《心血管疾病與腫瘤疾病中西醫(yī)臨床大數(shù)據(jù)分析與應(yīng)用研究》_第1頁
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文檔簡介

心血管疾病與腫瘤疾病

中西醫(yī)臨床大數(shù)據(jù)處理分析與應(yīng)用研究國家高技術(shù)研究發(fā)展計(jì)劃(863計(jì)劃)整理課件匯報(bào)提綱一、目標(biāo)與任務(wù)二、課題主要技術(shù)路線三、課題任務(wù)的支撐條件四、課題年度計(jì)劃五、課題組織實(shí)施六、課題預(yù)算整理課件一、

目標(biāo)與任務(wù)整理課件提高兩類重大疾病的臨床服務(wù)能力和水平促進(jìn)中醫(yī)藥源于臨床、回歸臨床的循證醫(yī)學(xué)研究提高中醫(yī)藥在人類健康保障的貢獻(xiàn)度心血管及腫瘤疾病是危害人類健康的主要疾病,中國擁有這兩類疾病大量的臨床數(shù)據(jù)。利用大數(shù)據(jù)處理、存儲和分析技術(shù),探索符合中國實(shí)際的臨床診療模式與規(guī)律,對兩類重大疾病的防治有重大意義。在我國,中醫(yī)藥是貫穿心血管與腫瘤疾病診治全過程的重要組成部分,對這兩類疾病的診治研究如果缺少了中醫(yī)藥數(shù)據(jù)將是不完整的。課題意義整理課件中醫(yī)藥是治療兩類重大疾病重要組成部分課題意義中醫(yī)藥參與度高,普遍為國民接受強(qiáng)調(diào)個性化的辨證論治,難以獲得可重復(fù)的療效評價(jià)規(guī)律病歷數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化與結(jié)構(gòu)化程度較低——分析和研究中西醫(yī)臨床大數(shù)據(jù)的必要性2014年3月上海市級醫(yī)院心血管和腫瘤疾病的診療情況整理課件課題意義——基于區(qū)域大數(shù)據(jù)分析和研究的必要性現(xiàn)行就醫(yī)模式下,兩類疾病患者的就醫(yī)隨機(jī)分散在各大醫(yī)院任何一家醫(yī)院的信息都是局部或不完整的只有區(qū)域性的數(shù)據(jù)中心才能提供完整的診療數(shù)據(jù)整理課件完成上海市心血管和腫瘤疾病的發(fā)病及治療總體情況研究完成中醫(yī)藥在心血管和腫瘤疾病治療方面的療效評價(jià)研究建立心血管疾病和腫瘤疾病的中西醫(yī)臨床知識庫及應(yīng)用研發(fā)上海市心血管疾病和腫瘤疾病中西醫(yī)臨床在線輔助決策支持系統(tǒng)課題目標(biāo)整理課件心血管疾病腫瘤疾病建立上海中醫(yī)臨床數(shù)據(jù)中心臨床大數(shù)據(jù)關(guān)鍵技術(shù)研究搭建臨床大數(shù)據(jù)平臺研發(fā)上海市心血管及腫瘤疾病中西醫(yī)臨床在線輔助決策支持系統(tǒng)大數(shù)據(jù)分析與應(yīng)用研究心力衰竭大腸癌課題任務(wù)中西醫(yī)知識庫及應(yīng)用研究整理課件課題的關(guān)聯(lián)性分析整理課件二、課題主要技術(shù)路線整理課件建立包含醫(yī)聯(lián)中心和四家中醫(yī)院數(shù)據(jù)的中醫(yī)臨床數(shù)據(jù)中心。利用大數(shù)據(jù)關(guān)鍵技術(shù)搭建大數(shù)據(jù)平臺,為大數(shù)據(jù)分析與應(yīng)用和知識庫構(gòu)建提供數(shù)據(jù)支撐。通過結(jié)構(gòu)化知識庫的構(gòu)建,向醫(yī)療專業(yè)用戶提供有價(jià)值的反饋。總體框架圖整理課件療效評價(jià)的復(fù)雜性問題中醫(yī)藥療效的貢獻(xiàn)問題診療方案的可推廣性問題管理決策缺乏數(shù)據(jù)支持全國臨床大數(shù)據(jù)不多上海已經(jīng)形成了區(qū)域臨床大數(shù)據(jù),但是缺乏病歷文本數(shù)據(jù)清洗病歷數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)化程度低大數(shù)據(jù)平臺大數(shù)據(jù)挖掘算法并行化語義化知識庫政府?dāng)?shù)據(jù)整合數(shù)據(jù)分析數(shù)據(jù)處理臨床決策臨床研究技術(shù)方面應(yīng)用方面項(xiàng)目難點(diǎn)整理課件臨床大數(shù)據(jù)挖掘技術(shù)研究及算法并行化改造技術(shù)

