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文檔簡介
第五章細(xì)胞核與遺傳信息的流向PartB逆轉(zhuǎn)錄第五節(jié)基因與基因轉(zhuǎn)錄DNARNA蛋白質(zhì)復(fù)制轉(zhuǎn)錄翻譯復(fù)制基因(gene):
是細(xì)胞內(nèi)遺傳物質(zhì)最小的結(jié)構(gòu)功能單位,是DNA分子中含有特定遺傳信息的核苷酸序列?;虮磉_(dá):DNA序列所攜帶的遺傳信息,通過轉(zhuǎn)錄和翻譯形成具有生物活性的蛋白質(zhì)的過程。一、原核細(xì)胞基因的結(jié)構(gòu)以大腸桿菌基因組為例DNA分子:擬核中的雙股環(huán)狀DNA,分子量2.4×109,長4×106bp
,約含3000~4000個(gè)基因。質(zhì)粒:環(huán)狀DNA,帶有少量基因,如對抗菌素、重金屬有抗性的基因。絕大部分是編碼序列。結(jié)構(gòu)基因(structuralgene):編碼蛋白質(zhì)或酶的基因大腸桿菌乳糖代謝有關(guān)的
三個(gè)結(jié)構(gòu)基因Z:β-半乳糖苷酶Y:β-半乳糖苷透性酶A:β-半乳糖苷乙酰化酶編碼這三個(gè)酶的結(jié)構(gòu)基因相鄰排列。二、原核細(xì)胞基因的轉(zhuǎn)錄
對于任一個(gè)特定的基因,DNA雙鏈分子中只有一條鏈帶有遺傳信息,稱為編碼鏈(codingstrand),與之互補(bǔ)的稱為反編碼鏈(anticodingstrand)。轉(zhuǎn)錄(transcription):在RNA聚合酶的催化下,以DNA的反編碼鏈為模板,按照堿基互補(bǔ)配對原則,以四種rNTPs為原料合成RNA的過程。編碼鏈:5'-ATGAAACGAGTCTTATGA-3'反編碼鏈:mRNA:3'-TACTTTGCTCAGAATACT-5'5'-AUGAAACGAGUCUUAUGA
-3'σ因子(起始因子):識別原核細(xì)胞結(jié)構(gòu)基因上游的啟動(dòng)子,負(fù)責(zé)RNA合成的起始。核心酶:α2ββ’四個(gè)亞基,核心酶能夠催化轉(zhuǎn)錄RNA,核心酶與σ因子相結(jié)合成為全酶RNA聚合酶轉(zhuǎn)錄過程示意圖RNA聚合酶與啟動(dòng)子結(jié)合轉(zhuǎn)錄的起始RNA鏈的延長轉(zhuǎn)錄的終止轉(zhuǎn)錄過程轉(zhuǎn)錄后的加工原核細(xì)胞mRNA一般不需要經(jīng)過加工,轉(zhuǎn)錄之后即為有功能的mRNA。tRNA分子的加工切除3’端的附加序列在3’末端加上CCA三個(gè)核苷酸酶促修飾成稀有堿基,如假尿嘧啶(二)原核細(xì)胞基因表達(dá)的調(diào)控基因表達(dá):遺傳信息通過轉(zhuǎn)錄和翻譯合成特定蛋白質(zhì)的過程大多數(shù)基因表達(dá)的調(diào)控是在轉(zhuǎn)錄水平上進(jìn)行的關(guān)于原核細(xì)胞基因表達(dá)調(diào)控的學(xué)說,即操縱子學(xué)說。法國巴斯德研究所著名分子生物學(xué)家Jacob和Monod對大腸桿菌中β-半乳糖苷酶合成的調(diào)節(jié)進(jìn)行了研究,1961年首先提出了操縱子和操縱基因的概念及乳糖操縱子模型。因而獲諾貝爾醫(yī)學(xué)或生理學(xué)獎(jiǎng)。操縱子學(xué)說操縱基因(operatorgene):位于結(jié)構(gòu)基因的上游的一段核苷酸序列,有控制結(jié)構(gòu)基因轉(zhuǎn)錄的作用。啟動(dòng)子(promoter):位于操縱基因上游的一段特殊的核苷酸序列,是RNA聚合酶的識別和結(jié)合部位。