腫瘤登記軟件使用介紹

1、腫瘤登記軟件使用介紹主要內(nèi)容全國腫瘤登記中心推薦使用國際癌癥研究中心(IARC)/國際癌癥登記協(xié)會(IACR)編制的兩款軟件：腫瘤登記軟件CanReg4：用于登記資料的收集與簡單分析腫瘤登記工具軟件IARCcrgTools：用于編碼的轉(zhuǎn)換與數(shù)據(jù)審核軟件的獲得兩個軟件均可從如下網(wǎng)址下載： 腫瘤登記軟件CanReg4使用需要授權，國際腫瘤登記協(xié)會（IARC）會員可以免費使用腫瘤登記工具軟件（IARC/IACR Cancer Registries Tools)可以免費使用CanReg概述CanReg是由國際癌癥研究中心描述流行病學室開發(fā)的腫瘤登記軟件，目前第4版，即將推出第5版 CanReg4是由

2、Andy Cooke、Max Parkin、Jacques Ferlay等人開發(fā)的1. CanReg特點CanReg用于基于人群腫瘤登記的軟件CanReg3最早在1996年發(fā)布，是DOS下使用的；CanReg4運行于Windows操作系統(tǒng)下目前全世界已經(jīng)有100多個腫瘤登記處在使用CanReg軟件CanReg特點CanReg4的解剖學部位及形態(tài)學編碼使用國際疾病分類腫瘤學專輯第三版（ICD-O-3）CanReg 4的數(shù)據(jù)錄入模塊中的檢查程序，可以很方便的檢查出不合格的、罕見的，以及重卡和多原發(fā)腫瘤病例記錄簡單易用的分析選項，包括按年的頻數(shù)分析表、發(fā)病頻數(shù)和發(fā)病率表等CanReg特點CanReg

3、4可擴充登記項目和數(shù)據(jù)質(zhì)量檢查項目CanReg4目前已有：英語、法語、西班牙語、意大利語，阿拉伯語、泰國語和簡體中文版等版本。各語言版本之間，可以方便地進行轉(zhuǎn)換2. CanReg4主要模塊數(shù)據(jù)錄入數(shù)據(jù)分析數(shù)據(jù)管理 數(shù)據(jù)錄入瀏覽/編輯記錄字典導入數(shù)據(jù)分析頻數(shù)分布（按年）發(fā)病率表導出/報告頻數(shù)/表格Epi-Info 6數(shù)據(jù)管理查看工作文件備份名字/性別檢查 （中文版不適用）重卡搜尋用戶/密碼選項CanReg4的安裝一、軟件的獲得與使用授權使用CanReg4必須得到授權，需要有由IACR/IARC統(tǒng)一定義的、帶有三位字符編碼的系統(tǒng)備份文件，且每個登記處使用唯一的編碼一、軟件的獲得與使用授權腫瘤登記處

4、為國際腫瘤登記協(xié)會（IACR）成為會員,才可以獲得免費CanReg4使用的授權全國腫瘤登記中心負責定義中國腫瘤登記處三位編碼，并授權使用CanReg4全國腫瘤登記中心以團體會員的形式，加入了IACR，因此各登記處可以得到授權使用CanReg4 使用現(xiàn)有系統(tǒng)登錄用戶名ANDY 密碼 cookeCanReg4的功能介紹登陸CanReg4用戶名： andy密碼： cooke數(shù)據(jù)錄入模塊瀏覽/編輯記錄字典導入瀏覽與編輯記錄CanReg4 的這個頁面用于瀏覽和編輯數(shù)據(jù)庫記錄瀏覽記錄：可利用篩選、排序和范圍等工具，對已有記錄進行查看。編輯記錄：可建立新記錄，或?qū)υ杏涗涍M行編輯、修改。使用篩選工具利用篩選

5、可以找出所需要的記錄:性別=1（男性）年齡=60性別=2 和年齡=60Sex=2 and Age 值 - 鍵入 60 完成利用快速篩選例如：選擇60歲以上的女性，先點擊.篩選工具右側的“笑臉”按鈕，然后選取排序CanReg4一共有7條索引： Registry No. : 登記號 / Update date : 更新日期 / Multiple Primary : 多原發(fā)腫瘤 / 發(fā)病日期 / Incidence date : 發(fā)病日期 / ICD-10 : ICD-10 / 性別 / Names : 姓名 / Pinyin : 姓名拼音 / 使用排序/范圍先將記錄根據(jù)選定索引進行排序然后為已排序

