二系統(tǒng)開發(fā)的主要內(nèi)容、關(guān)鍵技術(shù)、創(chuàng)新點與預(yù)期目標(biāo)-四川大學(xué)

1、轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)生物信息支撐平臺管理系統(tǒng)開發(fā)可行性研制論證報告版本：0.1四川大學(xué)自動化系2016年6月17日系統(tǒng)開發(fā)名稱轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)生物信息支撐平臺管理系統(tǒng)開發(fā)主要功能技術(shù)要求：華西轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)生物信息支撐平臺管理系統(tǒng)符合中國醫(yī)藥生物技術(shù)協(xié)會生物樣本庫標(biāo)準(zhǔn)（試行）關(guān)于生物樣本庫的管理要求，根據(jù)華西生物樣本庫硬件條件（包括冰箱、液氮罐等相應(yīng)存儲設(shè)備）和臨床科研的需求進行設(shè)計。系統(tǒng)的基本功能包括樣本管理、設(shè)備管理、耗材管理、樣本試驗管理、科研項目管理等全方位功能模塊，對樣本、設(shè)備、耗材在全生命周期中進行過程管理、監(jiān)控和質(zhì)量控制，實現(xiàn)相關(guān)數(shù)據(jù)的系統(tǒng)化記錄和管理，對樣本、設(shè)備、耗材的狀態(tài)和使用情況進行實時監(jiān)控。通過

2、使用信息系統(tǒng)，能夠幫助用戶有效建立起統(tǒng)一的生物樣本庫信息管理平臺，該平臺能夠符合本地管理、信息共享、合作利用等的臨床科研需要。在此基礎(chǔ)上，建立統(tǒng)一的數(shù)據(jù)存儲體系和豐富的數(shù)據(jù)接口，實現(xiàn)與HIS、LIS、BIMS等系統(tǒng)數(shù)據(jù)庫的數(shù)據(jù)融合，建立統(tǒng)一的數(shù)據(jù)管理與分析集成平臺、生物數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)以及專家系統(tǒng)，為預(yù)防人群相關(guān)疾病的發(fā)生并進行提前干預(yù)、新藥研制等提供基礎(chǔ)數(shù)據(jù)服務(wù)。系統(tǒng)采用B/S模式為主、C/S模式為輔的混合模式、三層架構(gòu)，使用MSSQLServer2008作為數(shù)據(jù)庫管理系統(tǒng)，采用Java+Html5+CSS開發(fā)，主要功能均可在包含手機、平板電腦在內(nèi)的智能終端以及臺式機上使用。系統(tǒng)包括系統(tǒng)設(shè)置、日

3、志管理、設(shè)備管理、樣品管理、耗材管理、臨床信息管理、文檔管理、數(shù)據(jù)中心、專家系統(tǒng)、試驗項目管理等模塊。止匕外，系統(tǒng)預(yù)留標(biāo)準(zhǔn)化數(shù)據(jù)接口，方便接入新的設(shè)備和外部數(shù)據(jù)庫；預(yù)留編程接口，方便在系統(tǒng)的專家系統(tǒng)和數(shù)據(jù)分析中心中使用自定義算法。1. 系統(tǒng)開發(fā)的必要性11. 系統(tǒng)開發(fā)的主要用途12. 系統(tǒng)開發(fā)的理由12.1 目的意義12.2 系統(tǒng)需求32.3 社會、經(jīng)濟效益分析62. 系統(tǒng)開發(fā)的主要內(nèi)容、關(guān)鍵技術(shù)、創(chuàng)新點與預(yù)期目標(biāo)71 .主要內(nèi)容71.1 系統(tǒng)設(shè)置71.2 日志管理81.3 設(shè)備管理81.4 樣品管理101.5 耗材管理121.6 臨床信息管理131.7 文檔管理141.8 數(shù)據(jù)中心141.9

4、 專家系統(tǒng)161.10 試驗項目管理172 .關(guān)鍵技術(shù)183 .創(chuàng)新點204 .預(yù)期目標(biāo)213. 現(xiàn)有工作基礎(chǔ)、條件和優(yōu)勢以及技術(shù)風(fēng)險分析221 .現(xiàn)有工作基礎(chǔ)、條件和優(yōu)勢222 .技術(shù)風(fēng)險分析224. 系統(tǒng)開發(fā)計劃進度和分階段目標(biāo)235. 系統(tǒng)開發(fā)的經(jīng)費概算27單項論證轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)生物信息支撐平臺管理系統(tǒng)開發(fā)一.系統(tǒng)開發(fā)的必要性1.系統(tǒng)開發(fā)的主要用途轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)生物信息支撐平臺管理系統(tǒng)是為了能方便有效地管理生物樣本及相關(guān)信息所建立的具有搜集、保存、檢索和分析功能的信息系統(tǒng)。系統(tǒng)對臨床標(biāo)本供體、標(biāo)本本體和生物治療衍生物及其相關(guān)信息進行分類和系統(tǒng)管理。形成臨床治療和臨床藥物試驗和隨訪的生物標(biāo)本采集、臨床

5、治療評估，科研問卷和科研結(jié)果一體化的動態(tài)工作模式，集成各模塊數(shù)據(jù)，開發(fā)智能管理軟件，打造信息共享平臺，達到信息資源的集成化、模塊化、自動化、網(wǎng)絡(luò)化運行，經(jīng)生物信息化分析反饋到?jīng)Q策層，使各獨立的功能單元有機地整合，實現(xiàn)基礎(chǔ)科研向臨床醫(yī)學(xué)轉(zhuǎn)化信息管理的變革。系統(tǒng)架構(gòu)在數(shù)據(jù)庫和WEBK務(wù)器信息設(shè)備基礎(chǔ)上，主要基于生物信息學(xué)、計算機技術(shù)、人工智能等方法進行智能生物樣本與生物信息方面的分析、存儲、管理、搜索海量生物信息、為醫(yī)學(xué)研究和治療提供信息化、自動化、網(wǎng)絡(luò)化的決策支撐。2.系統(tǒng)開發(fā)的理由2.1 目的意義生物樣本資源庫作為一種為研究利用人體生物樣本提供資源的貯藏室，已成為支持基因組學(xué)和個體化藥物研究等

6、的關(guān)鍵資源。但是臨床及轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)中新治療方法的研發(fā)僅僅依靠儲存大量的生物樣本是不夠的，還需要獲取樣本相應(yīng)的臨床、病理、影像、治療、隨訪、知情同意、生活方式等信息，所以樣本庫行業(yè)急需建立一個健全的樣本庫信息管理系統(tǒng)追蹤樣本的生命周期進行全程有效追蹤，獲取從樣本采集到處理、生理和臨床信息注釋、科研應(yīng)用、最終到樣本銷毀的信息數(shù)據(jù)。生物技術(shù)和計算機技術(shù)的快速發(fā)展為大規(guī)模收集如血液、尿液等人體生物樣本、存儲樣本的相關(guān)醫(yī)療信息、大量的樣本數(shù)據(jù)統(tǒng)計分析、生物樣本信息資源庫的信息化應(yīng)用管理及不同地域間的生物樣本信息資源庫的資源交流提供了良好的平臺。針對建立、統(tǒng)一、資源網(wǎng)絡(luò)是國際樣本庫發(fā)展趨勢中的三個里程碑，然而

