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文檔簡(jiǎn)介

現(xiàn)在是1頁\一共有59頁\編輯于星期五優(yōu)選第一章基因與基因工程現(xiàn)在是2頁\一共有59頁\編輯于星期五1基因研究的發(fā)展基因的發(fā)展大體可劃分為三個(gè)階段基因的染色體遺傳學(xué)階段(細(xì)胞遺傳學(xué)):

20世紀(jì)50年代之前,主要從細(xì)胞染色體水平上進(jìn)行研究?;虻姆肿由飳W(xué)階段(分子遺傳學(xué)):

20世紀(jì)50年代之后,主要從DNA水平上進(jìn)行研究?;蚬こ虒W(xué)階段(分子生物技術(shù)):

20世紀(jì)70年代,重組DNA技術(shù)的建立,使基因的研究進(jìn)入

了反向生物學(xué)研究階段?,F(xiàn)在是3頁\一共有59頁\編輯于星期五5′3′5′5′3′3′2DNA的分子結(jié)構(gòu)及其特點(diǎn)DNA分子中各脫氧核苷酸之間以3′-5′磷酸二酯鍵連接。不同的DNA分子具有不同的核苷酸排列順序,因此攜帶有不同的遺傳信息。5′3′DNA分子是脫氧核苷酸的多聚體?,F(xiàn)在是4頁\一共有59頁\編輯于星期五

DNA堿基組成特點(diǎn)和規(guī)律不同物種間DNA堿基組成一般是不同的;一個(gè)給定物種的DNA堿基組成不因個(gè)體的年齡、營養(yǎng)狀態(tài)和環(huán)境改變而改變

;

DNA堿基組成的Chargaff定律:腺嘌呤和胸腺嘧啶的摩爾數(shù)相等,即[A]=[T];鳥嘌呤和胞嘧啶的摩爾數(shù)也相等,即[G]=[C];嘌呤的總數(shù)等于嘧啶的總數(shù),即[A]+[G]=[C]+[T]?,F(xiàn)在是5頁\一共有59頁\編輯于星期五

DNA的雙螺旋結(jié)構(gòu)(Watson-Crick模型)5′3′5′3′5′3′5′3′磷酸脫氧核糖堿基T-A堿基對(duì)C-G堿基對(duì)小溝大溝現(xiàn)在是6頁\一共有59頁\編輯于星期五

DNA復(fù)制的一般特點(diǎn)

1、半保留復(fù)制2、固定的起點(diǎn)和方向3、半不連續(xù)4、需要RNA作為引物5、需要模板

DNA的特性DNA的復(fù)制

現(xiàn)在是7頁\一共有59頁\編輯于星期五DNA

的半保留復(fù)制實(shí)驗(yàn)依據(jù)

1958年Meselson&stahl用同位素示蹤標(biāo)記加密度梯度離心技術(shù)實(shí)驗(yàn),證明了DNA是采取半保留的方式進(jìn)行復(fù)制.[15N]DNA原始分子[14N-15N]DNA第一子代[14N]DNA[14N-15N]DNA第二子代現(xiàn)在是8頁\一共有59頁\編輯于星期五

DNA的特性DNA的變性

是指雙螺旋之間氫鍵斷裂,雙螺旋解開,形成單鏈無規(guī)則線團(tuán),因而發(fā)生性質(zhì)改變(如粘度下降,沉降速度增加,浮力上升,紫外吸收增加等),稱為DNA變性。

現(xiàn)在是9頁\一共有59頁\編輯于星期五

增色效應(yīng)(hyperchromiceffect)

由于DNA在260nm處有最大吸收值,因此,可利用DNA變性后波長(zhǎng)260nm處紫外吸收的變化追蹤變性過程。在DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)模型中堿基藏于內(nèi)側(cè),變性時(shí)由于雙螺旋解開,于是堿基外露,260nm紫外吸收值因而增加,這一現(xiàn)象稱為增色效應(yīng)。現(xiàn)在是10頁\一共有59頁\編輯于星期五

