jù)處理中的數(shù)據(jù)（Inprocess）:

最新的、尚未經(jīng)規(guī)范處理的數(shù)據(jù)，只有簡單的篇名、作者、出處等書目信息和文摘，沒有標引規(guī)范化醫(yī)學(xué)主題詞、物質(zhì)名稱、文獻類型等信息。該庫中數(shù)據(jù)在所有標引工作完成后，每周一次轉(zhuǎn)入MEDLINE-Indexed數(shù)據(jù)庫中。一、數(shù)據(jù)庫概況2/1/20234復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室收錄圖示2/1/20235復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室（五）MEDLINE的檢索系統(tǒng)NCBI-PubMedOvidSPWebofKnowledgeEBSCOOCLCFirstSearch一、數(shù)據(jù)庫概況2/1/20236復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室不同檢索系統(tǒng)中的Medline數(shù)據(jù)庫2/1/20237復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室二、NCBI-PubMed2/1/20238復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室（一）NCBI網(wǎng)站簡介

1988年，美國的參議員ClaudePepper發(fā)起，

1988年11月4日通過立法建立國立生物技術(shù)信息中心（NCBI）NCBI的任務(wù):

建立基于計算機信息處理的分子生物學(xué)、生物化學(xué)、遺傳學(xué)知識的自動存儲和分析系統(tǒng)，并進行先進方法的研究。促進生物技術(shù)研究者和醫(yī)藥治療人員對數(shù)據(jù)庫和軟件的使用。促進全世界范圍內(nèi)生物技術(shù)信息收集的合作2/1/20239復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室NCBI主頁2/1/202310復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室NCBI生物信息整合系統(tǒng)

Alldatabase檢索大分子生物學(xué)數(shù)據(jù)獲取GenBank,EMBL等數(shù)據(jù)庫的核酸序列；獲取Swiss-port,PIR,PRF,PDB等蛋白質(zhì)序列；從核酸序列翻譯到蛋白質(zhì)的序列；獲取基因和染色體圖譜；蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)及大分子模式（MMDB）等其他生物信息數(shù)據(jù)庫檢索。PubMed書目文獻數(shù)據(jù)。2/1/202311復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室（二）PubMed簡介特點：

1.免費提供題錄和文摘

2.提供與原文的網(wǎng)址鏈接(部分免費獲?。?/p>

3.提供檢索詞自動轉(zhuǎn)換匹配

4.操作簡便、快捷2/1/202312復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室PubMed

收錄數(shù)據(jù)MDENLINEIndexed 1966toprensent的MEDLINE已標引數(shù)據(jù)，有MeSH字段和摘要，每條記錄標有[PubMed-indexedforMEDNLINE]

OldMDENLINE 1950-1965年間的MEDLINE數(shù)據(jù)，沒有MeSH字段和摘要，每條記錄標有[PubMed-OLDMDENLINEforPre1966]

2/1/202313復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室PubMed

收錄數(shù)據(jù)MDENLINEInprocess

最新的MDENLINE尚未標引的處理中數(shù)據(jù)。每條記錄標有[PubMed-inprocess]。NotMDENLINE

是出版商提供的電子文獻，PubMed

收錄，而MDENLINE不收錄的數(shù)據(jù)。每條記錄標有[PubMed]。2/1/202314復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室基本檢索輸入框特征欄提供輔助檢索功能側(cè)欄提供其他檢索如期刊數(shù)據(jù)庫檢索、規(guī)范詞數(shù)據(jù)庫檢索、特定文獻檢索等執(zhí)行檢索PubMed

主頁高級檢索個性化服務(wù)檢索幫助手冊2/1/202315復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室可以在檢索欄中輸入一個或多個檢索詞（系統(tǒng)默認空格為AND檢索） 如：placentagrowthoxygen可以在檢索欄中輸入布爾邏輯運算式（運算符必須大寫） 如：asthmaAND(therapyORtreatment)（三）PubMed

