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第八章蛋白質(zhì)分選與膜泡運(yùn)輸?shù)谝还?jié)細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)的分選定義:依靠蛋白質(zhì)自身信號(hào)序列,從蛋白質(zhì)起始合成部位轉(zhuǎn)運(yùn)到其功能發(fā)揮部位的過(guò)程。蛋白質(zhì)分選不僅保證了蛋白質(zhì)的正確定位,也保證了蛋白質(zhì)的生物學(xué)活性。一、信號(hào)假說(shuō)與蛋白質(zhì)分選信號(hào)二、蛋白質(zhì)分選轉(zhuǎn)運(yùn)的基本途徑與類型三、蛋白質(zhì)向線粒體、葉綠體和過(guò)氧化酶體的分選一、信號(hào)假說(shuō)與蛋白質(zhì)分選信號(hào)信號(hào)假說(shuō)(signalhypothesis):分泌蛋白可能攜帶N端短信號(hào)序列,一旦該序列從核糖體翻譯合成,結(jié)合因子和蛋白結(jié)合,指導(dǎo)其轉(zhuǎn)移到內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜,后續(xù)翻譯過(guò)程將在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜上進(jìn)行。信號(hào)肽(signalpeptide):信號(hào)肽位于蛋白質(zhì)的N端,一般由16~26個(gè)氨基酸殘基組成,其中包括信號(hào)肽疏水核心區(qū)、N端和C端等3部分;原核細(xì)胞某些分泌性蛋白的N端也具有信號(hào)序列。信號(hào)肽的一級(jí)結(jié)構(gòu)序列信號(hào)識(shí)別顆粒(signalrecognitionparticle,SRP)信號(hào)識(shí)別顆粒的受體(又稱停泊蛋白,dockingprotein,DP):DP是內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜的整合蛋白,由α和β亞基組成,可特異地與SRP結(jié)合。信號(hào)肽酶(signalpeptidase):內(nèi)質(zhì)網(wǎng)腔面上蛋白水解酶,負(fù)責(zé)切除并快速降解新生多肽的N端信號(hào)肽序列。
分泌性蛋白的合成與跨越內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜的共翻譯轉(zhuǎn)運(yùn)圖解共翻譯轉(zhuǎn)運(yùn)(cotranslationaltranslocation):分泌蛋白向rER腔內(nèi)的轉(zhuǎn)運(yùn)是同蛋白質(zhì)翻譯過(guò)程偶聯(lián)進(jìn)行的,這種蛋白在信號(hào)肽引導(dǎo)下邊翻譯邊跨膜轉(zhuǎn)運(yùn)的過(guò)程稱為共翻譯轉(zhuǎn)運(yùn)。內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜整合蛋白的拓?fù)鋵W(xué)類型STA:內(nèi)部停止轉(zhuǎn)移錨定序列SA:內(nèi)部信號(hào)錨定序列導(dǎo)肽(leaderpeptide)翻譯后轉(zhuǎn)運(yùn)(post-translationaltranslocation)信號(hào)序列(signalsequence)信號(hào)斑(signalpatch)其他相關(guān)概念指導(dǎo)蛋白質(zhì)從細(xì)胞基質