蛋白質(zhì)的生物合成 1

第十二章蛋白質(zhì)的生物合成

翻譯

(ProteinBiosynthesis-Translation)

第一節(jié)參與蛋白質(zhì)生物合成的物質(zhì)第二節(jié)蛋白質(zhì)合成的過程第三節(jié)蛋白質(zhì)的靶向輸送第四節(jié)蛋白質(zhì)合成的干擾和抑制第一節(jié)參與蛋白質(zhì)合成的主要物質(zhì)一、mRNA二、tRNA三、核糖體四、其他氨基酸氨酰-tRNA合成酶各種因子ATP/GTP一、mRNA（一）mRNA上的開放閱讀框開放閱讀框（openreadingframe,ORF)：mRNA5′端起始密碼子開始到3′端終止密碼子之間連續(xù)的、無重疊的一連串密碼子組成的蛋白質(zhì)編碼區(qū)。·····AUGGCGAACGCU······UAG·····（二）密碼子

1.數(shù)量64個2.特殊密碼子(1)起始密碼子:ORF起始部位的AUG（編碼Met）UUG或GUG(少數(shù)原核生物）(2)終止密碼子：UAA、UAG、UGA（不編碼AA）3.密碼子的特點（1）簡并性

一種AA有幾個密碼子Trp（UGG)和Met(AUG)：只有一個密碼子同義密碼子：編碼同一種氨基酸的不同密碼子

簡并性的意義：？

GCUACUGCCACCGCAACAGCGACG

AlaThr意義：可以降低堿基突變造成的有害效應(yīng)（2）通用性從細(xì)菌到人，遺傳密碼子幾乎是通用的植物細(xì)胞的葉綠體、哺乳動物線粒體中密碼子的特殊性：UGA：不是終止密碼子，而是Trp的密碼子

UAA,UAG,AGA,AGG：

終止密碼子AUA：Met（notforIle）（3）密碼子有方向性5′3′（4）mRNA中密碼子間無間隔，不重疊5′·····AUGGCGAACGCU·····UAG·····3′二、tRNA

功能：1）氨基酸的“搬運(yùn)工具”2）識別mRNA的密碼子

反密碼環(huán)氨基酸臂（一）種類20種AA都有其特定的一種至幾種tRNA（二）搖擺性（wobble）反密碼子（anti-codon）的第1位與密碼子（codon）第3位配對時，不嚴(yán)格遵循堿基配對原則

I—C，I—A,I-U，U—G

（三）起始tRNA與普通tRNA1.起始tRNA真核：tRNAimet原核：tRNAifmet2.普通tRNA：除起始tRNAtRNAemet：肽鏈延伸中攜帶Met·····AUGGCGAUGGCUAUG····UAG·····三、核糖體

（一）核糖體（核蛋白體）的組成1.原核生物核糖體（70S）：（1）組成30S小亞單位：16SrRNA和21種蛋白質(zhì)50S大亞單位：5SrRNA、23SrRNA、~32種蛋白質(zhì)

2、真核生物的核糖體（80S）40S小亞單位：18SrRNA＋~33蛋白質(zhì)60S大亞單位:28SrRNA、5SrRNA、5.8SrRNA+49蛋白質(zhì)（二）核糖體的重要位點1、氨基酰-tRNA位點（Asite）2、肽酰-tRNA位點（Psite）3、tRNA退出位點（Esite）肽鍵形成部位第二節(jié)蛋白質(zhì)的合成一、氨酰-tRNA的合成（氨基酸的活化）二、肽鏈合成的起始三、肽鏈的延伸四、終止五、肽鏈的折疊和翻譯后加工（一）氨基酸的活化1.總反應(yīng)為：

氨基酸＋tRNA＋ATP氨基酰-tRNA＋AMP＋PPi

氨基酰-tRNA合成酶(鎂離子)氨基酰-tRNA鍵：高能鍵一、氨酰-tRNA的合成

第一步反應(yīng)氨基酸＋ATP＋E—→氨基酰-AMP-E＋PPi

第二步反應(yīng)氨基酰-AMP-E＋tRNA↓

氨基酰-tRNA

＋AMP＋E氨酰-tRNA2.Met－tRNAifMet的甲酰化(原核生物）N10-甲酰－FH4FH4Met－tRNAifMet

fMet－tRNAifMet甲?；D(zhuǎn)移酶（特異）（二）氨基酰-tRNA合成酶的特點1.每一種AA都只有一種特定的氨基酰-tRNA合成酶2.具有校讀功能（1）識別AA及其tRNA（2）將tRNA與正確的AA連接（3）可將錯誤的氨基酰-tRNA水解

