




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文檔簡(jiǎn)介
本節(jié)看點(diǎn)1.真原核生物基因結(jié)構(gòu)的差異2.DNA聚合酶與DNA連接酶的區(qū)別與聯(lián)系3.理解同尾酶定義及應(yīng)用01.原理與工具02.基因工程的過(guò)程原核生物的基因
基因非基因基因通常是具有遺傳效應(yīng)的DNA片段翻譯轉(zhuǎn)錄mRNA基因2基因3基因4基因1非編碼區(qū)編碼區(qū)放大基因3原核生物DNA收裁剪&拼接
翻譯收mRNA真核生物DNA基因1基因2基因3基因4
基因
非基因收收
轉(zhuǎn)錄hnRNA放大編碼區(qū)非編碼區(qū)基因3內(nèi)含子1外顯子1內(nèi)含子2外顯子2內(nèi)含子3外顯子3內(nèi)含子4內(nèi)含子外顯子基因3編碼區(qū)放大真核生物的核基因非編碼區(qū)的結(jié)構(gòu)啟動(dòng)子:
編碼區(qū)上游能與RNA聚合酶結(jié)合并形成轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合體的區(qū)域終止子:
位于編碼區(qū)下游,轉(zhuǎn)錄過(guò)程中能夠終止
RNA聚合酶轉(zhuǎn)錄的DNA序列,使RNA合成終止調(diào)控序列:對(duì)基因表達(dá)起調(diào)控作用的序列的統(tǒng)稱編碼區(qū)非編碼區(qū)調(diào)節(jié)基因操縱基因終止子啟動(dòng)子DNA基本結(jié)構(gòu)3'末端TTCGAA5'末端AAGCTT4
153
25'末端3'末端5'末端3'末端G
C
A
T
A
T
限制性核酸內(nèi)切酶——黏性末端5'
…
A3'
A5'3'
…
TT
C
G
A
5'黏性末端A
A
G
C
TTTTC
G
A
A3'A
G
C
TTA…
3'…
5'…
3'…
5'5'
…3'
…Hind
III5'末端A
A
G
C
T
T
3'末端TTCGAA3'末端5'末端限制性核酸內(nèi)切酶——平末端5'末端G
A
T
A
T
C
3'末端CTATAG5'
…3'
…G
A
T
A
T
CC
T
A
T
A
GEcoR
V…
3'…
5'3'5'平末端5'3'…
3'…
5'A
T
CT
A
GG
A
TC
T
A5'
…3'
…3'末端5'末端限制性核酸內(nèi)切酶限制(性核酸內(nèi)切)酶作用實(shí)質(zhì)斷開(kāi)(水解)磷酸二酯鍵作用于雙鏈作用結(jié)果形成黏性末端或平末端獲取目的基因特點(diǎn)識(shí)別特定序列(回文序列)來(lái)源原核生物(主要)舉例EcoR
I
、Alu
lSam
I
、BamH
I
等DNA連接酶5'
…
G
A
T
A
T
C
…
3'3'
…
C
T
A
T
A
G
…
5'
T4
DNA連接酶5'
…
A
A
G
C
T
T
…
3'3'
…
T
T
C
G
A
A
…
5'T4
DNA連接酶
DNA連接酶……3'5'平末端5'3'…
3'…
5'3'A
G
C
TT3'
A…
A…
TT
C
G
AA
T
CT
A
GG
A
TC
T
AA5'5'黏性末端…
3'…
5'ADNA連接酶DNA連接酶作用實(shí)質(zhì)形成磷酸二酯鍵作用于雙鏈作用結(jié)果連接已有DNA片段形成重組DNA舉例T4
DNA連接酶(黏性末端&平末端)E.coliDNA連接酶(黏性末端)注意:DNA聚合酶與DNA連接酶并非同一種酶
DNA聚合酶功能為連接游離的脫氧核糖
核苷酸(即形成單鏈),形成磷酸二酯鍵同尾酶識(shí)別切割不同的DNA片段但產(chǎn)生相同的黏性末端的一類限制性核酸內(nèi)切酶稱為同尾酶……GC
C
T
A
G……AT
C
T
A
GG
A
T
C
CG……G
A
T
C
TA……BamH
I……A
G
A
T
C
TT
C
T
A
G
AG
G
A
TC
CC
C
T
A
G
G……G
A
T
CC
T
A
………………G
A
T
C
…T
A
A
………
C
T
ASau3A
IBgl
II……同尾酶與二次酶切識(shí)別切割不同的DNA片段但產(chǎn)生相同的黏性末端的一類限制性核酸內(nèi)切酶稱為同尾酶同尾酶切出的序列,由于黏性末端一致,可以連接到一起但重新連接的DNA分子能否被相同的限制酶二次酶切,需要依識(shí)別序列討論BamH
I……G
A
T
C
CG…………G
G
A
TC
CC
C
T
A
G
G……GC
C
T
A
GBgl
II……G
A
T
C
TA………………A
G
A
T
C
TT
C
T
A
G
AAT
C
T
A
GCG連接……GCGCATTATA……4.
