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1、一、1cDNA 與 cccDNA:cDNA 是由 mRNA 通過反轉(zhuǎn)錄酶的雙鏈DNA;cccDNA 是游離于之外的質(zhì)粒雙鏈閉合環(huán)形DNA。2標(biāo)準(zhǔn)折疊:蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)單元螺旋與折疊通過各種連接多肽可以組成特殊幾何排列的結(jié)構(gòu)塊,此種確定的折疊類型通常稱為超二級(jí)結(jié)構(gòu)。幾乎所有的三級(jí)結(jié)構(gòu)都可以用這些折疊類型,乃至他們的組合型來予以描述,因此又將其稱為標(biāo)準(zhǔn)折疊。3CAP:環(huán)腺苷酸(c)受體蛋白 CRP(creceptor protein ),c與 CRP結(jié)合后所形成的復(fù)合物稱激活蛋白 CAP(cactivated protein )4回文序列:DN段上的一段所具有的反向互補(bǔ)序列,常是限制性酶切位點(diǎn)。5m
2、icRNA:互補(bǔ)干擾 RNA 或稱反義RNA,與 mRNA 序列互補(bǔ),可抑制 mRNA 的翻譯。6核酶:具有催化活性的RNA,在 RNA 的剪接加工過起到自我催化的作用。7模體:蛋白質(zhì)分子空間結(jié)構(gòu)中存在著某些形狀和拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)頗為類似的局部區(qū)域8信號(hào)肽:在蛋白質(zhì)過N 端有 1536 個(gè)氨基酸殘基的肽段,引導(dǎo)蛋白質(zhì)的跨膜。9弱化子:在區(qū)與結(jié)構(gòu)之間的一段可以終止轉(zhuǎn)錄作用的核苷酸序列。10魔斑:當(dāng)細(xì)菌生長(zhǎng)過,遇到氨基酸全面缺乏時(shí),細(xì)菌將會(huì)產(chǎn)生一個(gè)應(yīng)急反應(yīng),停止全部的表達(dá)。產(chǎn)生這一應(yīng)急反應(yīng)的信號(hào)是鳥苷四磷酸(ppGpp) 和鳥苷五磷酸(pppGpp)。PpGpp 與 pppGpp 的作用不只是一個(gè)或幾個(gè)子
3、,而是影響一大批,所以稱他們是超級(jí)調(diào)控子或稱為魔斑。11上游啟動(dòng)件:是指對(duì)啟動(dòng)子的活性起到一種調(diào)節(jié)作用的 DNA 序列,-10 區(qū)的A、-35 區(qū)的 TGACA 及增強(qiáng)子,弱化子等。12DNA 探針:是帶有標(biāo)記的一段已知序列 DNA,用以檢測(cè)未知序列、篩選目的等方面廣泛應(yīng)用。13SD 序列:是核糖體與 mRNA 結(jié)合序列,對(duì)翻譯起到調(diào)控作用。14單克隆抗體:只針對(duì)單一抗原決定簇起作用的抗體。15考斯質(zhì)粒:是經(jīng)過人工構(gòu)建的一種外源 DNA 載體,保留噬菌體兩端的 COS 區(qū),與質(zhì)粒連接。16藍(lán)-白斑篩選:含 LacZ(編碼半乳糖苷酶)該酶能分解生色底物 X-gal(5-溴-4-氯-3-吲哚-D-
4、半乳糖苷)產(chǎn)生藍(lán)色,從而使菌株變藍(lán)。當(dāng)外源DNA后,LacZ不能表達(dá),菌株呈白色,以此來篩選重組細(xì)菌。稱之為藍(lán)-白斑篩選。17順式作用元件:在 DNA 中一段特殊的堿基序列,對(duì)的表達(dá)起到調(diào)控作用的元件。18Klenow 酶:DNA 聚合酶 I 大片段,只是從DNA 聚合酶 I 全酶中去除了 5 3外切酶活性19錨定 PCR:用于擴(kuò)增已知一端序列的目的DNA。在未知序列一端加上一段多聚 dG 的尾巴,然后分別用多聚 dC 和已知的序列作為引物進(jìn)行 PCR 擴(kuò)增。20融合蛋白:真白的與外源連接,同時(shí)表達(dá)翻譯出的原蛋白與外源蛋白結(jié)合在一起所組成的蛋白質(zhì)。二、填 空1 DNA 的物理圖譜是 DNA 分
5、子的(限制性內(nèi)切酶酶解 )片段的排列順序。2 RNA 酶的剪切分為(自體催化 )、(異體催化 )兩種類型。3原核生物中有三種起始因子分別是(IF-1)、( IF-2 )和(IF-3 )。4蛋白質(zhì)的跨膜需要( 信號(hào)肽 )的引導(dǎo),蛋白伴侶的作用是(輔助肽鏈折疊成天然構(gòu)象的蛋白質(zhì))。5啟動(dòng)子中的元件通常可以分為兩種:(啟動(dòng)件 )和(上游啟動(dòng)件 )。6分子生物學(xué)的研究?jī)?nèi)容主要包含(結(jié)構(gòu)分子生物學(xué) )、(表達(dá)與調(diào)控 )、( DNA 重組技術(shù) )三部分。7證明DNA 是遺傳物質(zhì)的兩個(gè)關(guān)鍵性實(shí)驗(yàn)是(球菌小鼠 )、( T2 噬菌體大腸桿菌 )這兩個(gè)實(shí)驗(yàn)中主要的論點(diǎn)是:(生物體吸收的外源 DNA 改變了其遺傳潛
6、能 )。8hnRNA 與 mRNA 之間的差別主要有兩點(diǎn):( hnRNA 在轉(zhuǎn)變?yōu)?mRNA 的過經(jīng)過剪接,)、( mRNA 的 5末端被加上一個(gè) m7pGppp 帽子,在 mRNA3末端多了一個(gè)多聚腺苷酸(polyA)尾巴)。9蛋白質(zhì)多亞基形式的優(yōu)點(diǎn)是(亞基對(duì) DNA 的利用來說是一種經(jīng)濟(jì)的方法 )、(可以減少蛋白質(zhì)過隨機(jī)的錯(cuò)誤對(duì)蛋白質(zhì)活性的影響)、(活性能夠非常有效和迅速地被打開和被關(guān)閉 )。10蛋白質(zhì)折疊機(jī)制首先成核理論的主要內(nèi)容包括(成核 )、(結(jié)構(gòu)充實(shí))、(最后重排)。11半乳糖對(duì)細(xì)菌有雙重作用;一方面(可以作為碳源供細(xì)胞生長(zhǎng) );另一方面(它又是細(xì)胞壁的成分 )。所以需要一個(gè)不依賴
7、于 cCRP 的啟動(dòng)子 S2 進(jìn)行本底水平的型;同時(shí)需要一個(gè)依賴于 cCRP 的啟動(dòng)子 S1 對(duì)高水平進(jìn)行調(diào)節(jié)。有 G 時(shí)轉(zhuǎn)錄從( S2 )開始,無G 時(shí)轉(zhuǎn)錄從( S1 )開始。12DNA 重組技術(shù)也稱為(克?。┗颍ǚ肿涌寺?)。最終目的是(把一個(gè)生物體中的遺傳信息DNA 轉(zhuǎn)入另一個(gè)生物體)。典型的 DNA 重組實(shí)驗(yàn)通常包含以下幾個(gè)步驟:提取供體生物的目的(或稱外源),酶接連接到另一 DNA 分子上(克隆載體),形成一個(gè)新的重組DNA 分子。將這個(gè)重組 DNA 分子轉(zhuǎn)入受體細(xì)胞并在受體細(xì)胞中保存,這個(gè)過程稱為轉(zhuǎn)化。對(duì)那些吸收了重組DNA 的受體細(xì)胞進(jìn)行篩選和鑒定。對(duì)含有重組 DNA 的細(xì)胞進(jìn)行
8、大量培養(yǎng),檢測(cè)外援是否表達(dá)。13、質(zhì)粒的類型有兩種:受到宿主細(xì)白質(zhì)的嚴(yán)格控制的稱為(型質(zhì)粒),不受宿主細(xì)白質(zhì)的嚴(yán)格控制稱為( 松弛型質(zhì)粒 )。14PCR 的反應(yīng)體系要具有以下條件:a、被分離的目的兩條鏈各一端序列相互補(bǔ)的 DNA 引物(約 20 個(gè)堿基左右)。b、具有熱穩(wěn)定性的酶如:TagDNA 聚合酶。c、dNTPd、作為模板的目的DNA 序列15PCR 的基本反應(yīng)過程包括:(變性)、(退火)、(延伸 )三個(gè)階段。16、轉(zhuǎn)動(dòng)物的基本過程通常包括:將克隆的外源導(dǎo)入到一個(gè)卵或胚胎干細(xì)胞的細(xì)胞核中;接種后的卵或胚胎干細(xì)胞移植到雌性的;完成胚胎發(fā)育,生長(zhǎng)為后代并帶有外源;利用這些能產(chǎn)生外源蛋白的動(dòng)物
