第四章：病毒的命名和分類

第四章病毒的分類與命名

一、病毒的分類（一）病毒分類的發(fā)展歷程1937年：Levadifi&Leptin根據(jù)病毒對(duì)組織的親和性進(jìn)行分類；1948年：Holmes提出根據(jù)病毒感染引起的癥狀來分類；1950年：國(guó)際微生物學(xué)會(huì)提出分類的八項(xiàng)原則；1953年：Andremes提出按病毒的理化特性來分；1963年：國(guó)際微生物命名委員會(huì)病毒學(xué)分會(huì)提出新的八項(xiàng)分類原則；1966年成立國(guó)際病毒命名委員會(huì)（internationalcommitteeonnomenclatureofvirus,ICNV）；1971年發(fā)表第一份報(bào)告：500多種病毒分成43個(gè)病毒屬（組）；1973年更名為國(guó)際病毒分類委員會(huì)（internationalcommitteeontaxonomyofvirus,ICTV）；最新的病毒分類報(bào)告：第六次報(bào)告（1995年）現(xiàn)在已知的病毒有3600多種，它們分別屬于71個(gè)病毒科;其中動(dòng)物病毒（包括脊椎動(dòng)物病毒和無椎脊動(dòng)物病毒）有2000余種，分屬27個(gè)病毒科;（二）分類依據(jù)1．病毒的形態(tài)學(xué)特征病毒粒子的大小和形狀；有無表面纖突和纖突的特征；有無囊膜；衣殼對(duì)稱型和結(jié)構(gòu)；2．理化學(xué)特性病毒粒子的分子量、浮密度、沉降系數(shù)；對(duì)酸堿的穩(wěn)定性；對(duì)熱的穩(wěn)定性；對(duì)兩價(jià)陽離子的穩(wěn)定性；對(duì)去污劑的穩(wěn)定性；對(duì)脂溶劑的穩(wěn)定性；對(duì)輻射的穩(wěn)定性。3．基因組核酸類型：DNA或RNA基因組大??；線狀還是環(huán)狀；單股還是雙股是整個(gè)的還是分節(jié)段的，節(jié)段的大小和數(shù)目4.基因組的復(fù)制策略、開放閱讀框架的數(shù)目和位置、轉(zhuǎn)錄特征、翻譯特征、翻譯后加工特征。

5．蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)蛋白的數(shù)目、大小和功能活性，非結(jié)構(gòu)蛋白的數(shù)目、大小和功能活性，蛋白質(zhì)的特殊功能活性（轉(zhuǎn)錄酶、反轉(zhuǎn)錄酶、血凝素、神經(jīng)氨酸酶）6．脂質(zhì)、糖類含量和特性

7．在細(xì)胞培養(yǎng)中的生長(zhǎng)特性對(duì)細(xì)胞種類的特異性；病毒蛋白的聚集場(chǎng)所；病毒粒子的裝配場(chǎng)所；病毒粒子成熟和釋放的部位和性質(zhì)。8．抗原性與其他相關(guān)病毒的血清學(xué)關(guān)系9．生物學(xué)特性自然宿主范圍、傳播方式、傳播介體，地理分布、致病性及與疾病的關(guān)系；組織嗜性和組織病理學(xué)。二．病毒的命名規(guī)則（一）一般規(guī)則：1．病毒的分類和命名應(yīng)是國(guó)際性的，應(yīng)普遍適用于所有病毒;2.通用的病毒分類系統(tǒng)采用目、科、亞科、屬和種的等級(jí)制度，在種的命名尚不完善的情況下，許多病毒可用國(guó)際通用的俗名。3．ICTV不統(tǒng)一規(guī)定病毒種以下的分類和命名。關(guān)于血清型、基因型、病毒株、變異株等的命名由公認(rèn)的國(guó)際專家組決定。4．對(duì)人工產(chǎn)生的病毒和實(shí)驗(yàn)室雜交株不予分類考慮，這些病毒的命名也同樣由公認(rèn)的國(guó)際專家組決定。5．當(dāng)代表成員病毒經(jīng)過充分鑒定并在發(fā)表的文獻(xiàn)上描述后，才能建立一個(gè)類，以便與相似的類區(qū)別。同樣，命名一個(gè)病毒時(shí)，該病毒必須經(jīng)過充分鑒定并在文獻(xiàn)上發(fā)表以明確區(qū)別于相似的病毒（二）關(guān)于類和病毒的命名原則6．現(xiàn)有的類和病毒的名稱無論是否適用均應(yīng)予保留。7．在類和病毒的命名中不遵守優(yōu)先率。8．不使用人名。9．類和病毒的名稱應(yīng)便于使用，容易記憶，最好使用聽起來悅耳的名稱。10．不使用上標(biāo)、下標(biāo)、連字符、斜杠和希臘字母。11．新名稱不應(yīng)與已通過的名稱有重復(fù)，應(yīng)選用與正在使用的或過去使用的名稱不相近的名稱。12．如果縮拼詞對(duì)病毒學(xué)家有意義，且得到公認(rèn)的國(guó)際專家組的推薦，可以接受作為類的名稱。關(guān)于類和病毒的命名原則13．由一個(gè)類或病毒的名稱所隱含的任何意義都會(huì)因在名稱中涉及不是所有成員或潛在成員所具有的特征，以及不是均等地適用于不同類的特征而排斥該類中的合適成員病毒，這種情況應(yīng)當(dāng)避免。

