軟件在醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)分析中的應(yīng)用

SAS軟件在醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)分析中的應(yīng)用,SAS軟件簡介,SAS是美國與西歐使用最為廣泛的三大著名統(tǒng)計(jì)分析軟件（SAS，SPSS和SYSTAT）之一，是目前國際上最為流行的一種大型統(tǒng)計(jì)分析系統(tǒng)，被譽(yù)為統(tǒng)計(jì)分析的標(biāo)準(zhǔn)軟件。是國際上公認(rèn)的最權(quán)威的統(tǒng)計(jì)軟件。 以苛刻嚴(yán)格著稱于世的美國FDA新藥審批程序中,新藥試驗(yàn)結(jié)果的統(tǒng)計(jì)分析規(guī)定只能用SAS進(jìn)行,其他軟件的計(jì)算結(jié)果一律無效!哪怕只是簡單的均數(shù)和標(biāo)準(zhǔn)差也不行!由此可見SAS的權(quán)威地位。 2004年開始中國新藥臨床試驗(yàn)結(jié)果規(guī)定應(yīng)用SAS軟件分析。,SAS與SPSS比較,作為統(tǒng)計(jì)軟件大家族里的“傻瓜相機(jī)” ，SPSS的功能是最弱的，但易用性排在所有統(tǒng)計(jì)軟件之首。 不過SPSS的易用性也極大的限制了它的功能和可擴(kuò)展性。除了SPSS本身的菜單提供的功能，用戶無法通過編程或者插件來擴(kuò)展它的功能，而且SPSS提供的都只是最基本的常用的方法。,SAS全球?qū)I(yè)認(rèn)證,SAS專業(yè)認(rèn)證是一項(xiàng)擁有極高國際聲譽(yù)的專業(yè)認(rèn)證，在歐美等國的職場上流行的一句話“If you have a SAS certification, You will never lose your job ”。 銷售模式：只租不售 （每5年一個(gè)周期） 財(cái)富500強(qiáng)中97%的企業(yè)都在使用SAS商業(yè)智能解決方案,2003年(301醫(yī)院與軍事醫(yī)科院博士生）各統(tǒng)計(jì)軟件使用情況,SAS窗口,PGM窗口（Program Editor)： 提供編寫SAS程序的文本編輯器 LOG窗口： 顯示執(zhí)行程序過程中的相關(guān)信息 OUTPUT窗口： 顯示程序運(yùn)行的結(jié)果 命令窗口與探索者窗口,SAS程序的編寫,一個(gè)完整的SAS程序一般由數(shù)據(jù)步（DATA步）和過程步（PROC步）兩部分組成。 DATA步以DATA語句開始，通過指定數(shù)據(jù)集名稱、定義變量名及類型和讀入數(shù)據(jù)等建立SAS數(shù)據(jù)集。 過程步以PROC語句開始，通過調(diào)用不同的分析模塊來分析SAS數(shù)據(jù)集。,其它格式的數(shù)據(jù)庫直接導(dǎo)入轉(zhuǎn)換： excel(.xls); dbase(.dbf); lotus(.wk)等 將數(shù)據(jù)讀入系統(tǒng)，建立數(shù)據(jù)集（直接輸入Editor窗口）。,SAS數(shù)據(jù)集建立,外部數(shù)據(jù)導(dǎo)入,例：有一批體檢數(shù)據(jù)，包括受檢者的姓名、性別、年齡、身高、體重信息。要求按性別分別計(jì)算身高、體重的描述性統(tǒng)計(jì)量：均值、標(biāo)準(zhǔn)差、最大值、最小值。 該數(shù)據(jù)以Excel.xls文件形式儲存。 文件名稱：tijiandata.xls,探索者窗口,在Editor 程序編輯窗口輸入源程序,數(shù)據(jù)步：將數(shù)據(jù)讀入系統(tǒng)，建立數(shù)據(jù)集 : DATA語句開始,后面加上數(shù)據(jù)庫的名字。 INPUT語句描述數(shù)據(jù)變量 , 用$表示變量是字符型 CARDS語句指示后面是數(shù)據(jù),每行為一個(gè)觀測數(shù)據(jù)，數(shù)據(jù)間無分號。 數(shù)據(jù)最后以“；”開頭的空行結(jié)束 。 每個(gè)語句都以“；”結(jié)束。,SAS程序數(shù)據(jù)步格式,Data ； Input $ .; Cards; . