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文檔簡介

生物信息檢索與論文寫作復(fù)習(xí)思考2011年6月:1、 信息素養(yǎng)或素質(zhì)的具體內(nèi)容有那些? 信息素質(zhì)是指用戶在利用以計算機及其網(wǎng)絡(luò)技術(shù)為代表的現(xiàn)代科學(xué)技術(shù)進行知識學(xué)習(xí)、成長的過程中,逐步形成的制動參與信息活動、自覺應(yīng)用信息技術(shù)的意識、態(tài)度、理念及具備的獲取、識別、加工、處理、傳遞、創(chuàng)造信息的能力和利用信息去解決實踐問題的能力。它包括強烈的信息意識、系統(tǒng)化的信息理念、綜合信息能力等內(nèi)容。2、 信息、知識、情報、文獻的概念?文獻的組成要素? 信息的概念:1、信息是人們根據(jù)一定目的和需要,把從自然現(xiàn)象和社會現(xiàn)象中搜集的原始材料進行加工、處理,找出其中關(guān)系而形成的對象實體。 2、信息是有一定含義的、經(jīng)過加工處理的、對決策有價值的的數(shù)據(jù),即信息=數(shù)據(jù)+處理 3、信息是人們對數(shù)據(jù)進行系統(tǒng)組織、整理和分析,使其產(chǎn)生相關(guān)性,但沒有與特定用戶行動相關(guān)性的實體對象,信息可以被數(shù)字化。知識的概念:知識是指人們在認識世界、改造世界中所獲得的認知,包括通過閱讀、學(xué)習(xí)等方式的認知和通過自己或他人的歷練所積累的一切經(jīng)驗的總結(jié)。情報的概念:是被人們所利用的信息、被人們感受并可交流的信息。文獻的概念:是記錄有知識的一切載體。文獻的組成要素:不但包括現(xiàn)代圖書館的全部館藏,同時也包括了檔案館、博物館、聲像館和情報中心收藏的全部館藏。3、 信息、信息資源包括那些類型? 1)信息的類型:從產(chǎn)生信息的客體的性質(zhì)來分,可分為自然信息(瞬時發(fā)生的聲、光、熱、電、形形色色的天氣變化、緩慢的地殼運動、天體演化)、生物信息(生物為繁衍生存而表現(xiàn)出來的各種形態(tài)和行為,如遺傳信息、生物體內(nèi)信息交流、動物種群內(nèi)的信息交流)、機器信息(自動控制系統(tǒng))和(人類)社會信息。以信息所依附的載體為依據(jù),可分為文獻信息、口頭信息、電子信息、生物信息等信息資源類型:根據(jù)存儲媒介不同,信息資源可以劃分為印刷型信息資源、電子信息資源、數(shù)字信息資源和多媒體信息資源。4、文獻有那些類型?將文獻劃分成這些類型的依據(jù)是什么? 1)根據(jù)載體材料、存儲技術(shù)、和傳遞方式劃分可劃分為:印刷型、縮微型、試聽型和機讀型文獻信息源2)根據(jù)加工程度的不同劃分可分為:一次文獻信息源、二次文獻信息源、和三次文獻信息源3)根據(jù)文獻信息源的內(nèi)容劃分可以分為:圖書、期刊、報紙、科技報告、政府出版物、會議文獻、專利文獻、學(xué)位論文、標準文獻、檔案文獻、產(chǎn)品樣本 5、信息(文獻)檢索的方法與途徑,詳細論述檢索步驟? (1)、分析研究課題,明確檢索要求:分析課題的主要內(nèi)容、確定課題的文獻類型、確定檢索時間范圍、分析用戶的檢索評價要求(2)、選擇檢索工具:根據(jù)檢索課題的要求,選擇最能滿足檢索要求的檢索工具書,不同的資料類型就應(yīng)該選用不同的數(shù)據(jù)庫(3)、確定檢索策略:確定檢索途徑、制定檢索策略(4)、調(diào)整檢索方案:確定了具體的檢索方法之后,就要利用所用數(shù)據(jù)庫,在一定的年代范圍內(nèi)具體查找,以獲得文獻線索。