【生物醫(yī)學研究性學習課題研究2100字】

生物醫(yī)學研究性學習課題報告目錄TOC\o"1-2"\h\u26353生物醫(yī)學研究性學習課題報告 131338摘要 1266400引言 1310091實驗 23381.1材料與試劑 267201.2實驗儀器 2204541.3實驗方法 2119912結果與討論 2201683結論 3摘要快速和準確的分子診斷是控制傳染病和疫情的一個關鍵工具。隨著新型冠狀病毒（SARS-CoV-2）引起的肺炎患者的迅速增加和疫情的蔓延，SARS-CoV-2基因組測序和核酸檢測的診斷試劑和方法已被報道，全基因組深度測序和RT-PCR是目前檢測SARS-CoV-2的重要方法。然而，冠狀病毒（COVID-19）肺炎核酸檢測陰性而影像學檢查陽性的新病例越來越多，因此提高分子核酸診斷的效率和靈敏度勢在必行。關鍵詞：新型冠狀病毒；序列變異；比較基因組0引言2019年12月感染新型冠狀病毒肺炎病毒（COVID-19）在全球范圍內構成重大公共衛(wèi)生威脅，COVID-19屬于《中華人民共和國傳染病防治法》規(guī)定的乙類傳染病，按甲類傳染病管理。感染源主要是SARS-CoV-2感染者，但無癥狀攜帶者也是一個感染源。臨床數據顯示，SARSCoV-2感染的危重病人主要出現(xiàn)在老年人、糖尿病患者、高血壓患者和其他基礎疾病人群中，但也有家族性的密切接觸感染的情況[[]白靜.新冠病毒變異株的特點和防控[J].中國科技產業(yè),2021(9):22-23.]。COVID-19的流行病學特點是普通人群普遍易感，潛伏期為1-14天，大部分為3-7天。主要的臨床癥狀是發(fā)熱、乏力和干咳，危重病人與SARS感染者相似，表現(xiàn)為急性呼吸窘迫綜合征、膿毒性休克和DIC[[]白靜.新冠病毒變異株的特點和防控[J].中國科技產業(yè),2021(9):22-23.[]徐莉,郭勝楠,郭占東,等.國外新型冠狀病毒變異株疫苗研發(fā)與評價技術要求的比較與分析[J].中國生物制品學雜志,2021,34(9):5.1實驗1.1材料與試劑新冠病毒基因重組蛋白S-RBD；標記用S-RBD蛋白；過氧化物酶新冠病毒中和抗體檢測試劑盒(ELISA)；檢測系統(tǒng)SM-3型全自動酶標儀1.2實驗儀器快檢儀器和采樣管1.3實驗方法在這個研究組中使用了一種控制方法。根據分析，SARS-CoV-2與SARS和蝙蝠冠狀病毒關系最密切。SARS與蝙蝠冠狀病毒和SARS有共同的祖先序列，全基因組序列有顯著的相似性。發(fā)現(xiàn)SARS-CoV-2基因組與蝙蝠冠狀病毒全序列的同源性為87.99%，SARS-CoV-2基因組與SARS基因組全序列的同源性為79.5%。2結果與討論NCBI已經公布了SARS-CoV-2的全基因組序列，其長度為29.9kb?；蚪M結構和注釋顯示，SARS-CoV-2有11個功能基因，其中3個與SARS同源，7個與蝙蝠冠狀病毒同源，一個功能不明。在基因組中發(fā)現(xiàn)了22個單核苷酸多態(tài)性（SNP）位點。在SARS-CoV-2基因組中發(fā)現(xiàn)的22個SNP位點中，17個SNP位點位于編碼區(qū)，5個SNP位點位于非編碼區(qū)。出現(xiàn)了這些多態(tài)SNP位點的基因組坐標和堿基變化以及SARS-CoV-2的ORF3a和ORF8基因的蛋白質序列變異；全基因組中沒有發(fā)現(xiàn)STR基因變異序列。基于SARS-CoV-2的標準參考序列，全基因組的序列比對顯示兩個菌株有序列缺失。