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文檔簡介

1、第2章 染色體與DNA名詞解釋原癌基因:細胞內(nèi)與細胞增殖相關(guān)的正常基因,是維持機體正常生命活動所必須的,在進化上高等保守。 當原癌基因的結(jié)構(gòu)或調(diào)控區(qū)發(fā)生變異,基因產(chǎn)物增多或活性增強時,使細胞過度增殖,從而形成腫瘤。復(fù)制:以親代DNA或RNA為模板,根據(jù)堿基配對的原則,在一系列酶的作用下,生成與親代相同的子代DNA或RNA的過程。轉(zhuǎn)座子 (transposon 或 transposable element):位于染色體DNA上可自主復(fù)制和位移的基本單位。包括插入序列和復(fù)合轉(zhuǎn)座子。半保留復(fù)制:以親代DNA雙鏈為模板以堿基互補方式合成子代DNA,這樣新形成的子代DNA中,一條鏈來自親代DNA,而另一

2、條鏈則是新合成的,這種復(fù)制方式叫半保留復(fù)制。染色體: 染色體是遺傳信息的載體,由DNA、RNA和蛋白質(zhì)構(gòu)成,其形態(tài)和數(shù)目具有種系的特性。在細胞間期核中,以染色質(zhì)形式存在。在細胞分裂時,染色質(zhì)絲經(jīng)過螺旋化、折疊、包裝成為染色體,為顯微鏡下可見的具不同形狀的小體。核小體:是構(gòu)成真核生物染色體的基本單位,是DNA和蛋白質(zhì)構(gòu)成的緊密結(jié)構(gòu)形式,包括200bp左右的DNA和9個組蛋白分子構(gòu)成的致密結(jié)構(gòu)。填空題1.真核細胞核小體的組成是 DNA和 蛋白2.天然染色體末端不能與其他染色體斷裂片段發(fā)生連接,這是因為天然染色體末端存在端粒結(jié)構(gòu)。3.在聚合酶鏈反應(yīng)中,除了需要模板DNA外,還需加入引物、DNA聚合酶

3、、dNTP和鎂離子。4.引起DNA損傷的因素有自發(fā)因素、物理因素、化學因素。5.DNA復(fù)制時與DNA解鏈有關(guān)的酶和蛋白質(zhì)有拓撲異構(gòu)酶、解螺旋酶、單鏈DNA結(jié)合蛋白。6.參與DNA切除修復(fù)的酶有DNA聚合酶、DNA連接酶、特異的核酸內(nèi)切酶。7.在真核生物中DNA復(fù)制的主要酶是DNA聚合酶。在原核生物中是DNA聚合酶。8.端粒酶是端粒酶是含一段RNA的逆轉(zhuǎn)錄酶。9.DNA的修復(fù)方式有錯配修復(fù)、堿基切除修復(fù)、核苷酸切除修復(fù)、DNA的直接修復(fù)。選擇題1.真核生物復(fù)制起點的特征包括(B)A. 富含G-C區(qū) B. 富含A-T區(qū) C. Z-DNA D. 無明顯特征2.插入序列(IS)編碼(A)A.轉(zhuǎn)座酶 B

4、.逆轉(zhuǎn)錄酶 C. DNA合成酶 D.核糖核酸酶3.紫外線照射對DNA分子的損傷主要是(D)A.堿基替換 B.磷酸脂鍵斷裂 C。堿基丟失 D.形成共價連接的嘧啶二聚體4.自然界中以DNA為遺傳物質(zhì)的大多數(shù)生物DNA的復(fù)制方式(C)A.環(huán)式 B.D環(huán)式 C.半保留 D.全保留5.原核生物基因組中沒有(A)A.內(nèi)含子 B.外顯子 C.轉(zhuǎn)錄因子 D.插入序列 6.關(guān)于組蛋白下列說法正確的是(D)A.為中性蛋白 B.為酸性蛋白 C.進化上不具保守性 D.染色體結(jié)合蛋白7.DNA聚合酶(C)A.是復(fù)制酶,但不是修復(fù)酶 B.沒有模板依賴性 C.有53外切酶活性D. 53聚合酶活性極強簡述DNA復(fù)制的過程 D

5、NA的復(fù)制過程可被分為3個階段,即復(fù)制的起始、延伸和終止。每個DNA復(fù)制的獨立單元主要包括復(fù)制起始位點和終止位點。 DNA復(fù)制的起始包括預(yù)引發(fā)和引發(fā)兩個階段。在預(yù)引發(fā)階段,DNA解旋解鏈,形成復(fù)制叉,引發(fā)體組裝;在引發(fā)階段,在引發(fā)酶的催化下以DNA鏈為模板合成一段短的RNA引物。復(fù)制時DNA鏈的延伸由DNA聚合酶催化,以親代DNA鏈為模板,引發(fā)體移動,從53方向聚合子代DNA鏈。當子鏈延伸到達終止位點是,DNA復(fù)制就終止了,切除RNA引物,填補缺口,在DNA連接酶的催化下將相鄰的岡崎片段連接起來形成完整的DNA長鏈。試述真原核生物的DNA復(fù)制的特點的不同之處真核生物染色體有多個復(fù)制起點,多復(fù)制

