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(優(yōu)選)蛋白質(zhì)合成的生物學(xué)機(jī)制目前一頁(yè)\總數(shù)三十九頁(yè)\編于十八點(diǎn)氨基酸的活化翻譯的起始肽鏈的延伸肽鏈的終止4.4蛋白質(zhì)合成的生物學(xué)機(jī)制目前二頁(yè)\總數(shù)三十九頁(yè)\編于十八點(diǎn)(一)氨基酸的活化氨基酸+tRNA氨基酰-tRNAATP
AMP+PPi氨基酰-tRNA合成酶目前三頁(yè)\總數(shù)三十九頁(yè)\編于十八點(diǎn)氨基酰-tRNA合成酶對(duì)底物氨基酸和tRNA都有高度特異性。氨基酰-tRNA合成酶具有校正活性(proofreadingactivity)。氨基酰-tRNA的表示方法:Ala-tRNAAla
Ser-tRNASerMet-tRNAMet
目前四頁(yè)\總數(shù)三十九頁(yè)\編于十八點(diǎn)原核生物中,起始氨基酸是:起始AA-tRNA是:真核生物中,起始氨基酸是:起始AA-tRNA是:甲酰甲硫氨酸fMet-tRNAfMet甲硫氨酸Met-tRNAMet目前五頁(yè)\總數(shù)三十九頁(yè)\編于十八點(diǎn)第一步反應(yīng)氨基酸+ATP-E—→氨基酰-AMP-E
+AMP+PPi
目前六頁(yè)\總數(shù)三十九頁(yè)\編于十八點(diǎn)第二步反應(yīng)氨基酰-AMP-E+
tRNA
氨基酰-tRNA+AMP
+
E目前七頁(yè)\總數(shù)三十九頁(yè)\編于十八點(diǎn)tRNA與酶結(jié)合的模型tRNA氨基酰-tRNA合成酶ATP目前八頁(yè)\總數(shù)三十九頁(yè)\編于十八點(diǎn)(二)翻譯的起始原核生物(細(xì)菌)為例:所需成分:30S小亞基、50S大亞基、模板mRNA、fMet-tRNAfMet、GTP、Mg2+翻譯起始因子:IF-1、IF-2、IF-3、目前九頁(yè)\總數(shù)三十九頁(yè)\編于十八點(diǎn)(1)起始因子(initiationfactors,IF)
起始因子:
起始因子是參與蛋白質(zhì)生物合成起始的可溶性蛋白因子起始復(fù)合物:
蛋白質(zhì)合成的起始,生成核糖體·mRNA·起始-tRNA三元復(fù)合物,也叫起始復(fù)合物。起始復(fù)合物必須在起始因子幫助下才能形成。目前已知原核生物有3種起始因子,而真核生物約有10種。目前十頁(yè)\總數(shù)三十九頁(yè)\編于十八點(diǎn)
原核生物的3種起始因子:
▼
IF-1(9.5×103)為一小的堿性蛋白、已結(jié)晶、熱穩(wěn)定、沒有專一的功能,只能增加其他兩個(gè)起始因子的活性。
▼
IF-2(9.0×104~1.18×105,
有IF-2a
和IF-2b
兩種形式)熱不穩(wěn)定。IF-2的功能是通過(guò)生成IF-2·GTP·Met-tRNAfMet三元復(fù)合物,使起始tRNA與核糖體小亞基(30S亞基)結(jié)合。▼
IF-3(有IF-3a、IF-3b兩種)是個(gè)雙功能蛋白質(zhì),IF-3的功能是促進(jìn)mRNA與核糖體小亞基(30S亞基)結(jié)合,同時(shí)還具解離因子活性。
目前十一頁(yè)\總數(shù)三十九頁(yè)\編于十八點(diǎn)IF-3IF-1翻譯起始(翻譯起始復(fù)合物形成)又可被分成3步:1.30S小亞基首先與翻譯起始因子IF-1,IF-3結(jié)合,在通過(guò)SD序列與mRNA模板相結(jié)合AUG5'3'目前十二頁(yè)\總數(shù)三十九頁(yè)\編于十八點(diǎn)S-D序列目前十三頁(yè)\總數(shù)三十九頁(yè)\編于十八點(diǎn)IF-3IF-1IF-2GTP2.在IF-2和GTP的幫助下,fMet-tRNAfMet進(jìn)入小亞基的P位,tRNA上的反密碼子與mRNA上的起始密碼子配對(duì)。AUG5'3'目前十四頁(yè)\總數(shù)三十九頁(yè)\編于十八點(diǎn)IF-3IF-1IF-2GTPGDPPi3、帶有tRNA、mRNA和3個(gè)翻譯起始因子的小亞基復(fù)合物與50S大亞基結(jié)合,GTP水解,釋放翻譯起始因子。AUG5'3'目前十五頁(yè)\總數(shù)三十九頁(yè)\編于十八點(diǎn)IF-3IF-1AUG5'3'IF-2GTPIF-2-GTPGDPPi目前十六頁(yè)\總數(shù)三十九頁(yè)\編于十八點(diǎn)真核生物翻譯起始的特點(diǎn)