9、作為種畜,培育新的純合系。17雜交瘤細(xì)胞系的產(chǎn)生是由(脾 B)細(xì)胞與(骨髓瘤 )細(xì)胞雜交產(chǎn)生的,由于(脾細(xì)胞)可以利用次黃嘌呤,( 骨細(xì)胞 )提供細(xì)胞功能,所以能在 HAT 培養(yǎng)基中生長(zhǎng)。18隨著研究的深入第一代抗體稱為(多克隆抗體)、第二代(單克隆抗體)、第三代(基因工程抗體 )。19目前對(duì)昆蟲的工程改造主要集中于桿狀,表現(xiàn)在引入(外源毒蛋白);( 擾亂昆蟲正常生活周期的);( 對(duì)進(jìn)行修飾 )。20哺乳類RNA 聚合酶啟動(dòng)子中常見的元件A、GC、CAAT 所對(duì)應(yīng)的反式作用蛋白因子分別是( TFIID )、( SP-1 )和( CTF/NF1 )。21RNA 聚合酶的基本轉(zhuǎn)錄因子有、TF-A、
10、TF-B、TFII-D、TF-E 他們的結(jié)合順序是: ( D、A、B、E )。其中 TFII-D 的功能是(與A 盒結(jié)合 )。22與 DNA 結(jié)合的轉(zhuǎn)錄因子大多以二聚體形式起作用,轉(zhuǎn)錄因子與 DNA 結(jié)合的功能域常見有以下幾種( 螺旋-轉(zhuǎn)角-螺旋 )、( 鋅指模體 )、(堿性-亮氨酸拉鏈模體 )。23限制性內(nèi)切酶的切割方式有三種類型分別是(在對(duì)稱軸 5 側(cè)切割產(chǎn)生 5 粘端 )、(在對(duì)稱軸 3 側(cè)切割產(chǎn)生 3 粘端(在對(duì)稱軸處切割產(chǎn)生平段)。24質(zhì)粒DNA 具有三種不同的構(gòu)型分別是:( SC 構(gòu)型 )、( oc 構(gòu)型 )、( L 構(gòu)型 )。在電泳中最前面的是( SC 構(gòu)型 )。25外源表達(dá)系統(tǒng)
11、,主要有(大腸桿菌)、( 酵母)、( 昆蟲 )和( 哺乳類細(xì)胞表 )。26轉(zhuǎn)動(dòng)物常用的方法有:(逆轉(zhuǎn)錄法)、(DNA顯微注射法)、(胚胎干細(xì)胞法 )。三、簡(jiǎn) 答1 分別說出 5 種以上RNA 的功能?轉(zhuǎn)運(yùn) RNA tRNA 轉(zhuǎn)運(yùn)氨基酸白體RNA rRNA白體組成成信使 RNA mRNA 蛋白質(zhì)模板不均一核RNA hnRNA 成熟 mRNA 的前體小核 RNA snRNA 參與 hnRNA 的剪接小胞漿 RNA scRNA/7SL-RNA 蛋白質(zhì)內(nèi)質(zhì)網(wǎng)定位的信號(hào)識(shí)別體的組成成分反義 RNA anRNA/micRNA 對(duì)的表達(dá)起調(diào)節(jié)作用核 酶 Ribozyme RNA 有酶活性的 RNA2原核生物
12、與真核生物啟動(dòng)子的主要差別?原核生物TTGACA -AAT起始位點(diǎn)-35 -10真核生物增強(qiáng)子-GC -CAAT-AA5mGpp起始位點(diǎn)-110 -70 -253對(duì)天然質(zhì)粒的人工構(gòu)建主要表現(xiàn)在哪些方面?天然質(zhì)粒往往存在著缺陷,因而不適合用作工程的載體,必須對(duì)之進(jìn)行改造構(gòu)建:a、加入合適的選擇標(biāo)記,如兩個(gè)以上,易于用作選擇,通常是抗生素。b、增加或減少合適的酶切位點(diǎn),便于重組。c、縮短長(zhǎng)度,切去不必要的片段,提高導(dǎo)入效率,增加裝載量。d、改變子,變?yōu)樗沙?,變少拷貝為多拷貝。e、根據(jù)工程的特殊要求加裝特殊的元件4舉例說明差示篩選組織特異 cDNA 的方法??jī)煞N細(xì)胞群體,目的在其中一種細(xì)胞中表達(dá)或高
13、表達(dá),在另一種細(xì)胞中不表達(dá)或低表達(dá),然后通過雜交對(duì)比找到目的。例如:在腫瘤發(fā)生和發(fā)展過,腫瘤細(xì)胞會(huì)呈現(xiàn)與正常細(xì)胞表達(dá)水平不同的 mRNA,因此,可以通過差示雜交篩選出與腫瘤相關(guān)的。也可利用誘導(dǎo)的方法,篩選出誘導(dǎo)表達(dá)的。5雜交瘤細(xì)胞系的產(chǎn)生與篩選?脾 B 細(xì)胞+骨髓瘤細(xì)胞,加聚乙二醇(PEG)促進(jìn)細(xì)胞融合,HAT 培養(yǎng)基中培養(yǎng)(內(nèi)含次黃嘌呤、氨基蝶呤、T)生長(zhǎng)出來的脾 B-骨髓瘤融合細(xì)胞繼續(xù)擴(kuò)大培養(yǎng)。細(xì)胞融合物中包含:脾-脾融合細(xì)胞:不能生長(zhǎng),脾細(xì)胞不能體外培養(yǎng)。骨-骨融合細(xì)胞:不能利用次黃嘌呤,但可通過第二途 徑利用葉酸還原酶嘌呤。氨基蝶呤對(duì)葉酸還原酶有抑制作用,因此不能生長(zhǎng)。骨-脾融合細(xì)胞:
14、在 HAT 中能生長(zhǎng),脾細(xì)胞可以利用次黃嘌呤,骨細(xì)胞提供細(xì)胞功能。6、利脫氧末端終止法(Sanger 法)測(cè)定 DNA 一級(jí)結(jié)構(gòu)的原理與方法?原理是采用核苷酸鏈終止劑2,3,-雙脫氧核苷酸終止 DNA 的延長(zhǎng)。由于它缺少形成3/5/磷酸二脂鍵所需要的 3-OH,一旦參入到 DNA 鏈中,此 DNA 鏈就不能進(jìn)一長(zhǎng)。根據(jù)堿基配對(duì)原則,每當(dāng) DNA 聚合酶需要 dNMP 參入到正常延長(zhǎng)的 DNA 鏈中時(shí),就有兩種可能性,一是參入 ddNTP,結(jié)果導(dǎo)致脫氧核苷酸鏈延長(zhǎng)的終止;二是參入 dNTP,使 DNA鏈仍可繼續(xù)延長(zhǎng),直至參入下一個(gè) ddNTP。根據(jù)這一方法,就到一組以 ddNTP 結(jié)尾的長(zhǎng)短不一
15、的 DN段。方法是分成四組分別為 dd、ddGMP、ddCMP、ddTMP 反應(yīng)后,聚丙烯酰胺凝膠電泳按泳帶可讀出DNA 序列。7、激活蛋白(CAP)對(duì)轉(zhuǎn)錄的正調(diào)控作用?環(huán)腺苷酸(c)受體蛋白 CRP(creceptor protein),c與 CRP 結(jié)合后所形成的復(fù)合物稱激活蛋白 CAP(cactivated protein )。當(dāng)大腸桿菌生長(zhǎng)在缺乏葡萄糖的培養(yǎng)基中時(shí),CAP量增加,CAP 具有激活乳糖(Lac)等啟動(dòng)子的功能。一些依賴于CRP 的啟動(dòng)子缺乏一般啟動(dòng)子所具有的典型的-35 區(qū)序列特征(TTGACA)。因此 RNA 聚合酶難以與其結(jié)合。CAP 的存在(功能):能顯著提高酶與啟
