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文檔簡介
Chapter7.基因的表達與調(diào)控
------真核基因表達調(diào)控模式本章所講述內(nèi)容:
1、真核生物的基因結(jié)構(gòu)與轉(zhuǎn)錄活性;
2、真核基因的轉(zhuǎn)錄水平調(diào)控;
3、反式作用因子的調(diào)控作用;
4、真核基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控的主要模式;
5、其他水平的基因調(diào)控;
真核生物的基因結(jié)構(gòu)與轉(zhuǎn)錄活性:
1、簡述真核生物基因表達調(diào)控總論;
2、真核基因組的一般構(gòu)造特點;
3、基因的典型結(jié)構(gòu)及特點;
4、真核生物DNA水平上的基因表達調(diào)控;
5、DNA甲基化與基因活性的調(diào)控;真核生物和原核生物由于基本生活方式不同所決定基因表達調(diào)控上的巨大差別。原核生物的調(diào)控系統(tǒng)就是要在一個特定的環(huán)境中為細胞創(chuàng)造高速生長的條件,或使細胞在受到損傷時,盡快得到修復(fù),所以,原核生物基因表達的開關(guān)經(jīng)常是通過控制轉(zhuǎn)錄的起始來調(diào)節(jié)的。
真核生物(除酵母、藻類和原生動物等單細胞類之外)主要由多細胞組成,每個真核細胞所攜帶的基因數(shù)量及總基因組中蘊藏的遺傳信息量都大大高于原核生物。人類細胞單倍體基因組就包含有3×109bp總DNA,約為大腸桿菌總DNA的1000倍,是噬菌體總DNA的10萬倍左右!大腸桿菌約有4000個基因,人則約有3~5萬個基因。
真核基因表達調(diào)控的最顯著特征是能在特定時間和特定的細胞中激活特定的基因,從而實現(xiàn)"預(yù)定"的、有序的、不可逆轉(zhuǎn)的分化、發(fā)育過程,并使生物的組織和器官在一定的環(huán)境條件范圍內(nèi)保持正常功能。
真核生物基因調(diào)控,根據(jù)其性質(zhì)可分為兩大類:
第一類是瞬時調(diào)控或稱可逆性調(diào)控,它相當(dāng)于原核細胞對環(huán)境條件變化所做出的反應(yīng),包括某種底物或激素水平升降,或細胞周期不同階段中酶活性和濃度的調(diào)節(jié)。
第二類是發(fā)育調(diào)控或稱不可逆調(diào)控,是真核基因調(diào)控的精髓部分,它決定了真核細胞生長、分化、發(fā)育的全部進程。真核基因表達調(diào)控的環(huán)節(jié)更多
基因表達是基因經(jīng)過轉(zhuǎn)錄、翻譯、產(chǎn)生有生物活性的蛋白質(zhì)的整個過程。同原核生物一樣,轉(zhuǎn)錄依然是真核生物基因表達調(diào)控的主要環(huán)節(jié)。但真核基因轉(zhuǎn)錄發(fā)生在細胞核(線粒體基因的轉(zhuǎn)錄在線粒體內(nèi)),翻譯則多在胞漿,兩個過程是分開的,因此其調(diào)控增加了更多的環(huán)節(jié)和復(fù)雜性,轉(zhuǎn)錄后的調(diào)控占有了更多的分量。在真核生物中基因表達的調(diào)節(jié)其特點是:(1)多層次;(2)無操縱子和衰減子;(3)個體發(fā)育復(fù)雜;(4)受環(huán)境影響較小;7.1.1基因的典型結(jié)構(gòu)及特點
(1)真核基因組結(jié)構(gòu)龐大由DNA、組蛋白、非組蛋白(P25)等大分子組成。其基本結(jié)構(gòu)物質(zhì)是DNA和組蛋白。
