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第十四章
核酸的生物合成Nucleicacidbiosynthesis目的要求:掌握:DNA生物合成的概念、基本過程、特點(diǎn)及其生物學(xué)意義;RNA生物合成的概念、基本過程與特點(diǎn)。了解:逆轉(zhuǎn)錄現(xiàn)象及其意義;DNA損傷(突變)與修復(fù);真核生物轉(zhuǎn)錄后的加工和修飾。本章主要內(nèi)容DNA的生物合成RNA的生物合成復(fù)制蛋白質(zhì)逆轉(zhuǎn)錄DNA復(fù)制翻譯RNA中心法則(centraldogma)遺傳信息傳遞的規(guī)律轉(zhuǎn)錄基因表達(dá):
是指將遺傳信息由DNA轉(zhuǎn)錄為RNA、再翻譯成蛋白質(zhì)的過程。第一節(jié)DNA的生物合成
(復(fù)制)半保留復(fù)制(semiconservativereplication)從復(fù)制起點(diǎn)雙向復(fù)制半不連續(xù)復(fù)制一、復(fù)制(replication)(一)DNA復(fù)制的基本特征
以親代DNA分子為模板合成子代DNA分子,從從而將遺傳信息準(zhǔn)確傳遞到子代DNA分子的過程。半保留復(fù)制
復(fù)制時(shí),親代母鏈解開的兩單鏈均作為模板,按堿基互補(bǔ)配對(duì)原則指導(dǎo)合成一股新互補(bǔ)子鏈,最終得到與親代母鏈堿基序列完全一致的兩個(gè)子代DNA分子,每個(gè)子代DNA分子中都含有一股從親代完整接受過
來的單鏈,另一股單鏈完全是重新合成的,這種復(fù)制方式為半保留復(fù)制。AGAACTTAGTCTTGAATCAGAACTTAGTCTTGAATCAGAACTTAGTCTTGAATC親代子代半保留復(fù)制的實(shí)驗(yàn)依據(jù)同位素示蹤法CsCl密度梯度平衡離心法
從復(fù)制起點(diǎn)向兩個(gè)相反方向解鏈進(jìn)行的雙向復(fù)制雙向復(fù)制3′5′5′3′復(fù)制叉復(fù)制叉復(fù)制起點(diǎn)(origin)
origin前導(dǎo)鏈(leadingstrand)后隨鏈(laggingstrand)半不連續(xù)復(fù)制
(semidiscontinousreplication)岡崎片段(okazakifragment)3
5
3
5
解鏈方向3′5′3′3′5′5′新生互補(bǔ)子鏈的合成方向與模板解鏈方向相同時(shí),合成是連續(xù)進(jìn)行的,這股新生互補(bǔ)子鏈稱為前導(dǎo)鏈(領(lǐng)頭鏈);合成方向與模板解鏈方向相反時(shí),合成是不連續(xù)進(jìn)行的,這股新生互補(bǔ)子鏈稱為后隨鏈(隨從鏈);分段合成的片段稱為岡崎片段。
3
5
3
5
解鏈方向3′5′3′3′5′前導(dǎo)鏈(leadingstrand)后隨鏈(laggingstrand)岡崎片段(okazakifragment)
前導(dǎo)鏈連續(xù)復(fù)制而后隨鏈不連續(xù)復(fù)制
—復(fù)制的半不連續(xù)性
在雙向復(fù)制一條全長(zhǎng)的新生互補(bǔ)子鏈時(shí),在
復(fù)制起點(diǎn)一側(cè)的合成是以領(lǐng)頭鏈的方式連續(xù)合成,
在另一側(cè)則以隨從鏈的方式不連續(xù)合成,所以整個(gè)DNA分子的復(fù)制是全不連續(xù)的。模板(template):
DNA母鏈中的兩單鏈;底物(substrate):
dNTP(dATP,dGTP,dCTP,dTTP);引物(primer):一小段RNA鏈,其提供的3