16、動(dòng)子結(jié)合常數(shù)。主要表現(xiàn)以下二方面:CAP 通過改變啟動(dòng)子的構(gòu)象以及與酶的相互作用幫助酶分子正確定向,以便與-10 區(qū)結(jié)合,起到取代-35 區(qū)功能的作用。CAP 還能抑制 RNA 聚合酶與DNA 中其它位點(diǎn)的結(jié)合,從而提高與其特定啟動(dòng)子結(jié)合的概率。8、典型的DNA 重組實(shí)驗(yàn)通常包括哪些步驟?a、提取供體生物的目的(或稱外源),酶接連接到另一 DNA 分子上(克隆載體),形成一個(gè)新的重組DNA 分子。b、將這個(gè)重組 DNA 分子轉(zhuǎn)入受體細(xì)胞并在受體細(xì)胞中保存,這個(gè)過程稱為轉(zhuǎn)化。c、對(duì)那些吸收了重組DNA 的受體細(xì)胞進(jìn)行篩選和鑒定。d、對(duì)含有重組 DNA 的細(xì)胞進(jìn)行大量培養(yǎng),檢測(cè)外援是否表達(dá)。9、文
17、庫的構(gòu)建對(duì)重組子的篩出 3 種方法并簡(jiǎn)述過程??股乜剐院Y選、抗性的失活、蘭-白斑篩選 或PCR 篩選、差式篩選、DNA 探針多數(shù)克隆載體均帶有抗生素抗性(抗氨芐青霉素、四環(huán)素)。當(dāng)質(zhì)粒轉(zhuǎn)入大腸桿菌中后,該菌便獲得抗性,沒有轉(zhuǎn)入的不具有抗性。但不能區(qū)分是否已重組。在含有兩個(gè)抗性的載體中,如果外源 DN段其中一個(gè)并導(dǎo)致該失活,就可用兩個(gè)分別含不同藥物的平板對(duì)照篩選陽性重組子。 如 pUC 質(zhì)粒含LacZ(編碼半乳糖苷酶)該酶能分解生色底物 X-gal(5-溴-4-氯-3-吲哚-D-半乳糖苷)產(chǎn)生藍(lán)色,從而使菌株變藍(lán)。當(dāng)外源 DNA后,LacZ不能表達(dá),菌株呈白色,以此來篩選重組細(xì)菌。10、說明通
18、過胚胎干細(xì)胞獲得轉(zhuǎn)動(dòng)物的基本過程?胚胎干細(xì)胞(embryonic stem cell,ES):是胚胎發(fā)育期的胚細(xì)胞,可以人工培養(yǎng)增殖并具有分化成其它類型細(xì)胞的功能。ES 細(xì)胞的培養(yǎng):分離胚泡的內(nèi)層細(xì)胞團(tuán)進(jìn)行培養(yǎng)。ES 在無飼養(yǎng)層中培養(yǎng)時(shí)會(huì)分化為肌細(xì)胞、N 細(xì)胞等多種功能細(xì)胞,在含有成細(xì)胞中培養(yǎng)時(shí) ES 將保持分化功能??梢詫?duì) ES 進(jìn)行操作,不影響它的分化功能可以定點(diǎn)整合,解決了隨機(jī)整合。向胚胎干細(xì)胞導(dǎo)入外源,然后植入到待孕雌鼠,發(fā)育成幼鼠,雜交獲得純合鼠。一、1、:能夠表達(dá)和產(chǎn)生蛋白質(zhì)和RNA 的 DNA 序列,是決定遺傳性狀的功能。 2、組:細(xì)胞或生物體的一套完整單倍體的遺傳物質(zhì)的總和。
19、3、端粒:以線性形式存在的真核組 DNA 末端都有一種特殊的結(jié)構(gòu)叫端粒。該結(jié)構(gòu)是一段 DNA 序列和蛋白質(zhì)形成的一種復(fù)合體,僅在真核細(xì)胞末端存在。4、子:是指數(shù)個(gè)功能上相關(guān)的結(jié)構(gòu)串聯(lián)在一起,信息區(qū),連同其上游的調(diào)控區(qū)(包括啟動(dòng)子和)以及下游的轉(zhuǎn)錄終止信號(hào)所的表達(dá),所轉(zhuǎn)錄的RNA 為多順反子。 5、 順式作用元件:是指那些與結(jié)構(gòu)表達(dá)調(diào)控相關(guān)、能夠被調(diào)控蛋白特異性識(shí)別和結(jié)合的特異 DNA 序列。包括啟動(dòng)子、上游啟動(dòng)子元件、增強(qiáng)子、加尾信號(hào)和一些反應(yīng)元件等。 6、 反式作用因子:是指真核細(xì)胞內(nèi)含有的大量可以通過直接或間接結(jié)合順式作用元件而調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)錄活性的蛋白質(zhì)因子。 7、 啟動(dòng)子:是 RNA 聚合酶特
20、異性識(shí)別和結(jié)合的 DNA 序列。 8、 增強(qiáng)子:位于真核中遠(yuǎn)離轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn),能明顯增強(qiáng)啟動(dòng)子轉(zhuǎn)錄效率的特殊 DNA 序列。它可位于被增強(qiáng)的轉(zhuǎn)錄的上游或下游,也可相距靶較遠(yuǎn)。 9、表達(dá):是指生物組中結(jié)構(gòu)所攜帶的遺傳信息經(jīng)過轉(zhuǎn)錄、翻譯等一系列過程,特定的蛋白質(zhì),進(jìn)而發(fā)揮其特定的生物學(xué)功能和生物學(xué)效應(yīng)的全過程。 10、 信息分子:調(diào)節(jié)細(xì)胞生命活動(dòng)的化學(xué)物質(zhì)。其中由細(xì)胞的調(diào)節(jié)靶細(xì)胞生命活動(dòng)的化學(xué)物質(zhì)稱為細(xì)胞間信息分子;而在細(xì)胞內(nèi)傳遞信息調(diào)控信號(hào)的化學(xué)物質(zhì)稱為細(xì)胞內(nèi)信息分子。11、 受體:是存在于靶細(xì)胞膜上或細(xì)胞內(nèi)能特異識(shí)別生物活性分子并與之結(jié)合,進(jìn)而發(fā)生生物學(xué)效應(yīng)的的特殊蛋白質(zhì)。 12、 分子克?。涸隗w
21、外對(duì) DNA 分子按照即定目的和方案進(jìn)行人工重組,將重組分子導(dǎo)入合適宿主,使其在宿主中擴(kuò)增和繁殖,以獲得該 DNA 分子的大量拷貝。 13、 蛋白激酶:是指能夠?qū)⒘姿釓牧姿峁w分子轉(zhuǎn)移到底物蛋白的氨基酸受體上的一大類酶。 14、 蛋白磷酸酶:是具有催化已經(jīng)磷酸化的蛋白質(zhì)分子發(fā)生去磷酸化反應(yīng)的一類酶分子,與蛋白激酶相對(duì)應(yīng)存在,共同了磷酸化和去磷酸化這一重要的蛋白質(zhì)活性的開關(guān)系統(tǒng)。 15、工程:有目的的通過分子克隆技術(shù),人為的操作改造,改變生物遺傳性狀的系列過程。 16、載體:能在連接酶的作用下和外源 DN段連接并運(yùn)送 DNA 分子進(jìn)入受體細(xì)胞的DNA 分子。 17、 轉(zhuǎn)化:指質(zhì)粒DNA 或以它為
22、載體構(gòu)建的重組DNA 導(dǎo)入細(xì)菌的過程。 18、:以噬菌體、粘性質(zhì)粒和真核細(xì)胞為載體的重組 DNA 分子,在體外經(jīng)過包裝成具有能力的或噬菌體顆粒,才能適當(dāng)?shù)募?xì)胞,并在細(xì)胞內(nèi)擴(kuò)增。 19、 轉(zhuǎn)導(dǎo):指以噬菌體為載體,在細(xì)菌之間轉(zhuǎn)移 DNA 的過程,有時(shí)也指在真核細(xì)胞之間通過逆轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)移和獲得細(xì)胞 DNA 的過程。 20、 轉(zhuǎn)染:指或以它為載體構(gòu)建的重組子導(dǎo)入真核細(xì)胞的過程。 21、 DNA 變性:在物理或化學(xué)的作用下,導(dǎo)致兩條 DNA 鏈之間的氫鍵斷裂,而核酸分子中的所有共價(jià)鍵則不受影響。 22、 DNA 復(fù)性:當(dāng)促使變性的解除后,兩條 DNA 鏈又可以通過堿基互補(bǔ)配對(duì)結(jié)合形成 DNA 雙螺旋結(jié)構(gòu)。