核小體是染色質(zhì)的基本單位。真核染色體上三要素:DNA復(fù)制起始點、著絲點(centromere)和端粒(telomere)。
著絲粒(centromere):細胞分裂時染色體與仿錘絲相連結(jié)的部位,為染色體的正常分離所必需。
端粒(telomere):真核生物線狀染色體分子末端的DNA區(qū)域.具有防止DNA末端降解,保證染色體的穩(wěn)定性的功能
(2)重復(fù)序列分為三種:單拷貝序列(singlecopysequences)
:
一個基因組中只有一個或幾個拷貝的序列;長度約為750-2000bp,相當(dāng)于一個結(jié)構(gòu)基因的長度,占基因組的40-80%。例如結(jié)構(gòu)基因基本上屬于不重復(fù)序列,如蛋清蛋白、蠶的絲心蛋白等。中度重復(fù)序列(moderaterepetitivesequences)
:重復(fù)次數(shù)在101-104之間;多數(shù)長100-500bp,占基因組10-40%。各種rRNA、tRNA及某些結(jié)構(gòu)蛋白基因(如組蛋白基因)。高度重復(fù)序列(highrepetitivesequences)—衛(wèi)星DNA
:這類序列一般較短,長10-300bp,重復(fù)次數(shù)>lO5,占基因組DNA序列總量的10-60%,人的基因組中這類序列約占20%,功能還不明了。
重復(fù)序列的存在是真核生物DNA區(qū)別于原核生物DNA的一個重要特征。
(3)基因不連續(xù)性(interruptedgene)
基因的編碼序列在DNA分子上是不連續(xù)的,為不編碼的序列所隔開。不連續(xù)基因是通過mRNA和DNA雜交試驗發(fā)現(xiàn)的。外顯子(exon):編碼序列內(nèi)含子(intron):非編碼序列外顯子和內(nèi)含子的概念與是否編碼氨基酸的概念并不相對應(yīng)。從不連續(xù)基因到成熟mRNA之間存在著一個基因轉(zhuǎn)錄的中間體,叫做初級轉(zhuǎn)錄物,叫做不均一核RNA(heterogeneousnuclearRNA,hnRNA),這個基因的初級轉(zhuǎn)錄物既含有外顯子又含有內(nèi)合子序列,從不均一核RNA到成熟mRNA要經(jīng)過一轉(zhuǎn)錄后的加工拼接過程。真核生物基因的不連續(xù)性和轉(zhuǎn)錄后加工是真核基因有別于原核基因的又一重要特征。在真核生物中也有些基因是不含內(nèi)含子的,如組蛋白基因及α型、β型干擾素基因、大多數(shù)酵母蛋白基因等。在一個結(jié)構(gòu)基因中,編碼某一蛋白質(zhì)不同區(qū)域的各個外顯子并不連續(xù)排列在一起,而常常被長度不等的內(nèi)含子所隔離,形成鑲嵌排列的斷裂方式。所以,真核基因有時被稱為斷裂基因(interruptedgene)。目前尚不清楚內(nèi)含子的生理功能。研究發(fā)現(xiàn),只有真核生物具有切除基因中內(nèi)含子,產(chǎn)生功能型mRNA和蛋白質(zhì)的能力,原核生物一般不具有這種本領(lǐng)。如果要在原核細胞里表達真核基因,必須首先構(gòu)建切除內(nèi)含子的重組基因,才有可能得到所研究的蛋白質(zhì)。
(4)存在許多基因家族(genefamily)來源相同、結(jié)構(gòu)相似、功能相關(guān)的基因組成為單一的基因簇或稱基因家族。同一家族中的成員有時緊密地排列在一起,成為一個基因簇;更多的時候,它們卻分散在同一染色體的不同部位,甚至位于不同的染色體上,具有各自不同的表達調(diào)控模式。簡單多基因家族