在受體細(xì)胞中
自主復(fù)制
或
隨受體細(xì)胞復(fù)制多以質(zhì)粒形式存在多為重組至宿主細(xì)胞染色體上基因工程的載體工具常見(jiàn)載體:質(zhì)粒(小型環(huán)狀DNA分子)、λ噬菌體的衍生物、動(dòng)植物病毒注意:質(zhì)粒并非只存在于原核細(xì)胞中,許多真核細(xì)胞(如酵母菌等)中也存在質(zhì)粒1.
適宜的多種限制酶切點(diǎn)(好切)2.
具有標(biāo)記基因
供重組DNA篩選
常為抗性基因3.
具有啟動(dòng)子、終止子
等調(diào)控區(qū)
以受體細(xì)胞中可表達(dá)為準(zhǔn)良好載體的基本要求復(fù)制原點(diǎn)
5.
對(duì)受體細(xì)胞無(wú)害質(zhì)粒本節(jié)看點(diǎn)1.基因組文庫(kù)與cDNA文庫(kù)的區(qū)別2.單酶切的弊端與雙酶切的優(yōu)勢(shì)3.表達(dá)載體導(dǎo)入受體細(xì)胞的不同方式4.目的基因檢測(cè)的方式及應(yīng)用01.原理與工具02.基因工程的過(guò)程基因工程的步驟復(fù)制原點(diǎn)啟動(dòng)子、終止子目的基因
標(biāo)記基因目的基因的獲取表達(dá)載體的構(gòu)建DNA分子雜交分子雜交抗原-抗體雜交性狀檢測(cè)表達(dá)載體導(dǎo)入受體細(xì)胞目的基因的檢測(cè)與鑒定動(dòng)物:顯微注射法微生物:Ca2+處理,感受態(tài)細(xì)胞基因文庫(kù)法人工合成法基因組文庫(kù)cDNA文庫(kù)反轉(zhuǎn)錄法
化學(xué)合成法植物農(nóng)桿菌轉(zhuǎn)化法
基因槍法花粉管通道法PCR技術(shù)(獲取/擴(kuò)增)基因組文庫(kù)基因組DNA用限制性核酸內(nèi)切酶酶切基因組文庫(kù)內(nèi)含完整編碼區(qū)(外顯子
+
內(nèi)含子)所以基因組文庫(kù)不適宜直接導(dǎo)入原核生物細(xì)胞內(nèi)表達(dá)導(dǎo)入噬菌體進(jìn)行克隆導(dǎo)入細(xì)菌進(jìn)行克隆隨機(jī)大量酶切為多個(gè)片段隨機(jī)大量酶切為多個(gè)片段cDNA文庫(kù)操作文庫(kù)大小基因多寡啟動(dòng)子終止子內(nèi)含子物種間交流基因文庫(kù)酶切?多有有大都不可以cDNA文庫(kù)逆轉(zhuǎn)錄?少??大都可以與基因組文庫(kù)的制作方式不同,
cDNA文庫(kù)提取mRNA作為模板,通過(guò)逆轉(zhuǎn)錄形成cDNA并保存注意:cDNA文庫(kù)DNA分子沒(méi)有啟動(dòng)子、終止子及內(nèi)含子序列,更加適合種間基因交流分別導(dǎo)入
受體細(xì)胞提取mRNA逆轉(zhuǎn)錄+質(zhì)粒增殖mRNAcDNA人工合成人工合成反轉(zhuǎn)
錄
法目的基因的
mRNA雜交雙鏈(單鏈RNA/單鏈DNA)單鏈DNA雙鏈DNA(目的基因)反轉(zhuǎn)錄法的具體操作已知蛋白質(zhì)的氨基酸序列推測(cè)mRNA的核苷酸序列推測(cè)目的基因的核苷酸序列DNA合成儀
化學(xué)合成目的基因化學(xué)合成法的過(guò)程化學(xué)合成法表達(dá)載體的構(gòu)建表達(dá)載體終止子復(fù)制原點(diǎn)
標(biāo)記基因目的基因啟動(dòng)子質(zhì)粒
同一種限制酶
DNA連接酶單酶切及其弊端質(zhì)粒自身環(huán)化×目的基因反接×若只用同一種限制酶處理DNA連接酶處理目的基因正接雙酶切及其優(yōu)勢(shì)DNA連接酶處理目的基因正確連接若用兩種不同的限制酶同時(shí)處理目的基因及質(zhì)粒
