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文檔簡介
關(guān)于生物催化劑的修飾與改造第1頁,課件共47頁,創(chuàng)作于2023年2月
第一節(jié)酶化學(xué)修飾及修飾目的一、酶化學(xué)修飾
1.限制酶大規(guī)模應(yīng)用的原因:
1)細胞外穩(wěn)定性差;
2)酶活性不夠高;
3)具有抗原性。
第2頁,課件共47頁,創(chuàng)作于2023年2月2.改變酶特性有兩種主要的方法:
1)通過分子修飾的方法來改變已分離出來的天然酶的活性。
2)通過基因工程方法改變編碼酶分子的基因而達到改造酶的目的。第3頁,課件共47頁,創(chuàng)作于2023年2月3.酶化學(xué)修飾的概念酶的化學(xué)修飾(chemicalmodification):通過化學(xué)基團的引入或除去,使蛋白質(zhì)共價結(jié)構(gòu)發(fā)生改變。酶選擇性化學(xué)修飾:描述肽鏈側(cè)鏈基團被化學(xué)試劑專一性地修飾。第4頁,課件共47頁,創(chuàng)作于2023年2月二、酶化學(xué)修飾的目的1.研究酶的結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系。(50年代末)2.人為改變天然酶的某些性質(zhì),擴大酶的應(yīng)用范圍。(70年代末之后)1)提高酶的生物活性(酶活力)。過氧化氫酶用右旋糖酐修飾后,在有機溶劑中的溶解性和酶活性也得到提高,如在三氯乙烷中酶活是天然酶的200倍,在水溶液中酶活是天然酶的15-20倍。
第5頁,課件共47頁,創(chuàng)作于2023年2月2)增強酶的穩(wěn)定性(熱穩(wěn)定性)。α-胰凝乳蛋白酶表面的氨基修飾成親水性更強的-NHCH2COOH后,該酶抗不可逆熱失活的穩(wěn)定性在60°可提高1000倍。這種穩(wěn)定的酶能經(jīng)受滅菌的極端條件而不失活。
3)消除抗原性(針對特異性反應(yīng)降低生物識別能力)。4)產(chǎn)生新的催化能力。木瓜蛋白酶用黃素共價結(jié)合修飾后,蛋白酶變成氧化還原酶。第6頁,課件共47頁,創(chuàng)作于2023年2月
第二節(jié)酶化學(xué)修飾的原理一、如何增強酶天然構(gòu)象的穩(wěn)定性與耐熱性
修飾劑分子存在多個反應(yīng)基團,可與酶形成多點交聯(lián)。使酶的天然構(gòu)象產(chǎn)生“剛性”結(jié)構(gòu)。二、如何保護酶活性部位與抗抑制劑大分子修飾劑與酶結(jié)合后,產(chǎn)生的空間障礙或靜電斥力阻擋抑制劑,“遮蓋”了酶的活性部位。第7頁,課件共47頁,創(chuàng)作于2023年2月三、如何維持酶功能結(jié)構(gòu)的完整性與抗蛋白水解酶酶化學(xué)修飾后通過兩種途徑抗蛋白水解酶:1.大分子修飾劑產(chǎn)生空間障礙阻擋蛋白水解酶接近酶分子?!罢谏w”酶分子上敏感鍵免遭破壞。2.酶分子上許多敏感基團交聯(lián)上修飾劑后,減少了受蛋白水解酶破壞的可能性。第8頁,課件共47頁,創(chuàng)作于2023年2月四、如何消除酶的抗原性及穩(wěn)定酶的微環(huán)境1.酶蛋白氨基酸組成的抗原決定簇,與修飾劑形成了共價鍵。破壞了抗原決定簇——抗原性降低乃至消除“遮蓋”了抗原決定簇——阻礙抗原、抗體結(jié)合2.大分子修飾劑本身是多聚電荷體,能在酶分子表面形成“緩沖外殼”,抵御外界環(huán)境的極性變化,維持酶活性部位微環(huán)境相對穩(wěn)定。第9頁,課件共47頁,創(chuàng)作于2023年2月
第三節(jié)酶化學(xué)修飾的設(shè)計
