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第八章蛋白質(zhì)分選與膜泡運輸?shù)谝还?jié)細胞內(nèi)蛋白質(zhì)的分選定義:依靠蛋白質(zhì)自身信號序列,從蛋白質(zhì)起始合成部位轉(zhuǎn)運到其功能發(fā)揮部位的過程。蛋白質(zhì)分選不僅保證了蛋白質(zhì)的正確定位,也保證了蛋白質(zhì)的生物學活性。一、信號假說與蛋白質(zhì)分選信號二、蛋白質(zhì)分選轉(zhuǎn)運的基本途徑與類型三、蛋白質(zhì)向線粒體、葉綠體和過氧化酶體的分選一、信號假說與蛋白質(zhì)分選信號信號假說(signalhypothesis):分泌蛋白可能攜帶N端短信號序列,一旦該序列從核糖體翻譯合成,結(jié)合因子和蛋白結(jié)合,指導其轉(zhuǎn)移到內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜,后續(xù)翻譯過程將在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜上進行。信號肽(signalpeptide):信號肽位于蛋白質(zhì)的N端,一般由16~26個氨基酸殘基組成,其中包括信號肽疏水核心區(qū)、N端和C端等3部分;原核細胞某些分泌性蛋白的N端也具有信號序列。信號肽的一級結(jié)構(gòu)序列信號識別顆粒(signalrecognitionparticle,SRP)信號識別顆粒的受體(又稱停泊蛋白,dockingprotein,DP):DP是內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜的整合蛋白,由α和β亞基組成,可特異地與SRP結(jié)合。信號肽酶(signalpeptidase):內(nèi)質(zhì)網(wǎng)腔面上蛋白水解酶,負責切除并快速降解新生多肽的N端信號肽序列。
分泌性蛋白的合成與跨越內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜的共翻譯轉(zhuǎn)運圖解共翻譯轉(zhuǎn)運(cotranslationaltranslocation):分泌蛋白向rER腔內(nèi)的轉(zhuǎn)運是同蛋白質(zhì)翻譯過程偶聯(lián)進行的,這種蛋白在信號肽引導下邊翻譯邊跨膜轉(zhuǎn)運的過程稱為共翻譯轉(zhuǎn)運。內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜整合蛋白的拓撲學類型STA:內(nèi)部停止轉(zhuǎn)移錨定序列SA:內(nèi)部信號錨定序列導肽(leaderpeptide)翻譯后轉(zhuǎn)運(post-translationaltranslocation)信號序列(signalsequence)信號斑(signalpatch)其他相關概念指導蛋白質(zhì)從細胞基質(zhì)轉(zhuǎn)運到細胞器的靶向序列的主要特征細胞內(nèi)膜泡運輸需要多種轉(zhuǎn)運膜泡參與,根據(jù)轉(zhuǎn)運膜泡表面包被蛋白的不同,主要分3種不同類型:核基因編碼的蛋白質(zhì)的分選大體可分2條途徑:膜泡運輸?shù)年P鍵步驟至少包括如下過程:(2)翻譯后轉(zhuǎn)運(post-translationaltranslocation)途徑COPⅠ包被膜泡介導的細胞內(nèi)膜泡逆向運輸,負責從高爾基體反面膜囊到順面膜囊以及從高爾基體順面管網(wǎng)狀區(qū)到內(nèi)質(zhì)網(wǎng)的膜泡轉(zhuǎn)運;(三)過氧化物酶體蛋白的分選三、COPⅠ包被膜泡的裝配與運輸③轉(zhuǎn)運膜泡與特定靶膜的錨定和融合。