熔解溫度(meltingtemperature,Tm)通常把DNA分子雙螺旋結(jié)構(gòu)失去一半時(shí)的溫度稱為熔點(diǎn)或熔解溫度(meltingtemperature,Tm)。DNA的Tm一般在70-85℃之間。現(xiàn)在是11頁\一共有59頁\編輯于星期五1)DNA的均一性:均一性高的DNA,Tm值的范圍越窄;DNA的Tm值與以下因素有關(guān):2)溶劑的性質(zhì):離子強(qiáng)度較低的介質(zhì)中,DNA的Tm值較低,熔解溫度的范圍也較窄。因此,DNA制劑不應(yīng)保存在離子強(qiáng)度過低的溶液中,一般保存在1MNaCl溶液中較穩(wěn)定;

3)G-C含量:G-C含量越高,Tm值越高?,F(xiàn)在是12頁\一共有59頁\編輯于星期五

DNA的特性DNA的復(fù)性與雜交

復(fù)性(renaturation):變性DNA在適當(dāng)條件,二條彼此分開的互補(bǔ)鏈重新結(jié)合,恢復(fù)原來的雙螺旋結(jié)構(gòu),這一過程稱為復(fù)性或退火(annealing)。雜交(hybridization):當(dāng)DNA復(fù)性時(shí),來源不同的DNA(或RNA)片段,按堿基互補(bǔ)關(guān)系形成雜交雙鏈分子

。現(xiàn)在是13頁\一共有59頁\編輯于星期五復(fù)性在基因工程中的應(yīng)用顯示不同生物體間的遺傳相關(guān)性;檢測(cè)特定的DNA;考查某些序列在特定生物體DNA中的拷貝數(shù);確定特定堿基序列在DNA中的位置;分離克隆基因?,F(xiàn)在是14頁\一共有59頁\編輯于星期五現(xiàn)在是15頁\一共有59頁\編輯于星期五現(xiàn)在是16頁\一共有59頁\編輯于星期五12345CKSouthernbloting現(xiàn)在是17頁\一共有59頁\編輯于星期五3基因的定義

經(jīng)典的基因概念:在染色體或DNA分子上,基因是成串珠似的一個(gè)挨一個(gè)地排列著,它們之間是由非遺傳的物質(zhì)連接起來。交換只是在基因之間進(jìn)行,而不是在基因內(nèi)部發(fā)生?;虻娜灰惑w論

遺傳功能單位交換單位突變單位現(xiàn)在是18頁\一共有59頁\編輯于星期五

順反子概念的提出

1955年,Benzer通過對(duì)噬菌體的研究提出了順反子(cistron)概念。順反子(cistron)

:編碼一種完整多肽鏈的核苷酸序列。這種多肽既可以是一種具有生物活性的蛋白質(zhì),也可同別的多肽聚合形成多功能的蛋白質(zhì)。

現(xiàn)在是19頁\一共有59頁\編輯于星期五順反子是功能單位,其最小交換單位(又稱交換子)和最小突變單位(又稱突變子),都應(yīng)是DNA分子中的一個(gè)核苷酸對(duì)。順反子概念表明,基因不是最小的單位,它仍然是可分的;并非所有的DNA序列都是基因,而只有其中某一特定的多核苷酸區(qū)段才是基因的編碼區(qū)。

現(xiàn)在是20頁\一共有59頁\編輯于星期五基因就是合成有功能意義的蛋白質(zhì)多肽鏈或RNA所必需的全部核酸序列。基因的分子定義:按照這個(gè)定義,一個(gè)基因應(yīng)包括哪些部分?

?現(xiàn)在是21頁\一共有59頁\編輯于星期五4基因的結(jié)構(gòu)1.基因的組成部分基因編碼區(qū)(codingregion)非編碼區(qū)(nocodingregion)啟動(dòng)區(qū)(promoterregion)

終止區(qū)(terminatorregion)現(xiàn)在是22頁\一共有59頁\編輯于星期五編碼區(qū)(codingregion)含有大量的遺傳密碼,包括起始密碼子(AUG)和終止密碼子(UAA,UAG或UGA),以及表達(dá)子(exon)。

非編碼區(qū)(nocodingregion)指基因分子結(jié)構(gòu)中存在的對(duì)于遺傳信息表達(dá)所必須的、但卻不能轉(zhuǎn)譯成蛋白質(zhì)多肽的DNA序列。

