pubmed檢索方法與技巧32765

1、劉春艷北京大學醫(yī)學圖書館信息咨詢部PubMed生物醫(yī)學數(shù)據(jù)庫檢索方法與技巧主要內容qPubMedPubMed概況 qPubMed數(shù)據(jù)來源qPubMed檢索機制qPubMed檢索運算符qPubMed檢索方法q結果的顯示、打印、保存q其他輔助功能1. PubMed概況p創(chuàng)建機構：美國國家醫(yī)學圖書館下設的美國生物技術信息中心(NCBI)n1997年6月開始向全球開放p特色：具有收錄范圍廣（免費）、內容全、檢索途徑多、檢索體系完備等特點，部分文獻還可在網(wǎng)上直接免費獲得全文。2. PubMed數(shù)據(jù)來源pMEDLINE： pubmed-indexed for medlinepIn Process Cita

2、tions：每天收錄，尚未經(jīng)規(guī)范處理的數(shù)據(jù)。pubmed-in processpPublisher-Supplied Citations：由出版商提供的電子文獻，每條記錄標有PubMed-as supplied by Publisher。3. PubMed檢索機制n自動轉換匹配功能n(Automatic Term Mapping)nLeukemianleukaemiaAll Fields OR leukemiaMeSH Terms OR leukemiaAll Fieldsn對于輸入的檢索詞，PubMed先按一定的詞表順序進行對照匹配和轉換，再進行檢索。詞表匹配轉換順序是：nMeSH表 期刊刊

3、名表 短語表 作者索引n如果在以上4個表中都找不到相匹配的詞，PubMed將把短語分開，以單詞為單位，分別重復以上的過程，檢索時各個詞之間是AND邏輯關系。如果仍找不到相匹配的詞，則用單個詞在所有字段查找，各個詞之間也是AND邏輯關系。3.1 自動轉換匹配功能自動轉換匹配功能人重組三葉因子（human recombinant trefoil factor）n(humansMeSH Terms OR humansAll Fields OR humanAll Fields) AND recombinantAll Fields AND (trefoil factorSupplementary Con

4、cept OR trefoil factorAll Fields)4. PubMed檢索運算符n邏輯運算符邏輯運算符n邏輯“與”運算AND： 檢索式寫成A and B，表示文獻中同時包含檢索詞A和檢索詞B的文獻才是命中文獻。 AIDS and therapy n邏輯“或”運算OR： 檢索式寫成A or B，表示包含檢索詞A的文獻或者包含檢索詞B的文獻或者同時包含檢索詞A和B的文獻為命中文獻。 AIDS or Acquired Immunodeficiency Syndromen邏輯“非”運算NOT： 檢索式寫成A not B，表示包含檢索詞A同時不包含檢索詞B的文獻為命中文獻。 Hepatit

5、is not AnimalnIP地址：PubMed 網(wǎng)址基本檢索高級檢索主題檢索臨床咨詢臨床實驗5. PubMed檢索方法n5.1 基本檢索n5.2 高級檢索n5.3 主題檢索n5.4 臨床咨詢5.1 基本檢索默認檢索字段為主題、作者、期刊關鍵詞、詞(詞組)或短語： 輸入任意關鍵詞：liver cancer、Lung cancer； 帶有雙引號” ”作為短語檢索：”cancer therapy”； 帶有連接號”-”作為一個詞組檢索（英文可以，中文不行）：interleukin-6。限制檢索字段：如liver cancerti作者：Smith J 、 僅知道作者姓

6、，則必須加上字段標識，如： Smithau2002年以后的文獻若文中有作者全稱可用全稱檢索如：Joshua Lederberg5.1 基本檢索期刊刊名： 可用期刊全稱：GENE THERAPYTA； 可用期刊簡稱：JAMATA；(The Journal of the American Medical Association) 復雜表達式：liver cancer AND therapy帶有摘要文獻的檢索 ：liver cancer AND hasabstract5.1 基本檢索n分析該檢索課題，包含兩個方面： n肝癌：liver cancer；n酒精：alcoholn兩個主題之間的邏輯關系是A

7、ND，即nliver cancer AND alcohol 基本檢索舉例：肝癌和酒精的關系基本檢索舉例：肝癌和酒精的關系輸入：liver cancer AND alcohol“肝癌和酒精的關系”的基本檢索結果5.2 高級檢索高級檢索5.2 高級檢索5.2 高級檢索n分析該檢索課題，包含兩個方面： n作者為：馬大龍（ma dl）；n作者單位為： 北京大學（peking university）。 高級檢索舉例：北京大學醫(yī)學部馬大龍教授發(fā)表的文獻高級檢索舉例：北京大學醫(yī)學部馬大龍教授發(fā)表的文獻輸入：ma dl輸入：peking university高級檢索舉例：北京大學醫(yī)學部馬大龍教授發(fā)表的文獻5.

