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歡迎歡迎蛋白質(zhì)的生物合成(翻譯)
ProteinBiosynthesis,Translation第六章基因表達(dá)中的信息流中心法則(TheCentralDogma)
蛋白質(zhì)生物合成中的三大發(fā)現(xiàn)PaulZamecnik
核糖體是蛋白質(zhì)生物合成的場(chǎng)所MahlonHoagland發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)運(yùn)RNA(tRNA)FrancisCrick
提出tRNA應(yīng)接器假說(shuō)遺傳密碼一.密碼的破譯二.密碼的性質(zhì)簡(jiǎn)并性擺動(dòng)性通用性偏愛(ài)性一.遺傳密碼——三聯(lián)子
mRNA上每3個(gè)核苷酸翻譯成蛋白質(zhì)多肽鏈上的一個(gè)氨基酸,這3個(gè)核苷酸就稱為一個(gè)密碼,也叫三聯(lián)子密碼。翻譯時(shí)從起始密碼子AUG開(kāi)始,沿mRNA5’→3’的方向連續(xù)閱讀直到終止密碼子,生成一條具有特定序列的多肽鏈。
mRNA中只有4種核苷酸,而蛋白質(zhì)中有20種氨基酸,若以一種核苷酸代表一種氨基酸,只能代表4種(41=4)。若以兩種核苷酸作為一個(gè)密碼(二聯(lián)子),能代表42=16種氨基酸。而假定以3個(gè)核苷酸代表一個(gè)氨基酸,則可以有43=64種密碼,滿足了編碼20種氨基酸的需要。FrancisCrick等人第一次證實(shí)只有用三聯(lián)子密碼的形式才能把包含在由AUGC四個(gè)字母組成遺傳信息(核酸)準(zhǔn)確無(wú)誤地翻譯成由20種不同氨基酸組成的蛋白質(zhì)序列,實(shí)現(xiàn)遺傳信息的表達(dá)。
實(shí)驗(yàn)1:
用吖啶類(lèi)試劑(誘導(dǎo)核苷酸插入或丟失)處理T4噬菌體rII位點(diǎn)上的兩個(gè)基因,使之發(fā)生移碼突變(frame-shift),就生成完全不同的、沒(méi)有功能的蛋白質(zhì)。
實(shí)驗(yàn)2:
研究煙草壞死衛(wèi)星病毒發(fā)現(xiàn),其外殼蛋白亞基由400個(gè)氨基酸組成,相應(yīng)的RNA片段長(zhǎng)1200個(gè)核苷酸,與密碼三聯(lián)子體系正好相吻合。遺傳密碼子的破譯實(shí)驗(yàn)3:
以均聚物為模板指導(dǎo)多肽的合成。在含有tRNA、核糖體、AA-tRNA合成酶及其它蛋白質(zhì)因子的細(xì)胞抽提物中加入mRNA或人工合成的均聚物作為模板以及ATP、GTP、氨基酸等成分時(shí)又能合成新的肽鏈,新生肽鏈的氨基酸順序由外加的模板來(lái)決定。
1961年,Nirenberg等以poly(U)作模板時(shí)發(fā)現(xiàn)合成了多聚苯丙氨酸,從而推出UUU代表苯丙氨酸(Phe)。以poly(C)及poly(A)做模板分別得到多聚脯氨酸和多聚賴氨酸。體外翻譯系統(tǒng)尼倫伯格(.M.W.Nirenberg)ATP、GTP、AA*體外翻譯系統(tǒng)以poly(G)作模板時(shí),多聚G中的鳥(niǎo)苷酸殘基以氫鍵牢固的彼此結(jié)合成三股螺旋,防礙其與核糖體結(jié)合,所以用多聚核苷酸的方式無(wú)法判斷出GGG所編碼的氨基酸.實(shí)驗(yàn)4:
以特定序列的共聚物為模板指導(dǎo)多肽的合成。以多聚二核苷酸作模板可合成由2個(gè)氨基酸組成的多肽,
5'…UGUGUGUGUGUGUGUGUG…3',不管讀碼從U開(kāi)始還是從G開(kāi)始,都只能有UGU(Cys)及GUG(Val)兩種密碼子。實(shí)驗(yàn)5:
以共聚三核苷酸作為模板可得到有3種氨基酸組成的多肽。如以多聚(UUC)為模板,可能有3種起讀方式:
5’…UUCUUCUUCUUCUUC…3’或5’…UCUUCUUCUUCUUCU…3’或5'…CUUCUUCUUCUUCUU…3'分別產(chǎn)生UUC(Phe)、UCU(Ser)或CUU(Leu).