用戶對每次檢索結(jié)果在作出判斷,并對檢索策略做出相應(yīng)的修改和調(diào)整,知道得到滿意的結(jié)果(5)、獲取原文:利用全文數(shù)據(jù)庫直接獲取,利用文獻傳遞系統(tǒng)獲取、利用文摘數(shù)據(jù)庫的原文服務(wù)、利用OPAC檢索系統(tǒng),進行館際互借。6、信息檢索策略有哪些,怎樣綜合使用它們?積木型策略:把檢索課題剖析成若干不同概念面,分別對它們檢索,并在各概念面中盡可能多地列舉同義詞、相關(guān)詞、近意詞,用布爾算符OR或聯(lián)結(jié)成子檢索式,再用布爾算苻AND或*把所有子檢索式聯(lián)結(jié)在一起,構(gòu)成總檢索式。優(yōu)點:提供較明確的檢索邏輯過程,容易理解執(zhí)行,適合復(fù)雜的多概念檢索課題。缺點:各概念面不是逐個加入檢索,而是一次性組配得到檢索結(jié)果,出現(xiàn)問題難確定原因在哪里,迅速有效地做出針對性改進。引文珠型增長策略:從已知的關(guān)于檢索問題的少數(shù)幾個專指詞開始檢索,以便至少撿出一篇命中文獻或一條相關(guān)信息,再審閱這批文獻,選出新的相關(guān)檢索詞,補充到檢索式中,查出新的命中結(jié)果。不斷重復(fù),直到找不到其他合適包含于本檢索式的附加詞為止。優(yōu)點:直接、靈活,能極大發(fā)揮人機交互的優(yōu)勢,使檢索詞選擇的有效性和針對性提高,有利于取得更理想的檢索結(jié)果。缺點:需審讀文獻,要較多的思考時間,需要有豐富的領(lǐng)域知識。逐次分餾策略:先確定一個相當(dāng)大、范圍較廣的檢索初始對象集合,再提高檢索的專指度,得到一個較小的命中結(jié)果集合;繼續(xù)提高檢索式的專指度,一步一步縮小命中結(jié)果集合,直到得到數(shù)量適宜、用戶滿意的結(jié)果為止。優(yōu)點:有利于保證檢索的全面性,如能在適當(dāng)?shù)臈l件下加以利用,可取得較高的查全率。缺點:比較耗時最專指面優(yōu)先策略:選擇從課題中最專指的概念面入手,瀏覽結(jié)果后如發(fā)現(xiàn)檢得的文獻已經(jīng)比較專指,通常就不需要把其他概念面加入到檢索式中去。若檢出的結(jié)果不夠?qū)V福賹⒐┻x擇用的其它概念面加入到檢索式中,以便獲得最高的查準率。在檢索中,應(yīng)根據(jù)課題的內(nèi)容特征、自身的領(lǐng)域知識優(yōu)劣以及對各種策略的使用熟悉程度來選擇不同策略:若所需的資料量較少,無特別的要求,最專指面優(yōu)先策略和逐次分餾策略比較常用;但若所需文獻量多,需深入全面了解,引文珠型增長策略就相對比較好用;積木型策略則適合概念復(fù)雜的課題,并且需要檢索者對此課題有一定理解并列舉出各種類的關(guān)鍵詞。幾種策略并不一定要分開使用,可根據(jù)情況相互結(jié)合嵌套,以發(fā)揮最大優(yōu)勢,即適合的才是最好的。7、 結(jié)合經(jīng)驗,怎樣利用圖書館數(shù)據(jù)庫找需要的中外文獻?從圖書館進入,選擇合適的文獻庫(學(xué)校內(nèi)的網(wǎng)絡(luò)可以直接登陸,校外網(wǎng)絡(luò)需要用學(xué)號密碼登陸),進入初級檢索,利用關(guān)鍵檢索詞尋找匹配文獻(如提名、關(guān)鍵字、主題或作者等)。若檢索出的文獻太多無法識別過濾,就使用高級檢索引擎,利用各種邏輯關(guān)系與關(guān)鍵詞的結(jié)合來尋找所需文獻,可以結(jié)合日期、學(xué)科等各種要素,結(jié)合不同手段、途徑、策略、程序一起查找。一般來說先輸入領(lǐng)域?qū)I(yè)方面關(guān)鍵詞,如認知發(fā)展或SDT等,然后在結(jié)果中進一步查找,比較容易擊中所需的東西。在搜索出的結(jié)果中,利用摘要、預(yù)覽等瀏覽模式,先大致了解這些文獻是否是自己需要的,然后再根據(jù)情況下載PDF、CAJ、txt等格式,論文類全文下載或期刊書本類部分下載。