中藥科技基礎信息數(shù)據(jù)庫的研究與應用

1、中藥科技根底信息數(shù)據(jù)庫的研究與應用【關鍵詞】數(shù)據(jù)庫；中藥科技根底信息庫；中藥知識挖掘“中藥科技根底信息數(shù)據(jù)庫的建庫理念是建立可提供構造型、標準性標準化中藥科技根底數(shù)據(jù),支持用戶多用處、多途徑、多層次檢索查詢、中藥數(shù)據(jù)挖掘的構造型中藥根底數(shù)據(jù)庫,為中醫(yī)藥科研、臨床、教育、管理、消費開發(fā)等各類人員提供中藥單味藥、中藥資源品種、中藥化學成分、中藥藥理、中藥臨床藥理、中藥毒理、炮制品等標準化的根底數(shù)據(jù),可進展關聯(lián)查詢的新型檢索工具。1中藥科技根底信息數(shù)據(jù)庫的構造1.1中藥科技根底信息數(shù)據(jù)庫遠程錄入程序中藥科技根底信息數(shù)據(jù)庫目前有8張庫表,即：單味藥、品種、生藥材鑒定、中藥藥理、中藥毒理、中藥臨床藥理、

2、化學成分、炮制品,分別設有：14、17、26、30、18、26、27、14共172個字段。每張庫表即可成為一個獨立的個體,又與各表間有著一定的內在關聯(lián),使之成為一個有機的整體。中藥科技根底信息數(shù)據(jù)庫構造以“單味藥為主表,二級表有：品種、生藥材鑒定、中藥藥理、中藥毒理、中藥臨床藥理、化學成分、炮制品。該庫遠程編輯加工的界面可以在很大程度上組織起一個中醫(yī)藥信息系統(tǒng),包容了中草藥中的大量知識。該系統(tǒng)設計了遠程錄入程序btany,這個程序采用了不同的數(shù)據(jù)庫構造,具有較強的容錯性,提供數(shù)據(jù)的遠程錄入和維護、多用戶分級分權限管理、表查詢字段管理、人員錄入工作量統(tǒng)計等功能。1.1.1標準表的建立在中醫(yī)藥數(shù)據(jù)

3、中,存在著一些專用的標準詞匯,對這些詞匯的引用和管理一直以來沒有很好的技術支持。為此,該系統(tǒng)設計開發(fā)了標準表管理程序,提供了對標準數(shù)據(jù)的統(tǒng)一管理和規(guī)劃。其功能包括標準表的創(chuàng)立,標準表的刪除以及對標準表數(shù)據(jù)的添加、刪除、修改以及向標準表中批量導入輸入?；谥兴幙萍几仔畔?shù)據(jù)庫的構造數(shù)據(jù)關系我們建立了33張標準表,標準表的設立引導了與關聯(lián)數(shù)據(jù)項的關聯(lián)。見表1。表1中藥科技根底信息庫的標準表略1.1.2數(shù)據(jù)來源以“中藥數(shù)據(jù)庫為根底數(shù)據(jù),以權威工具書?中華本草?、?中華人民共和國藥典?、?中國常用中藥材?、?中國藥材學?、?中藥現(xiàn)代研究與臨床應用?、?現(xiàn)代中藥栽培養(yǎng)植與加工手冊?、?常用中藥成分與藥

4、理手冊?、?植物活性成分辭典?、?天然活性成分簡明手冊?、?中藥炮制學?以及普通高等教育中醫(yī)藥類規(guī)劃教材為數(shù)據(jù)根據(jù)。1.1.3質量控制該課題組先后制定了“中藥根底庫界面編輯標準、“中藥根底庫操作手冊、“中藥藥理補充說明、“中毒理及中藥臨床藥理樣本、“中藥炮制學說明、“中藥炮制學加工工藝標準,為數(shù)據(jù)制作奠定了基矗中藥科技根底信息庫的完成數(shù)據(jù)量：單味藥11013條、化學成分5944條、品種8199條、生藥材鑒定4350條、中藥藥理5407條、中藥臨床藥理632條、中藥毒理1160條、炮制品375條,總計37080條。1.2中藥科技根底信息數(shù)據(jù)庫導入程序本系統(tǒng)為面對管理人員的管理系統(tǒng)(agi)。目前

5、支持導入遠程錄入的有8張表：“單味藥、化學成分、品種、生藥材鑒定、一般藥理、一般臨床藥理、一般毒理、炮制品。登陸以后進入主界面,選擇需要導入的表,就進入相應表的導入界面。每個表的導入界面都是一樣的：最上面是一些挑選條件,用來選擇需要導入的記錄；中間是將要導入的記錄,為了簡單起見(遠程界面提供添加、修改、刪除全套功能),只顯示了1個id、1個相關字段(如中藥名稱等)和一些附加信息(錄入人員、狀態(tài)標志等)；最下面是記錄導入的統(tǒng)計和控制。在導入時要先填入挑選條件,然后點擊統(tǒng)計生成要導入的記錄集,才能進展數(shù)據(jù)的導入。此外,agi附帶了統(tǒng)計錄入人員工作量的功能,在主界面點擊統(tǒng)計工作量即可。1.3中藥科技

