微生物進化與分類學

1、第十章 微生物進化與分類學一、名詞解釋1. 菌株； 2.GC比 3.種 4.模式菌株 5.亞種或變種 6.型 7.菌株或品系8培養(yǎng)物 9. 群 10. 系統(tǒng)發(fā)育樹 11.分類單元 12. 數(shù)值分類 二、填空1、微生物分類學的三個具體任務為 、 、 。2、大量資料表明：功能重要的分子或功能重要的分子區(qū)域比功能不重要的大分子或大分子區(qū)域進化變化的 。3、微量多項試驗鑒定系統(tǒng)，實際上是一類專門設計制作的 特征檢測卡。4、微生物種的學名由 和 兩部分構成。5、伯杰氏系統(tǒng)細菌學手冊第一版分 卷出版，它將原核生物分成 組。6、分類學的內(nèi)容涉及3個互相依存又有區(qū)別的組成部分，即 、命名和 。7、如果相似性系

2、數(shù)（SAB）等于1，說明所比較的兩菌株rRNA序列 ，若SAB值小于0.1，則表明兩菌株親緣關系 。8、API/ATB是微量多項試驗鑒定系統(tǒng)，它包括眾多的 ，共計有幾百種生理生化反應，可鑒定幾乎所有常見的 。9、微孔濾膜菌落計數(shù)板是一種可攜帶的檢測水中大腸菌數(shù)的大腸菌測試卡，適于 工作和 使用，因可以放在人體內(nèi)衣口袋中培養(yǎng)。10、伍斯用寡核苷酸序列編目分析法對微生物的16SrRNA序列進行比較后，提出將生物分成三界（域）： 、 、和 。11、伍斯為了避免把古細菌也看作是細菌的一類，他又把三界（域）改稱為： 、 、 和 。并構建了三界（域）生物的系統(tǒng)樹。7、根據(jù)在分類過程中采用特征的種類，通常把

3、微生物分類分成4個不同的水平： 、 、 和 。8、 簡單來講，數(shù)值分類過程主要可分為五步，即 、 、 、 和 。9、 自20世紀60年代以來，核酸分析已經(jīng)成為微生物、尤其是原核微生物分類不可缺少的指標，主要包括 、 和 。10、 1987年國際系統(tǒng)細菌學委員會規(guī)定，DNA同源性( )%，雜交分子的熱解鏈溫度相差（ Tm） 為細菌種的界限。11、 關系密切的生物應該具有相似的細胞蛋白質(zhì)。蛋白圖譜的比較可以采用 或 ，常用的方法是 。12、微生物種以上的分類單位從小到大依次為: 、 、 、 、 、 和 。13、 亞種以下具有相同或相似特性的一個或一組菌株稱為“型”,如：具有特殊的生物化學或生理特性

4、的菌株群，被稱為 型；能產(chǎn)生特殊化學物質(zhì)的菌株群,被稱為 型；具有特殊培養(yǎng)性狀的菌株群,被稱為 ；具有特殊抗原特征的菌株群，被稱為 。14、 縮寫的單數(shù)或復數(shù)，例如Pseudomonas sp.表示 ，Micrococcus spp.表示 。15、按照“國際命名法規(guī)”，新的微生物分類單元必須在國際公認的刊物發(fā)表才能有效，如細菌新分類單元必須在 雜志發(fā)表，才被學術界承認。新的分類單元在發(fā)表時要指定新分類單元的 ，分類單元的模式培養(yǎng)物要存放在國際供認的菌種保藏機構，以便科學界的交流使用。16 、原核生物包括 域與 域，前者目前已記載 種，后者截止2000年已記載 種。三、選擇1、伯杰氏系統(tǒng)細菌學手

5、冊第二版把葡萄球菌屬和微球菌屬分別放在不同的門中，最可能的原因是（ ）。（1）生理生化特征不同 （2）DNADNA雜交同源性不同（3）革蘭氏染色反應不同 （4）G+C含量和rRNA序列不同2、如果需要查閱枯草芽孢桿菌及相關種的分類學資料，并假定伯杰氏系統(tǒng)細菌手冊第二版已經(jīng)全部出版，你將選擇該書的（）。（1）第一卷 （2）第三卷 （3）第四卷 （4）第五卷3、血清學試驗，尤其在醫(yī)學細菌的分類鑒定中的重要意義，但它主要用于劃分（ ）。（1）種內(nèi)血清型 （2）種間血清型 （3）屬間血清型 （4）屬以上血清型4、根據(jù)你所掌握的知識，認為形態(tài)學特征學特征在以下幾類微生物中的哪嚴分類鑒定中顯得更加重要？（