分別創(chuàng)造不同的兩側(cè)末端雙酶切:
防止目的基因的反向連接及質(zhì)粒自身環(huán)化現(xiàn)象產(chǎn)生目的基因(表達(dá)載體)導(dǎo)入受體細(xì)胞(植物)注意:雙子葉和裸子植物受到傷害會(huì)產(chǎn)生酚類化合物,吸引農(nóng)桿菌農(nóng)桿菌轉(zhuǎn)化法是受體細(xì)胞為植物細(xì)胞時(shí)最普適的轉(zhuǎn)入方法即使受體細(xì)胞為單子葉植物細(xì)胞,也可以通過(guò)添加酚類物質(zhì)完成轉(zhuǎn)入及表達(dá)受體細(xì)胞為雙子葉植物:
農(nóng)桿菌轉(zhuǎn)化法受體細(xì)胞為單子葉植物:基因槍法
此外還有花粉管通道法等方法表現(xiàn)出新性狀
的植株含重組Ti質(zhì)粒
的農(nóng)桿菌插入染色體的目的基因DNA植物細(xì)胞表達(dá)載體再生植株培養(yǎng)為農(nóng)桿菌Ti質(zhì)粒T-DNA構(gòu)建轉(zhuǎn)入導(dǎo)入目的基因(表達(dá)載體)導(dǎo)入受體細(xì)胞(動(dòng)物or微生物)顯微注射法注意:若想最終獲得轉(zhuǎn)基因動(dòng)物,則表達(dá)載體必須直接導(dǎo)入受精卵中43℃;
2minCaCl2處理質(zhì)粒與鈣離子結(jié)合
吸附在細(xì)胞外受體細(xì)胞為微生物細(xì)胞受體細(xì)胞為動(dòng)物細(xì)胞CaCl2轉(zhuǎn)化法質(zhì)粒進(jìn)入細(xì)胞感受態(tài)細(xì)胞感受態(tài)細(xì)胞正常細(xì)胞目的基因的檢測(cè)與鑒定進(jìn)沒(méi)進(jìn)去是否轉(zhuǎn)錄是否翻譯性狀體現(xiàn)待測(cè)物DNAmRNA蛋白質(zhì)個(gè)體性狀檢測(cè)邏輯目的基因是否存在DNA分子雜交DNA-DNA分子雜交是否出現(xiàn)雜交帶目的基因是否轉(zhuǎn)錄分子雜交DNA-DNA分子雜交是否出現(xiàn)雜交帶目的基因是否翻譯抗原-抗體雜交是否出現(xiàn)雜交帶個(gè)體是否表現(xiàn)性狀抗蟲、抗病抗抗生素等接種實(shí)驗(yàn)是否存活習(xí)題精練苯丙酮尿癥是PKU基因突變引起的,研究人員嘗試用基因治療的方式治療該疾病,即將正?;駾導(dǎo)入到有突變基因的細(xì)胞中。下圖中的圖甲為A
、B
、C三種質(zhì)粒,圖乙為含有目的基因D的DNA片段,圖丙表示重組
載體的示意圖。其中Ap為氨芐青霉素抗性基因,
Tc為四環(huán)素抗性基因,
lacZ為藍(lán)色顯色基因(基因表達(dá)的產(chǎn)
物將無(wú)色化合物X-gal轉(zhuǎn)化為一種藍(lán)色物質(zhì),菌落呈藍(lán)色),
EcoRI(0.7kb)
、PvuI(0.8kb)等為限制酶及其切割
位點(diǎn)與復(fù)制原點(diǎn)之間的距離。已知1kb=1000堿基對(duì),請(qǐng)結(jié)合所學(xué)知識(shí)回答:(1)將正常的D基因?qū)胧荏w細(xì)胞的基因工程操作步驟中,其核心是
,據(jù)圖分析上述甲圖中三種質(zhì)粒中不宜作為運(yùn)載體的有
,請(qǐng)分析原因
習(xí)題精練苯丙酮尿癥是PKU基因突變引起的,研究人員嘗試用基因治療的方式治療該疾病,即將正?;駾導(dǎo)入到有突變基因的細(xì)胞中。下圖中的圖甲為A