6、根底信息數(shù)據(jù)庫導航系統(tǒng)中藥科技根底信息數(shù)據(jù)庫的導航系統(tǒng)包含了幾十張大型復雜的數(shù)據(jù)表,其拓撲構造之復雜、數(shù)據(jù)格式的多樣化以及表與表之間的關系紛繁錯雜是中醫(yī)藥學科固有的特性。為了能實現(xiàn)這些表數(shù)據(jù)之間的導航,設計了basevie網(wǎng)頁導航系統(tǒng)。該系統(tǒng)將錯綜復雜的表構造及其關系通過網(wǎng)頁聯(lián)接起來,實現(xiàn)了數(shù)據(jù)相關性的良好導航。該導航系統(tǒng)查詢是以查詢類別對應相應的查詢內容的導航系統(tǒng),可以進展準確與模糊兩種查詢。查詢類別設有“單味藥、品種、炮制品、藥理作用、化學成分。查詢單味藥主表可直接查詢到11個相關聯(lián)關系。從查詢類別五大板塊查詢,可查詢與五大板塊相對應的每個主題的關系項,如“單味藥對應本庫表14項與之關聯(lián)的

7、內容。以此類推,“品種對應本庫表17項、“炮制品對應本庫表14項、“中藥藥理對應本庫表30項、“中藥化學成分對應本庫表27項,這樣查詢點共有102個。與102個查詢點相關聯(lián)的庫表可進展系列關聯(lián)查詢。2中藥科技根底信息數(shù)據(jù)庫的應用及歸類2.1中藥科技根底信息數(shù)據(jù)庫的應用以“紅花為例,按“單味藥查詢,選擇后在相應中藥名稱處填“紅花,查詢結果見表2。表2以“紅花為例查詢所得結果略“中藥科技根底信息數(shù)據(jù)庫關聯(lián)查詢以紅花為例：從該表進入查詢類別,可以按“單味藥、品種、炮制品、藥理作用、化學成分查詢?？傻玫脚c“紅花單味藥的數(shù)據(jù)相關聯(lián)的其他數(shù)據(jù),如品種、藥理、毒理、臨床藥理、成效、歸經(jīng)、性味、疾并化學成分、

8、配伍、炮制品等11種關聯(lián)數(shù)據(jù),并可進一步深化關聯(lián)。見表3。這時我們得到該藥的品種數(shù)據(jù)并與之相關的生藥材鑒定方法、該品種的單味藥、該品種的科屬類別。以生藥材鑒別為例,見表4。表3以“紅花為例進一步深化關聯(lián)查詢結果略表4“紅花生藥材鑒別查詢略通過查詢我們理解到紅花藥材的一系列信息,假如進入“藥理表或“臨床藥理表,又會從另一點而展開,最終又回到基點上,即由點到面,由面到點多重關聯(lián)的查詢,充分表達了中藥科技根底信息的特性。2.2中藥科技根底信息數(shù)據(jù)庫的歸類查詢中藥科技根底信息庫單味藥歸類項；化學成分、疾并成效、性味、歸經(jīng)、品種,化學成分歸類項：成效、單位藥。以單味藥大黃的性味歸類為例,從“單味藥進入準

9、確查詢,然后進入“大黃相關聯(lián)的“該性味的單味藥,得到：“苦、“寒中藥藥性。查詢順序是：單味藥：大黃,準確查詢-查詢詳情-性味：大黃-該單味藥的性味：苦、寒。我們再以性味“苦為例,點擊“苦,再連續(xù)進入具備該性味的“單味藥,得到具有性味“苦的單味藥有4275條,如芙蓉麻、芙蓉菊根、扶栘木皮、扶桑金星蕨、。扶芳藤、伏牛花、佛手柑根、鳳仙透骨草、鳳仙根、鳳仙、鳳尾豬鬃草、鳳尾搜山虎、鳳凰毛、縫線石楠、蜂窩草、蜂斗菜、楓香樹根、楓柳皮、風箱樹葉、風箱樹花、風箱樹根、風花菜、飽滿鳳仙花、豐花草、糞箕篤、粉團花、粉萍婆、粉綠藤、粉苞苣、分心木、肺形草、榧花、肥豬苗、肥肉草、非洲戴星草、飛天蠄蟧、飛來藍、飛海

10、蛾、飛蛾樹、防風草、滇雞骨常山、毛貫眾等。按其歸類項查詢,還可根據(jù)需求對其單味藥的其他歸類項進展歸類,為中藥的知識挖掘提供了一個強大的中藥科技根底信息數(shù)據(jù)平臺。3中藥科技根底信息數(shù)據(jù)庫維護與完善隨著中醫(yī)藥研究的不斷深化,工具書的不斷完善,中藥科技根底信息數(shù)據(jù)庫的內容也需不斷維護、更新、充實。其中一些數(shù)據(jù)需進展構造化處理,如“生藥材鑒定中的：“藥材鑒別、理化鑒別、顯微鑒別、色譜鑒別、光譜鑒別等字段,“品種表中的“藥材栽培這局部數(shù)據(jù)的構造化目前也具備了一定的條件。中藥科技根底信息數(shù)據(jù)庫“生藥材鑒定、“品種表,假設進一步構造化后,對于中藥材科研及消費以及市場需求,可提供有效的根底信息。在不斷的優(yōu)化進程中,統(tǒng)計功能也將得到完