面向臨床大數(shù)據(jù),利用并行化改造后的分類、聚類、回歸、關(guān)聯(lián)等數(shù)據(jù)挖掘技術(shù),將支持向量機(jī)模型、向量空間模型、Logistic回歸模型以及Cox比例風(fēng)險(xiǎn)等用于進(jìn)行兩類疾病的病例分類、疾病相似度匹配、疾病診療方案聚類、疾病轉(zhuǎn)歸影響因素分析。面向中醫(yī)診療效果評價(jià)的Cox比例風(fēng)險(xiǎn)模型面向疾病轉(zhuǎn)歸分析的多元Logistic回歸方程模型基于粗糙集的疾病特征相似度匹配臨床數(shù)據(jù)挖掘算法基于遺傳算法的生命周期癥狀監(jiān)測模型基于聚類分析的慢性病種診療方案慢性病跟蹤預(yù)測模型常用的數(shù)據(jù)挖掘算法分類分析聚類分析關(guān)鍵詞搜索序列分析關(guān)聯(lián)分析預(yù)測分析偏差分析遺傳算法粗糙集方法1、臨床大數(shù)據(jù)關(guān)鍵技術(shù)研究整理課件臨床大數(shù)據(jù)面向診療效果因果關(guān)系評價(jià)的生存分析常用的生存分析方法生存率分布K-M估計(jì)方法生存表分析對數(shù)秩檢驗(yàn)經(jīng)驗(yàn)似然推斷Buckley-James估計(jì)比例風(fēng)險(xiǎn)回歸分析可加風(fēng)險(xiǎn)回歸分析…………傾向性得分匹配因果推斷K-M估計(jì)生存率分布對數(shù)秩檢驗(yàn)對比研究風(fēng)險(xiǎn)回歸模型影響因素研究

利用臨床觀測大數(shù)據(jù),基于RCM(羅賓因果模型),采用多元Logistic回歸,構(gòu)建影響因素的傾向性得分,以“控制”混雜變量,達(dá)到滿足非混雜假定,進(jìn)行因果性推斷;在此基礎(chǔ)上,將生存分析統(tǒng)計(jì)方法應(yīng)用于大數(shù)據(jù)臨床數(shù)據(jù),對比研究中、西醫(yī)不同診療手段的診療效果;進(jìn)而發(fā)展新的適用于大數(shù)據(jù)分析的新的統(tǒng)計(jì)方法。臨床大數(shù)據(jù)挖掘技術(shù)研究及算法并行化改造技術(shù)整理課件

詞匯二義性臨床文本分析技術(shù)——病歷結(jié)構(gòu)化的必要性傳統(tǒng)非結(jié)構(gòu)化病歷數(shù)據(jù),只能通過文本匹配來進(jìn)行查詢無法理解相同文字但不同含義的詞匯

