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關(guān)于分子診斷技術(shù)第1頁(yè),講稿共22頁(yè),2023年5月2日,星期三常見(jiàn)的核酸分子診斷技術(shù)核酸分子雜交
(NucleicacidmolecularHybridization)基因芯片(GeneChip)聚合酶鏈反應(yīng)(polymerasechainreactionreaction;PCR)第2頁(yè),講稿共22頁(yè),2023年5月2日,星期三核酸分子雜交的原理雙鏈核酸加熱或經(jīng)鹼處理變性后,可解鏈成兩條互補(bǔ)的單鏈核酸。在適當(dāng)溫度、鹽濃度下,雙鏈能按鹼基互補(bǔ)配對(duì)原則(A-T,C-G)復(fù)性而重新成為雙鏈核酸。用已知序列的單鏈核酸,經(jīng)標(biāo)記制成核酸探針,與變性后的待測(cè)標(biāo)本核酸進(jìn)行雜交,通過(guò)檢測(cè)標(biāo)記探針的信號(hào),可判斷標(biāo)本是否存在與探針互補(bǔ)雜交的同源核酸。第3頁(yè),講稿共22頁(yè),2023年5月2日,星期三核酸分子雜交探針的制備制備探針的靶核酸可通過(guò):分離、切割病毒的特定核酸片段獲得;用重組技術(shù),將該片段克隆到細(xì)菌質(zhì)粒,經(jīng)擴(kuò)增和純化大量獲得;選擇已知病毒的一段基因序列,用人工方法合成寡核苷酸,其長(zhǎng)度以20個(gè)左右最為常用,過(guò)短易出現(xiàn)非特異性雜交。第4頁(yè),講稿共22頁(yè),2023年5月2日,星期三核酸分子雜交探針的制備常見(jiàn)的用于標(biāo)記探針的示蹤物質(zhì)放射性核素如:32P,35S,3H,125I等,雜交后可通過(guò)放射自顯影技術(shù)進(jìn)行檢測(cè)非放射性物質(zhì)如:生物素、地高辛和酶等,雜交后可通過(guò)底物顯色、化學(xué)發(fā)光等技術(shù)進(jìn)行檢測(cè)第5頁(yè),講稿共22頁(yè),2023年5月2日,星期三
核酸分子雜交示意圖核酸分子雜交的程序
第6頁(yè),講稿共22頁(yè),2023年5月2日,星期三常用的核酸分子雜交技術(shù)斑點(diǎn)雜交(spotblothybridization)凝膠電泳印跡轉(zhuǎn)移雜交(Southern
blothybridization)原位雜交(in-situhybridization)第7頁(yè),講稿共22頁(yè),2023年5月2日,星期三斑點(diǎn)雜交DotBoltHybridizationforHBVDNAQuantitationin5μlofPatientSera第8頁(yè),講稿共22頁(yè),2023年5月2日,星期三
凝膠電泳印跡轉(zhuǎn)移雜交原位雜交
(Southernblothybridization)(in-situhybridization)第9頁(yè),講稿共22頁(yè),2023年5月2日,星期三核酸分子雜交技術(shù)的應(yīng)用核酸分子雜交具有很高的靈敏度和高度的特異性,因而該技術(shù)在分子生物學(xué)領(lǐng)域中已廣泛地使用于克隆基因的篩選、酶切圖譜的制作、基因組中特定基因序列的定性等在醫(yī)學(xué)上,目前已用于多種遺傳性疾病的基因診斷,惡性腫瘤的基因分析,傳染病病原體的檢測(cè)等領(lǐng)域中。第10頁(yè),講稿共22頁(yè),2023年5月2日,星期三基因芯片基因芯片(或DNAChip,或Microarray)又稱DNA微陣列,是指固定在固相載體上的高密度DNA微點(diǎn)陣。即將大量靶基因或寡核苷酸片段有序地,高密度地(點(diǎn)與點(diǎn)間距一般小于500μm)排列在玻璃、硅等載體上,稱之為基因芯片。上圖顯示大量的DNA探針,按照一定的規(guī)律有序地排列在支撐物上,每個(gè)探針與相對(duì)應(yīng)的特異互補(bǔ)序列結(jié)合后,即可發(fā)出熒光。利用該芯片可同時(shí)獲取大量信息。DNAMicroarray第11頁(yè),講稿共22頁(yè),2023年5月2日,星期三基因芯片技術(shù)原理大規(guī)模集成的固相雜交