6、眼,呈雙向復(fù)制,多復(fù)制子。原核生物的染色體只有一個復(fù)制起點,單復(fù)制子也呈雙向復(fù)制。 真核生物岡崎片段長約200bp比原核生物略短。真核生物DNA復(fù)制速度比原核慢,速度為10003000bp/min(僅為原核生物的1/201/50)。 真核生物復(fù)制的終止在端粒處,原核生物的復(fù)制叉相遇時即終止。真核生物染色體在全部復(fù)制完之前起點不再重新開始復(fù)制;而在快速生長的原核生物染色體DNA復(fù)制中,起點可以連續(xù)發(fā)動復(fù)制。真核生物快速生長時,往往采用更多的復(fù)制起點。 真核生物有多種DNA聚合酶,DNA聚合酶是真正的復(fù)制酶,在PCNA存在下有持續(xù)的合成能力。PCNA稱為增殖細胞核抗原,相當于大腸桿菌DNA聚合酶的

7、-夾子,RFC蛋白相當于夾子裝配器。原核生物的DNA聚合酶有三種DNA聚合酶DNA的真正復(fù)制酶:多亞基酶,含十種亞基,該酶DNA合成的持續(xù)能力強。真核生物線性染色體兩端有端粒結(jié)構(gòu),它是由許多成串的重短復(fù)序列組成,端粒功能是穩(wěn)定染色體末段結(jié)構(gòu),防止染色體間的末端連接,并可補償滯后鏈5-末段在消除RNA引物后造成的空缺,使染色體保持一定長度。端粒酶是含一段RNA的逆轉(zhuǎn)錄酶。RPA:真核生物的單鏈結(jié)合蛋白;RNaseH1和MF-1切除RNA引物,DNA聚合酶填補缺口。簡述半保留復(fù)制的生物學意義DNA的復(fù)制過程(以大腸桿菌為例)復(fù)制起始:(1)、拓撲異構(gòu)酶解開超螺旋。(2)、Dna A蛋白識別并在AT

8、P存在下結(jié)合于四個9bp的重復(fù)序列。(3)、在類組蛋白(HU、ATP參與下, Dan A蛋白變性13個bp的重復(fù)序列,形成開鏈復(fù)合物。(4) 、Dna B借助于水解ATP產(chǎn)生的能量在Dna C的幫助下沿5 3 方向移動,解開DNA雙鏈,形成前引發(fā)復(fù)合物。(5)、單鏈結(jié)合蛋白結(jié)合于單鏈。(6)、引物合成酶(Dna G蛋白)開始合成RNA引物。 鏈的延長(岡崎片段的合成):在DNA聚合酶的催化下,以四種5 -脫氧核苷三磷酸為底物,在RNA引物的3端以磷酸二酯鍵連接上脫氧核糖核苷酸并釋放出焦磷酸。DNA鏈的延伸同時進行前導(dǎo)鏈和滯后鏈的合成。兩條鏈方向相反。6、PCR的基本原理?PCR是在試管中進行的

9、DNA復(fù)制反應(yīng),基本原理是依據(jù)細胞內(nèi)DNA半保留復(fù)制的機理,以及體外DNA分子于不同溫度下雙鏈和單鏈可以互相轉(zhuǎn)變的性質(zhì),人為地控制體外合成系統(tǒng)的溫度,以促使雙鏈DNA變成單鏈,單鏈DNA與人工合成的引物退火,然后耐熱DNA聚合酶以dNTP為原料使引物沿著單鏈模板延伸為雙鏈DNA。PCR全過程每一步的轉(zhuǎn)換是通過溫度的改變來控制的。需要重復(fù)進行DNA模板解鏈、引物與模板DNA結(jié)合、DNA聚合酶催化新生DNA的合成,即高溫變性、低溫退火、中溫延伸個步驟構(gòu)成PCR反應(yīng)的一個循環(huán),此循環(huán)的反復(fù)進行,就可使目的DNA得以迅速擴增。DNA模板變性:模板雙鏈DNA?單鏈DNA,94。退火:引物單鏈DNA?雜交

10、鏈,引物的Tm值。引物的延伸:溫度至70 左右, Taq DNA聚合酶以種dNTP為原料,以目的DNA為模板,催化以引物末端為起點的53DNA鏈延伸反應(yīng),形成新生DNA鏈。新合成的引物延伸鏈經(jīng)過變性后又可作為下一輪循環(huán)反應(yīng)的模板PCR,就是如此反復(fù)循環(huán),使目的DNA得到高效快速擴增。第三章啟動子:是一段位于結(jié)構(gòu)基因5,端上游區(qū)的DNA序列,能活化RNA聚合酶,使之與模板DNA準確地相結(jié)合并具有轉(zhuǎn)錄起始的特異性。指RNA聚合酶識別、結(jié)合和開始轉(zhuǎn)錄的一段特定的DNA序列。增強子:能強化轉(zhuǎn)錄起始的序列稱為增強子。轉(zhuǎn)錄:以DNA為模板,按照堿基配對原則合成RNA,即將DNA所含的遺傳信息傳給RNA,形

11、成一條與DNA鏈互補的RNA的過程。RNA的編輯:是某些RNA,特別是mRNA的一種加工方式,它導(dǎo)致了DNA所編碼的遺傳信息的改變。外顯子(Exon) :真核細胞基因DNA中的編碼序 列,這些序列被轉(zhuǎn)錄成RNA并進而翻譯為蛋白質(zhì)。內(nèi)含子(Intron) :真核細胞基因DNA中的間插序列,這些序列被轉(zhuǎn)錄成RNA,但隨即被剪除而不翻譯。 復(fù)制子:生物體的復(fù)制單位稱為復(fù)制子(replicon) ,是在同一個復(fù)制起點控制下的一段DNA序列。轉(zhuǎn)錄單元:是一段啟動子開始至終止子結(jié)束的DNA序列。轉(zhuǎn)錄起點:是與新生RNA鏈的第一個核苷酸相對應(yīng)的DNA鏈上的堿基,通常為一個嘌呤。轉(zhuǎn)錄開始時模板上的第一個堿基,