基本檢索規(guī)則2/1/202316復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室輸入多個檢索詞2/1/202317復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室字段限定符：[]

如：Stem[ti]ANDneuroscience截詞符：treat*強迫短語匹配符：“brca1”

嚴格按輸入形式匹配，不再自動轉(zhuǎn)換匹配和擴展檢索，常用于詞組和專有名詞檢索。（三）PubMed

基本檢索規(guī)則2/1/202318復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室含字段限定的檢索式2/1/202319復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室自動轉(zhuǎn)換匹配檢索詞：

對常用醫(yī)學(xué)名詞進行自動在規(guī)范詞索引、文本詞及所有記錄字段中轉(zhuǎn)換匹配。 如：renalfailurekidneyfailure[MESH]ORkidney[AllField]ORrenalfailure[AllField]……（三）PubMed

基本檢索規(guī)則2/1/202320復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室2/1/202321復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室自動擴展檢索：

系統(tǒng)自動對主題詞、副主題詞進行擴展檢索。

如：輸入hypertensiontherapy，系統(tǒng)自動檢索高血壓的藥物治療、飲食療法（三）PubMed

基本檢索規(guī)則2/1/202322復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室2/1/202323復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室著者檢索(authors)：姓全稱在前，名首字母在后。加字段限定符 如：genbacev

o[au]

moore

am[au]2002年以后的文章可以查著者全名

如：joshua

lederberg

（三）PubMed

基本檢索規(guī)則2/1/202324復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室著者檢索mooream[au]（三）PubMed

基本檢索規(guī)則2/1/202325復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室期刊檢索（journals）：刊名全稱檢索 如：newenglandjournalofmedicine[so]MEDLINE認可的標準刊名縮寫檢索 如：clinexpimmunol[so]國際標準期刊號檢索 如：1059-1524（三）PubMed

基本檢索規(guī)則2/1/202326復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室刊名的檢索（字段限定來源SO）2/1/202327復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室PubMed記錄字段說明文摘第一著者單位地址出版商提供文獻識別號著者群版權(quán)說明參考評論文獻合著者文獻參考評論定稿版校樣版輸入日期輸入完成日期電子出版日期2/1/202328復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室電子出版日期文獻出版日期數(shù)據(jù)加入PubMed日期文獻勘誤參考文獻勘誤全部著者姓名全部調(diào)研者姓名作為文章主題的著者全稱文獻相關(guān)注釋基金編號基因符號期編號資助調(diào)研者資助調(diào)研單位國際標準期刊號美國立醫(yī)學(xué)圖書館識別號期刊全稱2/1/202329復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室最后修訂日期規(guī)范詞表詞規(guī)范詞確立日期系統(tǒng)組織的文摘版權(quán)擁有者題錄提供機構(gòu)的識別號病史相關(guān)與原始記錄其他關(guān)鍵詞提供其他關(guān)鍵詞的機構(gòu)數(shù)據(jù)提供者機構(gòu)文章總頁數(shù)出版商提供數(shù)據(jù)時間期刊出版國數(shù)據(jù)庫文獻編號2/1/202330復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室作為主題詞的個人姓名出版狀態(tài)文獻類型出版模式（紙張或電子）參考文獻數(shù)已撤回的文獻酶或化學(xué)物質(zhì)代碼正在撤消中的文章初版文獻修訂和再版的文章子專題文檔太空署提供的數(shù)據(jù)二次文獻數(shù)據(jù)庫以及文章討論的分子序列訪問號原文來源引用了病例的文獻內(nèi)部處理代碼標準期刊縮寫文獻標題翻譯標題更新文獻文獻正在更新期刊卷號2/1/202331復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室（四）PubMed的輔助檢索1.Limits（檢索限制選擇）：字段限制：著者、刊名、篇名、出版日期、濾過（filter原文收藏處）等限制。數(shù)據(jù)輸入時間：默認檢索可回溯到1950年，限制選擇30天-10年。各種文獻類型限制各種語種限制期刊類別與學(xué)科文檔限制2/1/202332復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室作者限定添加作者姓名輸入框清除限定期刊限定作者姓名索引選詞多作者邏輯匹配選項全文、免費全文、摘要限定日期限定Limits—檢索限制2/1/202333復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室出版日期限定入庫日期限定研究對象人/動物限定研究對象性別限定語種限定子文檔限定2/1/202334復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室檢索字段限定執(zhí)行檢索清除所有限定文獻類型限定研究對象年齡限定2/1/202335復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室2.Previw/index（檢索策略預(yù)覽/索引）：瀏覽檢索式，預(yù)覽檢出文獻數(shù)量修改檢索式組配檢索式 如：可用檢索式編號#1OR#2瀏覽索引（index）選詞檢索（四）PubMed的輔助檢索2/1/202336復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室檢索預(yù)覽檢索歷史索引加詞檢索2/1/202337復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室PubMed-Index索引檢索例johnshopkinsasthma選擇著者地址字段輸入地址起始單詞點擊顯示索引詞表選擇相關(guān)詞條選擇詞條間的邏輯關(guān)系添加到檢索框執(zhí)行檢索2/1/202338復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室