另外,在下載時最好將文件名改為標題-作者格式,一方面在后期查找比較方便,另一方面也防止在其它檢索庫找到相同文獻卻沒發(fā)現(xiàn)而重復(fù)下載。8、簡述“超星電子圖書館”、“書生之家數(shù)字圖書館”、“中國學(xué)術(shù)期刊全文數(shù)據(jù)庫”、“維普中文科技期刊數(shù)據(jù)庫”和“萬方數(shù)字化期刊”收藏資源的特點1)、超星電子圖書館:收錄的電子圖書內(nèi)容豐富,包括經(jīng)典理論、哲學(xué)、社科、經(jīng)濟、語言文字、文學(xué)、數(shù)理化、生物、工業(yè)技術(shù)、計算機等50余個學(xué)科門類,現(xiàn)擁有中文電子圖書80萬種,論文300萬篇,全文總量4億余業(yè),并且每天仍在不斷地更新與增加2)書生之家數(shù)字圖書館:主要收錄1999年以后出版的新書,其收錄量為每年中國出版的新書品種一半以上,目前擁有圖書15萬種,數(shù)量可觀,學(xué)科門類齊全。3)中國學(xué)術(shù)期刊全文數(shù)據(jù)庫:該庫的產(chǎn)品分為十大專輯:理工A、理工B、理工C、農(nóng)業(yè)、醫(yī)藥衛(wèi)生、文史哲、政治軍事與法律、教育與社會科學(xué)綜合、電子技術(shù)與信息科學(xué)、經(jīng)濟與管理。個專輯分為若干專題,共168個專題。4)維普中文科技期刊數(shù)據(jù)庫:按照中國圖書館分類法進行分類,所有文獻被分為8個專輯:社會科學(xué)、自然科學(xué)、工程技術(shù)、醫(yī)藥衛(wèi)生、農(nóng)業(yè)科學(xué)、經(jīng)濟管理、教育科學(xué)和圖書情報。8大專輯又被細分為36個專題 。5)萬方數(shù)字化期刊收藏資源的特點:目前集納了理、工、農(nóng)、醫(yī)、人文五大類70多個類目,2500多種科技類核心期刊,實現(xiàn)全文上網(wǎng)。該系統(tǒng)收錄的期刊種類主要有7個:基礎(chǔ)科學(xué)、農(nóng)業(yè)科學(xué)、社會科學(xué)、哲學(xué)政法、醫(yī)學(xué)衛(wèi)生、教科文藝、經(jīng)濟財政。9、結(jié)合“中國學(xué)術(shù)期刊全文數(shù)據(jù)庫”、“維普中文科技期刊數(shù)據(jù)庫”兩種數(shù)據(jù)庫,談各自的“高級檢索”的方法1)、維普中文科技期刊數(shù)據(jù)庫“高級檢索”的方法:打開維普數(shù)據(jù)庫,點擊高級檢索,輸入關(guān)鍵詞、作者、分類號、機構(gòu)、刊名,擴展檢索條件,如:時間條件、專業(yè)限制、期刊范圍,然后點擊檢索。2)、中國學(xué)術(shù)期刊全文數(shù)據(jù)庫“高級檢索”的方法:打開中國知網(wǎng),點擊高級檢索,進入中國學(xué)術(shù)期刊全文數(shù)據(jù)庫,輸入檢索控制條件,如:發(fā)表時間 來源期刊期刊年期 支持基金,然后輸入內(nèi)容檢索條件。10、簡要回答:三大檢索工具SCI,EI和ISTP的內(nèi)涵(1)、SCI ,即科學(xué)引文索引,是自然科學(xué)領(lǐng)域基礎(chǔ)理論學(xué)科方面的重要期刊文摘索引數(shù)據(jù)庫。它創(chuàng)建于1961 年,創(chuàng)始人為美國科學(xué)情報研究所所長 Eugene Garfield(1925.9.15).