染色體微陣列分析技術(shù)(CMA)在產(chǎn)前診斷中的應(yīng)用

1、編輯課件編輯課件主要內(nèi)容主要內(nèi)容 CMA在產(chǎn)前診斷中的應(yīng)用概況在產(chǎn)前診斷中的應(yīng)用概況 CMA芯片平臺選擇芯片平臺選擇 CMA應(yīng)用于產(chǎn)前診斷的臨床指征應(yīng)用于產(chǎn)前診斷的臨床指征 CMA檢測前后的遺傳咨詢及結(jié)果解釋檢測前后的遺傳咨詢及結(jié)果解釋編輯課件CMA在產(chǎn)前診斷中的應(yīng)用概況在產(chǎn)前診斷中的應(yīng)用概況編輯課件CMA在產(chǎn)前診斷中的應(yīng)用概況在產(chǎn)前診斷中的應(yīng)用概況 在在染色體核型分析未發(fā)現(xiàn)異常染色體核型分析未發(fā)現(xiàn)異常的病例中，的病例中，CMA 技術(shù)對技術(shù)對基因組不平衡重組基因組不平衡重組的額外的額外檢出率為檢出率為0.4%50%（變異范圍較大的原因主要為樣本量、樣本選擇標準及芯片（變異范圍較大的原因主要為樣

2、本量、樣本選擇標準及芯片平臺存在差異），臨床意義不明確的平臺存在差異），臨床意義不明確的CNV比例為比例為1.4%； 在在超聲提示胎兒結(jié)構(gòu)異常且核型正常超聲提示胎兒結(jié)構(gòu)異常且核型正常的病例中，的病例中，CMA 技術(shù)的額外檢出率為技術(shù)的額外檢出率為10%，VOUS 比例為比例為2.1%； 超聲提示胎兒結(jié)構(gòu)異常且超聲提示胎兒結(jié)構(gòu)異常且CMA 檢測正常的病例中，染色體核型分析的額外檢出檢測正常的病例中，染色體核型分析的額外檢出率為率為0.8%，其中絕大部分為染色體平衡重組。，其中絕大部分為染色體平衡重組。 而在而在CMA 檢測結(jié)果未發(fā)現(xiàn)異常的病例中，染色體核型分析的額外檢出率為檢測結(jié)果未發(fā)現(xiàn)異常的病

3、例中，染色體核型分析的額外檢出率為0.6%，其中絕大部分為染色體平衡易位或倒位。，其中絕大部分為染色體平衡易位或倒位。2013 年年Hillman 等的等的meta 分析共涉及分析共涉及25 篇文獻共篇文獻共18 113 例個體例個體:CMA 技術(shù)可以作為臨床產(chǎn)前診斷常規(guī)檢測的技術(shù)可以作為臨床產(chǎn)前診斷常規(guī)檢測的一部分，對于所有介入性產(chǎn)前診斷，特別是超聲一部分，對于所有介入性產(chǎn)前診斷，特別是超聲提示胎兒結(jié)構(gòu)異常者，應(yīng)用提示胎兒結(jié)構(gòu)異常者，應(yīng)用CMA 技術(shù)可技術(shù)可明顯提明顯提高高有臨床意義的有臨床意義的CNV 檢出率。檢出率。編輯課件CMA芯片平臺選擇芯片平臺選擇基于微陣列的比較基因組雜交技術(shù)基于

4、微陣列的比較基因組雜交技術(shù)(aCGH)單核苷酸多態(tài)性微陣列技術(shù)單核苷酸多態(tài)性微陣列技術(shù)(SNP array)優(yōu)勢：用戶可根據(jù)需要設(shè)計并制作芯片優(yōu)勢：用戶可根據(jù)需要設(shè)計并制作芯片 可針對特定區(qū)域設(shè)計高密度探針可針對特定區(qū)域設(shè)計高密度探針 以增加在該區(qū)域的檢測靈敏度和特異性以增加在該區(qū)域的檢測靈敏度和特異性優(yōu)勢：優(yōu)勢：SNP 芯片除了帶有拷貝數(shù)信息外，芯片除了帶有拷貝數(shù)信息外， 還帶有還帶有SNP 分型分型的信息；的信息； 可檢測可檢測雜合性缺失雜合性缺失（loss of heterozygous，LOH），從而用于檢測），從而用于檢測單親二倍體單親二倍體（uniparental disomy，U