、B
、C三種質(zhì)粒,圖乙為含有目的基因D的DNA片段,圖丙表示重組
載體的示意圖。其中Ap為氨芐青霉素抗性基因,
Tc為四環(huán)素抗性基因,
lacZ為藍(lán)色顯色基因(基因表達(dá)的產(chǎn)
物將無(wú)色化合物X-gal轉(zhuǎn)化為一種藍(lán)色物質(zhì),菌落呈藍(lán)色),
EcoRI(0.7kb)
、PvuI(0.8kb)等為限制酶及其切割
位點(diǎn)與復(fù)制原點(diǎn)之間的距離。已知1kb=1000堿基對(duì),請(qǐng)結(jié)合所學(xué)知識(shí)回答:(2)若要獲取目的基因D,上述乙圖中應(yīng)選擇限制酶
對(duì)其所在的DNA進(jìn)行切割,如果僅知道D基因首位的部分核苷酸序列,通常可根據(jù)該基因首位兩端的已知核苷酸序列合成
,利用
技術(shù)得到大量的目的基因習(xí)題精練苯丙酮尿癥是PKU基因突變引起的,研究人員嘗試用基因治療的方式治療該疾病,即將正常基因D導(dǎo)入到有突變基因的細(xì)胞中。下圖中的圖甲為A
、B
、C三種質(zhì)粒,圖乙為含有目的基因D的DNA片段,圖丙表示重組
載體的示意圖。其中Ap為氨芐青霉素抗性基因,
Tc為四環(huán)素抗性基因,
lacZ為藍(lán)色顯色基因(基因表達(dá)的產(chǎn)
物將無(wú)色化合物X-gal轉(zhuǎn)化為一種藍(lán)色物質(zhì),菌落呈藍(lán)色),
EcoRI(0.7kb)
、PvuI(0.8kb)等為限制酶及其切割
位點(diǎn)與復(fù)制原點(diǎn)之間的距離。已知1kb=1000堿基對(duì),請(qǐng)結(jié)合所學(xué)知識(shí)回答:(3)將目的基因D和甲圖中可做載體的質(zhì)粒進(jìn)行連接后,會(huì)得到圖丙中三種連接方式。需要選出正向連接的重組質(zhì)粒,可使用
酶切割所獲得的重組質(zhì)粒。完全酶切后進(jìn)行電泳分析。若是載體自連,電泳圖譜
中出現(xiàn)2.7kb一條帶,若是正向連接載體和反向連接載體,電泳圖譜中出現(xiàn)長(zhǎng)度分別為
和
.習(xí)題精練苯丙酮尿癥是PKU基因突變引起的,研究人員嘗試用基因治療的方式治療該疾病,即將正?;駾導(dǎo)入到有突變基因的細(xì)胞中。下圖中的圖甲為A
、B
、C三種質(zhì)粒,圖乙為含有目的基因D的DNA片段,圖丙表示重組
載體的示意圖。其中Ap為氨芐青霉素抗性基因,
Tc為四環(huán)素抗性基因,
lacZ為藍(lán)色顯色基因(基因表達(dá)的產(chǎn)
物將無(wú)色化合物X-gal轉(zhuǎn)化為一種藍(lán)色物質(zhì),菌落呈藍(lán)色),
EcoRI(0.7kb)
、PvuI(0.8kb)等為限制酶及其切割
位點(diǎn)與復(fù)制原點(diǎn)之間的距離。已知1kb=1000堿基對(duì),請(qǐng)結(jié)合所學(xué)知識(shí)回答:(4)選擇自身不含lacZ基因且對(duì)抗生素敏感的大腸桿菌作為受體細(xì)胞,在已轉(zhuǎn)化的含重組質(zhì)粒、空質(zhì)粒的受體細(xì)胞中和未轉(zhuǎn)化成功的細(xì)胞中如何篩選出成功導(dǎo)入重組質(zhì)粒的受體細(xì)胞性狀檢測(cè)——雙標(biāo)記問(wèn)題在真實(shí)的基因工程相關(guān)實(shí)驗(yàn)中,若表達(dá)載體上只有一個(gè)標(biāo)記基因(如抗性基因),則通過(guò)含抗生素培養(yǎng)基篩選后所得菌落有兩種可能,其一為含有完整表達(dá)載體,其二為只含有空質(zhì)粒,內(nèi)部并沒(méi)有目的基因存在。因此在實(shí)際操作中常使用雙抗性標(biāo)記,以平板影印法輔助鑒定完成基因工程操作進(jìn)行目的基因檢測(cè)含四環(huán)素培養(yǎng)基四環(huán)素抗性基因目的基因啟動(dòng)子Tetr復(fù)制原點(diǎn)