一、充分認(rèn)識酶分子的特性包括酶的——1.活性部位情況
2.穩(wěn)定條件及反應(yīng)最佳條件
3.側(cè)鏈基團的化學(xué)性質(zhì)及反應(yīng)活潑性第10頁,課件共47頁,創(chuàng)作于2023年2月二、修飾劑的選擇要考慮——
1.修飾劑的分子量及鏈的長度(要求有較大的分子量)
2.修飾劑上反應(yīng)基團的數(shù)目及位置(要求有較多的反應(yīng)活性基團)
3.修飾劑上反應(yīng)基團的活化方法與條件第11頁,課件共47頁,創(chuàng)作于2023年2月三、反應(yīng)條件的選擇要注意——1.酶與修飾劑的分子比例
2.反應(yīng)體系的溶劑性質(zhì)、鹽濃度、pH條件
3.反應(yīng)溫度及時間第12頁,課件共47頁,創(chuàng)作于2023年2月第四節(jié)酶化學(xué)修飾的種類及應(yīng)用
一、酶的表面化學(xué)修飾
(一)大分子修飾(大分子結(jié)合修飾)是目前應(yīng)用最廣的酶分子修飾方法。
1.定義:利用水溶性大分子與酶結(jié)合,使酶的空間結(jié)構(gòu)發(fā)生某些精細的改變,從而改變酶的特性與功能的方法。第13頁,課件共47頁,創(chuàng)作于2023年2月2.修飾劑:聚乙二醇(PEG)、右旋糖酐(dextran)、肝素(heparin)、蔗糖聚合物(Ficoll)等。修飾方法:修飾前活化,然后在一定條件下與酶分子共價結(jié)合。第14頁,課件共47頁,創(chuàng)作于2023年2月3.應(yīng)用:如:PEG-超氧化物歧化酶(SOD)
PEG-人血紅蛋白
PEG-天門冬酰胺酶(ASNase)降低了抗原性延長了酶在體內(nèi)的半衰期又如:用Dextran修飾-淀粉酶,-淀粉酶,胰蛋白酶、過氧化氫酶,提高了酶的熱穩(wěn)定性。第15頁,課件共47頁,創(chuàng)作于2023年2月(二)小分子修飾(酶蛋白側(cè)鏈基團修飾)定義:采用小分子試劑使酶分子側(cè)鏈上特定的功能基團發(fā)生化學(xué)反應(yīng)。側(cè)鏈基團:組成蛋白質(zhì)氨基酸殘基上的功能團。主要有:氨基、羧基、胍基、巰基、酚基、咪唑基。側(cè)鏈基團修飾劑:采用的各種小分子化合物。
20種不同氨基酸的側(cè)鏈基團中只有極性氨基酸的側(cè)鏈易被修飾,它們一般具有親核性。第16頁,課件共47頁,創(chuàng)作于2023年2月根據(jù)氨基酸側(cè)鏈R基的極性,20種氨基酸可分成4類。
1.非極性R基氨基酸(共8種):丙氨酸(Alanine,Ala,A),
亮氨酸(Leucine,Leu,L),
纈氨酸(Valine,Val,V)),
異亮氨酸(Isoleucine,Ile,I),
苯丙氨酸(Phenylalanine,Phe,F),
色氨酸(Tryptophan,Trp,W),
甲硫氨酸(Methionine,Met,M),
脯氨酸(Proline,Pro,P)第17頁,課件共47頁,創(chuàng)作于2023年2月2.無電荷的極性R基氨基酸(共7種):絲氨酸(Serine,Ser,S),蘇氨酸(Threonine,Thr,T),酪氨酸(Tyrosine,Tyr,Y),半胱氨酸(Cysteine,Cys,C),天冬酰胺(Asparagine,Asn,N),甘氨酸(Glycine,Gly,G),谷氨酰胺(Glutamine,Gln,Q)3.帶正電荷的極性R基氨基酸(共3種):賴氨酸(Lysine,Lys,K),精氨酸(Arginine,Arg,R),組氨酸(Histidine,His,H)4.帶負(fù)電荷的極性R基氨基酸(共2種):天冬氨酸(Asparticacid,Asp,D),谷氨酸(Glutamicacid,Glu,E)第18頁,課件共47頁,創(chuàng)作于2023年2月幾種重要的修飾反應(yīng):烷基化反應(yīng)酰化反應(yīng)氧化還原反應(yīng)芳香環(huán)取代反應(yīng)第19頁,課件共47頁,創(chuàng)作于2023年2月1.化學(xué)修飾反應(yīng)的類型