基本原理是核酸分子雜交,即依據(jù)DNA雙鏈堿基互補(bǔ)配對(duì)、變性和復(fù)性的原理
以大量已知序列的寡核苷酸、cDNA或基因片段作探針,檢測(cè)樣品中哪些核酸序列與其互補(bǔ),然后通過(guò)定性、定量分析得出待測(cè)樣品的基因序列及表達(dá)的信息第12頁(yè),講稿共22頁(yè),2023年5月2日,星期三基因芯片的作用原理第13頁(yè),講稿共22頁(yè),2023年5月2日,星期三基因芯片的制作方式原位合成直接點(diǎn)樣原位光蝕刻合成原位噴印合成
分子印章法針式點(diǎn)樣噴墨點(diǎn)樣光導(dǎo)原位合成法第14頁(yè),講稿共22頁(yè),2023年5月2日,星期三基因芯片技術(shù)流程第15頁(yè),講稿共22頁(yè),2023年5月2日,星期三基因芯片的應(yīng)用基因表達(dá)分析
分析基因表達(dá)時(shí)空特征基因差異表達(dá)檢測(cè)發(fā)現(xiàn)新基因大規(guī)模DNA測(cè)序基因型、基因突變和多態(tài)性分析疾病的診斷與治療
遺傳病相關(guān)基因的定位腫瘤診斷感染性疾病的診斷耐藥菌株和藥敏檢測(cè)第16頁(yè),講稿共22頁(yè),2023年5月2日,星期三聚合酶鏈反應(yīng)
(polymerasechainreactionreaction;PCR)PCR是八十年代中期問(wèn)世的一種體外模擬體內(nèi)DNA復(fù)制過(guò)程的技術(shù),可在短時(shí)間內(nèi)將待測(cè)特異性DNA擴(kuò)增百萬(wàn)倍以上,并具有簡(jiǎn)單、快速、特異的特點(diǎn),成為分子生物學(xué)發(fā)展史的又一個(gè)里程碑。PCR不僅可檢測(cè)各種DNA病毒的核酸,還可經(jīng)過(guò)逆轉(zhuǎn)錄,檢測(cè)各種RNA病毒的核酸,因而在各型肝炎病毒的檢測(cè)中,敏感性遠(yuǎn)超過(guò)分子雜交,有著不可替代的作用。第17頁(yè),講稿共22頁(yè),2023年5月2日,星期三
PCR的常見(jiàn)類型常規(guī)PCR逆轉(zhuǎn)錄PCR(RT-PCR)巢式PCR〔nested-PCR〕原位PCR(in-situPCR)多重PCR…非對(duì)稱PCR免疫PCR定量PCR隨機(jī)引物PCR簡(jiǎn)并引物PCR錨定PCR第18頁(yè),講稿共22頁(yè),2023年5月2日,星期三實(shí)時(shí)熒光定量PCR熒光檢測(cè)技術(shù)SYBRGreenI。是一種結(jié)合于所有dsDNA雙螺旋小溝區(qū)域的具有綠色激發(fā)波長(zhǎng)的染料。
TaqMan水解探針。由產(chǎn)熒光基團(tuán),熒光淬滅基團(tuán),與擴(kuò)增子有互補(bǔ)的特異核苷酸序列組成。第19頁(yè),講稿共22頁(yè),2023年5月2日,星期三實(shí)時(shí)熒光定量PCR:水解探針?lè)ㄍ嘶鹧由烨懈罹酆贤瓿稍摲ㄒ卜QTaqMan技術(shù),在PCR系統(tǒng)中,加入能和靶核酸模板雜交的探針,其5’端帶有熒光報(bào)告基團(tuán),發(fā)射的熒光被3’端帶有的熒光淬滅基團(tuán)所吸收。引物延伸時(shí),由于聚合酶具有的5’→3’‘核酸外切酶作用,可把熒光報(bào)告基團(tuán)從探針上切下,因與淬滅基團(tuán)遠(yuǎn)離,發(fā)出的熒光不被淬滅,隨模板擴(kuò)增和游離熒光報(bào)告基團(tuán)的增加而增強(qiáng),并和初始靶核酸的量呈正相關(guān)。第
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