5、PD）、）、低水平嵌合體低水平嵌合體（mosaic）、近）、近親婚配及親婚配及三倍體三倍體。編輯課件CMA應(yīng)用于產(chǎn)前診斷的臨床指征應(yīng)用于產(chǎn)前診斷的臨床指征加拿大醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)會（加拿大醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)會（CCMG）美國婦產(chǎn)科醫(yī)師學(xué)院（美國婦產(chǎn)科醫(yī)師學(xué)院（ACOG）母胎醫(yī)學(xué)會（母胎醫(yī)學(xué)會（SMFM）編輯課件CMA檢測前的遺傳咨詢檢測前的遺傳咨詢1. CMA 技術(shù)的優(yōu)勢技術(shù)的優(yōu)勢：能夠檢出所有引起：能夠檢出所有引起基因組不平衡改變基因組不平衡改變的染色體異常，包括所的染色體異常，包括所有核型分析能夠檢出的有核型分析能夠檢出的染色體不平衡變異染色體不平衡變異，以及核型分析無法檢出的，以及核型分析無法檢出的染色

6、體微缺失染色體微缺失與微重復(fù)與微重復(fù)。2. CMA 技術(shù)的局限性技術(shù)的局限性：（1） 無法檢測平衡染色體重組、極低比例嵌合體（無法檢測平衡染色體重組、極低比例嵌合體（10%）、某些標記染色體、）、某些標記染色體、單基因突變及單基因突變及DNA 甲基化異常、甲基化異常、aCGH 芯片還無法檢測三倍體。芯片還無法檢測三倍體。（2）可能會發(fā)現(xiàn)）可能會發(fā)現(xiàn)VOUS，即可能需要對父母樣本進行檢測，通過家系綜合分析，即可能需要對父母樣本進行檢測，通過家系綜合分析，以協(xié)助對胎兒檢測結(jié)果的判讀。但基于目前對人類基因組的認識和數(shù)據(jù)庫的積累程以協(xié)助對胎兒檢測結(jié)果的判讀。但基于目前對人類基因組的認識和數(shù)據(jù)庫的積累程

7、度，仍然無法對某些檢測結(jié)果進行精確判讀和解釋。度，仍然無法對某些檢測結(jié)果進行精確判讀和解釋。編輯課件3. 檢出疾病的遺傳異質(zhì)性檢出疾病的遺傳異質(zhì)性：所檢出的某些遺傳性疾病由于：所檢出的某些遺傳性疾病由于外顯率和表現(xiàn)度外顯率和表現(xiàn)度的差異，的差異，在在不同患者間臨床表現(xiàn)可能存在很大的變異不同患者間臨床表現(xiàn)可能存在很大的變異。4. 可能檢出與臨床表型不相關(guān)的可能檢出與臨床表型不相關(guān)的CNV：通過：通過CMA 技術(shù)檢測可能發(fā)現(xiàn)非親生父親、技術(shù)檢測可能發(fā)現(xiàn)非親生父親、近親婚配、遲發(fā)性的遺傳病或成人期發(fā)病的遺傳?。ㄈ缒[瘤），這些結(jié)果應(yīng)該讓孕近親婚配、遲發(fā)性的遺傳病或成人期發(fā)病的遺傳病（如腫瘤），這些結(jié)果

8、應(yīng)該讓孕婦及家屬選擇是否被告知。婦及家屬選擇是否被告知。CMA檢測前的遺傳咨詢檢測前的遺傳咨詢編輯課件CMA檢測報告及結(jié)果解釋檢測報告及結(jié)果解釋CMA 檢測的臨床報告至少應(yīng)包括以下幾方面內(nèi)容：檢測的臨床報告至少應(yīng)包括以下幾方面內(nèi)容：編輯課件CMA檢測后咨詢及臨床處理檢測后咨詢及臨床處理1. 非致病性非致病性CNV： 基本可以排除由基因組不平衡改變而導(dǎo)致的遺傳病，但必須向患基本可以排除由基因組不平衡改變而導(dǎo)致的遺傳病，但必須向患者說明者說明CMA 技術(shù)不能檢測所有的遺傳病，如極低比例嵌合體（技術(shù)不能檢測所有的遺傳病，如極低比例嵌合體（10%）、平衡染色體）、平衡染色體重組、單基因突變等。重組、單