1)烷基化反應(yīng)試劑特點:烷基上帶活潑鹵素,導(dǎo)致酶分子的親核基團(如-NH2,-SH等)發(fā)生烷基化。可作用基團:氨基(Lys,Arg),巰基(Cys),羧基(Asp、Glu),甲硫基(Met),咪唑基(His)。修飾劑:2,4-二硝基氟苯、碘乙酸、碘乙酰胺等。第20頁,課件共47頁,創(chuàng)作于2023年2月烷基化反應(yīng)第21頁,課件共47頁,創(chuàng)作于2023年2月
2)?;磻?yīng)試劑特點:含有結(jié)構(gòu),作用于側(cè)鏈基團上的親核基團,使之?;?。可作用基團:氨基,巰基,醇羥基(Ser、Thr),酚羥基(Tyr)第22頁,課件共47頁,創(chuàng)作于2023年2月?;磻?yīng)
第23頁,課件共47頁,創(chuàng)作于2023年2月3)氧化和還原反應(yīng)試劑特點:具有氧化性或還原性。氧化劑:H2O2,N-溴代琥珀酰亞胺可被氧化的側(cè)鏈基團:巰基,甲硫基,吲哚基(Trp)、咪唑基,酚基等。還原劑:2-巰基乙醇、DTT等??杀贿€原的側(cè)鏈基團:二硫鍵。第24頁,課件共47頁,創(chuàng)作于2023年2月連四硫酸鹽氧化巰基,DTT還原逆回,用于保護巰基。第25頁,課件共47頁,創(chuàng)作于2023年2月
4)芳香環(huán)取代反應(yīng)試劑:鹵(碘)化,硝化試劑。碘代:
I2+
+HI
硝化:
(NO2)4C++(NO2)3CH
(四硝基甲烷)第26頁,課件共47頁,創(chuàng)作于2023年2月2.特定氨基酸殘基側(cè)鏈基團的化學(xué)修飾1)氨基的化學(xué)修飾:來源:Lys,Arg,His,Gln修飾反應(yīng):酰基化與烷基化?;揎梽?
三硝基苯磺酸(TNBS)、丹磺酰氯(DNS)烷基化修飾劑:
2,4-二硝基氟苯(DNFB)、碘乙酸、碘乙酰胺、亞硝酸等第27頁,課件共47頁,創(chuàng)作于2023年2月第28頁,課件共47頁,創(chuàng)作于2023年2月2)羧基的化學(xué)修飾修飾羧基的反應(yīng)專一性較差。常用水溶性碳化二亞胺修飾天冬氨酸和谷氨酸??啥繙y定酶分子中羧基的數(shù)目。
+
水溶性碳化二亞胺第29頁,課件共47頁,創(chuàng)作于2023年2月3)胍基的化學(xué)修飾來源:Arg修飾反應(yīng):本質(zhì)上是羰基對氨基?;P揎梽?/p>
丁二酮二羰基化合物
1,2-環(huán)己二酮苯乙二醛第30頁,課件共47頁,創(chuàng)作于2023年2月第31頁,課件共47頁,創(chuàng)作于2023年2月4)巰基的化學(xué)修飾來源:Cys
修飾反應(yīng):烷基化修飾劑:碘乙酸(IAA)
碘乙酰胺(IAM)
E-SH+R-X->E-SR+HXN-乙基馬來酰亞胺(NEM)(常用的專一修飾巰基試劑)E-SH+
第32頁,課件共47頁,創(chuàng)作于2023年2月5)二硫鍵的化學(xué)修飾還原:巰基乙醇、二硫蘇糖醇(DTT)第33頁,課件共47頁,創(chuàng)作于2023年2月氧化:過甲酸:Performicacid第34頁,課件共47頁,創(chuàng)作于2023年2月
6)咪唑基的化學(xué)修飾
來源:His
修飾反應(yīng):酰基化與烷基化
?;揎梽?