一是轉(zhuǎn)運膜泡將駐留蛋白有效排斥在外;二、蛋白質(zhì)分選轉(zhuǎn)運的基本途徑與類型③轉(zhuǎn)運膜泡與特定靶膜的錨定和融合。真核細胞蛋白質(zhì)分選的主要途徑與類型轉(zhuǎn)運到線粒體和過氧化物酶體的蛋白質(zhì)靠的是線粒體蛋白N端的導肽(leaderpeptide)或過氧化物酶體蛋白C端的靶向序列(targetingsequence)。信號識別顆粒(signalrecognitionparticle,SRP)二、蛋白質(zhì)分選轉(zhuǎn)運的基本途徑與類型二、蛋白質(zhì)分選轉(zhuǎn)運的基本途徑與類型
核基因編碼的蛋白質(zhì)的分選大體可分2條途徑:(1)共翻譯轉(zhuǎn)運(cotranslationaltranslocation)途徑:(2)翻譯后轉(zhuǎn)運(post-translationaltranslocation)途徑(2)可大大減少所需的遺傳物質(zhì)信息量;Sar1:一種調(diào)節(jié)膜泡轉(zhuǎn)運的小G蛋白,有一個共價結(jié)合的疏水N端脂基團,幫助其插入ER膜,同膜結(jié)合的Sar1對包被蛋白的進一步裝配起募集者作用。③轉(zhuǎn)運膜泡與特定靶膜的錨定和融合。細胞內(nèi)膜泡運輸需要多種轉(zhuǎn)運膜泡參與,根據(jù)轉(zhuǎn)運膜泡表面包被蛋白的不同,主要分3種不同類型:v-SNARE與t-SNARE蛋白的配對(互補性)是介導轉(zhuǎn)運膜泡與靶膜融合的主要機制:網(wǎng)格蛋白(A)、多角形網(wǎng)格包被結(jié)構(gòu)(B)及發(fā)動蛋白介導的網(wǎng)格蛋白/接頭蛋白包被膜泡的形成(C)示意圖定位到葉綠體的前體蛋白N端具有40~50個氨基酸組成的轉(zhuǎn)運肽(transitpeptide),用以指引多肽定位到葉綠體并進一步穿過葉綠體被膜進入基質(zhì)或類囊體中。信號肽(signalpeptide):信號肽位于蛋白質(zhì)的N端,一般由16~26個氨基酸殘基組成,其中包括信號肽疏水核心區(qū)、N端和C端等3部分;1、線粒體蛋白從細胞質(zhì)基質(zhì)輸入到線粒體基質(zhì)共翻譯轉(zhuǎn)運(cotranslationaltranslocation):分泌蛋白向rER腔內(nèi)的轉(zhuǎn)運是同蛋白質(zhì)翻譯過程偶聯(lián)進行的,這種蛋白在信號肽引導下邊翻譯邊跨膜轉(zhuǎn)運的過程稱為共翻譯轉(zhuǎn)運。COPⅠ包被膜泡介導逆向運輸。信號識別顆粒(signalrecognitionparticle,SRP)(3)選擇性門控轉(zhuǎn)運(gatedtransport):一是轉(zhuǎn)運膜泡將駐留蛋白有效排斥在外;五、轉(zhuǎn)運膜泡與靶膜的錨定和融合真核細胞蛋白質(zhì)分選的主要途徑與類型
左:共翻譯轉(zhuǎn)運右:翻譯后轉(zhuǎn)運根據(jù)蛋白質(zhì)分選的機制或轉(zhuǎn)運方式不同,又可將蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)運分為4類:
(1)跨膜轉(zhuǎn)運(transmembranetransport):
(2)膜泡運輸(vesiculartransport):
(3)選擇性門控轉(zhuǎn)運(gatedtransport):