關(guān)聯(lián)查詢無法精確切分查詢詞,理解查詢意圖整理課件臨床文本分析技術(shù)——基于實(shí)體鏈接算法的實(shí)體抽取整理課件臨床文本分析技術(shù)——基于病歷文本的病情正負(fù)面分析整理課件臨床文本分析技術(shù)——病歷結(jié)構(gòu)化表示示意圖【主訴】兩周內(nèi)便血2次【現(xiàn)病史】患者2周前無明顯誘因下出現(xiàn)大便帶鮮紅色液體2次,無肛門口異物感,肛門口無突出物,大便色黃,無粘胨膿液,無惡心嘔吐,無胃寒發(fā)熱,無尿頻尿急尿痛血尿,無腹痛腹瀉里急后重,至我院門診查腸鏡示“距肛9-12cm見一浸潤性腫塊,累及近2/3腸腔---直腸癌”,今為進(jìn)一步診治,門診擬“直腸癌”收入我科”3.矛以西力欣、圣諾安抗感染、巴曲亭、捷凝止血,耐信制酸,潘金南、衛(wèi)美佳、培爾吉、樂凡命、血必凈、天晴寧、力能、氯化鉀等營養(yǎng)支持,環(huán)磷酰苷營養(yǎng)細(xì)胞,開順化痰,貝科能保肝,甲硫氨酸維B1保肝治療,托烷司瓊止吐治療,丙帕他莫止痛。整理課件臨床文本分析技術(shù)——基于時間線索的臨床路徑分析整理課件研究臨床大數(shù)據(jù)整合、存儲、處理與挖掘技術(shù),搭建臨床大數(shù)據(jù)平臺2、搭建臨床大數(shù)據(jù)平臺利用ApacheSqoop實(shí)現(xiàn)醫(yī)聯(lián)中心關(guān)系型數(shù)據(jù)庫和臨床大數(shù)據(jù)平臺之間的數(shù)據(jù)整合利用列式存儲技術(shù)實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)格式的靈活擴(kuò)充與調(diào)整,探索分布式數(shù)據(jù)管理平臺的性能優(yōu)化構(gòu)建基于內(nèi)存的臨床大數(shù)據(jù)高速計(jì)算與分析引擎,實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)查詢和算法性能等方面優(yōu)化在分布式引擎上,實(shí)現(xiàn)臨床數(shù)據(jù)挖掘算法整理課件3、建立上海市中醫(yī)臨床數(shù)據(jù)中心在醫(yī)聯(lián)中心數(shù)據(jù)基礎(chǔ)上,補(bǔ)充采集4家三級中醫(yī)醫(yī)院中醫(yī)診療信息,建立上海市中醫(yī)臨床數(shù)據(jù)中心2013年全市4家三級中醫(yī)醫(yī)院共診治:門診病人903萬人次住院病人13萬人次建設(shè)整合中西醫(yī)診療過程的臨床數(shù)據(jù)中心:---實(shí)現(xiàn)上海市中、西醫(yī)數(shù)據(jù)中心的整合整理課件中心端原始數(shù)據(jù)整合處理上傳庫數(shù)據(jù)傳輸交換處理暫存庫整合入庫處理診療業(yè)務(wù)庫整合庫原始數(shù)據(jù)抽取采集內(nèi)部業(yè)務(wù)庫醫(yī)院前置端醫(yī)院內(nèi)部備份庫備份庫分析庫數(shù)據(jù)質(zhì)量庫診療映像庫外網(wǎng)業(yè)務(wù)庫臨床數(shù)據(jù)中心數(shù)據(jù)處理流程3、建立上海市中醫(yī)臨床數(shù)據(jù)中心數(shù)據(jù)抽取采集:將接口要求的業(yè)務(wù)數(shù)據(jù)從醫(yī)院數(shù)據(jù)庫遷移到前置機(jī)的整合庫中,保證來自于同一個系統(tǒng)的業(yè)務(wù)明細(xì)子表數(shù)據(jù)能與業(yè)務(wù)主表關(guān)聯(lián)。數(shù)據(jù)整合處理:初步整合“整合庫”中的數(shù)據(jù),并寫入上傳庫。傳輸交換處理:將前置端上傳庫中的數(shù)據(jù)完整地遷移到中心端暫存庫。遷移完成后,交換處理過程將清空前置端上傳庫中的數(shù)據(jù),并將其轉(zhuǎn)移到備份庫。整合入庫處理:校驗(yàn)并整合中心端暫存庫中數(shù)據(jù),主要處理內(nèi)容:將所有數(shù)據(jù)導(dǎo)入業(yè)務(wù)診療庫,清空中心端暫存庫,寫入備份庫。整理課件4、心血管和腫瘤疾病中西醫(yī)知識庫及應(yīng)用研究依托國家標(biāo)準(zhǔn)和行業(yè)規(guī)范,整合規(guī)范教材和經(jīng)典案例構(gòu)建知識庫通過編輯界面允許專家審核修改或擴(kuò)充知識庫通過應(yīng)用接口提供查詢、檢索相關(guān)知識,輔助決策支持等功能知識庫——查詢應(yīng)用示意圖整理課件語義知識庫技術(shù)架構(gòu)——基礎(chǔ)知識庫以醫(yī)聯(lián)網(wǎng)結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)、國家標(biāo)準(zhǔn)為基礎(chǔ),使用D2R映射以及文本抽取等方式構(gòu)建中西醫(yī)基礎(chǔ)知識庫,利用眾包編輯擴(kuò)充知識庫。使用圖數(shù)據(jù)庫以更好地表達(dá)與擴(kuò)充概念之間的關(guān)聯(lián)。利用本體推理引擎自動檢測數(shù)據(jù)之間的不一致性。經(jīng)過人工協(xié)作編輯、核對、審批,形成檢驗(yàn)的知識庫。使用基于自然語言的語義檢索,完成問答式查詢。整理課件基于臨床病例,通過信息抽取和語義標(biāo)注技術(shù)生成中西醫(yī)病例庫病例庫將包含家族史、病史、入院原因、用藥、手術(shù)情況等,并記錄病情與手術(shù)、用藥之間的關(guān)聯(lián)。支持病例語義查詢:如早期具有某種癥狀的病人,或是與特定病例最相似的病例語義知識庫技術(shù)架構(gòu)——病例庫整理課件臨床語義知識庫檢索——預(yù)期結(jié)果臨床語義知識庫的優(yōu)勢:根據(jù)自然語言檢索詞,定位具體的屬性和語義上的推理查詢,返回精確的查詢結(jié)果整理課件5、心血管和腫瘤疾病的大數(shù)據(jù)分析與應(yīng)用研究上海市心血管和腫瘤疾病的發(fā)病及治療總體情況研究體現(xiàn)中醫(yī)藥特色的心血管及腫瘤疾病的療效評價(jià)研究心力衰竭及大腸癌病種的病例知識庫建立及應(yīng)用研究對大數(shù)據(jù)進(jìn)行分析和應(yīng)用研究,包括3個方面:整理課件基于預(yù)后評估、治療與安全性監(jiān)測等,分析研究符合中國實(shí)際的診療方案。基于終點(diǎn)事件,分析研究不同診治方案及中醫(yī)藥參與的