多聚三核苷酸為模板時(shí)也可能只合成2種多肽:5’…GUAGUAGUAGUAGUA…3’或5’…UAGUAGUAGUAGUAG…3’
或5’…AGUAGUAGUAGUAGU…3’由第二種讀碼方式產(chǎn)生的密碼子UAG是終止密碼,不編碼任何氨基酸,因此,只產(chǎn)生GUA(Val)或AGU(Ser)。氨基酸的“活化”與核糖體結(jié)合技術(shù)。
如果把氨基酸與ATP和肝臟細(xì)胞質(zhì)共培養(yǎng),氨基酸就會(huì)被固定在某些熱穩(wěn)定且可溶性RNA分子(transferRNA,tRNA)上?,F(xiàn)將氨基酸活化后的產(chǎn)物稱為氨基酰-tRNA(aminoacyl-tRNA),并把催化該過(guò)程的酶稱為氨基酰合成酶(aminoacyl-tRNASynthetase)。以人工合成的三核苷酸如UUU、UCU、UGU等為模板,在含核糖體、AA-tRNA的反應(yīng)液中保溫后通過(guò)硝酸纖維素濾膜,只有游離的AA-tRNA因相對(duì)分子質(zhì)量小而通過(guò)濾膜,而核糖體或與核糖體結(jié)合的AA-tRNA則留在濾膜上,這樣可把已結(jié)合與未結(jié)合的AA-tRNA分開(kāi)。
核苷酸結(jié)合技術(shù)AUGUGAUAAUAG遺傳密碼的性質(zhì)1.連續(xù)性(commaless)2.簡(jiǎn)并性(degeneracy)3.通用性(universal)4.擺動(dòng)性(wobble)5.偏愛(ài)性(bias)1.連續(xù)性(commaless)
編碼蛋白質(zhì)氨基酸序列的各個(gè)三聯(lián)體密碼連續(xù)閱讀,密碼間既無(wú)間斷也無(wú)交叉。連續(xù)性和方向性:兩個(gè)密碼子之間無(wú)任何核苷酸加以隔開(kāi)和重疊,如插入/刪除堿基,可發(fā)生移碼突變或框移遺傳密碼的特點(diǎn)5′….UACGGACAUCUG….3′5′….UACCGGACAUCUG….3′酪甘組蛋酪精蘇半胱5′….UACGACAUCUG….3′酪天異亮插入缺失遺傳密碼的連續(xù)性沿5/-3/方向連續(xù)閱讀插入堿基缺失堿基移碼突變酪酪酪蘇蘇蘇亮亮亮5’-U-A-C-U-A-C-U-A-C-U-A-C-3’5’-U-A-C-U-A-C-U-A-C-U-A-C-3’5’-U-A-C-U-A-C-U-A-C-U-A-C-3’2.簡(jiǎn)并性(degeneracy)多數(shù)氨基酸都具有一個(gè)以上的密碼子,密碼子的這種特性就稱為密碼子的簡(jiǎn)并性.編碼相同氨基酸的密碼子稱為密碼子家族(codonfamily),其成員互稱為同義密碼子(synonymouscodons).遺傳密碼中,除色氨酸和甲硫氨酸僅有一個(gè)密碼子外,其余氨基酸有2、3、4個(gè)或多至6個(gè)三聯(lián)體為其編碼。起始密碼子:AUG終止密碼子:UAA,UAG,UGA密碼子的使用頻率★簡(jiǎn)并性的生物學(xué)意義?可以降低由于遺傳密碼突變?cè)斐傻臑?zāi)難性后果假如每種氨基酸只有一個(gè)密碼子,那么剩下的44個(gè)密碼子都成了終止子,如果一旦哪個(gè)氨基酸的密碼子發(fā)生了單堿基的點(diǎn)突變,那么極有可能造成肽鏈合成的過(guò)早終止。如GUN編碼Ala,由于簡(jiǎn)并性的存在,不論第三位的U變成什么,都仍然編碼Ala3.擺動(dòng)性(wobble)轉(zhuǎn)運(yùn)氨基酸的tRNA的反密碼需要通過(guò)堿基互補(bǔ)與mRNA上的遺傳密碼反向配對(duì)結(jié)合,但反密碼與密碼間不嚴(yán)格遵守常見(jiàn)的堿基配對(duì)規(guī)律,稱為擺動(dòng)配對(duì)。