保證蛋白質(zhì)合成的精確性

蛋白質(zhì)合成中mRNA模板的方向：5′→3′蛋白質(zhì)的合成方向：N端→C端

二、肽鏈合成的起始

參與的物質(zhì)（1）30S和50S亞單位

mRNA

fMet－tRNAifMet（2）

GTP（3）Mg2+（4）起始因子（一）原核生物翻譯的起始

三種起始因子的作用：IF1:防止氨基酰-tRNA進(jìn)入AsiteIF2：引導(dǎo)fMet－tRNAifMet進(jìn)入PsiteIF3：防止30S結(jié)合50S亞單位2.起始過程

Step1Step2Step3Step1：30S亞單位在mRNA上定位過程：30S亞單位依次結(jié)合IF3(Esite),和IF1（Asite）；30S亞單位16SrRNA-3′端與mRNA的SD序列互補(bǔ)，結(jié)合到mRNA,并使起始密碼子準(zhǔn)確定位在P位點。SD序列（Shine-Dalgarno）

:

mRNA分子中緊靠起始密碼子上游的一段富含嘌呤堿基的8－13核苷酸的序列。又稱為核蛋白體結(jié)合位點（ribosomalbindingsite，RBS)

Step2：定位fMet－tRNAifMetfMet－tRNAifMet-IF2－GTP進(jìn)入Psite，并與起始AUG配對。Step3：結(jié)合50S大亞單位，形成70S復(fù)合物

起始密碼子和反密碼子的配對，使30s構(gòu)象改變，釋放IF3，結(jié)合50S大亞單位，釋放IF2和IF1，形成70S起始復(fù)合物。消耗1個GTP（二）真核生物翻譯起始起始即將40S亞單位和Met－tRNAiMet、mRNA、60S亞單位組裝成80S起始復(fù)合物的過程。1. 43S復(fù)合物的形成

40S結(jié)合多種起始因子（eIF1A、eIF3、eIF5B-GTP），并俘獲eIF2－GTP-Met－tRNAiMet（Psite），形成43S復(fù)合物。2.小亞單位在mRNA上的定位

mRNA的5′Cap與復(fù)合體eIF4F結(jié)合，并俘獲eIF4B,RNA解旋,形成eIF4F/4B－mRNA復(fù)合體。eIF4F/4B－mRNA俘獲43S復(fù)合物，43S復(fù)合物沿mRNA5′3′方向掃描起始AUG，在mRNA上準(zhǔn)確定位。

3、80S復(fù)合物的形成

Met－tRNAiMet的反密碼子與mRNA的起始密碼子配對，使eIF2、eIF3釋放，60S與40S結(jié)合，eIF5B水解GTP，釋放其他起始因子，形成80S復(fù)合物。消耗GTP真核與原核生物肽鏈合成起始的主要區(qū)別1）更多的起始因子參與2）Met－tRNAiMet先定位到核糖體3）mRNA結(jié)合多種起始因子后才與核糖體結(jié)合4）小核糖體通過Met－tRNAiMet的反密碼子與mRNA起始密碼子之間互補(bǔ)配對而準(zhǔn)確定位.二、延伸1.需要70S（80S)起始復(fù)合物、氨基酰-tRNA、延伸因子、GTP延伸因子：原核：EF（Tu，Ts，G)真核：EF-1和EF-22.三步循環(huán)進(jìn)位成肽轉(zhuǎn)位（一）step1－進(jìn)位過程：氨基酰-tRNA-Tu-GTP結(jié)合到Asite，GTP水解，釋放Tu-GDP只有與密碼子正確互補(bǔ)配對的氨基酰-tRNA才能進(jìn)入A位點：維持蛋白質(zhì)合成準(zhǔn)確性的另一個機(jī)制。進(jìn)位消耗1GTPTu-GTP：在Ts（GTP交換因子）的參與下生成。Tu：GTPase活性Step2－成肽過程：Asite中氨基酰－tRNA的氨基攻擊Psite的fMet－tRNAfMet