5-UTR,即5-末端非轉(zhuǎn)譯區(qū);3-UTR,即3-末端非轉(zhuǎn)譯區(qū);Intron,即真核基因的間隔子序列。現(xiàn)在是23頁\一共有59頁\編輯于星期五啟動(dòng)區(qū)(promoterregion)指位于基因5上游的一段具有特殊功能的DNA序列區(qū),RNA聚合酶是通過同它結(jié)合作用而啟動(dòng)基因的轉(zhuǎn)錄。終止區(qū)(terminator)位于基因3端下游外側(cè)與終止密碼子相連的一段非編碼的核苷酸短序列區(qū),具有終止轉(zhuǎn)錄信號(hào)的功能?,F(xiàn)在是24頁\一共有59頁\編輯于星期五按照基因的定義,一個(gè)基因應(yīng)包括:⑴編碼蛋白質(zhì)多肽鏈或RNA的核酸序列;⑵保證轉(zhuǎn)錄所必需的調(diào)控序列、5′端非翻譯序列、內(nèi)含子、3′端非翻譯序列等所有的核酸序列。現(xiàn)在是25頁\一共有59頁\編輯于星期五2.原核基因的結(jié)構(gòu)原核基因的范圍原核基因(Prokargoticgene):系指由原核生物如大腸桿菌基因組的編碼基因,以及高等植物葉綠體基因組的編碼基因,還有線粒體基因組的編碼基因,都是屬于原核基因?,F(xiàn)在是26頁\一共有59頁\編輯于星期五

……TAATTTCCGAGGAAAACCTCGGAAAAAA反向回文序列反向回文序列終止區(qū)序列+1-10-35轉(zhuǎn)錄區(qū)終止區(qū)啟動(dòng)區(qū)5上游3下游原核基因的結(jié)構(gòu)T80A95t45A60A50T96T82T84G78A65C54a45

ATGttgaca…………tataat…TAA5‘UTR3‘UTRN5-9N17NNNNNNNNNNNN……………現(xiàn)在是27頁\一共有59頁\編輯于星期五原核基因的mRNA結(jié)構(gòu)原核基因的mRNA編碼區(qū)(是連續(xù)不間斷的序列)轉(zhuǎn)錄而不轉(zhuǎn)譯的5-UTR轉(zhuǎn)錄而不轉(zhuǎn)譯的3-UTR現(xiàn)在是28頁\一共有59頁\編輯于星期五真核基因的范圍3.真核基因的結(jié)構(gòu)真核基因(Eukaryoticgene):系指由真核細(xì)胞基因組的編碼基因和感染真核細(xì)胞的DNA病毒及反轉(zhuǎn)錄病毒基因組的編碼基因均屬于真核基因。現(xiàn)在是29頁\一共有59頁\編輯于星期五+1-20-70轉(zhuǎn)錄區(qū)終止區(qū)啟動(dòng)區(qū)-80TATACCAATGC增強(qiáng)子內(nèi)含子剪接點(diǎn)內(nèi)含子剪接點(diǎn)內(nèi)含子真核基因的結(jié)構(gòu)加尾信號(hào)…ggccacaccc…ggccaatct…ggggcatataa………ATGCAACGGGCT…TGTGCTAT5‘UTR…GTCACTCAGgtaagg……catataggccaa……ctgcagTAGCAGCTG……AATAAA3‘UTR現(xiàn)在是30頁\一共有59頁\編輯于星期五真核基因的mRNA結(jié)構(gòu)真核基因的mRNA5端帽的結(jié)構(gòu)5-UTR3端poly(A)尾巴編碼區(qū)3-UTRm7G5’ppp-NmpNp-…AUGCTT…CAACGGUAA…AAUAAA……AAAAAA…5端帽的結(jié)構(gòu)

3端poly(A)尾巴現(xiàn)在是31頁\一共有59頁\編輯于星期五5基因的類型1.根據(jù)產(chǎn)物類型分類結(jié)構(gòu)基因(Structuralgenes)除了調(diào)節(jié)基因以外的編碼任何RNA或蛋白質(zhì)產(chǎn)物的基因。