-OH末端
能引導(dǎo)dNTP聚合;酶類:(二)參與DNA復(fù)制的物質(zhì)1、DNA聚合酶(DNApolymerase)
簡(jiǎn)寫為DNA-pol
DNA聚合酶的作用特點(diǎn):⑴5
3
的聚合活性,催化底物dNTP
(dATP、dGTP、dCTP、dTTP)與模板鏈結(jié)合;⑵形成3
,5
磷酸二酯鍵;
⑶使新生互補(bǔ)子鏈按5
→3
方向延長(zhǎng);
⑷3
5
核酸外切酶活性;
⑸5
3
核酸外切酶活性及切口平移能力。。參與DNA復(fù)制的主要酶類即時(shí)校讀:當(dāng)DNA復(fù)制出現(xiàn)堿基配對(duì)錯(cuò)誤時(shí),DNA聚合酶利用3
→5
外切酶活性切除錯(cuò)配堿基,并利用5
→3
聚合酶活性回補(bǔ)正確堿基與模板配對(duì)。DNA復(fù)制高度穩(wěn)定性和保真性的機(jī)制
DNA模板指導(dǎo)下正確選擇配對(duì)的堿基校讀功能原核生物的DNA聚合酶
DNA-pol
Ⅰ
DNA-pol
Ⅱ
DNA-pol
Ⅲ真核生物的DNA聚合酶
DNA-pol
DNA-pol
DNA-pol
DNA-pol
DNA-pol
DNA聚合酶
DNA-polⅡ:
DNA-pol
Ⅲ:DNA-pol
/
:
DNA-pol
:切除引物并填補(bǔ)缺口,具有切口平移作用,參與DNA修復(fù)校正;
DNA-pol
Ⅰ:DNA-polβ/ε:復(fù)制線粒體DNA。無酶Ⅰ、Ⅲ時(shí)起作用,參與DNA修復(fù);延長(zhǎng)新生互補(bǔ)子鏈;2、解旋、解鏈酶類解旋酶(helicase)
作用于氫鍵,使DNA雙鏈解開成兩股單鏈,需消耗ATP;
DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶(topoisomerase)松弛DNA雙、超螺旋,克服打結(jié)、纏繞和連環(huán)現(xiàn)象。解鏈過程中易形成正超螺旋單鏈DNA結(jié)合蛋白(single-strandedDNA-bindingprotein)
維持復(fù)制時(shí)模板處于單鏈狀態(tài)并保護(hù)復(fù)制中的
DNA模板單鏈不被核酸酶降解。前導(dǎo)鏈解鏈酶
DNA拓樸異構(gòu)酶單鏈DNA結(jié)合蛋白
SSB解開、理順DNA鏈、維持DNA單鏈狀3、引物酶(primase):特殊的RNA聚合酶。引物酶可在復(fù)制初期催化合成一小段RNA引物;
引發(fā)體:解旋酶聯(lián)合其他復(fù)制因子在局部解鏈區(qū)形成引發(fā)前體后繼續(xù)向前解鏈,引物酶在解開的DNA模板單鏈上的某一部位與
引發(fā)前體構(gòu)成引發(fā)體時(shí),能催化一段RNA引物合成,其3
-OH末端可供
dNTP加入時(shí)連接之用。HO5
3
3
5
DNA連接酶ATPADP5
3
5
3
4、DNA連接酶(DNAligase)通過3
,5
-磷酸二酯鍵連接互補(bǔ)鏈中DNA片段;H(三)DNA的復(fù)制過程:起始、延長(zhǎng)、終止1、模板DNA解旋與解鏈,形成復(fù)制叉;起始:2、引發(fā)階段:引發(fā)體在解開的模板DNA單鏈上的某一部位合成一小段RNA引物;例:原核生物DNA的合成過程前導(dǎo)鏈:后隨鏈:在Tus蛋白(terminusutilizationsubstance)參與下,終止復(fù)制。1、按A=T、G≡C堿基配對(duì)規(guī)則,合成新生DNA互補(bǔ)子鏈或?qū)槠?;2、切除引物、填補(bǔ)缺口;3、DNA連接酶連接切口,形成長(zhǎng)鏈DNA。延長(zhǎng):DNA的合成終止:DNA復(fù)制示意圖拓?fù)洚悩?gòu)酶解旋酶5′3′3′5′3′5′DNA聚合酶Ⅲ單鏈結(jié)合蛋白DNA聚合酶Ⅰ前導(dǎo)鏈
