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第十二章DNA的復(fù)制和修復(fù)
本章重點(diǎn)介紹遺傳中心法則和DNA的半保留復(fù)制以及逆轉(zhuǎn)錄的過程和機(jī)理,對(duì)DNA的損傷和修復(fù)、突變和重組作一般介紹。
返回思考
DNA是絕大多數(shù)生物體遺傳信息的載體,繼1953年Watson&Crick提出DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)模型后,1958年,Crick提出了“中心法則”(Centraldogma)揭示了遺傳信息的傳遞規(guī)律。第十二章DNA的復(fù)制和修復(fù)返回思考遺傳信息傳遞的中心法則
蛋白質(zhì)翻譯轉(zhuǎn)錄逆轉(zhuǎn)錄復(fù)制復(fù)制DNARNA生物的遺傳信息以密碼的形式儲(chǔ)存在DNA分子上,表現(xiàn)為特定的核苷酸排列順序。在細(xì)胞分裂的過程中,通過DNA復(fù)制把親代細(xì)胞所含的遺傳信息忠實(shí)地傳遞給兩個(gè)子代細(xì)胞。在子代細(xì)胞的生長(zhǎng)發(fā)育過程中,這些遺傳信息通過轉(zhuǎn)錄傳遞給RNA,再由RNA通過翻譯轉(zhuǎn)變成相應(yīng)的蛋白質(zhì)多肽鏈上的氨基酸排列順序,由蛋白質(zhì)執(zhí)行各種各樣的生物學(xué)功能,使后代表現(xiàn)出與親代相似的遺傳特征。后來(lái)人們又發(fā)現(xiàn),在宿主細(xì)胞中一些RNA病毒能以自己的RNA為模板復(fù)制出新的病毒RNA,還有一些RNA病毒能以其RNA為模板合成DNA,稱為逆轉(zhuǎn)錄這是中心法則的補(bǔ)充。
中心法則總結(jié)了生物體內(nèi)遺傳信息的流動(dòng)規(guī)律,揭示遺傳的分子基礎(chǔ),不僅使人們對(duì)細(xì)胞的生長(zhǎng)、發(fā)育、遺傳、變異等生命現(xiàn)象有了更深刻的認(rèn)識(shí),而且以這方面的理論和技術(shù)為基礎(chǔ)發(fā)展了基因工程,給人類的生產(chǎn)和生活帶來(lái)了深刻的革命。遺傳信息傳遞的中心法則
蛋白質(zhì)翻譯轉(zhuǎn)錄逆轉(zhuǎn)錄復(fù)制復(fù)制DNA目錄第一節(jié)DNA的復(fù)制(DNA指導(dǎo)下的DNA合成)第二節(jié)DNA的損傷與修復(fù)第三節(jié)DNA突變第四節(jié)逆轉(zhuǎn)錄作用(RNA指導(dǎo)下的DNA的合成)第五節(jié)DNA的遺傳重組目錄第一節(jié)DNA的復(fù)制(DNA指導(dǎo)下的DNA合第一節(jié)DNA的半保留復(fù)制
一、概念和實(shí)驗(yàn)依據(jù)二、DNA聚合反應(yīng)有關(guān)的酶類三、DNA的復(fù)制的起始點(diǎn)和方式四、原核細(xì)胞DNA的復(fù)制過程五、DNA復(fù)制的忠實(shí)性六、真核細(xì)胞DNA的復(fù)制
第一節(jié)DNA的半保留復(fù)制
一、概念和實(shí)驗(yàn)依據(jù)DNA的半保留復(fù)制的概念
DNA在復(fù)制時(shí),兩條鏈解開分別作為模板,在DNA聚合酶的催化下按堿基互補(bǔ)的原則合成兩條與模板鏈互補(bǔ)的新鏈,以組成新的DNA分子。這樣新形成的兩個(gè)DNA分子與親代DNA分子的堿基順序完全一樣。由于子代DNA分子中一條鏈來(lái)自親代,另一條鏈?zhǔn)切潞铣傻?,這種復(fù)制方式稱為半保留復(fù)制。DNA的半保留復(fù)制的概念
DNA在復(fù)制時(shí),兩DNA的半保留復(fù)制實(shí)驗(yàn)依據(jù)
1958年Meselson&stahl用同位素示蹤標(biāo)記加密度梯度離心技術(shù)實(shí)驗(yàn),證明了DNA是采取半保留的方式進(jìn)行復(fù)制.[15N]DNA[14N-15N]DNA[14N]DNA[14N-15N]DNADNA的半保留復(fù)制實(shí)驗(yàn)依據(jù)1958年Meselson復(fù)制中的大腸桿菌染色體放射自顯影圖
(Cairns實(shí)驗(yàn))將3H-胸苷標(biāo)記大腸桿菌DNA,經(jīng)過近兩代的時(shí)間,3H-胸苷摻入大腸桿菌DNA。用溶菌酶把細(xì)胞壁消化掉,使完整的大腸桿菌染色體DNA釋放出來(lái),放射自顯影,得到上圖。非復(fù)制部分(C)銀粒子密度較低,由一股放射性鏈和一股非放射性鏈構(gòu)成。已復(fù)制部分站整個(gè)染色體的三分之二,其中一條雙鏈(B)僅有一股鏈?zhǔn)菢?biāo)記的,另外一股雙鏈(A)的兩股鏈都是標(biāo)記的,銀粒子密度為前二者的兩倍。染色體全長(zhǎng)約為1100微米。ABC環(huán)狀DNA的復(fù)制ABC復(fù)制中的大腸桿菌染色體放射自顯影圖