8、3 主題檢索n根據(jù)medline數(shù)據(jù)主題標引的規(guī)范性，利用主題詞進行的研究，對提高查全率、查準率會有相當?shù)膸椭?。點擊MeSH Database打開主題檢索界面高級檢索主題檢索基本檢索5.3 主題檢索主題檢索舉例：長春新堿（Vincristine ）治療白血病（leukemia）的文獻n分析該檢索課題，有2個概念：長春新堿（Vincristine ） 、白血?。╨eukemia）：n對長春新堿來說是利用其治療疾病，故其應組配副主題詞“治療應用（therapeutic use）”；n對白血病來說是利用藥物來治療，故其應組配副主題詞“藥物療法（drug therapy）”。n同時這兩個概念之間是AN

9、D的關系。主題檢索舉例：長春新堿（Vincristine ）治療白血病（leukemia）的文獻第1步：檢索長春新堿/治療應用主題檢索舉例：長春新堿（Vincristine ）治療白血?。╨eukemia）的文獻第1步：檢索長春新堿/治療應用主題檢索舉例：長春新堿（Vincristine ）治療白血?。╨eukemia）的文獻第1步：檢索長春新堿/治療應用副主題詞主題檢索舉例：長春新堿（Vincristine ）治療白血病（leukemia）的文獻第1步：檢索長春新堿/治療應用主題檢索舉例：長春新堿（Vincristine ）治療白血?。╨eukemia）的文獻第1步：檢索長春新堿/治療應用主

10、題檢索舉例：長春新堿（Vincristine ）治療白血?。╨eukemia）的文獻第2步：檢索白血病/藥物療法主題檢索舉例：長春新堿（Vincristine ）治療白血病（leukemia）的文獻第2步：檢索白血病/藥物療法主題檢索舉例：長春新堿（Vincristine ）治療白血?。╨eukemia）的文獻第2步：檢索白血病/藥物療法主題檢索舉例：長春新堿（Vincristine ）治療白血?。╨eukemia）的文獻第2步：檢索白血病/藥物療法主題檢索舉例：長春新堿（Vincristine ）治療白血?。╨eukemia）的文獻5.4 臨床咨詢和系統(tǒng)評價n可以使用戶方便快捷地檢索到有關臨

11、床方面的文獻，如臨床疾病的診斷、治療、病因和預后等；n也可以用它來檢索臨床實踐過程中遇到的一些具體問題，如系統(tǒng)性綜述、元分析、臨床試驗、循證醫(yī)學、實踐指導以及有關遺傳學方面的問題等。 5.4 臨床咨詢和系統(tǒng)評價臨床咨詢系統(tǒng)評價檢索醫(yī)學遺傳學研究方面的文獻6. 結果的顯示、打印、保存n顯示n保存、打印6.1 結果的顯示n顯示格式：系統(tǒng)提供的顯示格式很多，一般較常用的有以下4種：n（1）Summary：為默認顯示格式。顯示的信息包括文獻的標題、著者、出處、PMID、綜述出版類型、非英文文獻的原文語種等。n（2）Abstract：顯示信息除了文獻標題、著者、出處等基本信息外，還包括摘要信息，以便用戶

12、了解文獻詳細內容。n（3）MEDLINE：以MEDLINE數(shù)據(jù)庫的記錄格式來顯示檢索結果。字段內容主要包括PMID、題目、摘要、作者、作者地址、語種、出版類型、出處、MeSH、文獻ID、出版狀態(tài)等。6.1 結果的顯示6.1 結果的顯示6.1 結果的顯示n保存記錄n在“send to”下拉菜單中選擇“File”，可完成將記錄保存為文件。n選擇“E-mail”，則可將結果發(fā)送至郵箱。n在檢索結果顯示頁面可將某一次檢索的全部記錄或標記記錄保存；而“Clipboard”頁面可用于保存一次或多次檢索的結果記錄。6.2 檢索結果的保存 6.2 檢索結果的保存 6.2 檢索結果的保存 6.2 檢索結果的保存 7 其他輔助功能n7.1 檢索策略的存儲和調用n7.2 全文鏈接n7.3 相關文獻鏈接7.1 檢索策略的存儲和調用n使用My NCBI(Cubby)n首先要登記注冊n保存檢索策略（save search）n定期瀏覽新的檢索結果（注冊時設置，自動按照檢索式定期重新檢索出文章）7.2 全文鏈接-摘要格式顯示7.2 全文鏈接-打開單篇詳細頁面7.3 相關文獻鏈接7.3 相關文獻鏈接nEstrogen Receptorsngene polymorphismnCardiovascular diseasenOcular tuberculosis(副主題詞：并發(fā)癥)nBlindness（副