23、23、 退火:指將溫度降至引物的 TM 值左右或以下,引物與 DNA 摸板互補(bǔ)區(qū)域結(jié)合形成雜交鏈。 24、 筑巢 PCR:先用一對(duì)外側(cè)引物擴(kuò)增含目的的大片段,再用內(nèi)側(cè)引物以大片段為摸板擴(kuò)增獲取目的??梢蕴岣?PCR 的效率和特異性。 25、 原位 PCR:以組織固定處理細(xì)胞內(nèi)的 DNA或 RNA 作為靶序列,進(jìn)行 PCR 反應(yīng)的過程。 26、 定量 PCR:表達(dá)涉及的轉(zhuǎn)錄水平的研究常需要對(duì)mRNA 進(jìn)行定量測(cè)定,對(duì)此采用的 PCR 技術(shù)就叫定量PCR。27、打靶:是指通過 DNA 定點(diǎn)同源重組,改變組中的某一特定,從而在生物內(nèi)研究此的功能。 28、 DNA:DNA技術(shù)是指在固相支持物上原位寡核
24、苷酸或者直接將大量的 DNA 探針以顯微打印的方式有序地于支持物表面,然后與標(biāo)記的樣品雜交,通過對(duì)雜交信號(hào)的檢測(cè)分析,即可獲得樣品的遺傳信息。由于常用計(jì)算機(jī)硅作為固相支持物,所以稱為 DNA。 29、 錯(cuò)義突變:DNA 分子中堿基對(duì)的取代,使得 mRNA 的某一子發(fā)生變化,由它所編碼的氨基酸就變成另一種的氨基酸,使得多肽鏈中的氨基酸順序也相應(yīng)的發(fā)生改變的突變。30、 無義突變:由于堿基對(duì)的取代,使原來可以翻譯某種氨基酸的子變成了終止子的突變。 31、 同義突變:堿基對(duì)的取代并不都是引起錯(cuò)義突變和翻譯終止,有時(shí)雖然有堿基被取代,但在蛋白質(zhì)水平上沒有引起變化,氨基酸沒有被取代,這是因?yàn)橥蛔兒蟮淖雍?/p>
25、原來的子代表同一個(gè)氨基酸的突變。 32、 移碼突變:在編碼序列中,單個(gè)堿基、數(shù)個(gè)堿基的缺失或以及片段的缺失或等均可以使突變位點(diǎn)之后的三聯(lián)體閱讀框發(fā)生改變,不能編碼原來的蛋白質(zhì)的突變。 33、 癌:是細(xì)胞內(nèi)控制細(xì)胞生長(zhǎng)的,具有潛在的誘導(dǎo)細(xì)胞惡性轉(zhuǎn)化的特性。當(dāng)癌基因結(jié)構(gòu)或表達(dá)發(fā)生異常時(shí),其產(chǎn)物可使細(xì)胞增殖,導(dǎo)致腫瘤的發(fā)生。包括癌和細(xì)胞癌。 34、 細(xì)胞癌:存在于正常的細(xì)胞組中,與癌基因有同源序列,具有促進(jìn)正常細(xì)胞生長(zhǎng)、增殖、分化和發(fā)育等生理功能。在正常細(xì)胞內(nèi)未激活的細(xì)胞癌叫原癌,當(dāng)其受到某些條件激活時(shí),結(jié)構(gòu)和表達(dá)發(fā)生異常,能使細(xì)胞發(fā)生惡性轉(zhuǎn)化。 35、癌:存在于(大多是逆轉(zhuǎn)錄)組中能使靶細(xì)胞發(fā)生惡
26、性轉(zhuǎn)化的。它不編碼結(jié)分,對(duì)無作用,但是當(dāng)受到外界的條件激活時(shí)可產(chǎn)生誘導(dǎo)腫瘤發(fā)生的作用。 36、:以 DNA或 RNA 為材料,通過檢查的存在、結(jié)構(gòu)缺陷或表達(dá)異常,對(duì)的狀態(tài)和疾病作出的方法和過程。 37、 RFLP:即限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性,之間 DNA的核苷酸序列存在差異,稱為 DNA 多態(tài)性。若因此而改變了限制性內(nèi)切酶的酶切位點(diǎn)則可導(dǎo)致相應(yīng)的限制性片段的長(zhǎng)度和數(shù)量發(fā)生變化,稱為 RFLP。 38、治療:一般是指將限定的遺傳物質(zhì)轉(zhuǎn)入患者特定的靶細(xì)胞,以最終達(dá)到預(yù)防或改變特殊疾病狀態(tài)為目的治療方法。 39、 反義 RNA:堿基序列正好與有意義的 mRNA 互補(bǔ)的RNA 稱為反義 RNA??梢宰鳛橐?/p>
27、種調(diào)控特定表達(dá)段。 40、核酶:是一種可以催化 RNA 切割和RNA 剪接反應(yīng)的由RNA 組成的酶,可以作為表達(dá)和的抑制劑。 34、 細(xì)胞癌:存在于正常的細(xì)胞組中,與癌有同源序列,具有促進(jìn)正常細(xì)胞生長(zhǎng)、增殖、分化和發(fā)育等生理功能。在正常細(xì)胞內(nèi)未激活的細(xì)胞癌叫原癌,當(dāng)其受到某些條件激活時(shí),結(jié)構(gòu)和表達(dá)發(fā)生異常,能使細(xì)胞發(fā)生惡性轉(zhuǎn)化。 35、癌:存在于(大多是逆轉(zhuǎn)錄)組中能使靶細(xì)胞發(fā)生惡性轉(zhuǎn)化的。它不編碼結(jié)分,對(duì)無作用,但是當(dāng)受到外界的條件激活時(shí)可產(chǎn)生誘導(dǎo)腫瘤發(fā)生的作用。 36、:以 DNA 或RNA 為材料,通過檢查的存在、結(jié)構(gòu)缺陷或表達(dá)異常,對(duì)的狀態(tài)和疾病作出的方法和過程。 37、 RFLP:即
28、限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性,之間DNA 的核苷酸序列存在差異,稱為 DNA 多態(tài)性。若因此而改變了限制性內(nèi)切酶的酶切位點(diǎn)則可導(dǎo)致相應(yīng)的限制性片段的長(zhǎng)度和數(shù)量發(fā)生變化,稱為 RFLP。 38、治療:一般是指將限定的遺傳物質(zhì)轉(zhuǎn)入患者特定的靶細(xì)胞,以最終達(dá)到預(yù)防或改變特殊疾病狀態(tài)為目的治療方法。 39、 反義 RNA:堿基序列正好與有意義的 mRNA 互補(bǔ)的RNA 稱為反義 RNA??梢宰鳛橐环N調(diào)控特定表達(dá)段。 40、 核酶:是一種可以催化 RNA 切割和RNA 剪接反應(yīng)的由RNA 組成的酶,可以作為表達(dá)和的抑制劑。 41、 三鏈 DNA:當(dāng)某一 DNA 或 RNA 寡核苷酸與 DNA 高嘌呤區(qū)可結(jié)合形成
29、三鏈,能特異地結(jié)合在 DNA 的大溝中,并與富含嘌呤鏈上的堿基形成氫鍵。 42、 SSCP:?jiǎn)捂湗?gòu)象多態(tài)性檢測(cè)是一種基于 DNA 構(gòu)象差別來檢測(cè)點(diǎn)突變的方法。相同長(zhǎng)度的單鏈 DNA,如果堿基序列不同,形成的構(gòu)象就不同,這樣就形成了單鏈構(gòu)象多態(tài)性。 43、 管家:在生物體生命的全過程都是必須的,且在一個(gè)生物的幾乎所有細(xì)胞中持續(xù)表達(dá)的。 44、 細(xì)胞全能性:指同一種生物的所有細(xì)胞都含有相同的DNA,即的數(shù)目和種類是一樣的,但在不同階段,同一的不同組織和中表達(dá)的種類和數(shù)目是不同的。 45、 SD 序列:轉(zhuǎn)錄出的 mRNA要進(jìn)入核糖體上進(jìn)行翻譯,需要一段富含嘌呤的核苷酸序列與大腸桿菌 16S rRNA
30、3,末端富含嘧啶的序列互補(bǔ),是核糖體的識(shí)別位點(diǎn)。 46、 反義核酸技術(shù):是通過一種短鏈且與 DNA 或 RNA 互補(bǔ)的,以 DNA 或 RNA 為目標(biāo)抑制翻譯的反義分子,干擾目的的轉(zhuǎn)錄、剪接、轉(zhuǎn)運(yùn)、翻譯等過程的技術(shù)。 47、 核酸探針:探針是指能與某種大分子發(fā)生特異性相互作用,并在相互作用之后可以檢測(cè)出來的生物大分子。核酸探針是指能識(shí)別特異堿基順序的帶有標(biāo)記的一段 DNA 或 RNA 分子。 48、 周期蛋白:是一類呈細(xì)胞周期特異性或時(shí)相性表達(dá)、累積與分解的蛋白質(zhì),它與周期素依賴性激酶共同影響細(xì)胞周期的運(yùn)行。 49、 CAP:是大腸桿菌分解代謝物活化蛋白,這種蛋白可將葡萄糖饑餓信號(hào)傳遞個(gè)許多子