6、變量指定開始和結束范圍例如: 按發(fā)病日期排序, 僅顯示1991年和1992的記錄: 索引 =發(fā)病日期（Incidence Date） 開始 =1991 結束 =19929999導航按鈕下頁上頁第一個記錄最后一個記錄顯示變量點擊變量“單選按鈕”可以選擇顯示如下變量: 全部變量(All variables) 指定(強制性)變量(Mandatory variables)登記處定義為必須填寫的項目 關鍵變量(Key variables)姓名,年齡,發(fā)病日期,腫瘤部位等不可空缺的項目7. 編輯記錄使用右側3個按鈕可以編輯記錄:建立新記錄: 使用這個選項可建立一個新的空白記錄表，當保存這個記錄的時候，會自

7、動賦予一個登記號編輯表中記錄: 這個選項可編輯在數(shù)據(jù)表中的被藍色條標記的當前記錄編輯記錄號: 在按這個按鈕之前，先填寫你想編輯的記錄的登記號。如果記錄已經(jīng)存在，將打開這個記錄進行編輯；如果不存在，則打開一個空白記錄且將登記號賦予這個空白記錄使用這個選項可重新設置登記號。8. 刷新表格如果數(shù)據(jù)庫中的記錄數(shù)改變了，使用這個按鈕可以刷新顯示的列表新錄入的數(shù)據(jù)不會馬上顯示，刷新之后會顯示編輯頁面組成“系統(tǒng)變量”面板數(shù)據(jù)錄入“多原發(fā)腫瘤”面板 數(shù)據(jù)錄入表數(shù)據(jù)錄入表由4部分組成：病人信息腫瘤信息醫(yī)院信息隨訪信息變量名稱對于每個變量，有三個變量名：中文變量名 Long Variable names短的變量名

8、 Short Variable names英文變量名 English Variable names例如：出生日期 Birthda Birth Date病人信息變量11個腫瘤信息變量11個the International Classification of Childhood Cancer (ICCC). 國際兒童腫瘤分類醫(yī)院信息變量4個 隨訪信息變量6個新病例控制變量8個數(shù)據(jù)錄入 點“建立新記錄”在數(shù)據(jù)錄入過程中使用下列方法移動光標: - 向上或向下鍵可移動到下一個或上一個變量; - 回車鍵可到下個變量; - PgDown, PgUp 鍵可移動到下一個,上一個組; - Home, End 鍵

9、可移動到第一個, 最后一個變量。 - 鍵入 “?” 可看見字典彈出。使用鼠標，可以直接點擊想編輯的變量，并可在彈出的字典框中去選擇正確的編碼。數(shù)據(jù)錄入或修改后，必須完成以下步驟： 錄入檢查 當數(shù)據(jù)錄入完成后執(zhí)行各種的一致性檢查。重卡檢查 搜尋任何的可能屬于同一個病例的記錄。記錄狀態(tài) 改變記錄狀態(tài)是確認、掛起、或刪除。保存/退出如果更改過記錄內(nèi)容，將出現(xiàn)一個紅色的星號在”保存”按鈕旁邊 。 如果不保存，修改無效 ?！跋到y(tǒng)變量”面板 檢查狀態(tài)：是否做過，結果是什么。 重卡檢查：是否做過，結果是什么。 記錄狀態(tài)：在成功的完成“檢查” 和 “重卡搜尋” 程序以前，所有新的記錄都被設置成 “未確定的”。