調(diào)節(jié)基因(regulatorgene):編碼某種調(diào)節(jié)蛋白(阻遏蛋白),調(diào)節(jié)操縱子的活動(dòng)。負(fù)調(diào)節(jié):阻遏蛋白與操縱基因結(jié)合后對于結(jié)構(gòu)基因的轉(zhuǎn)錄起阻止作用,這種調(diào)節(jié)方式稱為負(fù)調(diào)節(jié)。正調(diào)節(jié):代謝物激活蛋白(cataboliteactivatorprotein,CAP)與啟動(dòng)子結(jié)合后可以增強(qiáng)結(jié)構(gòu)基因的轉(zhuǎn)錄活動(dòng),這種調(diào)節(jié)方式稱為正調(diào)節(jié)三、真核細(xì)胞基因組的特點(diǎn)①真核細(xì)胞基因組龐大,存在著許多重復(fù)序列。②基因多為斷裂基因。斷裂基因(splitgene):大部分基因含有非編碼序列,即基因中的編碼序列是不連續(xù)的。③存在多基因家族。DNA重復(fù)序列(repetitivesequence)單一序列中度重復(fù)順序高度重復(fù)順序:
(一)真核細(xì)胞基因組的特點(diǎn)多基因家族
概念:一組功能類似、其核苷酸序列具有同源性的基因。經(jīng)過重復(fù)和變異所產(chǎn)生的一組基因。分類:1.基因家族成簇地分布在某一條染色體上2.一個(gè)基因家族的不同成員成簇地分布不同染色體上真核細(xì)胞基因組的特點(diǎn)斷裂基因真核細(xì)胞的大部分基因中含有非編碼序列,即基因中的編碼序列是不連續(xù)的,稱為斷裂基因(splitgene)。真核細(xì)胞基因組的特點(diǎn)真核細(xì)胞基因的種類:結(jié)構(gòu)基因45srRNA基因5srRNA基因tRNA基因等3.增強(qiáng)子(enhancer):增強(qiáng)子是基因中的一個(gè)調(diào)節(jié)序列存在部位:位于轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)上游或下游,也可位于內(nèi)含子。功能:能增強(qiáng)相關(guān)基因的轉(zhuǎn)錄活性4.終止子:結(jié)構(gòu)基因末端具有回文結(jié)構(gòu)有一段堿基序列,作用:具有終止轉(zhuǎn)錄的作用(二)真核基因的轉(zhuǎn)錄與加工
不均一核RNA(heterogeneousnuclearRNA,hnRNA):
結(jié)構(gòu)基因轉(zhuǎn)錄的初級產(chǎn)物分子量大小各不相同的各種前體RNA,存在于細(xì)胞核內(nèi)。剪接: 將DNA基因中非編碼順序(如內(nèi)含子)轉(zhuǎn)錄的部分剪掉,然后將DNA基因中編碼順序(外顯子)拼接起來。戴帽: 對mRNA的5’端進(jìn)行化學(xué)修飾。即在mRNA的5’端第一個(gè)核苷酸前方接上一個(gè)7甲基鳥嘌呤三磷酸(m7G)的結(jié)構(gòu)。作用:①提供核糖體所識別的標(biāo)志;②封閉mRNA5’端的作用、防止被磷酸酶水解,對mRNA起保護(hù)作用加尾:
由多聚腺苷酸聚合酶催化,在mRNA3’端加上50~250個(gè)腺苷酸殘基,形成多聚腺苷酸(稱polyA)的尾巴。加尾可防止被磷酸酶水解,能延長mRNA的壽命。結(jié)構(gòu)基因的轉(zhuǎn)錄加工過程:結(jié)構(gòu)基因轉(zhuǎn)錄后形成前體RNA對hnRNA進(jìn)行剪切.拼接,形成mRNA對mRNA的5’端化學(xué)修飾“戴帽”對mRNA3’端化學(xué)修飾“加尾”成熟mRNA遺傳密碼
Allthetripletcodonshavemeaning:61representaminoacids,and3causetermination(STOP).