12、在原核中常為A或G,而且位置固定。填空1轉(zhuǎn)錄的基本過程包括:模板識別,轉(zhuǎn)錄起始,轉(zhuǎn)錄的延伸,轉(zhuǎn)錄的終止。2基因表達包括:轉(zhuǎn)錄和翻譯 兩個階段。3RNA的編輯方式:堿基突變,尿甘酸的缺失和添加。4在原核生物中,-35區(qū)與-10區(qū)之間的距離大約是1619bp5帽子結(jié)構(gòu)的功能:1在翻譯中起識別作用2使mRNA免遭核苷酸的破壞6原核生物只有一種RNA聚合酶而真核生物有三種,每一種都有其特定的功能。聚合酶合成rRNA,聚合酶合成mRNA,聚合酶合成tRNA和5s rRNA。三種聚合酶都是具有多亞基的大的蛋白復(fù)合體。7 轉(zhuǎn)錄因子通常具有兩個獨立的結(jié)構(gòu)域:一個結(jié)合DNA,一個激活轉(zhuǎn)錄。8 在真核細胞mRNA

13、的修飾中,“帽子”結(jié)構(gòu)由甲基組成,“尾”由多聚腺嘌呤組成。9原核生物的絕大部分起啟動子都存在共同的序列,即位于-10bp處的 區(qū)和-35bp處的 區(qū),他們都是RNA聚合酶與啟動子結(jié)合的位點,能與因子相互識別而具高度親和性。真核生物中,在轉(zhuǎn)錄起始位點上游-25-35bp處有 區(qū)和位于-70-80bp處 的 區(qū)。選擇題1因子的結(jié)合依靠(A)A對啟動子共有序列的長度和間隔的識別B與核心酶的相互作用C翻譯起始密碼子的距離D轉(zhuǎn)錄單位的長度2下列哪一項是對三元轉(zhuǎn)錄復(fù)合物的正確描述(C)A因子、核心酶和雙鏈DNA在啟動子形成的復(fù)合物B全酶、TFI和解鏈DNA雙鏈形成的復(fù)合物C全酶、模板DNA和新生RNA形成

14、的復(fù)合物D三個全酶在轉(zhuǎn)錄起始位點形成的復(fù)合物3因子和DNA之間相互的最佳描述是(C)A游離和與DNA結(jié)合的因子的數(shù)量是一樣的,而且因子合成的越多,轉(zhuǎn)錄起始的機會越大B因子通常與DNA結(jié)合,且沿著DNA搜尋,直到在啟動子碰到核心酶,他與DNA的結(jié)合不需要依靠核心酶C因子通常與DNA結(jié)合,且沿著DNA搜尋,直到碰到啟動子,再有核心酶存在時與之結(jié)合D因子加入三元復(fù)合物而啟動RNA合成4 因子專一性表現(xiàn)在(B)A因子修飾酶催化因子變構(gòu),使其成為可識別應(yīng)激啟動子的因子B不同基因編碼識別不同啟動子的因子C不同細菌產(chǎn)生可互換的因子D因子參與起始依靠特定的核心酶5在大腸桿菌的熱激反應(yīng)中,某些蛋白質(zhì)表達的開啟和

15、關(guān)閉的機制是(C)A溫度升高使特定阻抑蛋白失活B編碼熱敏感蛋白的基因的啟動子區(qū)域在較高溫度下發(fā)生變形C在高溫時合成新的因子,調(diào)節(jié)熱激基因的表達D高溫時,已存在的聚合酶因子與啟動子的結(jié)合能力強6 真核生物中rRNA包括(D)A 28s,23s,5s rRNA B 23s,16s,5s rRNAC 23s,16s,5.8s rRNA D 28s,23s,5.8s,5s rRNA7 內(nèi)含子的剪切位點具有的特征(A)A 5,GU,3,AG B 5,AG,3,GUC 5,GA,3,UG D 5,UG,3,GA8 部分原核基因的轉(zhuǎn)錄終止子在終止位點前均有(A)A 回文序列 B 多聚T序列 C TATA序列

16、 D 多聚A序列9 mRNA5,端帽子結(jié)構(gòu)為(C)A pppmG B GpppG C m7GpppG D GpppmG簡答題1增強子的特點1有遠距離效應(yīng)2無方向性3順勢調(diào)節(jié)4無物種和基因的特異性5具有組織的特異性6有相位性,其作用與DNA的構(gòu)象有關(guān)7有的增強子可以對外部信號產(chǎn)生反應(yīng)。2比較DNA復(fù)制和轉(zhuǎn)錄的異同點相同點:都以DNA鏈作為模板,合成方向均為5,端到3,端,聚合反應(yīng)均遵循堿基配對原則,通過核苷酸之間形成的3,5,磷酸二酯鍵使核苷酸鍵延長。不同點:復(fù)制轉(zhuǎn)錄模板兩條鏈均被復(fù)制模板鏈轉(zhuǎn)錄(不對稱轉(zhuǎn)錄)原料DntpNTP酶DNA聚合酶RNA聚合酶產(chǎn)物子代雙鏈DNA(半保留復(fù)制)mRNA t