密碼子反密碼子3’3’123321密碼子、反密碼子配對(duì)的擺動(dòng)現(xiàn)象tRNA反密碼子第1位堿基IUGACmRNA密碼子第3位堿基U,C,AA,GU,CUGWobblehypothesis①任意一個(gè)密碼子的前兩位堿基都與tRNAanticodon中的相應(yīng)堿基形成Watson-Crick堿基配對(duì)。②反密碼子第一位是A或C時(shí),只能識(shí)別一個(gè)密碼子。當(dāng)反密碼子第一位是U或G時(shí),能識(shí)別兩個(gè)密碼子。當(dāng)Inosine(I)作為反密碼子第一位時(shí),能識(shí)別三個(gè)密碼子。③如果數(shù)個(gè)密碼子同時(shí)編碼一個(gè)氨基酸,凡是第一、二位堿基不相同的密碼子都對(duì)應(yīng)于各自的tRNA。如UUA和CUU都編碼亮氨酸,但它們卻有各自的tRNA.4.通用性(universal)蛋白質(zhì)生物合成的整套密碼,從原核生物到人類(lèi)都通用。已發(fā)現(xiàn)少數(shù)例外,如動(dòng)物細(xì)胞的線粒體、植物細(xì)胞的葉綠體。密碼的通用性進(jìn)一步證明各種生物進(jìn)化自同一祖先。5.遺傳密碼的偏愛(ài)性多數(shù)氨基酸有一個(gè)以上的密碼子,但這些密碼子的使用頻率各不相同,稱之為遺傳密碼的偏愛(ài)性.原核生物和真核生物有各自的密碼子偏愛(ài)性.基因工程指導(dǎo)原則,使人工合成的基因片段在細(xì)胞內(nèi)高效表達(dá).第二節(jié)蛋白質(zhì)的生物合成一生物合成的模板----mRNA二合成場(chǎng)所----核糖體三蛋白質(zhì)生物合成的機(jī)制四蛋白質(zhì)生物合成的調(diào)節(jié)參與蛋白質(zhì)生物合成的物質(zhì)*蛋白質(zhì)生物合成體系
模板:mRNA
原料:20種編碼氨基酸氨基酸運(yùn)載體:tRNA
場(chǎng)所:核蛋白體酶:氨基酰-tRNA合成酶、轉(zhuǎn)肽酶蛋白質(zhì)因子:IF、EF、RF
能量(ATP、GTP)無(wú)機(jī)離子(Mg2+、Mn2+)從mRNA5端起始密碼子AUG到3端終止密碼子之間的核苷酸序列,各個(gè)三聯(lián)體密碼連續(xù)排列編碼一個(gè)蛋白質(zhì)多肽鏈,稱為開(kāi)放閱讀框(openreadingframe,ORF)。AUGUAAORF一、mRNA是翻譯的直接模板原核生物的多順?lè)醋诱婧松锏膯雾樂(lè)醋臃蔷幋a序列核蛋白體結(jié)合位點(diǎn)起始密碼子終止密碼子編碼序列PPP53蛋白質(zhì)PPPmG-53蛋白質(zhì)SD序列原核生物mRNA的起始密碼子AUG上游8-13個(gè)核苷酸以外有一段
5’-UAAGGAGG-3’的保守核苷酸序列,成為SD序列(Shine-DalgarnoSequence).SD序列是mRNA和核糖體識(shí)別,結(jié)合的位點(diǎn).它能夠與細(xì)菌核糖體小亞基16SrRNA的3’-AUUCCUCC-5’保守序列反向互補(bǔ),從而使核糖體借此判定mRNA的翻譯起始位點(diǎn).Kozak序列真核生物的mRNA沒(méi)有SD序列,核糖體小亞基識(shí)別5’端帽子結(jié)構(gòu),隨后移動(dòng)到起始密碼子處.起始密碼子常處于-GCCACCAUGG-序列中,這段保守序列的存在能增加翻譯起始的效率,這段序列稱為Kozak序列.核糖體像一個(gè)能沿mRNA模板移動(dòng)的工廠,執(zhí)行著蛋白質(zhì)合成的功能。它是由幾十種蛋白質(zhì)和幾種核糖體RNA(ribosomalRNA,rRNA)組成的亞細(xì)胞顆粒。一個(gè)細(xì)菌細(xì)胞內(nèi)約有20000個(gè)核糖體,而真核細(xì)胞內(nèi)可達(dá)106個(gè),在未成熟的蟾蜍卵細(xì)胞內(nèi)則高達(dá)1012
