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文檔簡介
IncRNA的基本知識點lncRNA是長鏈非編碼RNA(Longnon-codingRNA)的簡稱,其長度大于200個核苷酸,在表觀遺傳調控、細胞周期調控和細胞分化調控等眾多生命活動中發(fā)揮重要作用,已經(jīng)成為了當今遺傳學研究的熱點,同時也是發(fā)文利器。IncRNA的研究背景在近十余年的生命科學研究中非編碼調控RNA可謂是研究最火的領域之一。RNA不僅承擔遺傳信息中間載體的輔助性角色,而更多地承擔了各種調控功能。IncRNA在發(fā)育和基因表達中發(fā)揮的復雜精確的調控功能極大地解釋了基因組復雜性之難題,同時也為人們從基因表達調控網(wǎng)絡的維度來認識生命體的復雜性開啟新的天地。lncRNA起初被認為是基因組轉錄的“噪音”,是RNA聚合酶II轉錄的副產(chǎn)物,不具有生物學功能。然而,隨著研究的深入,研究者發(fā)現(xiàn)lncRNA參與了染色體沉默、基因組印記以及染色質修飾、轉錄激活、轉錄干擾、核內運輸?shù)榷喾N重要的調控過程。IncRNA的特征及分類lncRNA是一類長度>200bp的非編碼RNA,根據(jù)lncRNA與編碼序列的位置關系可分為intergeniclncRNA,introniclncRNA,anti-senselncRNA,senselncRNA,bidirectionallncRNA等類型。門tergenic[|lncRNA主要有以下特征:1.lncRNA通常較長,具有mRNA樣結構,經(jīng)過剪接,具有polyA尾巴與啟動子結構,分化過程中有動態(tài)的表達與不同的剪接方
式;lncRNA啟動子同樣可以結合轉錄因子,局部染色質組蛋白同樣具有特征性的修飾方式與結構特征;大多數(shù)的lncRNA在組織分化發(fā)育過程中,呈現(xiàn)動態(tài)的表達變化,具有明顯的時空表達特異性。IncRNA的作用機制編碼蛋白的基因上游啟動子區(qū)(橙色)轉錄,干擾下游基因(藍色)的表達;抑制RNA聚合酶II或者介導染色質重構以及組蛋白修飾,影響下游基因(藍色)的表達;與編碼蛋白基因的轉錄本形成互補雙鏈(紫色),干擾mRNA的剪切,形成不同的剪切形式;與編碼蛋白基因的轉錄本形成互補雙鏈(紫色),在Dicer酶的作用下產(chǎn)生內源性siRNA;與特定蛋白質結合,lncRNA轉錄本(綠色)可調節(jié)相應蛋白的活性;作為結構組分與蛋白質形成核酸蛋白質復合體;結合到特定蛋白質上,改變該蛋白質的細胞定位;作為小分子RNA(如miRNA、piRNA)的前體分子。9.7uAlt^rprti-t^inlocalization8.SmallRNAPrecursorI.TVfanscriptionalinterference2.Inducechrcimatin
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proteinactivityIncRNA的應用領域由于lncRNA主要從三個層面實現(xiàn)對基因表達的調控:表觀遺傳學調控、轉錄調控以及轉錄后調控。因此,lncRNA在生物體生長發(fā)育的各個過程都起著重要的作用。在實際研究中,在人類疾病機制(癌癥、腫瘤等)、植物抗逆脅迫、昆蟲生長發(fā)育等研究中都能找出lncRNA的身影。也就是說,無論什么樣的實驗設計,都可以通過lncRNA來尋找其內在的轉錄調控機制。研究IncRNA就要研究其功能,lncRNA功能主要通過cis或trans方式作用于蛋白編碼靶基因來實現(xiàn),也就是說研究lncRNA的功能就是研究其靶基因的功能。目前來說,lncRNA的研究主要是基于測序手段進行的。通過測序數(shù)據(jù)進行l(wèi)ncRNA的鑒定與靶基因的預測,從而進一步結合實驗設計來研究lncRNA的作用機制。以上
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