簡單多基因家族中的基因一般以串聯(lián)方式前后相連。在大腸桿菌中,16S,23S和5SrRNA基因聯(lián)合成一個轉(zhuǎn)錄單位,各種rRNA分子都是從這個轉(zhuǎn)錄單位上剪切下來的。
在真核生物中,前rRNA轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的分子量為45S,包括18S,28S和5.8S三個主要rRNA分子。前rRNA分子中至少有100處被甲基化(主要是核糖的2-OH甲基化),原始轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物也被特異性RNA酶切割降解,產(chǎn)生成熟rRNA分子。5SrRNA作為一個獨立的轉(zhuǎn)錄單位,由RNA聚合酶III(而不是聚合酶I)完成轉(zhuǎn)錄。復(fù)雜多基因家族
復(fù)雜多基因家族一般由幾個相關(guān)基因家族構(gòu)成,基因家族之間由間隔序列隔開,并作為獨立的轉(zhuǎn)錄單位?,F(xiàn)已發(fā)現(xiàn)存在不同形式的復(fù)雜多基因家族。
海膽的組蛋白基因家族串聯(lián)單位中的每一個基因分別被轉(zhuǎn)錄成單順反子RNA,這些RNA都沒有內(nèi)含子,而且各基因在同一條DNA鏈上按同一方向轉(zhuǎn)錄,每個基因的轉(zhuǎn)錄與翻譯速度都受到調(diào)節(jié)。研究還表明,在一個特定的細胞中,并不是所有串聯(lián)的單位都得到轉(zhuǎn)錄。胚胎發(fā)育的不同階段或不同組織中,有不同的串聯(lián)單位被轉(zhuǎn)錄,暗示可能存在具有不同專一性的組蛋白亞類和發(fā)育調(diào)控機制。發(fā)育調(diào)控的復(fù)雜多基因家族
多基因家族成員的表達受到不同發(fā)育階段的影響,而形成不同的基因產(chǎn)物。如血紅蛋白α2β2的亞基在胚胎期為2ζ22ε2,嬰兒期有2%為2α22δ,98%為2α22β,這是由于在不同的發(fā)育階段基因的排列順序決定了基因的表達順序。不同發(fā)育階段血紅蛋白亞型7.1.3真核生物DNA水平上的基因表達調(diào)控
分子生物學(xué)的最新研究表明,在個體發(fā)育過程中,用來合成RNA的DNA模板也會發(fā)生規(guī)律性變化,從而控制基因表達和生物體的發(fā)育。高度重復(fù)基因的形成通常與個體分化階段DNA的某些變化有關(guān)。例如,一個成熟的紅細胞能產(chǎn)生大量的可翻譯出成熟珠蛋白的mRNA,而其前體細胞卻不產(chǎn)生珠蛋白。許多情況下,這種變化是由于基因本身或它的拷貝數(shù)發(fā)生了永久性變化。這種DNA水平的調(diào)控是真核生物發(fā)育調(diào)控的一種形式,它包括了基因丟失、擴增、重排和移位等方式,通過這些方式可以消除或變換某些基因并改變它們的活性。這些調(diào)控方式與轉(zhuǎn)錄及翻譯水平的調(diào)控是不同的,因為它使基因組發(fā)生了改變。
7.1.3.1.“開放”型活性染色質(zhì)(activechromatin)結(jié)構(gòu)對轉(zhuǎn)錄的影響
真核基因的活躍轉(zhuǎn)錄是在常染色質(zhì)(euchromatin)上進行的(異染色質(zhì)hetrochromatin高度壓縮,不轉(zhuǎn)錄)