。核糖體和它的輔助因子為蛋白質(zhì)合成提供了必要條件。二、核蛋白體是肽鏈合成的場(chǎng)所核糖體的組成
原核生物核糖體由約2/3的RNA及1/3的蛋白質(zhì)組成。真核生物核糖體中RNA占3/5,蛋白質(zhì)占2/5。核糖體是一個(gè)致密的核糖核蛋白顆粒,可以解離為兩個(gè)亞基,每個(gè)亞基都含有一個(gè)相對(duì)分子質(zhì)量較大的rRNA和許多不同的蛋白質(zhì)分子。
大腸桿菌核糖體小亞基由21種蛋白質(zhì)組成,分別用S1……S21表示,大亞基由33種蛋白質(zhì)組成,分別用L1……L33表示。真核生物細(xì)胞核糖體大亞基含有49種蛋白質(zhì),小亞基有33種蛋白質(zhì)。
原核生物16S21種
23S5S31種真核生物49種28S5.8S5S18S33種rRNA蛋白質(zhì)小亞基大亞基
(50S)(30S)(40S)
(60S)小亞基大亞基70S80S30S核糖體亞基結(jié)構(gòu)包括頭(head)、基部(base)、平臺(tái)(platform)以及縫隙(cleft)等;50S核糖體亞基的結(jié)構(gòu)包括中央突(centralprotuberance)、莖(stalk)、嵴(ridge)以及谷(valley)等。核糖體30S小亞基的平臺(tái)伸入到50S大亞基的谷中而嵌和在一起。游離狀態(tài)和蛋白質(zhì)合成過(guò)程中的核糖體結(jié)構(gòu)有區(qū)別,說(shuō)明核糖體的結(jié)構(gòu)在蛋白質(zhì)合成過(guò)程中有一定的靈活性。頭基部縫隙平臺(tái)中央突莖谷脊核糖體的功能中心是富含RNA的,亞基相互作用的主要位點(diǎn)也是由RNA組成,而核糖體蛋白只在一些小的和更外周的位點(diǎn)形成中發(fā)揮作用。解碼位點(diǎn)和肽酰轉(zhuǎn)移酶中心都沒(méi)有蛋白成分?,F(xiàn)在已經(jīng)確定,距離肽酰轉(zhuǎn)移酶中心最近的核糖體蛋白沒(méi)有催化作用,它們的功能主要是維持活性位點(diǎn)的構(gòu)象。盡管核糖體的解碼和肽酰轉(zhuǎn)移酶中心以RNA為主,核糖體蛋白也發(fā)揮著非常重要的作用。沒(méi)有了蛋白成分,核糖體既不能裝配也不會(huì)發(fā)揮其功能?,F(xiàn)在發(fā)現(xiàn)在翻譯的各階段均有rRNA的參與,rRNA的正確結(jié)構(gòu)是蛋白質(zhì)發(fā)揮催化功能所必需的。在翻譯起始過(guò)程中,rRNA的3’端直接與mRNA作用;16SrRNA在A和P位直接與反密碼子作用;23SrRNA與肽酰-tRNA的CCA端直接作用;大小亞基的結(jié)合可能涉及到16S和23SrRNA間的堿基配對(duì)關(guān)系。在翻譯的各個(gè)階段,抑制翻譯的抗生素幾乎都作用于rRNA,說(shuō)明了rRNA的重要性。
