浙江大學生物化學與分子生物學筆記8-蛋白質結構與功能-PPT幻燈片

蛋白質結構與功能研究方法X-Ray衍射NMR(核磁共振)MolecularModelingMutation/Function(分子生物學)結晶困難分子量不能太大理論不太完善費時費力蛋白質結構與功能研究方法1、免疫體系中分子間的識別機制2、DNA與蛋白質的相互作用3、蛋白水解酶與疾病4、膜蛋白、受體與信號轉導5、酶抑制劑與藥物開發(fā)本章主要內(nèi)容1.免疫體系分子的相互識別1免疫體系分子的相互識別兩種T細胞上的MHC分子是特異性識別的關鍵兩種不同的MHC分子TCR識別抗原TCR如何識別抗原MHC1分子的結構容納抗原的口袋MHCI分子結構2.蛋白質與DNA的相互作用Helix-Turn-HelixHelix-Loop-HelixZinc-fingerLeucinezipper非特異性:特異性:Histones2蛋白質與DNA的相互作用核小體上DNA與組蛋白的接觸點核小體的組蛋白與DNA核小體上的DNA堿基組成分布核小體的DNA堿基組成分布蛋白質與DNA的相互作用Helix-turn-helix，HTHHelix-turn-helixHTH的分子識別機制HTH的分子識別機制HLH結構特征HLH的結構特征Leucine-zipper的結構特征Lwucine-zipper結構特征Alphahelix截面圖上Ca的位置LeucineZipper蛋白的剪刀型結合模式LeucineZipper蛋白與DNA的結合模式Zinc-finger蛋白結構特征Zinc-finger蛋白結構特征研究蛋白在DNA上的結合位點的FootPrintingFoot-Printing3.蛋白水解酶與人體疾病Cardiovasculardieseases心血管疾病HemophiliaA/B血友病Programmedcelldeath/appotosis細胞凋亡Alzheimerdisease癡呆Cancermetastasis癌細胞轉移Pulmonaryemphysema/pancreatitis/arthritisParasitedisease:malaria/Tcruzain瘧疾InfluenzaA&AIDS甲型流感與愛滋病3蛋白水解酶與人體疾病血栓形成與消除血栓形成與消失LifeCycleofInfluenzaAvirus甲型流感病毒生活史A型流感病毒的H抗原蛋白的結構域受蛋白水解酶活化后才有感染細胞的能力H抗原蛋白的結構域AIDS病毒生活史有個必須的ProteaseAIDS病毒生活史癌細胞的轉移需要蛋白水解酶的幫助癌細胞的轉移4.膜蛋白、受體與信號轉導4膜蛋白_受體與信號轉導白介素-6的信號轉導IL-6的信號轉導FGF的信號轉導幾條信號轉導途徑5.酶抑制劑與藥物開發(fā)5酶抑制劑與藥物開發(fā)真正意義上的抗流感病毒藥物ZanamivirSialicacidGS4104真正意義上的抗流感病毒藥物金剛烷(Amantadine)的結構作用于MatrixProtein2(M2)蛋白Amantadine結構作用于DNA聚合酶的抗病毒藥物病毒DNA聚合酶的抑制劑，真核生物的DNA聚合酶不敏感抗病毒藥物抗AIDS病毒

的藥物（I）抗AIDS藥物I核苷類抗AIDS藥物作用原理核苷類藥物作用原理HIVprotease

HIVprotease作用于AIDS病毒專有的蛋白水解酶抗AIDS病毒的藥物（II）Viracept(Nelfinavir,Agouron,1998)Crivivian(Indinavir,Merck,1997)Invirase(Sequinavir,Roche,1995)Norvir(Ritonavir,Abbot,1997)抗AIDS藥物II抗病毒感染藥物的開發(fā)抗病毒感染抗癌藥物的研究動態(tài)MMPinhibitorcdk2/cdk4inhibitorPoly(ADP-ribose)polymerase(PARP)inhibitorGlycinamideRibonucleotideformyltransferase(GRFT)inhibitorVDGFreceptorblocker等等，等等抗癌藥物研究動態(tài)6.新方向與新技術1、Proteomics2、Proteinchips3、Display/molecularevolutionengineering4、Two-hybridsystem5、Geneknockoutmice

新研究方法與技術WhatisProteomics?Proteomics什么是生物芯片技術？以微點陣排列技術（MicroarrayTechnology）將生物大分子固定到適當?shù)墓腆w載體上，方便各種生化和分子生物學的操作。生物芯片技術蛋白質芯片篩選新藥的原理受體、酶的微點陣與中草藥抽提物反應后再與受熒光標記的配體或底物結合以激光進行檢測不出現(xiàn)熒光的點表明中草藥樣品中含有與這些點上的蛋白質相互作用的物質，因此是作用于這些位點的新藥候補熒