調(diào)節(jié)基因(Regulatorgenes)其產(chǎn)物能夠控制另外一個(gè)基因或若干基因表達(dá)效率的基因。例如大腸桿菌lac操縱子的laci基因,其編碼蛋白質(zhì)能夠控制lac操縱子結(jié)構(gòu)基因的表達(dá)?,F(xiàn)在是32頁\一共有59頁\編輯于星期五無誘導(dǎo)物時(shí)葡萄糖(+),乳糖(–)結(jié)構(gòu)基因表達(dá)關(guān)閉現(xiàn)在是33頁\一共有59頁\編輯于星期五2.根據(jù)表達(dá)特性組成基因(Constitutivegenes)又叫做看家基因(Housekeepinggene),是一類理論上在所有細(xì)胞類型中都能進(jìn)行表達(dá)、并為所有類型細(xì)胞生存提供必需的基本功能的基因。誘導(dǎo)基因(Induciblegenes)因環(huán)境中某種特殊物質(zhì)的存在而被誘導(dǎo)表達(dá)的基因,叫做“誘導(dǎo)型基因”,簡(jiǎn)稱“誘導(dǎo)基因”?,F(xiàn)在是34頁\一共有59頁\編輯于星期五3.根據(jù)實(shí)驗(yàn)用途選擇基因(Selectablegenes)

是指可使被轉(zhuǎn)化的細(xì)胞獲得其親本細(xì)胞所不具備的新的遺傳特性,從而使得人們能夠使用特定的選擇性培養(yǎng)基,將轉(zhuǎn)化的新細(xì)胞從其親本細(xì)胞群體中選擇出來的一類特殊的基因。

選擇基因主要是一類編碼可使抗菌素(諸如氨芐青霉素、潮霉素、鏈霉素、卡那霉素等)或除草劑失活的蛋白酶基因?,F(xiàn)在是35頁\一共有59頁\編輯于星期五

Amp選擇培養(yǎng)基篩選A.pBridge-GmMYBZ1B.pBridge-GmMYBZ2C.pBridge-GmMYBJ6D.pBridge-GmMYBJ7

D

A

B

C

現(xiàn)在是36頁\一共有59頁\編輯于星期五C

A

B

D

A.CKB.GmMYBZ2C.GmMYBJ6D.GmMYBJ7現(xiàn)在是37頁\一共有59頁\編輯于星期五報(bào)告基因(reportergene)

特指其編碼產(chǎn)物能被快速檢測(cè),常用來判斷外源基因是否已經(jīng)成功地導(dǎo)入寄主細(xì)胞、器官或組織的一類特殊的基因。

常用的報(bào)告基因有氯霉素乙酰轉(zhuǎn)移酶(CAT)基因,-葡萄糖醛酸糖苷酶(GUS)基因,以及綠色熒光蛋白(greenfluorescentprotein,GFP)基因?,F(xiàn)在是38頁\一共有59頁\編輯于星期五promoter-GUSexpressionpattern現(xiàn)在是39頁\一共有59頁\編輯于星期五subcellularlocalizationoftheOsAbc1-2protein現(xiàn)在是40頁\一共有59頁\編輯于星期五3.根據(jù)結(jié)構(gòu)特點(diǎn)斷裂基因(splitgene)編碼序列不連續(xù)的間斷基因,即在其核苷酸序列中間插入了與氨基酸編碼無關(guān)的DNA間隔區(qū),使一個(gè)基因分隔成若干個(gè)不連續(xù)的區(qū)段。現(xiàn)在是41頁\一共有59頁\編輯于星期五splitgene現(xiàn)在是42頁\一共有59頁\編輯于星期五移動(dòng)基因(movablegene)又叫跳躍基因或轉(zhuǎn)位因子,是指一種可以在染色體基因組上移動(dòng),甚至在不同染色體之間、噬菌體及質(zhì)粒DNA之間躍遷的DNA短片段。

1951年由BarbaraMclintock(麥克林托克)首次在玉米中發(fā)現(xiàn)了一種控制元件,后來這個(gè)元件被命名為轉(zhuǎn)座元件或轉(zhuǎn)座子。由此,BarbaraMclintock在1983年獲得了諾貝爾獎(jiǎng)?,F(xiàn)在是43頁\一共有59頁\編輯于星期五特點(diǎn):不必借助同源序列就可移動(dòng)的DNA片段,即轉(zhuǎn)座作用與供體和受體之間的序列無關(guān)。轉(zhuǎn)座序列可沿染色體移動(dòng),也可在不同染色體間跳躍(又稱之為跳躍基因)。原核生物和真核生物均有轉(zhuǎn)座子?,F(xiàn)在是44頁\一共有59頁\編輯于星期五