3.History（檢索史）：歷次檢索式回顧編輯檢索式 如：#5ANDgenbacev

o[au]（四）PubMed的輔助檢索2/1/202339復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室檢索歷史回顧檢索式檢索時間檢出篇數(shù)檢索式編號可替代檢索式進行輸入檢索如：#6ANDgenbacev

o[au]2/1/202340復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室4.Details（檢索的詳細匹配過程）：顯示檢索詞轉(zhuǎn)換匹配運算詳細過程用途：轉(zhuǎn)換、確定規(guī)范詞如：livercancer

liverneoplasms修改檢索策略（四）PubMed的輔助檢索2/1/202341復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室檢索明細數(shù)據(jù)庫匹配過程檢索詞轉(zhuǎn)換顯示用戶輸入的檢索式2/1/202342復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室檢索策略（檢索式）的修改 以下途徑均能實現(xiàn)檢索策略的修改：基本檢索框中隨時修改“Limit”“Preview/index”“History”“Details”2/1/202343復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室（五）PubMed的高級檢索在一個網(wǎng)頁中集檢索史、檢索字段選擇、檢索詞輸入、詞表查詢、邏輯算符選擇、檢索限定于一體。選擇檢索字段后，檢索框內(nèi)只能輸入檢索詞，不能輸入檢索式。2/1/202344復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室多欄復(fù)合檢索詞表查詢欄間邏輯組配2/1/202345復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室（六）PubMed其他檢索服務(wù)1.MeshDatabase（規(guī)范化主題詞表）：確定規(guī)范化主題詞查看主題詞詞義注釋、樹狀結(jié)構(gòu)表選擇副主題詞、擴展主題詞、主要主題詞 例1：欲查植物（plant）生長素（growthfactor）研究的相關(guān)文獻。2/1/202346復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室PubMed

基本檢索輸入檢索式：plant*ANDgrow*ANDfactor* 默認在全部字段中檢索結(jié)果太多，相關(guān)度低植物Synadenium

umbellatum

Pax的抗腫瘤和抗血管生成活性血管內(nèi)皮生長因子的水平并非植物生長素2/1/202347復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室PubMed

基本檢索輸入檢索式：plant*[TI]ANDgrow*[TI]ANDfactor*[TI]2/1/202348復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室MeSH規(guī)范化主題詞表選詞檢索送至檢索框2/1/202349復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室輸入自由詞檢索ANDgrowthfactor2/1/202350復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室MeSH