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)到細(xì)胞器的靶向序列的主要特征細(xì)胞內(nèi)膜泡運(yùn)輸需要多種轉(zhuǎn)運(yùn)膜泡參與,根據(jù)轉(zhuǎn)運(yùn)膜泡表面包被蛋白的不同,主要分3種不同類型:核基因編碼的蛋白質(zhì)的分選大體可分2條途徑:膜泡運(yùn)輸?shù)年P(guān)鍵步驟至少包括如下過(guò)程:(2)翻譯后轉(zhuǎn)運(yùn)(post-translationaltranslocation)途徑COPⅠ包被膜泡介導(dǎo)的細(xì)胞內(nèi)膜泡逆向運(yùn)輸,負(fù)責(zé)從高爾基體反面膜囊到順面膜囊以及從高爾基體順面管網(wǎng)狀區(qū)到內(nèi)質(zhì)網(wǎng)的膜泡轉(zhuǎn)運(yùn);(三)過(guò)氧化物酶體蛋白的分選三、COPⅠ包被膜泡的裝配與運(yùn)輸③轉(zhuǎn)運(yùn)膜泡與特定靶膜的錨定和融合。一是轉(zhuǎn)運(yùn)膜泡將駐留蛋白有效排斥在外;二、蛋白質(zhì)分選轉(zhuǎn)運(yùn)的基本途徑與類型③轉(zhuǎn)運(yùn)膜泡與特定靶膜的錨定和融合。真核細(xì)胞蛋白質(zhì)分選的主要途徑與類型轉(zhuǎn)運(yùn)到線粒體和過(guò)氧化物酶體的蛋白質(zhì)靠的是線粒體蛋白N端的導(dǎo)肽(leaderpeptide)或過(guò)氧化物酶體蛋白C端的靶向序列(targetingsequence)。信號(hào)識(shí)別顆粒(signalrecognitionparticle,SRP)二、蛋白質(zhì)分選轉(zhuǎn)運(yùn)的基本途徑與類型二、蛋白質(zhì)分選轉(zhuǎn)運(yùn)的基本途徑與類型
核基因編碼的蛋白質(zhì)的分選大體可分2條途徑:(1)共翻譯轉(zhuǎn)運(yùn)(cotranslationaltranslocation)途徑:(2)翻譯后轉(zhuǎn)運(yùn)(post-translationaltranslocation)途徑(2)可大大減少所需的遺傳物質(zhì)信息量;Sar1:一種調(diào)節(jié)膜泡轉(zhuǎn)運(yùn)的小G蛋白,有一個(gè)共價(jià)結(jié)合的疏水N端脂基團(tuán),幫助其插入ER膜,同膜結(jié)合的Sar1對(duì)包被蛋白的進(jìn)一步裝配起募集者作用。③轉(zhuǎn)運(yùn)膜泡與特定靶膜的錨定和融合。細(xì)胞內(nèi)膜泡運(yùn)輸需要多種轉(zhuǎn)運(yùn)膜泡參與,根據(jù)轉(zhuǎn)運(yùn)膜泡表面包被蛋白的不同,主要分3種不同類型:v-SNARE與t-SNARE蛋白的配對(duì)(互補(bǔ)性)是介導(dǎo)轉(zhuǎn)運(yùn)膜泡與靶膜融合的主要機(jī)制:網(wǎng)格蛋白(A)、多角形網(wǎng)格包被結(jié)構(gòu)(B)及發(fā)動(dòng)蛋白介導(dǎo)的網(wǎng)格蛋白/接頭蛋白包被膜泡的形成(C)示意圖定位到葉綠體的前體蛋白N端具有40~50個(gè)氨基酸組成的轉(zhuǎn)運(yùn)肽(transitpeptide),用以指引多肽定位到葉綠體并進(jìn)一步穿過(guò)葉綠體被膜進(jìn)入基質(zhì)或類囊體中。