7、完成“統(tǒng)一”的任務(wù)是發(fā)展樣本資源網(wǎng)絡(luò)的基礎(chǔ)。我國生物樣本信息建設(shè)起步較晚，使得國內(nèi)的第1頁共30頁單項論證轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)生物信息支撐平臺管理系統(tǒng)開發(fā)生物樣本信息資源難以實現(xiàn)資源共享、資源得不到充分有效的利用。目前國內(nèi)大部分樣本庫信息以臨床診斷作為樣本的主要信息，如特定類別腫瘤樣本庫的主要信息局限于病患的臨床診斷結(jié)果，而個體健康信息（如飲食習(xí)慣、生活方式、家系信息等相關(guān)信息）卻可能缺失，這是國內(nèi)信息化管理方面存在的問題之一，也是中國生物樣本庫信息化建設(shè)現(xiàn)狀的縮影。2009年9月，美國國家癌癥研究中心（NationalCancerInstitute,NCI）籌劃建立了美國第一個國家級人類癌癥生物樣本信息

8、資源庫（TheCancerHumanBiobank,caHUB,該樣本庫是世界上技術(shù)最先進、管理最完善的大規(guī)模生物樣本庫之一，其為生物樣本庫的管理制定的一套先進完善的樣本庫管理規(guī)范。NCIBestPracticesforBiospecimenResources»中也提到，生物樣本庫信息管理系統(tǒng)是高標(biāo)準(zhǔn)樣本庫的重要組成部分。統(tǒng)一的生物樣本庫信息管理平臺應(yīng)以數(shù)字化、規(guī)范化、網(wǎng)絡(luò)化為目標(biāo)，完整包含和整合樣本質(zhì)控信息、樣本存儲信息、生物信息及整合了醫(yī)療機構(gòu)已建立的信息系統(tǒng)（HIS）、電子病歷系統(tǒng)（EMR等臨床信息，減少生物樣本庫多源信息化資源重疊，簡便查詢和檢索、優(yōu)化流程，為臨床和科研提供可

9、靠方便的決策信息。建立起統(tǒng)一的、健全的生物樣本庫信息化系統(tǒng)也是今后國內(nèi)生物樣本庫海量數(shù)據(jù)整合的發(fā)展趨勢和必要途徑。2015年9月4日，美國國家健康中心（NIH）宣布將投入總計4800萬美元的資金專門用于收集整合基因組信息并將其錄入至電子健康記錄系統(tǒng)。NIH的這一計劃主要是為了完善電子健康病例系統(tǒng)以及醫(yī)療保險體系并服務(wù)于精準(zhǔn)醫(yī)療計劃。華西醫(yī)院是中國西部疑難危急重癥診療的國家級中心，也是世界規(guī)模第一的綜合性單點醫(yī)院。華西醫(yī)院的臨床和基礎(chǔ)研究在轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)方面歷經(jīng)長期努力與實踐，打造了一個多學(xué)科、多功能的科研和臨床相結(jié)合的團隊。團隊提出了高于第三代標(biāo)本庫建設(shè)的需求，即在傳統(tǒng)標(biāo)本庫的基礎(chǔ)上，建設(shè)具備多種衍

10、生功能，并能夠分析和集成多學(xué)科綜合信息的大規(guī)模、自動化、集成化的新型資源庫。而建立標(biāo)準(zhǔn)統(tǒng)一的樣本信息管理平臺，則是數(shù)據(jù)信息規(guī)范收集、有效使用、擴大共享的重要基礎(chǔ)。第2頁共30頁單項論證轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)生物信息支撐平臺管理系統(tǒng)開發(fā)2.2 系統(tǒng)需求轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)生物信息支撐平臺管理系統(tǒng)需對臨床標(biāo)本供體、標(biāo)本本體和生物治療衍生物及其相關(guān)信息進行分類和系統(tǒng)管理。形成臨床治療和臨床藥物試驗和隨訪的生物標(biāo)本采集、臨床治療評估，科研問卷和科研結(jié)果一體化的動態(tài)工作模式，集成各模塊數(shù)據(jù)，開發(fā)智能管理軟件，打造信息共享平臺，達到信息資源的集成化、模塊化、自動化、網(wǎng)絡(luò)化運行，經(jīng)生物信息化分析反饋到?jīng)Q策層，使各獨立的功能單元有機地

11、整合，實現(xiàn)基礎(chǔ)科研向臨床醫(yī)學(xué)轉(zhuǎn)化信息管理的變革。信息管理單元架構(gòu)在數(shù)據(jù)庫和WEBK務(wù)器信息設(shè)備基礎(chǔ)上，主要基于生物信息學(xué)、計算機技術(shù)、人工智能等方法進行智能生物樣本與生物信息方面的分析、存儲、管理、搜索海量生物信息、為醫(yī)學(xué)研究和治療提供信息化、自動化、網(wǎng)絡(luò)化的決策支撐，主要包括臨床生物樣本智能管理和數(shù)據(jù)處理分析中心兩大部分，信息管理系統(tǒng)單元流程圖如圖2.1標(biāo)本及相關(guān)信息系統(tǒng)的功能性需求如表2.1所示：表2.1信息支撐平臺管理系統(tǒng)功能性需求功能類別功能名稱描述系統(tǒng)設(shè)置用戶管理設(shè)置多用戶/、同權(quán)限，控制/、同用戶對樣品信息的讀取及操作權(quán)限?？蓪崿F(xiàn)用戶分級配置、分組授權(quán)管理、功能與資源雙重授權(quán)；用戶

12、均需通過唯一用戶名及密碼登錄系統(tǒng)，同時系統(tǒng)具有長時間無人操作自動退出功能。樣本類型管理支持樣本類型設(shè)置（可以為每種樣本類型設(shè)廿個唯一代碼和圖標(biāo)）；每個樣品類型均使用圖標(biāo)標(biāo)示。第3頁共30頁單項論證轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)生物信息支撐平臺管理系統(tǒng)開發(fā)續(xù)表2.1信息支撐平臺管理系統(tǒng)功能性需求功能類別功能名稱描述編碼管理支持樣本編碼規(guī)則的設(shè)置（根據(jù)樣本類型制定樣本編碼規(guī)則）；支持低溫條碼打印機的設(shè)置和批量或單條設(shè)置樣本警戒量或者有效期。日志管理日志管理提供樣本、設(shè)備、耗材使用日志，可追蹤樣本米集、處理及使用的全過程；追溯設(shè)備、耗材使用的全過程；提供詳細(xì)的數(shù)據(jù)訪問日志，可追溯數(shù)據(jù)的訪問記錄，查詢數(shù)據(jù)的訪問量和使用量；

13、提供完備的系統(tǒng)操作日志，可以追溯全部操作日志，監(jiān)控不良事件，規(guī)范使用者行為。設(shè)備管理容器管理提供通用化的容器模型定義，支持各類實際存儲空間建模，并進行圖形化展示。設(shè)備使用管理管理設(shè)備生命周期全過程中的所有數(shù)據(jù)，包括設(shè)備的購買、安裝、使用、維護、報廢，以及設(shè)備使用中的人員、時間、數(shù)量、使用率等信息；對設(shè)置使用中的異常情況能以多種手段進行預(yù)警。設(shè)備管理供應(yīng)商管理建立設(shè)備供應(yīng)商目錄，評估設(shè)備使用效率、壽命、維護周期與維護成本等與供應(yīng)商之間的關(guān)系，建議供應(yīng)商質(zhì)量保障和跟蹤體系。樣品管理樣品存儲管理對臨床標(biāo)本供體、標(biāo)本本體和生物治療衍生物及其相關(guān)信息進行分類和系統(tǒng)管理；通過條碼實現(xiàn)快速樣品定位和檢索；使