(Cairns實(shí)驗(yàn))原核生物DNA聚合反應(yīng)有關(guān)的酶類
(1)DNA聚合酶(DNApolymerase)(2)引物酶(primase)和引發(fā)體(primosome)
:?jiǎn)?dòng)RNA引物鏈的合成。(3)DNA連接酶(DNAligase)(4)DNA解鏈酶(DNAhelicase)(5)單鏈結(jié)合蛋白(single-strandbindingprotein,SSB):結(jié)合在解開的DNA單鏈上,防止重新形成雙螺旋。(6)拓?fù)洚悩?gòu)酶(topoisomerase):兼具內(nèi)切酶和連接酶活力,能迅速將DNA超螺旋或雙螺旋緊張狀態(tài)變成松馳狀態(tài),便于解鏈。解旋酶DNA聚合酶III解鏈酶RNA引物引物酶和引發(fā)體DNA聚合酶ISSB3′3′5′3′5′5′RNA引物原核生物DNA聚合反應(yīng)有關(guān)的酶類
(1)DNA聚合酶(DNADNA聚合酶催化的鏈延長(zhǎng)反應(yīng)5′RNA引物子鏈3′3′5′5′3′3′5′5′3′3′5′模板鏈DNA聚合酶催化的鏈延長(zhǎng)反應(yīng)5′RNA引物子鏈3′3′5′5大腸桿菌三種DNA聚合酶比較DNA聚合酶Ⅱ分子量每個(gè)細(xì)胞的分子統(tǒng)計(jì)數(shù)5′-3′聚合酶作用3′-5′核酸外切酶作用5′-3′核酸外切酶作用轉(zhuǎn)化率DNA聚合酶Ⅰ109,000400+++1120,000100++-0.05400,00010-20++-50比較項(xiàng)目DNA聚合酶III切除引物修復(fù)修復(fù)復(fù)制功能
2019年發(fā)現(xiàn)聚合酶IV和V,它們涉及DNA的錯(cuò)誤傾向修復(fù)(errorpronerepair)大腸桿菌三種DNA聚合酶比較DNA分子量DNA109,000DNA聚合酶的3′-5′外切酶水解位點(diǎn)3′3′5′5′錯(cuò)配堿基3′-5′核酸外切酶水解位點(diǎn)DNA聚合酶的3′-5′外切酶水解位點(diǎn)3′3′5′5′錯(cuò)配DNA聚合酶5′-3′外切酶活力
5′-3′核酸外切酶水解位點(diǎn)單鏈缺口5′DNA聚合酶5′-3′外切酶活力
5′-3′核酸外切酶水大腸桿菌DNA聚合酶Ⅲ全酶的結(jié)構(gòu)和功能延長(zhǎng)因子DNA聚合酶Ⅲ兩個(gè)亞基夾住DNADNA聚合酶Ⅲ異二聚體核心酶校對(duì)引物的結(jié)合和識(shí)別促使核心酶二聚化大腸桿菌DNA聚合酶Ⅲ全酶的結(jié)構(gòu)和功能延長(zhǎng)連接酶連接切口Mg2+連接酶ATP或NAD+AMP+PPi或NMN+AMPATCGPTTPPPAACCTGAPACPPPPOHTGGATCGPTTPPPAACCTGAPACPPPTGGP缺口3'3'5'5'5'5'3'3'模板鏈模板鏈連接酶連接切口Mg2+連接酶ATP或NAD+AMP+PPi或DNA的雙向和單向復(fù)制環(huán)狀DNA復(fù)制時(shí)所形成的Q結(jié)構(gòu)起始點(diǎn)復(fù)制叉的推進(jìn)復(fù)制叉起始點(diǎn)起始點(diǎn)起始點(diǎn)復(fù)制叉復(fù)制叉未復(fù)制DNA單向復(fù)制雙向復(fù)制DNA的雙向和單向復(fù)制環(huán)狀DNA復(fù)制時(shí)所形成的Q結(jié)構(gòu)起始點(diǎn)大腸桿菌復(fù)制起點(diǎn)成串排列的重復(fù)序列
GATCTNTTNTTT成串排列的三個(gè)13bp序列共有序列共有序列TTATCCACADnaA蛋白結(jié)合位點(diǎn)四個(gè)9bp序列DnaADnaB(解螺旋酶)SSB大腸桿菌DNA復(fù)制起點(diǎn)在起始階段的結(jié)構(gòu)模型大腸桿菌復(fù)制起點(diǎn)成串排列的重復(fù)序列
GATCTNTTNTTT原核細(xì)胞DNA的半不連續(xù)復(fù)制復(fù)制過程
復(fù)制叉的移動(dòng)方向解旋酶DNA聚合酶III解鏈酶RNA引物引物體DNA聚合酶ISSB3′3′5′前導(dǎo)鏈隨后鏈3′5′復(fù)制的起始DNA鏈的延長(zhǎng)DNA鏈終止5′RNA引物3′3′原核細(xì)胞DNA的半不連續(xù)復(fù)制復(fù)制過程
