第八章:蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)和功能(12學(xué)時)_第1頁
第八章:蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)和功能(12學(xué)時)_第2頁
第八章:蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)和功能(12學(xué)時)_第3頁
第八章:蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)和功能(12學(xué)時)_第4頁
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1、第八章:蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)和功能(12學(xué)時) 第一節(jié):活性蛋白質(zhì)與前體(PP277-285)2.3.前體蛋白酶的限制性水解切去一個或幾個肽段活性蛋白質(zhì)例如:酶原激素原蛋白酶;激素,或者:前激素原激素原激素、激素與激素原(PP277-279)1.2.提取和確定前體的方法:前體不表現(xiàn)生物活性,活性測定的方法無效。免疫復(fù)合物提取法(主要方法,例如胰島素前體的提取),步驟如下:制備抗激素抗體:以激素作為抗原,注射到實(shí)驗(yàn)動物體內(nèi),待動物產(chǎn)生 相應(yīng)的抗體后,抽取血清,提取具有交叉反應(yīng)性的抗激素抗體。找出無活性的蛋白質(zhì):利用激素原能和“抗激素抗體”形成免疫復(fù)合物 的特性,將抗激素抗體與產(chǎn)生激素的腺體的組織勻漿混合

2、,分離提取免 疫復(fù)合物,找出無活性的蛋白質(zhì),即為可疑的激素原。鑒定激素原:對這種無活性的蛋白質(zhì)測序,與相應(yīng)的激素的一級結(jié)構(gòu)對 比,就能推斷是不是該激素的前體。重組DNA譯碼法:例如“前腦啡肽原”的確定前體與激素在一級結(jié)構(gòu)方面的關(guān)系:見227頁表8-1。前體部分序列與激素相同,或者說,激素的序列包含在前體的序列之中。胰島素與前體1 .胰島素的分布、功能和來源:主要作用于肝、肌肉、脂肪組織,參與糖代謝, 有平衡血糖的作用。作為糖尿病的特效藥,在臨床醫(yī)學(xué)上廣為應(yīng)用。胰島素 原由胰腺中胰島B細(xì)胞產(chǎn)生。胰島素的活化過程:前胰島素原:胰島素原:3.4.(見278頁圖8-1和8-2)信號肽一B-鏈一C-肽鏈

3、一A-鏈(105肽)信號肽酶 切下信號肽(24肽)B-鏈一C-肽鏈一A-鏈(81肽)類胰蛋白酶+類羧肽酶切下 Arg31, Arg32, Lys59, Arg60 和 C 鏈胰島素(A-鏈+B-鏈)(21肽+30肽)便于生物合成;利于二硫鍵正確配對。胰島素:C肽的作用:信號肽的作用:在新生肽鏈的傳送過程中起識別和導(dǎo)向的作用。1.C端為甲硫氨酸;C端為亮氨酸。(見280頁圖8-3 )腦啡肽與前體腦啡肽的分布和功能:腦啡肽存在于腦區(qū),與腦細(xì)胞的專一性受體結(jié)合,對機(jī)體具有強(qiáng)烈的鎮(zhèn)痛作用。腦啡肽的種類:甲硫腦啡肽:Tyr-Gly-Gly- Phe-Met亮腦啡肽:Tyr-Gly-Gly-Phe-Leu

4、前腦啡肽原的一級結(jié)構(gòu)特征:(LEK ) 1 個:位于 230234 ;MEK-RK ) 1 個:位于 261-267;MEK-RGL ) 1 個:位于 189-193;(配對堿性殘基):三種(Lys-Arg ; Lys-Lys ; Arg-Arg ), 12 個。4.腦啡肽結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系:Tyr1 :Gly2 :Gly3 :P he4:Met5 :全長267個氨基酸殘基(人體);信號肽段1個:位于124 ;甲硫腦啡肽(MEK) 4 個:位于 100104、107111、136140、210214; 亮腦啡肽甲七肽( 甲八肽( 酶切位點(diǎn)以甲氧基取代酚羥基,失去活性;前面加一個Arg,活性下降;

5、改為D-Ala ( D型丙氨酸),則鎮(zhèn)痛作用大大提高;為活性必需的,不能被取代;可被Trp或者N-CH 3-Phe取代;但不能被 Tyr和Leu取代; 去除則活性下降;延長一個Thr,則活性不變。pp279-283)二、酶與酶原(體內(nèi)蛋白酶的來源和功能: 胃和胰臟:產(chǎn)生消化食物蛋白質(zhì)的酶; 血液:產(chǎn)生導(dǎo)致血液凝固的蛋白酶。酶原的概念:酶的前體,含有酶的一級結(jié)構(gòu)的氨基酸殘基序列,但是由于多余肽段的存在,沒有形成活化中心的立體結(jié)構(gòu)(功能域),因而不具有催化活性。在生理活動需要時,在其他酶和/或因子的作用下,切去多余的肽段,形成酶。10種酶原激活的條件和過程:見281頁,表8-2。 胰凝乳蛋白酶原的

6、激活1.激活過程:(282頁,圖8-4)胰凝乳蛋白酶原:1.2.3.單鏈,n -胰凝乳蛋白酶:雙鏈,245肽,5對二硫鍵胰蛋白酶Arg15 Ile16之間切斷15肽+230肽,酶活性最高,但不穩(wěn)定n -胰凝乳蛋白酶(自身激活)切開三處釋放 2 個 2 肽:Ser14-Arg15 ;Thr147-As n148A鏈、B鏈、C鏈,穩(wěn)定,但活性較低三鏈:a -胰凝乳蛋白酶:2.活化中心的形成:(催化部位變化不大,結(jié)合部位從無到有) 催化部位(Asp102、His57、Ser195):酶原和酶的分子構(gòu)象非常相似,活化中心的催化部位具有相同的取向(282-283頁,圖8-5 A.和B.)。 結(jié)合部位(1

7、89192位口袋):是酶原中不存在的(283頁圖8-6)。胰凝乳蛋白酶結(jié)合部位形成的機(jī)理:Ile16氨基質(zhì)子化:15-16切開后,Ile16與Asp 194羧基形成離子鍵。 形成“口袋”結(jié)構(gòu):上述離子鍵的形成,引起一系列的構(gòu)象變化:-Met192從酶分子內(nèi)部轉(zhuǎn)移到分子表面,暴露疏水側(cè)鏈;- Gly187和Gly193伸展,形成疏水“口袋”,可與底物結(jié)合;- Ser195和Gly193的亞氨基也與底物羰基氧形成氫鍵。胰蛋白酶原的激活1. 激活過程:(284頁,圖8-7)(提前教室畫圖) 激活的地點(diǎn):來自胰臟,在12指腸激活。 過程:在腸激酶或者胰蛋白酶的催化下,切下N端6肽。2 .連鎖反應(yīng):(2