14、用圖形化操作，直觀顯示樣品入庫過程；提供樣品預(yù)警，采用多種手段對預(yù)設(shè)事件進行響應(yīng)。樣品使用管理在樣品的全生命周期中，對樣品的采集、入庫、運輸、存儲、維護、領(lǐng)用、出庫及刪除回收等全過程依據(jù)預(yù)定制度進行流程管理；提供批量出入庫向?qū)?，提高樣品管理效率。耗材管理耗材管理在耗材的整個生命周期中進行流程管理。實現(xiàn)條形碼管理、采購計劃管理、耗材領(lǐng)用管理、供應(yīng)商管理、質(zhì)量跟蹤管理、庫存數(shù)量自動預(yù)警等功能。臨床信息管理樣本臨床信息管理記錄患者如基本信息和臨床診斷等信息，支持用戶對樣本源信息結(jié)構(gòu)和字段內(nèi)容的自定義，支持用戶通過患者/樣本信息組合條件查詢符合條件的患者，進行瀏覽到相應(yīng)的樣本信息，并將查閱信息導(dǎo)出到E

15、XCE送單，可通過樣本源類型對樣本源信息分類。捐贈者信息管理追蹤捐贈者的問卷和知情同意；管理QA/QC®序和文件，捐贈者臨床數(shù)據(jù)電子采集；捐贈者需隨訪樣本采集的自動信息提示；捐贈者日常信息管理。第4頁共30頁單項論證轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)生物信息支撐平臺管理系統(tǒng)開發(fā)續(xù)表2.1信息支撐平臺管理系統(tǒng)功能性需求功能類別功能名稱描述隨訪管理生成患者隨訪計劃，通過篩選找到需要的隨訪記錄并支持記錄每次隨訪的健康數(shù)據(jù)和隨訪狀態(tài)。支持用戶對隨訪信息結(jié)構(gòu)和字段內(nèi)容的自定義，并將患者隨訪信息導(dǎo)出到EXCE假單。文檔管理文檔管理基于設(shè)備、樣品數(shù)據(jù)和文檔模板，定時生成相關(guān)文檔及報表；文檔模板由用戶自行設(shè)置，通過fa范插入

16、數(shù)據(jù)，并能定期生成指定期限內(nèi)的數(shù)據(jù)文檔；支持多種文檔格式、多種媒體文件的導(dǎo)入導(dǎo)出及快速檢索。數(shù)據(jù)中心數(shù)據(jù)接口為所有設(shè)備開發(fā)數(shù)據(jù)接口，實現(xiàn)設(shè)備數(shù)據(jù)自動存儲；提供系統(tǒng)與物聯(lián)網(wǎng)系統(tǒng)的數(shù)據(jù)接口，實現(xiàn)基十物聯(lián)網(wǎng)的設(shè)備、耗材、樣本跟蹤；提供與各類醫(yī)院信息管理系統(tǒng)的數(shù)據(jù)接口，實現(xiàn)多數(shù)據(jù)源的數(shù)據(jù)集成度；為數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)預(yù)留數(shù)據(jù)接口，方便接入新的設(shè)備和外部數(shù)據(jù)庫；預(yù)留編程接口，方便在系統(tǒng)的專家系統(tǒng)和數(shù)據(jù)分析中心中使用自定義算法。數(shù)據(jù)中心數(shù)據(jù)查詢對文本、公式等信息在系統(tǒng)所記錄的所有義檔及與系統(tǒng)相連的各數(shù)據(jù)庫中進行透明、實時、智能查詢，并以統(tǒng)一的格式顯示查詢結(jié)果。對系統(tǒng)管理的各項數(shù)據(jù)提供詳盡的統(tǒng)計功能和統(tǒng)計報表。序列數(shù)

17、據(jù)管理與分析集成平臺為試驗室提供基于序列產(chǎn)生和管理以及后續(xù)處理的一體化平臺；有強大的數(shù)據(jù)查詢、導(dǎo)航、視圖分析、匯總功能。支持功能擴展和結(jié)構(gòu)化定制，能夠滿足序列信息收集與科研中的個性化需求，為序列研究中的序列信息收集、序列分析等提供強有力的信息化保障。生物數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)集成高逋量數(shù)據(jù)處理算法及常用醫(yī)學(xué)統(tǒng)計算法，提供各種高能量數(shù)據(jù)處理及醫(yī)學(xué)統(tǒng)計功能；提供豐富的數(shù)據(jù)導(dǎo)入、導(dǎo)出及備份功能。專家系統(tǒng)生物樣本信息挖掘建設(shè)一個專門針對生物樣本庫的信息挖掘工具，以期從大量樣本信息庫中揭示出隱含的、先前未知的并有潛在基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)和轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)價值的信息。預(yù)防醫(yī)學(xué)專家系統(tǒng)針對不同病種，依據(jù)對系統(tǒng)數(shù)據(jù)的信息挖掘，并引入各科室

18、醫(yī)生專家意見，建立預(yù)防醫(yī)學(xué)專家系統(tǒng)。致力于對亞健康人群依據(jù)各項檢查分析數(shù)據(jù)進行分類，對此類人群的患病風(fēng)險和程度進行持續(xù)的跟蹤、辨識，為疾病的預(yù)防及治療提供專家意見和建議。試驗項目管理試驗項目管理對使用樣本庫進行的試驗，從試驗立項、審批、試驗開展、數(shù)據(jù)記錄、結(jié)題的全過程進行流程管理。第5頁共30頁單項論證轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)生物信息支撐平臺管理系統(tǒng)開發(fā)2.3 社會、經(jīng)濟效益分析第6頁共30頁單項論證轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)生物信息支撐平臺管理系統(tǒng)開發(fā)二.系統(tǒng)開發(fā)的主要內(nèi)容、關(guān)鍵技術(shù)、創(chuàng)新點與預(yù)期目標(biāo)1 .主要內(nèi)容本系統(tǒng)包括系統(tǒng)設(shè)置、日志管理、設(shè)備管理、樣品管理、耗材管理、臨床信息管理、文檔管理、數(shù)據(jù)中心、專家系統(tǒng)、試驗項目

19、管理等模塊。止匕外，系統(tǒng)預(yù)留標(biāo)準(zhǔn)化數(shù)據(jù)接口，方便接入新的設(shè)備和外部數(shù)據(jù)庫；預(yù)留編程接口，方便在系統(tǒng)的專家系統(tǒng)和數(shù)據(jù)分析中心中使用自定義算法。1.1 系統(tǒng)設(shè)置系統(tǒng)設(shè)置管理是系統(tǒng)的基礎(chǔ)模塊之一，用于對系統(tǒng)的使用及控制進行設(shè)置。(1)用戶管理擁有不同權(quán)限的用戶可訪問的數(shù)據(jù)和使用的系統(tǒng)功能不同，可以根據(jù)樣本的類別、用途和所屬的科室、課題來劃分樣本的組別和用戶的權(quán)限。多用戶權(quán)限設(shè)計：可設(shè)置多用戶不同權(quán)限，控制不同用戶對樣品信息的讀取及操作權(quán)限?？蓪崿F(xiàn)用戶分級配置、分組授權(quán)管理、功能與資源雙重授權(quán)，以保護個人隱私及數(shù)據(jù)安全。安全許可：所有用戶均需要通過唯一用戶名及密碼登錄系統(tǒng)，同時系統(tǒng)具有長時間無人操作自

20、動退出功能。充分考慮工作人員級別和使用需求的差異、數(shù)據(jù)和系統(tǒng)功能的重要程度和安全級別，可設(shè)置不同級別的用戶賬號及樣本數(shù)據(jù)訪問權(quán)限。用戶可以通過互聯(lián)網(wǎng)遠程訪問并操作系統(tǒng)。只需在任意一臺計算機或智能終端上通過任一網(wǎng)絡(luò)瀏覽器即可實現(xiàn)系統(tǒng)的快捷安全訪問。(2)樣本類型及編碼管理系統(tǒng)能夠支持樣本類型設(shè)置(可以為每種樣本類型設(shè)定一個唯一代碼和圖標(biāo))支持樣本編碼規(guī)則的設(shè)置(根據(jù)樣本類型制定樣本編碼規(guī)則)，支持低溫條碼打印機的設(shè)置和批量或單條設(shè)置樣本警戒量或者有效期。本系統(tǒng)具有靈活、方便的特點,用戶可根據(jù)實際需求定制標(biāo)簽編碼組合或標(biāo)簽編碼規(guī)則。形象逼真的彩色圖標(biāo)：每個樣品類型均有獨特直觀的彩色圖標(biāo)標(biāo)示。預(yù)置8

