基因診斷PPT學(xué)習(xí)教案

1、會(huì)計(jì)學(xué)1基因診斷基因診斷第1頁(yè)/共42頁(yè)第2頁(yè)/共42頁(yè)第3頁(yè)/共42頁(yè)第4頁(yè)/共42頁(yè)第5頁(yè)/共42頁(yè)第6頁(yè)/共42頁(yè)第7頁(yè)/共42頁(yè)（）單鏈構(gòu)象多態(tài)性（）單鏈構(gòu)象多態(tài)性（single strand single strand conformation ploymorphism,SSCP) conformation ploymorphism,SSCP)分析分析第8頁(yè)/共42頁(yè)第9頁(yè)/共42頁(yè) 限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性 RFLPs ( restriction fragment length polymorphisms)樣品一樣品二1987年等人以RFLP為遺傳標(biāo)記繪制了第一張人

2、類(lèi)遺傳圖譜第10頁(yè)/共42頁(yè)缺點(diǎn)：富含高熔點(diǎn)GC區(qū)時(shí)，則難以檢測(cè)出突變第11頁(yè)/共42頁(yè)第12頁(yè)/共42頁(yè).n第13頁(yè)/共42頁(yè)子數(shù)的相對(duì)量,是一種半定量方法.第14頁(yè)/共42頁(yè)第15頁(yè)/共42頁(yè)第16頁(yè)/共42頁(yè)第17頁(yè)/共42頁(yè)第18頁(yè)/共42頁(yè)設(shè)計(jì)探針.第19頁(yè)/共42頁(yè)第20頁(yè)/共42頁(yè)在疾病與正常樣本之間尋找分子水平上的差異.第21頁(yè)/共42頁(yè)第22頁(yè)/共42頁(yè)第23頁(yè)/共42頁(yè)第24頁(yè)/共42頁(yè)短串聯(lián)重復(fù)序列短串聯(lián)重復(fù)序列STRs (short tendem repeats, Microsatellites )STR廣泛存在于人基因組，占約廣泛存在于人基因組，占約5%，基本單位是基

3、本單位是1bp-8bp的的串聯(lián)重復(fù)，串聯(lián)重復(fù)，重復(fù)次數(shù)重復(fù)次數(shù) n=15-60，已知，已知8000多個(gè)，多個(gè)，主要形式為：主要形式為： (CA)n ， (GA)n ， (AA)n ， (GG)n ， (CAA)n， (CGG)n ，其中以其中以 (CA)n ， (GT)n 為多見(jiàn)。為多見(jiàn)。1992年，年，Welssenbanch等以等以STR為標(biāo)記的為標(biāo)記的第二代連鎖圖取代了第二代連鎖圖取代了RFLP連鎖圖連鎖圖。第25頁(yè)/共42頁(yè) 定義定義: :主要是指在基因組水平上由單個(gè)核苷酸的主要是指在基因組水平上由單個(gè)核苷酸的變異所引起的變異所引起的DNADNA序列多態(tài)性。序列多態(tài)性。與與RFLPRF

4、LP與與STRSTR不同不同, ,它是直接以序列的變異作為標(biāo)記它是直接以序列的變異作為標(biāo)記, ,而不是以片段的而不是以片段的長(zhǎng)度差異作為標(biāo)記長(zhǎng)度差異作為標(biāo)記. . 人類(lèi)基因組圖譜的初步分析表明，共有人類(lèi)基因組圖譜的初步分析表明，共有3 3萬(wàn)萬(wàn)至萬(wàn)個(gè)基因。有至萬(wàn)個(gè)基因。有300300多萬(wàn)個(gè)單核苷酸多態(tài)性多萬(wàn)個(gè)單核苷酸多態(tài)性,SNP,SNP在在人類(lèi)基因組中廣泛存在，平均每人類(lèi)基因組中廣泛存在，平均每50050010001000個(gè)堿基個(gè)堿基對(duì)中就有對(duì)中就有1 1個(gè)，個(gè)，3-43-4個(gè)相鄰的標(biāo)記構(gòu)成的單倍型（個(gè)相鄰的標(biāo)記構(gòu)成的單倍型（haplotypehaplotype）就可有）就可有8-168-16

5、種。種。 19961996年，年，LanderLander報(bào)道了用單核苷酸多態(tài)性報(bào)道了用單核苷酸多態(tài)性 標(biāo)記制備第三代遺傳連鎖圖的遺傳標(biāo)記。標(biāo)記制備第三代遺傳連鎖圖的遺傳標(biāo)記。單核苷酸多態(tài)性單核苷酸多態(tài)性（single nucleotid polymorphismsingle nucleotid polymorphism，SNPSNP）第26頁(yè)/共42頁(yè)第27頁(yè)/共42頁(yè)第28頁(yè)/共42頁(yè)珠蛋白珠蛋白mRNAmRNA的量減少，因的量減少，因此可用此可用 RT-PCR RT-PCR定量分析定量分析mRNAmRNA的量的量以助診斷以助診斷第29頁(yè)/共42頁(yè)第30頁(yè)/共42頁(yè)第31頁(yè)/共42頁(yè)多重PCR法:對(duì)基因突變較集中的區(qū)域,設(shè)計(jì)多對(duì)引物,擴(kuò)增基因相應(yīng)的突變高發(fā)區(qū),檢測(cè)相應(yīng)的基因突變.第32頁(yè)/共42頁(yè)第33頁(yè)/共42頁(yè)第34頁(yè)/共42頁(yè)第35頁(yè)/共42頁(yè)Burkitt 淋巴瘤人類(lèi)乳頭瘤病毒(HPV)宮