后隨鏈DNA連接酶岡崎片段引物酶二、DNA復(fù)制與端粒(telomere)、端粒酶(telomerase)端粒:
是由蛋白質(zhì)和DNA緊密結(jié)合、膨大的特殊結(jié)構(gòu);端粒酶:是一種自身攜帶模板RNA的逆轉(zhuǎn)錄酶。端粒酶合成端粒的爬行模式CUAGCCAAAACCCCAAAACAAA3’5’DNA5’----TTTTGGGGTTTTG-OH(3’)3’----端粒酶的結(jié)合CUAGCCAAAACCCCAAAACAAA3’5’DNA5’----TTTTGGGGTTTTGGGGTTTT3’----G-OH(3’)延長(zhǎng)合成CUAGCCAAAACCCCAAAACAAA3’5’DNA5’----TTTTGGGGTTTTGGGGTTTTG-OH(3’)3’----端粒酶移位進(jìn)一步的聚合作用端粒酶的特殊生物學(xué)功能:1、端粒的長(zhǎng)度和端粒酶活性與遺傳信息的穩(wěn)定性;2、端粒的長(zhǎng)度和端粒酶活性與細(xì)胞壽命和細(xì)胞衰老有關(guān);3、端粒酶活性與腫瘤的關(guān)系。三、逆轉(zhuǎn)錄(reversetranscription)概念:以RNA為模板合成DNA的過程。依賴RNA的DNA聚合酶功能;
RNaseH功能(水解RNA-DNA雜交鏈);依賴DNA的DNA聚合酶功能;無3
→5
和5
→3
核酸外切酶活性,無較對(duì)功能。酶:逆轉(zhuǎn)錄酶RNA病毒+----------------------------------------宿主細(xì)胞DNA分子cDNA插入宿主細(xì)胞DNA分子中------------------------------------------------------------------------被整合的宿主細(xì)胞逆轉(zhuǎn)錄酶----------------------------------------RNA-cDNA
雜交體單鏈cDNARNaseH----------------------------------------雙鏈cDNA逆轉(zhuǎn)錄酶意義:對(duì)中心法則的補(bǔ)充;有助于基因工程的實(shí)施。逆轉(zhuǎn)錄過程HIV生活史1、進(jìn)入宿主細(xì)胞
2、逆轉(zhuǎn)錄及cDNA合成3、整合4、轉(zhuǎn)錄5、翻譯6、裝配四、DNA損傷(基因突變)與修復(fù)突變自發(fā)突變(spontaneousmutation)人工誘變(inducedmutation)(一)引起人工突變的因素物理因素:紫外線、各種輻射;化學(xué)因素:亞硝酸鹽、烷化劑、芳香烴類;生物因素:RNA病毒和DNA病毒等。DNA鏈上兩個(gè)相鄰胸腺嘧啶間形成二聚體(二)損傷的類型點(diǎn)突變(pointmutation)(錯(cuò)配):轉(zhuǎn)換(transition):A
G或C
T顛換(transversion):嘌呤堿
嘧啶堿框移突變(frameshiftmutation):是指改變?nèi)?lián)體密碼的閱讀框架,造成蛋白質(zhì)氨基酸排列順序發(fā)生改變。缺失、插入非3倍數(shù)堿基重排(rearrangement):DNA分子內(nèi)較大片段的交換,稱為重組或重排。鐮刀形紅細(xì)胞性貧血血紅蛋白中遺傳信息的異常正常DNA…TGTGGGCTTCTTTTT…mRNA…ACACCCGAAGAAAAA…HbA(β鏈)(氨基末端)蘇脯谷6谷賴異常DNA…TGTGGGCATCTTTTT…mRNA…ACACCCGUAGAAAAA…HbS(β鏈)(氨基末端)蘇脯纈6谷賴點(diǎn)突變紅細(xì)胞鐮狀紅細(xì)胞谷酪蛋絲5