17、RNA rRNA配對方式A-T G-CA-U A-T G-C引物RNA引物不需要引物DNA復(fù)制與轉(zhuǎn)錄的異同相同點: 都需要模板 都以三磷酸核苷酸為底物(NTP或dNTP) 合成方向都是53不同點轉(zhuǎn)錄不需引物;只轉(zhuǎn)錄DNA分子中的一個片段(稱為轉(zhuǎn)錄單位或操縱子,operon);雙鏈DNA中只有一條鏈具有轉(zhuǎn)錄活性(稱為模板鏈);哪個基因被轉(zhuǎn)錄與特定的時間、空間、生理狀態(tài)有關(guān)。RNA聚合酶無校對功能。原核生物與真核生物mRNA的比較(1)、原核生物mRNA的半衰期短;(2)、許多原核生物mRNA以多順反子形式存在;(3)、原核生物5端無帽子結(jié)構(gòu),3或只有短的poly(A)。(4)、真核生物mRNA5

18、端有帽子結(jié)構(gòu),(5)、絕大多數(shù)真核生物mRNA3具有poly(A)尾巴,是轉(zhuǎn)錄后加上的,是mRNA從核到質(zhì)轉(zhuǎn)移所必需的形式,提高mRNA的穩(wěn)定性。大腸桿菌的轉(zhuǎn)錄過程:(1)、識別階段:RNA聚合酶在亞基的引導(dǎo)下結(jié)合于啟動子上;(2)、DNA雙鏈局部解開;(3)、起始階段:在模板鏈上通過堿基配對合成最初RNA鏈;(4)、延伸階段:核心酶向前移動,RNA鏈不斷生長;(5)、終止階段:RNA聚合酶到達終止子;(6)、RNA和RNA聚合酶從DNA上脫落。論述題1 真核生物轉(zhuǎn)錄的前體hnRNA如何加工為成熟的mRNA?真核生物mRNA的結(jié)構(gòu)組成:5,端存在帽子結(jié)構(gòu),3,端通常具有poly(A)尾巴,無內(nèi)

19、含子,部分堿基發(fā)生甲基化。5,端加帽:當RNA聚合酶聚合的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物達到25堿基長時,在其5,端加上一個以5,3,方向相連的7甲基鳥苷帽,防止5,核苷酸外切酶的攻擊,有利于剪接、轉(zhuǎn)運和翻譯的進行;3,端加尾:很多真核生物的hnRNA的3,端經(jīng)過剪切后再加上多聚A殘基即poly(A)尾巴,這有助于整個分子的穩(wěn)定;剪接:在真核生物的mRNA加工過程中,內(nèi)含子序列被切除,兩側(cè)的外顯子片段連接。剪接反應(yīng)在核內(nèi)進行,需要內(nèi)含子有5,GU,AU3,以及一段分支點序列。其過程是:內(nèi)含子先以一個具尾的環(huán)狀分子或套索狀分子形式被刪除,然后被降解,剪接包括snRNP與保守序列結(jié)合,形成剪接體,在其內(nèi)發(fā)生剪接與連接反

20、應(yīng);編輯;甲基化修飾:當序列為5,RRACX3,時會在第6位N原子位置發(fā)生甲基化。2概括細菌細胞的轉(zhuǎn)錄過程轉(zhuǎn)錄是通過RNA聚合酶的作用,以一條DNA鏈為模板產(chǎn)生一條單鏈RNA過程。步驟如下:與RNA聚合酶全酶的結(jié)合:一個RNA聚合酶全酶分子與待轉(zhuǎn)錄的DNA編碼序列上游的啟動子序列松弛的結(jié)合。起始:RNA聚合酶往下游移動了幾個核苷酸到達啟動子的另一段短序列Pribnow框,緊密地與DNA結(jié)合。DNA上的啟動子區(qū)域解鏈,RNA便從Pribnow框下游的幾個核苷酸處開始合成,通常是DNA的反義鏈作為模板,合成幾個核苷酸后,因子被釋放并循環(huán)使用,以下步驟不再需要因子。延伸:RNA聚合酶核心酶沿著DNA

21、模板移動,使DNA解鏈,與DNA模板的下一堿基互補核苷三磷酸聚合到鏈上。RNA聚合酶繼續(xù)在DNA上移動,RNA鏈從模板鏈被釋放出來,DNA雙螺旋重新形成。當所有編碼序列被轉(zhuǎn)錄后,RNA聚合酶移動一個終止序列,即終止子。轉(zhuǎn)錄復(fù)合體解體,RNA聚合酶和新形成的RNA從DNA模板上脫落下來。3、復(fù)雜轉(zhuǎn)錄單位的原始轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的加工方式有幾種?分別是什么?(1)剪、利用多個5端轉(zhuǎn)錄起始為點或接位點產(chǎn)生不同的蛋白質(zhì)。(2)、利用多個加poly(A)位點和不同的剪接方式產(chǎn)生不同的蛋白質(zhì)。(3)、雖無剪接,但有多個轉(zhuǎn)錄起始位點或加poly(A)位點的基因。第四章.SD序列:在原核生物mRNA起始密碼AUG上游,

