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文檔簡介

生物化學(xué)部分知識結(jié)構(gòu)化學(xué)成分:水、無機鹽、糖類、脂類、蛋白質(zhì)、核酸、酶、維生素和輔酶

細胞的代謝異化作用:糖的異化、脂肪的異化、蛋白質(zhì)的異化、核酸的異化同化作用:光合作用、多糖合成、脂類的合成等分子生物學(xué):復(fù)制、轉(zhuǎn)錄、翻譯、調(diào)控蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)與功能第一章一、什么是蛋白質(zhì)?蛋白質(zhì)(protein)是由許多氨基酸(aminoacids)通過肽鍵(peptidebond)相連形成的高分子含氮化合物。組成蛋白質(zhì)的元素主要有C、H、O、N和S。

有些蛋白質(zhì)含有少量磷或金屬元素鐵、銅、鋅、錳、鈷、鉬,個別蛋白質(zhì)還含有碘

1、蛋白質(zhì)的元素組成:氮的含量在多種的蛋白質(zhì)比較接近,平均為16%,因此用凱氏(kjelahl)法定N,受檢物質(zhì)中含蛋白質(zhì)量為N含量的6.25倍。★蛋白質(zhì)含量的測定:凱氏定氮法(測定氮的經(jīng)典方法)

優(yōu)點:對原料無選擇性,儀器簡單,方法也簡單;缺點:易將無機氮,都歸入蛋白質(zhì)中,不精確。樣品含氮量平均在16%,取其倒數(shù)100/16=6.25,即為蛋白質(zhì)換算系數(shù),其含義是樣品中每存在1g元素氮,就說明含有6.25g蛋白質(zhì));故:

※蛋白質(zhì)含量=氮的量×100/16

一、氨基酸

——組成蛋白質(zhì)的基本單位存在自然界中的氨基酸有300余種,但組成人體蛋白質(zhì)的氨基酸僅有20種.必需氨基酸和非必需氨基酸:必需氨基酸包括亮氨酸、異亮氨酸、纈氨酸、蘇氨酸、蛋氨酸(甲硫氨酸)、色氨酸、賴氨酸、苯丙氨酸等8種。精氨酸和組氨酸為半必需氨基酸。2、蛋白質(zhì)的氨基酸組成(1)氨基酸的結(jié)構(gòu)天然蛋白質(zhì)中存在的氨基酸都是L-a-氨基酸

COOH|

NH2—C—H|RL-a-氨基酸

一種為脯氨酸,它也有類似結(jié)構(gòu),但側(cè)鏈與氮原子相接形成亞氨基酸。除甘氨酸外,蛋白質(zhì)中的氨基酸都具有不對稱碳原子,都有L—型與D一型之分,為區(qū)別兩種構(gòu)型,通過與甘油醛的構(gòu)型相比較,人為地規(guī)定一種為L型,另種為D一型。當(dāng)書寫時—NH2寫在左邊為L型,-NH2在右為D一型。已知天然蛋白質(zhì)中的氨基酸都屬L型。

非極性疏水性氨基酸(7)甘丙纈亮異苯脯極性中性氨基酸(8)色絲酪半蛋天谷蘇酸性氨基酸(2)天谷堿性氨基酸(3)賴精組(一)氨基酸的分類(二)氨基酸的理化性質(zhì)1.兩性解離及等電點氨基酸是兩性電解質(zhì),其解離程度取決于所處溶液的酸堿度。等電點(isoelectricpoint,pI)

在某一pH的溶液中,氨基酸解離成陽離子和陰離子的趨勢及程度相等,成為兼性離子,呈電中性。此時溶液的pH值稱為該氨基酸的等電點。pH=pI+OH-pH>pI+H++OH-+H+pH<pI氨基酸的兼性離子陽離子移向陰極陰離子移向陽極2.紫外吸收色氨酸(TrpW)、酪氨酸(TryY

)的最大吸收峰在280nm

附近。大多數(shù)蛋白質(zhì)含有這兩種氨基酸殘基,所以測定蛋白質(zhì)溶液280nm的光吸收值是分析溶液中蛋白質(zhì)含量的快速簡便的方法。芳香族氨基酸的紫外吸收3.茚三酮反應(yīng)氨基酸與茚三酮水合物共熱,可生成藍紫色化合物,其最大吸收峰在570nm處。由于此吸收峰值與氨基酸的含量存在正比關(guān)系,因此可作為氨基酸定量分析方法。

氨基酸代謝庫食物蛋白質(zhì)消化吸收

組織蛋白質(zhì)分解

體內(nèi)合成氨基酸(非必需氨基酸)