8、84頁,圖8-8)(提前教室畫圖)三、兩類前體的不同功能(PP283-285) 表兩類前體功能和結(jié)構(gòu)的比較前體前激素原/前酶原激素原/酶原多余肽段的 生理作用:信號肽:起識別和向?qū)ё饔茫瑢⑿?生肽輸送到內(nèi)質(zhì)網(wǎng),信號 肽切除后,肽段進(jìn)入儲存 場所分泌顆粒。多余肽段:起阻礙活化中心或者活性 肽形成的作用,是酶的無活 性儲備形式,接受生理功能 調(diào)節(jié)。多余肽段的 結(jié)構(gòu)特征:信號肽:數(shù)目:1個;位置:多肽鏈的 N端; 長度:1530個殘基; 殘基:很強(qiáng)的疏水性。多余肽段:數(shù)目:1至多個; 位置:末端或肽段的中部; 長度:或長或短;殘基:切口處常有 Arg,Lys第二節(jié):血紅蛋白的結(jié)構(gòu)與功能(pp285-

9、299)一、概述1.2.3.pp285-285) 分布及功能 存在于人和脊椎動物的紅細(xì)胞中,是02和CO2的運(yùn)載工具。學(xué)科發(fā)展史上的貢獻(xiàn) 在結(jié)構(gòu)和功能關(guān)系的研究上,它是研究得最清楚的蛋白質(zhì)。 血紅蛋白的種類和亞基的組成 HbA : HbA 2: HbF:在成人體內(nèi)為主要成分,占 在成人體內(nèi)為次要成分,占 是胎兒的主要血紅蛋白。95% 以上;2 % 左右;二、血紅蛋白的分子結(jié)構(gòu)( 血紅蛋白一、二、三、四級結(jié)構(gòu) 一級結(jié)構(gòu)特征: (以 HbA 為例)見 286 頁的圖 a鏈和3鏈有60處氨基酸殘基是相同的,占pp285-291)1.8-942 % ;2.3. a鏈和3鏈與肌紅蛋白有23處相同,占16

10、 % ;二、三級結(jié)構(gòu): a鏈和3鏈與肌紅蛋白三者的構(gòu)象高度相似,走向相同(見圖 三者的差異見 288頁表 8-4(以肌紅蛋白作標(biāo)準(zhǔn)) 。 四級結(jié)構(gòu):(見 288頁的圖 8-1)8-11);四聚體結(jié)構(gòu):為四面體排布(二面體對稱),體積:6.4 X 5.5X 5 nm。亞基的接觸:分為兩種a i/ 3 1 或者(a 2/ 3 2):兩條鏈之間有 34 個殘基的接觸,共形成 17-19 個氫鍵,接觸面積較 大,形成一個穩(wěn)定的二聚體,不受 02 結(jié)合作用的影響; a i/ 3 2 或者(a 2/ 3 1):兩條鏈之間只有 19 個殘基的接觸,接觸面積較小,受02結(jié)合作用的影響。能把兩個二聚體聯(lián)系成為一

11、個四聚體。脫氧血紅蛋白的亞基間的離子鍵(見 289 頁的圖 8-13 ) :總共 8個1與a 2之間的離子鍵:兩個末端離子鍵,兩個鏈間的離子鍵;1 或者3 2的各自鏈內(nèi)離子鍵一個,共兩個;1 與3 2之間離子鍵一個;2 與3 1 之間離子鍵一個。(X這種四聚體對氧分子的親和力低于亞基,也低于氧合血紅蛋白。 脫氧血紅蛋白亞基與 DPG 間的離子鍵(見 290頁的圖 8-14 ) :共 6個DPG:是2,3-二磷酸甘油醛的簡稱,位于四聚體的中央空穴中。 離子鍵: DPG 帶負(fù)電荷,與3 1 和3 2 上六個(每鏈三個)帶正電荷 的基團(tuán)形成離子鍵。作用:使脫氧血紅蛋白四級結(jié)構(gòu)更加穩(wěn)定,降低對氧分子的

12、親和力。 原卟啉、鐵原子(見 212 頁 圖 6-24 提前畫圖 ; 291 頁 圖 8-15) 血紅素、 血紅素:位于各亞基的疏水性空穴中,由一個原卟啉和一個鐵原子組成。 原卟啉:由 4 個吡咯基構(gòu)成,呈扁平狀,鐵原子位于中央。 鐵原子:通過 2個共價鍵和 2 個配位鍵與原卟啉的 4個氮原子相連,另外還 5 配位鍵和第 6 配位鍵。1.2.3.能形成 2 個具有非常重要生物功能的配位鍵,稱為第血紅素與珠蛋白的結(jié)合、氧分子的結(jié)合位 血紅素與珠蛋白的結(jié)合依靠來自1.2.E和第5配位鍵與F8組氨酸的相連: 位鍵與鐵原子相連; 第6配位鍵與E7組氨酸的相連:(291 頁圖 8-15)F螺旋上的E7和

13、F8位上的兩個組氨酸:F8位上的組氨酸距離血紅素較近,直接以配E7位上的組氨酸距離血紅素較遠(yuǎn),不能直接與鐵原子相連,因此在兩者之間形成了一個空間; 氧分子的結(jié)合位:上述的空間就是氧分子的結(jié)合位。氧分子在這個位置上的 結(jié)合是一種可逆的結(jié)合過程。疏水性空穴:水分子可以障礙氧分子的結(jié)合。為了防水,珠蛋白為血紅素構(gòu) 筑了一個防水的空穴。三、血紅蛋白對氧分子的結(jié)合(PP291-292)結(jié)合狀態(tài)的決定因素: 血紅蛋白與氧分子的可逆結(jié)合主要取決與血液中的氧分壓( 在肺部,氧分壓高: 在組織,氧分壓低:3.4.1.P02):2.3.Hb + 4 0 2Hb(O2)4;Hb(O2)4 Hb + 4 02式中Hb

14、成為脫氧血紅蛋白;Hb(O2)4稱為氧合血紅蛋白 每個血紅蛋白有四條肽鏈,故可以與四個氧分子結(jié)合。鐵原子的變價: 在血紅蛋白分子中,鐵原子可以有二價與三價的變化: 在Hb中,鐵原子為亞鐵:Fe2* ; 在Hb(O 2)4中,鐵原子為三價鐵:Fe3+。 血紅蛋白氧飽和度(丫):(有時簡寫為HbO2)。100%血紅蛋白上已結(jié)合氧分 子的氧結(jié)合部位數(shù)4.Y 血紅蛋白應(yīng)能結(jié)合氧分子的氧結(jié)合部位總數(shù)血紅蛋白的氧結(jié)合曲線(氧解離曲線):即全部為脫氧血紅蛋 坐標(biāo)系:P02為橫坐標(biāo);丫為縱坐標(biāo):最低值為 0%白,最高值為100%即全部為氧合血紅蛋白。 特征:肌紅蛋白為雙曲線型,血紅蛋白為S型(見292頁 圖8