6、 ）（1）病毒 （2）細菌 （3）酵母菌 （4）霉菌5、在下列4種細菌中，哪一種最有可能屬于伯杰氏系統(tǒng)細菌學手冊第一版第5組“兼性厭氧的革蘭氏陰性桿菌”？（ ）（1）梅毒密螺旋體 （2）枯草芽孢桿菌 （3）大腸埃希氏菌 （4）金黃色葡萄球菌6、如果你在實驗室用牛肉膏蛋白胨培養(yǎng)基和常規(guī)平板法分離到一株不產(chǎn)芽孢、始終呈桿狀的細菌，只要進行以下哪一組試驗就可以確定它屬于33組中的某一組？（ ）（1）革蘭氏染色和厭氧生長試驗 （2）革蘭氏染色、光能和化能自養(yǎng)生長試驗（3）革蘭氏染色和運動性試驗 （4）革蘭氏染色、好氧、厭氧和兼性厭生長試驗7、現(xiàn)在自動化程度最高、功能最多的微生物專用檢測儀是（ ）（1）

7、氣相色譜儀 （2）高壓液相色譜儀（3）自動微生物檢測儀 （4）激光拉曼光譜儀8、目前微生物的快速檢測和自動化分析中，廣泛地采用的免疫學技術是（ ）。（1）DNA探針 （2）聚合酶鏈反應技術（3）DNA芯片 （4）酶聯(lián)免疫吸附測定法四、是非題1、“大腸埃希氏菌”才是俗稱“大腸桿菌”的學名。2、所謂“模式菌株”通常是指一個細菌的種內(nèi)了具代表的菌株。3、兩種細菌的G+C含量相近，說明它們親緣關系近，反之，G+C含量差別大說明它們親緣關系遠。4、DNADNA雜交主要用于種、屬水平上的分類研究，而進行親緣關系更遠（屬以上等級）分類單元的比較，則需進行DNArRNA雜交。5、數(shù)值分類由于采用了先進的計算想

8、技術，減少了大量的特征測定的實驗操作，所以它是比較科學的現(xiàn)代微生物系統(tǒng)分類方法。6、物理、化學、材料、電子信息等科學和技術領域通常使用的分析、測量物質(zhì)成分、結(jié)構、性能和各種信息的自動化的精密儀器和設備，幾乎都能用于微生物的快速鑒定和自動化分析。7、“吹口氣查胃病”的原理是：幽門螺桿菌具有人體不具有的尿素酶，受檢者口服13C標記的尿素，如有該菌感染，則尿素被尿素酶分解生成NH3和13CO2，用質(zhì)譜儀能快速靈敏地測出受檢者呼氣中13CO2的量，準確地鑒定是否被幽門螺桿菌感染。8、亞種名為三元式組合，即由科名、屬名加詞和亞種名加詞構成。9、現(xiàn)代微生物生理生化特征的比較也是對微生物基因組的間接比較，加

9、上測定生理生化特征比直接分析基因組要容易得多，因此生理生化特征對于微生物的系統(tǒng)仍然是有意義的。10、蛋白質(zhì)氨基酸順序的進化速率大體上是恒定的，但功能不同的蛋白質(zhì)常以不同的速率進化。功能重要的分子序列或序列區(qū)域往往進化變化速率高。五、簡答題1、分類學有哪些組成部分？2、微生物有哪些常用的分類鑒定依據(jù)和方法？3、蛋白質(zhì)和核酸分子被用作微生物進化譜系分析所依據(jù)的原理是什么？4、為什么16S（18）rRNA目前被挑選作為研究微生物進化的主要對象？5、試述古生菌和細菌的主要區(qū)別。6、為什么在從事微生物的工作中不僅要注意種名還要注意菌株名稱？7、 為什么真核生物進化成功后，并不能取代原核生物？8、作為衡量生物物種間真正進化關系的生物進化時鐘的生物大分子必須滿足哪些條件？六、論述題1、外單位送來一個細菌培養(yǎng)物要求鑒定，你如何將其鑒定到種？2、現(xiàn)代微生物分類主要根據(jù)基因型特征來建立分類單元，基因型特征的測定通常都需要高新的復雜技術，而以實用為目的菌種鑒定卻希望采用更易于測定的表型特征，你認為如何解決這一矛盾？3、為什么人們推測在生物進化過程中有一個RNA生命時代