21、0種彩色圖標(biāo)，包含了試驗室所有樣品類型第7頁共30頁單項論證轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)生物信息支撐平臺管理系統(tǒng)開發(fā)1.2 日志管理系統(tǒng)能夠提供所有樣本、設(shè)備及耗材信息以及患者、用戶、文檔的操作日志，并支持按照日期、操作用戶、容器存儲、樣本類型、樣本源類型查看日志信息，從而實現(xiàn)操作過程全記錄。系統(tǒng)提供詳細(xì)的樣本操作日志，可追蹤樣本采集、處理及使用的全過程；系統(tǒng)提供詳細(xì)的設(shè)備、耗材使用日志，可追溯設(shè)備、耗材使用的全過程；系統(tǒng)提供詳細(xì)的數(shù)據(jù)訪問日志，可追溯數(shù)據(jù)的訪問記錄，查詢數(shù)據(jù)的訪問量和使用量；系統(tǒng)提供完備的系統(tǒng)操作日志，可以追溯全部操作日志，監(jiān)控不良事件，規(guī)范使用者行為。安全審核追蹤：可保存并能顯示所有操作記錄及

22、操作人員信息，最大程度保證安全及機密信息。1.3 設(shè)備管理第8頁共30頁單項論證轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)生物信息支撐平臺管理系統(tǒng)開發(fā)（1）容器管理（空間管理）系統(tǒng)能夠以樹狀結(jié)構(gòu)化虛擬化模擬顯示實際存儲空間（冰箱、液氮罐等）的各級結(jié)構(gòu)（包括冰箱、架子、凍存盒），并設(shè)置各級存儲空間的規(guī)格大小，靈活模擬和設(shè)置，使用戶任意自定義存儲空間結(jié)構(gòu)，系統(tǒng)還可批次復(fù)制和根據(jù)復(fù)雜條件查詢樣本位置。多模型支持：通用化的容器模型定義，支持任何一種存儲容器建模圖形化展示：圖形化的存儲單元展示，像操作實體容器一樣進行存取操作，通過顏色顯示容器的存儲量使用率統(tǒng)計：實時統(tǒng)計容器的使用率，了解容器使用狀況，有效規(guī)劃樣本存儲虛擬冰箱技術(shù)：利用虛

23、擬冰柜技術(shù)，通過自定義層，架，歹I，樣品盒等的空間位置，可完全模擬任何品牌冰箱/液氮罐的真實儲存空間。（2）設(shè)備使用管理在設(shè)備的全生命周期中，采用流程管理，能在系統(tǒng)中定義設(shè)備的使用流程（如審批等），然后按流程要求對設(shè)備的使用進行申請、審核并生成設(shè)備的使用記錄（如使用人、使用時間等），實現(xiàn)設(shè)備使用的規(guī)范化管理。在后臺能監(jiān)控設(shè)備當(dāng)前的使用情況，統(tǒng)計某階段設(shè)備的使用情況。對設(shè)備的維護調(diào)整，依據(jù)現(xiàn)有制度，進行流程管理，并有完整記錄。設(shè)備警告：可設(shè)置設(shè)備警告提示。當(dāng)設(shè)備存儲量過少或過多、設(shè)備使用頻度過低或過高、設(shè)備維護期臨近、設(shè)備狀態(tài)異常時觸發(fā)警告，可定制聲音報警、圖形顏色報警、手機短信報警及電子郵件報

24、警等多種報警方式。第9頁共30頁單項論證轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)生物信息支撐平臺管理系統(tǒng)開發(fā)(3)供應(yīng)商管理建立設(shè)備供應(yīng)商目錄，依據(jù)設(shè)備使用、維護的管理日志對設(shè)備的質(zhì)量進行跟蹤評估，并以此對供應(yīng)商進行質(zhì)量評估，在下次設(shè)備采購時，可方便地確定可選供應(yīng)商并給出排序。1.4 樣品管理本模塊實現(xiàn)對臨床標(biāo)本供體、標(biāo)本本體和生物治療衍生物及其相關(guān)信息進行分類和系統(tǒng)管理。管理生物樣本采集、處理、儲存和運輸?shù)娜^程。為此，需在設(shè)備管理的基礎(chǔ)上，保存所有樣品與臨床、生活方式和試驗相關(guān)的數(shù)據(jù)，樣品位置，儲存時間，網(wǎng)絡(luò)超級鏈接和圖片等信息。同時具有樣本需求與儲備總數(shù)應(yīng)答和常規(guī)需求最低閾值報警提示；樣本的優(yōu)化出入庫條件設(shè)置(如單一樣

25、本的庫存分裝數(shù)量，采集難易程度，本次科研的重要性和貯存時間等權(quán)重)；設(shè)置超低溫冰箱溫度監(jiān)控和報警系統(tǒng)，對樣本貯存溫度實時記錄等功能。(1)樣品存儲管理樣本管理的物理存儲和設(shè)備息息相關(guān)，系統(tǒng)通過條形碼定位功能，在管理軟件里精確標(biāo)出存放空間位置。樣本的生命周期是樣本管理的另一個重要方面。系統(tǒng)支持管理樣本的基本信息(如樣本類型、樣本量等)，支持用戶對樣本信息結(jié)構(gòu)和享段內(nèi)容的自定義以及導(dǎo)出樣本信息到EXCE送單。通過樣本信息中的條件組合篩選樣本，支持刪除生物樣本庫里的樣本，被刪除的樣本存放在樣本回收站中，樣本回收站中的樣本可以被徹底刪除或撤銷刪除。提供樣本冷凍盒位置校驗，可以通過輸入或者掃描樣本編號，

26、快速獲取樣本目前的狀態(tài)和存儲位置等信息?？焖俅嫒∨c定位：快速樣本定位，導(dǎo)航方式或檢索方式立即定位；工單功能：虛擬與實體對照，快速定位樣本圖形化操作：圖形化樣本入庫，操作簡單、形象、直觀。可通過顏色快速了解樣本存儲情況，能準(zhǔn)確快速地反映樣本的出入庫情況，同時更新并明確標(biāo)識樣本的存儲位置，應(yīng)用圖形化設(shè)計，操作更直觀易用。標(biāo)準(zhǔn)化編碼：方便靈活的樣本編碼方式，支持規(guī)范和自定義形象逼真的彩色圖標(biāo)：每個樣品類型均有獨特直觀的彩色圖標(biāo)標(biāo)示。預(yù)置80第10頁共30頁單項論證轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)生物信息支撐平臺管理系統(tǒng)開發(fā)種彩色圖標(biāo)，包含了試驗室所有樣品類型樣品識別：條形碼打印，掃描及識別功能。創(chuàng)建條形碼功能，即時恢復(fù)樣品

27、信息及儲存位置。完善的樣品管理功能：保存所有樣品相關(guān)信息，樣品數(shù)量，儲存時間，網(wǎng)絡(luò)超級鏈接和圖片等。同時具有樣品報警功能，超過保質(zhì)期、總數(shù)減少等均可設(shè)置觸發(fā)警報。人性化界面設(shè)計，采用彩色直觀圖標(biāo)標(biāo)明樣品種類，讓樣品識別易如反掌?？梢越o樣品儲存盒命名，設(shè)置最常用的樣品盒表單，或者選擇最近使用的樣品盒，讓您最快速度找到所需樣品。樣品警告：可設(shè)置樣品警告提示。當(dāng)樣品總量過少、樣品過期、樣品凍融循環(huán)次數(shù)過多時觸發(fā)警告，可定制聲音報警、圖形顏色報警、手機短信報警及電子郵件報警等多種報警方式。(2)樣品使用管理CGB-FC-(M»2血液祥本采集流程BB埒寫知情同意朽柔曲耗村準(zhǔn)需第11頁共30頁單