復(fù)制叉的移動(dòng)方向解旋酶聚合酶III核心酶大腸桿菌復(fù)制體結(jié)構(gòu)示意圖聚合酶I聚合酶III核心酶滯后鏈前導(dǎo)鏈解螺旋酶引物合成酶RNA引物引發(fā)體拓?fù)洚悩?gòu)酶II-夾子-聚體-夾子-復(fù)合物RNA引物單鏈結(jié)合蛋白(SSB)聚合酶III核心酶大腸桿菌復(fù)制體結(jié)構(gòu)示意圖聚合酶I聚合酶II大腸桿菌染色體復(fù)制的終止oric復(fù)制叉2復(fù)制叉1終止復(fù)制叉2終止復(fù)制叉1復(fù)制叉1復(fù)制叉2完成復(fù)制DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶連鎖染色體大腸桿菌染色體復(fù)制的終止oric復(fù)制叉2復(fù)制叉1終止復(fù)制叉2復(fù)制叉處前導(dǎo)鏈和隨后鏈同時(shí)合成的工作模型聚合酶III全酶引物聚合酶III全酶引物引物體引物體解旋酶解旋酶復(fù)制叉處前導(dǎo)鏈和隨后鏈同時(shí)合成的工作模型聚合酶III全酶引物復(fù)制的忠實(shí)性
DNA復(fù)制過程是一個(gè)高度精確的過程,據(jù)估計(jì),大腸桿菌DNA復(fù)制5109堿基對(duì)僅出現(xiàn)一個(gè)誤差,保證復(fù)制忠實(shí)性的原因主要有以下三點(diǎn):
DNA聚合酶的高度專一性(嚴(yán)格遵循堿基配對(duì)原則,但錯(cuò)配率為710-6)
DNA聚合酶的校對(duì)功能(錯(cuò)配堿基被3’-5’外切酶切除)起始時(shí)以RNA作為引物復(fù)制的忠實(shí)性
DNA復(fù)制過程是一個(gè)高度精確的DNA聚合酶的校對(duì)功能
5′-核酸外切酶3′-核酸外切酶裂縫聚合中心裂縫內(nèi)部DNA聚合酶的校對(duì)功能
5′-核酸外切酶3′-核酸外切酶裂縫DNA聚合酶的校對(duì)功能聚合酶錯(cuò)配鹼基復(fù)制方向正確核苷酸5′5′5′3′3′3′切除錯(cuò)配核苷酸DNA聚合酶的校對(duì)功能聚合酶錯(cuò)配鹼基復(fù)制方向正確核苷酸5′起始時(shí)以RNA作為引物的作用
DNA復(fù)制為什么要合成一個(gè)RNA引物,而后又把這個(gè)引物消除呢?這是保證DNA聚合過程高度精確的又一措施。已知DNA聚合酶具有35外切酶功能校對(duì)復(fù)制過程中的核苷酸,也就是說(shuō)聚合酶在開始形成一個(gè)新的磷酸二酯鍵前,總是檢查前一個(gè)堿基是否正確,這就決定了它不能從頭開始合成。因此先合成一條低忠實(shí)性的多核苷酸來(lái)開始DNA的合成,并以核糖核苷酸來(lái)表示是“暫時(shí)”的,當(dāng)DNA開始聚合以后再以53外切酶的功能切除,以高忠實(shí)性的脫氧核苷酸取而代之,確保復(fù)制的忠實(shí)性。起始時(shí)以RNA作為引物的作用
DNA復(fù)制為什真核細(xì)胞DNA復(fù)制的特點(diǎn)多個(gè)起點(diǎn)復(fù)制起點(diǎn)起點(diǎn)起點(diǎn)起點(diǎn)起點(diǎn)起點(diǎn)真核生物的DNA聚合酶端粒(telemere)復(fù)制真核細(xì)胞DNA復(fù)制的特點(diǎn)多個(gè)起點(diǎn)復(fù)制起點(diǎn)起點(diǎn)起點(diǎn)起點(diǎn)起點(diǎn)真核生物的DNA聚合酶DNA聚合酶分子量亞基數(shù)細(xì)胞內(nèi)分布酶活力百分比外切酶活力DNA聚合酶110-23,000多個(gè)細(xì)胞核~80%無(wú)120,000一個(gè)細(xì)胞核和線粒體2~15%無(wú)-400,000一個(gè)細(xì)胞核+10~25%5-3外切酶DNA聚合酶DNA聚合酶45,000一個(gè)細(xì)胞核10~15%無(wú)真核生物的DNA聚合酶DNA分子量DNA110-23,000端粒酶(telomerase)DNA復(fù)制需要引物,但在線形DNA分子末端不可能通過正常的機(jī)制在引物被降解后合成相應(yīng)的片段.如果沒有特殊的機(jī)制合成末端序列,染色體就會(huì)在細(xì)胞傳代中變得越來(lái)越短。這一難題是通過端粒酶的發(fā)現(xiàn)才得到了澄清,端粒酶是一種含RNA的蛋白復(fù)合物,實(shí)質(zhì)上是一種逆轉(zhuǎn)錄酶,它能催化互補(bǔ)于RNA模板的DNA片段的合成,使復(fù)制以后的線形DNA分子的末端保持不變。