療效評價(jià)?;诹餍胁W(xué)、衛(wèi)生經(jīng)濟(jì)學(xué)評估等,為管理決策提供大數(shù)據(jù)證據(jù)。5、心血管和腫瘤疾病的大數(shù)據(jù)分析與應(yīng)用研究整理課件6、研發(fā)上海市心血管及腫瘤疾病中西醫(yī)臨床在線輔助決策支持系統(tǒng)通過臨床決策支持引擎,幫助醫(yī)護(hù)人員及時做出臨床決策。推薦符合中醫(yī)辨證論治規(guī)律的、遵循現(xiàn)代醫(yī)學(xué)診治規(guī)范的診療方案。覆蓋38家三級醫(yī)院的10000余臺聯(lián)網(wǎng)醫(yī)生工作站。研發(fā)中西醫(yī)臨床在線輔助決策支持系統(tǒng):----以心力衰竭和大腸癌為實(shí)例進(jìn)行驗(yàn)證整理課件考核目標(biāo)建成兩類疾病的臨床病例庫,病例庫包含醫(yī)聯(lián)以及四家中醫(yī)院心血管與腫瘤方面的主要病例。建成兩類疾病的中醫(yī)臨床知識庫,兼容中醫(yī)95與97兩個標(biāo)準(zhǔn),包含疾病、證候、診治規(guī)則與處方等,數(shù)據(jù)表示支持OWL/RDF標(biāo)準(zhǔn)。開發(fā)5類重大疾病相關(guān)模型,包括風(fēng)險(xiǎn)調(diào)查與數(shù)據(jù)評估模型、治療與用藥安全性監(jiān)測模型、預(yù)后評估模型、衛(wèi)生經(jīng)濟(jì)學(xué)評估模型、中醫(yī)“證-治-效”評價(jià)模型。建立腫瘤與心血管重大疾病大數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)與質(zhì)量體系。12345建立1000萬級人群,150TB數(shù)據(jù)量的中西醫(yī)臨床數(shù)據(jù)中心。整理課件考核目標(biāo)建成區(qū)域性中西醫(yī)臨床在線輔助決策支持系統(tǒng)。申請國家發(fā)明專利和軟件著作權(quán)10項(xiàng)。發(fā)表論文30篇,其中SCI收錄10篇。培養(yǎng)2名學(xué)術(shù)帶頭人,形成1個臨床大數(shù)據(jù)分析團(tuán)隊(duì),包含博士5名,碩士15名以上。6897建立臨床大數(shù)據(jù)處理平臺1)完成醫(yī)療大數(shù)據(jù)處理及隱私保護(hù)脫敏共性技術(shù)支撐框架的研發(fā);2)實(shí)現(xiàn)面向腫瘤及心血管疾病的多來源異構(gòu)異質(zhì)數(shù)據(jù)的接入、集成

整合及分布式存儲;3)實(shí)現(xiàn)大數(shù)據(jù)統(tǒng)一元數(shù)據(jù)管理及基于Hadoop的SQL訪問引擎。

4)實(shí)現(xiàn)面向心血管及腫瘤中西醫(yī)結(jié)合大數(shù)據(jù)挖掘?qū)I(yè)算法構(gòu)建及核心分析運(yùn)行系統(tǒng)。10整理課件研究特色和創(chuàng)新首次對兩類重大疾病進(jìn)行1000萬級病人臨床數(shù)據(jù)的分析研究首創(chuàng)從大數(shù)據(jù)角度研究中醫(yī)藥的“證—治—效”評價(jià)體系首次建立區(qū)域性的臨床在線輔助決策支持系統(tǒng)首創(chuàng)面向臨床的中西醫(yī)大數(shù)據(jù)平臺采用基于臨床數(shù)據(jù)的知識庫(半)自動生成技術(shù)和基于知識庫的語義標(biāo)注技術(shù)整理課件三、課題任務(wù)的支撐條件整理課件負(fù)責(zé)制定WHO

ICD-11《傳統(tǒng)醫(yī)學(xué)國際疾病分類標(biāo)準(zhǔn)》承擔(dān)國家863項(xiàng)目“綜合性中醫(yī)院信息系統(tǒng)研發(fā)與示范”上海中醫(yī)藥大學(xué)附屬曙光醫(yī)院是國際標(biāo)準(zhǔn)化組織傳統(tǒng)醫(yī)學(xué)標(biāo)準(zhǔn)化技術(shù)委員會(ISOTC249)秘書處的依托單位,在中醫(yī)藥學(xué)的規(guī)范化、標(biāo)準(zhǔn)化方面發(fā)揮重要的作用中醫(yī)信息規(guī)范化研究具備較強(qiáng)實(shí)力病案分析視圖病案檢索視圖整理課件