查找植物生長素結(jié)果2/1/202351復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室詳細結(jié)果2/1/202352復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室檢索分析一般檢索邏輯關(guān)系粗淺、修飾概念匹配不特定、檢索詞涵蓋不全面規(guī)范檢索邏輯關(guān)系緊密、修飾概念匹配特定、下位詞檢索全面2/1/202353復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室例2：欲查腎衰竭（renalfailure）飲食療法(diettherapy)療效觀察(treatmentoutcome)的相關(guān)文獻。基本檢索腎衰竭的飲食療法2/1/202354復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室結(jié)果中有些主要內(nèi)容并非腎衰竭2/1/202355復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室MeSHDatabase規(guī)范主題詞數(shù)據(jù)庫檢索腎衰竭飲食療法課題1.輸入檢索詞3.點按規(guī)范詞可獲詳細注解2.執(zhí)行瀏覽2/1/202356復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室主題詞注釋可選副主題詞限定作為主要主題詞匹配不進行下位詞擴檢2/1/202357復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室該主題詞所替代的非規(guī)范詞形式主題詞樹形結(jié)構(gòu)表：顯示該詞的學(xué)科隸屬關(guān)系2/1/202358復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室檢出結(jié)果更為專指2/1/202359復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室進一步用主題詞表檢索綜合療效觀察（treatmentoutcome）2/1/202360復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室2.Journaldatabase（期刊數(shù)據(jù)庫）：通過輸入刊名全稱或縮寫等瀏覽特定期刊上發(fā)表的文獻。提供電子原文的超鏈按鈕。（六）PubMed其他檢索服務(wù)2/1/202361復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室期刊數(shù)據(jù)庫檢索2/1/202362復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室輸入待檢期刊名得出期刊詳細信息2/1/202363復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室3.引文匹配器（CitationMatcher）:輸入題錄信息，查找特定文獻進行補缺。刊名要準確，縮寫要標準著者姓名大小寫不敏感如查找：TaiwanIHsueh

Hui

Chih由ChangPY（taiwan

yi

xue

hui

za

zhi)撰寫、1975發(fā)表文獻的其他著者2/1/202364復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室輸入待檢刊名、年份輸入待檢第一著者特定文獻查找（已知文獻第一著者，欲查其他信息如其他著者等2/1/202365復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室得出其他著者2/1/202366復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室4.臨床問題（ClinicalQueries)專門檢索臨床研究方法學(xué)（循證醫(yī)學(xué)）文獻，主要涉及治療、診斷、病因、和預(yù)后四個分類，并提供強調(diào)選擇，即敏感度（強調(diào)查全）或?qū)Ｖ付龋◤娬{(diào)查準）。2/1/202367復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室5.臨床警示（ClinicalAlert）1991年開始，NIH美國衛(wèi)生健康研究所不定期公布能引起死亡率和致病率升高的臨床試驗項目重要新聞稿。2/1/202368復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室（七）PubMed檢索結(jié)果輸出顯示檢索結(jié)果保存檢索結(jié)果保存檢索策略打印檢索結(jié)果2/1/202369復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室顯示字段選擇（Display）Abstract:來源期刊、標題、著者、著者地址、記錄性質(zhì)、文獻類型、勘誤、評論、PMID或UI、摘要。Citation:顯示除上述內(nèi)容外，加MeSH敘詞、化學(xué)物質(zhì)名稱、資助項目號等字段。MEDLINE:（最完整，有標識符）2/1/202370復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室顯示格式選擇2/1/202371復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室排序/輸出方式選擇排序方式輸出方式2/1/202372復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室顯示記錄選擇單一記錄顯示：著者姓名所有記錄顯示：選display旁的格式，及每頁顯示記錄數(shù)選定記錄顯示:方框內(nèi)打鉤2/1/202373復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室點擊作者鏈接顯示文摘增強格式文摘增強格式電子期刊全文鏈接2/1/202374復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻檢索教研室輸出格式選擇（sendto）選中題錄（或文摘）后Text當前網(wǎng)頁文本格式，用瀏覽器文件保存File所有記錄純文本格式保存，用對話框保存Clipboad