9、基因突變等。2. 致病性致病性CNV：（1）胎兒檢出明確致病性染色體微缺失或微重復(fù)綜合征：若其父母）胎兒檢出明確致病性染色體微缺失或微重復(fù)綜合征：若其父母有再次妊娠計劃，有再次妊娠計劃，應(yīng)建議父母行應(yīng)建議父母行CMA 檢測以明確胎兒致病性片段是新發(fā)突變還是遺檢測以明確胎兒致病性片段是新發(fā)突變還是遺傳自父母傳自父母，以對再次生育作遺傳風(fēng)險評估。（，以對再次生育作遺傳風(fēng)險評估。（2）胎兒同時檢出缺失和重復(fù)：）胎兒同時檢出缺失和重復(fù)：胎兒的缺失和重復(fù)可能來源于親代的染色體平衡易位片段的不平衡分離，若其父母有胎兒的缺失和重復(fù)可能來源于親代的染色體平衡易位片段的不平衡分離，若其父母有再次妊娠計劃，應(yīng)對父

10、母樣本進行熒光原位雜交再次妊娠計劃，應(yīng)對父母樣本進行熒光原位雜交FISH或染色體核型分析以排除染色或染色體核型分析以排除染色體相互易位或倒位，并對再發(fā)風(fēng)險進行評估。體相互易位或倒位，并對再發(fā)風(fēng)險進行評估。編輯課件3. VOUS：應(yīng)建議父母行：應(yīng)建議父母行CMA 檢測，通過檢測，通過家系綜合分析家系綜合分析以協(xié)助對胎兒檢測結(jié)以協(xié)助對胎兒檢測結(jié)果的判斷。果的判斷。（1）新發(fā)）新發(fā)CNV：若有證據(jù)表明該區(qū)域內(nèi)：若有證據(jù)表明該區(qū)域內(nèi)有疾病表型相關(guān)的功能基因有疾病表型相關(guān)的功能基因，通常，通常認為是認為是可能致病性可能致病性；若該區(qū)域內(nèi)；若該區(qū)域內(nèi)無基因無基因，通常認為是，通常認為是可能良性可能良性，也

11、有，也有可能目可能目前未發(fā)現(xiàn)其臨床意義前未發(fā)現(xiàn)其臨床意義。（2） 遺傳性遺傳性CNV：若若胎兒父母有臨床表型胎兒父母有臨床表型，且該區(qū)域內(nèi)，且該區(qū)域內(nèi)有疾病表型相關(guān)的功能基因有疾病表型相關(guān)的功能基因，通常認，通常認為該為該CNV 為為可能致病性可能致病性。若胎兒父母若胎兒父母無臨床表型無臨床表型，通常情況下，可判斷該，通常情況下，可判斷該CNV 為為家族性良性家族性良性CNV；若胎兒若胎兒CNV與親代與親代CNV 大小不同，且缺失或重復(fù)的范圍擴大了，則應(yīng)考慮大小不同，且缺失或重復(fù)的范圍擴大了，則應(yīng)考慮為可能致病性。此外，還需考慮不完全外顯、臨床表型差異（父母可能有亞為可能致病性。此外，還需考慮不完全外顯、臨床表型差異（父母可能有亞臨床表現(xiàn)）的可能。臨床表現(xiàn)）的可能。編輯課件CMA檢出數(shù)據(jù)檢出數(shù)據(jù)對檢出的對檢出的CNV進行注釋進行注釋致病性致病性CNV良性良性CNV臨床意義不確臨床意義不確定定CNV報告對應(yīng)的遺傳綜合報告對應(yīng)的