●核糖體較大,為80S;●起始因子比較多(約有10種);●mRNA5′端具有m7Gppp帽子結(jié)構(gòu)●Met-tRNAMet
●mRNA的5′端帽子結(jié)構(gòu)和3′端polyA都參與形成翻譯起始復(fù)合物;目前十七頁(yè)\總數(shù)三十九頁(yè)\編于十八點(diǎn)
真核生物的起始因子對(duì)于生成80S核糖體·mRNA·Met-tRNAMet三元起始復(fù)合物是必要的。目前十八頁(yè)\總數(shù)三十九頁(yè)\編于十八點(diǎn)表4-14a真核細(xì)胞中參與翻譯起始的蛋白質(zhì)因子及其功能真核因子功能eIF2促進(jìn)Met-tRNAMet與核糖體40S小亞基結(jié)合。(最重要的)
eIF2B
eIF3是最早與核糖體40S小亞基結(jié)合的促進(jìn)因子,蛋白質(zhì)合成反應(yīng)的正常進(jìn)。eIF4A具有RNA解旋酶活性,解除mRNA模板的次級(jí)結(jié)構(gòu)并使之與40S小亞基結(jié)合,形成eIF4F復(fù)合物。eIF4B與mRNA模板相結(jié)合,協(xié)助核糖體掃描模板序列,定位AUG。eIF4E與mRNA5'的帽子結(jié)構(gòu)相結(jié)合,形成eIF4F復(fù)合物。eIF4G與eIF4E和poly(A)結(jié)合蛋白(PAB)相結(jié)合,形成eIF4F復(fù)合物。eIF5促使多個(gè)蛋白因子與40S小亞基解體,以此幫助大小亞基結(jié)合形成80核糖體,形成翻譯起始復(fù)合物。eIF6促進(jìn)沒有蛋白質(zhì)合成活性的80S核糖體解離成40S和60S兩個(gè)亞基。目前十九頁(yè)\總數(shù)三十九頁(yè)\編于十八點(diǎn)真核生物翻譯起始復(fù)合物形成(區(qū)別原核生物)
原核生物中30S小亞基首先與mRNA模板相結(jié)合,再與fMet-tRNAfMet結(jié)合,最后與50S大亞基結(jié)合。而在真核生物中,40S小亞基首先與Met-tRNAMet相結(jié)合,再與模板mRNA結(jié)合,最后與60S大亞基結(jié)合生成80S·mRNA·Met-tRNAMet起始復(fù)合物。目前二十頁(yè)\總數(shù)三十九頁(yè)\編于十八點(diǎn)內(nèi)容原核生物真核生物核糖體完整70S80S亞基50S,30S60S,40S起始tRNAfMet-tRNAfMetMet-tRNAiMet起始因子三種至少七種起始復(fù)合物生成順序1.30S-mRNA1.40S-Met-tRNAMet2.30S-mRNA·fMet-tRNAfMet2.40S-mRNA·Met-tRNAMet3.70S-mRNA·fMet-tRNAfMet3.80S-mRNA·Met-tRNAMet原核生物和真核生物蛋白質(zhì)合成起始的區(qū)別目前二十一頁(yè)\總數(shù)三十九頁(yè)\編于十八點(diǎn)met40SMetMetmRNAelF-3②GDP+Pi各種elF釋放elF-5④ATPADP+PielF4E,elF4G,elF4A,elF4B,PAB③MetMet-tRNAMet-elF-2
-GTP真核生物翻譯起始復(fù)合物形成過(guò)程目前二十二頁(yè)\總數(shù)三十九頁(yè)\編于十八點(diǎn)
肽鏈延伸由許多循環(huán)組成,每加一個(gè)氨基酸就是一個(gè)循環(huán),每個(gè)循環(huán)包括:AA-tRNA與核糖體結(jié)合、肽鍵的生成和移位。
延伸因子(elongationfactor,EF)
:
原核生物:EF-T(EF-Tu,EF-Ts)EF-G
真核生物:EF-1、EF-2(三)肽鏈的延伸目前二十三頁(yè)\總數(shù)三十九頁(yè)\編于十八點(diǎn)1、AA-tRNA與核糖體A位點(diǎn)的結(jié)合
需要消耗GTP,并需EF-Tu、EF-Ts兩種延伸因子目前二十四頁(yè)\總數(shù)三十九頁(yè)\編于十八點(diǎn)延伸因子(elongationfactorsEF)
延伸因子:是一類參與蛋白質(zhì)合成過(guò)程中肽鏈延伸的蛋白因子。