28、項論證轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)生物信息支撐平臺管理系統(tǒng)開發(fā)在樣品的全生命周期中，對樣品的采集、入庫、運輸、存儲、維護、領(lǐng)用、出庫及刪除回收等全過程依據(jù)預(yù)定制度進行流程管理。系統(tǒng)能夠提供出入庫操作向?qū)?，引?dǎo)用戶完成樣本出入庫操作并規(guī)范管理流程。根據(jù)生物樣本庫需求由計算機輔助生成樣本編號并自動生成二維條形碼，自動為多個樣本復(fù)份分配空間位置，查看、打印和對照出入庫。并支持貼碼管和預(yù)制管兩種樣本容器。系統(tǒng)能夠提供還庫操作的向?qū)?，引?dǎo)用戶完成樣本還庫操作并規(guī)范管理流程。通過查找樣本復(fù)份的編號快速將樣本歸還至樣本復(fù)份出借前的空間位置。同時查看到未歸還的樣本記錄以及所歸還樣本的剩余量。支持預(yù)置二維編碼的凍存管的還庫管理。還

29、庫處理時自動記錄樣本的凍融次數(shù)，樣本還庫信息都存儲在記錄單中，方使用戶查看以往批次還庫信息。全生命周期樣本管理：隨時知道樣本使用狀態(tài)；批量樣本出入庫：省時省力，提高樣本管理效率1.5 耗材管理審批（八輯席批）供應(yīng)商三證及合同管理到期操證）/自動訂貨科室申請（訂貨點自全流程管理制定采購計劃果購訂貨（自動分供應(yīng)商訂貨,支持理信訂貨1庫.采購驗收（按訂單選攝入科室使用（記錄和追溯使用情況）科室領(lǐng)用（言哽領(lǐng)用報倉庫庫存管理（可支恃s級倉庫的管理）低值耗材采購及領(lǐng)用流程管理可有效地、全程監(jiān)控低值耗材的采購、申請以及使用，并設(shè)置了多級權(quán)限的管理與審批，大大降低耗材的采購成本及運營成本，提高低值耗材的監(jiān)控與

30、追溯管理。第12頁共30頁單項論證轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)生物信息支撐平臺管理系統(tǒng)開發(fā)模塊實現(xiàn)條形碼管理、采購計劃管理、耗材領(lǐng)用管理、供應(yīng)商管理、質(zhì)量跟蹤管理、庫存數(shù)量自動預(yù)警等功能，覆蓋了樣品庫中耗材的整個生命周期，為規(guī)劃化地對耗材進行管理提供了數(shù)據(jù)支持。耗材警告：可設(shè)置耗材警告提示。當(dāng)耗材總量過少、耗材損耗率過高、耗材保質(zhì)期臨近時觸發(fā)警告，可定制聲音報警、圖形顏色報警、手機短信報警及電子郵件報警等多種報警方式。耗材質(zhì)量跟蹤：通過日志，追蹤試驗過程中耗材與試驗效果之間的關(guān)系，建立耗材及供應(yīng)商的質(zhì)量評價體系，優(yōu)化耗材供應(yīng)商管理，盡量降低耗材使用成本，提高耗材使用效率。供應(yīng)量管理：建立供應(yīng)商目錄，依托質(zhì)量跟蹤評

31、價體系，對供應(yīng)商的供應(yīng)資質(zhì)進行標(biāo)定，在耗材選購時，依據(jù)評價順序，優(yōu)化供應(yīng)商選取，以達到降低成本，提高效率和質(zhì)量的目的。1.6 臨床信息管理(1)樣本臨床信息管理系統(tǒng)能夠提供樣本相關(guān)臨床信息管理：可記錄患者如基本信息和臨床診斷等信息，支持用戶對樣本源信息結(jié)構(gòu)和字段內(nèi)容的自定義，支持用戶通過患者/樣本信息組合條件查詢符合條件的患者，進行瀏覽到相應(yīng)的樣本信息，并將查閱信息導(dǎo)出到EXCEL!單，可通過樣本源類型對樣本源信息分類。(2)捐贈者信息管理追蹤捐贈者的問卷和知情同意；管理QA/QC®序和文件，捐贈者臨床數(shù)據(jù)電子采集；捐贈者需隨訪樣本采集的自動信息提示；隨訪管理系統(tǒng)能夠生成患者隨訪計劃

32、，可通過篩選找到需要的隨訪記錄并支持記錄每次隨訪的健康數(shù)據(jù)和隨訪狀態(tài)。支持用戶對隨訪信息結(jié)構(gòu)和字段內(nèi)容的自定義，并將患者隨訪信息導(dǎo)出到EXCE送單。第13頁共30頁單項論證轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)生物信息支撐平臺管理系統(tǒng)開發(fā)樣本和醫(yī)療數(shù)據(jù)信息提取安全、便利，使醫(yī)療和科研工作者進行貫穿信息的標(biāo)準(zhǔn)化管理及綜合搜索、分析，真正實現(xiàn)數(shù)據(jù)的實用化，從而為醫(yī)療數(shù)據(jù)挖掘及醫(yī)學(xué)健康領(lǐng)域的科研發(fā)現(xiàn)提供可靠而全面的數(shù)據(jù)基礎(chǔ)，推動精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)的發(fā)展。系統(tǒng)能夠?qū)ψ远x問卷進行管理，用戶可根據(jù)樣本信息的實際需要，自定義收集的數(shù)據(jù)字段（限制制定問卷數(shù)量）。支持?jǐn)?shù)值、文本、多選、單選、圖片等多種字段類型；該模塊是樣本信息、樣本源信息、隨訪信息

33、數(shù)據(jù)字段自定義的支持模塊。附有患者信息模板，可涉及患者在醫(yī)院信息系統(tǒng)中的所有信息以及住院、出院過程的所有信息。1.7 文檔管理系統(tǒng)能夠支持查看生物樣本庫存總體情況并按照報表形式顯示，還支持按照日期、樣本類型、樣本的擁有者、樣本源類型、樣本組成的分類來分別查看樣本庫存總體情況?；谠O(shè)備、樣品數(shù)據(jù)和文檔模板，定時生成相關(guān)文檔及報表。文檔模板由用戶自行設(shè)置，通過一定規(guī)范插入數(shù)據(jù)，并能定期生成指定期限內(nèi)的數(shù)據(jù)文檔。圖片、文本、音頻、視頻等多格式文件存儲支持，支持將文檔導(dǎo)出為WOREXCELPDF£圖形等多種文件格式。多角度立體保存資料，能通過掃描儀、攝像頭快速采集圖像、報告單。文件快速調(diào)用和

34、檢索，全方位、高速管理。各類報告（庫存、采集、使用、QA等報告）的存儲、查閱、打?。挥涗泩蟾尜|(zhì)量等功能。1.8 數(shù)據(jù)中心系統(tǒng)提供試驗管理的功能模塊，將樣本的試驗記錄抽象化、電子化，并對樣本試驗所產(chǎn)生的衍生物進行記錄、統(tǒng)計、分析。數(shù)據(jù)接口為所有設(shè)備開發(fā)（基于硬件或軟件，具體由設(shè)備情況而定）數(shù)據(jù)接口，實現(xiàn)設(shè)第14頁共30頁單項論證轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)生物信息支撐平臺管理系統(tǒng)開發(fā)備數(shù)據(jù)與數(shù)據(jù)庫的自動、實時記錄。此部分采用C/S模式。提供系統(tǒng)與物聯(lián)網(wǎng)系統(tǒng)的數(shù)據(jù)接口，實現(xiàn)基于物聯(lián)網(wǎng)的設(shè)備、耗材、樣本跟蹤。系統(tǒng)提供各類醫(yī)院信息管理系統(tǒng)如HIS、LIS、PIS、GCPPACSCRIM以及基礎(chǔ)研究平臺、技術(shù)研究平臺及臨床