初步研究表明,人體中生殖細(xì)胞的端粒長(zhǎng)度保持不變,而體細(xì)胞的端粒長(zhǎng)度則隨個(gè)體的老化而逐步縮短。對(duì)此的一個(gè)推論是:人的生殖細(xì)胞具端粒酶的活力,體細(xì)胞則否。這一問題的解決無(wú)疑會(huì)有助于對(duì)生命衰老的認(rèn)識(shí)。5′3′AAAACCCCAAAACCCCCCA端粒酶端粒酶(telomerase)DNA復(fù)制需要引物端粒合成的一種模型3′5′TTTTGGGGTTTTG5′3′AAAACCCCAAAACCCCCCAAA3′5′TTTTGGGGTTTTGGGGTTTTG5′3′AAAACCCCAAAACCCCCCAAATTGGGTGGGT3′5′AATTTTG5′3′AAAACCCCAAAACCCCCCAGTTTTG整合和雜交移位和再雜交端粒合成的完成TTTTGGGGTTTTGGGGTTTTGGGGTTTT5′3′nAA3′TTTTGGGGTTTTGGGGTTTTGGGGT5′3′TTCCCCTnAA3′TTTTGGGGTTTTGGGGTTTTGGGGT5′3′TTAAAACCCCAAAACCCCAAAACCCCTn進(jìn)一步加工繼續(xù)延伸端粒合成的一種模型3′5′5′3′AAAACCCCAAAAC真核和原核DNA細(xì)胞復(fù)制比較真核和原核DNA細(xì)胞復(fù)制比較第二節(jié)DNA的損傷與修復(fù)
某些物理化學(xué)因子,如紫外線、電離輻射和化學(xué)誘變劑等,都有引起生物突變和致死的作用,其機(jī)理是作用于DNA,造成DNA結(jié)構(gòu)和功能的破壞,稱為DNA的損傷.DNA的修復(fù)主要有以下類型:暗修復(fù)四、誘導(dǎo)修復(fù)(SOS修復(fù))一、光裂合酶修復(fù)二、切除修復(fù)三、重組修復(fù)
第二節(jié)DNA的損傷與修復(fù)某些物理化學(xué)DNA紫外線損傷的光裂合酶修復(fù)1、形成嘧啶二聚體2、光復(fù)合酶結(jié)合于損傷部位3、酶被可見光激活4、修復(fù)后酶被釋放DNA紫外線損傷的光裂合酶修復(fù)1、形成嘧啶二聚體2、光復(fù)合酶DNA的損傷和切除修復(fù)堿基丟失堿基缺陷或錯(cuò)配結(jié)構(gòu)缺陷切開核酸內(nèi)切酶核酸外切酶切除DNA聚合酶DNA連接酶AP核酸內(nèi)切酶核酸外切酶切開切除修復(fù)連接糖苷酶插入酶堿基取代DNA的損傷和切除修復(fù)堿基丟失堿基缺陷或錯(cuò)配結(jié)構(gòu)缺陷切開核酸DNA的重組修復(fù)胸腺嘧啶二聚體復(fù)制核酸酶及重組蛋白修復(fù)復(fù)制DNA聚合酶DNA連接酶重組DNA的重組修復(fù)胸腺嘧啶二聚體復(fù)制核酸酶及重組蛋白修復(fù)復(fù)制DSOS反應(yīng)的機(jī)制未誘導(dǎo)的細(xì)胞靶基因lexA基因被LexA
蛋白質(zhì)部分阻遏recA基因被LexA
蛋白質(zhì)部分阻遏(40個(gè)不同的位點(diǎn)被阻遏)LexA(阻遏物)
RecA(輔蛋白酶)靶基因表達(dá)lexA靶基因表達(dá)但產(chǎn)物被分解recA大量表達(dá)RecA促使分解LexA誘導(dǎo)的細(xì)胞單鏈DNAATPSOS反應(yīng)的機(jī)制未誘導(dǎo)的細(xì)胞靶基因lexA基因被LexAre
第三節(jié)DNA的突變
DNA分子中的核苷酸序列發(fā)生突然而穩(wěn)定的改變,從而導(dǎo)致DNA的復(fù)制以及后來(lái)的轉(zhuǎn)錄和翻譯產(chǎn)物隨之發(fā)生變化,表現(xiàn)出異常的遺傳特性,稱為DNA的突變。它包括由于DNA損傷和錯(cuò)配得不到修復(fù)而引起的突變,以及由于不同DNA分子之間的交換而引起的遺傳重組。二、誘變劑的作用堿基類似物(baseanalog)
堿基修飾劑(basemodifier)嵌入染料(intercalationdye)
紫外線(ultraviolet)和電離輻射(ionizingradiation)一、突變的類型
堿基對(duì)的置換(substitution)
移碼突變(framesshiftmutation)第三節(jié)DNA的突變
DNA分子中的核苷酸序
DNA突變的類型
-T-C-T-G-C-T-G-T-A-C-G--A-G-A-C-G-A-C-A-T-G-C-轉(zhuǎn)換野生型基因
-T-C-G-A-C-T-G-T-A-C-G--A-G-C-T-G-A-C-A-T-G-C-
-T-C-T-T-C-T-G-T-A-C-G--A-G-A-A-G-A-C-A-T-G-C-顛換堿基對(duì)的置換(substitution)移碼突變(framesshiftmutation)
-T-C-T-C-G-C-T-G-T-A-C-G--A-G-A-G-C-G-A-C-A-T-G-C-插入
-T-C-G-C-T-G-T-A-C-G--A-G-C-G-A-C-A-T-G-C-缺失ATDNA突變的類型
-T-C-T-G-C-T-G-T-A-第四節(jié)
逆轉(zhuǎn)錄作用一、概念二、逆轉(zhuǎn)錄酶三、病毒逆轉(zhuǎn)錄過程四、逆轉(zhuǎn)錄的生物學(xué)意義擴(kuò)充了中心法則有助于對(duì)病毒致癌機(jī)制的了解與真核細(xì)胞分裂和胚胎發(fā)育有關(guān)逆轉(zhuǎn)錄酶是分子生物學(xué)重要工具酶三種功能依賴DNA指導(dǎo)下的DNA聚合酶活力依賴RNA的DNA聚合酶活力核糖核酸酶H活力