rRNA的分子結(jié)構(gòu)基本上都是由部分雙螺旋與部分突環(huán)相間排列而成。16SrRNA二級(jí)結(jié)構(gòu)A位點(diǎn)需要與mRNA互補(bǔ)核糖體的功能活性中心:即mRNA結(jié)合部位、結(jié)合或接受AA-tRNA部位(A位)結(jié)合或接受肽基tRNA的部位(P位)空載tRNA脫離核蛋白體前的結(jié)合位點(diǎn)(E位)形成肽鍵的部位(轉(zhuǎn)肽酶中心)此外還有負(fù)責(zé)肽鏈延伸的各種延伸因子的結(jié)合位點(diǎn)。1.三個(gè)與tRNA結(jié)合的位點(diǎn):⑴A位:又稱受位或氨基酰tRNA結(jié)合部位,可與新進(jìn)入的氨基酰tRNA結(jié)合;由大、小亞基成分構(gòu)成。⑵P位:又稱給位或肽?;鵷RNA結(jié)合部位,可與延伸中的肽?;鵷RNA結(jié)合;由大、小亞基成分構(gòu)成。⑶E位:又稱排出位,空載tRNA脫離核蛋白體前的結(jié)合位點(diǎn);主要由大亞基成分構(gòu)成。原核生物翻譯過(guò)程中核蛋白體結(jié)構(gòu)模式:A位:氨基酰位(aminoacylsite)P位:肽酰位(peptidylsite)E位:排出位(exitsite)
每種氨基酸都有2~6種相應(yīng)的tRNA,書(shū)寫(xiě)時(shí)在右上角注上氨基酸縮寫(xiě)符號(hào),如tRNAPhe代表轉(zhuǎn)運(yùn)苯丙氨酸的tRNA。tRNA由70~90個(gè)核苷酸組成,二級(jí)結(jié)構(gòu)呈三葉草形(cloverleaf)。雙螺旋區(qū)構(gòu)成了葉柄,突環(huán)(loop)區(qū)好像是三葉草的三片小葉。由于雙螺旋結(jié)構(gòu)所占比例甚高,tRNA的二級(jí)結(jié)構(gòu)十分穩(wěn)定。三葉草形結(jié)構(gòu)由氨基酸臂、二氫尿嘧啶環(huán)、反密碼環(huán)、額外環(huán)和TφC環(huán)等五部分組成。三、氨基酸轉(zhuǎn)運(yùn)工具--tRNA“L”形三級(jí)結(jié)構(gòu)
三葉草型的二級(jí)結(jié)構(gòu)可折疊成倒L-型的三維結(jié)構(gòu)。tRNA的種類(lèi)(1)起始tRNA和延伸tRNA
能特異地識(shí)別mRNA模板上起始密碼子的tRNA叫起始tRNA,其他tRNA統(tǒng)稱為延伸tRNA。原核生物起始tRNA攜帶甲酰甲硫氨酸(fMet),真核生物起始tRNA攜帶甲硫氨酸(Met)。(2)同工tRNA
代表同一種氨基酸的tRNA稱為同工tRNA,同工tRNA既要有不同的反密碼子以識(shí)別該氨基酸的各種同義密碼,又要有某種結(jié)構(gòu)上的共同性,能被AA-tRNA合成酶識(shí)別。四.氨基酰-tRNA合成酶(aminoacyl-tRNAsynthetase)氨基酸+tRNA氨基酰-tRNAATP
AMP+PPi氨基酰-tRNA合成酶第一步反應(yīng)氨基酸+ATP-E—→氨基酰-AMP-E
+PPi
第二步反應(yīng)氨基酰-AMP-E+
tRNA↓
氨基酰-tRNA+AMP
+
E氨基酸的活化EEAAEAAtRNAAAEtRNAAAEtRNAAA氨基酸ATP+氨酰腺苷酸E-AMPPPi第一步AMP第二步E氨基酸的活化3-氨酰-tRNA氨酰-tRNA合成酶特點(diǎn)
a、專(zhuān)一性:
對(duì)氨基酸有極高的專(zhuān)一性,每種氨基酸都有專(zhuān)一的酶,只作用于L-氨基酸,不作用于D-氨基酸。
對(duì)tRNA具有專(zhuān)一性。