35、研究平臺之間的數(shù)據(jù)集成功能。系統(tǒng)將對不同時期、采用不同技術(shù)研發(fā)、不同數(shù)據(jù)庫管理系統(tǒng)存儲的各類醫(yī)院信息管理系統(tǒng)進行數(shù)據(jù)集成，將這些分散的數(shù)據(jù)源中的數(shù)據(jù)，邏輯地集成到一個統(tǒng)一的數(shù)據(jù)集合中，使用戶能夠以透明的方式訪問這些數(shù)據(jù)源，以提高數(shù)據(jù)共享利用的效率。這里，透明的方式是指用戶無需關(guān)心信息是來自于HIS系統(tǒng)還是GC朦統(tǒng),只需指明需要讀取什么信息，由系統(tǒng)自行選擇信息的來源，并且將不同來源的信息以相同的方式呈現(xiàn)給用戶。提供其它系統(tǒng)使用本系統(tǒng)獲取信息的開放接口，使不同的信息系統(tǒng)如臨床治療系統(tǒng)則方便、透明地共享本系統(tǒng)的信息資料，以提高信息的共享度、利用率和有效性。為數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)預(yù)留數(shù)據(jù)接口，方便接入新的設(shè)備和

36、外部數(shù)據(jù)庫；預(yù)留編程接口，方便在系統(tǒng)的專家系統(tǒng)和數(shù)據(jù)分析中心中使用自定義算法。(2)數(shù)據(jù)查詢通對文本、公式等信息在系統(tǒng)所記錄的所有文檔及與系統(tǒng)相連的各數(shù)據(jù)庫中進行查詢，并以統(tǒng)一的格式顯示查詢結(jié)果。實時查詢：實時查詢(鍵盤輸入實時更新結(jié)果)可根據(jù)樣品名稱、序列號、關(guān)鍵字隨時準(zhǔn)確定位樣品。圖形化結(jié)果即時顯示樣品詳細(xì)儲存信息。通過日志，實時監(jiān)控設(shè)備、樣品、耗材的當(dāng)前狀態(tài)、使用者等信息。智能查詢：通過實時查詢生成器和智能文件夾，實現(xiàn)高級智能查詢?？芍苯永霉綄Ψ肿?、DNAi?進行查詢。詳盡的統(tǒng)計功能：輕松統(tǒng)計所有設(shè)備、樣品、耗材的每一項詳細(xì)信息：根據(jù)設(shè)備分類、樣品分類、來源分類等。(3)序列數(shù)據(jù)管理

37、與分析集成平臺為試驗室提供基于序列產(chǎn)生和管理以及后續(xù)處理的一體化平臺。構(gòu)建本地序列庫管理平臺，對試驗室產(chǎn)生的序列導(dǎo)入導(dǎo)出，構(gòu)建數(shù)據(jù)質(zhì)控審核機制；構(gòu)建本地Blast比對數(shù)據(jù)庫，對數(shù)據(jù)進行比對檢索、高度同源檢索、進化樹第15頁共30頁單項論證轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)生物信息支撐平臺管理系統(tǒng)開發(fā)構(gòu)建等；對病毒微生物序列進行序列突變位點分析和耐藥分析，對具有參考序列數(shù)據(jù)自動鑒別突變位點，并進行深入分析如耐藥位點變異分析、序列基因型血清型、表面抗原分析等生物信息相關(guān)層次自動分析注釋需求；集成WindowsLinux平臺算法，構(gòu)建基于Wet#面的算法配置。具有強大的數(shù)據(jù)查詢、導(dǎo)航、視圖分析、匯總功能。支持功能擴展和結(jié)構(gòu)化

38、定制，能夠滿足序列信息收集與科研中的個性化需求，為序列研究中的序列信息收集、序列分析等提供強有力的信息化保障。具有統(tǒng)一的技術(shù)規(guī)范和標(biāo)準(zhǔn)，能夠?qū)崿F(xiàn)信息資源的共享，具有很好的實際應(yīng)用價值，提供強有力的信息化保障。（4）生物數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)1）高通量數(shù)據(jù)分析，顯著性分析、聚類分析、相關(guān)分析、主成分分析；2）SN吩析，Hardy-Weinberg平衡、LD分析、單體型分析；3）醫(yī)學(xué)統(tǒng)計分析，假設(shè)檢驗、方差分析、分參數(shù)檢驗、生存分析、回歸分析等。分析流程化：芯片分析，數(shù)據(jù)質(zhì)控->顯著性分析->聚類分析->相關(guān)分析->主成分分析；SN吩析，基因型頻率的計算->Hardy-Wein

39、berg平衡->連鎖不平衡分析->單體型分析。算法的集成：高通量數(shù)據(jù)處理算法集成，常用醫(yī)學(xué)統(tǒng)計算法的集成。數(shù)據(jù)導(dǎo)入：僅需鼠標(biāo)點擊幾次，便可以輕松將現(xiàn)有數(shù)據(jù)導(dǎo)入系統(tǒng)。僅需鼠標(biāo)簡單拖放，即可優(yōu)化存儲空間，更改樣品位置，或者轉(zhuǎn)移全部樣品盒位置。數(shù)據(jù)備份：系統(tǒng)能夠具備數(shù)據(jù)備份恢復(fù)功能，預(yù)防系統(tǒng)數(shù)據(jù)的遺失和破壞；有兩種以上不同的備份方式，可選擇每月/每周/每日等多種情況進行自動備份；支持EXCEL!動備份數(shù)據(jù)及輸出，保存10年以上數(shù)據(jù)量。1.9 專家系統(tǒng)利用庫內(nèi)信息實現(xiàn)亞健康人群的辨識（即該人群的患病風(fēng)險、程度等的評估）。以往系統(tǒng)只能實現(xiàn)病人、正常人的分類，無法對亞健康人群進行定量分析。希望

40、能通過本系統(tǒng)并聯(lián)系各相關(guān)數(shù)據(jù)庫提取人員信息，實現(xiàn)對這類人群基于模糊數(shù)學(xué)和專家系統(tǒng)的定量分析，為預(yù)防人群相關(guān)疾病的發(fā)生及提前干預(yù)做準(zhǔn)備。第16頁共30頁單項論證轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)生物信息支撐平臺管理系統(tǒng)開發(fā)(1)生物樣本信息挖掘建設(shè)一個專門針對生物樣本庫的信息挖掘工具，以期從大量樣本信息庫中揭示出隱含的、先前未知的并有潛在基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)和轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)價值的信息。是一種決策支持、智能搜索和可視化處理過程，主要基于人工智能、機器學(xué)習(xí)、模式識別、統(tǒng)計學(xué)、數(shù)據(jù)庫、可視化技術(shù)等，高度自動化地分析系統(tǒng)數(shù)據(jù)，做出歸納性的推理，從中挖掘出潛在的模式，提取出有價值的規(guī)律，幫助使用者獲得有用信息。通過預(yù)測未來趨勢及行為，做出前攝的、基