(4)細胞質(zhì)基質(zhì)中蛋白質(zhì)的轉(zhuǎn)運:三、蛋白質(zhì)向線粒體、葉綠體和過氧化酶體的分選轉(zhuǎn)運到線粒體、葉綠體和過氧化物酶體等細胞器的蛋白質(zhì)分選是一個多步過程,需要多個不同的靶向序列(targetingsequence)。定位到葉綠體的前體蛋白N端具有40~50個氨基酸組成的轉(zhuǎn)運肽(transitpeptide),用以指引多肽定位到葉綠體并進一步穿過葉綠體被膜進入基質(zhì)或類囊體中。轉(zhuǎn)運到線粒體和過氧化物酶體的蛋白質(zhì)靠的是線粒體蛋白N端的導肽(leaderpeptide)或過氧化物酶體蛋白C端的靶向序列(targetingsequence)。網(wǎng)格蛋白/接頭蛋白包被膜泡介導蛋白質(zhì)從高爾基體TGN向胞內(nèi)體、溶酶體、分泌泡和植物細胞液泡的運輸,也參與質(zhì)膜受體介導的胞吞作用中從細胞表面運往胞內(nèi)體轉(zhuǎn)而到溶酶體的運輸。細胞內(nèi)膜泡運輸需要多種轉(zhuǎn)運膜泡參與,根據(jù)轉(zhuǎn)運膜泡表面包被蛋白的不同,主要分3種不同類型:是什么因素決定蛋白是否被保留在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)或進入高爾基體?信號識別顆粒(signalrecognitionparticle,SRP)二、COPⅡ包被膜泡的裝配與運輸核基因編碼的蛋白質(zhì)的分選大體可分2條途徑:在細胞的膜泡運輸中,糙面內(nèi)質(zhì)網(wǎng)相當于重要的物質(zhì)生產(chǎn)車間和供應站,而高爾基體是重要的樞紐和集散中心。膜泡運輸?shù)年P鍵步驟至少包括如下過程:(4)細胞結(jié)構(gòu)及結(jié)構(gòu)體系之間的組裝。三、COPⅠ包被膜泡的裝配與運輸(2)翻譯后轉(zhuǎn)運(post-translationaltranslocation)途徑Tic:內(nèi)膜轉(zhuǎn)運體復合物內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜整合蛋白的拓撲學類型(2)協(xié)助裝配(aided-assembly);(3)COPⅠ包被膜泡。(一)蛋白質(zhì)從細胞質(zhì)基質(zhì)輸入到線粒體1、線粒體蛋白從細胞質(zhì)基質(zhì)輸入到線粒體基質(zhì)2、線粒體蛋白以3種途徑從細胞質(zhì)基質(zhì)輸入到線粒體內(nèi)膜3、線粒體蛋白質(zhì)從細胞質(zhì)基質(zhì)輸入到線粒體膜間隙通過后翻譯轉(zhuǎn)運途徑對核基因編碼的線粒體蛋白的轉(zhuǎn)運A:線粒體蛋白從細胞質(zhì)基質(zhì)輸入到線粒體基質(zhì)B:線粒體蛋白通過3種途徑從細胞質(zhì)基質(zhì)輸入到線粒體內(nèi)膜C:線粒體蛋白通過2種途徑從細胞質(zhì)基質(zhì)輸入到線粒體膜間隙(二)葉綠體基質(zhì)蛋白與類囊體蛋白的靶向輸入通過翻譯后轉(zhuǎn)運途徑將葉綠體蛋白從細胞質(zhì)基質(zhì)輸入到類囊體腔Toc:外膜轉(zhuǎn)運體復合物Tic:內(nèi)膜轉(zhuǎn)運體復合物(三)過氧化物酶體蛋白的分選過氧化物酶體靶向信號(PTS):常見的C端PTS1(Ser-Lys-Leu)和少見的N端PTS2(Arg/Lys-Leu/Ile-5X-His/Gln-Leu)。過氧化物酶體靶向序列1(PTS1)指導的過氧化物酶體基質(zhì)蛋白的輸入第二節(jié)細胞內(nèi)膜泡運輸一、膜泡運輸概觀二、COPⅡ包被膜泡的裝配與運輸三、COPⅠ包被膜泡的裝配與運輸四、網(wǎng)格蛋白/接頭蛋白包被膜泡的裝配與運輸五、轉(zhuǎn)運膜泡與靶膜的錨定和融合六、細胞結(jié)構(gòu)體系的組裝一、膜泡運輸概觀