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ;,SAS過程步,對數(shù)據(jù)集中數(shù)據(jù)進(jìn)行分析、處理。 以PROC語句開始，調(diào)用SAS過程。 每個(gè)語句都以“；”結(jié)束。 整個(gè)程序最后要有RUN語句。,SAS程序的書寫格式,不分大小寫 單個(gè)名稱中不能空格，不同名稱間必須空格 一行可寫多條語句，用分號分割 一條語句可寫多行 數(shù)據(jù)行后不加分號，數(shù)據(jù)最后單獨(dú)加分號行 程序用“RUN；”語句結(jié)束,運(yùn)行SAS程序,方式一：鼠標(biāo)點(diǎn)擊執(zhí)行按鈕 方式二：按功能鍵“F8” 方式三：執(zhí)行菜單命令 RunSubmit 方式四：在命令框輸入SUBMIT 命令并執(zhí)行,SAS程序?qū)嵗?例子 某學(xué)生上學(xué)期8門課程的分?jǐn)?shù)分別為88，90，87，76，92，78，80，86。試用SAS編程求其平均分?jǐn)?shù)。 （1） 在PGM窗口鍵入下列程序 data fenshu; input chengji; cards; 88 90 87 76 92 78 80 86 ; proc means; var chengji; run; 過程步,數(shù)據(jù)步,查看結(jié)果 （output 窗口）,Analysis Variable : chengji N Mean Std Dev Minimum Maximum - 8 84.6250000 5.8782286 76.0000000 92.0000000 - 從結(jié)果看出，該學(xué)生上學(xué)期8門課程的平均成績?yōu)?4.625。,查看運(yùn)行過程及出錯(cuò)信息,激活LOG窗口( F6 ) 黑色文字：源程序及運(yùn)行情況 藍(lán)色文字：程序運(yùn)行情況的說明信息 紅色文字：出錯(cuò)信息 綠色文字：警告信息,保存SAS程序及其他窗口內(nèi)容,激活相應(yīng)窗口，然后選擇： 方式一：鼠標(biāo)點(diǎn)擊“存盤”工具按鈕 方式二：執(zhí)行菜單命令【File】【Save】/ 【Save as】 可保存程序、數(shù)據(jù)文件、運(yùn)行結(jié)果、日志等。 SAS保存成純文本格式文件（.txt)。,在SAS系統(tǒng)內(nèi)打開已保存的文件,只能在Program Edit窗口打開文件，選擇： 方式一：鼠標(biāo)點(diǎn)擊“打開”工具按鈕 方式二：執(zhí)行菜單命令【File】【Open】 可打開以前保存的程序、數(shù)據(jù)文件、運(yùn)行結(jié)果、日志等文件及其他文本格式的文件。,SAS程序主要關(guān)鍵詞,means; (n, mean, std, Q1, Q3, CV, median, clm) univariate normal; (正態(tài)性檢驗(yàn)，均數(shù)是否為0的 假設(shè)檢驗(yàn)：參數(shù)與非參數(shù)檢驗(yàn)） ttest; (兩個(gè)樣本均數(shù)比較的t檢驗(yàn)） anova; (各樣本含量相等的方差分析） glm; (各樣本含量不等的方差分析） npar1way; (非參數(shù)檢驗(yàn)） reg; (線性回歸方程：單元或多元） corr; (線性相關(guān)：線性相關(guān)或秩相關(guān)） freq; (卡方、Fisher檢驗(yàn)） logistic; (非線性回歸） lifetest; (生存分析）,proc,定量資料的描述性分析,分析結(jié)果,定量資料的正態(tài)性檢驗(yàn),正態(tài)性檢驗(yàn)結(jié)果,配對設(shè)計(jì)的t-test,為了比較兩種方法對乳酸飲料中脂肪的含量測定結(jié)果是否不同，隨機(jī)抽取了10份乳酸飲料制品，分別采用哥特里-羅紫法和脂肪酸水解法測定其結(jié)果，問兩種方法檢測結(jié)果是否不同？,成組設(shè)計(jì)資料的t-test,采用國產(chǎn)藥物和進(jìn)口藥物治療絕經(jīng)后婦女骨質(zhì)疏松癥，試比較兩種藥物的療效是否有差別,完全隨機(jī)設(shè)計(jì)資料的方差分析,方差齊性檢驗(yàn),四格表資料的2-test,某醫(yī)師欲比較胞磷膽堿與神經(jīng)節(jié)苷脂治療腦血管疾病的療效，將78例腦血管疾病患者隨機(jī)