10、只有被“確認”的病例記錄才可用于本軟件的分析。 保存/退出：保存或不保存退出。 更新日期：方框顯示的是這條記錄最后的編輯日期檢查內(nèi)容編輯檢查地方檢查（Local Checks）各登記處自定義項目的檢查強制性變量檢查（Mandatory Variables）登記處規(guī)定必須填寫的變量檢查名和性別（中文版不適用）交叉檢查（Cross-Checks）檢查項目發(fā)病日期檢查出生日期檢查年齡檢查死亡日期檢查性別檢查部位檢查形態(tài)學檢查行為檢查分期檢查診斷級別檢查發(fā)病日期/出生日期年齡 = 發(fā)病 - 出生發(fā)病日期/死亡日期部位/形態(tài)形態(tài)/行為性別/部位性別/形態(tài)年齡/部位年齡/形態(tài)年齡/部位/形態(tài)部位/行為重卡

11、檢查搜尋可能屬于同一個病例的記錄，既查重在查重過程中使用如下有關的變量：日期出生、居住地址、身份證號碼、姓名、拼音等，每個變量的權重不同如果沒有發(fā)現(xiàn)匹配的記錄,系統(tǒng)將會出一個提示信息。IARC有關多原發(fā)腫瘤的定義識別存在著兩個或兩個以上的原發(fā)腫瘤不取決于時間。一個原發(fā)腫瘤是一個起源于一個原發(fā)部位或組織的腫瘤。因此既不是擴散也不是復發(fā)和轉(zhuǎn)移。某一發(fā)生在一個或多個器官或組織（由ICD-O解剖學所限定的）腫瘤，除組織學不同外應認識是單一腫瘤。字典CanReg4允許登記處編輯字典內(nèi)容，并可添加或刪除代碼；編輯字典代碼注意事項及步驟：確定沒有用戶在使用輸出字典到文本文件根據(jù)需要對文本文件進行編輯輸入文本

12、文件到字典CanReg4中文版共有字典18個1.Record status記錄狀態(tài)10. Grade 分級2.Check status檢查狀態(tài)11. Tribe 民族3.Person search人工搜索12. Marital status婚姻狀況4.Topography解剖學部位13. Status最后接觸狀態(tài)5.Morphology形態(tài)14. Cause Death死亡原因6.Behaviour行為15. Address地址代碼7.Sex 性別16. Doctors醫(yī)師8.Basis Diagnosis 診斷依據(jù)17. Place of Death死亡地點9.Hospital醫(yī)院18. O

13、ccupation職業(yè)CanReg4中文版共有字典18個1.Record status記錄狀態(tài)10. Grade 分級2.Check status檢查狀態(tài)11. Tribe 民族3.Person search人工搜索12. Marital status婚姻狀況4.Topography解剖學部位13. Status最后接觸狀態(tài)5.Morphology形態(tài)14. Cause Death死亡原因6.Behaviour行為15. Address地址代碼7.Sex 性別16. Doctors醫(yī)師8.Basis Diagnosis 診斷依據(jù)17. Place of Death死亡地點9.Hospital醫(yī)

14、院18. Occupation職業(yè)新病例控制部分字典3個1.Record status記錄狀態(tài)10. Grade 分級2.Check status檢查狀態(tài)11. Tribe 民族3.Person search人工搜索12. Marital status婚姻狀況4.Topography解剖學部位13. Status最后接觸狀態(tài)5.Morphology形態(tài)14. Cause Death死亡原因6.Behaviour行為15. Address地址代碼7.Sex 性別16. Doctors醫(yī)師8.Basis Diagnosis 診斷依據(jù)17. Place of Death死亡地點9.Hospital醫(yī)

15、院18. Occupation職業(yè)病人信息部分字典5個Sex 性別Tribe 民族Marital status婚姻狀況Occupation職業(yè)Address 地址代碼腫瘤信息部分字典5個1.Record status記錄狀態(tài)10. Grade 分級2.Check status檢查狀態(tài)11. Tribe 民族3.Person search人工搜索12. Marital status婚姻狀況4.Topography解剖學部位13. Status最后接觸狀態(tài)5.Morphology形態(tài)14. Cause Death死亡原因6.Behaviour行為15. Address地址代碼7.Sex 性別16.