以RNA為模板合成DNA,這與通常轉(zhuǎn)錄過程中遺傳信息從DNA到RNA的方向相反,故稱為逆轉(zhuǎn)錄作用。第四節(jié)逆轉(zhuǎn)錄作用一、概念二、逆轉(zhuǎn)錄酶三、病毒逆轉(zhuǎn)錄逆轉(zhuǎn)錄過程中cDNA的合成
依賴RNA的DNA聚合酶核糖核酸酶H活力依賴DNA的DNA聚合酶逆轉(zhuǎn)錄過程中cDNA的合成
依賴RNA的DNA聚合酶核糖核酸逆逆轉(zhuǎn)錄病毒的生活周期
生活周期RNA衣殼被膜逆轉(zhuǎn)錄酶轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)譯整合入宿主細(xì)胞染色體DNA進(jìn)入細(xì)胞丟失被膜丟失衣殼逆轉(zhuǎn)錄RNARNAcDNA衣殼蛋白被膜蛋白逆轉(zhuǎn)錄酶逆逆轉(zhuǎn)錄病毒的生活周期
生活周期RNA衣殼被膜逆轉(zhuǎn)錄酶轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)
第五節(jié)DNA的遺傳重組
DNA分子內(nèi)或分子間發(fā)生遺傳信息的重新組合,稱為遺傳重組(geneticrecombination),或者基因重排(generearrangement)。重組產(chǎn)物稱為重組體DNA(recombinantDNA)。重組的意義在于,它能迅速地增加群體的遺傳多樣性;使有利的突變與不利突變分開;通過優(yōu)化組合積累有意義的遺傳信息。此外,重組還參與了許多重要的生物學(xué)過程,它為DNA損傷或復(fù)制障礙提供修復(fù)機(jī)制。某些生物的基因表達(dá)受基因重組的調(diào)節(jié),生物發(fā)育過程也受到基因加工的控制。一、同源重組(homologousrecombination)二、特異位點(diǎn)重組(site-specificrecombination)三、轉(zhuǎn)座重組(transpositionalrecombination)第五節(jié)DNA的遺傳重組
DNA分子第十二章DNA的復(fù)制和修復(fù)
本章重點(diǎn)介紹遺傳中心法則和DNA的半保留復(fù)制以及逆轉(zhuǎn)錄的過程和機(jī)理,對(duì)DNA的損傷和修復(fù)、突變和重組作一般介紹。
返回思考
DNA是絕大多數(shù)生物體遺傳信息的載體,繼1953年Watson&Crick提出DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)模型后,1958年,Crick提出了“中心法則”(Centraldogma)揭示了遺傳信息的傳遞規(guī)律。第十二章DNA的復(fù)制和修復(fù)返回思考遺傳信息傳遞的中心法則
蛋白質(zhì)翻譯轉(zhuǎn)錄逆轉(zhuǎn)錄復(fù)制復(fù)制DNARNA生物的遺傳信息以密碼的形式儲(chǔ)存在DNA分子上,表現(xiàn)為特定的核苷酸排列順序。在細(xì)胞分裂的過程中,通過DNA復(fù)制把親代細(xì)胞所含的遺傳信息忠實(shí)地傳遞給兩個(gè)子代細(xì)胞。在子代細(xì)胞的生長(zhǎng)發(fā)育過程中,這些遺傳信息通過轉(zhuǎn)錄傳遞給RNA,再由RNA通過翻譯轉(zhuǎn)變成相應(yīng)的蛋白質(zhì)多肽鏈上的氨基酸排列順序,由蛋白質(zhì)執(zhí)行各種各樣的生物學(xué)功能,使后代表現(xiàn)出與親代相似的遺傳特征。后來(lái)人們又發(fā)現(xiàn),在宿主細(xì)胞中一些RNA病毒能以自己的RNA為模板復(fù)制出新的病毒RNA,還有一些RNA病毒能以其RNA為模板合成DNA,稱為逆轉(zhuǎn)錄這是中心法則的補(bǔ)充。
中心法則總結(jié)了生物體內(nèi)遺傳信息的流動(dòng)規(guī)律,揭示遺傳的分子基礎(chǔ),不僅使人們對(duì)細(xì)胞的生長(zhǎng)、發(fā)育、遺傳、變異等生命現(xiàn)象有了更深刻的認(rèn)識(shí),而且以這方面的理論和技術(shù)為基礎(chǔ)發(fā)展了基因工程,給人類的生產(chǎn)和生活帶來(lái)了深刻的革命。遺傳信息傳遞的中心法則
蛋白質(zhì)翻譯轉(zhuǎn)錄逆轉(zhuǎn)錄復(fù)制復(fù)制DNA目錄第一節(jié)DNA的復(fù)制(DNA指導(dǎo)下的DNA合成)第二節(jié)DNA的損傷與修復(fù)第三節(jié)DNA突變第四節(jié)逆轉(zhuǎn)錄作用(RNA指導(dǎo)下的DNA的合成)第五節(jié)DNA的遺傳重組目錄第一節(jié)DNA的復(fù)制(DNA指導(dǎo)下的DNA合第一節(jié)DNA的半保留復(fù)制