22、存在49個富含嘌呤堿的一致性序列,如-AGGAGG-,稱為S-D序列。位于原核生物起始密碼子上游7-12個核苷酸處的保守區(qū),該序列與16SrRNA3端反向互補。又稱為核蛋白體結(jié)合位點(ribosomal binding site,RBS)正轉(zhuǎn)錄調(diào)控:負轉(zhuǎn)錄調(diào)控:填空題1tRNA的種類有:起始tRNA和延伸tRNA,同工tRNA,校正tRNA。2. tRNA的二級結(jié)構(gòu)為三葉草型,三級結(jié)構(gòu)為倒L型。tRNA結(jié)構(gòu)3.原核生物蛋白質(zhì)合成的起始tRNA是甲酰甲硫氨酰tRNA(fMet-tRNA fMet),它攜帶的氨基酸是甲酰甲硫氨酸(fMet),而真核生物蛋白質(zhì)合成的起始tRNA是甲硫氨酰tRNA(M

23、et-tRNA Met),它攜帶的氨基酸是甲硫氨酸(Met)。4新生肽鏈每增加一個氨基酸單位都要經(jīng)過AA-tRNA與核糖體的結(jié)合,肽鍵形成,移位三步反應(yīng)。5. 核糖體的作用位點有:A位點、P位點、E位點。5在真核生物中蛋白質(zhì)合成起始時先形成起始因子和起始tRNA復(fù)合物,再和40S亞基形成40S起始復(fù)合物。6氨酰tRNA合成酶既能識別氨基酸,又能識別相應(yīng)的tRNA。7多肽合成的起始密碼子是AUG,而UAA,UAG,UGA是終止密碼子。8遺傳密碼的特點包括連續(xù)性,簡并性,擺動性,普遍性與特殊性。9核酸復(fù)制時,DNA聚合酶沿模板鏈35方向移動;轉(zhuǎn)錄時,RNA聚合酶沿模板鏈35方向移動;翻譯時,核糖體

24、沿模板鏈5 3方向移動。10原核生物蛋白質(zhì)合成形成起始復(fù)合物時,其mRNA先與核糖體的30S亞基結(jié)合,然后再與結(jié)合起始因子和GTP的甲酰甲硫氨酰tRNA結(jié)合,形成30S起始復(fù)合物,然后再與50S形成70S起始復(fù)合物。選擇題1在蛋白質(zhì)合成中催化肽鍵合成的是(D)A延長因子EF-Ts B. 延長因子EF-Tu C. 啟動因子IF3 D.轉(zhuǎn)肽酶2翻譯后加工過程的產(chǎn)物是(B)A一條多肽鏈 B. 一條多肽鏈或一條以上的多肽鏈C多條多肽鏈 D. 多肽鏈的降解產(chǎn)物3.已知某蛋白質(zhì)多肽鏈編碼序列為GGA,則其mRNA轉(zhuǎn)錄本(A)A以5 GGA3為模板,沿轉(zhuǎn)錄本5 3方向延長B. 以5 GGA3為模板,沿轉(zhuǎn)錄本

25、3 5方向延長C. 以3GGA5為模板,沿轉(zhuǎn)錄本5 3方向延長D. 以3GGA5為模板,沿轉(zhuǎn)錄本3 5方向延長4.細菌核糖體RNA中大亞基由以下物質(zhì)組成(C)A5S rRNA , 18S rRNA, 5.8S rRNA和49種蛋白質(zhì) B. 5S rRNA , 28S rRNA, 5.8S rRNA和49種蛋白質(zhì)C5S rRNA , 23S rRNA和34種蛋白質(zhì) D. 5S rRNA , 16S rRNA和34種蛋白質(zhì)5.肽鏈生物合成時信號肽序列(B)A決定糖類殘基的附著點 B.將新生肽鏈導(dǎo)入內(nèi)質(zhì)網(wǎng)C.控制蛋白質(zhì)分子的最終構(gòu)象 D.具有疏水性6.真核生物的翻譯起始復(fù)合物在何處形成(B)A. 起

26、始密碼子AUG處 B. 5端的帽子結(jié)構(gòu)CTATA框 D.CAAT框7.蛋白質(zhì)生物合成的終止信號由(D)AtRNA識別 B.EF識別 C.IF(或eIF )識別 D.RF識別8.能編碼多肽鏈的最小DNA單位是(A)A順反子 B.操縱子 C .啟動子 D.復(fù)制子9.參與原核生物肽鏈延長的因子是(C)AIF1 B. IF2 C.EF-Tu D.RF110. 參與真核生物肽鏈延長的因子是(D)A eRF B. eIF1 C.EF-Tu D.eEF1簡答題:1簡述核糖體的結(jié)構(gòu)及功能特點:答:核糖體的結(jié)構(gòu):真核生物:由60S大亞基和40S小亞基組成的80S的核糖體;原核生物:由50S大亞基和30S小亞基組

27、成的70S的核糖體功能特點:合成蛋白質(zhì) 。在單個核糖體上,包括至少5個功能活性中心,在蛋白質(zhì)合成過程中,各有專一的識別作用和功能:mRNA的結(jié)合部位小亞基 ,結(jié)合或接受AA-tRNA的部位大亞基A位,結(jié)合或接受肽基tRNA部位大亞基,肽基轉(zhuǎn)移部位大亞基P位,形成肽鍵部位(轉(zhuǎn)肽酶中心)大亞基E位。2.簡述氨基酸的活化過程答:游離的氨基酸必須經(jīng)過活化以獲得能量,才能參與蛋白質(zhì)的合成,活化反應(yīng)由氨酰tRNA合成酶催化?;罨謨刹剑夯罨篴a + ATP+ E氨基酰-AMP釋放出 PPi 轉(zhuǎn)移:氨基酰-AMP轉(zhuǎn)移到 tRNA 并釋放出 AMP。3、論述蛋白質(zhì)的翻譯過程。答:蛋白質(zhì)的翻譯即合成過程可分為