15、-16 )。四、血紅蛋白的變構(gòu)效應(yīng)( PP292-293)1. 變構(gòu)效應(yīng)的概念:變構(gòu)效應(yīng)(allosteric effect)指的是:在蛋白質(zhì)分子中一個亞基由于與配子體 (例如氧分子)的結(jié)合,導(dǎo)致亞基的構(gòu)象發(fā)生變化,隨之引起相鄰亞基的構(gòu)象和功能發(fā)生改變的現(xiàn)象。許多蛋白質(zhì)和酶都具有變構(gòu)效應(yīng)。2. 血紅蛋白的變構(gòu)效應(yīng):書上的Adair模型的推導(dǎo)過程請同學(xué)自己看,不作要求。模型要點(diǎn)是: 血紅蛋白的4個亞基(或者4個氧結(jié)合位)之間有協(xié)同作用; 這種協(xié)同作用使結(jié)合常數(shù) K1 K2 K3 K 4,換句話說,對氧分子的結(jié)合, 一個比一個更容易,具體就表現(xiàn)為這種S型曲線;在血紅蛋白分子中,a -亞基首先與氧分

16、子結(jié)合,氧分子引起a-亞基構(gòu)象變化。這種構(gòu)象變化使相鄰的B-亞基的構(gòu)象隨之發(fā)生變化,排除了B亞基氧分子結(jié)合部位的空間障礙,提高了B-亞基對氧的親和力。五、血紅蛋白的變構(gòu)過程( pp293-295 ) 是實(shí)際測量結(jié)果加上推斷得出理論假說。 1鐵原子和血紅素的變化: 原子半徑的變化:在血紅素中,鐵原子由于其電子所占外層軌道的不同, 而有高自旋和低自旋兩種狀態(tài)。在脫氧血紅蛋白中,鐵原子處于高自旋 狀態(tài),半徑大;在氧合血紅蛋白中,鐵原子處于低自旋狀態(tài), 血紅素構(gòu)象的變化: (參見 294 頁圖 8-17)在脫氧狀態(tài), 大,不能嵌合在卟啉環(huán)的中央小孔,而偏離原卟啉平面 與Fe2+結(jié)合時,鐵原子由高旋狀態(tài)

17、變成低旋狀態(tài),半徑縮小半徑小。 由于鐵原子半徑0.06 nm;當(dāng) 0213 %,于是23鐵原子移動0.06 nm,進(jìn)入原卟啉的中央小孔, 并且牽動了 F8 His向原卟 啉平面的位移,從而引起蛋白質(zhì)分子的構(gòu)象發(fā)生變化。亞基三級結(jié)構(gòu)的變化:F8 His 向原卟啉平面的位移,引起亞基三級結(jié)構(gòu)的變化包括:F螺旋、EF拐角、FG拐角發(fā)生位移 F 螺旋與 H 螺旋之間的空隙變小(見 HC2 Tyr 的酚基排出空隙之外; 導(dǎo)致與相鄰亞基相連的離子鍵斷裂(見見 294 頁 圖 8-18 );296 頁 圖 8-21 ),使位于該空隙的 四級結(jié)構(gòu)的變化:296頁 圖 8-21)。a 1 3 1二聚體與a 2

18、3 2二聚體之間相對位置旋轉(zhuǎn)15,平移0.08 nm ;3 2相對于a 1旋轉(zhuǎn)了 13.5 0: 3 2的AspG1(99)與a i的TyrC7(42)之間的氫 鍵消失,而新建3 2的AsnG4(102)與a1的AspG1(94)之間的氫鍵(295頁 圖 8-21 ); 兩個3亞基之間的空隙變小,擠出了 DPG 分子,兩個3亞基之間的離子 鍵全部斷裂;上述變化進(jìn)一步使維持四級結(jié)構(gòu)所有的離子鍵都斷裂;血紅蛋白分子由緊密的 T構(gòu)象轉(zhuǎn)變成松弛的 R構(gòu)象,對O2親和力提高; 3亞基的構(gòu)象變化,使對氧分子結(jié)合的空間障礙(E11Val)消失,3亞基也與氧結(jié)合。六、S型氧合曲線的生理意義(PP295-296

19、)1 血液流經(jīng)肺部時:肺部氧分壓相對較高,但是受環(huán)境氣壓的影響較大。即使 02分壓從 100 毫米汞柱降至 80 毫米汞柱(例如從平原進(jìn)入高原地區(qū)) ,由于 S 型曲線上部較為平坦, 血液的氧飽和度并不受很大的影響, 氧飽和度僅下降 2 %(從 0.95 降至 0.93),血紅蛋白仍然能夠保證充分的攝氧能力。2 血液流經(jīng)組織時:進(jìn)入了解離曲線的中段,氧分壓從 40 毫米汞柱降至 20 毫 米汞柱,血液的氧飽和度隨之下降 30 %(從 0.60 降至 0.30),保證了血液在 流經(jīng)氧分壓低的在組織時,即使氧分壓僅有較小的變化,氧合血紅蛋白的解 離也有明顯的增加,從而釋放出更多的 02,保證組織需

20、要。七、影響血紅蛋白氧親和力的因素( pp296-299 )氧親和力:指的是血紅蛋白對氧結(jié)合的牢固程度,表示為P0250,含義是血紅蛋白中的氧達(dá)到半飽和程度所需要的氧分壓。 氧親和力越高, 血紅蛋白與氧分子的結(jié)合 越牢固,則釋放給給組織的氧就越少;反之越低, 組織就能得到更多的氧供應(yīng)。影 響血紅蛋白氧親和力的因素有: H+、C02、DPG 等濃度, Hb 的變異。 質(zhì)子(H +)和二氧化碳(CO2)的影響1.2.3.波爾效應(yīng)(Bohr effect):質(zhì)子濃度和二氧化碳分壓,能夠降低血紅蛋白對氧分子的親和力,促使氧解離曲線右移(297頁圖8-22)。波爾效應(yīng)(Bohr effect)的生理意義

21、: 當(dāng)血液流經(jīng)組織時:與血液相比,組織的pH值較低,CO2分壓較高,曲線右移,因而有利于氧合血紅蛋白釋放02,同時02的釋放又促進(jìn)了脫氧血紅蛋白分子與 H+和CO2的結(jié)合; 當(dāng)血液流經(jīng)肺部時:由于肺氣泡的O2分壓較高,促使脫氧血紅蛋白分子釋放H+和CO2。CO2的呼出,曲線左移,有利于氧合血紅蛋白的生成。波爾效應(yīng)(Bohr effect)的發(fā)生機(jī)理:H+有助于離子鍵形成:日+與鏈N末端Vai的一NH2結(jié)合:生成正電基團(tuán)一 NH3+,后者再 與另一個a鏈的C末端的一COO 結(jié)合形成離子鍵;日+與8鏈His146的咪唑基結(jié)合:生成帶正電荷的基團(tuán),后者再與同 一條鏈上的B Asp94的側(cè)鏈一COO

