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章核酸的理化性質(zhì)研究方法詳解演示文稿當(dāng)前1頁,總共23頁。(優(yōu)選)章核酸的理化性質(zhì)研究方法當(dāng)前2頁,總共23頁。核酸的化學(xué)結(jié)構(gòu)和作為高聚物決定其理化性質(zhì):核酸的糖苷鍵和磷酸二酯鍵:可被水解;磷酸基和堿基:酸堿性質(zhì);堿基:紫外吸收特性;雙螺旋結(jié)構(gòu):變性和復(fù)性。當(dāng)前3頁,總共23頁。一、核酸的水解(一)酸水解糖苷鍵比磷酸酯鍵更易被酸水解,產(chǎn)生嘌呤和嘧啶堿(二)堿水解RNA的磷酸酯鍵更易被堿水解(RNA的核糖上有2’-OH,在堿作用下形成磷酸三酯,極不穩(wěn)定易水解,產(chǎn)生核苷2’,3’-環(huán)磷酸酯,繼續(xù)水解產(chǎn)生2’-核苷酸和3’-核苷酸)當(dāng)前4頁,總共23頁。(三)酶水解專一水解核酸的磷酸二酯鍵的酶稱為核酸酶(nuclease)。能識別特定的核苷酸順序,并從特定位點(diǎn)水解核酸的內(nèi)切酶稱為限制性核酸內(nèi)切酶(限制酶)。
當(dāng)前5頁,總共23頁。1、核酸酶的分類(1)按底物專一性分類:核糖核酸酶(ribonuclease,RNase):作用于核糖核酸;脫氧核糖核酸酶(deoxyribonuclease,DNase):作用于脫氧核糖核酸;(2)按底物作用的方式分類:核酸外切酶(endonuclease):從多核苷酸鏈的末端開始,逐個將核苷酸切下的酶;核酸內(nèi)切酶(exonuclease):從多核苷酸鏈的內(nèi)部開始水解核酸的酶。當(dāng)前6頁,總共23頁。(3)按磷酸二酯鍵斷裂的方式分類:一種是在3’-OH與磷酸基之間斷裂,其產(chǎn)物是5’-磷酸核苷酸或寡核苷酸,如(1);另一種是在5’-OH與磷酸基之間斷裂,其產(chǎn)物是3’-磷酸核苷酸或寡核苷酸,如(2)。PPPNNN(1)(2)(1)(2)5’3’當(dāng)前7頁,總共23頁。2、核糖核酸酶類牛胰核糖核酸酶、核糖核酸酶T1、核糖核酸酶T2等;3、脫氧核糖核酸酶類牛胰脫氧核糖核酸酶、牛脾脫氧核糖核酸酶、限制性內(nèi)切酶等。4、N-糖苷酶當(dāng)前8頁,總共23頁。核酸酶底物切點(diǎn)產(chǎn)物胰核糖核酸酶RNA內(nèi)切核酸酶嘧啶3’端,留下3’-P3’嘧啶單核苷酸或3’-嘧啶核苷酸結(jié)尾的寡聚核苷酸蛇毒磷酸二酯酶RNA,DNA外切核酸酶3’端,留下3’-OH5’-單核苷酸牛脾磷酸二酯酶RNA,DNA外切核酸酶5’端,留下5’-OH3’-單核苷酸大腸桿菌核酸外切酶Ⅰ單鏈DNA外切核酸酶5’端,留下5’-OH3’-單核苷酸及一個末尾二核苷酸大腸桿菌核酸外切酶Ⅲ雙鏈DNA外切核酸酶3’端,留下3’-OH5’-單核苷酸當(dāng)前9頁,總共23頁。當(dāng)前10頁,總共23頁。二、核酸的酸堿性質(zhì)1、堿基的解離C的N3有一對未共用電子,可與質(zhì)子結(jié)合;C的烯醇式羥基具有釋放質(zhì)子的能力;U的N3酸性解離的pK1’=9.5;T的N3酸性解離的pK1’=9.9;A的N1pK1’=4.15G的N7pK1’=3.2
N1pK2’=9.6;N9pK3’=12.4當(dāng)前11頁,總共23頁。2、核苷的解離戊糖的存在增強(qiáng)了堿基的酸性解離:A的N1pK1’由4.15降為3.63;C的pK1’由4.6降為4.15;當(dāng)前12頁,總共23頁。3、核苷酸的解離HpK1’=1.5當(dāng)前13頁,總共23頁。核苷酸有磷酸與堿基,為兩性電介質(zhì);U的堿基堿性極弱,不能形成兼性離子;A,G,C中,pK1’:第一磷酸基-PO3H2的解離;pK2’:含氮環(huán)=N+H-的解離;pK3’:第二磷酸基-PO3H-的解離;故其pI=(pK1’
+pK2’)/2DNA變性雙鏈打開后,堿基即參與酸堿滴定。
當(dāng)前14頁,總共23頁。三、核酸的紫外吸收Py和Pu有共軛雙鍵,使堿基、核苷、核苷酸和核酸能吸收紫外光,最大吸收峰為260nm。不同核苷酸當(dāng)前15頁,總共23頁。A260=εCL公式中,A260為光密度
ε,為260nm處的堿苦摩爾消光系數(shù)
C,為每升溶液中堿基的摩爾數(shù)
L,為比色杯內(nèi)徑的厚度如:已知鳥嘌呤溶液的A260=0.325,
ε=7.2X103,L=1cm,則:C=0.325/(7.2X103X1)=4.5X10-5(mol/l)紫外光區(qū)最大吸收:260nm,定性定量分析當(dāng)前16頁,總共23頁。第五節(jié)DNA的理化性質(zhì)及其應(yīng)用一、核酸的一般理化性質(zhì)核酸具有酸性;粘度大;當(dāng)前17頁,總共23頁。二、DNA的變性
在理化因素作用下,DNA雙螺旋的兩條互補(bǔ)鏈松散而分開成為單鏈,從而導(dǎo)致DNA的理化性質(zhì)及生物學(xué)性質(zhì)發(fā)生改變,這種現(xiàn)象稱為DNA的變性(denaturation)
。變性時維持雙螺旋穩(wěn)定性的氫鍵斷裂,堿基間的堆積力遭到破壞,但不涉及到其一級結(jié)構(gòu)的改變。
當(dāng)前18頁,總共23頁。①增色效應(yīng):指DNA變性后對260nm紫外光的光吸收度增加的現(xiàn)象;②旋光性下降;③粘度降低;④生物學(xué)功能喪失或改變。引起DNA變性的因素主要有:①高溫,②強(qiáng)酸、強(qiáng)堿,③有機(jī)溶劑等。DNA變性后的性質(zhì)改變:
當(dāng)前19頁,總共23頁。
DNA的變性溫度:加熱DNA溶液,使其對260nm紫外光的吸收度突然增加,達(dá)到其最大值一半時的溫度,就是DNA的變性溫度(融解溫度,Tm)。當(dāng)前20頁,總共23頁。
Tm的高低與DNA分子中G+C的含量有關(guān),G+C的含量越高,則Tm越高。Tm=69.3+0.41(%G+C)12nd當(dāng)前21頁,總共23頁。三、DNA的復(fù)性與分子雜交將熱變性后的DNA溶液緩慢冷卻,在低于變性溫
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