(肽酰－tRNA）形成肽鍵，生成二肽酰（肽酰）-tRNA(Asite)，tRNAfMet（空載的tRNA）留在Psite。催化肽鍵形成的酶：轉(zhuǎn)肽酶(23SrRNA)能量：氨基酰－tRNA中高能鍵斷裂提供Step3－轉(zhuǎn)位過程：核糖體向mRNA3′方向移動一個密碼子→二肽酰－tRNA進(jìn)入PSite,空載的tRNA進(jìn)入Esite并由此進(jìn)入胞質(zhì),第三個（下一個）密碼子進(jìn)入Asite，進(jìn)入下一個延伸循環(huán)。轉(zhuǎn)位需EF-G-GTP水解提供能量(轉(zhuǎn)位酶）。三、終止1.以終止密碼子出現(xiàn)為信號2.釋放因子：原核三個：RF1(UAG/UAA),RF2(UGA/UAA),RF3(促進(jìn)RF1或RF2從核糖體上釋放）真核：eRF1、eRF3(eRF3-GTP)3.終止過程過程：（1）終止密碼子進(jìn)入Asite，RF1（或RF2）與之結(jié)合，水解肽酰－tRNA鍵，肽鏈釋放。（2）30S亞單位結(jié)合RF3-GDP,并轉(zhuǎn)變?yōu)镽F3-GTP，RF1從核糖體上釋放。GTP水解，RF3-GDP從核糖體上釋放。（3）RRF（Asite）、EF-G-GTP、IF3依次結(jié)合到核糖體,30S與50S亞單位分離，進(jìn)入下一個翻譯起始過程。

RRF：核糖體循環(huán)因子核糖體循環(huán)能量消耗起始、終止分別消耗1和2個GTP氨酰－tRNA形成消耗ATP(AMP)

進(jìn)位、轉(zhuǎn)位各消耗1個GTP

每個聚合一個AA能量消耗≥4NTP的高能磷酸鍵五、多肽鏈的折疊及翻譯后加工（一）多肽鏈的折疊多數(shù)需要其他蛋白質(zhì)的參與1.分子伴侶熱休克蛋白（HSP)、伴侶素2.酶蛋白二硫鍵異構(gòu)酶肽－脯氨酰順反異構(gòu)酶（二）翻譯后加工1、一級結(jié)構(gòu)的加工（1）N端fMet或Met的切除（2）特定氨基殘基的修飾：乙酰化（50%的蛋白質(zhì)N端被修飾）、磷酸化（如酪蛋白）、羥基化、羧基化、甲基化（如肌蛋白、鈣調(diào)蛋白）等（3）多肽鏈的切割：特定位置水解

如信號肽等的切除2、空間結(jié)構(gòu)的加工（1）二硫鍵的形成（2）亞基聚合（3）輔基連接：如血紅蛋白連接血紅素（4）糖基化修飾（糖蛋白）（5）疏水脂鏈的連接糖基化修飾（糖蛋白）

Asn（Gln）、Ser、Thr-糖疏水脂鏈的連接：特殊位點連接脂肪鏈或多異戊二烯如G蛋白、Ras等中心法則中心法則：遺傳信息從DNA傳遞給RNA,再從RNA傳遞給蛋白質(zhì)的轉(zhuǎn)錄和翻譯的過程。

DNA

RNA

Protein

第三節(jié)蛋白質(zhì)的靶向輸送

proteintargeting蛋白質(zhì)的靶向輸送：蛋白質(zhì)合成加工后通過復(fù)雜機(jī)制定向輸送到內(nèi)質(zhì)網(wǎng)或發(fā)揮生物功能的目標(biāo)位置的過程。去向：胞液、其他細(xì)胞器、體液（運(yùn)輸?shù)桨屑?xì)胞或器官）信號序列（signalsequence）：新合成的蛋白質(zhì)分子中引導(dǎo)蛋白質(zhì)輸送到細(xì)胞靶部位的特異氨基酸序列。信號序列包括：信號肽（內(nèi)質(zhì)網(wǎng)）

、核定位序列NLS（核）、

前導(dǎo)肽（線粒體）等靶向輸送蛋白信號序列或成分分泌蛋白信號肽內(nèi)質(zhì)網(wǎng)腔蛋白信號肽，C端-Lys-Asp-Glu-Leu-COO-(KDEL序列