……GCA
GUA
CAU
GUC……丙纈組纈正常mRNA5
……GAG
UAC
AUG
UC……mRNA缺失C框移突變(三)DNA的損傷修復(fù)光復(fù)活(lightrepairing)切除修復(fù)(excisionrepair)重組修復(fù)(recombinationrepairing)SOS修復(fù)修復(fù)(repairing)
:對(duì)已發(fā)生改變的分子的修復(fù)措施,使其回復(fù)為原有的天然狀態(tài)。修復(fù)的主要類型:光修復(fù)(photoreactivation)紫外輻射致DNA鏈上兩相鄰胸腺嘧啶殘基間形成二聚體光解酶切除修復(fù)核酸內(nèi)切酶核酸外切酶DNA-pol、DNAligase細(xì)胞內(nèi)最重要的有效修復(fù)機(jī)制,主要由核酸內(nèi)切酶、核酸外切酶、DNA-pol和DNA連接酶完成。重組修復(fù)第二節(jié)
RNA的生物合成(轉(zhuǎn)錄)轉(zhuǎn)錄(transcription)
:
生物體在RNA聚合酶作用下,按堿基互補(bǔ)配對(duì)原則,準(zhǔn)確地把DNA堿基序列轉(zhuǎn)變成RNA堿基序列的過程。轉(zhuǎn)錄mRNAtRNArRNADNA
一、參與轉(zhuǎn)錄的主要物質(zhì)轉(zhuǎn)錄模板:?jiǎn)喂蒁NA鏈;酶:RNA聚合酶(RNApolymerase,RNA-pol);底物:底物NTP(ATP、UTP、GTP、CTP);終止因子。(一)轉(zhuǎn)錄模板模板:能轉(zhuǎn)錄出RNA的DNA區(qū)段(基因)。模板鏈(templatestrand):
基因雙鏈中的一股具有轉(zhuǎn)錄功能的單鏈,也稱為有意義鏈或Watson鏈;
編碼鏈(codingstrand):
與模板鏈互補(bǔ)的另一股不具轉(zhuǎn)錄功能的單鏈,也稱為反義鏈或Crick鏈。
5′……GGAGTACATGTC…3′(編碼鏈)3′……CCTCATGTACAG…5′(模板鏈)
↓(轉(zhuǎn)錄)5′……GGAGUACAUGUC…3′
mRNA↓(翻譯)
N……Ala…Val…His…Val…C
多肽鏈
DNA5′3′不對(duì)稱轉(zhuǎn)錄:1、基因雙鏈中只有一股可轉(zhuǎn)錄;2、模板鏈并非總在同一股單鏈上。RNA合成方向:5
→3
不對(duì)稱轉(zhuǎn)錄(asymmetrictranscription)選擇性轉(zhuǎn)錄:特征5′3′(二)RNA聚合酶:催化轉(zhuǎn)錄合成RNA的主要酶
。
全酶:核心酶(
2
)
+
起始因子()原核生物的RNA聚合酶亞基功能
決定被轉(zhuǎn)錄基因的類型和種類
轉(zhuǎn)錄全程起催化聚合作用
參與結(jié)合模板鏈
功能不詳
辨認(rèn)轉(zhuǎn)錄模板啟動(dòng)子類型細(xì)胞內(nèi)定位催化轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物對(duì)α鵝膏蕈堿的反應(yīng)Ⅰ核仁(5.8、18、28)SrRNA前體耐受Ⅱ核質(zhì)mRNA前體、snRNA
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