22、結(jié)合形成離子鍵;CO2也有助于離子鍵形成:與N末端的a NH2發(fā)生可逆反應(yīng),生成 H+和R NH COO;后者可與B 82 Lys和a 141 Arg的正電基團(tuán)生成離子鍵 這些離子鍵增加了脫氧血紅蛋白的穩(wěn)定性從而降低了對氧的親和力。 2,3-二磷酸甘油酸(DPG)的影響1 .DPG的來源和特征:DPG分子量雖然不DPG是一種有機(jī)磷酸酯,是紅細(xì)胞中糖酵解支路的產(chǎn)物。 大,但是帶有高密度的負(fù)電。DPG的右移作用:DPG能夠穩(wěn)定脫氧血紅蛋白的四級結(jié)構(gòu),降低后者對氧分子的親和力,使血 紅蛋白的氧合曲線右移(見298頁 圖8-23)。DPG的右移作用的發(fā)生機(jī)理: 脫氧血紅蛋白分子的中央空穴較大,可以容納

23、1個DPG分子。在氧分壓低的組織中,DPG與血紅蛋白的結(jié)合能力大于O2,同時在血紅蛋白中 DPG又與O2是互不相容,這樣在血紅蛋白與DPG結(jié)合的同時,就必須釋放O2;而另一方面,與 DPG的結(jié)合使得血紅蛋白四級結(jié)構(gòu)更加穩(wěn)定,使血紅蛋白對O2的親和力進(jìn)一步降低。當(dāng)血液流經(jīng) O2分壓低組織時:紅細(xì)胞中的DPG能促進(jìn)氧合血紅蛋白釋放 更多的O2,以滿足組織對 O2的需要。DPG的濃度越大,則釋放的 O2越 多。故DPG濃度變化是調(diào)節(jié)血紅蛋白分子對O2親和力的重要因素;在有呼吸困難時:例如在空氣稀薄的高山上的人,或者有換氣困難的肺氣腫病人,其紅細(xì)胞中的 DPG濃度都會代償性增加,使為數(shù)不多的氧合血 紅

24、蛋白分子盡量地釋放 O2,以滿足組織對O2的需要。胎兒紅細(xì)胞中的 DPG :胎兒紅細(xì)胞中血紅蛋白主要是HbF (a 2 丫 2) , HbF對O2的親和力比HbA高,這使胎兒血液流經(jīng)胎盤時,HbF能從胎盤的另側(cè)母體的HbA奪取到O2。其原因是丫鏈的143位是絲氨酸而不是組氨酸, 故而HbF結(jié)合DPG的能力弱,因而對 O2親和力高。DPG的生理作用: 第三節(jié):分子?。≒P299-305)一、概述1.2.(PP299-300)分子?。╩olecular disease):這一名詞常用來稱呼蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)的氨基酸序 列與正常有所不同的遺傳病。病因是DNA分子上的基因突變,機(jī)體合成了失去正?;钚缘漠惓?/p>

25、蛋白質(zhì),或者是缺失了某種蛋白質(zhì),影響了機(jī)體的正常生 理功能,而產(chǎn)生的疾病。由于病因是基因的突變,故分子病可以遺傳。 基因突變的類型: 單個堿基取代;一個或多個密碼子的嵌入或缺失; 基因的連接;終止密碼子的變異等3.異常血紅蛋白:即單個 單個堿基取代:目前發(fā)現(xiàn)的異常血紅蛋白絕大多數(shù)是第一種類型, 堿基的取代。單個堿基引起蛋白質(zhì)異常的機(jī)理如下: 按照蛋白質(zhì)生物合成的翻譯機(jī)理(A-U、G-C、C-G、T-A配對):DNA 所含的A、G、C、T (腺、鳥嘌呤;胞、胸腺嘧啶); mRNA 所含的U、C、G、A (尿、胞嘧啶;鳥、腺嘌呤、mRNA中四種核苷酸,三個一組相連,可以排列組成64種三聯(lián)密碼子。6

26、4個密碼子中61種對應(yīng)于20種不同的氨基酸(每種氨基酸,少則對應(yīng)1種密碼子,如蛋氨酸 AUG、色氨酸UGC ;多則對應(yīng)6種密碼子,如精氨酸、亮 氨酸),如果三聯(lián)密碼子中某個堿基被取代,就有可能翻譯出不同的氨基酸, 造成蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)的錯誤(見2-4頁表1-1,第5列)。舉例:參見299頁 圖8-24:(提前畫表)4.其它突變類型:還可以見到一個或多個密碼子的嵌入或缺失等等情況。 異常血紅蛋白的分類:改換分子表面:改換活性部位:改換三級結(jié)構(gòu):改換四級結(jié)構(gòu):取代發(fā)生在分子的表面,絕大多數(shù)無害(HbS等例外);變異發(fā)生在血紅素附近,影響對氧的結(jié)合; 多肽鏈?zhǔn)フ?gòu)象,結(jié)構(gòu)不穩(wěn)定; 在亞基之間界面上

27、的突變,常具有異常的氧親和力。異常Hb正常B鏈異常B鏈位置DNAmRNA1 AADNAmRNAAAHbS6CTTGAAGluCATGUAValHbC6CTTGAAGluTTTAAALysHb Siriraj7CTTGAAGluTTTAAALysHbE26CTTGAAGluTTTAAALysHb Ms63GTACAUHisATAUAUTyrHb N95TTTAAA1 LysCTTGAAGlu100二、分子表面突變的血紅蛋白一鐮刀狀紅細(xì)胞貧血癥(PP300-302)1. 概況:暴露于血紅蛋白 (HbA )分子表面是極性的氨基酸殘基。在人類以及各種動物的血紅蛋白之間,分子表面的氨基酸殘基有顯著的差異

28、。說明這部分 的氨基酸容易變異,它們對于血紅蛋白的功能是不重要的。已經(jīng)發(fā)現(xiàn)的 多種在分子表面發(fā)生氨基酸取代的異常血紅蛋白,絕大多數(shù)是無害的。只有 一小部分,例如:HbS、HbC、HbE、HbI、HbK等可以引起臨床癥狀。2. 鐮刀狀紅細(xì)胞貧血癥: 分布及危害:鐮刀狀紅細(xì)胞貧血癥在非洲黑人中流行。因?yàn)榧t細(xì)胞中含 有HbS血紅蛋白,使病人的紅細(xì)胞呈鐮刀狀,而不是正常的扁圓形(見300頁 圖8-25)。鐮刀狀紅細(xì)胞極易破碎,壽命短,造成嚴(yán)重的貧血,危 及生命。遺傳學(xué)分析表明,患者若為純合子(HbS/HbS ),其紅細(xì)胞中HbS 含量高達(dá)95%以上,患者很難活到成年;患者若為雜合子(HbS/HbA),