α-酮酸

脫氨基作用

酮體氧化供能

糖胺類脫羧基作用氨

尿素代謝轉(zhuǎn)變其它含氮化合物

(嘌呤、嘧啶等)合成

氨基酸代謝概況一、氨基酸的脫氨基作用脫氨基方式:?氧化脫氨基?轉(zhuǎn)氨基作用?聯(lián)合脫氨基?非氧化脫氨基

轉(zhuǎn)氨基和氧化脫氨基偶聯(lián)轉(zhuǎn)氨基和嘌呤核苷酸循環(huán)偶聯(lián)(一)、氧化脫氨基作用

L-谷氨酸脫氫酶+H2O+NH3NAD(P)+NAD(P)H+H+COOHCH2CH2C=OCOOHCOOHCH2CH2CHNH2COOH*L-谷氨酸脫氫酶:

活性強,分布于肝、腎及腦組織

輔酶為NAD+或NADP+

專一性強,只作用于谷氨酸(二)、轉(zhuǎn)氨基作用(transamination)

特點:

*沒有游離的氨產(chǎn)生,但改變了氨基酸代謝庫中各種氨基酸的比例。

*大多數(shù)氨基酸可參與轉(zhuǎn)氨基作用,但賴氨酸、脯氨酸、羥脯氨酸除外。谷丙轉(zhuǎn)氨酶(GPT)谷草轉(zhuǎn)氨酶(GOT)谷丙轉(zhuǎn)氨酶(GPT)和谷草轉(zhuǎn)氨酶(GOT)氨基酸

谷氨酸α-酮酸

α-酮戊二酸

H2O+NAD+轉(zhuǎn)氨酶NH3+NADH+H+L-谷氨酸脫氫酶

*此種方式既是氨基酸脫氨基的主要方式,也是體內(nèi)合成非必需氨基酸的主要方式。*主要在肝、腎組織進行。1、

轉(zhuǎn)氨基偶聯(lián)氧化脫氨基作用蘋果酸

腺苷酸代琥珀酸次黃嘌呤核苷酸

(IMP)腺苷酸代琥珀酸合成酶α-酮戊二酸氨基酸

谷氨酸α-酮酸轉(zhuǎn)氨酶1草酰乙酸天冬氨酸轉(zhuǎn)氨酶

2腺苷酸脫氫酶H2ONH3延胡索酸腺嘌呤核苷酸(AMP)2、轉(zhuǎn)氨基偶聯(lián)嘌呤核苷酸循環(huán)(二)、血氨的去路?在肝內(nèi)合成尿素?合成非必需氨基酸及其它含氮化合物?合成谷氨酰胺?腎小管泌氨:分泌的NH3酸性條件下生成NH4+,隨尿排出。

谷氨酸+NH3谷氨酰胺

谷氨酰胺合成酶ATPADP+Pi尿素的生成1、生成部位:主要在肝細胞的線粒體及胞液中。2、生成過程尿素的生成過程由HansKrebs和KurtHenseleit提出,稱為鳥氨酸循環(huán)(orinithinecycle),又稱尿素循環(huán)(ureacycle)或Krebs-Henseleit循環(huán)。鳥氨酸循環(huán)2ADP+PiCO2+NH3+H2O氨基甲酰磷酸2ATPN-乙酰谷氨酸Pi鳥氨酸瓜氨酸精氨酸延胡索酸氨基酸草酰乙酸蘋果酸α-酮戊二酸谷氨酸α-酮酸精氨酸代琥珀酸瓜氨酸天冬氨酸ATPAMP+PPi鳥氨酸尿素線粒體胞液*原料:2分子氨,一個來自于游離氨,另一個來自Asp(天冬氨酸);*過程:先在線粒體中進行,再在胞液中進行;*耗能:3個ATP,4個高能磷酸鍵。蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)一級結(jié)構(gòu)(1)組成蛋白質(zhì)的多肽鏈數(shù)目.(2)多肽鏈的氨基酸順序,(3)多肽鏈內(nèi)或鏈間二硫鍵的數(shù)目和位置。其中最重要的是多肽鏈的氨基酸順序,它是蛋白質(zhì)生物功能的基礎(chǔ)。蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)二級結(jié)構(gòu)α-螺旋:多肽鏈中氨基酸殘基以1000的角度圍繞螺旋軸心盤旋上升,每3.6個殘基就旋轉(zhuǎn)一圈,螺距為0.54nm;右手旋轉(zhuǎn);多肽鏈內(nèi)的氫鍵由肽鏈中一個肽鍵的-CO的氧原子與第四個肽鍵的-NH的氫原子組成,每個氫鍵所形成的環(huán)內(nèi)共有13個原子,這種螺旋稱為3.613β-折疊:平行式、反平行式。鄰近兩鏈以相反或相同方向平行排列成片層狀。兩個氨基酸殘基之間的軸心距離為0.35nm,β-折疊結(jié)構(gòu)的氫鍵是由兩條肽鏈中的一條的-CO基與另一條-NH基之間所形成。二級結(jié)構(gòu)還有