16、 Doctors醫(yī)師8.Basis Diagnosis 診斷依據(jù)17. Place of Death死亡地點9.Hospital醫(yī)院18. Occupation職業(yè)醫(yī)院信息部分字典2個Hospital 醫(yī)院Doctors 醫(yī)師隨訪信息部分字典3個Status 最后接觸狀態(tài)Cause Death死亡原因Place of Death死亡地點 軟件安裝完畢后需要根據(jù)實際情況修改字典修改字典修改字典點擊 數(shù)據(jù)錄入 點擊 字典修改字典點擊 ：輸出字典到文本文件找到 #9 - Hospital#15 - Addcode#16 - Doctors修改這三個地方的字典 修改字典 #9 - Hospital 報

17、告醫(yī)院#15 - Addcode 地區(qū)代碼#16 - Doctors 報告醫(yī)師根據(jù)實際情況修改這三個地方的字典 注意：其他字典內(nèi)容請勿修改修改字典#15 - Addcode地區(qū)代碼增加“區(qū)”代碼和“街道”的代碼。請注意，區(qū)的代碼4位，街道的代碼6位，且區(qū)的前四位代碼和街道的前四位代碼應該相同，否則區(qū)和街道不能對應。相應的，區(qū)可以改為”縣”,街道可以改為鄉(xiāng)鎮(zhèn)的代碼，這樣方便農(nóng)村登記地修改完畢之后請點擊輸入來自文本的字典否則修改的字典不保存修改字典點擊OK 后關閉字典即修改成功修改字典#15 - Addcode 地區(qū)代碼在字典中定義之后，錄入軟件中用到地區(qū)代碼的地方，需要定義“區(qū)”代碼和“街道”的

18、代碼，且區(qū)代碼的4位數(shù)和街道代碼應該對應 修改字典#9 - Hospital#16 - ICD-O-2 = ICD-O-3Check審核：一是檢查變量是否完整并在編碼范圍內(nèi)的有效性檢查；二是對不同變量之間是否合乎邏輯的一致性進行檢查；Check 程序變量的一致性審核Age/Incidence and birth dates 年齡/出生日期與發(fā)病日期Age/Site/Histology (ICD-O-3) 年齡/部位/組織學Site/Histology (ICD-O-3) 部位/組織學Sex/Site 性別/部位Check 程序變量的一致性審核Sex/Histology (ICD-O-3) 性別

19、/組織學Behaviour/Site (ICD-O-3) 行為/部位Behaviour/Histology (ICD-O-3) 行為/組織學Grade/Histology (ICD-O-3) 分級/組織學Basis of diagnosis/Histology (ICD-O-3) 診斷依據(jù)/組織學變量的一致性審核發(fā)病/出生日期： 發(fā)病日期 出生日期年齡/發(fā)病/出生日期：年齡=發(fā)病日期-出生日期 在Excel中用公式：=DATEDIF(出生日期,發(fā)病日期,“Y”) 計算年齡一致性審核:年齡/部位/組織學在一般情況下，某些腫瘤的部位和形態(tài)學，在某些特定年齡中是非常罕見的年齡在15歲以下的不太可能出

20、現(xiàn)的腫瘤： 腫瘤診斷不太可能出現(xiàn)的年齡 Hodgkin lymphoma（霍其金淋巴瘤） 0-2 Neuroblastoma（神經(jīng)細胞瘤） 10-14 Retinoblastoma（視網(wǎng)膜母細胞瘤） 6-14 Wilms tumour（維爾姆斯瘤） 9-14 Renal carcinoma（腎癌） 0-8 Hepatoblastoma（肝母細胞瘤） 6-14 一致性審核:部位/組織學部位/組織學通過兩種方式進行審核：一是通過審核某些形態(tài)學編碼僅用于特定部位的腫瘤編碼，如：8170/3 肝細胞癌（C22.0)，8586/3 胸腺癌（C37.9)二是通過審核“不常見的”或“不可能的”部位與形態(tài)學編

21、碼組合一致性審核:性別/部位男性，不應出現(xiàn)如下部位的腫瘤：C51._(外陰), C52._(陰道), C53._(宮頸), C54._(宮體), C55._(子宮), C56._(卵巢), C57._(其它和未特指的女性生殖器官), C58._(胎盤) 女性，不應出現(xiàn)如下部位的腫瘤：C60._(陰莖), C61._(前列腺), C62._(睪丸), C63._( 其它和未特指的男性生殖器官),Check 程序變量的有效性審核日期變量：格式 2000-01-12 或2007/01/09發(fā)病年齡：必須是數(shù)字格式，不大于105歲；如果出生日期和發(fā)病日期完整，年齡可以通過計算獲得；如果出生日期不詳，則