b、校對(duì)作用:氨酰-tRNA合成酶的水解部位可以水解錯(cuò)誤活化的氨基酸。五.蛋白質(zhì)因子原核生物起始因子IF(initiationfactor)和真核生物起始因子eIF(eukaryoticinitiationfactor)延伸因子EF(elogationfactor)釋放因子RF(releasefactor)蛋白質(zhì)的生物合成過(guò)程翻譯過(guò)程分為三個(gè)階段一、翻譯的起始二、翻譯的延長(zhǎng)三、翻譯的終止以原核生物為例
一、原核生物的翻譯過(guò)程(一)起始階段1.核蛋白體大小亞基分離;2.mRNA與小亞基結(jié)合;3.起始氨基酰-tRNA與小亞基結(jié)合;4.核蛋白體大亞基結(jié)合;(一)翻譯的起始
翻譯起始是把帶有甲酰甲硫氨酸的起始tRNA連同mRNA結(jié)合到核蛋白體上,生成翻譯起始復(fù)合物(translationalinitiationcomplex),此過(guò)程需要多種起始因子的參與。IF-3IF-11.核蛋白體大小亞基分離目錄IF-1和IF-3與小亞基結(jié)合,促進(jìn)核蛋白體大、小亞基拆離,為新一輪合成作準(zhǔn)備。AUG5'3'IF-3IF-12.mRNA在小亞基定位結(jié)合目錄原核mRNA的起始部位由一段富含嘌呤的特殊核苷酸順序組成,稱為S-D序列(核蛋白體結(jié)合位點(diǎn),RBS)。而原核16SrRNA存在一段富含嘧啶的序列,二者之間可通過(guò)堿基配對(duì),使mRNA與核蛋白體小亞基結(jié)合。IF-3IF-1IF-2GTP3.起始氨基酰tRNA(fMet-tRNAimet)結(jié)合到小亞基AUG5'3'目錄起始fMet-tRNAimet以及IF2-GTP一起,識(shí)別結(jié)合小亞基P位,并對(duì)應(yīng)模板mRNA的起始密碼AUG。IF-3IF-1IF-2GTPGDPPi4.核蛋白體大亞基結(jié)合,起始復(fù)合物形成AUG5'3'目錄IF2結(jié)合的GTP被水解,三種IF脫離,50S大亞基與30S小亞基、模板mRNA以及起始fMet-tRNAifMet構(gòu)成起始復(fù)合體。IF-3IF-1AUG5'3'IF-2GTPIF-2-GTPGDPPi目錄真核生物翻譯起始復(fù)合物形成60S40S
eIF-2BeIF-3eIF-6①60S40SeIF-3②Met40SMet40SMet40SMetmRNA③④eIF-5Met-tRNAiMet-eIF-2-GTPATPADP+PieIF4E,eIF4G,eIF4B,eIF4A,PABp各種eIF釋放ADP+Pi原核、真核生物各種起始因子的生物功能(二)延長(zhǎng)階段
肽鏈延長(zhǎng)在核蛋白體上連續(xù)性循環(huán)式進(jìn)行,又稱為核蛋白體循環(huán),每次循環(huán)增加一個(gè)氨基酸,包括以下三步:1.進(jìn)位(entrance)(注冊(cè))2.成肽(peptidebondformation)3.轉(zhuǎn)位(translocation)肽鏈延伸也可被分為三步:
第一步,與新進(jìn)來(lái)的氨基酰-tRNA相結(jié)合。氨基酰-tRNA首先必須與GTP-EF-Tu復(fù)合物相結(jié)合,形成氨基酰-tRNA-GTP-EF-Tu復(fù)合物并與70S中的A位點(diǎn)相結(jié)合。此時(shí),GTP水解并釋放GDP-EF-Tu復(fù)合物。
第二步,肽鍵形成。肽鍵形成之初,兩個(gè)氨基酸仍然分別與各自的tRNA相結(jié)合,仍然分別位于A位點(diǎn)和P位點(diǎn)上。A位點(diǎn)上的氨基酸(第二個(gè)氨基酸)中的α-氨基作為親核基團(tuán)取代了P位點(diǎn)上的tRNA,并與起始氨基酸中的COOH基團(tuán)形成肽鍵。本反應(yīng)可能由peptidyltransferase催化。