上海申康醫(yī)院發(fā)展中心的醫(yī)聯(lián)工程項(xiàng)目連接了38家三級甲等醫(yī)療機(jī)構(gòu),已經(jīng)建立3900萬人的個人診療檔案庫。內(nèi)容包括患者基本信息、處方、檢驗(yàn)檢查報(bào)告、影像、病案首頁、出院小結(jié),其中檢查可調(diào)閱的診療記錄達(dá)到了2.5億條,處方明細(xì)20億條,各類檢驗(yàn)報(bào)告6000萬份、病案250萬份。是國內(nèi)規(guī)模最大的區(qū)域醫(yī)療信息系統(tǒng)

醫(yī)聯(lián)數(shù)據(jù)中心具有堅(jiān)實(shí)的數(shù)據(jù)基礎(chǔ)整理課件項(xiàng)目團(tuán)隊(duì)主要研究大數(shù)據(jù)平臺、模型與算法,搭建大數(shù)據(jù)挖掘環(huán)境,形成了較為成熟的平臺、軟件與大數(shù)據(jù)挖掘方法論。成果已經(jīng)在醫(yī)聯(lián)大數(shù)據(jù)平臺進(jìn)行了嘗試,初步實(shí)現(xiàn)了醫(yī)聯(lián)大數(shù)據(jù)的監(jiān)控、處理和分析挖掘。在大數(shù)據(jù)挖掘分析技術(shù)上擁有堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ)大數(shù)據(jù)平臺監(jiān)控系統(tǒng)高血壓疾病關(guān)聯(lián)分析整理課件將電子病歷轉(zhuǎn)換為一個圖數(shù)據(jù)鄭XX:女,49歲,醫(yī)保,上海曙光醫(yī)院,床號:0903,門診號:06289170,住院號:00367285,主任醫(yī)生:梁延平,主治醫(yī)生:沈秀英,住院醫(yī)生:何嫣,入院診斷:,診療經(jīng)過:患者入院后完善相關(guān)檢查,予息隱+米索擴(kuò)宮頸,于2011.1.13在宮腔鏡檢查+定位取環(huán)術(shù)。HSC下見:子宮內(nèi)膜輕度肥厚增生,光澤正常。宮底部一環(huán)影,部分嵌頓于子宮內(nèi)膜中。兩側(cè)輸卵管開口正常。定位取出一園環(huán),完整。手術(shù)順利,術(shù)中出血少。術(shù)后抗炎治療。,出院情況:少量陰道流血,無腹痛、腹脹。體溫正常。,出院醫(yī)囑:1.門診隨訪。轉(zhuǎn)換中文開放鏈接知識庫對不同的中文數(shù)據(jù)源進(jìn)行合并,組成統(tǒng)一的知識庫。共有621萬實(shí)例,73萬類別,上億的事實(shí)。成果在ISWC以及SCI期刊上發(fā)表。其中用到的文本結(jié)構(gòu)化技術(shù)與本項(xiàng)目相關(guān)。知識庫技術(shù)的工作基礎(chǔ)整理課件