31、,使細(xì)菌在缺乏葡萄糖時(shí)可以利用其他碳源。 50、 順反子 51、 結(jié)構(gòu)域 二、 問答題(一)、原核、真核組的特點(diǎn)?答:1、組的特點(diǎn): 種類單一;單倍體組:每個(gè)組在中只出現(xiàn)一次;形式多樣;大小不一;動(dòng)物/細(xì)菌病毒與真核/原核相似:內(nèi)含子;具有不規(guī)則的結(jié)構(gòu);編碼區(qū)無間隔:通過宿主及本身酶切;無帽狀結(jié)構(gòu);結(jié)構(gòu)沒有翻譯起始序列。2、原核組的特點(diǎn): 為一條環(huán)狀雙鏈DNA;只有一個(gè)起點(diǎn);具有子結(jié)構(gòu);絕大部分為單拷貝;可表達(dá)約 50%,大于真核生物小于;一般是連續(xù)的,無內(nèi)含子;重復(fù)序列很少。 3、真核組的特點(diǎn): 真核生物組遠(yuǎn)大于原核生物組,結(jié)構(gòu)復(fù)雜,數(shù)龐大,具有多個(gè)起點(diǎn);組DNA與蛋白質(zhì)結(jié),于細(xì)胞核內(nèi);真核
32、為反子,而細(xì)菌和的結(jié)構(gòu)多為多順反子;組中非編碼區(qū)多于編碼區(qū);真核多為不連續(xù)的斷裂,由外顯子和內(nèi)含子鑲嵌而成;存在大量的重復(fù)序列;功能相關(guān)的各種;存在可移動(dòng)的遺傳;體細(xì)胞為雙倍體,而和為單倍體。(二)、乳糖子的作用機(jī)制?答:1、乳糖子的組成:大腸桿菌乳糖子含 Z、Y、A 三個(gè)結(jié)構(gòu),分別編碼半乳糖苷酶、透酶和半乳糖苷乙酰轉(zhuǎn)移酶,此外還有一個(gè)序列 O,一個(gè)啟動(dòng)子 P 和一個(gè)調(diào)節(jié)I。 2、阻遏蛋白的負(fù)性調(diào)節(jié):沒有乳糖存在時(shí),I編碼的阻遏蛋白結(jié)合于序列 O 處,乳糖子處于阻遏狀態(tài),不能分解乳糖的三種酶;有乳糖存在時(shí),乳糖作為誘導(dǎo)物誘導(dǎo)阻遏蛋白變構(gòu),不能結(jié)合于序列,乳糖子被誘導(dǎo)開放分解乳糖的三種酶。所以,
33、乳糖子的這種調(diào)控機(jī)制為可誘導(dǎo)的負(fù)調(diào)控。 3、CAP 的正性調(diào)節(jié):在啟動(dòng)子上游有 CAP結(jié)合位點(diǎn),當(dāng)大腸桿菌從以葡萄糖為碳源的環(huán)境轉(zhuǎn)變?yōu)橐匀樘菫樘荚吹沫h(huán)境時(shí),c濃度升高,與 CAP 結(jié)合,使 CAP 發(fā)生變構(gòu),CAP 結(jié)合于乳糖子啟動(dòng)序列附近的 CAP 結(jié)合位點(diǎn),激活 RNA 聚合酶活性,促進(jìn)結(jié)構(gòu)轉(zhuǎn)錄,調(diào)節(jié)蛋白結(jié)合于子后促進(jìn)結(jié)構(gòu)的轉(zhuǎn)錄,對(duì)乳糖子實(shí)行正調(diào)控,加速分解乳糖的三種酶。 4、協(xié)調(diào)調(diào)節(jié):乳糖子中的 I編碼的阻遏蛋白的負(fù)調(diào)控與 CAP 的正調(diào)控兩種機(jī)制,互相協(xié)調(diào)、互相制約。(三)、真核生物轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)控機(jī)制?答:真核生物在轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)控主要是通過反式作用因子、順式作用元件和 RNA 聚合酶的
34、相互作用來完成的,主要是反式作用因子結(jié)合順式作用元件后影響轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物的形成過程。 1、 轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物的形成:真核生物 RNA 聚合酶識(shí)別的是由通用轉(zhuǎn)錄因子與DNA 形成的蛋白質(zhì)-DNA 復(fù)合物,只有當(dāng)一個(gè)或多個(gè)轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合到DNA 上,形成有功能的啟動(dòng)子,才能被 RNA 聚合酶所識(shí)別并結(jié)合。轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物的形成過:TFD 結(jié)合A 盒;RNA 聚合酶識(shí)別并結(jié)合TNA 復(fù)合物形成一個(gè)閉合的復(fù)合物;其他轉(zhuǎn)錄因子與 RNA 聚合酶結(jié)合形成一個(gè)開放復(fù)合物。在這個(gè)過,反式作用因子的作用是:促進(jìn)或抑制 TFD 與A 盒結(jié)合;促進(jìn)或抑制 RNA 聚合酶與 TNA 復(fù)合物的結(jié)合;促進(jìn)或抑制轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物的
35、形成。 2、 反式作用因子:一般具有三個(gè)功能域(DNA 識(shí)別結(jié)合域、轉(zhuǎn)錄活性域和結(jié)合其他蛋白結(jié)合域);能識(shí)別并結(jié)合上游調(diào)控區(qū)中的順式作用元件;對(duì)的表達(dá)有正性或負(fù)性調(diào)控作用。3、 轉(zhuǎn)錄起始的調(diào)控: 反式作用因子的活性調(diào)節(jié):表達(dá)式調(diào)節(jié)反式作用因子出來就具有活性;共價(jià)修飾磷酸化和去磷酸化,糖基化;配體結(jié)合許多激素受體是反式作用因子;蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)相互作用蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)復(fù)合物的解離與形成。反式作用因子與順式作用元件的結(jié)合:反式作用因子被激活后,即可識(shí)別并結(jié)合上游啟動(dòng)件和增強(qiáng)子中的保守性序列,對(duì)轉(zhuǎn)錄起調(diào)節(jié)作用。反式作用因子的作用方式成環(huán)、滑動(dòng)、Oozing。 反式作用因子的組合式調(diào)控作用:每一種反式作用
36、因子結(jié)合順式作用元件后雖然可以發(fā)揮促進(jìn)或抑制作用,但反式作用因子對(duì)調(diào)控不是由單一因子完成的而是幾種因子組合發(fā)揮特定的作用。(四)、真核生物轉(zhuǎn)錄后水平的調(diào)控機(jī)制?答:(1)、5,端加帽和 3,端多聚腺苷酸化的調(diào)控意義:5,端加帽和 3,端多聚腺苷酸化是保持 mRNA 穩(wěn)定的一個(gè)重要,它至少保證 mRNA 在轉(zhuǎn)錄過不被降解。(2)、mRNA 選擇性剪接對(duì)表達(dá)調(diào)控的作用(3)、mRNA的控制(五)、受體的特點(diǎn)?答:1、高度專一性;2、高度親和性;3、可逆性;4、可飽和性;5、特定的作用模式(六)、表皮生長(zhǎng)因子介導(dǎo)的信號(hào)傳導(dǎo)途徑?答:表皮生長(zhǎng)因子受體是一個(gè)典型的蛋白酪氨酸激酶受體,這個(gè)信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑的主