表達(dá)載體終止子性狀檢測(cè)——雙標(biāo)記問(wèn)題在真實(shí)的基因工程相關(guān)實(shí)驗(yàn)中,若表達(dá)載體上只有一個(gè)標(biāo)記基因(如抗性基因),則通過(guò)含抗生素培養(yǎng)基篩選后所得菌落有兩種可能,其一為含有完整表達(dá)載體,其二為只含有空質(zhì)粒,內(nèi)部并沒(méi)有目的基因存在。因此在實(shí)際操作中常使用雙抗性標(biāo)記,以平板影印法輔助鑒定Pst
I酶切位點(diǎn)1472583691458369Tetr四環(huán)素抗性基因Ampr青霉素抗性基因完成基因工程操作進(jìn)行目的基因檢測(cè)含四環(huán)素培養(yǎng)基含青霉素培養(yǎng)基沾取菌落無(wú)菌絨布習(xí)題精練(1)獲取目的基因的方法很多,上圖是利用人生長(zhǎng)激素mRNA
。而在構(gòu)建基因表達(dá)載體時(shí)必須使用的酶是
和
。⑤過(guò)程要用CaCl2處理大腸桿菌,目的是
。(2)如果限制性內(nèi)切晦Pst
l
、EcoR
l和Hind
lll對(duì)質(zhì)粒pBR322進(jìn)行切割,用兩種晦、三種晦分別切割時(shí),則形
成的DNA片段共
種,其中含有完整四環(huán)素抗性基因的DNA片段的所占比例是
。習(xí)題精練(3)如果只用限制性內(nèi)切酶Pst
I切割目的基因和質(zhì)粒pBR322,完成過(guò)程
④、⑤后,將三角瓶?jī)?nèi)的大腸桿菌(不含Ampr
、Tetr抗性質(zhì)粒)先接種到甲培養(yǎng)基上,形成菌落后用無(wú)菌牙簽挑取甲上的單個(gè)菌落,分別接種到乙和丙兩個(gè)培養(yǎng)基的相同位置上,一段時(shí)間后,菌落的生長(zhǎng)狀況如圖所示。能在乙培養(yǎng)基上生長(zhǎng)的大腸桿菌是含有
抗性基因,含有目的基因的大腸桿菌應(yīng)該在
(填“乙培養(yǎng)基”、“丙培養(yǎng)基”)性狀檢測(cè)——“藍(lán)白斑”(報(bào)告基因)問(wèn)題已知:lacZt編碼Z酶氨基端的一個(gè)片段(稱為α-肽)α-肽、缺失α-肽的Z酶片段單獨(dú)存在時(shí)均無(wú)Z酶活性,共同存在時(shí)
就會(huì)表現(xiàn)出Z酶活性底物X-gal正常大腸桿菌
表達(dá)Z酶水解為藍(lán)色物質(zhì)所謂“報(bào)告基因”是指一類在細(xì)胞、組織/器官或個(gè)體處于特定情況下會(huì)表達(dá)并使得他們產(chǎn)生易于檢測(cè)、且實(shí)驗(yàn)材料原本不會(huì)產(chǎn)生的性狀的基因Sal
I酶切位點(diǎn)lacZt
基因報(bào)告基因青霉素抗性基因性狀檢測(cè)——“藍(lán)白斑”(報(bào)告基因)問(wèn)題所謂“報(bào)告基因”是指一類在細(xì)胞、組織/器官或個(gè)體處于特定情況下會(huì)表
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