利用它,可以檢索數(shù)學(xué)、物理學(xué)、化學(xué)、天文學(xué)、生物學(xué)、醫(yī)學(xué)、農(nóng)業(yè)科學(xué)以及計算機科學(xué)、材料科學(xué)等學(xué)科方面自 1945 年以來重要的學(xué)術(shù)成果信息;SCI 還被國內(nèi)外學(xué)術(shù)界當(dāng)做制定學(xué)科發(fā)展規(guī)劃和進行學(xué)術(shù)排名的重要依據(jù)。(2)、Ei,即工程索引,創(chuàng)刊于 1884 年,由 Elsevier Engineering Information Inc. 編輯出版。主要收錄工程技術(shù)領(lǐng)域的論文(主要為科技期刊和會議錄論文 ) ,數(shù)據(jù)覆蓋了核技術(shù)、生物工程、交通運輸、化學(xué)和工藝工程、照明和光學(xué)技術(shù)、農(nóng)業(yè)工程和食品技術(shù)、計算機和數(shù)據(jù)處理、應(yīng)用物理、電子和通信、控制工程、土木工程、機械工程、材料工程、石油、宇航、汽車工程等學(xué)科領(lǐng)域。(3)、ISTP ,即科學(xué)技術(shù)會議錄索引,創(chuàng)刊于 1978 年,由美國科學(xué)情報研究所編制,主要收錄國際上著名的科技會議文獻。它所收錄的數(shù)據(jù)包括農(nóng)業(yè)、環(huán)境科學(xué)、生物化學(xué)、分子生物學(xué)、生物技術(shù)、醫(yī)學(xué)、工程、計算機科學(xué) 、化學(xué)、物理學(xué)等學(xué)科。從 1990-2003 年間, ISTP 和 ISSHP( 后文將要講到 ISSHP) 共收錄了 60 , 000 個會議的近 300 萬篇論文的信息。11、網(wǎng)絡(luò)NCBI提供檢索的服務(wù)包括哪些方面?12、學(xué)術(shù)論文一般由哪幾部分構(gòu)成?各部分的寫作規(guī)范分別是什么(1)、標題:準確、精煉的技術(shù)術(shù)語表達的創(chuàng)新點名稱(2)、單位和作者:只寫作者和實際參與了論文寫作的人名,按對論文而不是工作的貢獻排序。(3)、摘要:是論文不加注釋和評論的精煉縮寫,是一篇獨立的短文。(4)、關(guān)鍵詞:關(guān)鍵詞是表達論文所屬門類的主題詞。列出能通過模糊檢索查到這篇文章的38個主題詞。關(guān)鍵詞要反映研究范圍,但不一定是文中的高頻詞,排列最好按范圍,先大后小。關(guān)鍵詞忌生僻,最好出自中文主題詞表。(5)、引言:引言可以作為論文的一節(jié)(符號可以是0、可以是1),也可以是正文前的一段無標題文字。應(yīng)鮮明簡潔,不要圖表、公式。(6)、正文:正文要分節(jié),合理分節(jié)并擬定小標題可以突出重點,有助于理解。要盡量多用圖表直觀地表達,圖表要有自明性,使用中文表頭、坐標,無需解釋就能看懂。(7)、結(jié)論:全文而不僅是試驗或仿真的總結(jié)。歸納研究中發(fā)現(xiàn)的規(guī)律、優(yōu)點;應(yīng)用或應(yīng)用方向;局限或不足,今后努力方向。結(jié)論應(yīng)相對獨立,提到創(chuàng)新點時不應(yīng)使用“該方法”之類代用詞。不十分肯定時可用“討論”代替“結(jié)論”,但不得使用“結(jié)束語”、“小結(jié)”之類標題。結(jié)論中不應(yīng)有圖表、公式。(8)、參考文獻:列出作者在研究范圍內(nèi)所看過的國內(nèi)外文獻。參考文獻與引言呼應(yīng),反映作者跟蹤技術(shù)發(fā)展的眼界和敏銳性,反映作者知識的廣度和深度,反映作者有資格說自己是創(chuàng)新。數(shù)量不可過少,例如中國科協(xié)期刊優(yōu)秀論文評選要求研究性學(xué)術(shù)論文參考文獻不少于20篇。參考文獻不限于中文但,教科書不可多,不宜過陳舊。