37、要步驟是: 1、 受體二聚化的形成及其磷酸化:表皮生長(zhǎng)因子與受體的結(jié)合使受體發(fā)生二聚化,從而改變受體構(gòu)象,使蛋白酪氨酸激酶活性增強(qiáng),受體自身的幾個(gè)蛋白酪氨酸殘基在激酶的作用下發(fā)生磷酸化。 2、 募集接頭蛋白 Grb2:表皮生長(zhǎng)因子受體自身被磷酸化后,不僅其激酶活性增強(qiáng),而且其構(gòu)象發(fā)生變化,從而適合與含 SH2 結(jié)構(gòu)域的蛋白分子相結(jié)合。Grb2 是作為接頭蛋白結(jié)合到受體上。 3、調(diào)控分子 SOS 的活化:SOS 含有可與 SH3 結(jié)構(gòu)域相結(jié)合的富含脯氨酸基序,當(dāng) Grb2結(jié)合到磷酸化的表皮生長(zhǎng)因子受體后,它的兩個(gè) SH3 結(jié)構(gòu)域即可結(jié)合 SOS,使之活化。 4、 低分子量 G 蛋白 Ras 的活
38、化:SOS 可促進(jìn)RasGDP,結(jié)合GTP 的反應(yīng),使Ras 激活?;罨腞as 作用其下游分子Raf,使之活化。Raf 是 MAPK 級(jí)聯(lián)反應(yīng)的第一個(gè)分子,由此啟動(dòng)了 MAPK 的三級(jí)激活過程。 5、 MAPK 的級(jí)聯(lián)激活:Raf是一種 MAPKKK,它作用于 MEK,使之磷酸化而激活,活化的 MEK 在作用于 MAPK的 ERK1,使之磷酸化激活由此完成了三級(jí)激活。 6、 轉(zhuǎn)錄因子的磷酸化及轉(zhuǎn)錄調(diào)控作用:活化的 ERK 可以轉(zhuǎn)至細(xì)胞核內(nèi),使某些轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子發(fā)生磷酸化,從而影響的轉(zhuǎn)錄。(七)、c信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑?答:1、組成:胞外信息分子(主要是胰高血糖素、腎上腺素和促腎上腺皮質(zhì)激素),受體,G
39、 蛋白,AC,c, PKA。 2、途徑: ? 信號(hào)分子與受體結(jié)合,引起受體構(gòu)象變化 ? 受體活化 G 蛋白 ? 活化后的G 蛋白激活腺苷酸環(huán)化酶(AC) ? AC 催化ATP 生成 c? c活化 PKA,PKA使目標(biāo)蛋白磷酸化,調(diào)節(jié)代謝酶的活性或調(diào)節(jié)的表達(dá)(八)、IP3-Ca2+信號(hào)途徑:?信號(hào)分子與受體結(jié)合,引起受體構(gòu)象變化 ? 受體活化G 蛋白 ? 活化后的G 蛋白激活PLC ? PLC 水解PIP2 生成IP3 和DG ? IP3 使鈣通道打開,細(xì)胞內(nèi) Ca2+升高 ? Ca2+與 CaM 結(jié)合,激活 Ca2+-CaM 依賴的蛋白激酶 ? Ca2+-CaM 依賴的蛋白激酶使目標(biāo)蛋白磷酸化
40、。(九)、分子克隆中常用的工具酶及良好載體的條件?答:(1)、常用的工具酶 1、 限制性核酸內(nèi)切酶:是細(xì)菌產(chǎn)生的一類能識(shí)別和切割雙鏈 DNA 分子內(nèi)特定的堿基順序的核酸水解酶。 2、 DNA 連接酶:將兩段 DNA 分子拼接起來的酶。3、 DNA 聚合酶:催化單核苷酸鏈延伸。 4、 逆轉(zhuǎn)錄酶:依賴于 RNA 的 DNA 聚合酶,這是一種有效的轉(zhuǎn)錄 RNA 成為DNA 的酶,產(chǎn)物 DNA 又稱互補(bǔ) DNA。 5、 末端脫氧核糖核酸轉(zhuǎn)移酶:將脫氧核糖核酸加到 DNA 的 3 末端。 6、 堿性磷酸酶:催化去除DNA、RNA 等的 5 磷酸基團(tuán)。 7、 依賴DNA 的 RNA 聚合酶:識(shí)別特異性啟動(dòng)
41、子,RNA 轉(zhuǎn)錄。(2)、良好載體的條件 1、必須有自身的子;2、載體分子上必須有限制性核酸內(nèi)切酶的酶切位點(diǎn),即多克隆位點(diǎn),以供外源DNA;3、載體應(yīng)具有可供選擇的遺傳標(biāo)志,以區(qū)別陽性重組子和重組子;4、載體分子必須有足夠的容量;5、可通過特定的方法導(dǎo)入細(xì)胞;6、對(duì)于表達(dá)載體還應(yīng)具備與宿主細(xì)胞相適應(yīng)的啟動(dòng)子、前導(dǎo)順序、增強(qiáng)子、加尾信號(hào)等DNA 調(diào)控元件。(十)、藍(lán)-選的原理?答:某些質(zhì)粒帶有大腸桿菌的半乳糖苷酶片段,在半乳糖苷酶的區(qū)外又另外引入了一段含多種單一限制酶位點(diǎn)的 DNA 序列。這些位點(diǎn)上如果沒有克隆外源性 DN段,在質(zhì)粒被導(dǎo)入 lac-的大腸桿菌后,質(zhì)粒攜帶的半乳糖苷酶將正常表達(dá),與
42、大腸桿菌的半乳糖苷酶互補(bǔ),產(chǎn)生有活性的半乳糖苷酶,加入人工底物 X-gal 和誘導(dǎo)劑 IPTG 后,出現(xiàn)藍(lán)色的菌落。如果在多克隆位點(diǎn)上外源 DN段,將使 lac Z滅活,不能生成半乳糖苷酶,結(jié)果菌落出現(xiàn)白色。由于這種顏色標(biāo)志,重組克隆和非重組克隆的區(qū)分一目了然。十一)SANGER 雙脫氧鏈終止法的原理?答:DNA 鏈中核苷酸以 3,5-磷酸二酯鍵連接,DNA 所用的底物是 2-脫氧核苷三磷酸。2,3ddNTP 與普通 dNTP 不同,它們?cè)诿撗鹾颂堑?3位置缺少一個(gè)羥基。在 DNA 聚合酶作用下通過三磷酸基團(tuán)摻入到延伸的DNA 鏈中,但由于沒有 3羥基,不能同后續(xù)的 dNTP 形成磷酸二酯鍵,
43、因此,正在延伸的 DNA鏈不能繼續(xù)延伸。在 DNA反應(yīng)混合物的 4 種普通 dNTP 中加入少量的一種ddNTP,鏈延伸將與偶然發(fā)生但卻十分特異的鏈終止競(jìng)爭(zhēng),產(chǎn)物是一系列的核苷酸鏈,其長(zhǎng)度取決于引物末端到出現(xiàn)過早鏈終止位置間的距離。在 4 組獨(dú)立酶反應(yīng)中分別采用 4 種不同的 ddNTP,結(jié)果將產(chǎn)生 4 組寡核苷酸,它們將分別終止于模板鏈的 A、C、G 或 T 位置。(十二)、核酸分子雜交的原理?答:具有互補(bǔ)序列的兩條單鏈核酸分子在一定的條件下(適宜的溫度及離子強(qiáng)度等)堿基互補(bǔ)配對(duì)結(jié)合,重新形成雙鏈;在這一過,核酸分子經(jīng)歷了變性和復(fù)性的變化,以及在復(fù)性過個(gè)分子間鍵的形成和斷裂。雜交的雙方是待測(cè)
44、核酸和已知序列。(十三)、影響雜交的?答:1、核酸分子的濃度和長(zhǎng)度:核酸濃度越大,復(fù)性速度越快。探針長(zhǎng)度應(yīng)控制在 50-300個(gè)堿基對(duì)為好。 2、溫度:溫度過高不利于復(fù)性,而溫度過低,少數(shù)堿基配對(duì)形成的局部雙鏈不易解離,適宜的溫度是較 TM 值低 25 度。 3、離子強(qiáng)度:在低離子強(qiáng)度下,核酸雜交非常緩慢,隨著離子強(qiáng)度的增加,雜交反應(yīng)率增加。高濃度的鹽使堿基錯(cuò)配的雜交體更穩(wěn)定,所以進(jìn)行序列不完全同源的核酸分子雜交時(shí)必須維持雜交反應(yīng)液中的鹽濃度和洗膜液中的鹽濃度。 4、雜交液中的甲酰胺:甲酰胺能降低核酸雜交的 TM 值。它有以下優(yōu)點(diǎn):在低溫下探針更穩(wěn)定;能更好地保留非共價(jià)結(jié)合的核酸。 5、核酸分