信號(hào)肽(signalpeptide):信號(hào)肽位于蛋白質(zhì)的N端,一般由16~26個(gè)氨基酸殘基組成,其中包括信號(hào)肽疏水核心區(qū)、N端和C端等3部分;1、線粒體蛋白從細(xì)胞質(zhì)基質(zhì)輸入到線粒體基質(zhì)共翻譯轉(zhuǎn)運(yùn)(cotranslationaltranslocation):分泌蛋白向rER腔內(nèi)的轉(zhuǎn)運(yùn)是同蛋白質(zhì)翻譯過(guò)程偶聯(lián)進(jìn)行的,這種蛋白在信號(hào)肽引導(dǎo)下邊翻譯邊跨膜轉(zhuǎn)運(yùn)的過(guò)程稱為共翻譯轉(zhuǎn)運(yùn)。COPⅠ包被膜泡介導(dǎo)逆向運(yùn)輸。信號(hào)識(shí)別顆粒(signalrecognitionparticle,SRP)(3)選擇性門控轉(zhuǎn)運(yùn)(gatedtransport):一是轉(zhuǎn)運(yùn)膜泡將駐留蛋白有效排斥在外;五、轉(zhuǎn)運(yùn)膜泡與靶膜的錨定和融合真核細(xì)胞蛋白質(zhì)分選的主要途徑與類型
左:共翻譯轉(zhuǎn)運(yùn)右:翻譯后轉(zhuǎn)運(yùn)根據(jù)蛋白質(zhì)分選的機(jī)制或轉(zhuǎn)運(yùn)方式不同,又可將蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)分為4類:
(1)跨膜轉(zhuǎn)運(yùn)(transmembranetransport):
(2)膜泡運(yùn)輸(vesiculartransport):
(3)選擇性門控轉(zhuǎn)運(yùn)(gatedtransport):
(4)細(xì)胞質(zhì)基質(zhì)中蛋白質(zhì)的轉(zhuǎn)運(yùn):三、蛋白質(zhì)向線粒體、葉綠體和過(guò)氧化酶體的分選轉(zhuǎn)運(yùn)到線粒體、葉綠體和過(guò)氧化物酶體等細(xì)胞器的蛋白質(zhì)分選是一個(gè)多步過(guò)程,需要多個(gè)不同的靶向序列(targetingsequence)。定位到葉綠體的前體蛋白N端具有40~50個(gè)氨基酸組成的轉(zhuǎn)運(yùn)肽(transitpeptide),用以指引多肽定位到葉綠體并進(jìn)一步穿過(guò)葉綠體被膜進(jìn)入基質(zhì)或類囊體中。轉(zhuǎn)運(yùn)到線粒體和過(guò)氧化物酶體的蛋白質(zhì)靠的是線粒體蛋白N端的導(dǎo)肽(leaderpeptide)或過(guò)氧化物酶體蛋白C端的靶向序列(targetingsequence)。網(wǎng)格蛋白/接頭蛋白包被膜泡介導(dǎo)蛋白質(zhì)從高爾基體TGN向胞內(nèi)體、溶酶體、分泌泡和植物細(xì)胞液泡的運(yùn)輸,也參與質(zhì)膜受體介導(dǎo)的胞吞作用中從細(xì)胞表面運(yùn)往胞內(nèi)體轉(zhuǎn)而到溶酶體的運(yùn)輸。細(xì)胞內(nèi)膜泡運(yùn)輸需要多種轉(zhuǎn)運(yùn)膜泡參與,根據(jù)轉(zhuǎn)運(yùn)膜泡表面包被蛋白的不同,主要分3種不同類型:是什么因素決定蛋白是否被保留在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)或進(jìn)入高爾基體?信號(hào)識(shí)別顆粒(signalrecognitionparticle,SRP)二、COPⅡ包被膜泡的裝配與運(yùn)輸核基因編碼的蛋白質(zhì)的分選大體可分2條途徑:在細(xì)胞的膜泡運(yùn)輸中,糙面內(nèi)質(zhì)網(wǎng)相當(dāng)于重要的物質(zhì)生產(chǎn)車間和供應(yīng)站,而高爾基體是重要的樞紐和集散中心。膜泡運(yùn)輸?shù)年P(guān)鍵步驟至少包括如下過(guò)程:(4)細(xì)胞結(jié)構(gòu)及結(jié)構(gòu)體系之間的組裝。