29、紅細(xì)胞中HbS含量約為35%,臨床癥狀不嚴(yán)重,不危及生命,但能將疾 病的基因傳給下一代。HbS與HbA 級結(jié)構(gòu)的差異:如上表所述,決定B 6位氨基酸的mRNA 的三聯(lián)密碼子由 GAA變成了 GUA , (DNA中:CTT變成了 CAT;),使 得氨基酸由Glu變成為Vai。HbS與HbA三級結(jié)構(gòu)的差異:相同點(diǎn):B6位氨基酸都位于分子表面;不同點(diǎn):在 HbS中B 6位氨基酸疏水側(cè)鏈不帶電荷,HBA中B 6位氨基酸側(cè)鏈帶負(fù)電荷。使脫氧 HbS在紅細(xì)胞中的溶解度大大降低。B亞基6位粘斑和血紅蛋白纖維的形成:在HbS中B 6位氨基酸疏水側(cè)鏈起到了粘斑的作用(301頁圖8-26),使得HbS分子可以形成

30、細(xì)長的 聚合體,即一股螺旋纖維。幾股螺旋纖維進(jìn)一步纏繞在一起,就形成了 直徑為17nm和21.5 nm的兩種纖維(302頁圖8-27 )。它們使紅細(xì)胞變 成了鐮刀形,而這種細(xì)胞就容易破碎,導(dǎo)致貧血,最后危及生命。三、活性部位突變的血紅蛋白一HbM病和CHBHA ?。╬p302-303) 先天性青紫癥(HbM?。?.HbM病的分布和危害:HbM病發(fā)現(xiàn)于世界各地區(qū)和各種種族。在HbM的四聚體中只有半數(shù)的血紅素可以與02結(jié)合,結(jié)果產(chǎn)生組織供氧不足,導(dǎo)致臨床上的先天性青紫癥狀,以 及繼發(fā)性的紅細(xì)胞增多癥。2.血紅蛋白名稱氨基酸的取代氧親和力波爾效應(yīng)M Bost onTyra 58(E7)His降低降低

31、M IwateTyra 87(F8)His降低降低M Saskatoo nTyrB 63(E7)His正常存在M Hyde ParkTyrB 92(F8)His正常存在M Milwaukee-1GluB 67(E11)Val降低存在HbM病的發(fā)病機(jī)理(見 303頁 圖8-28):3. CHBHACHBHAHbM的分類:分為以下五種類型 表8-6血紅蛋白M的類型酪氨酸Tyr對E7和F8 His的取代:見于前四種 HbM病。由于Tyr殘基 的負(fù)離子(一 0)與血紅素的Fe 3+構(gòu)成了離子鍵,從而使血紅素固定 在高鐵(Fe 3+)狀態(tài),受影響的血紅素喪失了與氧結(jié)合的能力。谷氨酸Glu對B 67 (E

32、11) Vai的取代:見于最后一種 HbM病。B 67 (E11) Vai 與B 63 (E7) His非常接近,相距4個殘基,這在a螺旋上大致相當(dāng)于轉(zhuǎn)了 一圈,因此兩者指的方向相同。由于Glu帶負(fù)電荷,它也能與血紅素的Fe 3+構(gòu)成了離子鍵,從而使血紅素固定在高鐵(Fe 3+)狀態(tài),受影響的血紅素喪失了與氧結(jié)合的能力。病的發(fā)病機(jī)理(見 290頁表8-5和304頁 圖8-29):病又稱為“先天性亨氏小體溶血性貧血癥”。與血紅素接觸的氨基酸殘基都位于血紅素空穴的周圍,這些殘基絕大多數(shù)都 是非極性的殘基,非極性殘基與血紅素互相作用,可以將血紅素固定在該空穴之中,這對于血紅蛋白的功能是必需的。如果上

33、述殘基被極性殘基取代,可以使血紅素脫離血紅蛋白,不能攜帶氧分子,失去血紅蛋白的功能。,故這一而沒有血紅素的珠蛋白也會發(fā)生變性、沉淀形成所謂的“亨氏小體”類的分子病又稱為“先天性亨氏小體溶血性貧血癥” 。四、三級結(jié)構(gòu)突變的血紅蛋白(pp303-304)1 殘基被脯氨酸 Pro 取代,造成三級結(jié)構(gòu)的破壞:Pro是a螺旋的破壞者(參見 200頁上)。如果脯氨酸取代了螺旋段中的氨基 酸殘基,則血紅蛋白的三級結(jié)構(gòu)就會遭到破壞,從而產(chǎn)生不穩(wěn)定的血紅蛋白 和 CHBHA 。例如:Hb Duarte 是3 62 (E6) 的 Val 被 Pro 取代所致;Hb Genoa 是3 28 (B10) 的 Leu

34、被 Pro 取代所致。2 殘基的缺失,造成三級結(jié)構(gòu)的破壞: 許多種不穩(wěn)定的血紅蛋白,由于多肽鏈關(guān)鍵部位缺失一個或多個氨基酸殘基, 從而使a螺旋和肽鏈的構(gòu)象受到破壞,導(dǎo)致血紅蛋白的穩(wěn)定性下降,喪失了 結(jié)合02的能力。例如(見 304頁圖8-30):Hb Freiburg 是由于3 23 (B5) 缺失所致;Hb Gun Hill 是由于 3 91 3 95 (即 F7FG2)缺失所致。五、四級結(jié)構(gòu)突變的血紅蛋白(1a1圖 8-20):99 (G1) Asp與a 42(G7)Tyr之間形成一個氫鍵;102 (G4) Asn與a 94(G1)Asp之間形成一個氫鍵。pp304-305) 亞基之間界面

35、上的相對位移: 在正常情況下,在氧合血紅蛋白與脫氧血紅蛋白互相轉(zhuǎn)變時,血紅蛋白的四 級結(jié)構(gòu)會發(fā)生改變,包括a1 3 2 (或者a 23 1 )的接觸處兩條肽鏈發(fā)生明顯的前后位移(見 295 頁在脫氧狀況下:3 在氧合狀況下:3 當(dāng)這一個氫鍵形成時,另一個就破壞;另一個形成時,這一個就破壞。維持了血紅蛋白四級結(jié)構(gòu)構(gòu)象的穩(wěn)定。 如果相關(guān)的殘基被取代, 會引起血紅蛋白變構(gòu) 效應(yīng)的喪失,出現(xiàn)異常的氧親和力(升高或降低) 。23 99 (G1) Asp 被取代: 如果3 99 (G1) Asp 被取代,將會破壞脫氧狀態(tài)構(gòu)象的穩(wěn)定性,氧親和力升高。 屬于這類的突變血紅蛋白有:Hb Yakima :His