28、四個階段:氨基酸的活化、肽鏈合成的起始、延伸和終止。 氨基酸的活化:游離的氨基酸必須經(jīng)過活化以獲得能量,才能參與蛋白質(zhì)的合成,活化反應(yīng)由氨酰tRNA合成酶催化,最終氨基酸連接在tRNA的3端合成氨酰- tRNA。 肽鏈合成的起始:核蛋白體大小亞基分離 ,mRNA在小亞基上定位結(jié)合,起始氨基酰tRNA與小亞基結(jié)合,核蛋白體大亞基結(jié)合。肽鏈的延伸:肽鏈的延長是在核蛋白體上連續(xù)性循環(huán)式進行,每次循環(huán)增加一個氨基酸,分為以下三步:(一)進位:根據(jù)mRNA下一組遺傳密碼指導(dǎo),使相應(yīng)氨基酰-tRNA進入核蛋白體A位。(二)成肽:肽酰轉(zhuǎn)移酶將相鄰的兩個氨基酸相連形成肽鍵,該過程不需要能量的輸入;(三)轉(zhuǎn)位:

29、移位酶利用GTP水解釋放的能量使核糖體沿mRNA移動一個密碼子,釋放出空載的tRNA并將新生肽鏈運至P位點。 肽鏈合成的的終止與釋放:釋放因子識別并與終止密碼子結(jié)合,水解P位上多肽鏈與tRNA之間的二脂鍵,接著,新生肽鏈和tRNA從核糖體上釋放,核糖體大、小亞基解體,蛋白質(zhì)合成結(jié)束。4、原核生物翻譯的起始過程(1)核糖體大小亞基分離(2)30s小亞基通過SD序列與mRNA模板相結(jié)合(3)在IF-2和GTP的幫助下fMet-tRNAfMet進入小亞基的P位,tRNA的反密碼子與mRNA上密碼子配對。(4)帶有tRNA、mRNA和三個翻譯起始因子的小亞基起始復(fù)合物與50s的大亞基結(jié)合,GTP水解釋

30、放翻譯起始因子。5、以大腸桿菌為例簡述蛋白質(zhì)合成的過程從以下四個方面詳細論述(1)氨基酸的活化:(2)肽鏈合成的起始:(3)肽鏈的延生:(4)肽鏈合成的終止:第六章乳糖操縱子模型內(nèi)容(1)Z、Y、A基因產(chǎn)物由同一條多順反子mRNA分子所編碼。(2)乳糖操縱子mRNA分子的啟動區(qū)(P)位于阻遏基因(I)與操縱區(qū)(O)之間,不能單獨起始半乳糖苷酶和透過酶基因的高效表達。(3)乳糖操縱子的操縱區(qū)是DNA上的一小段序列(僅為26bp),是阻遏物的結(jié)合位點。(4)當阻遏物與操縱區(qū)相結(jié)合時,lacmRNA的轉(zhuǎn)錄起始受到抑制。(5)誘導(dǎo)物通過與阻遏物結(jié)合,改變其三維構(gòu)象,使之不能與操縱區(qū)相結(jié)合,誘發(fā)lac

31、mRNA的合成。色氨酸操縱子轉(zhuǎn)錄水平上的調(diào)控通過核糖體與mRNA前導(dǎo)序列結(jié)合,對轉(zhuǎn)錄終止進行調(diào)控。 Attenuator(衰減子): 是位于轉(zhuǎn)錄單位開始區(qū)的一種內(nèi)部終止子,由核糖體在mRNA上的位置決定該終止發(fā)夾是否形成。若不形成發(fā)夾,RNA聚合酶通讀終止子,基因得以表達。當缺乏色氨酸時,核糖體在trp密碼子上暫停,此密碼子是1區(qū)的一部分。所以1區(qū)被核糖體隔離,不能與2區(qū)堿基配對,這意味著在4區(qū)轉(zhuǎn)錄之前2區(qū)已和3區(qū)配對,迫使4區(qū)保持單鏈形式,不能形成終止子發(fā)夾,RNA聚合酶穿越衰減子繼續(xù)轉(zhuǎn)錄。核糖體可以合成前導(dǎo)肽,并延伸到mRNA上的UGA密碼子,UGA密碼子位于1區(qū)與2區(qū)之間。當核糖體前進到

32、此點時,通過2區(qū)并阻止其形成堿基配對,導(dǎo)致3區(qū)與4區(qū)配對,產(chǎn)生終止子發(fā)夾。因此,在這種情況下,RNA聚合酶在衰減子處終止。乳糖操縱子(lac operon)的結(jié)構(gòu)1、結(jié)構(gòu)基因(1)lacZ:編碼b 半乳糖苷酶 (使乳糖水解)(2)lacY:編碼b 半乳糖苷透過酶 (使b 半乳糖苷透過細胞壁、質(zhì)膜進入細胞內(nèi))(3)lacA:編碼b 半乳糖苷乙酰轉(zhuǎn)移酶(將乙?;D(zhuǎn)移到b 半乳糖苷上)2、調(diào)節(jié)基因(regulatory gene)(1)概念: 其產(chǎn)物參與調(diào)控其他結(jié)構(gòu)基因表達的基因(2)特點: a、可在結(jié)構(gòu)基因群附近、也可遠離結(jié)構(gòu)基因 b、不僅對同一條DNA鏈上的結(jié)構(gòu)基因起作用,而且能對不同DNA鏈上

