pubmed檢索策略解讀課件

網(wǎng)絡(luò)醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫

PubMed6/4/20231復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室PubMed——NCBI網(wǎng)站簡介

1988年，美國的參議員ClaudePepper發(fā)起，

1988年11月4日通過立法建立國立生物技術(shù)信息中心（NCBI）NCBI的任務(wù):

建立基于計算機信息處理的分子生物學(xué)、生物化學(xué)、遺傳學(xué)知識的自動存儲和分析系統(tǒng)，并進(jìn)行先進(jìn)方法的研究。促進(jìn)生物技術(shù)研究者和醫(yī)藥治療人員對數(shù)據(jù)庫和軟件的使用。促進(jìn)全世界范圍內(nèi)生物技術(shù)信息收集的合作6/4/20232復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室NCBI主頁6/4/20233復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室NCBI生物信息整合系統(tǒng)

Alldatabase檢索大分子生物學(xué)數(shù)據(jù)獲取GenBank,EMBL等數(shù)據(jù)庫的核酸序列；獲取Swiss-port,PIR,PRF,PDB等蛋白質(zhì)序列；從核酸序列翻譯到蛋白質(zhì)的序列；獲取基因和染色體圖譜；蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)及大分子模式（MMDB）等其他生物信息數(shù)據(jù)庫檢索。PubMed書目文獻(xiàn)數(shù)據(jù)。6/4/20234復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室PubMed特點：

1.免費提供題錄和文摘

2.提供與原文的網(wǎng)址鏈接(部分免費獲?。?/p>

3.提供檢索詞自動轉(zhuǎn)換匹配

4.操作簡便、快捷6/4/20235復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室PubMed主要收錄MDENLINE：為美國國立醫(yī)學(xué)圖書館創(chuàng)建的醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫收錄內(nèi)容：MEDLINE主要收錄生物醫(yī)學(xué)和健康科學(xué)以及生命科學(xué)相關(guān)領(lǐng)域的文獻(xiàn)，包括行為科學(xué)、健康專業(yè)所需要的化學(xué)、生物工藝學(xué)，基礎(chǔ)研究和臨床護理、公共衛(wèi)生、衛(wèi)生政策發(fā)展或者相關(guān)教育活動的內(nèi)容。2000年起增加收錄對生物醫(yī)學(xué)的實習(xí)者、研究員和教育家至關(guān)重要的專業(yè)內(nèi)容，包括生物、環(huán)境科學(xué)、海洋生物、植物和動物學(xué)、生物物理學(xué)和生物化學(xué)等生命科學(xué)方面的研究內(nèi)容。6/4/20236復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室PubMed

主要收錄

MEDLINE數(shù)據(jù)：文獻(xiàn)來源：MEDLINE數(shù)據(jù)來源于全世界70多個國家和地區(qū)的近5000種生物醫(yī)學(xué)期刊，這些期刊大都經(jīng)美國衛(wèi)生健康研究院的文獻(xiàn)選擇技術(shù)評估委員會LiteratureSelectionTechnicalReviewCommittee(LSTRC)評估挑選,以及美國國立醫(yī)學(xué)圖書館和數(shù)據(jù)協(xié)作采集專家（各專業(yè)協(xié)會）推薦。近年數(shù)據(jù)涉及37種語種，回溯至1950年的數(shù)據(jù)涉及60種語種。數(shù)據(jù)庫47%為美國本土出版的文獻(xiàn)，90%為英文文獻(xiàn)，79%的文獻(xiàn)有著者撰寫的英文文摘，（以上數(shù)據(jù)根據(jù)2007年11月數(shù)據(jù)庫提供）。MDENLINE數(shù)據(jù)題錄標(biāo)有[PubMed-indexedforMDENLINE]6/4/20237復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室PubMed主要收錄

Inprocess數(shù)據(jù):1996年8月開始，PubMed每天收錄由MDENLINE的期刊出版商提供的尚未經(jīng)規(guī)范處理的數(shù)據(jù)，該庫中的記錄只有簡單的書目信息和文摘。該庫中的數(shù)據(jù)每周一次轉(zhuǎn)入MDENLINE。當(dāng)進(jìn)入MDENLINE時就會被標(biāo)引MeSH（數(shù)據(jù)庫規(guī)范控制詞表詳見MeSHDatabase內(nèi)容）詞、文獻(xiàn)類型及其它數(shù)據(jù)。記錄有[PubMed-inprocess]的標(biāo)記。6/4/20238復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室PubMed主要收錄OldMDENLINE1950-1965年間的MEDLINE文檔，收錄發(fā)表的200多萬篇文獻(xiàn)，沒有MeSH字段和摘要，每條記錄標(biāo)有[PubMed-OLDMDENLINEforPre1966]PubMednotMDENLINE是PubMed