36、-3 99 (G1) Asp ;Hb Kempsey :Asn-3 99 (G1) Asp ;Hb Radcliffe :Ala -3 99 (G1) Asp ;3 102 (G4) Asn 被取代:如果B 102 (G4) Asn被取代,將會破壞氧合狀態(tài)構(gòu)象的穩(wěn)定性,氧親和力降低。屬于這類的突變血紅蛋白有:Hb Kansas:Thr 3 102 (G4) Asn。第四節(jié):蛋白質(zhì)的進(jìn)化( pp305-313 ) 一、蛋白質(zhì)分子進(jìn)化的一般規(guī)律: ( pp305-306) 123456104個(個別 103 個)108個111114個(一般為 112 個)在 N 端增長了 4 個 在 N 端增長了

37、 58 個突變理論:蛋白質(zhì)是 DNA 基因表達(dá)的產(chǎn)物。結(jié)構(gòu)基因的突變會導(dǎo)致蛋白質(zhì)分子的變異。 自然選擇的淘汰:如果變異有損于蛋白質(zhì)的生物功能,則有關(guān)的生物個 體就受到自然選擇的淘汰,得不到延續(xù); 物種的進(jìn)化:如果變異有助于蛋白質(zhì)的生物功能的改進(jìn),或者新的功能 的產(chǎn)生,就有可能促成物種的進(jìn)化; 中性突變:在更多的情況下,蛋白質(zhì)的生物功能不受影響,則這種突變 可以得以遺傳,稱為中性突變。同源蛋白: 指的是:由共同的祖先蛋白質(zhì)分子經(jīng)過變異和自然選擇而產(chǎn)生的功能上相同、 相關(guān)、甚至不同,但是結(jié)構(gòu)上有某種程度相似性的不同蛋白質(zhì)。例如血紅蛋 白與肌紅蛋白就是同源蛋白(結(jié)構(gòu)相似,功能相關(guān)) 同源蛋白的進(jìn)化趨

38、勢: 功能完善:使蛋白質(zhì)所具備的功能得以保全,并得以完善; 功能異化:使蛋白質(zhì)產(chǎn)生新的功能。功能異化是蛋白質(zhì)進(jìn)化的普遍現(xiàn)象。 守恒氨基酸殘基(嚴(yán)格守恒) : 指的是:在生物進(jìn)化過程中,始終保持不變氨基酸殘基。守恒氨基酸殘基一 般與蛋白質(zhì)分子的生物功能保持密切的關(guān)聯(lián)。尤其是與活性部位(包括與金 屬輔基或輔酶相結(jié)合的位置)構(gòu)象有關(guān)的氨基酸殘基均不會發(fā)生改變,這是 維持蛋白質(zhì)生物功能的基本條件。疏水核疏水性的守恒(相對守恒) : 蛋白質(zhì)分子的疏水核,其疏水作用對維持蛋白質(zhì)分子的構(gòu)象有重要的作用, 因此在進(jìn)化過程中,疏水核中的個別殘基可以置換,但疏水性是守恒的。 蛋白質(zhì)分子表面的變異(相對易變) :

39、由于分子內(nèi)部的氨基酸殘基通常對維系三維結(jié)構(gòu)比較重要,因此變異較多發(fā) 生在蛋白質(zhì)分子表面上。在同源蛋白的進(jìn)化過程中,氨基酸殘基之間的置換 有下列規(guī)律:殘基側(cè)鏈的大小、形狀、柔性、電荷、氫鍵形成能力等越近似, 則置換越容易發(fā)生。例如: Lys 被置換為 Arg ;Ile 被置換為 Leu 等等。二、細(xì)胞色素 C 分子的進(jìn)化( pp306-313 ) 細(xì)胞色素 C 一級結(jié)構(gòu)的種族差異 1 用細(xì)胞色素 C 分子研究進(jìn)化的優(yōu)勢: 分布廣泛:細(xì)胞色素 C 是生物界中廣泛存在的一種古老蛋白質(zhì),從細(xì)菌 到人,一切需要氧的生物體中都有細(xì)胞色素C 存在。 結(jié)構(gòu)簡單:細(xì)胞色素 C 分子結(jié)構(gòu)比較簡單,大小合適,容易純

40、化、結(jié)晶, 結(jié)構(gòu)測定比較方便?,F(xiàn)在,已經(jīng)測出近 100 種生物的細(xì)胞色素 C 一級結(jié)構(gòu)。 2 細(xì)胞色素 C 一級結(jié)構(gòu)的種族差異: 多肽鏈殘基數(shù)目的差異: 脊椎動物: 昆蟲: 植物:一級結(jié)構(gòu)殘基改變數(shù)與親緣關(guān)系(見人與黑猩猩:完全相同;人與恒河猴:相差一個殘基;人與馬:相差12個殘基;人與烏龜:相差15個殘基;人與金槍魚:相差21個殘基;人與蠶蛾:相差31個殘基;人與小麥:相差43個殘基;人與面包酵母:相差45個殘基;306頁 表8-7):以人為例 生物進(jìn)化樹:Dickerson等人根據(jù)各種生物的細(xì)胞色素 c 一級結(jié)構(gòu)的差異和相同性,繪 制出生物界的進(jìn)化樹(evoiuti on ary tree

41、),與生物分類學(xué)所繪制的進(jìn)化樹 是一致的。細(xì)胞色素C三級結(jié)構(gòu)的保守性從表8-7中發(fā)現(xiàn),在不同物種的細(xì)胞色素c 一級結(jié)構(gòu)中,有 26個位置的氨基酸殘基是完全不變的(守恒殘基)。這些守恒殘基分散在多肽鏈的各個部位。在分子進(jìn)化過程中,細(xì)胞色素c的一級結(jié)構(gòu)雖然有較大的變化,但是三級結(jié)構(gòu)基本上保持不變(見 312頁 圖8-32)O血紅素結(jié)合位(功能域)的嚴(yán)格保守性(312頁圖8-32):血紅素是細(xì)胞色素 c分子的電子傳遞中心,在生物進(jìn)化中保持不變。 Cys14和Cys17的S原子與血紅素的乙烯基共價相連;Met18的N原子和Met80的S原子與血紅素的 Fe原子配位鍵相連; Tyr48和Trp59與血紅