。轉(zhuǎn)錄發(fā)生之前,染色質(zhì)常常會在特定的區(qū)域被解旋松弛,形成自由DNA。這種變化可能包括核小體結(jié)構(gòu)的消除或改變,DNA本身局部結(jié)構(gòu)的變化等,這些變化可導(dǎo)致結(jié)構(gòu)基因暴露,促進轉(zhuǎn)錄因子與啟動區(qū)DNA的結(jié)合,誘發(fā)基因轉(zhuǎn)錄。
用DNA酶I處理各種組織的染色質(zhì)時,發(fā)現(xiàn)處于活躍狀態(tài)的基因比非活躍狀態(tài)的DNA更容易被DNA酶I所降解。雞成紅細胞(erythroblast)染色質(zhì)中,β-血紅蛋白基因比卵清蛋白基因更容易被DNA酶I切割降解。雞輸卵管細胞的染色質(zhì)中被DNA酶I優(yōu)先降解的是卵清蛋白基因,而不是β-血紅蛋白基因。
存在于“燈刷型”染色體(lampbrush)上的環(huán)形結(jié)構(gòu)可能與基因的活性轉(zhuǎn)錄有關(guān)?!盁羲⑿汀比旧w只有在兩棲類動物卵細胞發(fā)生減數(shù)分裂時才能被觀察到,它是染色體充分伸展時的一種形態(tài)。高倍電鏡下觀察發(fā)現(xiàn),燈刷型染色體上存在許多突起的“泡”狀或“環(huán)”狀結(jié)構(gòu),有時還能看到RNP沿著這些突起結(jié)構(gòu)移動,表明這些DNA正在被RNA聚合酶所轉(zhuǎn)錄。1.基因的擴增(amplification)兩棲類和昆蟲卵母細胞rRNA基因的擴增:如非洲爪蟾卵母細胞rDNA(rRNA基因)的擴增,以滿足受精后合成大量蛋白質(zhì)的需要。一旦卵母細胞成熟,多余的rDNA就沒有用了,將被逐漸降解。
7.1.3.2.基因擴增
基因擴增是指某些基因的拷貝數(shù)專一性大量增加的現(xiàn)象,它使細胞在短期內(nèi)產(chǎn)生大量的基因產(chǎn)物以滿足生長發(fā)育的需要,是基因活性調(diào)控的一種方式。
7.1.3.3.基因重排(rearrangement)將一個基因從遠離啟動子的地方移到距它很近的位點從而啟動轉(zhuǎn)錄,這種方式被稱為基因重排。
真核生物最典型的例子是:1、免疫球蛋白在成熟過程中的重排2、酵母的交配型轉(zhuǎn)變.
通過基因重排調(diào)節(jié)基因活性的典型例子是免疫球蛋白(抗體)結(jié)構(gòu)基因和T-細胞受體基因的表達,前者是由B淋巴細胞合成的,而后者則由T-淋巴細胞合成??贵w有100萬種以上,一種淋巴細胞只產(chǎn)生一種抗體。免疫球蛋白的肽鏈主要由可變區(qū)(V區(qū))、恒定區(qū)(C區(qū))以及兩者之間的連接區(qū)(J區(qū))組成重鏈由V、D、J、C四種不同基因片段組成,結(jié)構(gòu)比輕鏈更為復(fù)雜V、C和J基因片段在胚胎細胞中相隔較遠。編碼產(chǎn)生免疫球蛋白的細胞發(fā)育分化時,通過染色體內(nèi)DNA重組把4個相隔較遠的基因片段連接在一起,從而產(chǎn)生了具有表達活性的免疫球蛋白基因。7.1.4
DNA甲基化與基因活性的調(diào)控
DNA甲基化是最早發(fā)現(xiàn)的修飾途徑之一,這一修飾途徑可能存在于所有高等生物中并與基因表達調(diào)控密切相關(guān)。
大量研究表明,DNA甲基化能關(guān)閉某些基因的活性,去甲基化則誘導(dǎo)了基因的重新活化和表達。
DNA甲基化能引起染色質(zhì)結(jié)構(gòu)、DNA構(gòu)象、DNA穩(wěn)定性及DNA與蛋白質(zhì)相互作用方式的改變,從而控制基因表達。7.1.4.1.DNA的甲基化
DNA甲基化主要形成5-甲基胞嘧啶(5-mC)和少量的N6-甲基腺嘌呤(N6-mA)及7-甲基鳥嘌呤(7-mG)。
