lvthwEx22乙醇氣相分子優(yōu)化

大師兄比較笨，第一反應是，這怎么可能？冰箱那么點，大象那當朋友告訴我答案的時候，才然大悟，這跟大小沒關系VASP計算乙醇分子？很多童鞋就如同第一次跟被問VASP3）打開冰箱O2復下前面學到的INCAR和KPOINTS的內容氣相分子計算，要用ISMEAR=0，SIGMA取值要SIGMA=0.02；表示注釋，這個符號后面的內容，VASP1

ENCUT=400#ENCUT=500和ENCUT=2VASP#寫在INCAR里面，方便計算的時候進行設置?？梢?開頭，單起一行，INCAR氣相分子計算，Kgamma把大象塞到冰箱里面POSCAR的準備（本節(jié)重點前面學習到，一個好的初始結構會加快計算，獲取準確的計算結果。因此需要去找一個合理的模型。對于氣相分子的結構，一是手動搭建，大師兄用view，另一個辦法就是找數據庫，大師兄英國學會的ChemScpider。是 下面把手動搭建乙醇分子的模型具體解釋一下打開ethanolC2H6O….2D3D下面有對應結構的百科，的筒子們可以查閱下相關結構3D點擊箭頭指的地方保存，瀏覽器會對應的.mol文件，文件名為該結構在數據庫中的。.mol文件也是純文本，使用notepad++打開如下.mol文件，很多結構文件都是文本格式，直接打開就從里面找到乙醇結構的xyz刪除上圖中除紅色框之外的所有行，1-4行，14-xyz手動寫POSCAR，首先你要熟記POSCAR的格式，知道20x20x20000可以刪掉，也可以1mol4POSCAR中的6,7行！2CartesianDirect.Direct的坐標xyz值1.如果你想刪掉圖中坐標第3列后面的內容：大師兄notepad++里點擊之后，可能會彈 框，告訴你如何使用，列塊模摁住alt鍵，然后用鼠標選擇文本，不腦可能不一樣，大師兄這邊同時摁controlalt兩個鍵，然后用鼠標選擇的。alt和shift鍵，通過鍵盤上前后左右的箭頭選擇文本delete鍵刪除然后另存為POSCARp4vaspO2數學上，把xyz10使用上，講一下p4vasp的操作方法editMoveMovegroupCHO三個元素符號（中間有空格）Vector中選擇xyz111Move按10次。Movegroup入CHO)，需要按照大師兄說的步驟走：POSCAR中元Getgroup，會顯示選擇的那在VectorxyxMove按然后點擊file→Savesystemas→選 →保存成POSCAR講完了，就要按照里面的元素順序POTCAR了首先:要準備OCH三個元素的POTCAR，去POTCAR的數據然后到當前 O,POTCAR-C和POTCAR-H，把三個元素的POTCAR合并在一起，命令就是catPOTCAR- 提交任擴展練習嘗試使用view，MS，以及其他可視化界面搭建模型學會使用VESTAPOSCAR總結------------------------------ 如果你有自己的科研經驗和心得，也歡迎給大家歷史練習（可回復對應的數字查看序言學習本書？Learn-VASP-The-Hard-Way（序言Ex0:學習前的準備工作Learn-VASP-The-Hard-Ex1VASP本輸入文件的準備Learn-VASP-The-Hard-Ex2（一）Learn-VASP-The-Hard-Way（ex2）Ex3（二）Learn-VASP-The-Hard-Way（ex3）Ex4做計算常用的批量處理方法（三）Learn-VASP-The-Hard-Way（ex4）Ex5VASP以及OSZICAR解Learn-VASP-The-Hard-Way（ex5）Ex6OUTCAR內容Learn-VASP-The-Hard-Ex76總結Learn-VASP-The-Hard-Ex8氧原子能量的正確計算Learn-VASP-The-Hard-Ex9Learn-VASP-The-Hard-Ex10:O2建以POTCAR部分Learn-VASP-The-Hard-Ex11VASP中MAGMOMLearnVASPTheHardWay（Ex11）Ex12O2計算和優(yōu)化結果分析LearnVASPTheHardWay（Ex12）Ex13論合理結構的重要性（一）LearnVASPTheHardWay（Ex13）Ex14論合理結構的重要性（二）LearnVASPTheHardWayEx15（三）LearnVASPTheHardWay（Ex15）Ex16誰偷走了機時（一）LearnVASPTheHardWay（Ex16）Ex17誰偷走了機時（二）LearnVASPTheHardWay（Ex17）Ex18如何學習 LearnVASPTheHardWayEx19誰偷走的機時？（三）LearnVASPTheHardWay（Ex19）