42、素的丙酸基以氫鍵相連。8-7):1 .血紅素疏水環(huán)境的嚴(yán)格保守性(表70-80位11個殘基參與形成血紅素的疏水環(huán)境,都是守恒殘基。多肽鏈轉(zhuǎn)彎處的嚴(yán)格保守性: Pro (30, 71,76); Gly (29, 34, 45, 77, 84)。環(huán)狹縫疏水基團(tuán)的保守性取代:環(huán)繞狹縫的16個疏水殘基:Leu (32, 35, 64, 68, 94, 98)6 個;3個;2 個;2 個;2 個;1個。Ile (81,85, 95)Pro (30, 71)Phe (10, 46)Tyr 輕 67)Trp (59)雙下畫線為守恒殘基;單下畫線為保守性取代殘基。所謂保守性取代指 的是:化學(xué)性質(zhì)相似的氨基酸殘

43、基之間的互相置換現(xiàn)象。例如:Leu 與 lie;Vai 與 lie;Phe 與 Tyr;電子傳遞通道的守恒殘基:血紅素與環(huán)境之間有兩個通道,其中左通道由5274肽段組成,是電子的傳遞通道,其中 Trp59, Tyr67, Tyr74是3個疏水守恒殘基。5.第五節(jié):蛋白質(zhì)變性( pp313-326)一、概述( pp313-315 ) 引起變性的因素:、尿素、1 化學(xué)因素:包括:酸、堿、有機(jī)溶劑(如:乙醇、甲醇、丙酮、乙醚)鹽酸胍、SDS、三氯乙酸、磷鎢酸、水楊酸等等;2 物理因素:包括:熱、紫外線、X 射線、超聲波、高壓、表面張力、劇烈的振蕩、研磨、攪拌等等。 變形現(xiàn)象:變性蛋白有下列表現(xiàn)1物理

44、性質(zhì)的改變:包括溶解度下降,凝集、沉淀; 失去結(jié)晶能力; 出現(xiàn)流動雙折射現(xiàn)象; 特性黏度增加; 旋光值和橢圓度的改變; 熒光光譜發(fā)生變化。2化學(xué)性質(zhì)改變:包括 消化率提高:在變性前不易被水解,但變性后,水解部位增加,加快。 內(nèi)部基團(tuán)暴露:變性后,埋藏在分子內(nèi)部的基團(tuán)暴露到了分子的表面。 從而變得可以與某些試劑發(fā)生反應(yīng)了。3生物性能的改變:包括 抗原性質(zhì)的改變:抗體失去與專一抗原結(jié)合的能力;4 生物功能的喪失:例如,酶失去催化活性、激素失去生理調(diào)節(jié)功能等。 天然蛋白質(zhì):沒有發(fā)生上述變化的蛋白質(zhì),就是天然蛋白質(zhì)。 狹義天然蛋白質(zhì):在體內(nèi)條件下,具有呈現(xiàn)全部生物功能所需要的精確 構(gòu)象的蛋白質(zhì)。 廣義

45、天然蛋白質(zhì):一般來說,關(guān)于蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能的研究是在體外進(jìn) 行的,需要從體內(nèi)分離提純蛋白質(zhì)。因此,把具有生物活性的離體蛋白 質(zhì)也稱為“天然”蛋白質(zhì),并假定這種蛋白質(zhì)的構(gòu)象,完全類似于體內(nèi) 天然蛋白質(zhì)的構(gòu)象。廣義天然蛋白質(zhì)的概念用得更為頻繁。 變性的概念1 變性的定義:由于外界因素的作用,使天然蛋白質(zhì)分子的構(gòu)象發(fā)生了異常變 化,從而導(dǎo)致生物活性的喪失,以及物理、化學(xué)性質(zhì)的異常變化。變性可以 涉及次級鍵、二硫鍵的斷裂,但不涉及一級結(jié)構(gòu)的斷裂。2 變性的程度:變性的程度有大小之分:小的變性只引起很小的構(gòu)象變化,以 致于目前的實(shí)驗(yàn)手段都無法測量;大的變性可以用物理、化學(xué)的方法測量。測定蛋白質(zhì)的比活性:

46、用幾種方法提純的蛋白質(zhì),若得到相同的比活性,就 可認(rèn)為,此蛋白質(zhì)制劑是天然蛋白質(zhì)。比活性可以追蹤純化蛋白質(zhì)變性程度。 測定蛋白質(zhì)的物理性質(zhì): 觀察蛋白質(zhì)的溶解度是否下降, 是否凝集、 沉淀; 以天然蛋白質(zhì)作對照,測定蛋白質(zhì)的物理性質(zhì)。例如: a 用旋光法測定蛋 白質(zhì)的旋光度的變化;b用圓二色法測定蛋白質(zhì)的橢圓度變化;c以紫外差示光譜法測定蛋白質(zhì)消光系數(shù)的變化; d 以粘度法測量蛋白質(zhì)溶液的特征粘度變 化;e以電泳法測定蛋白質(zhì)的電泳遷移率的變化等。測定蛋白質(zhì)的化學(xué)性質(zhì):例如:測定蛋白質(zhì)分子中某側(cè)鏈基團(tuán)與專一性試劑 蛋白質(zhì)變性的鑒定方法231反應(yīng)的數(shù)目,觀察參加反應(yīng)的側(cè)鏈基團(tuán)數(shù)目有無增加;測定蛋白

47、質(zhì)的水解速 度,看蛋白質(zhì)被水解的速度有無增加。4 測定蛋白質(zhì)的抗原性:用免疫法測定蛋白質(zhì)的抗原性是否改變,抗體能不能 與抗原專一性結(jié)合。5 測定方法的綜合應(yīng)用:檢查蛋白質(zhì)變性的情況往往要采用多種方法,最后觀 察其綜合結(jié)果,才能得到確切的結(jié)論。 變性研究的重要意義:掌握變性條件,掌握變性條件,利用變性條件,利用變性過程,123防止產(chǎn)生變性:大多數(shù)從事該領(lǐng)域研究的人,都希望認(rèn)識和 以得到高活性的蛋白質(zhì)和酶制劑。 研究亞基特征:例如:亞基的拆離和亞基分子量的測定。研究各種作用力:例如:維持二級、三級、四級結(jié)構(gòu)的作用力;研究各種作用力在活性部位上的作用。二、變性和復(fù)性( pp321 -325) 可逆變