-轉(zhuǎn)角、自由回轉(zhuǎn)(無規(guī)卷曲)蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)三級結(jié)構(gòu):是指多肽鏈在二級結(jié)構(gòu)、超二級結(jié)構(gòu)、結(jié)構(gòu)域的基礎(chǔ)上,進一步盤繞、折疊形成的包括主鏈和側(cè)鏈構(gòu)象在內(nèi)的特征三維結(jié)構(gòu)。四級結(jié)構(gòu):是指由兩個或兩個以上具有三級結(jié)構(gòu)的亞基按一定方式聚合而成的特定構(gòu)象的蛋白質(zhì)分子。通常亞基只有一條多肽鏈,但有的亞基由兩條或多條多肽鏈組成,這些多肽鏈間多以二硫鍵相連。亞基單獨存在時無生物學(xué)活性。

維系蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)的作用力:肽鍵、二硫鍵維系蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)的作用力:氫鍵維系蛋白質(zhì)三級結(jié)構(gòu)的作用力:范德華力、鹽鍵、氫鍵、疏水相互作用維系蛋白質(zhì)四級結(jié)構(gòu)的作用力:范德華力、鹽鍵、氫鍵、疏水鍵。其中疏水鍵是最主要的作用力。(一)蛋白質(zhì)的兩性電離一、理化性質(zhì)蛋白質(zhì)分子除兩端的氨基和羧基可解離外,氨基酸殘基側(cè)鏈中某些基團,在一定的溶液pH條件下都可解離成帶負電荷或正電荷的基團。*蛋白質(zhì)的等電點(isoelectricpoint,pI)當(dāng)?shù)鞍踪|(zhì)溶液處于某一pH時,蛋白質(zhì)解離成正、負離子的趨勢相等,即成為兼性離子,凈電荷為零,此時溶液的pH稱為蛋白質(zhì)的等電點。蛋白質(zhì)的鹽溶、鹽析、變性和復(fù)性鹽溶是指蛋白質(zhì)溶液中由于加入低濃度的中性鹽后,使蛋白質(zhì)溶解度增加的現(xiàn)象稱為鹽溶。鹽析是指高濃度中性鹽可使蛋白質(zhì)分子脫去水化層并中和其電荷而使蛋白質(zhì)從溶液中凝集出來的現(xiàn)象叫做鹽析。蛋白質(zhì)的變性作用是指天然蛋白質(zhì)分子由于受到物理或化學(xué)因素的影響使次級鍵破壞,引起天然構(gòu)象的改變,導(dǎo)致生物活性的喪失及一些理化性質(zhì)的改變,但未引起肽鍵的斷裂,這種現(xiàn)象叫做蛋白質(zhì)的變性作用。蛋白質(zhì)的復(fù)性是指當(dāng)變性因素除去后,變性蛋白又可重新回復(fù)到天然構(gòu)象,這一現(xiàn)象叫蛋白質(zhì)的復(fù)性。蛋白質(zhì)的紫外吸收由于蛋白質(zhì)分子中含有共軛雙鍵的酪氨酸和色氨酸,因此在280nm波長處有特征性吸收峰。蛋白質(zhì)的OD280與其濃度呈正比關(guān)系,因此可作蛋白質(zhì)定量測定。蛋白質(zhì)的呈色反應(yīng)⒈茚三酮反應(yīng)(ninhydrinreaction)

蛋白質(zhì)經(jīng)水解后產(chǎn)生的氨基酸也可發(fā)生茚三酮反應(yīng)。⒉雙縮脲反應(yīng)(biuretreaction)蛋白質(zhì)和多肽分子中肽鍵在稀堿溶液中與硫酸銅共熱,呈現(xiàn)紫色或紅色,此反應(yīng)稱為雙縮脲反應(yīng),雙縮脲反應(yīng)可用來檢測蛋白質(zhì)水解程度。蛋白質(zhì)的分離提純技術(shù)

一、根據(jù)分子大小不同進行分離純化1、透析和超過濾

透析和超過濾都是利用蛋白質(zhì)分子不能通過半透膜的性質(zhì),使蛋白質(zhì)和其它小分子物質(zhì)分開。

超過濾是利用壓力或離心力,強使水和其它小分子溶液透過半透膜,而蛋白質(zhì)留在膜上。蛋白質(zhì)的分離提純技術(shù)

二、根據(jù)溶解度差別的分離方法1.等電點沉淀和PH值控制利用各種蛋白質(zhì)在等電點時,溶解度最小這一性質(zhì),可以通過調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)溶液的PH值,將不同的蛋白質(zhì)分開。2.蛋白質(zhì)鹽溶或鹽析中性鹽在低濃度時,可以增加蛋白質(zhì)的溶解度,這種現(xiàn)象叫鹽溶。當(dāng)溶液離子強度增加到一定數(shù)值時,蛋白質(zhì)的溶解度下降開始沉淀,這種現(xiàn)象叫鹽析。蛋白質(zhì)的分離提純技術(shù)

三、根據(jù)電荷不同的分離方法1.

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