獲得獎項(xiàng):2013年國家科技進(jìn)步獎二等獎2011年上海市科學(xué)技術(shù)獎一等獎2011年中國醫(yī)院協(xié)會科技創(chuàng)新獎一等獎2010年中國國際工業(yè)博覽會銀獎(計(jì)算機(jī)類最高獎項(xiàng))2008年區(qū)域信息平臺方案獲得衛(wèi)生部評比一等獎2008年上海市信息化優(yōu)秀應(yīng)用成果獎2011年獲得科技部十一五支撐計(jì)劃優(yōu)秀項(xiàng)目團(tuán)隊(duì)項(xiàng)目團(tuán)隊(duì)在臨床大數(shù)據(jù)平臺架構(gòu)研究和應(yīng)用中取得了豐碩的成果,其中“醫(yī)聯(lián)工程——區(qū)域醫(yī)療信息共享及協(xié)同服務(wù)系統(tǒng)研發(fā)與規(guī)模應(yīng)用”,獲得2013年度國家科技進(jìn)步獎二等獎。臨床大數(shù)據(jù)平臺架構(gòu)研究有較強(qiáng)實(shí)力整理課件上海中醫(yī)藥大學(xué)附屬曙光醫(yī)院---科技部和上海市(部市)共建研究型中醫(yī)醫(yī)院國家教育部重點(diǎn)學(xué)科3個國家中醫(yī)藥管理局重點(diǎn)專科專病7個國家中醫(yī)藥管理局中醫(yī)藥科研三級實(shí)驗(yàn)室5個上海市中醫(yī)藥研究院研究所4個目前承擔(dān)國家863計(jì)劃1項(xiàng)、國家科技重大專項(xiàng)7項(xiàng)項(xiàng)目承擔(dān)單位整理課件國有資產(chǎn)投資管理運(yùn)營的責(zé)任主體和政府辦醫(yī)的責(zé)任主體醫(yī)聯(lián)數(shù)據(jù)中心覆蓋上海市38家三級醫(yī)院、8個區(qū)、3900萬就診人群涉及就診記錄2.5億條,形成國內(nèi)最大的臨床數(shù)據(jù)庫獲得2013年度國家科技進(jìn)步獎二等獎“國家衛(wèi)生信息共享技術(shù)及應(yīng)用工程技術(shù)研究中心”依托單位國家發(fā)改委高新技術(shù)產(chǎn)業(yè)化示范工程企業(yè)國家863計(jì)劃成果產(chǎn)業(yè)化基地上海大數(shù)據(jù)產(chǎn)業(yè)技術(shù)創(chuàng)新戰(zhàn)略聯(lián)盟理事長單位承建上海市健康信息網(wǎng)(市-區(qū)兩級健康檔案信息平臺)、上海市醫(yī)聯(lián)工程、上海市公共衛(wèi)生信息系統(tǒng)、上海市醫(yī)療保險(xiǎn)信息系統(tǒng)“985優(yōu)勢學(xué)科創(chuàng)新平臺”大學(xué)國家“211工程”重點(diǎn)建設(shè)大學(xué)信息學(xué)院承擔(dān)國家863計(jì)劃、國家“973”項(xiàng)目多項(xiàng)信息學(xué)院獲國家科技進(jìn)步二等獎2項(xiàng)上海申康醫(yī)院發(fā)展中心萬達(dá)信息股份有限公司華東理工大學(xué)項(xiàng)目合作單位整理課件國家首批建立的四所中醫(yī)藥高等院校之一,上海市高校中唯一一所醫(yī)科類重點(diǎn)特色院?!,F(xiàn)有國家重點(diǎn)學(xué)科6個,數(shù)量居全國中醫(yī)院校第二、上海地方高校之首。在2012年的國家一級學(xué)科評估中,中藥學(xué)一級學(xué)科排名全國第一,中醫(yī)學(xué)一級學(xué)科排名全國第二,中西醫(yī)結(jié)合一級學(xué)科排名全國第三。上海中醫(yī)藥大學(xué)外部技術(shù)支撐條件中醫(yī)醫(yī)院醫(yī)療質(zhì)量監(jiān)測中心全國中醫(yī)醫(yī)院醫(yī)療質(zhì)量監(jiān)測中心隸屬于國家中醫(yī)藥管理局,委托上海中醫(yī)藥大學(xué)組建,依托曙光醫(yī)院建設(shè)及管理。中心擁有龐大的監(jiān)測網(wǎng)絡(luò),擁有龐大的數(shù)據(jù)資源,也是國家中醫(yī)藥管理局中醫(yī)醫(yī)療服務(wù)評估重點(diǎn)研究室的重要組成部分。中心定時采集全國2000家二級以上中醫(yī)醫(yī)院病案信息,有效數(shù)據(jù)超過700萬份。作為依托單位的上海中醫(yī)藥大學(xué)附屬曙光醫(yī)院能利用中心的數(shù)據(jù)對本課題的數(shù)據(jù)源進(jìn)行有效的分析。整理課件外部技術(shù)支撐條件上海市疾病預(yù)防控制中心是實(shí)施上海市政府衛(wèi)生防病職能的專業(yè)機(jī)構(gòu)。作為上海市公共衛(wèi)生信息化建設(shè)和管理的責(zé)任單位,牽頭承擔(dān)

上海市健康信息網(wǎng)工程的疾控信息化項(xiàng)目,建立了基于電子健康檔案的常住人口的疾病管理、死亡登記、流行病學(xué)管理等六個業(yè)務(wù)信息系統(tǒng)。本課題可以利用上海疾控中心心血管、腫瘤、死因數(shù)據(jù)開展相關(guān)輔助研究。上海市疾病預(yù)防控制中心

在醫(yī)療知識庫構(gòu)建和語義技術(shù)方面,和國外一流科研機(jī)構(gòu)保持交流和合作關(guān)系:斯坦福醫(yī)學(xué)院的TaniaTudorache研究員負(fù)責(zé)擴(kuò)展世界著名本體編輯器Protégé來支持ICD11疾病術(shù)語庫的構(gòu)建。歐洲科學(xué)院院士FrankVanHarmelen負(fù)責(zé)了歐盟第7框架重大項(xiàng)目LARKC以及后續(xù)的OpenPhacts項(xiàng)目,完成了開放鏈接生物科學(xué)數(shù)據(jù)(linkedlifescience)的發(fā)布以及用藥安全管理和臨床指南語義理解等。國外科研機(jī)構(gòu)