遺傳信息翻譯遺傳密碼的三個(gè)特點(diǎn):通用型;簡并性;閱讀的無間隔性(1)遺傳密碼是三聯(lián)體密碼。(2)遺傳密碼無逗號。(3)遺傳密碼是不重迭的。(4)遺傳密碼具有通用性。(5)遺傳密碼具有簡并性(degeneracy(synonyms)。(6)密碼子有起始密碼子和終止密碼子。(7)反密碼子中的“擺動(dòng)”(wobble)Wobblehypothesis
accountsfortheabilityofatRNAtorecognizemorethanonecodonbyunusual(non-GC,non-AT)pairingwiththethirdbaseofacodon.
Codon-anticodonrecognitioninvolveswobbling密碼子與反密碼子配對的擺動(dòng)假說第三節(jié)tRNA的結(jié)構(gòu)和功能
一.tRNA的結(jié)構(gòu)(一)三葉草型的二維結(jié)構(gòu)(1)各種tRNA均含有70~80個(gè)堿基,其中22個(gè)堿基是恒定的。(2)5’端和3’端配對(常為7bp)形成莖區(qū),稱為受體臂(acceptorarm)或稱氨基酸臂。在3’端永遠(yuǎn)是4個(gè)堿基(XCCA)的單鏈區(qū),在其末端有2’-OH或3’-OH,是被氨基?;稽c(diǎn)。此臂負(fù)責(zé)攜帶特異的氨基酸。
(3)TψC常由5bp的莖和7Nt和環(huán)組成。此臂負(fù)責(zé)和核糖體上的rRNA識別結(jié)合;(4)反密碼子臂(anticodonarm)常由5bp的莖區(qū)和7Nt的環(huán)區(qū)組成,它負(fù)責(zé)對密碼子的識別與配對。(5)D環(huán)(Darm)的莖區(qū)長度常為4bp,也稱雙氫尿嘧啶環(huán)。負(fù)責(zé)和氨基酰tRNA聚合酶結(jié)合;(6)額外環(huán)(extraarm)可變性大,從4Nt到21Nt不等,其功能是在tRNA的L型三維結(jié)構(gòu)中負(fù)責(zé)連接兩個(gè)區(qū)域(D環(huán)-反密碼子環(huán)和TψC-受體臂)。轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)控一.順式作用元件和反式作用因子元件:順式作用因子元件:(1)核心啟動(dòng)子成分,如TATA框;(2)上游啟動(dòng)子分,如CAAT框,GC框;(3)遠(yuǎn)上游順序:如增強(qiáng)子,減弱子、靜息子,酵母的UAS
(upstreamactivatorsequences)等。
反式作用因子可以分為3類;(1)
通用反式作用因子,,主要識別啟動(dòng)子的核心啟動(dòng)成分,如TBP;(2)特殊組織與細(xì)胞中的反式作用因子,如淋巴細(xì)胞中的Oct-2;(3)和反應(yīng)性元件(responseelenents)相結(jié)合的反式作用因子。如HSE(熱休克反應(yīng)元件,heatshockresponseelement),GRE(糖皮質(zhì)激素反應(yīng)元件glucocorticoidresponseelement);MRE(金屬反應(yīng)元件,metalresponseelement);
TRE(腫瘤誘導(dǎo)劑反應(yīng)元件,tumorgenicagentresponseelement);(一)蛋白質(zhì)直接和DNA結(jié)合1.
螺旋轉(zhuǎn)角螺旋(Helix-turn-helix,
HTH):如LacO的R蛋白,λ的CI,Cro蛋白,涉及酵母交配型的a1和a2蛋白。真核生物中的Oct-1和Oct-2;2.鋅指結(jié)構(gòu)(zincfimger)單個(gè)的鋅指保守序列是:Cys-X2-4-Cys-X3-Phe-X5-Leu-X2-His-X2-HisⅠ型:2Cys/2His:TFIIIA,SP1Ⅱ型:2cys/2cys:GAL4
3.亮氨酸拉鏈(Leucineziipper)同二聚體(honwdimers)異二聚體(hefercdimers)C-Jun,C-Fos,Myc,4.
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