一、概念和實(shí)驗(yàn)依據(jù)二、DNA聚合反應(yīng)有關(guān)的酶類三、DNA的復(fù)制的起始點(diǎn)和方式四、原核細(xì)胞DNA的復(fù)制過程五、DNA復(fù)制的忠實(shí)性六、真核細(xì)胞DNA的復(fù)制
第一節(jié)DNA的半保留復(fù)制
一、概念和實(shí)驗(yàn)依據(jù)DNA的半保留復(fù)制的概念
DNA在復(fù)制時(shí),兩條鏈解開分別作為模板,在DNA聚合酶的催化下按堿基互補(bǔ)的原則合成兩條與模板鏈互補(bǔ)的新鏈,以組成新的DNA分子。這樣新形成的兩個(gè)DNA分子與親代DNA分子的堿基順序完全一樣。由于子代DNA分子中一條鏈來(lái)自親代,另一條鏈?zhǔn)切潞铣傻?,這種復(fù)制方式稱為半保留復(fù)制。DNA的半保留復(fù)制的概念
DNA在復(fù)制時(shí),兩DNA的半保留復(fù)制實(shí)驗(yàn)依據(jù)
1958年Meselson&stahl用同位素示蹤標(biāo)記加密度梯度離心技術(shù)實(shí)驗(yàn),證明了DNA是采取半保留的方式進(jìn)行復(fù)制.[15N]DNA[14N-15N]DNA[14N]DNA[14N-15N]DNADNA的半保留復(fù)制實(shí)驗(yàn)依據(jù)1958年Meselson復(fù)制中的大腸桿菌染色體放射自顯影圖
(Cairns實(shí)驗(yàn))將3H-胸苷標(biāo)記大腸桿菌DNA,經(jīng)過近兩代的時(shí)間,3H-胸苷摻入大腸桿菌DNA。用溶菌酶把細(xì)胞壁消化掉,使完整的大腸桿菌染色體DNA釋放出來(lái),放射自顯影,得到上圖。非復(fù)制部分(C)銀粒子密度較低,由一股放射性鏈和一股非放射性鏈構(gòu)成。已復(fù)制部分站整個(gè)染色體的三分之二,其中一條雙鏈(B)僅有一股鏈?zhǔn)菢?biāo)記的,另外一股雙鏈(A)的兩股鏈都是標(biāo)記的,銀粒子密度為前二者的兩倍。染色體全長(zhǎng)約為1100微米。ABC環(huán)狀DNA的復(fù)制ABC復(fù)制中的大腸桿菌染色體放射自顯影圖
(Cairns實(shí)驗(yàn))原核生物DNA聚合反應(yīng)有關(guān)的酶類
(1)DNA聚合酶(DNApolymerase)(2)引物酶(primase)和引發(fā)體(primosome)
:?jiǎn)?dòng)RNA引物鏈的合成。(3)DNA連接酶(DNAligase)(4)DNA解鏈酶(DNAhelicase)(5)單鏈結(jié)合蛋白(single-strandbindingprotein,SSB):結(jié)合在解開的DNA單鏈上,防止重新形成雙螺旋。(6)拓?fù)洚悩?gòu)酶(topoisomerase):兼具內(nèi)切酶和連接酶活力,能迅速將DNA超螺旋或雙螺旋緊張狀態(tài)變成松馳狀態(tài),便于解鏈。解旋酶DNA聚合酶III解鏈酶RNA引物引物酶和引發(fā)體DNA聚合酶ISSB3′3′5′3′5′5′RNA引物原核生物DNA聚合反應(yīng)有關(guān)的酶類
(1)DNA聚合酶(DNADNA聚合酶催化的鏈延長(zhǎng)反應(yīng)5′RNA引物子鏈3′3′5′5′3′3′5′5′3′3′5′模板鏈DNA聚合酶催化的鏈延長(zhǎng)反應(yīng)5′RNA引物子鏈3′3′5′5大腸桿菌三種DNA聚合酶比較DNA聚合酶Ⅱ分子量每個(gè)細(xì)胞的分子統(tǒng)計(jì)數(shù)5′-3′聚合酶作用3′-5′核酸外切酶作用5′-3′核酸外切酶作用轉(zhuǎn)化率DNA聚合酶Ⅰ109,000400+++1120,000100++-0.05400,00010-20++-50比較項(xiàng)目DNA聚合酶III切除引物修復(fù)修復(fù)復(fù)制功能
2019年發(fā)現(xiàn)聚合酶IV和V,它們涉及DNA的錯(cuò)誤傾向修復(fù)(errorpronerepair)大腸桿菌三種DNA聚合酶比較DNA分子量DNA109,000DNA聚合酶的3′-5′外切酶水解位點(diǎn)3′3′5′5′錯(cuò)配堿基3′-5′核酸外切酶水解位點(diǎn)DNA聚合酶的3′-5′外切酶水解位點(diǎn)3′3′5′5′錯(cuò)配DNA聚合酶5′-3′外切酶活力
5′-3′核酸外切酶水解位點(diǎn)單鏈缺口5′DNA聚合酶5′-3′外切酶活力