33、的結(jié)構(gòu)基因起作用(3)調(diào)控蛋白:類型:a、阻遏蛋白(repressive protein)與操縱元件結(jié)合后能減弱或阻止所調(diào)控基因轉(zhuǎn)錄的調(diào)控蛋白 b、激活蛋白(activating protein):與操縱元件結(jié)合后能增強或啟動所調(diào)控基因轉(zhuǎn)錄的調(diào)控蛋白3、操縱元件(operator)(1)與啟動子鄰近或與啟動子部分序列重疊(2)具有回文結(jié)構(gòu),能形成十字形結(jié)構(gòu)。(3)與不同構(gòu)像的蛋白質(zhì)結(jié)合,可以分別起阻遏或激活基因表達的作用 4、啟動子(promoter)是指能被RNA聚合酶識別、結(jié)合并啟動基因轉(zhuǎn)錄的一段DNA序列。(1)-10序列- Pribnow盒:TATAAT;(2)-35bp序列:TTGA

34、CA操縱子至少有一個啟動子,一般在第一個結(jié)構(gòu)基因5上游,控制整個結(jié)構(gòu)基因群的轉(zhuǎn)錄5、終止子(terminator)是給予RNA聚合酶轉(zhuǎn)錄終止信號的DNA序列(1)不依賴因子的終止子 (2)依賴因子的終止子在一個操縱元中至少在結(jié)構(gòu)基因群最后一個基因的后面有一個終止子 大腸桿菌乳糖操縱子(lactose operon)包括3個結(jié)構(gòu)基因:Z、Y和A,以及啟動子、控制子和阻遏子等。轉(zhuǎn)錄的調(diào)控是在啟動區(qū)和操縱區(qū)進行的。LacI阻抑蛋白, LacZ-糖苷酶,LacY透性酶,LacA轉(zhuǎn)乙?;?。三種酶的功能: . -半乳糖酶:將乳糖分解成半乳糖和葡萄糖 . 滲透酶:增加糖的滲透,易于攝取乳糖和半乳糖 . 轉(zhuǎn)

35、乙酰酶:-半乳糖轉(zhuǎn)變成乙酰半乳糖lac 操縱子小結(jié)通常情況(葡萄糖供應(yīng)正常)阻遏蛋白與操縱序列結(jié)合,基因不轉(zhuǎn)錄。細胞外的乳糖通過透性酶吸收到細胞內(nèi);細胞內(nèi)的-半乳糖苷酶將乳糖轉(zhuǎn)變?yōu)楫惾樘?。異乳糖結(jié)合到乳糖阻抑物上使之從操縱序列上脫離,聚合酶迅速開始lacZYA基因的轉(zhuǎn)錄。這就是負控誘導(dǎo)。然而,還需要細菌生長系統(tǒng)中缺少葡萄糖,使cAMP含量增加,才有足夠量的cAMP與CRP結(jié)合形成CRP-cAMP復(fù)合物結(jié)合于Plac上游。使DNA雙螺旋發(fā)生彎曲,轉(zhuǎn)錄才可以有效地進行。組氨酸操縱子:與His降解代謝有關(guān)的兩組酶類被稱為hut酶(histidine utilizing enzyme),控制這些酶合成

36、的操縱子被稱為hut operon。由一個多重調(diào)節(jié)的操縱子控制,有兩個啟動子,兩個操縱區(qū)及兩個正調(diào)控蛋白。轉(zhuǎn)錄后調(diào)控一、 翻譯起始的調(diào)控 遺傳信息的翻譯起始于mRNA上的核糖體結(jié)合位點(RBS)起始密子AUG上游的一段非翻譯區(qū)。在RBS中有SD序列,與核糖體16S rRNA的3端互補配對,促使核糖體與mRNA相結(jié)合。RBS的結(jié)合強度取決于SD序列的結(jié)構(gòu)及與AUG的距離。SD與AUG相距一般以410核苷酸為佳,9核苷酸最佳。二、mRNA穩(wěn)定性對轉(zhuǎn)錄水平的影響所有細胞都有一系列核酸酶,用來清除無用的mRNA。一個典型的mRNA半衰期為2-3min。mRNA分子被降解的可能性取決于其二級結(jié)構(gòu)。SD序

37、列的微小變化,往往會導(dǎo)致表達效率成百上千倍的差異,這是由于核苷酸的變化改變了形成mRNA 5端二級結(jié)構(gòu)的自由能,影響了30S亞基與mRNA的結(jié)合,從而造成了蛋白質(zhì)合成效率上的差異。三、蛋白質(zhì)的調(diào)控作用細菌中有些mRNA結(jié)合蛋白可激活靶基因的翻譯。相反,mRNA特異性抑制蛋白則通過與核糖體競爭性結(jié)合mRNA分子來抑制翻譯的起始。大腸桿菌中的核糖體蛋白就存在翻譯抑制現(xiàn)象。四、反義RNA的調(diào)節(jié)作用RNA調(diào)節(jié)是原核基因表達轉(zhuǎn)錄后調(diào)節(jié)的另一種重要機制。細菌相應(yīng)環(huán)境壓力的改變,會產(chǎn)生一些非編碼小RNA分子,能與mRNA中的特定序列配對并改變其構(gòu)象,導(dǎo)致翻譯過程的開啟或關(guān)閉等作用。第七八章操縱子(opero