常用焦碳酸二乙酯(diethylparacarbonate)
++C2H5OH+CO2
烷基化修飾劑:碘乙酸+ICH2COOH+HI第35頁,課件共47頁,創(chuàng)作于2023年2月7)酚羥基的化學(xué)修飾來源:Tyr修飾反應(yīng):芳香環(huán)取代反應(yīng)修飾劑:碘、硝化試劑(四硝基甲烷)第36頁,課件共47頁,創(chuàng)作于2023年2月8)吲哚基的化學(xué)修飾來源:Trp
修飾反應(yīng):氧化反應(yīng)修飾劑:
N-溴代琥珀酰亞胺
2-羥基-5硝基芐溴第37頁,課件共47頁,創(chuàng)作于2023年2月氨基酸側(cè)鏈基團修飾劑Lys氨基三硝基苯磺酸、丹磺酰氯;2,4-二硝基氟苯、碘乙酸、碘乙酰胺、亞硝酸Asp、Glu羧基水溶性碳化二亞胺Arg胍基苯乙二醛,1,2-環(huán)己二酮、丁二酮Cys巰基碘乙酸、碘乙酰胺、N-乙基馬來酰亞胺二硫鍵巰基乙醇、DTTHis咪唑基焦碳酸二乙酯、碘乙酸Tyr酚羥基碘、四硝基甲烷Trp吲哚基N-溴代琥珀酰亞胺
各種氨基酸側(cè)鏈的修飾劑第38頁,課件共47頁,創(chuàng)作于2023年2月
但解釋修飾效果須十分小心,因為:①任何一種修飾劑不是絕對專一的。②有些修飾劑引起蛋白質(zhì)構(gòu)象變化——失活,不一定是活性中心基團被共價修飾。③不同部分的相同基團,修飾效果不同,分子內(nèi)部的必需基團,不易被修飾。第39頁,課件共47頁,創(chuàng)作于2023年2月蛋白質(zhì)化學(xué)修飾的局限性化學(xué)修飾的專一性是相對的;酶的構(gòu)象有些改變;化學(xué)修飾只能在具有極性的氨基酸殘基側(cè)鏈上進行。第40頁,課件共47頁,創(chuàng)作于2023年2月(三)交聯(lián)修飾(交聯(lián)法)用雙功能基團試劑(如戊二醛),與酶分子內(nèi)不同肽鏈部分共價交聯(lián),使酶分子空間構(gòu)象更加穩(wěn)定。分子間交聯(lián)、分子內(nèi)交聯(lián)(四)固定化修飾(共價偶聯(lián)法)通過酶表面的酸性或堿性殘基,將酶共價連接到惰性載體上,由于酶所處的微環(huán)境發(fā)生改變,使酶的最適pH、最適溫度和穩(wěn)定性發(fā)生改變。第41頁,課件共47頁,創(chuàng)作于2023年2月二、酶分子內(nèi)部修飾(一)蛋白主鏈修飾(肽鏈有限水解修飾)
蛋白主鏈修飾采用酶法(用專一性較強的蛋白酶或肽酶為修飾劑)。(與前面化學(xué)修飾區(qū)別)
第42頁,課件共47頁,創(chuàng)作于2023年2月
酶蛋白的肽鏈被水解后,可能出現(xiàn)以下三種情況中的一種:1引起酶活性中心的破壞,酶失去催化功
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