45、子的復(fù)雜性:是指存在于反應(yīng)體系中的不同順序的總長(zhǎng)度。兩個(gè)不同組DNA 變性后的相對(duì)雜交速率取決于樣品濃度絕對(duì)一致時(shí)的相對(duì)復(fù)雜性(即 DNA 中的堿基數(shù))。 6、非特異性雜交反應(yīng):在雜交前應(yīng)對(duì)非特異性雜交反應(yīng)位點(diǎn)進(jìn)行封閉,以減少其對(duì)探針的非特異性吸附作用。(十四)、探針的種類和優(yōu)缺點(diǎn)?答:1、cDNA探針:通過逆轉(zhuǎn)錄獲得 cDNA 后,將其克隆于適當(dāng)?shù)目寺≥d體,通過擴(kuò)增重組質(zhì)粒而使 cDNA 得到大量的擴(kuò)增。提取質(zhì)粒后分離純化作為探針使用。它是目前應(yīng)用最為廣泛的一種探針。 2、組探針:從組文庫里篩選得到一個(gè)特定的或片段的克隆后,大量擴(kuò)增、純化,切取片段,分離純化為探針。 3、寡核苷酸探針:根據(jù)已
46、知的核酸順序,采用 DNA儀一定長(zhǎng)度的寡核苷酸片段作為探針。 4、RNA 探針:采用克隆和體外轉(zhuǎn)錄的方法可以得到RNA 或反義RNA 作為探針。(十五)、探針的標(biāo)記法?答:1、缺口平移法:此法是利用適當(dāng)濃度的 DNase 在DNA雙鏈上隨機(jī)切割單鏈,造成單鏈切口。切口處產(chǎn)生一個(gè) 5 末端和 3 末端,3 末端就可以作為引物,在大腸桿菌 DNA 聚合酶的催化下,以互補(bǔ)的 DNA 單鏈為摸板,依次將 dNTP 連接到切口的 3 末端的羥基上,新的 DNA 單鏈;同時(shí) DNA 聚合酶的 53 的核酸外切酶活性在切口處將舊鏈從 5 末端逐步切除,新鏈不斷延伸,從而使原 DNA 分子上的部分核苷酸殘基被
47、標(biāo)記的核苷酸所取代。 2、隨機(jī)引物法:隨機(jī)引物是人工的長(zhǎng)度為 6 個(gè)寡核苷酸殘基的寡聚核苷酸片段的混合物。對(duì)于任何一個(gè)用作探針的 DN段,隨機(jī)引物混合物中都會(huì)有一些六核苷酸片段可以與之結(jié)合,起到 DNA引物的作用。將這些引物與變性的 DNA 單鏈結(jié)合后,以 4 種dNTP(其中一種是標(biāo)記物標(biāo)記的 dNTP)為底物,與探針DNA 互補(bǔ)的切帶有標(biāo)記物的 DNA 探針。 3、PCR 標(biāo)記法:在 PCR 反應(yīng)底物中,將一種 dNTP 換成標(biāo)記物標(biāo)記的 dNTP, 這樣標(biāo)記的 dNTP 就在 PCR 反應(yīng)的同時(shí)摻入到新的 DNA 鏈上。 4、末端標(biāo)記法:只是將 DN段的一端進(jìn)行標(biāo)記。(十六)、PCR 的
48、基本原理?答:PCR 是在試管中進(jìn)行的 DNA反應(yīng),基本原理是依據(jù)細(xì)胞內(nèi) DNA 半保留復(fù)制的機(jī)理,以及體外 DNA 分子于不同溫度下雙鏈和單鏈可以互相轉(zhuǎn)變的性質(zhì),人為地控制體外系統(tǒng)的溫度,以促使雙鏈 DNA 變成單鏈,單鏈 DNA 與人工的引物退火,然后耐熱 DNA 聚合酶以 dNTP 為原料使引物沿著單鏈模板延伸為雙鏈DNA。PCR 全過程每一步的轉(zhuǎn)換是通過溫度的改變來控制的。需要重復(fù)進(jìn)行 DNA 模板解鏈、引物與模板DNA 結(jié)合、DNA 聚合酶催化新生 DNA 的,即高溫變性、低溫退火、中溫延伸個(gè)步驟PCR 反應(yīng)的一個(gè)循環(huán),此循環(huán)的反復(fù)進(jìn)行,就可使目的 DNA 得以迅速擴(kuò)增。DNA 模板
49、變性:模板雙鏈 DNA?單鏈 DNA,94。退火:引物單鏈DNA?雜交鏈,引物的 Tm 值。引物的延伸:溫度至 70 左右, Taq DNA聚合酶以種 dNTP 為原料,以目的DNA 為模板,催化以引物末端為起點(diǎn)的 53DNA 鏈延伸反應(yīng),形成新生 DNA 鏈。新的引物延伸鏈經(jīng)過變性后又可作為下一輪循環(huán)反應(yīng)的模板 PCR,就是如此反復(fù)循環(huán),使目的 DNA 得到高效快速擴(kuò)增。(十七)、PCR 引物設(shè)計(jì)的基本要求?答:1、引物長(zhǎng)度一般為 1530 個(gè)核苷酸。過短影響 PCR 的特異性,過長(zhǎng)會(huì)提高相應(yīng)退火溫度,使延伸溫度超過 TaqDNA 聚合酶最適溫度 74,影響產(chǎn)物的生成。 2、引物的堿基盡可能
50、隨機(jī),避免出現(xiàn)嘌呤、嘧啶堿基堆積現(xiàn)象。3端不應(yīng)有連續(xù) 3 個(gè) G 和 C。否則會(huì)使引物和模板錯(cuò)誤配對(duì)。G+C含量一般占 45 -55。3端和 5端引物具有相似的 Tm 值,Tm 值計(jì)算公式:Tm4(G+C)+ 2(A+T) 3、引物自身不應(yīng)存在互補(bǔ)序列以避免折疊成發(fā)夾結(jié)構(gòu)。引物的連續(xù)互補(bǔ)序列,一般不超過 3bp。 4、兩個(gè)引物之間不應(yīng)存在互補(bǔ)序列,尤其應(yīng)避免3端的互補(bǔ)。 5、引物與非特異擴(kuò)增區(qū)的序列的同源性不超過 70,引物 3末端連續(xù) 8 個(gè)堿基在待擴(kuò)增區(qū)以外不能有完全互補(bǔ)序列,否則易導(dǎo)致非特異性擴(kuò)增。6、引物 3端堿基是延伸的起點(diǎn),因此一定要與模板 DNA 配對(duì)。引物 3端最佳堿基選擇是
51、G 和 C,形成的堿基配對(duì)比較穩(wěn)定。 7、引物與模板結(jié)合時(shí),引物的 5端最多可以游離十幾個(gè)堿基而不影響 PCR 反應(yīng)的進(jìn)行。 8、引物的 5端可以修飾,如附加限制酶位點(diǎn),引入突變位點(diǎn),用生物素、熒光物質(zhì)、地高辛標(biāo)記,加入其它短序列包括起始子、終止子等(十八)、PCR 的反應(yīng)條件?答:1、PCR 反應(yīng)的緩沖液: ? Tris-HCl 緩沖液 ? KCl 促進(jìn)引物的退火,濃度太高時(shí)會(huì)抑制 Taq DNA 聚合酶活性。 ? 加入 BSA 或明膠有利于保護(hù) TaqDNA 聚合酶活性。 ? 必要時(shí)加入適量二甲基亞砜(DMSO)或甲酰胺利于破壞模板二級(jí)結(jié)構(gòu),提高 PCR 反應(yīng)特異性。 2、鎂離子濃度 一般
52、用量 1.5-2.0 mmol/L,Taq DNA 聚合酶活性需要 Mg 2+。Mg 2+濃度過低,會(huì)顯著降低酶活性。Mg 2+濃度過高又使酶催化非特異性擴(kuò)增增強(qiáng)。Mg 2+濃度還會(huì)影響引物的退火、模板與 PCR 產(chǎn)物的解鏈溫度,從而影響擴(kuò)增片段的產(chǎn)率。3、底物濃度 工作濃度 20-200umol/L, dNTPs 濃度過高可加快反應(yīng)速度,也增加堿基的錯(cuò)配率和實(shí)驗(yàn)成本。降低濃度會(huì)導(dǎo)致反應(yīng)速度下降,可提高反應(yīng)的特異性。在PCR 反應(yīng)中,4 種 dNTP 必須以等摩爾濃度配制,以減少 PCR 反應(yīng)的錯(cuò)配誤差并提高使用效率。 4、Taq DNA 聚合酶 75-80時(shí)具有最高的聚合酶活性,150 個(gè)核