第三步,移位(translocation)。核糖體向mRNA的3’方向移動(dòng)一個(gè)密碼子,使得帶有第二個(gè)氨基酸(現(xiàn)已成為二肽)的tRNA從A位進(jìn)入P位,并使第一個(gè)tRNA從P位進(jìn)入E位。此時(shí)模板上的第三個(gè)密碼子正好在A位上。核糖體的移位需要EF-G(translocase)和另一分子GTP水解提供能量。原核延長(zhǎng)因子生物功能對(duì)應(yīng)真核延長(zhǎng)因子EF-Tu促進(jìn)氨基酰-tRNA進(jìn)入A位,結(jié)合分解GTPEF-1-αEF-Ts調(diào)節(jié)亞基EF-1-βγEFG有轉(zhuǎn)位酶活性,促進(jìn)mRNA-肽酰-tRNA由A位前移到P位,促進(jìn)卸載tRNA釋放EF-2肽鏈合成的延長(zhǎng)因子TuTsGTPGDPAUG5'3'TuTsGTP目錄(一)注冊(cè)(二)成肽A、P位的氨基酸形成肽鍵transpeptidasePAPAP位上tRNAimet所攜帶的甲酰甲硫氨酰(fmet)轉(zhuǎn)移到A位,與A位上的氨基酸形成肽鍵P位上無(wú)負(fù)載的tRNA生成的二肽酰-tRNA在A位(三)轉(zhuǎn)位由轉(zhuǎn)位酶(translocase;活性存在于EF-G)催化,核蛋白體向mRNA的3’端移動(dòng)相當(dāng)于一個(gè)密碼子的距離,原有帶肽鏈的tRNA由A位轉(zhuǎn)移至P位,mRNA分子第三個(gè)密碼子定位于A位,空著的A位等待接受下一個(gè)氨基酰-tRNA
PAPA1223fMetAUG5'3'fMetTuGTP目錄進(jìn)位轉(zhuǎn)位成肽*肽鏈延伸方向:N端C端進(jìn)位TuTsGTP是指根據(jù)mRNA下一組遺傳密碼指導(dǎo),使氨基酰-tRNA進(jìn)入核蛋白體A位fMetGTPTuGDPTsGTPfMetE位fMet成肽是轉(zhuǎn)肽酶催化的肽鍵形成的過(guò)程E位fMet轉(zhuǎn)位在轉(zhuǎn)位酶的作用下,促進(jìn)核蛋白體向mRNA的3‘測(cè)移動(dòng),使肽酰tRNA和mRNA相對(duì)位移進(jìn)入核蛋白體P位,而卸載的tRNA進(jìn)入E位E位fMetAA3TuGTP轉(zhuǎn)位mRNAPA氨酰tRNAAUGPAmRNAPAmRNA肽鍵PAmRNAPAmRNAPAmRNAPAmRNAPAmRNAPAmRNAPAmRNAPAmRNAUGA多肽鏈真核生物肽鏈的延伸
真核生物的在延伸階段的反應(yīng)也是不斷地經(jīng)歷進(jìn)位、轉(zhuǎn)肽和移位的循環(huán),只是由eEF-1代替了原核系統(tǒng)中的EF-Tu和EF-Ts,eEF-2代替了EF-G,轉(zhuǎn)肽酶的活性可能由核糖體蛋白提供。真菌還需要第三種延伸因子eEF-3,該延伸因子的作用是維持翻譯的忠實(shí)性。在真核生物中,肽鏈延伸的速度低于原核生物,大概是每秒鐘摻入2個(gè)氨基酸。原核生物釋放因子:RF-1,RF-2,RF-3識(shí)別終止密碼,如RF-1特異識(shí)別UAA、UAG;而RF-2可識(shí)別UAA、UGA。激活核糖體水解肽酰-tRNA的酯鍵,釋放多肽鏈并是翻譯復(fù)合物解體。(三)終止階段肽鏈合成的終止及釋放
(1)釋放因子RF1或RF2進(jìn)入核糖體A位。(2)多肽鏈的釋放(3)70S核糖體解離53UAG30S亞基50S亞基5
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