收錄MDENLINE不收錄的文檔。每條記錄標(biāo)有[PubMed]。6/4/20239復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室基本檢索輸入框特征欄提供輔助檢索功能側(cè)欄提供其他檢索如期刊數(shù)據(jù)庫檢索、規(guī)范詞數(shù)據(jù)庫檢索、特定文獻(xiàn)檢索執(zhí)行檢索PubMed主頁6/4/202310復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室在檢索欄中輸入:一個或多個檢索詞(系統(tǒng)默認(rèn)空格為AND檢索）

如：placentagrowthoxygengenbacevo著者姓名,姓在前,名首字母在后。 如:smithab[au]刊名輸全稱或MEDLINE認(rèn)可的標(biāo)準(zhǔn)縮寫形式 如：clinexpimmunol[so]布爾邏輯運算式：(運算符須大寫） 如：Stem[ti]ANDneuroscience二.PubMed

基本檢索規(guī)則6/4/202311復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室多個檢索詞輸入MooreAM撰寫的有關(guān)接觸性皮炎的文章6/4/202312復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室刊名的輸入（字段限定來源出SO）6/4/202313復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室著者檢索mooream[au]6/4/202314復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室檢索提問輸入僅檢索有文摘的文獻(xiàn)6/4/202315復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室截詞檢索：treat*強迫短語檢索：“brca1”（不再自動轉(zhuǎn)換匹配和擴展檢索）二.PubMed

基本檢索規(guī)則6/4/202316復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室自動擴展檢索系統(tǒng)自動對主題詞、副主題詞進(jìn)行擴展檢索，如：輸入“hypertensiontherapy,系統(tǒng)自動將高血壓的藥物治療、飲食療法，二.PubMed

基本檢索規(guī)則6/4/202317復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室PubMed記錄字段說明文摘第一著者單位地址出版商提供文獻(xiàn)識別號著者群版權(quán)說明參考評論文獻(xiàn)合著者文獻(xiàn)參考評論定稿版校樣版輸入日期輸入完成日期電子出版日期6/4/202318復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室電子出版日期文獻(xiàn)出版日期數(shù)據(jù)加入PubMed日期文獻(xiàn)勘誤參考文獻(xiàn)勘誤全部著者姓名全部調(diào)研者姓名作為文章主題的著者全稱文獻(xiàn)相關(guān)注釋基金編號基因符號期編號資助調(diào)研者資助調(diào)研單位國際標(biāo)準(zhǔn)期刊號美國立醫(yī)學(xué)圖書館識別號期刊全稱6/4/202319復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室最后修訂日期規(guī)范詞表詞規(guī)范詞確立日期系統(tǒng)組織的文摘版權(quán)擁有者題錄提供機構(gòu)的識別號病史相關(guān)與原始記錄其他關(guān)鍵詞提供其他關(guān)鍵詞的機構(gòu)數(shù)據(jù)提供者機構(gòu)文章總頁數(shù)出版商提供數(shù)據(jù)時間期刊出版國數(shù)據(jù)庫文獻(xiàn)編號6/4/202320復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室作為主題詞的個人姓名出版狀態(tài)文獻(xiàn)類型出版模式（紙張或電子）參考文獻(xiàn)數(shù)已撤回的文獻(xiàn)酶或化學(xué)物質(zhì)代碼正在撤消中的文章初版文獻(xiàn)修訂和再版的文章子專題文檔太空署提供的數(shù)據(jù)二次文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫以及文章討論的分子序列訪問號原文來源引用了病例的文獻(xiàn)內(nèi)部處理代碼標(biāo)準(zhǔn)期刊縮寫文獻(xiàn)標(biāo)題翻譯標(biāo)題更新文獻(xiàn)文獻(xiàn)正在更新期刊卷號6/4/202321復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室三.PubMed的輔助檢索Limits（檢索限制選擇）字段限制：著者、刊名、篇名、濾過（filter原文收藏處）等數(shù)據(jù)輸入時間：默認(rèn)檢索可回溯到1950年，限制選擇30天-10年7種文獻(xiàn)類型限制7種語種限制12種子文檔：(01年新增2種SpaceLifeSciencesandBioethics）6/4/202322復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室作者限定添加作者姓名輸入框清除限定期刊限定作者姓名索引選詞多作者邏輯匹配選項全文、免費全文、摘要限定日期限定6/4/202323復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室出版日期限定入庫日期限定研究對象人/動物限定研究對象性別限定語種限定子文檔限定文獻(xiàn)類型限定研究對象年齡限定6/4/202324復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室檢索字段限定執(zhí)行檢索清除所有限定6/4/202325復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室Previw/index（檢索策略預(yù)覽）瀏覽檢索式改變檢索式（可用檢索式編號#1OR#2）瀏覽索引（index）6/4/202326復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室檢索預(yù)覽檢索歷史索引加詞檢索6/4/202327復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室