38、n):是指數(shù)個功能上相關(guān)的結(jié)構(gòu)基因串聯(lián)在一起,構(gòu)成信息區(qū),連同其上游的調(diào)控區(qū)(包括啟動子和操縱基因)以及下游的轉(zhuǎn)錄終止信號所構(gòu)成的基因表達單位,所轉(zhuǎn)錄的RNA為多順反子。在原核生物中,若干結(jié)構(gòu)基因可串聯(lián)在一起,其表達受到同一調(diào)控系統(tǒng)的調(diào)控,這種基因的組織形式稱為操縱子。反式作用因子(trans-acting factor):能直接或間接地識別或結(jié)合在各類順式作用元件核心序列上,參與調(diào)控靶基因轉(zhuǎn)錄效率的蛋白質(zhì)。弱化子:在trp mRNA 5端有一個長162bp的mRNA片段被稱為前導(dǎo)區(qū),其中123150位堿基序列如果缺失,trp基因表達可提高6-10倍。mRNA合成起始以后,除非培養(yǎng)基中完全沒有

39、色氨酸,轉(zhuǎn)錄總是在這個區(qū)域終止,產(chǎn)生一個僅有140個核苷酸的RNA分子,終止trp基因轉(zhuǎn)錄。這個區(qū)域被稱為弱化子,該區(qū)mRNA可通過自我配對形成莖-環(huán)結(jié)構(gòu)。順式作用元件(cis-acting element)影響自身基因表達活性的非編碼DNA序列。斷裂基因(splite gene):真核生物結(jié)構(gòu)基因,由若干個編碼區(qū)和非編碼區(qū)互相間隔開但又連續(xù)鑲嵌而成,去除非編碼區(qū)再連接后,可翻譯出由連續(xù)氨基酸組成的完整蛋白質(zhì),這些基因稱為斷裂基因?;虻姆肿由飳W定義:產(chǎn)生一條多肽鏈或功能RNA所必需的全部核苷酸序列?;虮磉_的時間特異性:基因表達的空間特異性:填空題1、真核生物中反式作用因子的DNA結(jié)合結(jié)構(gòu)

40、域有:螺旋轉(zhuǎn)角螺旋,堿性螺旋-環(huán)-螺旋,鋅指,堿性亮氨酸拉鏈,同源域蛋白。2、轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子按功能可以分為:基本轉(zhuǎn)錄因子和特異轉(zhuǎn)錄因子。3、真核生物有3類RNA聚合酶,負責轉(zhuǎn)錄rRNA基因的RNA聚合酶是:RNA聚合酶I4、典型的原核啟動子的四個特征是:轉(zhuǎn)錄起始位點,原核基因轉(zhuǎn)錄起始位點通常是嘌呤,-10區(qū),-35區(qū)。5、乳糖操縱子的結(jié)構(gòu)結(jié)構(gòu)基因有:lacZ,lacY,lacA。選擇題1、在什么情況下,乳糖操縱子的轉(zhuǎn)錄活性最高( A )A 高乳糖,低葡萄糖 B 高乳糖,高葡萄糖 C 低乳糖,低葡萄糖 D低乳糖,高葡萄糖2、在真核基因表達調(diào)控中,( B )調(diào)控元件能促進轉(zhuǎn)錄的速率。A 弱化子 B

41、增強子 C repressor D TATA Box3、外顯子是( D )A 基因突變的表現(xiàn) B DNA被水解斷裂開的片段C 不轉(zhuǎn)錄的DNA D真核生物基因的編碼序列4、關(guān)于外顯子和內(nèi)含子的敘述,正確的是( C )A 僅外顯子在DNA模板上有相應(yīng)的互補序列 B hnRNA上只有外顯子而無內(nèi)含子序列C 除去內(nèi)含子及連接外顯子的過程稱為剪接 D 除去外顯子的過程稱為剪接5、不屬于轉(zhuǎn)錄后修飾的是( C )A 腺苷酸聚合 B 5端加帽子結(jié)構(gòu)C 外顯子切除 D 內(nèi)含子切除 6、AAUAAA序列是( D )A 啟動子的辨認序列 B 真核生物的轉(zhuǎn)錄終止點C 真核生物的反式作用因子 D 真核生物轉(zhuǎn)錄終止修飾點7、下列哪項不是真核生物轉(zhuǎn)錄后水平的調(diào)控機制( D )A 5端加帽和3端多聚腺苷酸化 B mRNA選擇性剪接C mRNA運輸?shù)目刂?D 外顯子切除問答題1、乳糖操縱子的作用機制。答:(1)乳糖操縱子的組成:大腸桿菌乳糖操縱子含Z,Y,A三個結(jié)構(gòu)基因,分別編碼半乳糖苷酶,透酶和半乳糖苷乙酰轉(zhuǎn)移酶,此外還有一個操縱序列O,一個啟動子P和一個調(diào)節(jié)基因I。(2)阻遏蛋白的負性調(diào)節(jié):沒有乳糖存在時,I基因編碼的阻遏蛋白結(jié)合于操縱序列

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