5′-3′核酸外切酶水大腸桿菌DNA聚合酶Ⅲ全酶的結(jié)構(gòu)和功能延長(zhǎng)因子DNA聚合酶Ⅲ兩個(gè)亞基夾住DNADNA聚合酶Ⅲ異二聚體核心酶校對(duì)引物的結(jié)合和識(shí)別促使核心酶二聚化大腸桿菌DNA聚合酶Ⅲ全酶的結(jié)構(gòu)和功能延長(zhǎng)連接酶連接切口Mg2+連接酶ATP或NAD+AMP+PPi或NMN+AMPATCGPTTPPPAACCTGAPACPPPPOHTGGATCGPTTPPPAACCTGAPACPPPTGGP缺口3'3'5'5'5'5'3'3'模板鏈模板鏈連接酶連接切口Mg2+連接酶ATP或NAD+AMP+PPi或DNA的雙向和單向復(fù)制環(huán)狀DNA復(fù)制時(shí)所形成的Q結(jié)構(gòu)起始點(diǎn)復(fù)制叉的推進(jìn)復(fù)制叉起始點(diǎn)起始點(diǎn)起始點(diǎn)復(fù)制叉復(fù)制叉未復(fù)制DNA單向復(fù)制雙向復(fù)制DNA的雙向和單向復(fù)制環(huán)狀DNA復(fù)制時(shí)所形成的Q結(jié)構(gòu)起始點(diǎn)大腸桿菌復(fù)制起點(diǎn)成串排列的重復(fù)序列
GATCTNTTNTTT成串排列的三個(gè)13bp序列共有序列共有序列TTATCCACADnaA蛋白結(jié)合位點(diǎn)四個(gè)9bp序列DnaADnaB(解螺旋酶)SSB大腸桿菌DNA復(fù)制起點(diǎn)在起始階段的結(jié)構(gòu)模型大腸桿菌復(fù)制起點(diǎn)成串排列的重復(fù)序列
GATCTNTTNTTT原核細(xì)胞DNA的半不連續(xù)復(fù)制復(fù)制過程
復(fù)制叉的移動(dòng)方向解旋酶DNA聚合酶III解鏈酶RNA引物引物體DNA聚合酶ISSB3′3′5′前導(dǎo)鏈隨后鏈3′5′復(fù)制的起始DNA鏈的延長(zhǎng)DNA鏈終止5′RNA引物3′3′原核細(xì)胞DNA的半不連續(xù)復(fù)制復(fù)制過程
復(fù)制叉的移動(dòng)方向解旋酶聚合酶III核心酶大腸桿菌復(fù)制體結(jié)構(gòu)示意圖聚合酶I聚合酶III核心酶滯后鏈前導(dǎo)鏈解螺旋酶引物合成酶RNA引物引發(fā)體拓?fù)洚悩?gòu)酶II-夾子-聚體-夾子-復(fù)合物RNA引物單鏈結(jié)合蛋白(SSB)聚合酶III核心酶大腸桿菌復(fù)制體結(jié)構(gòu)示意圖聚合酶I聚合酶II大腸桿菌染色體復(fù)制的終止oric復(fù)制叉2復(fù)制叉1終止復(fù)制叉2終止復(fù)制叉1復(fù)制叉1復(fù)制叉2完成復(fù)制DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶連鎖染色體大腸桿菌染色體復(fù)制的終止oric復(fù)制叉2復(fù)制叉1終止復(fù)制叉2復(fù)制叉處前導(dǎo)鏈和隨后鏈同時(shí)合成的工作模型聚合酶III全酶引物聚合酶III全酶引物引物體引物體解旋酶解旋酶復(fù)制叉處前導(dǎo)鏈和隨后鏈同時(shí)合成的工作模型聚合酶III全酶引物復(fù)制的忠實(shí)性
DNA復(fù)制過程是一個(gè)高度精確的過程,據(jù)估計(jì),大腸桿菌DNA復(fù)制5109堿基對(duì)僅出現(xiàn)一個(gè)誤差,保證復(fù)制忠實(shí)性的原因主要有以下三點(diǎn):
DNA聚合酶的高度專一性(嚴(yán)格遵循堿基配對(duì)原則,但錯(cuò)配率為710-6)
DNA聚合酶的校對(duì)功能(錯(cuò)配堿基被3’-5’外切酶切除)起始時(shí)以RNA作為引物復(fù)制的忠實(shí)性
DNA復(fù)制過程是一個(gè)高度精確的DNA聚合酶的校對(duì)功能
5′-核酸外切酶3′-核酸外切酶裂縫聚合中心裂縫內(nèi)部DNA聚合酶的校對(duì)功能
5′-核酸外切酶3′-核酸外切酶裂縫DNA聚合酶的校對(duì)功能聚合酶錯(cuò)配鹼基復(fù)制方向正確核苷酸5′5′5′3′3′3′切除錯(cuò)配核苷酸DNA聚合酶的校對(duì)功能聚合酶錯(cuò)配鹼基復(fù)制方向正確核苷酸5′起始時(shí)以RNA作為引物的作用
DNA復(fù)制為什么要合成一個(gè)RNA引物,而后又把這個(gè)引物消除呢?這是保證DNA聚合過程高度精確的又一措施。已知DNA聚合酶具有35外切酶功能校對(duì)復(fù)制過程中的核苷酸,也就是說(shuō)聚合酶在開始形成一個(gè)新的磷酸二酯鍵前,總是檢查前一個(gè)堿基是否正確,這就決定了它不能從頭開始合成。因此先合成一條低忠實(shí)性的多核苷酸來(lái)開始DNA的合成,并以核糖核苷酸來(lái)表示是“暫時(shí)”的,當(dāng)DNA開始聚合以后再以53外切酶的功能切除,以高忠實(shí)性的脫氧核苷酸取而代之,確保復(fù)制的忠實(shí)性。起始時(shí)以RNA作為引物的作用