整理課件外部技術(shù)支撐條件HL7ChinaHL7China中國委員會是HL7組織的國際會員之一,是唯一代表中國國家參與“HL7International”活動的成員。本次研究需要建立心血管疾病與腫瘤疾病大數(shù)據(jù)相關(guān)標(biāo)準(zhǔn),不僅在國內(nèi),在國際上也沒有系統(tǒng)的研究成果。萬達(dá)信息和工程中心作為HL7China理事單位和副主席,通過HL7China開展相關(guān)國際合作研究。中國衛(wèi)生信息學(xué)會衛(wèi)生信息標(biāo)準(zhǔn)專業(yè)委員會是跨部門、跨行業(yè)、開展衛(wèi)生信息標(biāo)準(zhǔn)化相關(guān)活動的專業(yè)性、全國性學(xué)術(shù)團(tuán)體,是中國衛(wèi)生信息學(xué)會下屬的二級學(xué)會,由從事衛(wèi)生信息標(biāo)準(zhǔn)及其相關(guān)領(lǐng)域工作的單位和個人自愿結(jié)成。本次研究需要建立心血管疾病與腫瘤疾病大數(shù)據(jù)相關(guān)標(biāo)準(zhǔn)。萬達(dá)信息和工程中心作為中國衛(wèi)生信息學(xué)會理事單位,將在專委會指導(dǎo)下,開展相關(guān)研究工作,并納入衛(wèi)生行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)的規(guī)劃和程序。中國衛(wèi)生信息學(xué)會衛(wèi)生信息標(biāo)準(zhǔn)專委會整理課件四、課題年度計(jì)劃(包括每年任務(wù)指標(biāo)和進(jìn)度安排)整理課件2015建立中醫(yī)臨床數(shù)據(jù)中心建立腫瘤與心血管重大疾病大數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)與質(zhì)量體系面向病歷文本的自然語言標(biāo)簽算法,以及基于標(biāo)簽的混合語義搜索算法初步完成