由于CpG二核苷酸通常成串出現(xiàn)在DNA上,這段序列往往被稱為CpG島。
真核生物細胞內(nèi)存在兩種甲基化酶活性:一種被稱為日常型甲基轉(zhuǎn)移酶,另一種是從頭合成型甲基轉(zhuǎn)移酶,前者主要在甲基化母鏈(模板鏈)指導(dǎo)下使處于半甲基化的DNA雙鏈分子上與甲基胞嘧啶相對應(yīng)的胞嘧啶甲基化。該酶催化特異性極強,對半甲基化的DNA有較高的親和力,使新生的半甲基化DNA迅速甲基化,從而保證DNA復(fù)制及細胞分裂后甲基化模式不變。后者催化未甲基化的CpG成為mCpG,它不需要母鏈指導(dǎo),但速度很慢。7.1.4.2.DNA甲基化抑制基因轉(zhuǎn)錄的機理
DNA甲基化導(dǎo)致某些區(qū)域DNA構(gòu)象變化,從而影響了蛋白質(zhì)與DNA的相互作用,抑制了轉(zhuǎn)錄因子與啟動區(qū)DNA的結(jié)合效率。研究表明,當(dāng)組蛋白H1與含CCGG序列的甲基化或非甲基化DNA分別形成復(fù)合體時,DNA的構(gòu)型存在著很大的差別,甲基化達到一定程度時會發(fā)生從常規(guī)的B-DNA向Z-DNA的過渡。由于Z-DNA結(jié)構(gòu)收縮,螺旋加深,使許多蛋白質(zhì)因子賴以結(jié)合的元件縮入大溝而不利于基因轉(zhuǎn)錄的起始。有實驗用序列相同但甲基化水平不同的DNA為材料,比較其作為RNA聚合酶轉(zhuǎn)錄模板的活性,發(fā)現(xiàn)甲基的引入不利于模板與RNA聚合酶的結(jié)合,降低了其體外轉(zhuǎn)錄活性。
5-甲基胞嘧啶在DNA上并不是隨機分布的,基因的5'端和3'端往往富含甲基化位點,而啟動區(qū)DNA分子上的甲基化密度與基因轉(zhuǎn)錄受抑制的程度密切相關(guān)。對于弱啟動子來說,稀少的甲基化就能使其完全失去轉(zhuǎn)錄活性。當(dāng)這一類啟動子被增強時(帶有增強子),即使不去甲基化也可以恢復(fù)其轉(zhuǎn)錄活性。若進一步提高甲基化密度,即使增強后的啟動子仍無轉(zhuǎn)錄活性。因為甲基化對轉(zhuǎn)錄的抑制強度與MeCPl(methylCpG-bindingproteinl)結(jié)合DNA的能力成正相關(guān),甲基化CpG的密度和啟動子強度之間的平衡決定了該啟動子是否具有轉(zhuǎn)錄活性。7.1.4.3.DNA甲基化與X染色體失活
X染色體失活是發(fā)育過程中獨特的調(diào)節(jié)機制。
雌性胎生哺乳類動物細胞中兩條X染色體之一在發(fā)育早期隨機失活,以確保與只有一條X染色體的雄性個體內(nèi)X染色體基因的劑量相同。一旦發(fā)生X染色體失活,這個信息便能夠穩(wěn)定地傳遞給子代細胞,使該細胞有絲分裂所產(chǎn)生的后代都保持同一條X染色體失活。X染色體失活中心(X-chromosomeinactivationcenter,Xic):Xist基因(Xi-specifictranscript)7.2真核基因轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)控
真核基因調(diào)控主要也是在轉(zhuǎn)錄水平上進行的,受大量特定的順式作用元件(cis-actingelement,又稱順式作用元件)和反式作用因子(trans-actingfactor,又稱跨域作用因子)的調(diào)控,真核生物的轉(zhuǎn)錄調(diào)控大多數(shù)是通過順式作用元件和反式作用因子復(fù)雜的相互作用來實現(xiàn)的。