玉米轉(zhuǎn)座因子對(duì)胚乳顏色的影響紫色無色紫色斑點(diǎn)?現(xiàn)在是45頁\一共有59頁\編輯于星期五假基因(pseudogene)指一類同野生型基因序列大部分同源,但由于突變而失去活性的畸變的核苷酸序列。重疊基因(overlappinggene)又叫嵌套基因(nestedgene)。系指核苷酸編碼序列彼此重疊的、編碼不同蛋白質(zhì)的兩個(gè)或多個(gè)基因。重復(fù)基因(repeatgene)以串聯(lián)方式重復(fù)排列在特定染色體上的某些多拷貝基因。如rRNA基因、tRNA基因等?,F(xiàn)在是46頁\一共有59頁\編輯于星期五6基因的表達(dá)1.正義鏈與反義鏈早期文獻(xiàn):正義鏈(有意義鏈):雙鏈DNA分子中轉(zhuǎn)錄成RNA分子的模板鏈。反義鏈(無意義鏈):與有意義鏈互補(bǔ)的DNA鏈?,F(xiàn)在是47頁\一共有59頁\編輯于星期五現(xiàn)代文獻(xiàn):反義鏈(-鏈):雙鏈DNA分子中轉(zhuǎn)錄成RNA分子的模板鏈。正義鏈(+鏈):雙鏈DNA分子中的編碼鏈。除了以T堿基取代U堿基之外,與RNA轉(zhuǎn)錄本具有同樣的序列結(jié)構(gòu)。現(xiàn)在是48頁\一共有59頁\編輯于星期五2.基因的表達(dá)基因表達(dá):基因通過DNA的轉(zhuǎn)錄和RNA的翻譯等過程,將其所攜帶的遺傳信息轉(zhuǎn)變成蛋白質(zhì)多肽鏈(或RNA轉(zhuǎn)錄本)的過程。定義:現(xiàn)在是49頁\一共有59頁\編輯于星期五組成性表達(dá)(constitutiveexpression)基因表達(dá)的方式

看家基因較少受環(huán)境因素影響,而是在個(gè)體各個(gè)生長(zhǎng)階段的大多數(shù)或幾乎全部組織中持續(xù)表達(dá),或變化很小。這類基因表達(dá)視為基本的或組成性基因表達(dá)?,F(xiàn)在是50頁\一共有59頁\編輯于星期五適應(yīng)型或調(diào)節(jié)型表達(dá)(adaptiveorregulatoryexpression)

有一些基因表達(dá)極易受環(huán)境變化影響而改變,稱為適應(yīng)型或調(diào)節(jié)型表達(dá)。在特定環(huán)境信號(hào)刺激下,相應(yīng)的基因被激活,基因表達(dá)產(chǎn)物增加,這種基因是可誘導(dǎo)的,稱為誘導(dǎo)。相反,如果基因?qū)Νh(huán)境信號(hào)應(yīng)答時(shí)被抑制,基因表達(dá)產(chǎn)物水平降低,稱為阻遏。現(xiàn)在是51頁\一共有59頁\編輯于星期五現(xiàn)在是52頁\一共有59頁\編輯于星期五時(shí)間特異性:按功能需要,某一特定基因的表達(dá)嚴(yán)格按特定的時(shí)間順序發(fā)生,這是基因表達(dá)的時(shí)間特異性。多細(xì)胞生物基因表達(dá)的時(shí)間特異性又稱階段特異性?;虮磉_(dá)的時(shí)間性及空間性空間特異性:在個(gè)體生長(zhǎng)全過程,某種基因產(chǎn)物在個(gè)體按不同組織空間順序出現(xiàn),這就是基因表達(dá)的空間特異性,又稱細(xì)胞特異性或組織特異性。現(xiàn)在是53頁\一共有59頁\編輯于星期五mRNA加工成熟水平上的調(diào)控(differentialprocessingofRNAtranscript)轉(zhuǎn)錄水平上的調(diào)控(transcriptionalregulation)翻譯水平上的調(diào)控(differentialtranslationofmRNA)3.基因的表達(dá)調(diào)控基因表達(dá)的調(diào)控水平DNA水平上的調(diào)控(regulationonDNAlevel)翻譯后水平上的調(diào)控(differentialpost-translationofmRNA)現(xiàn)在是54頁\一共有59頁\編輯于星期五

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