第四章：病毒的命名和分類

第四章病毒的分類與命名

一、病毒的分類（一）病毒分類的發(fā)展歷程1937年：Levadifi&Leptin根據(jù)病毒對組織的親和性進(jìn)行分類；1948年：Holmes提出根據(jù)病毒感染引起的癥狀來分類；1950年：國際微生物學(xué)會提出分類的八項原則；1953年：Andremes提出按病毒的理化特性來分；1963年：國際微生物命名委員會病毒學(xué)分會提出新的八項分類原則；1966年成立國際病毒命名委員會（internationalcommitteeonnomenclatureofvirus,ICNV）；1971年發(fā)表第一份報告：500多種病毒分成43個病毒屬（組）；1973年更名為國際病毒分類委員會（internationalcommitteeontaxonomyofvirus,ICTV）；最新的病毒分類報告：第六次報告（1995年）現(xiàn)在已知的病毒有3600多種，它們分別屬于71個病毒科;其中動物病毒（包括脊椎動物病毒和無椎脊動物病毒）有2000余種，分屬27個病毒科;（二）分類依據(jù)1．病毒的形態(tài)學(xué)特征病毒粒子的大小和形狀；有無表面纖突和纖突的特征；有無囊膜；衣殼對稱型和結(jié)構(gòu)；2．理化學(xué)特性病毒粒子的分子量、浮密度、沉降系數(shù)；對酸堿的穩(wěn)定性；對熱的穩(wěn)定性；對兩價陽離子的穩(wěn)定性；對去污劑的穩(wěn)定性；對脂溶劑的穩(wěn)定性；對輻射的穩(wěn)定性。3．基因組核酸類型：DNA或RNA基因組大?。痪€狀還是環(huán)狀；單股還是雙股是整個的還是分節(jié)段的，節(jié)段的大小和數(shù)目4.基因組的復(fù)制策略、開放閱讀框架的數(shù)目和位置、轉(zhuǎn)錄特征、翻譯特征、翻譯后加工特征。

5．蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)蛋白的數(shù)目、大小和功能活性，非結(jié)構(gòu)蛋白的數(shù)目、大小和功能活性，蛋白質(zhì)的特殊功能活性（轉(zhuǎn)錄酶、反轉(zhuǎn)錄酶、血凝素、神經(jīng)氨酸酶）6．脂質(zhì)、糖類含量和特性

7．在細(xì)胞培養(yǎng)中的生長特性對細(xì)胞種類的特異性；病毒蛋白的聚集場所；病毒粒子的裝配場所；病毒粒子成熟和釋放的部位和性質(zhì)。8．抗原性與其他相關(guān)病毒的血清學(xué)關(guān)系9．生物學(xué)特性自然宿主范圍、傳播方式、傳播介體，地理分布、致病性及與疾病的關(guān)系；組織嗜性和組織病理學(xué)。二．病毒的命名規(guī)則（一）一般規(guī)則：1．病毒的分類和命名應(yīng)是國際性的，應(yīng)普遍適用于所有病毒;2.通用的病毒分類系統(tǒng)采用目、科、亞科、屬和種的等級制度，在種的命名尚不完善的情況下，許多病毒可用國際通用的俗名。3．ICTV不統(tǒng)一規(guī)定病毒種以下的分類和命名。關(guān)于血清型、基因型、病毒株、變異株等的命名由公認(rèn)的國際專家組決定。4．對人工產(chǎn)生的病毒和實驗室雜交株不予分類考慮，這些病毒的命名也同樣由公認(rèn)的國際專家組決定。5．當(dāng)代表成員病毒經(jīng)過充分鑒定并在發(fā)表的文獻(xiàn)上描述后，才能建立一個類，以便與相似的類區(qū)別。同樣，命名一個病毒時，該病毒必須經(jīng)過充分鑒定并在文獻(xiàn)上發(fā)表以明確區(qū)別于相似的病毒（二）關(guān)于類和病毒的命名原則6．現(xiàn)有的類和病毒的名稱無論是否適用均應(yīng)予保留。7．在類和病毒的命名中不遵守優(yōu)先率。8．不使用人名。9．類和病毒的名稱應(yīng)便于使用，容易記憶，最好使用聽起來悅耳的名稱。10．不使用上標(biāo)、下標(biāo)、連字符、斜杠和希臘字母。11．新名稱不應(yīng)與已通過的名稱有重復(fù)，應(yīng)選用與正在使用的或過去使用的名稱不相近的名稱。12．如果縮拼詞對病毒學(xué)家有意義，且得到公認(rèn)的國際專家組的推薦，可以接受作為類的名稱。關(guān)于類和病毒的命名原則13．由一個類或病毒的名稱所隱含的任何意義都會因在名稱中涉及不是所有成員或潛在成員所具有的特征，以及不是均等地適用于不同類的特征而排斥該類中的合適成員病毒，這種情況應(yīng)當(dāng)避免。