53、苷酸/秒;具有良好的熱穩(wěn)定性,95仍有活性,應(yīng)用濃度一般為 1-2.5u/100ul 反應(yīng)體積。 5、引物 0.1-0.5umol/L。引物濃度偏高會(huì)引起錯(cuò)配或非特異性擴(kuò)增、生成引物二聚體,使目的 DN段產(chǎn)率下降。退火溫度與引物 Tm 值有關(guān),引物 Tm 值在55-80 范圍較為理想。 6、反應(yīng)溫度和循環(huán)次數(shù)(十九)、影響大腸桿菌系統(tǒng)外源表達(dá)的?答:1、啟動(dòng)子的強(qiáng)弱;2、的劑量;3、影響RNA 轉(zhuǎn)錄和翻譯效率的:SD 序列、mRNA;4、外源子的選擇;5、表達(dá)產(chǎn)物的大??;6、表達(dá)產(chǎn)物的穩(wěn)定性。(二十)、大腸桿菌系統(tǒng)表達(dá)外源必須具備的條件?答:1、要求外源的編碼區(qū)不能含有內(nèi)含子; 2、表達(dá)的外源
54、片段要位于大腸桿菌啟動(dòng)子的下游,并形成正確的閱讀框架;3、轉(zhuǎn)錄出的 mRNA 必須有與大腸桿菌 16S rRNA3,末端相匹配的 SD 序列,才能被有效的翻譯成蛋白質(zhì)。 4、蛋白產(chǎn)物必須穩(wěn)定,不易被細(xì)胞內(nèi)蛋白酶快速降解,且對(duì)宿主無害。(二十一)、真核細(xì)胞表達(dá)外源的條件?答:1、首先必須具備哺乳動(dòng)物細(xì)胞表達(dá)的功能元件。要求哺乳動(dòng)物細(xì)胞表達(dá)載體帶有能在真核細(xì)胞中表達(dá)外源的真核轉(zhuǎn)錄調(diào)控元件; 2、注意選擇轉(zhuǎn)染的受體細(xì)胞,不同類型的細(xì)胞具有不同的特性; 3、注意選擇適當(dāng)?shù)倪x擇標(biāo)記。(二十二)、轉(zhuǎn)動(dòng)物的概念、原理及應(yīng)用?答:1、概念:是指用人工方法將外源導(dǎo)入或整合到組內(nèi),并能穩(wěn)定傳代的一類動(dòng)物。它的特點(diǎn)
55、是“分子及細(xì)胞水平操作,組織及動(dòng)物整體水平表達(dá)”。 2、基本原理:將目的或組片段用顯微注射等方法注入實(shí)驗(yàn)動(dòng)物的卵或著床前的胚胎細(xì)胞中,使目的整合到組中,然后將此受精卵或著床前的胚胎細(xì)胞再植入受體動(dòng)物的或中,使其發(fā)育成攜帶有外源的轉(zhuǎn)動(dòng)物,人們可以通過分析轉(zhuǎn)和動(dòng)物表型的關(guān)系,揭示外源的功能;也可以通過轉(zhuǎn)入外源培育優(yōu)良的動(dòng)物品種。 3、應(yīng)用:建立用于研究外源基因表達(dá)調(diào)控體系;建立醫(yī)學(xué)中常用的疾病模型;培育動(dòng)物新品種;藥理學(xué)和藥用蛋白的生產(chǎn)研究。(二十三)、敲除的基本程序?答:通過 DNA 同源重組,使得胚胎干細(xì)胞特定的內(nèi)源被破壞而造成功能喪失,然后通過胚胎干細(xì)胞介導(dǎo)得到該喪失的小鼠模型的過程稱為敲除
56、。 1、 打靶載體的構(gòu)建:同源序列要足夠長(zhǎng),要含有篩選用的標(biāo)志。 2、 胚胎干細(xì)胞的體外培養(yǎng) 3、 打靶載體導(dǎo)入胚胎干細(xì)胞 4、 同源重組胚胎干細(xì)胞的篩選 5、敲除胚胎干細(xì)胞注射入胚泡 6、 胚泡植入假孕小鼠的中 7、 雜交育種獲得純合的敲除動(dòng)物(二十四)、DNA 芯片的原理?答:DNA技術(shù)就是一種大規(guī)模的集成的固相核酸分子雜交,以大量已知堿基序列的寡核苷酸片段為探針,檢測(cè)樣品中哪些核酸序列與其互補(bǔ),然后通過定性定量分析得出待測(cè)樣品的序列及表達(dá)的信息。其方法包括的、樣品的準(zhǔn)備、分子雜交和檢測(cè)分子。(二十五)、誘變劑的作用機(jī)制?答:1、堿基的類似物誘發(fā)突變 2、改變 DNA 的化學(xué)結(jié)構(gòu) 3、結(jié)合
57、到 DNA 分子上誘發(fā)移碼突變 4、紫外線及其他射線引起的 DNA 分子的變化(二十六)、突變類型及其遺傳效應(yīng)?答:1、突變類型: 點(diǎn)突變:DNA 大分子上一個(gè)堿基的變異。分為轉(zhuǎn)換和顛換。 缺失:一個(gè)堿基或一段核苷酸鏈從 DNA 大分子上。 :一個(gè)原來沒有的堿基或一段原來沒有的核苷酸鏈到 DNA 大分子中間。 倒位:DNA 鏈內(nèi)重組,使其中一段方向倒置。 2、突變的遺傳效應(yīng): 遺傳的改變:錯(cuò)義突變、無義突變、同義突變、移碼突變 對(duì) mRNA 剪接的影響:一是使原來的剪接位點(diǎn);二是產(chǎn)生新的剪接位點(diǎn)。 蛋白質(zhì)肽鏈中的片段缺失:(二十七)、治療的策略?答:1、置換或稱矯正:特定的目的導(dǎo)入特定的細(xì)胞,
58、通過定位重組,讓導(dǎo)入的正常置換組內(nèi)原有的缺陷,不涉及組的任何改變。分子生物學(xué)試題及一、1 cDNA 與 cccDNA: cDNA 是由 mRNA 通過反轉(zhuǎn)錄酶的雙鏈DNA ;cccDNA 是游離 于之外的質(zhì)粒雙鏈閉合環(huán)形 DNA 。2 標(biāo)準(zhǔn)折疊:蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)單元螺旋與折疊通過各種連接多肽可以組成特殊幾何排列的結(jié)構(gòu)塊,此種確定的折疊類型通常稱為超二級(jí)結(jié)構(gòu)。幾乎所有的三級(jí)結(jié)構(gòu)都可以 用這些 折疊類型, 乃至他們 的組合型 來予 以 描述 , 因 此 又將其 稱為標(biāo)準(zhǔn)折疊。 3 CAP :環(huán) 腺苷酸( c)受 體蛋白 CRP ( creceptor protein ) ,c與 CRP 結(jié)合 后 所
59、形成的 復(fù) 合物稱 激活 蛋白 CAP ( cactivatedprotein )4 回文序 列: DN段上 的一 段 所 具 有的反 向互補(bǔ)序 列,常是限制性 酶 切位 點(diǎn) 。 5 micRNA : 互補(bǔ)干擾 RNA 或 稱反 義 RNA ,與 mRNA序 列 互補(bǔ) ,可 抑制 mRNA 的 翻譯 。 6 核 酶: 具 有 催化活性 的 RNA , 在 RNA 的 剪 接加工 過起到自我催化 的 作用 。 7 模 體:蛋白質(zhì)分子 空間 結(jié)構(gòu) 中存在著某些形 狀和拓?fù)?結(jié)構(gòu) 頗 為類 似 的 局部區(qū)域 8 信號(hào) 肽: 在 蛋白質(zhì)過 程中 N 端 有 1536 個(gè)氨基酸殘基 的肽 段 , 引導(dǎo)
60、蛋白質(zhì)的 跨膜 。 9 弱化 子: 在區(qū) 與結(jié)構(gòu)之 間 的一 段可以 終止 轉(zhuǎn)錄 作用 的 核苷酸序 列。10 魔斑 : 當(dāng)細(xì)菌 生 長(zhǎng) 過, 遇 到氨基酸 全面缺乏時(shí) , 細(xì)菌 將 會(huì)產(chǎn)生一個(gè) 應(yīng)急 反 應(yīng) , 停 止 全 部的 表達(dá) 。 產(chǎn) 生 這 一 應(yīng)急 反 應(yīng) 的 信號(hào)是鳥苷 四磷 酸 (ppGpp) 和 鳥 苷五磷 酸( pppGpp ) 。 PpGpp 與 pppGpp 的作用不只 是一 個(gè)或幾 個(gè)子,而 是 影響 一 大批 ,所以稱 他們 是超級(jí) 調(diào) 控子或稱為 魔斑 。11 上 游 啟動(dòng)件 :是 指對(duì)啟動(dòng) 子的 活性起到 一種 調(diào)節(jié) 作用 的 DNA序列, -10 區(qū) 的A
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