第一個在序列的開頭有15個堿基的刪除，第二個在序列的結尾有11個堿基的刪除。根據SARS-CoV-2的復制過程，目前有定量PCR、多重PCR、反轉錄等病毒檢測技術或方法，主要是針對單鏈RNA、抗體和病毒陽性鏈。許多實驗室和公司已經根據這些原則開發(fā)了SARS-CoV-2診斷試劑[[]任勝勇,王興偉,趙霞飛,等.德爾塔新冠病毒變異株的特點及防控對策[J].中華危重病急救醫(yī)學,2021,33(9):4.[]任勝勇,王興偉,趙霞飛,等.德爾塔新冠病毒變異株的特點及防控對策[J].中華危重病急救醫(yī)學,2021,33(9):4.研究病毒RNA序列的多態(tài)性的目的是根據全基因組序列，包括病毒基因組序列設計引物對。本研究的目的是從含有RNA基因組序列變體的全基因組序列中設計引物對，以本研究的目的是從含有RNA基因組序列變體的全基因組序列中設計引物對，以識別包括SARS-CoV-2、SARS-CoV和MERS-CoV的病毒[[]張珂,沈潔綜述,胡麗華審校.新型冠狀病毒變異株對新型冠狀病毒疾病診治及防疫的影響分析[J].外科研究與新技術,2021,10(3):6.]。引物對被設計成包括RNA基因組序列變體，包括SARS-CoV-2、SARS-CoV和MERS-CoV。第三代納米孔測序技術可以直接捕獲RNA并檢測SARS-CoV-2的基因組變異，無需RNAi，無需反轉錄和RNA擴增，可以直接檢測病毒RNA中的SNPs?？梢灾苯訖z測病毒RNA中的SNP位點，而無需逆轉錄和RNA擴增。因此，通過提高COVID-19患者樣本中RNA亞型的可行性，可以為基于亞型的病毒鑒定和毒力分析建立一個基礎[[]張珂,沈潔綜述,胡麗華審校.新型冠狀病毒變異株對新型冠狀病毒疾病診治及防疫的影響分析[J].外科研究與新技術,2021,10(3):6.[]李忠東.面對新冠病毒變異株,我們該怎么辦[J].生命與災害,2021(2):4.3結論SARS-CoV-2已經在全基因組測序和臨床驗證的基礎上進行了大量的研究，但仍然缺乏準確快速的檢測技術和針對SARS-CoV-2的針對性抗病毒藥物和預防性疫苗。隨著環(huán)境的變化，人類居住區(qū)出現(xiàn)了越來越多的動物病原體庫，2011年至2018年，世界衛(wèi)生組織在172個國家監(jiān)測了1483起傳染病的爆發(fā)，不可預測的新疾病在SP出現(xiàn)的可能性仍然存在。因此，從遺傳學、基因組學、病毒學和進化生物學的角度理解SARS-CoV-2，追蹤病毒傳播的源頭，并根據病毒的基因組變異信息理解新冠狀病毒在動物、人類和環(huán)境中的傳播，為源頭控制和疫情預警提供最有力的證據。通過結合病毒的進化機制、致病基因變異、臨床表型、醫(yī)學影像學和分子病理學，可以統(tǒng)一COVID-19患者的基因型和臨床表型，基于SARS-CoV-2毒株臨床表型的亞型和診斷標準，對指導傳染病的有效預防和治療有很大的價值。參考文獻[1]白靜.新冠病毒變異株的特點和防控[J].中國科技產業(yè),2021(9):22-23.[2]徐莉,郭勝楠,郭占東,等.國外新型冠狀病毒變異株疫苗研發(fā)與評價技術要求的比較與分析[J].中國生物制品學雜志,2021,34(9):5.[3]任勝勇,王興偉,趙霞飛,等.德爾塔新冠病毒變異株的特點及防控對策[J].中華危重病急救醫(yī)學,2021,33(9):4.[4]張珂,沈潔綜述,胡麗華審校.新型冠狀病毒變異株對新型冠狀病毒疾病診治及防疫的影響分析[J].外科研究與新技術,2021,10(3):6.