14．新名的選用應(yīng)考慮國家或民族敏感性問題。應(yīng)采用那些被病毒學(xué)家在科學(xué)雜志上發(fā)表的工作中常用的名稱及衍生名稱作為命名的基礎(chǔ)，此時可不必考慮國家來源；在有一個以上的候選名稱時，相應(yīng)的研究組或分委員會向ICTV執(zhí)行委員會提出建議，由執(zhí)行委員會決定取哪一個名稱。15．新的名稱和名稱的變更應(yīng)以分類建議格式提交ICTV。16．病毒種是組成一個復(fù)制系并占有一個特定生態(tài)環(huán)境的一類多原則病毒。17．種名應(yīng)由少而實用的字組成18．種名，通常與株名一起，必須表示明確的特征，不涉及屬名或科名。19．已經(jīng)廣泛應(yīng)用的數(shù)字、字母及其組合可用作種名性質(zhì)形容詞。但新提出的連續(xù)數(shù)字、字母或其組合不單獨(dú)接受作為種名性質(zhì)形容詞。20．ICTV通過新提議的種、種名和型名的程序分兩步：首先，給予暫時性通過，這樣的建議將發(fā)表在ICTV報告中；然后，經(jīng)過三年的等候期，如果不撤銷或修正，該建議將得到最后通過。（三）關(guān)于屬的規(guī)則21．屬是一組具有某些共同特性的種。22．屬名應(yīng)是一個以“Virus”結(jié)尾的單詞。23．通過一個屬名的同時需通過一個代表種。瘟病毒屬：Pestivirus冠狀病毒屬：Coronavirus（四）關(guān)于亞科的規(guī)則24．亞科是一組具有某些共同特性的屬。只有當(dāng)需要處理復(fù)雜等級結(jié)構(gòu)問題時才使用亞科。25．亞科名應(yīng)是一個以“Virinae”結(jié)尾的單詞。

E.g.Retrovirinae：反轉(zhuǎn)錄病毒亞科Spumavirinae：泡沫病毒亞科（五）關(guān)于科的規(guī)則

26．科是一組具有某些共同特性的屬（不管這些屬是否組成了亞科）。27．科名應(yīng)是一個以“Viridae”結(jié)尾的單詞。28．通過一個科名的同時需通過一個屬名。皰疹病毒科：Herpesviridae腺病毒科：Adenoviridae（六）關(guān)于目的規(guī)則

29．目是一組具有某些共同特性的科。30．目名應(yīng)是一個以“Virales”結(jié)尾的單詞。動物病毒的命名現(xiàn)狀：1、種的命名1）大多用其所引起疾病的名稱，后加“病毒”兩字

脊髓灰質(zhì)炎病毒、豬瘟病毒、流感病毒2）在病名前加上最初發(fā)現(xiàn)該病毒的地名日本乙型腦炎病毒、東方型馬腦炎病毒3）直接用地名稱呼病毒新城疫病毒（Newcastlediseasevirus)4）用人名稱呼馬立克氏病病毒(Marek’sdiseasevirus)2、科、屬的命名1）依據(jù)病毒粒子的形態(tài)和理化學(xué)特性小RNA病毒科、反轉(zhuǎn)錄病毒科、輪狀病毒屬2）依據(jù)病毒所引起的病變的性質(zhì)皰疹病毒科、痘病毒科3）以病毒酶作用的基質(zhì)正粘病毒科、副粘病毒科4）以病毒的最初分離部位腺病毒科5）感染宿主的部位鼻病毒屬、腸道病毒屬6）以幾個屬的縮拼詞作為科名乳多空病毒科流感病毒的命名方法1.國際上通用的流感病毒命名方法型別/分離地點(diǎn)/分離序號/分離時間（年代）（血凝素和神經(jīng)氨酸酶序號）

e.gA/Hongkong/1/68（H3N2）A/京科/1/56（H1N1）H：hemagglutinin

血凝素N：neuraminidase

神經(jīng)氨酸酶流感病毒的命名方法2.動物流感病毒的命名則在型別與分離地點(diǎn)之間加上動物宿主名稱

e.g甲/馬/布拉格/1/56（H1N1）