三、COPⅠ包被膜泡的裝配與運(yùn)輸(2)翻譯后轉(zhuǎn)運(yùn)(post-translationaltranslocation)途徑Tic:內(nèi)膜轉(zhuǎn)運(yùn)體復(fù)合物內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜整合蛋白的拓?fù)鋵W(xué)類型(2)協(xié)助裝配(aided-assembly);(3)COPⅠ包被膜泡。(一)蛋白質(zhì)從細(xì)胞質(zhì)基質(zhì)輸入到線粒體1、線粒體蛋白從細(xì)胞質(zhì)基質(zhì)輸入到線粒體基質(zhì)2、線粒體蛋白以3種途徑從細(xì)胞質(zhì)基質(zhì)輸入到線粒體內(nèi)膜3、線粒體蛋白質(zhì)從細(xì)胞質(zhì)基質(zhì)輸入到線粒體膜間隙通過(guò)后翻譯轉(zhuǎn)運(yùn)途徑對(duì)核基因編碼的線粒體蛋白的轉(zhuǎn)運(yùn)A:線粒體蛋白從細(xì)胞質(zhì)基質(zhì)輸入到線粒體基質(zhì)B:線粒體蛋白通過(guò)3種途徑從細(xì)胞質(zhì)基質(zhì)輸入到線粒體內(nèi)膜C:線粒體蛋白通過(guò)2種途徑從細(xì)胞質(zhì)基質(zhì)輸入到線粒體膜間隙(二)葉綠體基質(zhì)蛋白與類囊體蛋白的靶向輸入通過(guò)翻譯后轉(zhuǎn)運(yùn)途徑將葉綠體蛋白從細(xì)胞質(zhì)基質(zhì)輸入到類囊體腔Toc:外膜轉(zhuǎn)運(yùn)體復(fù)合物Tic:內(nèi)膜轉(zhuǎn)運(yùn)體復(fù)合物(三)過(guò)氧化物酶體蛋白的分選過(guò)氧化物酶體靶向信號(hào)(PTS):常見(jiàn)的C端PTS1(Ser-Lys-Leu)和少見(jiàn)的N端PTS2(Arg/Lys-Leu/Ile-5X-His/Gln-Leu)。過(guò)氧化物酶體靶向序列1(PTS1)指導(dǎo)的過(guò)氧化物酶體基質(zhì)蛋白的輸入第二節(jié)細(xì)胞內(nèi)膜泡運(yùn)輸一、膜泡運(yùn)輸概觀二、COPⅡ包被膜泡的裝配與運(yùn)輸三、COPⅠ包被膜泡的裝配與運(yùn)輸四、網(wǎng)格蛋白/接頭蛋白包被膜泡的裝配與運(yùn)輸五、轉(zhuǎn)運(yùn)膜泡與靶膜的錨定和融合六、細(xì)胞結(jié)構(gòu)體系的組裝一、膜泡運(yùn)輸概觀
在細(xì)胞的膜泡運(yùn)輸中,糙面內(nèi)質(zhì)網(wǎng)相當(dāng)于重要的物質(zhì)生產(chǎn)車間和供應(yīng)站,而高爾基體是重要的樞紐和集散中心。細(xì)胞內(nèi)膜泡運(yùn)輸需要多種轉(zhuǎn)運(yùn)膜泡參與,根據(jù)轉(zhuǎn)運(yùn)膜泡表面包被蛋白的不同,主要分3種不同類型:(1)網(wǎng)格蛋白/接頭蛋白包被膜泡;(2)COP(包被蛋白)Ⅱ包被膜泡;(3)COPⅠ包被膜泡。蛋白質(zhì)的分泌與胞吞途徑概觀在細(xì)胞合成-分泌與內(nèi)吞途徑中3種不同的膜泡運(yùn)輸方式COP(包被蛋白)Ⅱ包被膜泡介導(dǎo)順向運(yùn)輸;COPⅠ包被膜泡介導(dǎo)逆向運(yùn)輸。網(wǎng)格蛋白/接頭蛋白包被膜泡從TGN出芽和從質(zhì)膜內(nèi)化形成,脫包被后與晚期胞內(nèi)體融合蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)中涉及的3種包被膜泡的特征比較二、COPⅡ包被膜泡的裝配與運(yùn)輸Sar1:一種調(diào)節(jié)膜泡轉(zhuǎn)運(yùn)的小G蛋白,有一個(gè)共價(jià)結(jié)合的疏水N端脂基團(tuán),幫助其插入ER膜,同膜結(jié)合的Sar1對(duì)包被蛋白的進(jìn)一步裝配起募集者作用。