中醫(yī)重大疾病知識庫構(gòu)建技術(shù),完成基礎(chǔ)知識庫搭建基于已經(jīng)收集的電子病歷數(shù)據(jù),研究中醫(yī)重大疾病知識發(fā)現(xiàn)技術(shù),初步實(shí)現(xiàn)部分大數(shù)據(jù)挖掘并行算法開展心血管疾病和腫瘤疾病這兩種重大疾病的發(fā)病及治療總體情況研究開展中醫(yī)在心血管疾病和腫瘤疾病這兩種重大疾病的療效分析研究1月~6月開展心血管和腫瘤疾病診療應(yīng)用及臨床研究需求調(diào)研,完成相應(yīng)應(yīng)用分析技術(shù)指標(biāo)的制定;中醫(yī)臨床數(shù)據(jù)調(diào)研和分析;完成心血管和腫瘤疾病大數(shù)據(jù)采集的技術(shù)研究;相應(yīng)疾病數(shù)據(jù)采集標(biāo)準(zhǔn)化定義與數(shù)據(jù)接口規(guī)范制定;建立相應(yīng)大數(shù)據(jù)存儲架構(gòu)模型,實(shí)現(xiàn)支持大數(shù)據(jù)快速訪問、索引查詢等功能。7月~12月需求調(diào)研、臨床分析、技術(shù)攻關(guān)、架構(gòu)設(shè)計(jì)階段:年度任務(wù)指標(biāo):建立臨床數(shù)據(jù)中心,兩類疾病的中醫(yī)臨床知識庫,重大疾病大數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)與質(zhì)量體系,申報(bào)軟件著作權(quán)2項(xiàng),論文6篇整理課件2016搭建心血管和腫瘤疾病大數(shù)據(jù)平臺;形成病歷結(jié)構(gòu)化軟件包,提供可配置的人機(jī)界面;形成醫(yī)療大數(shù)據(jù)挖掘軟件算法包;從應(yīng)用的角度挖掘中西醫(yī)最優(yōu)治療路徑,研發(fā)中西醫(yī)臨床數(shù)據(jù)分析系統(tǒng),形成診療知識庫;搭建數(shù)據(jù)查詢和可視化系統(tǒng),針對中西醫(yī)臨床數(shù)據(jù),形成相應(yīng)挖掘結(jié)果的展示平臺。1月~6月基于標(biāo)簽算法,進(jìn)一步形成病歷結(jié)構(gòu)化算法與結(jié)構(gòu)化語義搜索算法;大數(shù)據(jù)挖掘并行算法在Hadoop/Spark平臺上測試與優(yōu)化;建立心血管和腫瘤疾病相關(guān)病例知識庫;研究臨床診療輔助決策系統(tǒng)的建模方法,搭建相應(yīng)模型庫;7月~12月臨床分析、系統(tǒng)研發(fā)、系統(tǒng)集成階段:年度任務(wù)指標(biāo):完成兩類疾病的臨床病例庫,開發(fā)重大疾病相關(guān)模型,建立臨床大數(shù)據(jù)處理平臺,申報(bào)軟件著作權(quán)3項(xiàng),論文10篇整理課件2017匯總各子課題組的數(shù)據(jù),包括知識及模型等;組織申報(bào)申請專利和科技進(jìn)步獎勵;將數(shù)據(jù)、模型及算法匯總,形成科技論文,完成結(jié)題報(bào)告。1月~6月完整建立在線臨床診療輔助決策系統(tǒng);基于大數(shù)據(jù)平臺和相應(yīng)軟件系統(tǒng),開展心血管和腫瘤疾病的輔助診療等應(yīng)用示范。7月~12月應(yīng)用示范和課題總結(jié)階段:年度任務(wù)指標(biāo):建立在線輔助決策支持系統(tǒng),申報(bào)國家發(fā)明專利2項(xiàng),軟件著作權(quán)5項(xiàng),論文14篇應(yīng)用系統(tǒng)集成成果總結(jié)整理課件五、課題組織實(shí)施方式、參與單位任務(wù)分工情況整理課件研究團(tuán)隊(duì)以中青年優(yōu)秀人才為骨干,在醫(yī)學(xué)臨床和基礎(chǔ)研究、醫(yī)院信息化、大數(shù)據(jù)平臺建設(shè)等方面進(jìn)行了多年的研究和探索,具備了比較豐富的經(jīng)驗(yàn)和工作積淀研發(fā)隊(duì)伍建設(shè)中醫(yī)藥學(xué)心血管專科腫瘤??漆t(yī)療信息化大數(shù)據(jù)系統(tǒng)研發(fā)數(shù)理統(tǒng)計(jì)自然語言處理數(shù)據(jù)挖掘研究團(tuán)隊(duì)整理課件中國醫(yī)院協(xié)會分會常委上海市中西醫(yī)結(jié)合外科專業(yè)委員會副主任委員上海市衛(wèi)生后勤管理協(xié)會常務(wù)理事高炬主任醫(yī)師資深中西醫(yī)結(jié)合專家,長期致力于外科疾病的中醫(yī)和中西醫(yī)結(jié)合治療與研究,參與研發(fā)多項(xiàng)中藥新藥,2008年起領(lǐng)導(dǎo)醫(yī)院信息化工作,在中醫(yī)信息化研究和體系建設(shè)方面具有較豐富的經(jīng)驗(yàn)。課題負(fù)責(zé)人目前承擔(dān)醫(yī)院信息化相關(guān)項(xiàng)目:國家863項(xiàng)目“綜合性中醫(yī)院信息系統(tǒng)研發(fā)與示范”第二負(fù)責(zé)人上海市經(jīng)信委“多媒體醫(yī)患交流平臺建設(shè)”第一負(fù)責(zé)人整理課件自然語言處理副所長女阮彤系統(tǒng)架構(gòu)設(shè)計(jì)執(zhí)行副主任男馮東雷醫(yī)療信息化醫(yī)療事業(yè)部主任女趙蓉醫(yī)療信息化主任男劉珉姓名性別職務(wù)專業(yè)工作單位腫瘤主任醫(yī)師男李琦心血管主任醫(yī)師男王肖龍大數(shù)據(jù)平臺研發(fā)產(chǎn)品經(jīng)理男張鑫金數(shù)據(jù)挖掘?qū)嶒?yàn)室副主任男王昊奮華東理工大學(xué)上海衛(wèi)生信息工程技術(shù)研究中心上海申康醫(yī)院發(fā)展中心曙光醫(yī)院曙光醫(yī)院曙光醫(yī)院萬達(dá)信息股份有限公司華東理工大學(xué)課題研究骨干整理課件課題任務(wù)分工曙光醫(yī)院華東理工大學(xué)萬達(dá)信息股份有限公司上海申康醫(yī)院發(fā)展中心全面負(fù)責(zé)該課題總體設(shè)計(jì)方案、實(shí)施計(jì)劃、協(xié)調(diào)及在本院的示范應(yīng)用;負(fù)責(zé)心血管及腫瘤疾病的療效分析,挖掘疾病風(fēng)險(xiǎn)因素和中西醫(yī)最優(yōu)治療路徑,編輯和驗(yàn)證中西醫(yī)臨床知識庫內(nèi)容。負(fù)責(zé)上海中醫(yī)三級醫(yī)院統(tǒng)籌協(xié)調(diào),上海市中西醫(yī)臨床數(shù)據(jù)中心建設(shè),中醫(yī)三級醫(yī)院電子病歷數(shù)據(jù)交換接口改造和臨床輔助決策分析系統(tǒng)應(yīng)用示范。負(fù)責(zé)搭建中西醫(yī)臨床大數(shù)據(jù)平臺,研究部分挖掘算法和研發(fā)中西醫(yī)臨床數(shù)據(jù)可視化系統(tǒng)。負(fù)責(zé)中西醫(yī)臨床知識庫、大數(shù)據(jù)挖掘算法、病歷文本分析及結(jié)構(gòu)化等關(guān)鍵技術(shù)研究。上海衛(wèi)生信息工

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