在細胞的膜泡運輸中,糙面內(nèi)質(zhì)網(wǎng)相當于重要的物質(zhì)生產(chǎn)車間和供應站,而高爾基體是重要的樞紐和集散中心。細胞內(nèi)膜泡運輸需要多種轉(zhuǎn)運膜泡參與,根據(jù)轉(zhuǎn)運膜泡表面包被蛋白的不同,主要分3種不同類型:(1)網(wǎng)格蛋白/接頭蛋白包被膜泡;(2)COP(包被蛋白)Ⅱ包被膜泡;(3)COPⅠ包被膜泡。蛋白質(zhì)的分泌與胞吞途徑概觀在細胞合成-分泌與內(nèi)吞途徑中3種不同的膜泡運輸方式COP(包被蛋白)Ⅱ包被膜泡介導順向運輸;COPⅠ包被膜泡介導逆向運輸。網(wǎng)格蛋白/接頭蛋白包被膜泡從TGN出芽和從質(zhì)膜內(nèi)化形成,脫包被后與晚期胞內(nèi)體融合蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)運中涉及的3種包被膜泡的特征比較二、COPⅡ包被膜泡的裝配與運輸Sar1:一種調(diào)節(jié)膜泡轉(zhuǎn)運的小G蛋白,有一個共價結(jié)合的疏水N端脂基團,幫助其插入ER膜,同膜結(jié)合的Sar1對包被蛋白的進一步裝配起募集者作用。COPⅡ(包被蛋白Ⅱ)包被膜泡介導的細胞內(nèi)順向運輸,即負責從內(nèi)質(zhì)網(wǎng)到高爾基體的物質(zhì)運輸。已知的指導蛋白質(zhì)包裝到特異性轉(zhuǎn)運膜泡的分選信號不同類型的膜泡運輸A:COPⅡ包被膜泡介導順向運輸和COPⅠ包被膜泡介導逆向運輸B:駐留蛋白的回收C:出芽與膜泡包裝三、COPⅠ包被膜泡的裝配與運輸COPⅠ包被膜泡介導的細胞內(nèi)膜泡逆向運輸,負責從高爾基體反面膜囊到順面膜囊以及從高爾基體順面管網(wǎng)狀區(qū)到內(nèi)質(zhì)網(wǎng)的膜泡轉(zhuǎn)運;
包括再循環(huán)的膜脂雙層、內(nèi)質(zhì)網(wǎng)駐留的可溶性蛋白和膜蛋白(如v-SNARE);
是內(nèi)質(zhì)網(wǎng)回收錯誤分選的逃逸蛋白返回內(nèi)質(zhì)網(wǎng)的重要途徑。是什么因素決定蛋白是否被保留在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)或進入高爾基體?
一是轉(zhuǎn)運膜泡將駐留蛋白有效排斥在外;
二是對逃逸蛋白的回收機制,使其返回它們正常駐留的部位。四、網(wǎng)格蛋白/接頭蛋白包被膜泡的裝配與運輸網(wǎng)格蛋白/接頭蛋白包被膜泡介導蛋白質(zhì)從高爾基體TGN向胞內(nèi)體、溶酶體、分泌泡和植物細胞液泡的運輸,也參與質(zhì)膜受體介導的胞吞作用中從細胞表面運往胞內(nèi)體轉(zhuǎn)而到溶酶體的運輸。網(wǎng)格蛋白(A)、多角形網(wǎng)格包被結(jié)構(gòu)(B)及發(fā)動蛋白介導的網(wǎng)格蛋白/接頭蛋白包被膜泡的形成(C)示意圖五、轉(zhuǎn)運膜泡與靶膜的錨定和融合膜泡運輸?shù)年P鍵步驟至少包括如下過程:①供體膜的出芽、裝配和斷裂,形成不同包被轉(zhuǎn)運膜泡;②在細胞內(nèi)由馬達蛋白驅(qū)動、以微管為軌道的膜泡運輸;③轉(zhuǎn)運膜泡與特定靶膜的錨定和融合。膜泡錨定與融合是一個耗能的特異性過程:其特異性是通過供體膜和靶膜上的蛋白相互作用完成的。小分子GTP結(jié)合蛋白Rab主要介導供體膜和靶膜的錨定:
Rab-GTP與特定轉(zhuǎn)運膜泡的表面蛋白相互作用,并通過類異戊二烯基團插入轉(zhuǎn)運膜泡內(nèi)。
一旦Rab-GTP被結(jié)合在膜泡表面,便與靶膜上的Rab效應器結(jié)合蛋白相互作用,從而使轉(zhuǎn)運膜泡被錨定在適當?shù)陌心ど稀-SNARE與t-SNARE蛋白的配對(互補性)是介導轉(zhuǎn)運膜泡與靶膜融合的主要機制:
在供體膜和靶膜之間膜泡的錨定與融合模式圖解如果說Rab蛋白主要是控制轉(zhuǎn)運膜泡與適當靶膜的錨定,那么,
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