檢索式回顧編輯檢索式如#3ANDchildHistory（檢索史）6/4/202328復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室檢索歷史回顧檢索式檢索時間檢出篇數(shù)檢索式編號可替代檢索式進(jìn)行輸入檢索如：#5AND#66/4/202329復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室Details（匹配過程）顯示檢索詞轉(zhuǎn)換匹配運算詳細(xì)過程用途：轉(zhuǎn)換、確定規(guī)范詞如：livercancer

liverneoplasms修改檢索策略6/4/202330復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室檢索明細(xì)數(shù)據(jù)庫匹配過程檢索詞轉(zhuǎn)換顯示用戶輸入的檢索式6/4/202331復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室修改檢索策略檢索框中隨時修改“Limit”、“Preview/index”、“History”、“Details”功能實現(xiàn)。6/4/202332復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室四.其他檢索1.MeshDatabase功能：確定規(guī)范檢索詞查看詞義注釋、樹狀結(jié)構(gòu)表副主題詞、擴展、主要主題詞例：欲查2002-2008年腎衰竭（renalfailure）飲食療法(diettherapy)療效觀察(treatmentoutcome)的相關(guān)文獻(xiàn)？6/4/202333復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室PubMed基本檢索

植物生長素相關(guān)文獻(xiàn)plant*[TI]ANDgrow*[TI]ANDfactor*[TI]6/4/202334復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室PubMed基本查找植物生長素結(jié)果6/4/202335復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室MeSH查找植物生長素相關(guān)文獻(xiàn)6/4/202336復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室6/4/202337復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室MeSH

查找植物生長素結(jié)果6/4/202338復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室詳細(xì)結(jié)果6/4/202339復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室檢索分析一般檢索邏輯關(guān)系粗淺、修飾概念匹配不特定、檢索詞涵蓋不全面規(guī)范檢索邏輯關(guān)系緊密、修飾概念匹配特定、下位詞檢索全面6/4/202340復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室基本檢索腎衰竭的飲食療法6/4/202341復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室結(jié)果中有些主要內(nèi)容并非腎衰竭6/4/202342復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室MeSHDatabase規(guī)范主題詞數(shù)據(jù)庫檢索腎衰竭飲食療法課題1.輸入檢索詞3.點按規(guī)范詞可獲詳細(xì)注解2.執(zhí)行瀏覽6/4/202343復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室主題詞注釋可選副主題詞限定作為主要主題詞匹配不進(jìn)行下位詞擴檢6/4/202344復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室該主題詞所替代的非規(guī)范詞形式主題詞樹形結(jié)構(gòu)表：顯示該詞的學(xué)科隸屬關(guān)系6/4/202345復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室通過MeSHDatabase檢索的結(jié)果，其中41篇綜述文獻(xiàn)檢出結(jié)果更為專指6/4/202346復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室進(jìn)一步檢索腎衰竭綜合療效觀察（treatmentoutcome）6/4/202347復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室2.期刊數(shù)據(jù)庫

（Journaldatabase）:通過輸入刊名、縮寫名、等瀏覽期刊文獻(xiàn)。提供電子原文的超鏈鍵。6/4/202348復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室期刊數(shù)據(jù)庫檢索6/4/202349復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室輸入待檢期刊名得出期刊詳細(xì)信息6/4/202350復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室3.臨床警示（ClinicalAlert）1991年開始，NIH美國衛(wèi)生健康研究所不定期公布能引起死亡率和致病率升高的臨床試驗項目重要新聞稿。6/4/202351復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室五.檢索結(jié)果輸出顯示檢索結(jié)果保存檢索結(jié)果保存檢索策略打印檢索結(jié)果6/4/202352復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室顯示字段選擇（Display)Abstractreport:來源期刊、標(biāo)題、著者、著者地址、記錄性質(zhì)、文獻(xiàn)類型、勘誤、評論、PMID或UI、摘要。CitationReport:顯示除上述內(nèi)容外，加MeSH敘詞、化學(xué)物質(zhì)名稱、資助項目號等字段。MEDLINEReport:(最完整，有標(biāo)識符）6/4/202353復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室顯示格式選擇6/4/202354復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室顯示記錄選擇單一記錄：著者姓名所有記錄：選display旁的格式，及每頁顯示記錄數(shù)選定記錄:方框內(nèi)打鉤6/4/202355復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室可獲電子全文的鏈接6/4/202356復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室輸出格式選擇（sendto）選中題錄（或文摘）后Text當(dāng)前網(wǎng)頁文本格式，用瀏覽器文件保存File所有記錄純文本格式保存，用對話框保存Clipboad

剪貼板，暫存需下載記錄，多項檢索后一起保存。最多允許存儲500條，保留8小時。Email:通過郵件發(fā)送RSSFeed：檢索結(jié)果的RSS訂閱，通過安裝網(wǎng)絡(luò)聚合器可接收最新檢索結(jié)果，不必再次檢索。Other：全文傳遞服務(wù)等申請，需帳號、收費new6/4/202357復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室6/4/202358復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室保存檢索策略Details中的URL，可以讓檢索匹配的詳