真核細胞的三種RNA聚合酶(Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ)中,只有RNA聚合酶Ⅱ能轉(zhuǎn)錄生成mRNA,以下主要討論RNA聚合酶Ⅱ的轉(zhuǎn)錄調(diào)控。
I型:45S-rRNAII型:hnRNAIII型:小分子RNA(5S-rRNA,tRNA,snRNA)1.順式作用元件(cis-actingelements)
真核基因的順式調(diào)控元件是基因周圍能與特異轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合而影響轉(zhuǎn)錄的DNA序列。其中主要是起正調(diào)控作用的順式作用元件,包括啟動子(promoter)、增強子(enhancer)等;。真核基因表達以正調(diào)控為主
真核RNA聚合酶對啟動子的親和力很低,基本上不能獨靠其自身來起始轉(zhuǎn)錄,而是需要依賴多種激活蛋白的協(xié)同作用。真核基因調(diào)控中雖然也發(fā)現(xiàn)有負性調(diào)控元件,但其存在并不普遍;真核基因轉(zhuǎn)錄表達的調(diào)控蛋白也有起阻遏和激活作用或兼有兩種作用者,但總的是以激活蛋白的作用為主。即多數(shù)真核基因在沒有調(diào)控蛋白作用時是不轉(zhuǎn)錄的,需要表達時就要有激活的蛋白質(zhì)來促進轉(zhuǎn)錄。換言之:真核基因表達以正調(diào)控為主導(dǎo)。(一)順式作用元件真核生物DNA序列和被轉(zhuǎn)錄的結(jié)構(gòu)基因距離較近包括:啟動子(啟動子上游近側(cè)序列)增強子和轉(zhuǎn)錄調(diào)控有關(guān)
(可影響自身編碼基因表達活性)真核基因轉(zhuǎn)錄激活調(diào)節(jié)1.啟動子和啟動子上游近側(cè)序列是RNA聚合酶結(jié)合位點周圍的DNA序列位于轉(zhuǎn)錄起始點的上游按其對RNA聚合酶的影響分為兩類:位于較上游的元件,強烈影響轉(zhuǎn)錄起始
CAATbox,GCbox離轉(zhuǎn)錄點較近,起轉(zhuǎn)錄起始調(diào)控作用
TATAbox真核基因啟動子是RNA聚合酶結(jié)合位點周圍的一組轉(zhuǎn)錄控制組件,至少包括一個轉(zhuǎn)錄起始點以及一個以上的功能組件2.增強子一類能增強真核生物啟動子功能的順式作用元件(DNA序列)增強子、啟動子交錯覆蓋/連續(xù)沒有增強子啟動子不表現(xiàn)活性沒有啟動子增強子無法發(fā)揮作用增強子作用不受序列方向的制約有組織特異性
3.反應(yīng)元件真核細胞處于某一特定環(huán)境時有反應(yīng)的基因具有相同的順式作用元件這一類順式作用元件--反應(yīng)元件(DNA序列)
特點:(1)具較短的保守序列
(2)與轉(zhuǎn)錄起始點的距離不固定
(3)可位于啟動子或增強子內(nèi)舉例:激素反應(yīng)元件(HRE)
真核細胞DNA上位于基因上游能被轉(zhuǎn)錄因子識別和結(jié)合,能對特定環(huán)境因素作出應(yīng)答反應(yīng)的DNA序列.能專一結(jié)合特異性蛋白因子,從而調(diào)控基因特異表達.應(yīng)答元件(responseelement)
包括:熱激應(yīng)答元件(HSE)糖皮質(zhì)激素應(yīng)答元件(GRE)金屬應(yīng)答元件(MRE)血清應(yīng)答元件(SRE)當(dāng)糖皮質(zhì)激素作用時,真核細胞中有反應(yīng)的基因具有此類順式作用元件各種應(yīng)答元件的作用原理是相同的,即特定的蛋白因子識別應(yīng)答元件并與其結(jié)合,從而調(diào)控基因的表達。