無(wú)論原核或真核生物,延伸因子可分為二類:
一類:是幫助氨酰tRNA(延伸tRNA)進(jìn)入核糖體與mRNA結(jié)合的EF。原核生物EF-Tu、EF-Ts
真核生物EF-1目前二十五頁(yè)\總數(shù)三十九頁(yè)\編于十八點(diǎn)
另一類:是使肽基tRNA從核糖體的A位向P位移動(dòng)的EF
原核生物EF-G
真核生物EF-2
▼
在原核生物中:
EF-Tu的功能是按照mRNA上的編碼攜帶aa-tRNA進(jìn)入A位。EF-Tu有GTP存在下與aa-tRNA形成穩(wěn)定的三元復(fù)合物:
(EF-Tu·GTP·aa-tRNA)目前二十六頁(yè)\總數(shù)三十九頁(yè)\編于十八點(diǎn)目前二十七頁(yè)\總數(shù)三十九頁(yè)\編于十八點(diǎn)通過(guò)延伸因子EF-Ts再生GTP,形成EF-Tu?GTP復(fù)合物
EF-Tu-GDP+EF-TsEF-Tu-Ts+GDP
EF-Tu-Ts+GTPEF-Tu-GTP+EF-Ts重新參與下一輪循環(huán)目前二十八頁(yè)\總數(shù)三十九頁(yè)\編于十八點(diǎn)EF-Tu·GDPEF-TsEF-Tu·GTP
GDPEF-Tu·EF-TsGTP
目前二十九頁(yè)\總數(shù)三十九頁(yè)\編于十八點(diǎn)
EF-Tu具高度專一性,只能識(shí)別并結(jié)合除了fMet-tRNAf
Met
外的所有aa-tRNA。
EF-Tu的這一特性保證了起始tRNA攜帶的fMet不能進(jìn)入肽鏈內(nèi)部,因?yàn)闊o(wú)論甲酰或非甲酰的起始tRNA都不能與EF-Tu和GTP生成復(fù)合物。
GTP水解后,EF-Tu·GDP從核糖體釋放出來(lái)。EF-Tu是一個(gè)熱不穩(wěn)定的蛋白因子。
EF-Ts則是熱穩(wěn)定的,它不直接與核糖體發(fā)生聯(lián)系,其功能是使EF-Tu·GDP再生為EF-Tu·GTP,然后再參與肽鏈延伸:目前三十頁(yè)\總數(shù)三十九頁(yè)\編于十八點(diǎn)2、肽鍵形成
是由轉(zhuǎn)肽酶/肽基轉(zhuǎn)移酶催化
目前三十一頁(yè)\總數(shù)三十九頁(yè)\編于十八點(diǎn)3、移位核糖體向mRNA3’端方向移動(dòng)一個(gè)密碼子。需要消耗GTP,并需EF-G延伸因子自第一個(gè)肽鏈合成以后,每增加一個(gè)氨基酸,肽基-tRNA都要從A位移至P位,核糖體與mRNA相對(duì)移動(dòng)3個(gè)核苷酸(一個(gè)密碼子)的距離,該過(guò)程需要EF-G和GTP。EF-G是一種依賴于核糖體的GTPase它能使GTP水解。目前三十二頁(yè)\總數(shù)三十九頁(yè)\編于十八點(diǎn)延長(zhǎng)因子EF-G有轉(zhuǎn)位酶(translocase)活性,可結(jié)合并水解1分子GTP,促進(jìn)核蛋白體向mRNA的3'側(cè)移動(dòng)。目前三十三頁(yè)\總數(shù)三十九頁(yè)\編于十八點(diǎn)fMetAUG5'3'fMetTuGTP目前三十四頁(yè)\總數(shù)三十九頁(yè)\編于十八點(diǎn)目前三十五頁(yè)\總數(shù)三十九頁(yè)\編于十八點(diǎn)當(dāng)mRNA分子上終止密碼子出現(xiàn)在核糖體的A位時(shí),在一般情況下由于沒有任何氨酰tRNA可以與終止密碼子結(jié)合,不能把這些密碼子翻成氨基酸。釋放因子(終止因子:原核RF-1、RF-2、RF-3、真核RF)在GTP存在下能識(shí)別終止密碼子。
RF與A位結(jié)合后,活化肽基轉(zhuǎn)移酶,水解P位上tRNA與肽鏈之間的鍵。隨著新生肽鏈和最后一個(gè)非?;痶RNA離開核糖體,完成肽鏈的合成。
(四)肽鏈的終止目前三十六頁(yè)\總數(shù)三十九頁(yè)\編于十八點(diǎn)釋放因子(ReleaseFactorRF)或終止因子(terminationfactor)
釋放因子(ReleaseFactorRF):是一類參與蛋白質(zhì)合成過(guò)程中能識(shí)別終止密碼子而終止肽鏈延伸,使肽鏈從核糖體釋放出的蛋白因子。
原核生物中發(fā)現(xiàn)有3種釋放因子(Release
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