DNA復(fù)制為什真核細(xì)胞DNA復(fù)制的特點(diǎn)多個(gè)起點(diǎn)復(fù)制起點(diǎn)起點(diǎn)起點(diǎn)起點(diǎn)起點(diǎn)起點(diǎn)真核生物的DNA聚合酶端粒(telemere)復(fù)制真核細(xì)胞DNA復(fù)制的特點(diǎn)多個(gè)起點(diǎn)復(fù)制起點(diǎn)起點(diǎn)起點(diǎn)起點(diǎn)起點(diǎn)真核生物的DNA聚合酶DNA聚合酶分子量亞基數(shù)細(xì)胞內(nèi)分布酶活力百分比外切酶活力DNA聚合酶110-23,000多個(gè)細(xì)胞核~80%無(wú)120,000一個(gè)細(xì)胞核和線粒體2~15%無(wú)-400,000一個(gè)細(xì)胞核+10~25%5-3外切酶DNA聚合酶DNA聚合酶45,000一個(gè)細(xì)胞核10~15%無(wú)真核生物的DNA聚合酶DNA分子量DNA110-23,000端粒酶(telomerase)DNA復(fù)制需要引物,但在線形DNA分子末端不可能通過正常的機(jī)制在引物被降解后合成相應(yīng)的片段.如果沒有特殊的機(jī)制合成末端序列,染色體就會(huì)在細(xì)胞傳代中變得越來(lái)越短。這一難題是通過端粒酶的發(fā)現(xiàn)才得到了澄清,端粒酶是一種含RNA的蛋白復(fù)合物,實(shí)質(zhì)上是一種逆轉(zhuǎn)錄酶,它能催化互補(bǔ)于RNA模板的DNA片段的合成,使復(fù)制以后的線形DNA分子的末端保持不變。
初步研究表明,人體中生殖細(xì)胞的端粒長(zhǎng)度保持不變,而體細(xì)胞的端粒長(zhǎng)度則隨個(gè)體的老化而逐步縮短。對(duì)此的一個(gè)推論是:人的生殖細(xì)胞具端粒酶的活力,體細(xì)胞則否。這一問題的解決無(wú)疑會(huì)有助于對(duì)生命衰老的認(rèn)識(shí)。5′3′AAAACCCCAAAACCCCCCA端粒酶端粒酶(telomerase)DNA復(fù)制需要引物端粒合成的一種模型3′5′TTTTGGGGTTTTG5′3′AAAACCCCAAAACCCCCCAAA3′5′TTTTGGGGTTTTGGGGTTTTG5′3′AAAACCCCAAAACCCCCCAAATTGGGTGGGT3′5′AATTTTG5′3′AAAACCCCAAAACCCCCCAGTTTTG整合和雜交移位和再雜交端粒合成的完成TTTTGGGGTTTTGGGGTTTTGGGGTTTT5′3′nAA3′TTTTGGGGTTTTGGGGTTTTGGGGT5′3′TTCCCCTnAA3′TTTTGGGGTTTTGGGGTTTTGGGGT5′3′TTAAAACCCCAAAACCCCAAAACCCCTn進(jìn)一步加工繼續(xù)延伸端粒合成的一種模型3′5′5′3′AAAACCCCAAAAC真核和原核DNA細(xì)胞復(fù)制比較真核和原核DNA細(xì)胞復(fù)制比較第二節(jié)DNA的損傷與修復(fù)
某些物理化學(xué)因子,如紫外線、電離輻射和化學(xué)誘變劑等,都有引起生物突變和致死的作用,其機(jī)理是作用于DNA,造成DNA結(jié)構(gòu)和功能的破壞,稱為DNA的損傷.DNA的修復(fù)主要有以下類型:暗修復(fù)四、誘導(dǎo)修復(fù)(SOS修復(fù))一、光裂合酶修復(fù)二、切除修復(fù)三、重組修復(fù)
第二節(jié)DNA的損傷與修復(fù)某些物理化學(xué)DNA紫外線損傷的光裂合酶修復(fù)1、形成嘧啶二聚體2、光復(fù)合酶結(jié)合于損傷部位3、酶被可見光激活4、修復(fù)后酶被釋放DNA紫外線損傷的光裂合酶修復(fù)1、形成嘧啶二聚體2、光復(fù)合酶DNA的損傷和切除修復(fù)堿基丟失堿基缺陷或錯(cuò)配結(jié)構(gòu)缺陷切開核酸內(nèi)切酶核酸外切酶切除DNA聚合酶DNA連接酶AP核酸內(nèi)切酶核酸外切酶切開切除修復(fù)連接糖苷酶插入酶堿基取代DNA的損傷和切除修復(fù)堿基丟失堿基缺陷或錯(cuò)配結(jié)構(gòu)缺陷切開核酸DNA的重組修復(fù)胸腺嘧啶二聚體復(fù)制核酸酶及重組蛋白修復(fù)復(fù)制DNA聚合酶DNA連接酶重組DNA的重組修復(fù)胸腺嘧啶二聚體復(fù)制核酸酶及重組蛋白修復(fù)復(fù)制DSOS反應(yīng)的機(jī)制未誘導(dǎo)的細(xì)胞靶基因lexA基因被LexA
蛋白質(zhì)部分阻遏recA基因被LexA
蛋白質(zhì)部分阻遏(40個(gè)不同的位點(diǎn)被阻遏)LexA(阻遏物)
RecA(輔蛋白酶)靶基因表達(dá)lexA靶基因表達(dá)但產(chǎn)物被分解recA大量表達(dá)RecA促使分解LexA誘導(dǎo)的細(xì)胞單鏈DNAATPSOS反應(yīng)的機(jī)制未誘導(dǎo)的細(xì)胞靶基因lexA基因被LexAre
第三節(jié)DNA的突變
DNA分子中的核苷酸序列發(fā)生突然而穩(wěn)定的改變,從而導(dǎo)致DNA的
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