41、于知識的決策。生物樣本信息挖掘的目標(biāo)是從數(shù)據(jù)庫中發(fā)現(xiàn)隱含的、有意義的信息提供給決策層或共享研究人員使用，主要的內(nèi)容包括:生物樣本自動預(yù)測趨勢和行為、樣本關(guān)聯(lián)分析、樣本聚類分析、特質(zhì)樣本概念描述和樣本偏差檢測。(2)預(yù)防醫(yī)學(xué)專家系統(tǒng)針對不同病種，依據(jù)對系統(tǒng)數(shù)據(jù)的信息挖掘，并引入各科室醫(yī)生專家意見，建立預(yù)防醫(yī)學(xué)專家系統(tǒng)。致力于對亞健康人群依據(jù)各項檢查分析數(shù)據(jù)進行分類，對此類人類的患病風(fēng)險和程度進行持續(xù)的跟蹤、辨識，為疾病的預(yù)防及治療提供專家意見和建議。1.10 試驗項目管理對使用樣本庫進行的試驗從試驗立項、審批、試驗開展、數(shù)據(jù)記錄、結(jié)題的全過程進行流程管理。(1)立項流程管理主要是針對申辦者或CR

42、O有效管理項目的基本信息、項目概要、項目相關(guān)資料、項目簽署、項目執(zhí)行、內(nèi)部交接資料、會議紀(jì)要、項目日志等。(2)項目任務(wù)分配與進度管理可對項目的參與人員包括CRCCRADM進行參與任務(wù)分配，如入組例數(shù)，入組完成情況等；工作進度分配，包括總體進度，每個分中心進度，關(guān)鍵任務(wù)節(jié)點，以及任務(wù)變更處理等。(3)臨床試驗文件管理第17頁共30頁單項論證轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)生物信息支撐平臺管理系統(tǒng)開發(fā)管理臨床試驗中的各種相關(guān)文件，覆蓋試驗準(zhǔn)備階段、試驗啟動階段、試驗進行階段、試驗結(jié)束階段，文件包括倫理文件、知情同意書、研究方案、研究者手冊、會議紀(jì)要、試驗室文件以及受試者文件等。研究中心管理建立研究中心庫，包括各個醫(yī)院的

43、研究中心信息、研究者信息；以及與研究中心簽署的合同，付款信息；研究中心的溝通記錄等。(5)監(jiān)查信息管理監(jiān)查計劃的制定，以及每個監(jiān)查任務(wù)的明細(xì)任務(wù)；監(jiān)查報告記錄，包括受試者管理、研究中心情況、方案執(zhí)行情況、ICF監(jiān)查、核對原始醫(yī)療文件、數(shù)據(jù)質(zhì)疑、藥物檢查、研究者文件夾監(jiān)查等。(6)受試者數(shù)據(jù)過程管理可對各中心入組進度計劃與實際入組情況，項目的進展、數(shù)據(jù)錄入、受試者轉(zhuǎn)態(tài)、數(shù)據(jù)疑問等進行及時管理。(7)物資管理記錄物資包括藥品、器械、紙質(zhì)CRFS等接收、發(fā)放、退還銷毀、返回等。(8)費用管理記錄日常費用明細(xì)(研究中心支出、公司內(nèi)部支出、實際到賬、借款單)、合同費用明細(xì)(分期到賬信息、費用支出預(yù)算)等

44、。2 .關(guān)鍵技術(shù)(1)多用戶權(quán)限設(shè)計可設(shè)置多用戶不同權(quán)限，控制不同用戶對樣品信息的讀取及操作權(quán)限?？蓪崿F(xiàn)用戶分級配置、分組授權(quán)管理、功能與資源雙重授權(quán)，即在試驗項目、樣品、設(shè)備、耗材管理流程、不同種類數(shù)據(jù)上的權(quán)限均可進行設(shè)置，從而大大細(xì)化了系統(tǒng)的管理粒度，加大了系統(tǒng)的靈活性和安全性。(2)條形碼管理支持編碼規(guī)則自定義，支持低溫條碼打印設(shè)置；支持通過手持設(shè)備的相機，以圖形方式輸入條形碼，并進行條碼識別，從而使手機等智能終端能使用本系統(tǒng)的樣品管理、設(shè)備管理、耗材管理等功能。第18頁共30頁單項論證轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)生物信息支撐平臺管理系統(tǒng)開發(fā)(3)虛擬冰箱技術(shù)利用虛擬冰柜技術(shù)，通過自定義層，架，歹I，樣品盒

45、等的空間位置，可完全模擬任何品牌冰箱/液氮罐的真實儲存空間。從而實現(xiàn)容器的多模態(tài)支持和圖形化的存儲單元展示，能對任何一種存儲容器建模，并像操作實體容器一樣進行在計算機上進行虛擬存取操作。(4)實時預(yù)警技術(shù)開發(fā)實時預(yù)警技術(shù)，當(dāng)預(yù)警條件滿足時，能以定制音報、圖形、顏色、手機短信及電子郵件等多種方式進行報警，并將相應(yīng)信息寫入至日志中，以便后期統(tǒng)計匯總。本技術(shù)將用于設(shè)備、樣品、耗材、隨訪等多個模塊的預(yù)警功能的實現(xiàn)。(5)流程管理技術(shù)在設(shè)備管理、樣本管理、耗材管理、試驗項目管理中均采用了流程管理技術(shù)，以達到提高受控程度，提高工作效率，提高資源合理配置程度，提高管理水平以及活動規(guī)范的目的。(6)質(zhì)量跟蹤技

46、術(shù)建立基于日志和流程的質(zhì)量跟蹤體系，在設(shè)備、樣本、耗材、試驗項目、隨訪管理中實現(xiàn)質(zhì)量的記錄、跟蹤、追溯及評價，并以此為基礎(chǔ)，對供應(yīng)商進行評價和排序。(7)文檔管理技術(shù)可輕松、高效地控制和跟蹤系統(tǒng)中各類文件的進度，確保文檔的快速安全訪問，系統(tǒng)可提供文件的高級、智能化搜索，時間進度提醒，以有效地管理文檔。提供各種類型的文檔導(dǎo)入導(dǎo)出功能，以實現(xiàn)報告的高效、智能化生成、存儲和查閱。(8)數(shù)據(jù)接口技術(shù)通過此技術(shù)，系統(tǒng)提供各類醫(yī)院信息管理系統(tǒng)如HIS、LIS、PIS、GCPPACSCRIM以及基礎(chǔ)研究平臺、技術(shù)研究平臺及臨床研究平臺之間的數(shù)據(jù)集成功能。邏輯地集成不同時期、不同技術(shù)研發(fā)、不同數(shù)據(jù)庫存儲的各類

47、信息系統(tǒng)的分散數(shù)據(jù)，并提供對這些數(shù)據(jù)的透明訪問、透明查詢、透明統(tǒng)計等功能。(9)序列數(shù)據(jù)管理與分析集成技術(shù)第19頁共30頁單項論證轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)生物信息支撐平臺管理系統(tǒng)開發(fā)本技術(shù)用于構(gòu)建本地序列庫管理平臺，對試驗室產(chǎn)生的序列導(dǎo)入導(dǎo)出，構(gòu)建數(shù)據(jù)質(zhì)控審核機制；提供強大的數(shù)據(jù)查詢、導(dǎo)航、視圖分析、匯總功能，支持功能擴展和結(jié)構(gòu)化定制，以滿足序列信息收集與科研中的個性化需求，為序列研究中的序列信息收集、序列分析等提供強有力的信息化保障。(10)生物樣本信息挖掘技術(shù)通過在系統(tǒng)中集成高通量數(shù)據(jù)處理算法及常用醫(yī)學(xué)統(tǒng)計算法，并預(yù)留自定義算法接口，實現(xiàn)對數(shù)據(jù)的高通量處理及醫(yī)學(xué)統(tǒng)計分析，以期從大量樣本信息庫中揭示出隱含的