22、年齡字段必須是空白或是999（年齡不詳）性別：必須是有效編碼，如1、2或9(不詳)Check 程序變量的有效性審核解剖學部位編碼：必須是有效的ICD-O-3編碼, 如氣管編碼為C33, 或C33.9, 不能編碼為C33.0、C33.8 形態(tài)學編碼：必須是有效的ICD-O-3編碼，如沒有8006/3這個編碼 行為編碼：必須是0, 1, 2, 3 (或特殊編碼 6 或 9) 分級編碼：必須是有效的ICD-O-3編碼 IARC/IACR Cancer Registries Tools 使用對數(shù)據(jù)格式的要求數(shù)據(jù)庫文件必須以文本格式存放, 變量以間固定格式分隔每一病例用一行,要求必須包括以下變量:(1)

23、登記號； (2)性別；(3)年齡； (4)出生日期；(5)發(fā)病日期； (6)解剖學部位編碼(ICD-O-3)(7)組織學編碼(ICD-O-3)； (8)腫瘤行為編碼(ICD-O-3)；(9)腫瘤分級編碼(ICD-O-3)； (10)診斷依據(jù)編碼；數(shù)據(jù)格式 200701001 2 75 19321022 20070405 20070722 7 0 C20 C209 8010 39 C209 8010 39200701002 1 44 19630911 20070205 20070811 2 0 C22.9 C220 8000 39 C220 8000 39200701003 1 68 19380

24、413 20070106 20070708 2 0 C34.9 C349 8000 39 C349 8000 39200701004 2 49 19590530 20071002 20080525 7 0 C66 C669 8010 39 C669 8010 39200701005 2 69 19380714 20070723 20080205 2 0 C20 C209 8000 39 C209 8000 39200701006 1 80 19261025 20070509 20080124 2 0 C34.0 C340 8000 39 C340 8000 39200701007 1 59 1

25、9431003 20070410 20070521 2 0 C22.9 C220 8000 39 C220 8000 39200701008 2 78 19241125 20070122 20070805 2 0 C22.9 C220 8000 39 C220 8000 39200701009 1 83 19191119 20070506 20070807 2 0 C16.9 C169 8000 39 C169 8000 39200701010 1 72 19310209 20071005 20090818 7 0 C22.9 C220 8010 39 C220 8010 3920070101

26、9 2 84 19180511 20070225 20080208 7 0 C53.9 C539 8070 39 C539 8070 39200701020 1 74 19290116 20070819 20080419 7 0 C16.1 C161 8010 39 C161 8010 39File specification:1- 9 Year and ID11-11 Sex13-15 Age17-24 Date of birth26-33 Date of diagnosis35-42 Date of death44-44 Basis46-46 DCO48-52 ICD-1054-57 IC

27、D-O259-62 ICD-O2-morphology64-65 I CD-O2 Behavior and grade67-70 ICD-O372-75 ICD-O3-morphology77-78 ICD-O3 Behavior and grade使用crg Tools格式轉(zhuǎn)換當審核格式使用txt格式時，可能出現(xiàn)這樣提示使用crg Tools格式轉(zhuǎn)換打開IARCcrgToolsToolsFile Transfer點擊Input File欄下的Browse按鈕，選取Input文件 在Output File欄中鍵入輸出文件名下一步使用crg Tools格式轉(zhuǎn)換選中全部變量完成使用crg Tools編碼轉(zhuǎn)換打開IARCcrgToolsConversionsICD-0-3-ICD10點擊Input File欄下的Browse按鈕，選取Input文件(以文本格式存放,固定列寬)在Output File欄中鍵入輸出文件名下一步使用crg Tools編碼轉(zhuǎn)換打開IARCcrgToolsConversionsICD-0-3-ICD10點擊Input File欄下的Browse按鈕，選取Input文件(以文本格式存放,固定列寬)在Output File欄中鍵入輸出文件名下一步編碼轉(zhuǎn)換示例ICD-O-3到ICD10定義字段Registrat