48、性和不可逆變性1概念: 可逆變性:除去變性因素之后,在適當(dāng)?shù)臈l件下,蛋白質(zhì)構(gòu)象可以由變 性態(tài)恢復(fù)到天然態(tài)的變性,稱為可逆變性; 不可逆變性:除去變性因素之后,蛋白質(zhì)構(gòu)象不能由變性態(tài)恢復(fù)到天然 態(tài)的變性,稱為不可逆變性。2可逆變性的實(shí)驗(yàn)依據(jù):血紅蛋白:多種方法所致的血紅蛋白變性都可以設(shè)法使它復(fù)性,復(fù)性后 的蛋白質(zhì)的許多指標(biāo),如溶解度、結(jié)晶性質(zhì)、特征光譜、對氧的親和力 等都與天然蛋白質(zhì)一樣。RNA 酶:在溫和堿性條件下,由于巰基乙醇和 8 mol/L 脲的作用,發(fā)生 了變性。二硫鍵全部斷裂,肽鏈完全伸展,酶活性全部喪失。如果用透 析的方法除去變性劑,并在 O2 存在的條件下,讓二硫鍵重新生成,則酶

49、 的活性接近全部恢復(fù),晶體的 X 射線衍射圖譜,與天然晶體完全相同。胰蛋白酶:在酸性溶液中,經(jīng)過70100 C的熱處理,便喪失活性和溶解性。如果適當(dāng)冷卻,仍然可以恢復(fù)原來的酶活性和溶解度。40 年代之前,都認(rèn)為蛋白質(zhì)變性是不可逆的,但是后來的實(shí)驗(yàn)研究表明,有 些蛋白質(zhì)的變性是可逆的。這些實(shí)驗(yàn)包括:雖然,上述例子證明了蛋白質(zhì)變性是可逆的,但是為數(shù)很少,大多數(shù)蛋白質(zhì) 的變性是不可逆的。3不能復(fù)性的原因: 從理論上講,大多數(shù)蛋白質(zhì)的變性應(yīng)該是可逆的。不少蛋白質(zhì)之所以不能復(fù) 性,主要原因是因?yàn)樗枰臈l件復(fù)雜,如:折疊所需要的輔因子、蛋白酶 的徹底去除、解離和結(jié)合的條件、巰基的保護(hù)等等,未能掌握和滿足

50、。 蛋白質(zhì)的變性過程:1. 天然態(tài)( N )和變性態(tài)( U):天然態(tài):指的是天然蛋白質(zhì)分子的構(gòu)象,蛋白質(zhì)的多肽鏈處于折疊狀態(tài);變性態(tài):指的是變性蛋白質(zhì)分子的構(gòu)象,蛋白質(zhì)的多肽鏈處于伸展?fàn)顟B(tài)。2.3.中間態(tài)(I):部分蛋白質(zhì)的變性過程包含1個或多個中間態(tài)(中間構(gòu)象狀態(tài))。例如:-乳球蛋白,在鹽酸胍作用下,其變性過程包含一個中間態(tài);磷酸化酶b在尿素作用下,其變性過程包含 變性的可逆過程:天然態(tài)2個中間態(tài)。變性態(tài)(折疊態(tài))在某些變性條件下(變性)(伸展態(tài))在某些有利于天然態(tài)的條件下(復(fù)性)(折疊態(tài))天然態(tài)變性過程的二態(tài)性(見 322頁 圖8-37): 實(shí)驗(yàn)證明:在蛋白質(zhì)的變性(伸展)過程中,肽單位要

51、么呈充分折疊的狀態(tài)(N),要么呈充分伸展的狀態(tài)(U);如果某蛋白質(zhì)在變性過程中存在中間態(tài)(I),則中間態(tài)(I)存在的時間也是極為短暫,即所謂的“二態(tài)性”。例如:肽鏈的伸展百分?jǐn)?shù)為 50 %,這時的情況是:50 %的肽單位是處于充分伸展?fàn)?態(tài);余下的肽單位則是處于充分折疊狀態(tài)。而不是 100 %的肽單位同時處于 半折疊構(gòu)象狀態(tài)。變性過程的協(xié)同性:實(shí)驗(yàn)還證明:在蛋白質(zhì)的變性過程中,在某一個折疊構(gòu)象中,一旦任何一個 肽單位發(fā)生變性,由折疊態(tài)變成為伸展態(tài),都會導(dǎo)致這個折疊單位中其他肽 單位也發(fā)生一致的變化。形象地說,蛋白質(zhì)的變性過程好象“多米諾骨牌”的變化一樣:具有“二態(tài)性”:也具有“協(xié)同性”。4.5

52、.蛋白質(zhì)的復(fù)性過程:蛋白質(zhì)的復(fù)性過程(重新折疊)比變性過程(伸展)的動力學(xué)變化要復(fù)雜得多。1 .1個或多個中間態(tài)(I)。但是,所有的中間態(tài)(Ii, 和折疊態(tài)(N)穩(wěn)定。過程表達(dá)如下:復(fù)性的概念:當(dāng)無活性的伸展的蛋白質(zhì)處于有利于折疊的最適環(huán)境里,伸展 的肽鏈會自動折疊成天然的折疊態(tài),并恢復(fù)成天然的折疊態(tài),并恢復(fù)全部的 生物活性,稱為復(fù)性。復(fù)性過程的擇優(yōu)性:雖然多肽鏈有能力采取許多不同的構(gòu)象,例如100個殘基的多肽鏈可能形成 10100個不同的構(gòu)象,但是復(fù)性過程采取一種目前還不能 解釋的擇優(yōu)方式進(jìn)行,復(fù)性過程具有恢復(fù)天然蛋白質(zhì)的唯一構(gòu)象的趨勢。復(fù)性過程的步驟:復(fù)性過程通常包含二個或更多的步驟,過程

53、較為復(fù)雜。和 變性過程相同的是,可能包括I2In)都不如伸展態(tài)(U )5.U I1I2I3 In N中間產(chǎn)物的檢測:并不是每個中間產(chǎn)物都可以積累到可以檢測的水平,一般 只有限速步驟之前的中間產(chǎn)物,才有可能積累到一定的水平,并被檢出;即 它的形成速度常數(shù)大于消失速度常數(shù)。充分折疊的蛋白質(zhì):Baldwin等人的研究表明,蛋白質(zhì)的充分折疊一般要經(jīng)歷 兩個或兩個以上速度不等的的重新折疊步驟(根據(jù)速度的不同可以分為“快 速重新折疊”和“慢速重新折疊”);而充分折疊的蛋白質(zhì),總是以其中最慢步驟的速度形成(瓶頸效應(yīng)) 。6 造成慢速折疊的原因: 只有肽鍵中所有異構(gòu)態(tài)都與折疊態(tài)所要求的一致時,伸展的肽鏈才能重新折 疊。而糾正錯誤構(gòu)象的異構(gòu)體的是一種緩慢的過程。 與脯氨酸 Pro 殘基相鄰的肽鍵的“順反異構(gòu)現(xiàn)象” ; 其它錯誤構(gòu)象的異構(gòu)體(也有可能是先折疊,后糾正)。而在溶液中7 Uslow、Ufast 和 N 態(tài)之間的平衡( 323-324 頁,翻譯有問題) 要點(diǎn):如果存

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