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1、分子生物學(xué) PBL第一次討論Contents1. 人類細胞質(zhì)RNA的提取2. RT-PCR的原理、方法3.瓊脂凝膠電泳結(jié)果分析及應(yīng)用 人類細胞質(zhì)RNA的提取 真核細胞質(zhì)總RNA主要由rRNA(80-85%)、tRNA和核內(nèi)小分子RNA(10-15%)、mRNA(1-5%)組成,其rRNA、tRNA和mRNA位于細胞質(zhì)中。 人類細胞質(zhì)RNA的提取分析不同發(fā)育時期基因的表達狀況獲得新基因AIMS研究基因的拼接分析相應(yīng)的蛋白產(chǎn)物 人類細胞質(zhì)RNA的提取原理:RNA的不穩(wěn)定性 由于核糖殘基的2和3位置帶有羥基,RNA易于被RNA酶切割水解 RNA酶含量豐富,加熱后仍能夠正確折疊恢復(fù)活性,不易失活。 所
2、以需要RNA酶抑制劑來抑制RNA酶的活性,從而達到成功提取RNA。 人類細胞質(zhì)RNA的提取 RNA提取的一般步驟:破碎組織分離RNA沉淀RNA洗滌RNA融解RNA保存RNA 破碎組織和滅活RNA酶可以同步進行可以用鹽酸胍、硫氰酸胍、蛋白酶K等破碎組織 加入-巰基乙醇可以抑制RNA酶活性 分離RNA一般用酚、氯仿等有機溶劑,加入少量異戊醇,經(jīng)過此步,離心,RNA一般分布于上層,與蛋白層分開 沉淀RNA一般用乙醇、3M NaAc(pH=5.2)或異丙醇。 人類細胞質(zhì)RNA的提取 洗滌RNA使用70乙醇洗滌,有時,為避免RNA被洗掉,此步可以省掉,洗滌之后可以晾干或者烤干乙醇,但是不能過于干燥,否則
3、不易溶解 融解RNA一般使用TE(三羥甲基氨基甲烷和EDTA配置而成) 保存RNA應(yīng)該盡量低溫。為了防止痕量RNase(核糖核酸酶)的污染,從富含RNase的樣品(如胰臟、肝臟)中分離到的RNA需要貯存在甲醛中以保存高質(zhì)量的RNA,對于長期貯存也應(yīng)該如此 RT-PCR 的原理及方法 背景 基因的表達 不同細胞或組織表達不同的基因基因組DNA (genomic DNA)信使RNA (messenger RNA, mRNA)蛋白質(zhì)產(chǎn)物 RT-PCR 的原理及方法 目的通過反轉(zhuǎn)錄(reverse transcription,RT)和聚合酶鏈反應(yīng)(polymerase chain reaction,P
4、CR)的方法,檢測目的基因在特定組織或細胞中、mRNA水平的表達豐度 RT-PCR 的原理及方法原理及方法mRNA (messenger RNA)cDNA (complementary DNA) PCR產(chǎn)物RT(反轉(zhuǎn)錄) PCR(聚合酶鏈反應(yīng))Diagram 瓊脂糖凝膠電泳 瓊脂糖凝膠電泳主要是應(yīng)用瓊脂糖凝膠作為支持物的電泳法,借助瓊脂糖凝膠的分子篩作用,核酸片段因其分子量或者分子形狀的不同,電泳速度有差異而分離,這種技術(shù)是基因操作中常用的一種方法。 與其他支持物電泳最主要區(qū)別是:它兼有“分子篩”和“電泳”的雙重作用。 瓊脂糖凝膠電泳 PCR產(chǎn)物在瓊脂糖凝膠上的 電泳檢測 在基因組DNA的提取中,用蒸餾水溶解提取出的DNA,在1.0%的瓊脂糖膠進行電泳,以Marker(分子質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn))作為參照,用5V/cm的電泳 30-60分鐘,最后采用EB溶液進行染色后在凝膠成像系統(tǒng) 中進行觀察拍照。 瓊脂糖凝膠電泳 應(yīng)用(廣泛應(yīng)用與分子生物學(xué)、遺傳學(xué)和生物化學(xué))分離提取大分子DNA 可區(qū)分相差100bp的DNA片段測定糖化血紅蛋白PCR擴增產(chǎn)物的檢測免疫擴散法 利用瓊脂糖凝膠作為擴散介質(zhì),使抗原與抗體在瓊脂糖凝膠
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