13、綜述性論文與實驗研究論文的特點與寫作要求綜述的特點:綜合性:綜述要縱橫交錯,既要以某一專題的發(fā)展為縱線,反映當(dāng)前課題的進展;又要從本單位、省內(nèi)、國內(nèi)到國外,進行橫的比較。只有如此,文章才會占有大量素材,經(jīng)過綜合分析、歸納整理、消化鑒別,使材料更精練、更明確、更有層次和更有邏輯,進而把握本專題發(fā)展規(guī)律和預(yù)測發(fā)展趨勢。評述性:是指比較專門地、全面地、深入地、系統(tǒng)地論述某一方面的問題,對所綜述的內(nèi)容進行綜合、分析、評價,反映作者的觀點和見解,并與綜述的內(nèi)容構(gòu)成整體。一般來說,綜述應(yīng)有作者的觀點,否則就不成為綜述,而是手冊或講座了。先進性:綜述不是寫學(xué)科發(fā)展的歷史,而是要搜集最新資料,獲取最新內(nèi)容,將最新的信息和科研動向及時傳遞給讀者。綜述不應(yīng)是材料的羅列,而是對親自閱讀和收集的材料,加以歸納、總結(jié),做出評論和估價。并由提供的文獻資料引出重要結(jié)論。一篇好的綜述,應(yīng)當(dāng)是既有觀點,又有事實,有骨又有肉的好文章。由于綜述是三次文獻,不同于原始論文(一次文獻),所以在引用材料方面,也可包括作者自己的實驗結(jié)果、未發(fā)表或待發(fā)表的新成果。綜述的內(nèi)容和形式靈活多樣,無嚴格的規(guī)定,篇幅大小不一,大的可以是幾十萬字甚至上百萬字的專著,參考文獻可數(shù)百篇乃至數(shù)千篇;小的可僅有千余字,參考文獻數(shù)篇。一般醫(yī)學(xué)期刊登載的多為30004000字,引文1520篇,一般不超過20篇,外文參考文獻不應(yīng)少于13。綜述的內(nèi)容要求選題要新:即所綜述的選題必須是近期該刊未曾刊載過的。一片綜述文章,若與已發(fā)表的綜述文章撞車,即選題與內(nèi)容基本一致,同一種期刊是不可能刊用的。說理要明:說理必須占有充分的資料,處處以事實為依據(jù),決不能異想天開地臆造數(shù)據(jù)和診斷,將自己的推測作為結(jié)論寫。層次要清:這就要求作者在寫作時思路要清,先寫什么,后寫什么,寫到什么程度,前后如何呼應(yīng),都要有一個統(tǒng)一的構(gòu)思。語言要美:科技文章以科學(xué)性為生命,但語不達義、晦澀坳口,結(jié)果必然阻礙了科技知識的交流。所以,在實際寫作中,應(yīng)不斷地加強漢語修辭、表達方面的訓(xùn)練。文獻要新:由于現(xiàn)在的綜述多為現(xiàn)狀綜述,所以在引用文獻中,70的應(yīng)為3年內(nèi)的文獻。參考文獻依引用先后次序排列在綜述文末,并將序號置入該論據(jù)(引文內(nèi)容)的右上角。引用文獻必須確實,以便讀者查閱參考。校者把關(guān):綜述寫成之后,要請有關(guān)專家審閱,從專業(yè)和文字方面進一步修改提高。這一步是必須的,因為作者往往有顧此失彼之誤,常注意了此一方而忽視了彼一方。有些結(jié)論往往是荒謬的,沒有恰到好處地反應(yīng)某一課題研究的真面目。這些問題經(jīng)過校閱往往可以得到解決。14、 簡述寫好一份大學(xué)生生物科學(xué)研究項目申請書的基本要求?(1) 、題目要新穎。要突出新思想、新概念、新構(gòu)思、新理論、新方法、新技術(shù);畫龍點睛要在題目中用關(guān)鍵詞點明擬研究項目的特色、創(chuàng)新,此關(guān)鍵詞應(yīng)是申請項目在該領(lǐng)域內(nèi)、國內(nèi)外最有學(xué)術(shù)價值的突破點、創(chuàng)新點和特色,此關(guān)鍵詞應(yīng)是申請書論證圍繞的中心。(2)、項目信息簡表。