14．新名的選用應(yīng)考慮國(guó)家或民族敏感性問題。應(yīng)采用那些被病毒學(xué)家在科學(xué)雜志上發(fā)表的工作中常用的名稱及衍生名稱作為命名的基礎(chǔ)，此時(shí)可不必考慮國(guó)家來源；在有一個(gè)以上的候選名稱時(shí)，相應(yīng)的研究組或分委員會(huì)向ICTV執(zhí)行委員會(huì)提出建議，由執(zhí)行委員會(huì)決定取哪一個(gè)名稱。15．新的名稱和名稱的變更應(yīng)以分類建議格式提交ICTV。16．病毒種是組成一個(gè)復(fù)制系并占有一個(gè)特定生態(tài)環(huán)境的一類多原則病毒。17．種名應(yīng)由少而實(shí)用的字組成18．種名，通常與株名一起，必須表示明確的特征，不涉及屬名或科名。19．已經(jīng)廣泛應(yīng)用的數(shù)字、字母及其組合可用作種名性質(zhì)形容詞。但新提出的連續(xù)數(shù)字、字母或其組合不單獨(dú)接受作為種名性質(zhì)形容詞。20．ICTV通過新提議的種、種名和型名的程序分兩步：首先，給予暫時(shí)性通過，這樣的建議將發(fā)表在ICTV報(bào)告中；然后，經(jīng)過三年的等候期，如果不撤銷或修正，該建議將得到最后通過。（三）關(guān)于屬的規(guī)則21．屬是一組具有某些共同特性的種。22．屬名應(yīng)是一個(gè)以“Virus”結(jié)尾的單詞。23．通過一個(gè)屬名的同時(shí)需通過一個(gè)代表種。瘟病毒屬：Pestivirus冠狀病毒屬：Coronavirus（四）關(guān)于亞科的規(guī)則24．亞科是一組具有某些共同特性的屬。只有當(dāng)需要處理復(fù)雜等級(jí)結(jié)構(gòu)問題時(shí)才使用亞科。25．亞科名應(yīng)是一個(gè)以“Virinae”結(jié)尾的單詞。

E.g.Retrovirinae：反轉(zhuǎn)錄病毒亞科Spumavirinae：泡沫病毒亞科（五）關(guān)于科的規(guī)則

26．科是一組具有某些共同特性的屬（不管這些屬是否組成了亞科）。27．科名應(yīng)是一個(gè)以“Viridae”結(jié)尾的單詞。28．通過一個(gè)科名的同時(shí)需通過一個(gè)屬名。皰疹病毒科：Herpesviridae腺病毒科：Adenoviridae（六）關(guān)于目的規(guī)則

29．目是一組具有某些共同特性的科。30．目名應(yīng)是一個(gè)以“Virales”結(jié)尾的單詞。動(dòng)物病毒的命名現(xiàn)狀：1、種的命名1）大多用其所引起疾病的名稱，后加“病毒”兩字

脊髓灰質(zhì)炎病毒、豬瘟病毒、流感病毒2）在病名前加上最初發(fā)現(xiàn)該病毒的地名日本乙型腦炎病毒、東方型馬腦炎病毒3）直接用地名稱呼病毒新城疫病毒（Newcastlediseasevirus)4）用人名稱呼馬立克氏病病毒(Marek’sdiseasevirus)2、科、屬的命名1）依據(jù)病毒粒子的形態(tài)和理化學(xué)特性小RNA病毒科、反轉(zhuǎn)錄病毒科、輪狀病毒屬2）依據(jù)病毒所引起的病變的性質(zhì)皰疹病毒科、痘病毒科3）以病毒酶作用的基質(zhì)正粘病毒科、副粘病毒科4）以病毒的最初分離部位腺病毒科5）感染宿主的部位鼻病毒屬、腸道病毒屬6）以幾個(gè)屬的縮拼詞作為科名乳多空病毒科流感病毒的命名方法1.國(guó)際上通用的流感病毒命名方法型別/分離地點(diǎn)/分離序號(hào)/分離時(shí)間（年代）（血凝素和神經(jīng)氨酸酶序號(hào)）

e.gA/Hongkong/1/68（H3N2）A/京科/1/56（H1N1）H：hemagglutinin

血凝素N：neuraminidase

神經(jīng)氨酸酶流感病毒的命名方法2.動(dòng)物流感病毒的命名則在型別與分離地點(diǎn)之間加上動(dòng)物宿主名稱

e.g甲/馬/布拉格/1/56（H1N1）