48、、先前未知的并有潛在基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)和轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)價值的信息。(11)預(yù)防醫(yī)學(xué)專家系統(tǒng)針對不同病種，依據(jù)對系統(tǒng)數(shù)據(jù)的信息挖掘，并引入各科室醫(yī)生專家意見，建立預(yù)防醫(yī)學(xué)專家系統(tǒng)。致力于對亞健康人群依據(jù)各項檢查分析數(shù)據(jù)進行分類，對此類人類的患病風(fēng)險和程度進行持續(xù)的跟蹤、辨識，為疾病的預(yù)防及治療提供專家意見和建議。3 .創(chuàng)新點(1)在智能樣本管理系統(tǒng)中引入生物樣本信息挖掘技術(shù)，并建立專家系統(tǒng)，致力于對亞健康人群依據(jù)各項檢查分析數(shù)據(jù)進行分類，對此類人群的患病風(fēng)險和程度進行持續(xù)的跟蹤、辨識及定量分析，為疾病的預(yù)防及治療提供專家意見和建議。(2)使用多用戶權(quán)限設(shè)計，實現(xiàn)用戶分級配置、分組授權(quán)管理、功能與資源雙重授權(quán)，即

49、在試驗項目、樣品、設(shè)備、耗材管理流程、不同種類數(shù)據(jù)上的權(quán)限均可進行設(shè)置，從而大大細(xì)化了系統(tǒng)的管理粒度，加大了系統(tǒng)的靈活性和安全性。(3)設(shè)備、樣品、耗材的管理中使用流程管理，并配以強大的日志功能、報警功能及質(zhì)量跟蹤、追溯功能，提高了管理效率和管理質(zhì)量，并為設(shè)備、耗材采購提供設(shè)備、耗材的質(zhì)量水平及供應(yīng)商資質(zhì)排序。(4)預(yù)留數(shù)據(jù)接口及編程接口，方便接入新的設(shè)備和數(shù)據(jù)庫，以及在數(shù)據(jù)分析和信息挖掘中使用自定義算法進行研究。(5)在智能樣本管理系統(tǒng)中引入試驗項目管理，實現(xiàn)對試驗項目的實時在線跟蹤及監(jiān)控，保障了臨床試驗數(shù)據(jù)的質(zhì)量，有效縮短臨床研究的周期，為藥物上市贏得了寶貴的時間。第20頁共30頁單項論證

50、轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)生物信息支撐平臺管理系統(tǒng)開發(fā)4 .預(yù)期目標(biāo)本系統(tǒng)建成后，為適用于多用戶的基于網(wǎng)絡(luò)云計算技術(shù)、物聯(lián)網(wǎng)技術(shù)和生物信息大數(shù)據(jù)處理技術(shù)的智能生物樣本管理軟件。用戶可以通過互聯(lián)網(wǎng)使用計算機或智能終端通過任一網(wǎng)絡(luò)瀏覽器快捷安全地遠程訪問生物信息數(shù)據(jù)庫。系統(tǒng)可管理所有冰箱及液氮系統(tǒng)，保存所有樣品的相關(guān)臨床、生活方式和實驗數(shù)據(jù)、樣品位置、儲存時間、網(wǎng)絡(luò)超級鏈接和圖片等相關(guān)信息。系統(tǒng)可對設(shè)備、樣本、耗材的全生命周期中的各種活動（購買、運輸、存儲、使用、回收）進行流程管理，并實現(xiàn)全時監(jiān)控預(yù)警及質(zhì)量跟蹤。系統(tǒng)提供專門針對生物樣本庫的信息挖掘工具，以期從大量樣本信息庫中揭示出隱含的、先前未知的并有潛在基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)

51、和轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)價值的信息。系統(tǒng)中的專家系統(tǒng)，致力于對亞健康人群依據(jù)各項檢查分析數(shù)據(jù)進行分類，對此類人群的患病風(fēng)險和程度進行持續(xù)的跟蹤、辨識及定量分析，為疾病的預(yù)防及治療提供專家意見和建議。第21頁共30頁單項論證轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)生物信息支撐平臺管理系統(tǒng)開發(fā)三.現(xiàn)有工作基礎(chǔ)、條件和優(yōu)勢以及技術(shù)風(fēng)險分析1 .現(xiàn)有工作基礎(chǔ)、條件和優(yōu)勢2 .技術(shù)風(fēng)險分析(1)數(shù)據(jù)接口技術(shù)本技術(shù)希望為各類預(yù)聯(lián)入的數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)預(yù)留接口，為此需對現(xiàn)有的各醫(yī)學(xué)信息系統(tǒng)的數(shù)據(jù)庫進行研究，這是一項工作量極大的工作。為此，我們將邀請相關(guān)公司協(xié)助我們的工作，在研究華西醫(yī)院的HIS、HIS、LIS、PIS、GCPPACSCRIM等系統(tǒng)的基礎(chǔ)上，調(diào)研

52、現(xiàn)有的其它常用的醫(yī)學(xué)信息系統(tǒng)，從而設(shè)計出元數(shù)據(jù)系統(tǒng)，實現(xiàn)開發(fā)統(tǒng)一、開放的數(shù)據(jù)庫接口。(2)生物樣本信息挖掘技術(shù)本技術(shù)的實施需大量的生物信息學(xué)方面的算法，這是本系統(tǒng)研究團隊是華西醫(yī)院專家、自動化系專家兩者均比較薄弱的地方，我們將聘請生物信息學(xué)方面的專家教授作為項目技術(shù)顧問，指導(dǎo)關(guān)鍵技術(shù)的攻關(guān)分析。(3)預(yù)防醫(yī)學(xué)專家系統(tǒng)本技術(shù)的實施需要調(diào)研、理解并存儲大量醫(yī)學(xué)專家在相關(guān)疾病方面的研究信息，這可以通過聘請華西醫(yī)院相關(guān)科室的專家作用項目技術(shù)顧問以及接入共享華西HIS系統(tǒng)的相關(guān)信息來獲取。在專家系統(tǒng)的構(gòu)建方面，我們將聘請四川大學(xué)自動化系、計算機系等單位人工智能、專家系統(tǒng)等領(lǐng)域的專家學(xué)者作為項目顧問，指導(dǎo)

53、關(guān)鍵技術(shù)的攻關(guān)。除上述3項技術(shù)外，研發(fā)本系統(tǒng)所需的關(guān)鍵技術(shù)都是現(xiàn)有的成熟技術(shù)，不存在太大的技術(shù)風(fēng)險。第22頁共30頁單項論證轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)生物信息支撐平臺管理系統(tǒng)開發(fā)四.系統(tǒng)開發(fā)計劃進度和分階段目標(biāo)表4.1系統(tǒng)開發(fā)工作分解表階段序號階段類別階段期間階段目標(biāo)12016年4月6月01:需求調(diào)查：向用戶接觸，收集相關(guān)數(shù)據(jù)22016年6月20日02:需求說明：識別需求，并形成需求說明文檔3概念階段2016年6月25日03:評估會議：評估目標(biāo)、風(fēng)險、可行性和確定資源42016年6月30日04:項目首次會議：召開團隊會議，進行早期的工作安排52016年6月7月D1:項目計劃會議，對項目的執(zhí)行進行專題討論6項目計劃2016年7月D2:編寫項目開發(fā)計劃，進行規(guī)劃和總體安排72016年7月30日D3:項目計劃的審核和發(fā)布82016年7月D4:針對需求提出計算機模型、邏輯設(shè)計、功能設(shè)計，形成概要設(shè)計文件92016年7月9月D5:對數(shù)據(jù)庫進行規(guī)范化和對象設(shè)計，并形成數(shù)據(jù)庫設(shè)計文件102016年9月12月D6:模塊設(shè)計：數(shù)據(jù)庫實現(xiàn)、數(shù)據(jù)庫的訪問控制腳本112016年9月12月D7:模塊設(shè)計：貝囿邏輯和貝囿樣式122016年9月12月D8:模塊設(shè)計：系統(tǒng)設(shè)置132016年9月12月D9:模塊設(shè)計：日志管理14廠品設(shè)計20