學(xué)科代碼的填寫:交叉學(xué)科項目應(yīng)注意填寫相關(guān)科學(xué)部學(xué)科代碼,鼓勵學(xué)科交叉;申報哪個學(xué)科是指主要研究內(nèi)容和突破點所在學(xué)科;合作單位:鼓勵國際國內(nèi)(企業(yè))合作研究;經(jīng)費預(yù)算:要盡可能細化、準確、實事求是;項目組主要成員:研究隊伍結(jié)構(gòu)合理(年齡、職務(wù)職稱)、精干(數(shù)量合理)。(3)、立項依據(jù):研究意義:研究背景、學(xué)術(shù)價值和應(yīng)用前景(應(yīng)用基礎(chǔ)研究應(yīng)突出工程中的關(guān)鍵科技問題);國內(nèi)外研究現(xiàn)狀及分析(Why) :圍繞主要研究內(nèi)容和可能的突破點,展開國內(nèi)外研究情況,論證創(chuàng)新點或研究特色。參考文獻:新的國內(nèi)外最有代表性的論文.(4)、研究內(nèi)容、目標、方案(What / How)。研究目標:有所創(chuàng)新的具體的理論及技術(shù)研究目標,而不僅是論文篇,研究生名等;研究內(nèi)容和擬解決的關(guān)鍵問題(難題):研究內(nèi)容應(yīng)盡可能細些,關(guān)鍵問題不可過多,35個為宜,應(yīng)緊緊圍繞可能的突破點展開;研究方案及可行性分析:要讓評審人在原理、方法上而不是具體工藝上了解你的方案和技術(shù)路線;創(chuàng)新性強的項目尤其要論證好可行性。(5)、項目特色與創(chuàng)新(保護創(chuàng)新)。源頭創(chuàng)新與跟蹤創(chuàng)新;原理創(chuàng)新、方法創(chuàng)新還是技術(shù)創(chuàng)新;特色/創(chuàng)新的表述:應(yīng)是國內(nèi)外研究現(xiàn)狀分析中特色/創(chuàng)新論述的提煉和概括;特色/創(chuàng)新的基礎(chǔ)和條件。(6)、年度計劃/預(yù)期研究成果。年度計劃盡可能細而具體些;理論成果及成果提交形式(論文/專著);方法/技術(shù)成果及成果提交形式(論文/專利/工藝/儀器/裝備原型);人才培養(yǎng)及成果提交形式. (7)、與其它項目的關(guān)系。與原完成的和正在承擔(dān)的基金項目的關(guān)系;與正在承擔(dān)的其它相關(guān)項目的關(guān)系;實事求是而充分填寫;闡明其特點(其它項目未做過的、在原來項目完成基礎(chǔ)上提出的、具有重要的學(xué)術(shù)意義和創(chuàng)新點的內(nèi)容)。(8)、申請者承擔(dān)基金項目的完成情況績效掛鉤。實事求是而充分填寫原承擔(dān)完成項目的情況(注意突出主要有顯示度的成果);必須按要求標注基金資助項目的成果(如:國家自然科學(xué)基金資助項目,資助號:50275136);所附代表性論文和其他成果一定要標注。(9)、附件。國際合作協(xié)議書(協(xié)議書視同一份同行評議);國內(nèi)合作協(xié)議書(制造技術(shù)基礎(chǔ)研究項目鼓勵與企業(yè)合作);國外專家參加項目的信件;發(fā)明專利附件;推薦信。(10)、結(jié)論。 命題要新:新思想、新概念、新構(gòu)思、新理論、新方法、新技術(shù);論述要清楚(why/what/ how) :Why立題意義、國內(nèi)外研究現(xiàn)狀及發(fā)展趨勢;What重要研究內(nèi)容/關(guān)鍵科學(xué)問題(難題)/主要創(chuàng)新點/預(yù)期成果;How研究方案/研究基礎(chǔ)及條件。 選好題。調(diào)查研究/結(jié)合實際/找到切入點(創(chuàng)新和特色);申請書是給評審專家看的,“Why/How/What”中, “Why”最重要;鼓勵交叉、保護創(chuàng)新、績效掛鉤、支持

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