熱激應(yīng)答是多個基因受單一轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控,溫度升高,在關(guān)閉一些基因轉(zhuǎn)錄的同時,打開熱激基因(heatshockgene)的轉(zhuǎn)錄。無論是細菌還是高等真核生物,熱激基因散布在不同染色體上或同一染色體的不同部位,即生物處在最適溫度范圍以上時,受到熱的誘導(dǎo),就會使許多熱激基因轉(zhuǎn)錄,合成一系列熱激蛋白。熱激蛋白是一種分子陪伴(moleculerchaperon),可以使因溫度升高而構(gòu)型發(fā)生改變的蛋白質(zhì)恢復(fù)成維持原有的三維構(gòu)象,不致喪失功能而使機體得以存活。
2、反式作用因子
(轉(zhuǎn)錄因子transcriptionfactor)一類在真核細胞核中發(fā)揮作用的蛋白質(zhì)因子反式作用因子
識別/結(jié)合順式作用元件中的靶序列啟動轉(zhuǎn)錄例:轉(zhuǎn)錄因子TFⅡD識別結(jié)合TATAbox
轉(zhuǎn)錄因子SP1識別結(jié)合GCbox
轉(zhuǎn)錄因子CTF1識別結(jié)合CCAATbox表RNA聚合酶Ⅱ的基本轉(zhuǎn)錄因子轉(zhuǎn)錄因子分子量(kD)功能TBP30與TATA盒結(jié)合TFⅡ-B33介導(dǎo)RNA聚合酶Ⅱ的結(jié)合TFⅡ-F30,74解旋酶TFⅡ-E34,37ATP酶TFⅡ-H62,89解旋酶TFⅡ-A12,19,35穩(wěn)定TFⅡ-D的結(jié)合TFⅡ-I120促進TFⅡ-D的結(jié)合2、反式作用因子1.轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子分類(按功能特性)*基本轉(zhuǎn)錄因子(generaltranscriptionfactors)是RNA聚合酶結(jié)合啟動子所必需的一組蛋白因子,決定三種RNA(mRNA、tRNA及rRNA)轉(zhuǎn)錄的類別反式作用因子是能直接或間接地識別或結(jié)合在各類順式作用元件核心序列上,參與調(diào)控靶基因轉(zhuǎn)錄效率的蛋白質(zhì)。*特異轉(zhuǎn)錄因子(specialtranscriptionfactors)為個別基因轉(zhuǎn)錄所必需,決定該基因的時間、空間特異性表達。轉(zhuǎn)錄激活因子轉(zhuǎn)錄抑制因子
作為蛋白質(zhì)的轉(zhuǎn)錄因子從功能上分析其結(jié)構(gòu)可包含有不同區(qū)域:①DNA結(jié)合域(DNAbindingdomain),多由60-100個氨基酸殘基組成的幾個亞區(qū)組成;②轉(zhuǎn)錄激活域(transcriptionalactivationdomain),常由30-100氨基酸殘基組成,這結(jié)構(gòu)域有富含酸性氨基酸、富含谷氨酰胺、富含脯氨酸等不同種類;③連接區(qū),即連接上兩個結(jié)構(gòu)域的部分。反式作用因子的三個功能結(jié)構(gòu)域:
與DNA結(jié)合的轉(zhuǎn)錄因子大多以二聚體形式起作用,與DNA結(jié)合的功能域結(jié)構(gòu)常見有以幾種:
①螺旋-轉(zhuǎn)角-
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