COPⅡ(包被蛋白Ⅱ)包被膜泡介導(dǎo)的細(xì)胞內(nèi)順向運(yùn)輸,即負(fù)責(zé)從內(nèi)質(zhì)網(wǎng)到高爾基體的物質(zhì)運(yùn)輸。已知的指導(dǎo)蛋白質(zhì)包裝到特異性轉(zhuǎn)運(yùn)膜泡的分選信號(hào)不同類型的膜泡運(yùn)輸A:COPⅡ包被膜泡介導(dǎo)順向運(yùn)輸和COPⅠ包被膜泡介導(dǎo)逆向運(yùn)輸B:駐留蛋白的回收C:出芽與膜泡包裝三、COPⅠ包被膜泡的裝配與運(yùn)輸COPⅠ包被膜泡介導(dǎo)的細(xì)胞內(nèi)膜泡逆向運(yùn)輸,負(fù)責(zé)從高爾基體反面膜囊到順面膜囊以及從高爾基體順面管網(wǎng)狀區(qū)到內(nèi)質(zhì)網(wǎng)的膜泡轉(zhuǎn)運(yùn);
包括再循環(huán)的膜脂雙層、內(nèi)質(zhì)網(wǎng)駐留的可溶性蛋白和膜蛋白(如v-SNARE);
是內(nèi)質(zhì)網(wǎng)回收錯(cuò)誤分選的逃逸蛋白返回內(nèi)質(zhì)網(wǎng)的重要途徑。是什么因素決定蛋白是否被保留在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)或進(jìn)入高爾基體?
一是轉(zhuǎn)運(yùn)膜泡將駐留蛋白有效排斥在外;
二是對(duì)逃逸蛋白的回收機(jī)制,使其返回它們正常駐留的部位。四、網(wǎng)格蛋白/接頭蛋白包被膜泡的裝配與運(yùn)輸網(wǎng)格蛋白/接頭蛋白包被膜泡介導(dǎo)蛋白質(zhì)從高爾基體TGN向胞內(nèi)體、溶酶體、分泌泡和植物細(xì)胞液泡的運(yùn)輸,也參與質(zhì)膜受體介導(dǎo)的胞吞作用中從細(xì)胞表面運(yùn)往胞內(nèi)體轉(zhuǎn)而到溶酶體的運(yùn)輸。網(wǎng)格蛋白(A)、多角形網(wǎng)格包被結(jié)構(gòu)(B)及發(fā)動(dòng)蛋白介導(dǎo)的網(wǎng)格蛋白/接頭蛋白包被膜泡的形成(C)示意圖五、轉(zhuǎn)運(yùn)膜泡與靶膜的錨定和融合膜泡運(yùn)輸?shù)年P(guān)鍵步驟至少包括如下過(guò)程:①供體膜的出芽、裝配和斷裂,形成不同包被轉(zhuǎn)運(yùn)膜泡;②在細(xì)胞內(nèi)由馬達(dá)蛋白驅(qū)動(dòng)、以微管為軌道的膜泡運(yùn)輸;③轉(zhuǎn)運(yùn)膜泡與特定靶膜的錨定和融合。膜泡錨定與融合是一個(gè)耗能的特異性過(guò)程:其特異性是通過(guò)供體膜和靶膜上的蛋白相互作用完成的。小分子GTP結(jié)合蛋白R(shí)ab主要介導(dǎo)供體膜和靶膜的錨定:
Rab-GTP與特定轉(zhuǎn)運(yùn)膜泡的表面蛋白相互作用,并通過(guò)類異戊二烯基團(tuán)插入轉(zhuǎn)運(yùn)膜泡內(nèi)。
一旦Rab-GTP被結(jié)合在膜泡表面,便與靶膜上的Rab效應(yīng)器結(jié)合蛋白相互作用,從而使轉(zhuǎn)運(yùn)膜泡被錨定在適當(dāng)?shù)陌心ど稀-SNARE與t-SNARE蛋白的配對(duì)(互補(bǔ)性)是介導(dǎo)轉(zhuǎn)運(yùn)膜泡與靶膜融合的主要機(jī)制:
在供體膜和靶膜之間膜泡的錨定與融合模式圖解如果說(shuō)Rab蛋白主要是控制轉(zhuǎn)運(yùn)膜泡與適當(dāng)靶膜的錨定,那么,
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